| Total sequences | 528052 |
| New sequences | 1782 |
| New lineages | [] |
| New mutations | |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1 |
| intergenic | L92L BA.2.86.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1 |
| intergenic | A211D BA.2.86.1 |
| intergenic | P361P BA.2.86.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1 |
| intergenic | V1056L BA.2.86.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1 |
| intergenic | A1397V BA.2.86.1 |
| intergenic | K1763R BA.2.86.1 |
| intergenic | K1973R BA.2.86.1 |
| intergenic | S2015S BA.2.86.1 |
| intergenic | S2103F BA.2.86.1 |
| intergenic | N2526S BA.2.86.1 |
| intergenic | T2676T BA.2.86.1 |
| intergenic | A2710T BA.2.86.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1 |
| intergenic | V3593F BA.2.86.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1 |
| intergenic | L3711F BA.2.86.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1 |
| intergenic | L4184L BA.2.86.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1 |
| intergenic | N4358N BA.2.86.1 |
| intergenic | Y4430Y BA.2.86.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1 |
| intergenic | S5164S BA.2.86.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1 |
| intergenic | H6701H BA.2.86.1 |
| intergenic | V16_N17insMPLF BA.2.86.1 |
| intergenic | TTR19ITT BA.2.86.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1 |
| intergenic | S50L BA.2.86.1 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1 |
| intergenic | V127F BA.2.86.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1 |
| intergenic | FR157SG BA.2.86.1 |
| intergenic | N185T BA.2.86.1 |
| intergenic | N211_V213delinsIG BA.2.86.1 |
| intergenic | L216F BA.2.86.1 |
| intergenic | H245N BA.2.86.1 |
| intergenic | A264D BA.2.86.1 |
| intergenic | I332V BA.2.86.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1 |
| intergenic | K356T BA.2.86.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1 |
| intergenic | R403K BA.2.86.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1 |
| intergenic | VG445HS BA.2.86.1 |
| intergenic | N450D BA.2.86.1 |
| intergenic | L452W BA.2.86.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1 |
| intergenic | N481_E484delinsKGK BA.2.86.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1 |
| intergenic | A570V BA.2.86.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1 |
| intergenic | P621S BA.2.86.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1 |
| intergenic | P681R BA.2.86.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1 |
| intergenic | P1143L BA.2.86.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1 |
| intergenic | Y1215Y BA.2.86.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1 |
| intergenic | D3H BA.2.86.1 |
| intergenic | G6V BA.2.86.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1 |
| intergenic | T30A BA.2.86.1 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1 |
| intergenic | A104V BA.2.86.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1 |
| intergenic | A35V BA.2.86.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1 |
| intergenic | Q229K BA.2.86.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | R99C BA.4.1.8 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8 |
| intergenic | N188N BA.4.1.8 |
| intergenic | F536F BA.4.1.8 |
| intergenic | T753I BA.4.1.8 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | A1049V BA.4.1.8 |
| intergenic | G1125D BA.4.1.8 |
| intergenic | H1160Y BA.4.1.8 |
| intergenic | T1168I BA.4.1.8 |
| intergenic | K1304K BA.4.1.8 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | Y1354Y BA.4.1.8 |
| intergenic | P1692S BA.4.1.8 |
| intergenic | P1862L BA.4.1.8 |
| ORF1a | S2048A / NSP3 |
| intergenic | S2048A BA.4.1.8 |
| intergenic | P2055S BA.4.1.8 |
| intergenic | A2379V BA.4.1.8 |
| intergenic | C2445C BA.4.1.8 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | V3690V BA.4.1.8 |
| intergenic | D3728D BA.4.1.8 |
| intergenic | Y3765Y BA.4.1.8 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | P4220H BA.4.1.8 |
| intergenic | D4452D BA.4.1.8 |
| intergenic | Y4686Y BA.4.1.8 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| ORF1b | R5228R / NSP12 |
| intergenic | R5228R BA.4.1.8 |
| intergenic | T5461T BA.4.1.8 |
| intergenic | C5633C BA.4.1.8 |
| intergenic | V5680V BA.4.1.8 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| ORF1b | A5727V / NSP13 |
| intergenic | A5727V BA.4.1.8 |
| intergenic | Q5947H BA.4.1.8 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | V6016A BA.4.1.8 |
| ORF1b | H6113H / NSP14 |
| intergenic | H6113H BA.4.1.8 |
| ORF1b | L6334F / NSP14 |
| intergenic | L6334F BA.4.1.8 |
| intergenic | N6446N BA.4.1.8 |
| ORF1b | A6532V / NSP15 |
| intergenic | A6532V BA.4.1.8 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| ORF1b | M6782I / NSP15 |
| intergenic | M6782I BA.4.1.8 |
| intergenic | G6953G BA.4.1.8 |
| intergenic | V3G BA.4.1.8 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | F543F BA.4.1.8 |
| intergenic | N603N BA.4.1.8 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | V1060I BA.4.1.8 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | E1202Q BA.4.1.8 |
| intergenic | G1251G BA.4.1.8 |
| intergenic | D27Y BA.4.1.8 |
| intergenic | S40P BA.4.1.8 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | S180F BA.4.1.8 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | M260K BA.4.1.8 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | T10T BA.4.1.8 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | L116F BA.4.1.8 |
| intergenic | L11fs BA.4.1.8 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | I10I BA.4.1.8 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | N75N BA.4.1.8 |
| intergenic | G85G BA.4.1.8 |
| intergenic | P151S BA.4.1.8 |
| intergenic | P151Y BA.4.1.8 |
| N | P151Y BA.4.1.8 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | D341D BA.4.1.8 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | H81Y BA.1.14 |
| intergenic | D144Y BA.1.14 |
| intergenic | K141_F143del BA.1.14 |
| intergenic | H388Y BA.1.14 |
| intergenic | E441E BA.1.14 |
| intergenic | A656V BA.1.14 |
| intergenic | A735A BA.1.14 |
| intergenic | K856R BA.1.14 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | Q998H BA.1.14 |
| intergenic | A1061T BA.1.14 |
| ORF1a | K1077N / NSP3 |
| intergenic | K1077N BA.1.14 |
| intergenic | P1158L BA.1.14 |
| ORF1a | K1315R / NSP3 |
| intergenic | K1315R BA.1.14 |
| intergenic | L1438L BA.1.14 |
| intergenic | A1707A BA.1.14 |
| intergenic | Y1770Y BA.1.14 |
| ORF1a | L1774R / NSP3 |
| intergenic | L1774R BA.1.14 |
| intergenic | P2046S BA.1.14 |
| intergenic | P2046L BA.1.14 |
| intergenic | S2083_L2084delinsI BA.1.14 |
| ORF1a | G2499D / NSP3 |
| intergenic | G2499D BA.1.14 |
| intergenic | A2557A BA.1.14 |
| intergenic | A2710T BA.2.86.1,BA.1.14 |
| intergenic | N2894N BA.1.14 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | P3395H BA.1.14 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | A3620V BA.1.14 |
| intergenic | L3674_G3676del BA.1.14 |
| ORF1a | S3673_F3677delinsI / NSP6 |
| intergenic | S3673_F3677delinsI BA.1.14 |
| intergenic | I3758V BA.1.14 |
| intergenic | S3950S BA.1.14 |
| intergenic | Y3954Y BA.1.14 |
| intergenic | T4087I BA.1.14 |
| intergenic | T4174I BA.1.14 |
| intergenic | V4310V BA.1.14 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | P4770P BA.1.14 |
| intergenic | N4992N BA.1.14 |
| intergenic | F5158F BA.1.14 |
| intergenic | P5498S BA.1.14 |
| ORF1b | G5530V / NSP13 |
| intergenic | G5530V BA.1.14 |
| intergenic | Q5947Q BA.1.14 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | H6020Y BA.1.14 |
| ORF1b | D6057G / NSP14 |
| intergenic | D6057G BA.1.14 |
| intergenic | V6188V BA.1.14 |
| intergenic | V6536V BA.1.14 |
| intergenic | G6875R BA.1.14 |
| intergenic | A6990S BA.1.14 |
| intergenic | Y38Y BA.1.14 |
| intergenic | H69del BA.1.14 |
| intergenic | V70del BA.1.14 |
| intergenic | T95I BA.1.14 |
| intergenic | G142_Y145delinsD BA.1.14 |
| intergenic | N211_L212delinsI BA.1.14 |
| intergenic | D215_L216delinsEPEDF BA.1.14 |
| S | D215_L216delinsEPEDF BA.1.14 |
| intergenic | R214_D215insEPE BA.1.14 |
| intergenic | T240I BA.1.14 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | S371L BA.1.14 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | S375F BA.1.14 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | G446S BA.1.14 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | Q493R BA.1.14 |
| intergenic | G496S BA.1.14 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | T547K BA.1.14 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | T618T BA.1.14 |
| intergenic | Q628R BA.1.14 |
| S | Q628R BA.1.14 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | A706V BA.1.14 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | T768I BA.1.14 |
| intergenic | I844I BA.1.14 |
| intergenic | N856K BA.1.14 |
| intergenic | A892S BA.1.14 |
| intergenic | A930A BA.1.14 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | L981F BA.1.14 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | A103P BA.1.14 |
| ORF3a | A103P BA.1.14 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | D3G BA.1.14 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | D61D BA.1.14 |
| intergenic | H47Y BA.1.14 |
| intergenic | D69D BA.1.14 |
| intergenic | Y97_I100del BA.1.14 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | P36P BA.1.14 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | R68R BA.1.14 |
| intergenic | R149R BA.1.14 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14 |
| intergenic | T332I BA.1.14 |
| intergenic | g.C-163T BA.2.12 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12 |
| intergenic | M85del BA.2.12 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | G146S BA.2.12 |
| intergenic | V186V BA.2.12 |
| intergenic | C213C BA.2.12 |
| intergenic | Y229Y BA.2.12 |
| intergenic | K247N BA.2.12 |
| ORF1a | E553G / NSP2 |
| intergenic | E553G BA.2.12 |
| intergenic | A599V BA.2.12 |
| intergenic | L681F BA.2.12 |
| intergenic | D691D BA.2.12 |
| intergenic | T711T BA.2.12 |
| intergenic | I740I BA.2.12 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | V879V BA.2.12 |
| intergenic | T891I BA.2.12 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | P959S BA.2.12 |
| intergenic | T1001I BA.2.12 |
| ORF1a | V1056M / NSP3 |
| intergenic | V1056M BA.2.12 |
| intergenic | G1070G BA.2.12 |
| intergenic | H1113Y BA.2.12 |
| intergenic | T1168I BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | K1281R BA.2.12 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | T1322I BA.2.12 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | A1397V BA.2.86.1,BA.2.12 |
| intergenic | A1397A BA.2.12 |
| ORF1a | T1444T / NSP3 |
| intergenic | T1444T BA.2.12 |
| ORF1a | A1482A / NSP3 |
| intergenic | A1482A BA.2.12 |
| intergenic | K1720N BA.2.12 |
| intergenic | N1995N BA.2.12 |
| intergenic | S2015S BA.2.86.1,BA.2.12 |
| intergenic | S2048A BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | N2272N BA.2.12 |
| intergenic | F2334F BA.2.12 |
| intergenic | Y2384Y BA.2.12 |
| intergenic | D2506D BA.2.12 |
| intergenic | N2603N BA.2.12 |
| intergenic | A2618V BA.2.12 |
| intergenic | P2685S BA.2.12 |
| intergenic | I2709I BA.2.12 |
| intergenic | H2794Y BA.2.12 |
| intergenic | T2836I BA.2.12 |
| intergenic | D2907D BA.2.12 |
| intergenic | A2909V BA.2.12 |
| intergenic | G2959D BA.2.12 |
| intergenic | T2967I BA.2.12 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | I3052V BA.2.12 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | S3099L BA.2.12 |
| intergenic | L3180L BA.2.12 |
| intergenic | L3198L BA.2.12 |
| intergenic | L3201F BA.2.12 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | I3322I BA.2.12 |
| intergenic | K3353R BA.2.12 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | V3420V BA.2.12 |
| intergenic | Q3507Q BA.2.12 |
| intergenic | L3535L BA.2.12 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| ORF1a | N3609S / NSP6 |
| intergenic | N3609S BA.2.12 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | L3717L BA.2.12 |
| intergenic | A3730A BA.2.12 |
| intergenic | L3796L BA.2.12 |
| intergenic | Y3803Y BA.2.12 |
| ORF1a | I3835I / NSP6 |
| intergenic | I3835I BA.2.12 |
| intergenic | A3837T BA.2.12 |
| ORF1a | E3906G / NSP7 |
| intergenic | E3906G BA.2.12 |
| intergenic | Q4015Q BA.2.12 |
| intergenic | L4070L BA.2.12 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | L4284L BA.2.12 |
| ORF1a | C4294F / NSP10 |
| intergenic | C4294F BA.2.12 |
| intergenic | H4301H BA.2.12 |
| intergenic | F4321F BA.2.12 |
| intergenic | D4455Y BA.2.12 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | F4811F BA.2.12 |
| intergenic | D4915D BA.2.12 |
| ORF1b | A4977V / NSP12 |
| intergenic | A4977V BA.2.12 |
| intergenic | Y5011Y BA.2.12 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12 |
| intergenic | H5144H BA.2.12 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | Y5355Y BA.2.12 |
| intergenic | N5370N BA.2.12 |
| intergenic | Y5388Y BA.2.12 |
| intergenic | T5451N BA.2.12 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12 |
| intergenic | A5626A BA.2.12 |
| intergenic | A5692V BA.2.12 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | F5746F BA.2.12 |
| intergenic | P5853L BA.2.12 |
| intergenic | A5926S BA.2.12 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | V6050F BA.2.12 |
| intergenic | D6069D BA.2.12 |
| intergenic | L6082F BA.2.12 |
| intergenic | D6097D BA.2.12 |
| intergenic | D6104D BA.2.12 |
| intergenic | P6128L BA.2.12 |
| intergenic | R6130R BA.2.12 |
| intergenic | T6131T BA.2.12 |
| intergenic | R6203R BA.2.12 |
| intergenic | L6308L BA.2.12 |
| intergenic | DRYP6315EGCH BA.2.12 |
| intergenic | N6463N BA.2.12 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | S6799S BA.2.12 |
| intergenic | I6838V BA.2.12 |
| intergenic | T6891T BA.2.12 |
| intergenic | L6924F BA.2.12 |
| intergenic | T6938I BA.2.12 |
| intergenic | L5F BA.2.12 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | T73T BA.2.12 |
| intergenic | G75V BA.2.12 |
| intergenic | L84I BA.2.12 |
| intergenic | T95A BA.2.12 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | H146H BA.2.12 |
| intergenic | T208T BA.2.12 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | S221S BA.2.12 |
| intergenic | N331N BA.2.12 |
| S | N331N BA.2.12 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | N448S BA.2.12 |
| intergenic | L452Q BA.2.12 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | Q493R BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | QS493RP BA.2.12 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | P579P BA.2.12 |
| intergenic | T604I BA.2.12 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | V620V BA.2.12 |
| intergenic | A623S BA.2.12 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | S704L BA.2.12 |
| intergenic | T732I BA.2.12 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | L1141L BA.2.12 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | D1259D BA.2.12 |
| intergenic | F8F BA.2.12 |
| intergenic | V29I BA.2.12 |
| intergenic | F43F BA.2.12 |
| intergenic | G44R BA.2.12 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | H78Y BA.2.12 |
| intergenic | Q185H BA.2.12 |
| intergenic | Q213K BA.2.12 |
| intergenic | Y215H BA.2.12 |
| intergenic | T223I BA.2.12 |
| intergenic | S253S BA.2.12 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | A69V BA.2.12 |
| intergenic | M109I BA.2.12 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | L124L BA.2.12 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | H47Y BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | D51D BA.2.12 |
| intergenic | P84S BA.2.12 |
| intergenic | A15S BA.2.12 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | G66_K68delinsE BA.2.12 |
| intergenic | P70L BA.2.12 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | S23P BA.2.12 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | P67L BA.2.12 |
| intergenic | Y86Y BA.2.12 |
| intergenic | P117P BA.2.12 |
| intergenic | G175G BA.2.12 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | T296I BA.2.12 |
| intergenic | E367E BA.2.12 |
| intergenic | K369I BA.2.12 |
| N | K369I BA.2.12 |
| intergenic | Q389H BA.2.12 |
| intergenic | F403F BA.2.12 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | g.G-15T BA.2.12 |
| intergenic | P10S BA.2.12 |
| intergenic | R24H BA.2.12 |
| intergenic | A28V BA.2.12 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | G7S BA.1.17 |
| intergenic | K856R BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | A1283V BA.1.17 |
| intergenic | T1581T BA.1.17 |
| intergenic | A1707A BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | P1803S BA.1.17 |
| intergenic | V1887I BA.1.17 |
| intergenic | S2083_L2084delinsI BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | T2152I BA.1.17 |
| intergenic | D2573D BA.1.17 |
| intergenic | A2690V BA.1.17 |
| intergenic | A2710T BA.2.86.1,BA.1.14,BA.1.17 |
| ORF1a | M2796T / NSP4 |
| intergenic | M2796T BA.1.17 |
| intergenic | S2797F BA.1.17 |
| intergenic | L3234L BA.1.17 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | N3291N BA.1.17 |
| intergenic | P3395H BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | L3674_G3676del BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | I3758V BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | V4310V BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | S4398L BA.1.17 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | V4722A BA.1.17 |
| ORF1b | R4975G / NSP12 |
| intergenic | R4975G BA.1.17 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | N5020N BA.1.17 |
| intergenic | P5371P BA.1.17 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | V5776V BA.1.17 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | H69del BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | V70del BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | T95I BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | G142_Y145delinsD BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | M177I BA.1.17 |
| intergenic | N211_L212delinsI BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | R214_D215insEPE BA.1.17 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | S371L BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | S375F BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | G446S BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | Q493R BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | G496S BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | H519H BA.1.17 |
| intergenic | T547K BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | F643L BA.1.17 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | A701V BA.1.17 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | N856K BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | L981F BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | Q17H BA.1.17 |
| intergenic | I20I BA.1.17 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | T176I BA.1.17 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | V75L BA.1.17 |
| intergenic | D3G BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | L35I BA.1.17 |
| intergenic | D61D BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | E95X BA.1.17 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | D113D BA.1.17 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | D103D BA.1.17 |
| N | D103D BA.1.17 |
| intergenic | A134A BA.1.17 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | T282T BA.1.17 |
| intergenic | Y298Y BA.1.17 |
| intergenic | g.C-147T BA.5.2.2 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | G82S BA.5.2.2 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | H81H BA.5.2.2 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | P309L BA.5.2.2 |
| intergenic | G401G BA.5.2.2 |
| intergenic | S443F BA.5.2.2 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2 |
| intergenic | K722K BA.5.2.2 |
| ORF1a | G780G / NSP2 |
| intergenic | G780G BA.5.2.2 |
| intergenic | IT841VI BA.5.2.2 |
| ORF1a | NIT840SVI / NSP3 |
| intergenic | NIT840SVI BA.5.2.2 |
| intergenic | T842I BA.5.2.2 |
| intergenic | T882I BA.5.2.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | S966P BA.5.2.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | T1426T BA.5.2.2 |
| intergenic | L1438L BA.1.14,BA.5.2.2 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2 |
| ORF1a | D1440D / NSP3 |
| intergenic | D1440D BA.5.2.2 |
| ORF1a | E1461E / NSP3 |
| intergenic | E1461E BA.5.2.2 |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2 |
| intergenic | A1809V BA.5.2.2 |
| intergenic | F1925F BA.5.2.2 |
| intergenic | T2016K BA.5.2.2 |
| intergenic | S2024L BA.5.2.2 |
| ORF1a | N2449N / NSP3 |
| intergenic | N2449N BA.5.2.2 |
| intergenic | T2648I BA.5.2.2 |
| ORF1a | V2680V / NSP3 |
| intergenic | V2680V BA.5.2.2 |
| ORF1a | E2946A / NSP4 |
| intergenic | E2946A BA.5.2.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | T3090I BA.5.2.2 |
| intergenic | L3191L BA.5.2.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | V3349L BA.5.2.2 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | K3353N BA.5.2.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | A3454T BA.5.2.2 |
| intergenic | N3484N BA.5.2.2 |
| intergenic | D3492D BA.5.2.2 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | T3646I BA.5.2.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2 |
| intergenic | Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| ORF1b | T4668A / NSP12 |
| intergenic | T4668A BA.5.2.2 |
| intergenic | P4715F BA.5.2.2 |
| intergenic | P4715L BA.5.2.2 |
| ORF1b | V4816M / NSP12 |
| intergenic | V4816M BA.5.2.2 |
| intergenic | M4855I BA.5.2.2 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | A5270V BA.5.2.2 |
| intergenic | T5439I BA.5.2.2 |
| intergenic | T5451N BA.2.12,BA.5.2.2 |
| ORF1b | V5478V / NSP13 |
| intergenic | V5478V BA.5.2.2 |
| intergenic | T5538I BA.5.2.2 |
| ORF1b | F5549L / NSP13 |
| intergenic | F5549L BA.5.2.2 |
| intergenic | P5608P BA.5.2.2 |
| intergenic | A5645A BA.5.2.2 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | T5923T BA.5.2.2 |
| intergenic | T5956I BA.5.2.2 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | T6028T BA.5.2.2 |
| intergenic | T6144I BA.5.2.2 |
| intergenic | R6235R BA.5.2.2 |
| intergenic | D6256D BA.5.2.2 |
| intergenic | T6449I BA.5.2.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | Y6645Y BA.5.2.2 |
| intergenic | G6698S BA.5.2.2 |
| intergenic | V6772L BA.5.2.2 |
| intergenic | L6819L BA.5.2.2 |
| intergenic | A6976V BA.5.2.2 |
| intergenic | T19I BA.5.2.2 |
| intergenic | T19L BA.5.2.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | V127F BA.2.86.1,BA.5.2.2 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | A262A BA.5.2.2 |
| intergenic | L296L BA.5.2.2 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | R346I BA.5.2.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | L518I BA.5.2.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | D1163Y BA.5.2.2 |
| intergenic | G1219C BA.5.2.2 |
| intergenic | C1253C BA.5.2.2 |
| intergenic | P42H BA.5.2.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | L106L BA.5.2.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2 |
| intergenic | V256del BA.5.2.2 |
| intergenic | g.G-18T BA.5.2.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2 |
| intergenic | P84L BA.5.2.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2 |
| intergenic | L60F BA.5.2.2 |
| intergenic | I71T BA.5.2.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | G5R BA.5.2.2 |
| N | G5R BA.5.2.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | I130I BA.5.2.2 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | D144D BA.5.2.2 |
| intergenic | G178S BA.5.2.2 |
| N | G178S BA.5.2.2 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | T245I BA.5.2.2 |
| intergenic | Y360Y BA.5.2.2 |
| intergenic | g.C-3T BA.5.2.2 |
| intergenic | R24C BA.5.2.2 |
| intergenic | g.CAAT29675C BA.5.2.2 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2 |
| intergenic | g.G29717A BA.5.2.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | g.T-129C BA.5.1.10 |
| intergenic | g.C-119T BA.5.1.10 |
| intergenic | g.C-63T BA.5.1.10 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | G49V BA.5.1.10 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.10 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | N189N BA.5.1.10 |
| intergenic | P305S BA.5.1.10 |
| intergenic | G334G BA.5.1.10 |
| intergenic | H374H BA.5.1.10 |
| intergenic | G379E BA.5.1.10 |
| intergenic | T403I BA.5.1.10 |
| ORF1a | E441D / NSP2 |
| intergenic | E441D BA.5.1.10 |
| intergenic | S481S BA.5.1.10 |
| intergenic | A540V BA.5.1.10 |
| intergenic | A591V BA.5.1.10 |
| intergenic | T614I BA.5.1.10 |
| intergenic | D644D BA.5.1.10 |
| intergenic | G728C BA.5.1.10 |
| intergenic | L730I BA.5.1.10 |
| intergenic | P748L BA.5.1.10 |
| intergenic | V839V BA.5.1.10 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | T882I BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | P971S BA.5.1.10 |
| intergenic | T1001I BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | F1353fs BA.5.1.10 |
| intergenic | M1588T BA.5.1.10 |
| ORF1a | P1659S / NSP3 |
| intergenic | P1659S BA.5.1.10 |
| ORF1a | I1667V / NSP3 |
| intergenic | I1667V BA.5.1.10 |
| intergenic | N1673N BA.5.1.10 |
| ORF1a | L1725S / NSP3 |
| intergenic | L1725S BA.5.1.10 |
| intergenic | L1762I BA.5.1.10 |
| intergenic | A1851T BA.5.1.10 |
| intergenic | Y1873Y BA.5.1.10 |
| intergenic | S1905F BA.5.1.10 |
| intergenic | L2062F BA.5.1.10 |
| intergenic | N2147N BA.5.1.10 |
| intergenic | Y2168Y BA.5.1.10 |
| intergenic | V2776I BA.5.1.10 |
| intergenic | F2780S BA.5.1.10 |
| intergenic | M2796I BA.5.1.10 |
| intergenic | N2894N BA.1.14,BA.5.1.10 |
| intergenic | F2964F BA.5.1.10 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | S3149F BA.5.1.10 |
| intergenic | A3209V BA.5.1.10 |
| intergenic | G3245G BA.5.1.10 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | P3359S BA.5.1.10 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10 |
| intergenic | T3374T BA.5.1.10 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | Y3424Y BA.5.1.10 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10 |
| intergenic | F3603F BA.5.1.10 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | K3839R BA.5.1.10 |
| intergenic | I3853I BA.5.1.10 |
| intergenic | E3906E BA.5.1.10 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | Q3966R BA.5.1.10 |
| intergenic | Q4189H BA.5.1.10 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | I4291I BA.5.1.10 |
| ORF1a | N4338Y / NSP10 |
| intergenic | N4338Y BA.5.1.10 |
| ORF1a | D4344Y / NSP10 |
| intergenic | D4344Y BA.5.1.10 |
| ORF1b | C4446C / NSP12 |
| intergenic | C4446C BA.5.1.10 |
| intergenic | H4467H BA.5.1.10 |
| intergenic | T4477I BA.5.1.10 |
| ORF1b | L4578L / NSP12 |
| intergenic | L4578L BA.5.1.10 |
| ORF1b | Y4630Y / NSP12 |
| intergenic | Y4630Y BA.5.1.10 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10 |
| intergenic | F4820F BA.5.1.10 |
| intergenic | A4835A BA.5.1.10 |
| intergenic | N4851N BA.5.1.10 |
| intergenic | Y4908Y BA.5.1.10 |
| intergenic | F4986F BA.5.1.10 |
| intergenic | D5128N BA.5.1.10 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | L5254L BA.5.1.10 |
| intergenic | P5310L BA.5.1.10 |
| intergenic | P5371L BA.5.1.10 |
| intergenic | Y5444Y BA.5.1.10 |
| intergenic | T5451I BA.5.1.10 |
| intergenic | P5496H BA.5.1.10 |
| intergenic | R5572K BA.5.1.10 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | L5762L BA.5.1.10 |
| intergenic | I5804I BA.5.1.10 |
| intergenic | T5825I BA.5.1.10 |
| intergenic | T5912I BA.5.1.10 |
| intergenic | T5941A BA.5.1.10 |
| intergenic | G5942W BA.5.1.10 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | V6106V BA.5.1.10 |
| intergenic | L6205L BA.5.1.10 |
| intergenic | H6380Y BA.5.1.10 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | S6739L BA.5.1.10 |
| intergenic | Y6845Y BA.5.1.10 |
| intergenic | L6924F BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | Y6930Y BA.5.1.10 |
| intergenic | F6985F BA.5.1.10 |
| intergenic | PR7013LN BA.5.1.10 |
| ORF1b | T7032I / NSP16 |
| intergenic | T7032I BA.5.1.10 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | F32F BA.5.1.10 |
| intergenic | S60S BA.5.1.10 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | I68_H69del BA.5.1.10 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | V83V BA.5.1.10 |
| intergenic | S98F BA.5.1.10 |
| intergenic | I105V BA.5.1.10 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | Y145H BA.5.1.10 |
| intergenic | Q183R BA.5.1.10 |
| intergenic | V193L BA.5.1.10 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | S254S BA.5.1.10 |
| intergenic | D294D BA.5.1.10 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10 |
| intergenic | S359S BA.5.1.10 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10 |
| intergenic | E554G BA.5.1.10 |
| intergenic | N603N BA.4.1.8,BA.5.1.10 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | I692I BA.5.1.10 |
| intergenic | N710N BA.5.1.10 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | T1006T BA.5.1.10 |
| intergenic | F1062F BA.5.1.10 |
| intergenic | T1100T BA.5.1.10 |
| intergenic | I1114T BA.5.1.10 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | A1226A BA.5.1.10 |
| intergenic | G1251R BA.5.1.10 |
| intergenic | K21N BA.5.1.10 |
| intergenic | I37I BA.5.1.10 |
| intergenic | P42S BA.5.1.10 |
| intergenic | F43S BA.5.1.10 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | L106L BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | Y113Y BA.5.1.10 |
| intergenic | C148C BA.5.1.10 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | H247Y BA.5.1.10 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | g.T-6C BA.5.1.10 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | N121N BA.5.1.10 |
| intergenic | C15C BA.5.1.10 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | P36S BA.5.1.10 |
| intergenic | A55V BA.5.1.10 |
| intergenic | S67F BA.5.1.10 |
| intergenic | K68N BA.5.1.10 |
| intergenic | I71T BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | T87I BA.5.1.10 |
| intergenic | V114L BA.5.1.10 |
| intergenic | R115H BA.5.1.10 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | P13F BA.5.1.10 |
| intergenic | P13L BA.5.1.10 |
| intergenic | G25G BA.5.1.10 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | D63D BA.5.1.10 |
| intergenic | P67L BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10 |
| intergenic | N126S BA.5.1.10 |
| intergenic | A152S BA.5.1.10 |
| intergenic | N192N BA.5.1.10 |
| intergenic | S194P BA.5.1.10 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10 |
| intergenic | Y268Y BA.5.1.10 |
| intergenic | T271I BA.5.1.10 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10 |
| intergenic | S310S BA.5.1.10 |
| intergenic | K347T BA.5.1.10 |
| N | K347T BA.5.1.10 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | g.C-10T BA.5.1.10 |
| intergenic | R24C BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | g.C-222T BA.4 |
| intergenic | g.C-63T BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | R24C BA.4 |
| intergenic | H45Y BA.4 |
| intergenic | V60I BA.4 |
| intergenic | G82_V86del BA.4 |
| ORF1a | H81N / NSP1 |
| intergenic | H81N BA.4 |
| ORF1a | H81_M85delinsNV / NSP1 |
| intergenic | H81_M85delinsNV BA.4 |
| intergenic | M85_V86del BA.4 |
| intergenic | V86F BA.4 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4 |
| ORF1a | S142_F143delinsHTM / NSP1 |
| intergenic | S142_F143delinsHTM BA.4 |
| ORF1a | E172E / NSP1 |
| intergenic | E172E BA.4 |
| intergenic | K210K BA.4 |
| intergenic | S216S BA.4 |
| intergenic | V378I BA.4 |
| intergenic | V378A BA.4 |
| intergenic | I396I BA.4 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4 |
| intergenic | K492K BA.4 |
| intergenic | S505S BA.4 |
| intergenic | T512T BA.4 |
| ORF1a | A540A / NSP2 |
| intergenic | A540A BA.4 |
| intergenic | A555V BA.4 |
| intergenic | Q556K BA.4 |
| intergenic | Y576C BA.4 |
| intergenic | L580F BA.4 |
| intergenic | N615N BA.4 |
| intergenic | Y621Y BA.4 |
| intergenic | V627I BA.4 |
| intergenic | L730L BA.4 |
| ORF1a | D795G / NSP2 |
| intergenic | D795G BA.4 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | A964T BA.4 |
| intergenic | A967V BA.4 |
| ORF1a | I1023T / NSP3 |
| intergenic | I1023T BA.4 |
| intergenic | A1043V BA.4 |
| intergenic | D1088D BA.4 |
| intergenic | D1179D BA.4 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| ORF1a | A1482T / NSP3 |
| intergenic | A1482T BA.4 |
| intergenic | P1541S BA.4 |
| ORF1a | P1659T / NSP3 |
| intergenic | P1659T BA.4 |
| ORF1a | N1672N / NSP3 |
| intergenic | N1673N BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | Y1868Y BA.4 |
| ORF1a | S2048A / NSP3 |
| intergenic | T2121T BA.4 |
| intergenic | D2299D BA.4 |
| intergenic | M2365I BA.4 |
| intergenic | I2385I BA.4 |
| intergenic | V2421V BA.4 |
| intergenic | S2493G BA.4 |
| intergenic | Y2513Y BA.4 |
| intergenic | V2624V BA.4 |
| intergenic | S2625S BA.4 |
| ORF1a | E2681E / NSP3 |
| intergenic | E2681E BA.4 |
| intergenic | A2701A BA.4 |
| ORF1a | V2754I / NSP3 |
| intergenic | V2754I BA.4 |
| intergenic | H2799Y BA.4 |
| intergenic | F3018F BA.4 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | L3092L BA.4 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | T3284I BA.4 |
| intergenic | N3291N BA.1.17,BA.4 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4 |
| intergenic | A3357A BA.4 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | G3437G BA.4 |
| intergenic | F3486L BA.4 |
| intergenic | D3511D BA.4 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | A3625A BA.4 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | P3952P BA.4 |
| intergenic | Y3954Y BA.1.14,BA.4 |
| intergenic | A3960A BA.4 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | V3976I BA.4 |
| intergenic | L4045L BA.4 |
| intergenic | L4064L BA.4 |
| intergenic | I4098T BA.4 |
| intergenic | C4163C BA.4 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | L4209L BA.4 |
| intergenic | N4235N BA.4 |
| intergenic | L4284L BA.2.12,BA.4 |
| intergenic | C4330C BA.4 |
| intergenic | A4357V BA.4 |
| intergenic | R4387R BA.4 |
| intergenic | V4406V BA.4 |
| intergenic | M4588I BA.4 |
| intergenic | D4652D BA.4 |
| ORF1b | D4661E / NSP12 |
| intergenic | D4661E BA.4 |
| intergenic | P4715F BA.5.2.2,BA.4 |
| intergenic | P4715L BA.5.2.2,BA.4 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10 |
| intergenic | Y4738H BA.4 |
| intergenic | L4779L BA.4 |
| intergenic | Y4847Y BA.4 |
| intergenic | A4972A BA.4 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4 |
| intergenic | E5136D BA.4 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4 |
| intergenic | L5197L BA.4 |
| intergenic | L5230L BA.4 |
| intergenic | L5283L BA.4 |
| intergenic | A5342V BA.4 |
| intergenic | P5377S BA.4 |
| intergenic | G5378S BA.4 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4 |
| ORF1b | T5552T / NSP13 |
| intergenic | T5552T BA.4 |
| intergenic | A5620T BA.4 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | S5748S BA.4 |
| intergenic | F5823F BA.4 |
| intergenic | P5828P BA.4 |
| intergenic | L5963L BA.4 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | M6078I BA.4 |
| intergenic | V6314V BA.4 |
| intergenic | V6362V BA.4 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | T6854I BA.4 |
| intergenic | A6997A BA.4 |
| intergenic | P7034L BA.4 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | G75V BA.2.12,BA.4 |
| intergenic | A93S BA.4 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | K147_N148del BA.4 |
| S | K147_N148del BA.4 |
| intergenic | K182I BA.4 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | L229L BA.4 |
| intergenic | V308V BA.4 |
| S | V308V BA.4 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | G339V BA.4 |
| S | G339V BA.4 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | R346S BA.4 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | S640F BA.4 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | N658S BA.4 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | Q804Q BA.4 |
| intergenic | D936N BA.4 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | I1018I BA.4 |
| intergenic | A1020S BA.4 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | G1251G BA.4.1.8,BA.4 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4 |
| intergenic | V55F BA.4 |
| intergenic | A59V BA.4 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | S74F BA.4 |
| intergenic | L84L BA.4 |
| intergenic | L94F BA.4 |
| intergenic | L108F BA.4 |
| intergenic | L140F BA.4 |
| intergenic | G172V BA.4 |
| intergenic | Y206Y BA.4 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | P240S BA.4 |
| intergenic | g.G-15T BA.4 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | C33C BA.4 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | L56L BA.4 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4 |
| intergenic | L124L BA.2.12,BA.4 |
| intergenic | V170V BA.4 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4 |
| intergenic | g.C-5T BA.4 |
| intergenic | Y18H BA.4 |
| ORF7a | Y18H BA.4 |
| intergenic | V24L BA.4 |
| intergenic | Q62_F63delinsH BA.4 |
| intergenic | R80I BA.4 |
| intergenic | P84L BA.5.2.2,BA.4 |
| intergenic | V108_T111del BA.4 |
| ORF7a | V108_T111del BA.4 |
| intergenic | L11F BA.4 |
| intergenic | F19L BA.4 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | L32F BA.4 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | G66_K68delinsE BA.2.12,BA.4 |
| intergenic | F104L BA.4 |
| intergenic | F120fs BA.4 |
| intergenic | I121fs BA.4 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | P6S BA.4 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | G30_S33delinsF BA.4 |
| intergenic | P142S BA.4 |
| intergenic | P151S BA.4 |
| intergenic | PA151SS BA.4 |
| N | PA151SS BA.4 |
| intergenic | I157I BA.4 |
| intergenic | E174E BA.4 |
| intergenic | S180I BA.4 |
| intergenic | N192N BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4 |
| intergenic | RGT203KRN BA.4 |
| N | RGT203KRN BA.4 |
| intergenic | T332T BA.4 |
| intergenic | Y333Y BA.4 |
| intergenic | A336S BA.4 |
| N | A336S BA.4 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | g.C-12A BA.4 |
| intergenic | Q29X BA.4 |
| intergenic | g.TG29710T BA.4 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGT29734C BA.4 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGT29734T BA.4 |
| intergenic | g.C-95A BA.5.2.34 |
| intergenic | g.T-57G BA.5.2.34 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | K72K BA.5.2.34 |
| intergenic | M85del BA.5.2.34 |
| intergenic | L92L BA.2.86.1,BA.5.2.34 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34 |
| intergenic | I114V BA.5.2.34 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | P193L BA.5.2.34 |
| intergenic | D203N BA.5.2.34 |
| intergenic | L259L BA.5.2.34 |
| intergenic | F266F BA.5.2.34 |
| intergenic | Y304H BA.5.2.34 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34 |
| intergenic | A385V BA.5.2.34 |
| intergenic | R402R BA.5.2.34 |
| intergenic | A427V BA.5.2.34 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | D644D BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| ORF1a | A687D / NSP2 |
| intergenic | A687D BA.5.2.34 |
| intergenic | H712H BA.5.2.34 |
| intergenic | T727I BA.5.2.34 |
| intergenic | V757V BA.5.2.34 |
| intergenic | N786N BA.5.2.34 |
| intergenic | N811N BA.5.2.34 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| ORF1a | D981G / NSP3 |
| intergenic | D981G BA.5.2.34 |
| intergenic | L1065L BA.5.2.34 |
| intergenic | G1073R BA.5.2.34 |
| intergenic | Y1174Y BA.5.2.34 |
| intergenic | L1186F BA.5.2.34 |
| intergenic | L1191L BA.5.2.34 |
| intergenic | T1246T BA.5.2.34 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | E1341E BA.5.2.34 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | K1428K BA.5.2.34 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34 |
| intergenic | L1523L BA.5.2.34 |
| intergenic | N1555N BA.5.2.34 |
| intergenic | V1629V BA.5.2.34 |
| intergenic | T1890I BA.5.2.34 |
| intergenic | Y2003Y BA.5.2.34 |
| intergenic | D2043D BA.5.2.34 |
| intergenic | L2146F BA.5.2.34 |
| intergenic | S2242F BA.5.2.34 |
| intergenic | G2342E BA.5.2.34 |
| ORF1a | S2378P / NSP3 |
| intergenic | S2378P BA.5.2.34 |
| intergenic | L2518F BA.5.2.34 |
| intergenic | P2537S BA.5.2.34 |
| ORF1a | H2794H / NSP4 |
| intergenic | H2794H BA.5.2.34 |
| intergenic | P2870P BA.5.2.34 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | S3099L BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | A3209V BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | I3341I BA.5.2.34 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | D3439D BA.5.2.34 |
| intergenic | A3529A BA.5.2.34 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34 |
| intergenic | H3580H BA.5.2.34 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | S3742S BA.5.2.34 |
| intergenic | V3747I BA.5.2.34 |
| intergenic | T3750I BA.5.2.34 |
| intergenic | F3753V BA.5.2.34 |
| intergenic | N3801N BA.5.2.34 |
| intergenic | V3892A BA.5.2.34 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34 |
| intergenic | L4064F BA.5.2.34 |
| intergenic | D4165N BA.5.2.34 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | T4258T BA.5.2.34 |
| intergenic | V4369A BA.5.2.34 |
| intergenic | P4486L BA.5.2.34 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| ORF1b | S4825S / NSP12 |
| intergenic | S4825S BA.5.2.34 |
| ORF1b | A4977S / NSP12 |
| intergenic | A4977S BA.5.2.34 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34 |
| intergenic | T5072T BA.5.2.34 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | Y5220Y BA.5.2.34 |
| intergenic | T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34 |
| intergenic | I5475I BA.5.2.34 |
| intergenic | S5490L BA.5.2.34 |
| intergenic | T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | P5828S BA.5.2.34 |
| intergenic | L5932L BA.5.2.34 |
| intergenic | V5939L BA.5.2.34 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | G5969S BA.5.2.34 |
| intergenic | P5971P BA.5.2.34 |
| intergenic | V6188F BA.5.2.34 |
| intergenic | A6206V BA.5.2.34 |
| intergenic | C6307C BA.5.2.34 |
| intergenic | T6441I BA.5.2.34 |
| ORF1b | R6542K / NSP15 |
| intergenic | R6542K BA.5.2.34 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| ORF1b | K6601N / NSP15 |
| intergenic | K6601N BA.5.2.34 |
| intergenic | R6658S BA.5.2.34 |
| intergenic | A6735A BA.5.2.34 |
| intergenic | R7014H BA.5.2.34 |
| intergenic | R7014R BA.5.2.34 |
| ORF1b | P7049S / NSP16 |
| intergenic | P7049S BA.5.2.34 |
| intergenic | I7088V BA.5.2.34 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | V11V BA.5.2.34 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34 |
| intergenic | H146H BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | D215E BA.5.2.34 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | N460I BA.5.2.34 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | F562F BA.5.2.34 |
| intergenic | D574N BA.5.2.34 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | Q675Q BA.5.2.34 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | A688V BA.5.2.34 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | V826V BA.5.2.34 |
| intergenic | A879V BA.5.2.34 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | V1104L BA.5.2.34 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | C1248F BA.5.2.34 |
| intergenic | P1263L BA.5.2.34 |
| intergenic | L46F BA.5.2.34 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | H78Y BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | L96L BA.5.2.34 |
| intergenic | M125I BA.5.2.34 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | R61L BA.5.2.34 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34 |
| intergenic | L164L BA.5.2.34 |
| intergenic | G202G BA.5.2.34 |
| intergenic | V9V BA.5.2.34 |
| intergenic | D30D BA.5.2.34 |
| intergenic | C15S BA.5.2.34 |
| ORF7a | C15S BA.5.2.34 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34 |
| intergenic | V104F BA.5.2.34 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | E33X BA.5.2.34 |
| intergenic | L34L BA.5.2.34 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | H17H BA.5.2.34 |
| intergenic | P36P BA.1.14,BA.5.2.34 |
| intergenic | P38P BA.5.2.34 |
| intergenic | S82S BA.5.2.34 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | T24I BA.5.2.34 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | D103H BA.5.2.34 |
| intergenic | A155V BA.5.2.34 |
| intergenic | I157I BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | A273S BA.5.2.34 |
| intergenic | P302P BA.5.2.34 |
| intergenic | T334I BA.5.2.34 |
| intergenic | I337I BA.5.2.34 |
| intergenic | F346F BA.5.2.34 |
| intergenic | L353L BA.5.2.34 |
| intergenic | P383P BA.5.2.34 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | P10S BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | g.C-160T BA.5.1.24 |
| intergenic | g.T-98C BA.5.1.24 |
| intergenic | g.A-97G BA.5.1.24 |
| intergenic | g.T-89C BA.5.1.24 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L27L BA.5.1.24 |
| intergenic | G49D BA.5.1.24 |
| intergenic | G49G BA.5.1.24 |
| intergenic | C51Y BA.5.1.24 |
| intergenic | Q66Q BA.5.1.24 |
| intergenic | G82_H83del BA.5.1.24 |
| intergenic | M85del BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L88L BA.5.1.24 |
| intergenic | Y97Y BA.5.1.24 |
| intergenic | G98S BA.5.1.24 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D152G BA.5.1.24 |
| intergenic | V186V BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | D203D BA.5.1.24 |
| intergenic | L204F BA.5.1.24 |
| intergenic | D220D BA.5.1.24 |
| intergenic | I257V BA.5.1.24 |
| intergenic | P271P BA.5.1.24 |
| intergenic | S302F BA.5.1.24 |
| intergenic | Y304Y BA.5.1.24 |
| ORF1a | L349V / NSP2 |
| intergenic | L349V BA.5.1.24 |
| intergenic | E381E BA.5.1.24 |
| ORF1a | G432C / NSP2 |
| intergenic | G432C BA.5.1.24 |
| intergenic | L454F BA.5.1.24 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | V491V BA.5.1.24 |
| intergenic | S538L BA.5.1.24 |
| intergenic | V559A BA.5.1.24 |
| intergenic | L580F BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | L580L BA.5.1.24 |
| intergenic | I694I BA.5.1.24 |
| intergenic | T796T BA.5.1.24 |
| intergenic | F813F BA.5.1.24 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L864L BA.5.1.24 |
| intergenic | V886V BA.5.1.24 |
| intergenic | T891I BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| ORF1a | T1000T / NSP3 |
| intergenic | T1000T BA.5.1.24 |
| intergenic | I1002T BA.5.1.24 |
| intergenic | V1099V BA.5.1.24 |
| intergenic | K1112K BA.5.1.24 |
| intergenic | P1213L BA.5.1.24 |
| intergenic | D1282G BA.5.1.24 |
| intergenic | V1299L BA.5.1.24 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D1323D BA.5.1.24 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | H1500Y BA.5.1.24 |
| intergenic | V1570L BA.5.1.24 |
| intergenic | D1600N BA.5.1.24 |
| intergenic | P1640L BA.5.1.24 |
| intergenic | L1680L BA.5.1.24 |
| intergenic | N1691N BA.5.1.24 |
| intergenic | T1731I BA.5.1.24 |
| intergenic | Y1734H BA.5.1.24 |
| intergenic | Y1868Y BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | S1924R BA.5.1.24 |
| intergenic | C2041C BA.5.1.24 |
| intergenic | D2101D BA.5.1.24 |
| intergenic | L2113L BA.5.1.24 |
| intergenic | S2151G BA.5.1.24 |
| intergenic | M2374K BA.5.1.24 |
| intergenic | A2470A BA.5.1.24 |
| intergenic | P2480P BA.5.1.24 |
| intergenic | V2491I BA.5.1.24 |
| intergenic | L2609L BA.5.1.24 |
| ORF1a | I2634V / NSP3 |
| intergenic | I2634V BA.5.1.24 |
| ORF1a | C2691C / NSP3 |
| intergenic | C2691C BA.5.1.24 |
| intergenic | I2806I BA.5.1.24 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D3222D BA.5.1.24 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | C3285C BA.5.1.24 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | I3341V BA.5.1.24 |
| intergenic | M3345I BA.5.1.24 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | V3388V BA.5.1.24 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D3511N BA.5.1.24 |
| intergenic | D3526G BA.5.1.24 |
| intergenic | L3535L BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | T3575I BA.5.1.24 |
| ORF1a | I3576T / NSP6 |
| intergenic | I3576T BA.5.1.24 |
| intergenic | L3636L BA.5.1.24 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | M3684V BA.5.1.24 |
| intergenic | Y3744Y BA.5.1.24 |
| intergenic | Y3765C BA.5.1.24 |
| intergenic | V3815V BA.5.1.24 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24 |
| intergenic | C3867C BA.5.1.24 |
| intergenic | V3871V BA.5.1.24 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | T4083T BA.5.1.24 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | P4220L BA.5.1.24 |
| intergenic | L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | G4380G BA.5.1.24 |
| intergenic | R4447R BA.5.1.24 |
| intergenic | Q4473E BA.5.1.24 |
| intergenic | K4483E BA.5.1.24 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D4769D BA.5.1.24 |
| intergenic | P4804P BA.5.1.24 |
| intergenic | V4887V BA.5.1.24 |
| intergenic | T4983I BA.5.1.24 |
| intergenic | R5113C BA.5.1.24 |
| intergenic | D5130Y BA.5.1.24 |
| intergenic | D5130D BA.5.1.24 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D5152D BA.5.1.24 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24 |
| intergenic | P5319S BA.5.1.24 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24 |
| intergenic | P5377S BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | V5422F BA.5.1.24 |
| intergenic | L5454L BA.5.1.24 |
| ORF1b | T5465I / NSP13 |
| intergenic | T5465I BA.5.1.24 |
| intergenic | S5490L BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | Y5548C BA.5.1.24 |
| intergenic | A5662V BA.5.1.24 |
| intergenic | V5672L BA.5.1.24 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | T5737I BA.5.1.24 |
| intergenic | T5755I BA.5.1.24 |
| intergenic | I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24 |
| ORF1b | A5926S / NSP14 |
| intergenic | A5926S BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | D5955E BA.5.1.24 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| ORF1b | I6012I / NSP14 |
| intergenic | I6012I BA.5.1.24 |
| intergenic | P6046S BA.5.1.24 |
| ORF1b | D6069Y / NSP14 |
| intergenic | D6069Y BA.5.1.24 |
| intergenic | P6368S BA.5.1.24 |
| intergenic | F6370F BA.5.1.24 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | V6573V BA.5.1.24 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | K6741N BA.5.1.24 |
| intergenic | F6985F BA.5.1.10,BA.5.1.24 |
| intergenic | L7042L BA.5.1.24 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | V47V BA.5.1.24 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | K97K BA.5.1.24 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | N165Y BA.5.1.24 |
| S | N165Y BA.5.1.24 |
| intergenic | K182N BA.5.1.24 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | K444R BA.5.1.24 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L560L BA.5.1.24 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L629L BA.5.1.24 |
| intergenic | A647S BA.5.1.24 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | N657N BA.5.1.24 |
| intergenic | Q675H BA.5.1.24 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | I1130M BA.5.1.24 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | K1205N BA.5.1.24 |
| intergenic | G18V BA.5.1.24 |
| intergenic | I20I BA.1.17,BA.5.1.24 |
| intergenic | R30H BA.5.1.24 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | H78H BA.5.1.24 |
| intergenic | L94I BA.5.1.24 |
| intergenic | G100C BA.5.1.24 |
| intergenic | E102D BA.5.1.24 |
| ORF3a | E102D BA.5.1.24 |
| intergenic | H182H BA.5.1.24 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | V25V BA.5.1.24 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | Q19E BA.5.1.24 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | F100F BA.5.1.24 |
| intergenic | H148H BA.5.1.24 |
| intergenic | L181L BA.5.1.24 |
| intergenic | V5I BA.5.1.24 |
| intergenic | A12T BA.5.1.24 |
| intergenic | F22_D30del BA.5.1.24 |
| intergenic | Y31Y BA.5.1.24 |
| intergenic | K38K BA.5.1.24 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24 |
| intergenic | H19R BA.5.1.24 |
| ORF7a | H19R BA.5.1.24 |
| intergenic | H73Y BA.5.1.24 |
| intergenic | F101F BA.5.1.24 |
| intergenic | L116L BA.5.1.24 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | A14A BA.5.1.24 |
| intergenic | I121N BA.5.1.24 |
| intergenic | I121fs BA.5.1.24 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | Q9H BA.5.1.24 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D63Y BA.5.1.24 |
| intergenic | R89T BA.5.1.24 |
| N | R89T BA.5.1.24 |
| intergenic | P122S BA.5.1.24 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24 |
| intergenic | T245I BA.5.2.2,BA.5.1.24 |
| intergenic | Q289Q BA.5.1.24 |
| intergenic | A311T BA.5.1.24 |
| intergenic | R319R BA.5.1.24 |
| intergenic | T325I BA.5.1.24 |
| intergenic | T362I BA.5.1.24 |
| intergenic | D377Y BA.5.1.24 |
| intergenic | A398V BA.5.1.24 |
| intergenic | D401N BA.5.1.24 |
| intergenic | S413R BA.5.1.24 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34 |
| ORF1a | L39S / NSP1 |
| intergenic | L39S BA.5.2.3 |
| intergenic | R43C BA.5.2.3 |
| intergenic | L92L BA.2.86.1,BA.5.2.34 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34 |
| intergenic | K120N BA.5.2.3 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | R207C BA.5.2.3 |
| intergenic | R226K BA.5.2.3 |
| intergenic | S248S BA.5.2.3 |
| intergenic | T283I BA.5.2.3 |
| ORF1a | K292E / NSP2 |
| intergenic | K292E BA.5.2.3 |
| intergenic | P305S BA.5.1.10,BA.5.2.3 |
| intergenic | T350I BA.5.2.3 |
| intergenic | S376L BA.5.2.3 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3 |
| intergenic | A474A BA.5.2.3 |
| intergenic | S549S BA.5.2.3 |
| ORF1a | T554N / NSP2 |
| intergenic | T554N BA.5.2.3 |
| intergenic | M584V BA.5.2.3 |
| intergenic | L590F BA.5.2.3 |
| intergenic | D644D BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | V660V BA.5.2.3 |
| intergenic | K680K BA.5.2.3 |
| intergenic | T727I BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| ORF1a | P765L / NSP2 |
| intergenic | P765L BA.5.2.3 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A859A BA.5.2.3 |
| intergenic | A876T BA.5.2.3 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | N1436N BA.5.2.3 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | H1500Y BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| ORF1a | S1520Y / NSP3 |
| intergenic | S1520Y BA.5.2.3 |
| intergenic | I1525V BA.5.2.3 |
| ORF1a | F1553L / NSP3 |
| intergenic | F1553L BA.5.2.3 |
| intergenic | T1572I BA.5.2.3 |
| intergenic | K1655N BA.5.2.3 |
| intergenic | Y1658Y BA.5.2.3 |
| intergenic | R1953R BA.5.2.3 |
| intergenic | T2021I BA.5.2.3 |
| intergenic | A2033V BA.5.2.3 |
| ORF1a | I2076M / NSP3 |
| intergenic | I2076M BA.5.2.3 |
| ORF1a | P2079R / NSP3 |
| intergenic | P2079R BA.5.2.3 |
| intergenic | K2143K BA.5.2.3 |
| intergenic | T2247I BA.5.2.3 |
| ORF1a | T2484T / NSP3 |
| intergenic | T2484T BA.5.2.3 |
| intergenic | A2584V BA.5.2.3 |
| ORF1a | D2592Y / NSP3 |
| intergenic | D2592Y BA.5.2.3 |
| intergenic | S2625S BA.4,BA.5.2.3 |
| intergenic | L2675L BA.5.2.3 |
| intergenic | N2708N BA.5.2.3 |
| intergenic | N2768del BA.5.2.3 |
| intergenic | D2833D BA.5.2.3 |
| intergenic | V2892F BA.5.2.3 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A3061A BA.5.2.3 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | S3099L BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | F3100F BA.5.2.3 |
| intergenic | A3209V BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | F3271F BA.5.2.3 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L3321L BA.5.2.3 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | P3447P BA.5.2.3 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L3829L BA.5.2.3 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | P4197S BA.5.2.3 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A4357V BA.4,BA.5.2.3 |
| ORF1a | G4374S / NSP10 |
| intergenic | G4374S BA.5.2.3 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A4921V BA.5.2.3 |
| intergenic | I4928I BA.5.2.3 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| ORF1b | R5716S / NSP13 |
| intergenic | R5716S BA.5.2.3 |
| intergenic | F5746F BA.2.12,BA.5.2.3 |
| intergenic | V5819V BA.5.2.3 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | P6076L BA.5.2.3 |
| intergenic | N6424N BA.5.2.3 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | S6693S BA.5.2.3 |
| intergenic | G6890S BA.5.2.3 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3 |
| ORF1b | D6977G / NSP16 |
| intergenic | D6977G BA.5.2.3 |
| intergenic | T7032T BA.5.2.3 |
| intergenic | P7034S BA.5.2.3 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34 |
| intergenic | Y145_H146del BA.5.2.3 |
| intergenic | H146H BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | M153I BA.5.2.3 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L249S BA.5.2.3 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | R346S BA.4,BA.5.2.3 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | ST375FA BA.5.2.3 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | K444R BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | E484V BA.5.2.3 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.5.2.3 |
| intergenic | T547I BA.5.2.3 |
| intergenic | P561S BA.5.2.3 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | T618T BA.1.14,BA.5.2.3 |
| intergenic | A623V BA.5.2.3 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A694A BA.5.2.3 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L878L BA.5.2.3 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | P1162S BA.5.2.3 |
| intergenic | E1202Q BA.4.1.8,BA.5.2.3 |
| intergenic | A23V BA.5.2.3 |
| intergenic | Q38Q BA.5.2.3 |
| intergenic | S40L BA.5.2.3 |
| intergenic | L53L BA.5.2.3 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L71I BA.5.2.3 |
| intergenic | H78Y BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | H93Q BA.5.2.3 |
| intergenic | A99S BA.5.2.3 |
| intergenic | P104L BA.5.2.3 |
| intergenic | V112V BA.5.2.3 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | g.C-23T BA.5.2.3 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | I97V BA.5.2.3 |
| intergenic | H125N BA.5.2.3 |
| intergenic | I161I BA.5.2.3 |
| intergenic | L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | N207N BA.5.2.3 |
| intergenic | L4L BA.5.2.3 |
| intergenic | K23_Y31del BA.5.2.3 |
| intergenic | D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3 |
| intergenic | T28I BA.5.2.3 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | Y75Y BA.5.2.3 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | P36P BA.1.14,BA.5.2.34 |
| intergenic | D119D BA.5.2.3 |
| ORF8 | D119D BA.5.2.3 |
| intergenic | g.A-8T BA.5.2.3 |
| intergenic | g.A-3T BA.5.2.3 |
| intergenic | g.CTA-5_-3TTT BA.5.2.3 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | N8T BA.5.2.3 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | Y86Y BA.2.12,BA.5.2.3 |
| intergenic | D128E BA.5.2.3 |
| N | D128E BA.5.2.3 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3 |
| intergenic | I157I BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | Y172Y BA.5.2.3 |
| intergenic | G175G BA.2.12,BA.5.2.3 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | K299K BA.5.2.3 |
| intergenic | Y360Y BA.5.2.2,BA.5.2.3 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | g.C-13T BA.5.2.3 |
| intergenic | P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3 |
| intergenic | g.C-222T BA.4,BA.5 |
| intergenic | g.C-104T BA.5 |
| intergenic | g.G-67A BA.5 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | R24R BA.5 |
| intergenic | D25D BA.5 |
| intergenic | V26V BA.5 |
| intergenic | G32R BA.5 |
| intergenic | R43C BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | G49D BA.5.1.24,BA.5 |
| ORF1a | K58_L61delinsM / NSP1 |
| intergenic | K58_L61delinsM BA.5 |
| intergenic | R73C BA.5 |
| intergenic | G82_M85delinsV BA.5 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5 |
| intergenic | H83_M85del BA.5 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5 |
| intergenic | V84_V86del BA.5 |
| intergenic | M85del BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L92L BA.2.86.1,BA.5.2.34 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34 |
| intergenic | A117T BA.5 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | L219L BA.5 |
| ORF1a | P271P / NSP2 |
| intergenic | P305S BA.5.1.10,BA.5.2.3 |
| intergenic | A421A BA.5 |
| intergenic | S443S BA.5 |
| ORF1a | E452K / NSP2 |
| intergenic | E452K BA.5 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | G519S BA.5 |
| ORF1a | N522N / NSP2 |
| intergenic | N522N BA.5 |
| ORF1a | K527R / NSP2 |
| intergenic | K527R BA.5 |
| intergenic | F548S BA.5 |
| intergenic | Q556K BA.4,BA.5 |
| intergenic | L570L BA.5 |
| intergenic | L578L BA.5 |
| intergenic | L580F BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | V606V BA.5 |
| intergenic | E622G BA.5 |
| intergenic | V627F BA.5 |
| intergenic | D644D BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | W646L BA.5 |
| ORF1a | I652I / NSP2 |
| ORF1a | G661C / NSP2 |
| intergenic | G661C BA.5 |
| intergenic | I693T BA.5 |
| intergenic | Y717Y BA.5 |
| intergenic | T727I BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | I740I BA.2.12,BA.5 |
| intergenic | V774V BA.5 |
| intergenic | T796T BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | P820L BA.5 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | N869N BA.5 |
| intergenic | F871F BA.5 |
| intergenic | T882I BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | T891I BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| ORF1a | D930Y / NSP3 |
| intergenic | D930Y BA.5 |
| intergenic | P971L BA.5 |
| intergenic | T1001I BA.2.12,BA.5.1.10 |
| ORF1a | S1102R / NSP3 |
| intergenic | S1102R BA.5 |
| intergenic | H1141Y BA.5 |
| intergenic | P1213L BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | D1273D BA.5 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | Y1337Y BA.5 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | F1353fs BA.5.1.10,BA.5 |
| intergenic | A1397A BA.2.12,BA.5 |
| intergenic | L1438L BA.1.14,BA.5.2.2 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | T1444A BA.5 |
| intergenic | G1456G BA.5 |
| intergenic | N1487N BA.5 |
| intergenic | H1500Y BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | Y1658Y BA.5.2.3,BA.5 |
| ORF1a | M1771V / NSP3 |
| intergenic | M1771V BA.5 |
| intergenic | P1786L BA.5 |
| intergenic | C1847C BA.5 |
| intergenic | Y1868Y BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | L1896L BA.5 |
| intergenic | V1915I BA.5 |
| intergenic | N1922N BA.5 |
| intergenic | H1974Y BA.5 |
| intergenic | T2007T BA.5 |
| intergenic | M2096L BA.5 |
| ORF1a | T2197I / NSP3 |
| intergenic | V2238V BA.5 |
| intergenic | I2244I BA.5 |
| ORF1a | F2328L / NSP3 |
| intergenic | F2328L BA.5 |
| intergenic | P2376P BA.5 |
| intergenic | Y2560Y BA.5 |
| intergenic | A2584V BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | S2625S BA.4,BA.5.2.3 |
| intergenic | A2637T BA.5 |
| intergenic | L2675L BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | A2710T BA.2.86.1,BA.1.14,BA.1.17,BA.5 |
| ORF1a | P2739P / NSP3 |
| intergenic | P2739P BA.5 |
| intergenic | M2796I BA.5.1.10,BA.5 |
| ORF1a | H2831H / NSP4 |
| intergenic | H2831H BA.5 |
| intergenic | P2870P BA.5.2.34,BA.5 |
| intergenic | N2894N BA.1.14,BA.5.1.10 |
| intergenic | S2900L BA.5 |
| intergenic | S2992S BA.5 |
| intergenic | F3018F BA.4,BA.5 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | Y3062Y BA.5 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | S3099L BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | A3209V BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | F3271F BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | H3327H BA.5 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5 |
| ORF1a | T3361T / NSP5 |
| intergenic | T3361T BA.5 |
| ORF1a | P3371T / NSP5 |
| intergenic | P3371T BA.5 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | P3395Y BA.5 |
| intergenic | G3437G BA.4,BA.5 |
| intergenic | P3504L BA.5 |
| intergenic | L3535L BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5 |
| intergenic | F3604L BA.5 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | M3627I BA.5 |
| intergenic | A3645A BA.5 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | A3705A BA.5 |
| intergenic | L3796L BA.2.12,BA.5 |
| intergenic | L3828L BA.5 |
| intergenic | N3928N BA.5 |
| intergenic | N3937N BA.5 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | L4149L BA.5 |
| intergenic | N4173N BA.5 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24 |
| ORF1a | G4178V / NSP9 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | N4235N BA.4,BA.5 |
| intergenic | Y4283Y BA.5 |
| intergenic | L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | T4355I BA.5 |
| intergenic | A4357V BA.4,BA.5.2.3 |
| intergenic | K4377N BA.5 |
| intergenic | L4391F BA.5 |
| intergenic | G4417G BA.5 |
| intergenic | L4482F BA.5 |
| intergenic | K4483R BA.5 |
| ORF1b | L4519I / NSP12 |
| intergenic | L4519I BA.5 |
| intergenic | N4560N BA.5 |
| intergenic | Y4567Y BA.5 |
| intergenic | A4568A BA.5 |
| intergenic | T4638T BA.5 |
| intergenic | R4641S BA.5 |
| intergenic | T4654I BA.5 |
| intergenic | P4715F BA.5.2.2,BA.4,BA.5 |
| intergenic | P4715L BA.5.2.2,BA.4,BA.5 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | S4843S BA.5 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5 |
| intergenic | M4993I BA.5 |
| intergenic | N5020N BA.1.17,BA.5 |
| intergenic | T5036T BA.5 |
| intergenic | G5063C BA.5 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5 |
| intergenic | D5132Y BA.5 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| ORF1b | Y5180Y / NSP12 |
| intergenic | Y5180Y BA.5 |
| intergenic | H5208H BA.5 |
| ORF1b | Q5214L / NSP12 |
| intergenic | Q5214L BA.5 |
| intergenic | L5221F BA.5 |
| intergenic | Y5223Y BA.5 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | F5273F BA.5 |
| intergenic | D5302D BA.5 |
| intergenic | V5322V BA.5 |
| intergenic | C5332C BA.5 |
| intergenic | P5377S BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | S5490L BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | I5658V BA.5 |
| intergenic | V5672L BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | P5726P BA.5 |
| intergenic | F5746F BA.2.12,BA.5.2.3 |
| intergenic | I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24 |
| intergenic | T5805M BA.5 |
| intergenic | R5826R BA.5 |
| ORF1b | A5926S / NSP14 |
| intergenic | A5926S BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | T5956I BA.5.2.2,BA.5 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | D5973N BA.5 |
| intergenic | E6017E BA.5 |
| intergenic | A6044V BA.5 |
| ORF1b | P6083L / NSP14 |
| intergenic | P6083L BA.5 |
| intergenic | P6222L BA.5 |
| intergenic | D6249D BA.5 |
| intergenic | D6256D BA.5.2.2,BA.5 |
| ORF1b | S6282N / NSP14 |
| intergenic | S6282N BA.5 |
| intergenic | D6315G BA.5 |
| intergenic | DRYP6315EGCH BA.2.12,BA.5 |
| intergenic | Y6317Y BA.5 |
| intergenic | N6335N BA.5 |
| intergenic | L6393L BA.5 |
| intergenic | L6420L BA.5 |
| intergenic | M6425T BA.5 |
| intergenic | N6446N BA.4.1.8,BA.5 |
| intergenic | D6491N BA.5 |
| intergenic | L6509L BA.5 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | V6573V BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | D6576D BA.5 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | G6598S BA.5 |
| intergenic | F6628F BA.5 |
| intergenic | G6738C BA.5 |
| intergenic | S6760S BA.5 |
| intergenic | T6777I BA.5 |
| intergenic | L6797L BA.5 |
| intergenic | A6832V BA.5 |
| intergenic | R6884K BA.5 |
| intergenic | L6924F BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | T6938I BA.2.12,BA.5 |
| intergenic | G6953G BA.4.1.8,BA.5 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | F6985F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | A6997A BA.4,BA.5 |
| intergenic | L7070S BA.5 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | S12_T20del BA.5 |
| S | S12_T20del BA.5 |
| intergenic | T19I BA.5 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | D53D BA.5 |
| intergenic | S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | H69del BA.1.14,BA.1.17,BA.5 |
| intergenic | V70del BA.1.14,BA.1.17,BA.5 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | V127F BA.2.86.1,BA.5.2.2 |
| intergenic | D138_Y144del BA.5 |
| intergenic | G142D BA.5 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.5 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34 |
| intergenic | H146Y BA.5 |
| intergenic | H146H BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | S172S BA.5 |
| S | S172S BA.5 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | I231T BA.5 |
| intergenic | P251H BA.5 |
| intergenic | S255F BA.5 |
| intergenic | P272L BA.5 |
| intergenic | D294D BA.5.1.10,BA.5 |
| intergenic | L296L BA.5.2.2,BA.5 |
| intergenic | T299I BA.5 |
| intergenic | K304K BA.5 |
| S | K304K BA.5 |
| intergenic | F306L BA.5 |
| S | F306L BA.5 |
| intergenic | V327V BA.5 |
| S | V327V BA.5.5,BA.5 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | R346S BA.4,BA.5.2.3 |
| intergenic | N354N BA.5 |
| intergenic | R357K BA.5 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | R403K BA.2.86.1,BA.5 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | C432C BA.5 |
| intergenic | N440K BA.5 |
| intergenic | N440R BA.5 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | K444R BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | VG445AS BA.5 |
| intergenic | N448S BA.2.12,BA.5 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | N460S BA.5 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5 |
| intergenic | ST477DK BA.5 |
| S | ST477DK BA.5 |
| intergenic | ST477NK BA.5 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | E484A BA.5 |
| intergenic | VE483RA BA.5 |
| S | VE483RA BA.5 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.5.2.3 |
| intergenic | T547I BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | N603N BA.4.1.8,BA.5.1.10 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | T618T BA.1.14,BA.5.2.3 |
| intergenic | L629V BA.5 |
| S | L629V BA.5 |
| S | L629L BA.5.1.24,BA.5.5,BF.9 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | P665P BA.5 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | A684V BA.5 |
| intergenic | A688V BA.5.2.34,BA.5 |
| intergenic | V736I BA.5 |
| S | V736I BA.5 |
| intergenic | T739T BA.5 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | A879A BA.5 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | N960N BA.5 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| S | V1133V BA.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | P1143S BA.5 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | D1153Y BA.5 |
| intergenic | P1162S BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | E1202Q BA.4.1.8,BA.5.2.3 |
| intergenic | M5T BA.5 |
| intergenic | I20I BA.1.17,BA.5.1.24 |
| intergenic | A23S BA.5 |
| intergenic | D27Y BA.4.1.8,BA.5 |
| intergenic | V55A BA.5 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | L71L BA.5 |
| intergenic | H78Y BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | Y91Y BA.5 |
| intergenic | A99T BA.5 |
| intergenic | L106L BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | V112V BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | C148C BA.5.1.10,BA.5 |
| intergenic | T170T BA.5 |
| intergenic | E194G BA.5 |
| intergenic | Y206Y BA.4,BA.5 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | S272S BA.5 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | V17V BA.5 |
| intergenic | L73L BA.5 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L56L BA.4,BA.5 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L102L BA.5 |
| intergenic | L124L BA.2.12,BA.4,BA.5 |
| intergenic | H125Y BA.5 |
| intergenic | H148H BA.5.1.24,BA.5 |
| M | H148H BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | T172T BA.5 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5 |
| intergenic | L29L BA.5 |
| intergenic | Y31Y BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3 |
| intergenic | X62fs BA.5 |
| ORF6 | X62fs BA.5 |
| intergenic | g.-7_-4delAACG BA.5 |
| ORF6 | g.-7_-4delAACG BA.5 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | g.C-1T BA.5 |
| intergenic | T11K BA.5 |
| intergenic | C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | T28I BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | H47N BA.5 |
| intergenic | Q62X BA.5 |
| intergenic | V74I BA.5 |
| ORF7a | V74I BA.5.2.20,BA.5 |
| intergenic | Y75C BA.5 |
| intergenic | P84L BA.5.2.2,BA.4,BA.5 |
| intergenic | L116L BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | Q35K BA.5 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | H17H BA.5.2.34,BA.5 |
| intergenic | Q18X BA.5 |
| intergenic | P36L BA.5 |
| intergenic | P36P BA.1.14,BA.5.2.34 |
| intergenic | E59E BA.5 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5 |
| intergenic | I71T BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| ORF8 | H112H BA.2.3,BA.5.1.30 |
| intergenic | I121fs BA.5 |
| intergenic | g.A-3T BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | g.CTA-5_-3TTT BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | G5E BA.5 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | G25V BA.5 |
| N | G25V BA.5 |
| intergenic | N27N BA.5 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | G30_S33delinsF BA.4,BA.5 |
| intergenic | T49I BA.5 |
| intergenic | K65R BA.5 |
| intergenic | P67L BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | D82D BA.5 |
| intergenic | Y86Y BA.2.12,BA.5.2.3 |
| intergenic | A119S BA.5 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3 |
| intergenic | H145H BA.5 |
| intergenic | P151S BA.4,BA.5 |
| intergenic | P151L BA.5 |
| intergenic | I157I BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | L161F BA.5 |
| intergenic | G175G BA.2.12,BA.5.2.3 |
| intergenic | P199S BA.5 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | L219F BA.5 |
| intergenic | G243G BA.5 |
| intergenic | T245I BA.5.2.2,BA.5.1.24 |
| intergenic | E253E BA.5 |
| intergenic | Y268Y BA.5.1.10,BA.5 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5 |
| N | Q289Q BA.5.1.24,BA.5.1.30 |
| intergenic | H300H BA.5 |
| intergenic | P302S BA.5 |
| intergenic | D341D BA.4.1.8,BA.5 |
| intergenic | Y360Y BA.5.2.2,BA.5.2.3 |
| intergenic | T366T BA.5 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | V6I BA.5 |
| intergenic | P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | M21I BA.5 |
| ORF10 | M21I BA.5 |
| intergenic | S23F BA.5 |
| intergenic | R24C BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | g.T29685G BA.5 |
| intergenic | g.G29692T BA.5 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAG BA.5 |
| intergenic | g.C-80T BA.5.1.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | E36E BA.5.1.1 |
| intergenic | G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.1 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | V111A BA.5.1.1 |
| intergenic | V121F BA.5.1.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | I222V BA.5.1.1 |
| intergenic | S279F BA.5.1.1 |
| intergenic | S318L BA.5.1.1 |
| intergenic | P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | A498V BA.5.1.1 |
| intergenic | A599A BA.5.1.1 |
| intergenic | V606V BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | G618S BA.5.1.1 |
| intergenic | T727I BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | G817G BA.5.1.1 |
| intergenic | IT841VI BA.5.1.1 |
| intergenic | T842I BA.5.1.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | T882I BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | E929E BA.5.1.1 |
| intergenic | T1001I BA.2.12,BA.5.1.10 |
| ORF1a | K1124Q / NSP3 |
| intergenic | K1124Q BA.5.1.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| ORF1a | Y1536C / NSP3 |
| intergenic | Y1536C BA.5.1.1 |
| intergenic | S1743F BA.5.1.1 |
| ORF1a | M2254R / NSP3 |
| intergenic | M2254R BA.5.1.1 |
| intergenic | T2274I BA.5.1.1 |
| intergenic | D2299D BA.4,BA.5.1.1 |
| intergenic | A2325A BA.5.1.1 |
| intergenic | L2524S BA.5.1.1 |
| intergenic | S2631S BA.5.1.1 |
| intergenic | A2784V BA.5.1.1 |
| intergenic | N2894N BA.1.14,BA.5.1.10 |
| intergenic | V3024I BA.5.1.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | L3430L BA.5.1.1 |
| intergenic | D3439D BA.5.2.34,BA.5.1.1 |
| intergenic | T3459T BA.5.1.1 |
| intergenic | L3495F BA.5.1.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5 |
| ORF1a | A3625T / NSP6 |
| intergenic | A3625T BA.5.1.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | V3708V BA.5.1.1 |
| intergenic | I3853I BA.5.1.10,BA.5.1.1 |
| intergenic | N3896N BA.5.1.1 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| ORF1a | T4079I / NSP8 |
| intergenic | T4079I BA.5.1.1 |
| intergenic | T4083M BA.5.1.1 |
| intergenic | G4178V BA.5.1.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | P4220L BA.5.1.24,BA.5.1.1 |
| intergenic | N4235N BA.4,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | V4372I BA.5.1.1 |
| ORF1a | M4390T / NSP10 |
| intergenic | M4390T BA.5.1.1 |
| intergenic | L4639L BA.5.1.1 |
| intergenic | T4640T BA.5.1.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1 |
| intergenic | Y4871Y BA.5.1.1 |
| ORF1b | L4906F / NSP12 |
| intergenic | L4906F BA.5.1.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | N5182N BA.5.1.1 |
| intergenic | A5660T BA.5.1.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | V6016V BA.5.1.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | H6686Y BA.5.1.1 |
| ORF1b | Q6696R / NSP15 |
| intergenic | Q6696R BA.5.1.1 |
| intergenic | V6772L BA.5.2.2,BA.5.1.1 |
| intergenic | P6860P BA.5.1.1 |
| intergenic | T6918I BA.5.1.1 |
| intergenic | L6924F BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | A6997A BA.4,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | G7011N BA.5.1.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | D53D BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1 |
| intergenic | G72G BA.5.1.1 |
| intergenic | D80H BA.5.1.1 |
| intergenic | D80D BA.5.1.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1 |
| intergenic | H146del BA.5.1.1 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | D215H BA.5.1.1 |
| intergenic | G261V BA.5.1.1 |
| intergenic | I285I BA.5.1.1 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.5.2.3 |
| intergenic | N603N BA.4.1.8,BA.5.1.10 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | Q690L BA.5.1.1 |
| S | Q690L BA.5.1.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | A846A BA.5.1.1 |
| intergenic | R847K BA.5.1.1 |
| S | R847K BA.5.1.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | I1169I BA.5.1.1 |
| intergenic | E1195E BA.5.1.1 |
| S | E1195E BA.5.1.1 |
| intergenic | Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1 |
| intergenic | C1236S BA.5.1.1 |
| S | C1236S BA.5.1.1 |
| intergenic | S1252P BA.5.1.1 |
| intergenic | K21N BA.5.1.10,BA.5.1.1 |
| intergenic | V48F BA.5.1.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | L94I BA.5.1.24,BA.5.1.1 |
| intergenic | L95F BA.5.1.1 |
| intergenic | L106L BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | V25V BA.5.1.24,BA.5.1.1 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | L124L BA.2.12,BA.4,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | H125Y BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | V143V BA.5.1.1 |
| intergenic | g.C-6T BA.5.1.1 |
| intergenic | L16L BA.5.1.1 |
| intergenic | C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | T39I BA.5.1.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | I71T BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | Y105Y BA.5.1.1 |
| intergenic | I121fs BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | D22G BA.5.1.1 |
| intergenic | G25D BA.5.1.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | P67L BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | A182T BA.5.1.1 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | H300Y BA.5.1.1 |
| intergenic | F315F BA.5.1.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | R24C BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | A735A BA.1.14,BA.1.18 |
| intergenic | K856R BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | A964A BA.1.18 |
| intergenic | A1707A BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | N1709N BA.1.18 |
| intergenic | T1822I BA.1.18 |
| intergenic | S2083_L2084delinsI BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | A2710T BA.2.86.1,BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | P3395H BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | L3674_G3676del BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | I3758V BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | V4310V BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| ORF1b | P6519S / NSP15 |
| intergenic | P6519S BA.1.18 |
| intergenic | V11V BA.5.2.34,BA.1.18 |
| intergenic | H69del BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18 |
| intergenic | V70del BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18 |
| intergenic | T95I BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | G142_Y145delinsD BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | N211_L212delinsI BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | R214_D215insEPE BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | R346K BA.1.18 |
| intergenic | S371L BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | S375F BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | G446S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | Q493R BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | G496S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | T547K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | N856K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | L981F BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | D155Y BA.1.18 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | D3G BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18 |
| intergenic | R24L BA.1.18 |
| intergenic | g.C29774T BA.1.18 |
| intergenic | g.C-49T BA.5.2.8 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | G49C BA.5.2.8 |
| intergenic | G49D BA.5.1.24,BA.5,BA.5.2.8 |
| intergenic | G82_V86del BA.5.2.8 |
| intergenic | M85_E87delinsK BA.5.2.8 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | G137G BA.5.2.8 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | V378I BA.4,BA.5.2.8 |
| intergenic | N449N BA.5.2.8 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | V459V BA.5.2.8 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8 |
| intergenic | E913G BA.5.2.8 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | H1108H BA.5.2.8 |
| intergenic | H1141Y BA.5,BA.5.2.8 |
| intergenic | Q1227Q BA.5.2.8 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | F1353fs BA.5.1.10,BA.5,BA.5.2.8 |
| intergenic | T1597T BA.5.2.8 |
| intergenic | K1781K BA.5.2.8 |
| intergenic | P1786S BA.5.2.8 |
| intergenic | V1931V BA.5.2.8 |
| intergenic | S1978F BA.5.2.8 |
| intergenic | A2033V BA.5.2.3,BA.5.2.8 |
| intergenic | S2242F BA.5.2.34,BA.5.2.8 |
| intergenic | D2299D BA.4,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | T2335T BA.5.2.8 |
| intergenic | N2678N BA.5.2.8 |
| intergenic | L2869F BA.5.2.8 |
| intergenic | G2941S BA.5.2.8 |
| intergenic | S2960P BA.5.2.8 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | L3198L BA.2.12,BA.5.2.8 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | T3258T BA.5.2.8 |
| intergenic | F3271F BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | D3479D BA.5.2.8 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | I3738I BA.5.2.8 |
| intergenic | Y3803Y BA.2.12,BA.5.2.8 |
| intergenic | A3856A BA.5.2.8 |
| intergenic | L3887L BA.5.2.8 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | L3984L BA.5.2.8 |
| intergenic | Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8 |
| intergenic | L4037F BA.5.2.8 |
| ORF1a | Q4151R / NSP9 |
| intergenic | Q4151R BA.5.2.8 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | V4372V BA.5.2.8 |
| intergenic | K4483N BA.5.2.8 |
| intergenic | Y4555Y BA.5.2.8 |
| intergenic | T4617T BA.5.2.8 |
| intergenic | T4638T BA.5,BA.5.2.8 |
| ORF1b | D4661D / NSP12 |
| intergenic | D4661D BA.5.2.8 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | T4786M BA.5.2.8 |
| ORF1b | G5062V / NSP12 |
| intergenic | G5062V BA.5.2.8 |
| intergenic | Y5140Y BA.5.2.8 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | T5195I BA.5.2.8 |
| intergenic | L5349L BA.5.2.8 |
| intergenic | P5371L BA.5.1.10,BA.5.2.8 |
| intergenic | T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8 |
| intergenic | R5453K BA.5.2.8 |
| intergenic | K5463K BA.5.2.8 |
| intergenic | A5620S BA.5.2.8 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | D5725D BA.5.2.8 |
| intergenic | I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5.2.8 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | D6051D BA.5.2.8 |
| ORF1b | F6108L / NSP14 |
| intergenic | F6108L BA.5.2.8 |
| ORF1b | I6200T / NSP14 |
| intergenic | I6200T BA.5.2.8 |
| ORF1b | V6207C / NSP14 |
| intergenic | V6207C BA.5.2.8 |
| intergenic | N6347N BA.5.2.8 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | L6614F BA.5.2.8 |
| ORF1b | M6670K / NSP15 |
| intergenic | M6670K BA.5.2.8 |
| ORF1b | L6697L / NSP15 |
| intergenic | L6697L BA.5.2.8 |
| intergenic | Y6794Y BA.5.2.8 |
| intergenic | L6819L BA.5.2.2,BA.5.2.8 |
| intergenic | L6898F BA.5.2.8 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | F59S BA.5.2.8 |
| intergenic | S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.8 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | L84L BA.5.2.8 |
| intergenic | K97N BA.5.2.8 |
| intergenic | V130V BA.5.2.8 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | E180G BA.5.2.8 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | P631P BA.5.2.8 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | N658D BA.5.2.8 |
| S | N658D BA.5.2.8 |
| intergenic | P665P BA.5,BA.5.2.8 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | F855F BA.5.2.8 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | A1020S BA.4,BA.5.2.8 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | A51T BA.5.2.8 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | P138P BA.5.2.8 |
| intergenic | S180P BA.5.2.8 |
| ORF3a | S180P BA.5.2.8 |
| intergenic | Y211Y BA.5.2.8 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | I249I BA.5.2.8 |
| intergenic | P258L BA.5.2.8 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | M84V BA.5.2.8 |
| M | M84V BA.5.2.8 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8 |
| intergenic | V122V BA.5.2.8 |
| intergenic | P132P BA.5.2.8 |
| intergenic | L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8 |
| intergenic | T21I BA.5.2.8 |
| intergenic | P34L BA.5.2.8 |
| intergenic | S36_T39del BA.5.2.8 |
| ORF7a | S36_T39del BA.5.2.8 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.8 |
| intergenic | D69D BA.1.14,BA.5.2.8 |
| intergenic | H73Y BA.5.1.24,BA.5.2.8 |
| intergenic | L77S BA.5.2.8 |
| intergenic | P99S BA.5.2.8 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | C25S BA.5.2.8 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8 |
| intergenic | S194L BA.5.2.8 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | K248K BA.5.2.8 |
| N | K248K BA.5.2.8 |
| intergenic | A376A BA.5.2.8 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8 |
| intergenic | g.C29696T BA.5.2.8 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | G82_M85delinsV BF.20 |
| intergenic | G112G BF.20 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| ORF1a | T677A / NSP2 |
| intergenic | T677A BF.20 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| ORF1a | D978N / NSP3 |
| intergenic | D978N BF.20 |
| ORF1a | S984I / NSP3 |
| intergenic | S984I BF.20 |
| intergenic | K1231E BF.20 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | P1921S BF.20 |
| intergenic | V2238V BA.5,BF.20 |
| ORF1a | T2274N / NSP3 |
| intergenic | T2274N BF.20 |
| intergenic | G2987G BF.20 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | D5271G BF.20 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10,BF.20 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T172T BA.5,BF.20 |
| intergenic | P57L BF.20 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | A419A BF.20 |
| intergenic | g.C29686G BF.20 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | H13Y BA.5.1.2 |
| intergenic | L16L BA.5.1.2 |
| intergenic | S17_L18delinsM BA.5.1.2 |
| intergenic | M85del BA.5.1.2 |
| intergenic | M85del BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | P153L BA.5.1.2 |
| intergenic | S166G BA.5.1.2 |
| intergenic | V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | P271S BA.5.1.2 |
| intergenic | P309Q BA.5.1.2 |
| intergenic | G334C BA.5.1.2 |
| ORF1a | K394N / NSP2 |
| intergenic | K394N BA.5.1.2 |
| intergenic | L446F BA.5.1.2 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L580F BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | A591V BA.5.1.10,BA.5.1.2 |
| intergenic | V665V BA.5.1.2 |
| intergenic | A698V BA.5.1.2 |
| intergenic | F741F BA.5.1.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | A872A BA.5.1.2 |
| intergenic | T891I BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | A967S BA.5.1.2 |
| intergenic | P971L BA.5,BA.5.1.2 |
| intergenic | L1097L BA.5.1.2 |
| intergenic | G1155C BA.5.1.2 |
| intergenic | I1203I BA.5.1.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | Y1337Y BA.5,BA.5.1.2 |
| intergenic | K1350R BA.5.1.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | F1353fs BA.5.1.10,BA.5,BA.5.2.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | L1445L BA.5.1.2 |
| intergenic | L1643L BA.5.1.2 |
| intergenic | T1760I BA.5.1.2 |
| intergenic | C1847C BA.5,BA.5.1.2 |
| intergenic | Y1868Y BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | D2101D BA.5.1.24,BA.5.1.2 |
| intergenic | T2183I BA.5.1.2 |
| ORF1a | T2197I / NSP3 |
| intergenic | T2197I BA.5.1.2 |
| intergenic | S2242F BA.5.2.34,BA.5.2.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | C2445C BA.4.1.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | N2523N BA.5.1.2 |
| ORF1a | G2842G / NSP4 |
| intergenic | G2842G BA.5.1.2 |
| intergenic | G2871G BA.5.1.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | N3029N BA.5.1.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | N3239N BA.5.1.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | S3273S BA.5.1.2 |
| intergenic | N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | K3351R BA.5.1.2 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | P3359S BA.5.1.10,BA.5.1.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | L3535L BA.2.12,BA.5.1.24 |
| ORF1a | M3539I / NSP5 |
| intergenic | M3539I BA.5.1.2 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | A3615V BA.5.1.2 |
| intergenic | D3671D BA.5.1.2 |
| intergenic | T3672N BA.5.1.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2 |
| intergenic | L3919F BA.5.1.2 |
| intergenic | D3936D BA.5.1.2 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D4020D BA.5.1.2 |
| intergenic | T4083M BA.5.1.1,BA.5.1.2 |
| intergenic | Y4172Y BA.5.1.2 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | T4217I BA.5.1.2 |
| intergenic | L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A4396V BA.5.1.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D4769D BA.5.1.24,BA.5.1.2 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2 |
| ORF1b | L5055L / NSP12 |
| intergenic | L5055L BA.5.1.2 |
| intergenic | D5130D BA.5.1.24,BA.5.1.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | Y5220Y BA.5.2.34,BA.5.1.2 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.2 |
| ORF1b | M5298I / NSP12 |
| intergenic | M5298I BA.5.1.2 |
| intergenic | P5377S BA.4,BA.5.1.24 |
| ORF1b | T5385N / NSP13 |
| intergenic | T5385N BA.5.1.2 |
| intergenic | Y5388Y BA.2.12,BA.5.1.2 |
| intergenic | S5404G BA.5.1.2 |
| intergenic | S5490L BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2 |
| intergenic | S5701S BA.5.1.2 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5.2.8 |
| intergenic | V5819V BA.5.2.3,BA.5.1.2 |
| intergenic | P5828S BA.5.2.34,BA.5.1.2 |
| intergenic | T5871A BA.5.1.2 |
| ORF1b | A5926S / NSP14 |
| intergenic | A5926S BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D6270G BA.5.1.2 |
| intergenic | P6376S BA.5.1.2 |
| intergenic | N6443N BA.5.1.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | E6597D BA.5.1.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | V6638V BA.5.1.2 |
| intergenic | H6686Y BA.5.1.1,BA.5.1.2 |
| intergenic | L6819L BA.5.2.2,BA.5.2.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | A6914V BA.5.1.2 |
| intergenic | D6931D BA.5.1.2 |
| intergenic | F6985F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2 |
| intergenic | T19I BA.5.2.2,BA.5.1.2 |
| intergenic | T19L BA.5.2.2,BA.5.1.2 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | T29I BA.5.1.2 |
| intergenic | F32F BA.5.1.10,BA.5.1.2 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | V83V BA.5.1.10,BA.5.1.2 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D178N BA.5.1.2 |
| intergenic | F186F BA.5.1.2 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | S256L BA.5.1.2 |
| intergenic | T299I BA.5,BA.5.1.2 |
| intergenic | T307I BA.5.1.2 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D427D BA.5.1.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | N450I BA.5.1.2 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | P621P BA.5.1.2 |
| S | P621P BA.5.1.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D936D BA.5.1.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | T9K BA.5.1.2 |
| intergenic | I20I BA.1.17,BA.5.1.24 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | L73L BA.5.1.2 |
| intergenic | S177I BA.5.1.2 |
| intergenic | F207F BA.5.1.2 |
| intergenic | Y211C BA.5.1.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | P240L BA.5.1.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | L19L BA.5.1.2 |
| intergenic | S55F BA.5.1.2 |
| intergenic | N66N BA.5.1.2 |
| intergenic | AD2VN BA.5.1.2 |
| intergenic | D3N BA.5.1.2 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8 |
| intergenic | V5I BA.5.1.24,BA.5.1.2 |
| intergenic | L16L BA.5.1.1,BA.5.1.2 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2 |
| intergenic | L31L BA.5.1.2 |
| intergenic | F54L BA.5.1.2 |
| intergenic | L86L BA.5.1.2 |
| intergenic | L116F BA.4.1.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | A51V BA.5.1.2 |
| intergenic | S69P BA.5.1.2 |
| intergenic | P70T BA.5.1.2 |
| ORF8 | P70T BA.5.1.2 |
| intergenic | S103L BA.5.1.2 |
| intergenic | E106X BA.5.1.2 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | T54T BA.5.1.2 |
| intergenic | S78S BA.5.1.2 |
| intergenic | G114G BA.5.1.2 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | N140N BA.5.1.2 |
| intergenic | A152S BA.5.1.10,BA.5.1.2 |
| intergenic | A155V BA.5.2.34,BA.5.1.2 |
| intergenic | G178G BA.5.1.2 |
| intergenic | S197S BA.5.1.2 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | T245I BA.5.2.2,BA.5.1.24 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | g.G-5T BA.5.1.2 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2 |
| intergenic | g.G29706A BA.5.1.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| ORF1a | L204L / NSP2 |
| intergenic | L204L BF.41 |
| intergenic | S443F BA.5.2.2,BF.41 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S944L BF.41 |
| intergenic | N1094_G1095delinsR BF.41 |
| intergenic | P1158S BF.41 |
| intergenic | I1232I BF.41 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | H1818Y BF.41 |
| intergenic | S2389L BF.41 |
| intergenic | Y2560Y BA.5,BF.41 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | F3329F BF.41 |
| intergenic | P3371S BF.41 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | L3591I BF.41 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| ORF1b | F4834fs / NSP12 |
| intergenic | F4834fs BF.41 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | F5958F BF.41 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | Y5989Y BF.41 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | G257V BF.41 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | N777N BF.41 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | H1101Y BF.41 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | K192K BF.41 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | T172T BA.5,BF.20,BF.41 |
| ORF6 | A12V BF.41 |
| intergenic | D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3,BF.41 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | A43V BF.41 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | V62L BF.41 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41 |
| intergenic | S21S BF.41 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S193T BF.41 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | g.CGTC-25_-22TGTT BF.9 |
| intergenic | V35V BF.9 |
| intergenic | G133G BF.9 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5,BF.9 |
| intergenic | D264D BF.9 |
| intergenic | S302F BA.5.1.24,BF.9 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9 |
| intergenic | I502V BF.9 |
| intergenic | A516V BF.9 |
| intergenic | M584V BA.5.2.3,BF.9 |
| intergenic | V606I BF.9 |
| intergenic | I616I BF.9 |
| ORF1a | P777L / NSP2 |
| intergenic | P777L BF.9 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| ORF1a | T1001N / NSP3 |
| intergenic | T1001N BF.9 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | E1340D BF.9 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | T1521I BF.9 |
| ORF1a | F1527L / NSP3 |
| intergenic | F1527L BF.9 |
| intergenic | T1543I BF.9 |
| intergenic | T1597I BF.9 |
| ORF1a | V1661V / NSP3 |
| intergenic | V1661V BF.9 |
| intergenic | T1665T BF.9 |
| intergenic | G1764S BF.9 |
| intergenic | Y1873Y BA.5.1.10,BF.9 |
| ORF1a | S2048Y / NSP3 |
| intergenic | S2048Y BF.9 |
| intergenic | G2091G BF.9 |
| intergenic | D2101D BA.5.1.24,BA.5.1.2,BF.9 |
| intergenic | S2103F BA.2.86.1,BF.9 |
| intergenic | S2193F BF.9 |
| intergenic | V2238V BA.5,BF.20,BF.9 |
| ORF1a | R2267K / NSP3 |
| intergenic | R2267K BF.9 |
| intergenic | G2322G BF.9 |
| intergenic | V2324F BF.9 |
| ORF1a | A2733A / NSP3 |
| intergenic | A2733A BF.9 |
| intergenic | S2803L BF.9 |
| intergenic | A2856V BF.9 |
| intergenic | R2985R BF.9 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | F3100F BA.5.2.3,BF.9 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2,BF.9 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| ORF1a | Q3596H / NSP6 |
| intergenic | Q3596H BF.9 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9 |
| intergenic | L3644F BF.9 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| ORF1a | V3708L / NSP6 |
| intergenic | V3708L BF.9 |
| intergenic | F3785F BF.9 |
| intergenic | Y3813Y BF.9 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | D4317D BF.9 |
| intergenic | P4619L BF.9 |
| intergenic | T4638I BF.9 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | D4769D BA.5.1.24,BA.5.1.2,BF.9 |
| intergenic | P4897P BF.9 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | Y5276Y BF.9 |
| intergenic | A5342V BA.4,BF.9 |
| intergenic | A5532V BF.9 |
| intergenic | A5713V BF.9 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | A5727S BF.9 |
| ORF1b | T5873A / NSP13 |
| intergenic | T5873A BF.9 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | T6038I BF.9 |
| ORF1b | V6241F / NSP14 |
| intergenic | V6241F BF.9 |
| ORF1b | P6545P / NSP15 |
| intergenic | P6545P BF.9 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| ORF1b | D6734Y / NSP15 |
| intergenic | D6734Y BF.9 |
| intergenic | S6740F BF.9 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | F55F BF.9 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | H146H BA.2.12,BA.5.2.34,BF.9 |
| intergenic | N185S BF.9 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | P272S BF.9 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | L629L BA.5.1.24,BF.9 |
| S | L629L BA.5.1.24,BA.5.5,BF.9 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | T734T BF.9 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | R847R BF.9 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | S967S BF.9 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | G1124V BF.9 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | N1192D BF.9 |
| intergenic | Q57H BF.9 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | L73F BF.9 |
| intergenic | L94F BA.4,BF.9 |
| intergenic | L101L BF.9 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | g.T-26C BF.9 |
| intergenic | g.A-9G BF.9 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | N41N BF.9 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | T172T BA.5,BF.20,BF.41,BF.9 |
| intergenic | V29A BF.9 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | W29L BF.9 |
| intergenic | E33G BF.9 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | C37R BF.9 |
| ORF8 | C37R BF.9 |
| intergenic | I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9 |
| intergenic | T24I BA.5.2.34,BF.9 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | N126N BF.9 |
| intergenic | N140N BA.5.1.2,BF.9 |
| intergenic | H145L BF.9 |
| N | H145L BF.9 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | S235S BF.9 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9 |
| intergenic | S327L BF.9 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | g.T29680C BF.9 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1 |
| intergenic | N162N BA.4.1 |
| intergenic | S166G BA.5.1.2,BA.4.1 |
| intergenic | N188N BA.4.1.8,BA.4.1 |
| intergenic | D220D BA.5.1.24,BA.4.1 |
| intergenic | C231C BA.4.1 |
| intergenic | T333M BA.4.1 |
| intergenic | G442C BA.4.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1 |
| ORF1a | R542R / NSP2 |
| intergenic | R542R BA.4.1 |
| intergenic | V627F BA.5,BA.4.1 |
| intergenic | L642F BA.4.1 |
| ORF1a | K669T / NSP2 |
| intergenic | K669T BA.4.1 |
| intergenic | Y717Y BA.5,BA.4.1 |
| intergenic | A776T BA.4.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | P971S BA.5.1.10,BA.4.1 |
| intergenic | T1035I BA.4.1 |
| intergenic | N1059N BA.4.1 |
| intergenic | A1060V BA.4.1 |
| intergenic | G1125D BA.4.1.8,BA.4.1 |
| intergenic | H1160Y BA.4.1.8,BA.4.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | P1541P BA.4.1 |
| ORF1a | N1672N / NSP3 |
| intergenic | N1672N BA.4.1 |
| intergenic | Y1700Y BA.4.1 |
| intergenic | P1803L BA.4.1 |
| intergenic | T1822I BA.1.18,BA.4.1 |
| intergenic | N1917N BA.4.1 |
| intergenic | H1974H BA.4.1 |
| ORF1a | S2048A / NSP3 |
| ORF1a | V2051L / NSP3 |
| intergenic | V2051L BA.4.1 |
| intergenic | A2139T BA.4.1 |
| ORF1a | T2283T / NSP3 |
| intergenic | T2283T BA.4.1 |
| ORF1a | T2300A / NSP3 |
| intergenic | T2300A BA.4.1 |
| intergenic | F2351F BA.4.1 |
| ORF1a | K2511K / NSP3 |
| intergenic | K2511K BA.4.1 |
| intergenic | K2810K BA.4.1 |
| intergenic | R2949R BA.4.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2,BA.4.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| ORF1a | N3159N / NSP4 |
| intergenic | N3159N BA.4.1 |
| intergenic | A3179A BA.4.1 |
| intergenic | L3191L BA.5.2.2,BA.4.1 |
| intergenic | Y3250Y BA.4.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | M3280I BA.4.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | L3321L BA.5.2.3,BA.4.1 |
| intergenic | A3333T BA.4.1 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | N3494N BA.4.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | L3636L BA.5.1.24,BA.4.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | T3750I BA.5.2.34,BA.4.1 |
| intergenic | G3757S BA.4.1 |
| ORF1a | L3808L / NSP6 |
| intergenic | L3808L BA.4.1 |
| intergenic | K3839K BA.4.1 |
| intergenic | D3864D BA.4.1 |
| intergenic | N3928N BA.5,BA.4.1 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | L4045L BA.4,BA.4.1 |
| intergenic | P4058P BA.4.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | T4412A BA.4.1 |
| intergenic | P4656S BA.4.1 |
| intergenic | R4677H BA.4.1 |
| intergenic | N4689N BA.4.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | F4820F BA.5.1.10,BA.4.1 |
| intergenic | S4843I BA.4.1 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1 |
| intergenic | H5117H BA.4.1 |
| intergenic | T5131I BA.4.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | L5283L BA.4,BA.4.1 |
| intergenic | A5660T BA.5.1.1,BA.4.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | P6065S BA.4.1 |
| intergenic | D6069D BA.2.12,BA.4.1 |
| intergenic | L6102L BA.4.1 |
| intergenic | D6249D BA.5,BA.4.1 |
| ORF1b | D6270D / NSP14 |
| intergenic | D6270D BA.4.1 |
| intergenic | DRYP6315EGCH BA.2.12,BA.5,BA.4.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | D6724D BA.4.1 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1 |
| intergenic | L6959L BA.4.1 |
| intergenic | P7034S BA.5.2.3,BA.4.1 |
| intergenic | I7035I BA.4.1 |
| intergenic | V3G BA.4.1.8,BA.4.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | T73T BA.2.12,BA.4.1 |
| intergenic | G107G BA.4.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | E484A BA.5,BA.4.1 |
| intergenic | VE483IA BA.4.1 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | Y508Y BA.4.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | T632T BA.4.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | A672V BA.4.1 |
| S | A672V BA.4.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | A701V BA.1.17,BA.4.1 |
| intergenic | T732T BA.4.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | N824N BA.4.1 |
| intergenic | D867D BA.4.1 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | T1077T BA.4.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | E1182D BA.4.1 |
| S | E1182D BA.4.1 |
| intergenic | A1222A BA.4.1 |
| intergenic | L41F BA.4.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | Y189Y BA.4.1 |
| intergenic | E194E BA.4.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | F4F BA.4.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | TG9IC BA.4.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1 |
| intergenic | T175M BA.4.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1 |
| intergenic | E55K BA.4.1 |
| intergenic | P57P BA.4.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1 |
| intergenic | R25T BA.4.1 |
| intergenic | L31L BA.5.1.2,BA.4.1 |
| intergenic | K32N BA.4.1 |
| intergenic | P34L BA.5.2.8,BA.4.1 |
| intergenic | F46I BA.4.1 |
| ORF7a | F46I BA.4.1 |
| intergenic | A64S BA.4.1 |
| intergenic | Q76H BA.4.1 |
| intergenic | I110del BA.4.1 |
| intergenic | L11F BA.4,BA.4.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1 |
| intergenic | Y105Y BA.5.1.1,BA.4.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | T54T BA.5.1.2,BA.4.1 |
| intergenic | L56L BA.4.1 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1 |
| intergenic | P151S BA.4.1.8,BA.4.1 |
| intergenic | S193T BF.41,BA.4.1 |
| intergenic | S202C BA.4.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | G212C BA.4.1 |
| N | G212C BA.4.1 |
| intergenic | M234I BA.4.1 |
| intergenic | P302P BA.5.2.34,BA.4.1 |
| intergenic | P309P BA.4.1 |
| intergenic | T362I BA.5.1.24,BA.4.1 |
| intergenic | A381T BA.4.1 |
| N | A381T BA.4.1 |
| intergenic | P383S BA.4.1 |
| intergenic | S410S BA.4.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | I13T BA.4.1 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1 |
| intergenic | R24C BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | V14V BA.5.1.30 |
| intergenic | G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | V84V BA.5.1.30 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | N189N BA.5.1.10,BA.5.1.30 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30 |
| intergenic | P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | F411F BA.5.1.30 |
| intergenic | N447S BA.5.1.30 |
| intergenic | I475V BA.5.1.30 |
| intergenic | S505S BA.4,BA.5.1.30 |
| intergenic | S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30 |
| intergenic | T592I BA.5.1.30 |
| intergenic | A656V BA.1.14,BA.5.1.30 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | S918S BA.5.1.30 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | E939G BA.5.1.30 |
| ORF1a | T945N / NSP3 |
| intergenic | T945N BA.5.1.30 |
| intergenic | G1070V BA.5.1.30 |
| intergenic | A1082V BA.5.1.30 |
| intergenic | T1168I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.30 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L1438L BA.1.14,BA.5.2.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.30 |
| intergenic | L1441L BA.5.1.30 |
| intergenic | L1627L BA.5.1.30 |
| intergenic | P1640L BA.5.1.24,BA.5.1.30 |
| intergenic | M1732I BA.5.1.30 |
| intergenic | S1743F BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | P1921S BF.20,BA.5.1.30 |
| intergenic | P1977P BA.5.1.30 |
| intergenic | D2026A BA.5.1.30 |
| intergenic | S2114F BA.5.1.30 |
| intergenic | T2153I BA.5.1.30 |
| intergenic | S2303F BA.5.1.30 |
| intergenic | T2306T BA.5.1.30 |
| intergenic | T2319T BA.5.1.30 |
| intergenic | C2445C BA.4.1.8,BA.5.1.2,BA.5.1.30 |
| ORF1a | S2462S / NSP3 |
| intergenic | S2462S BA.5.1.30 |
| intergenic | S2500F BA.5.1.30 |
| intergenic | L2518L BA.5.1.30 |
| intergenic | N2523N BA.5.1.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | M2674V BA.5.1.30 |
| intergenic | D2693D BA.5.1.30 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | S3099L BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.30 |
| intergenic | V3107I BA.5.1.30 |
| ORF1a | M3129L / NSP4 |
| intergenic | M3129L BA.5.1.30 |
| intergenic | T3150I BA.5.1.30 |
| ORF1a | A3230S / NSP4 |
| intergenic | A3230S BA.5.1.30 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | G3578S BA.5.1.30 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | I3738I BA.5.2.8,BA.5.1.30 |
| intergenic | F3769F BA.5.1.30 |
| intergenic | I3853I BA.5.1.10,BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L3899L BA.5.1.30 |
| intergenic | A3907A BA.5.1.30 |
| ORF1a | S3950T / NSP8 |
| intergenic | S3950T BA.5.1.30 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | R4017R BA.5.1.30 |
| intergenic | P4058P BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | A4168A BA.5.1.30 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | T4302N BA.5.1.30 |
| intergenic | L4386F BA.5.1.30 |
| intergenic | R4387R BA.4,BA.5.1.30 |
| intergenic | A4394S BA.5.1.30 |
| intergenic | S4398L BA.1.17,BA.5.1.30 |
| intergenic | A4577V BA.5.1.30 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | T4736I BA.5.1.30 |
| intergenic | G4878G BA.5.1.30 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | C5353C BA.5.1.30 |
| intergenic | Y5388Y BA.2.12,BA.5.1.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3,BA.5.1.30 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L5762L BA.5.1.10,BA.5.1.30 |
| intergenic | N5883N BA.5.1.30 |
| intergenic | L5932L BA.5.2.34,BA.5.1.30 |
| intergenic | I5967L BA.5.1.30 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | G5969G BA.5.1.30 |
| intergenic | D6051D BA.5.2.8,BA.5.1.30 |
| intergenic | D6183N BA.5.1.30 |
| intergenic | K6274N BA.5.1.30 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | D6584D BA.5.1.30 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| ORF1b | S6659S / NSP15 |
| intergenic | S6659S BA.5.1.30 |
| intergenic | A6707S BA.5.1.30 |
| ORF1b | A6808T / NSP16 |
| intergenic | A6808T BA.5.1.30 |
| intergenic | N7084N BA.5.1.30 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | F58F BA.5.1.30 |
| intergenic | H69del BA.5.1.30 |
| intergenic | I68_H69del BA.5.1.30 |
| intergenic | V70del BA.5.1.30 |
| intergenic | P82T BA.5.1.30 |
| S | P82T BA.5.1.30 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L176F BA.5.1.30 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L276L BA.5.1.30 |
| intergenic | L296L BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.30 |
| intergenic | T307S BA.5.1.30 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | A688V BA.5.2.34,BA.5,BA.5.1.30 |
| intergenic | S698L BA.5.1.30 |
| intergenic | S758I BA.5.1.30 |
| S | S758I BA.5.1.30 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | E988E BA.5.1.30 |
| intergenic | V1133V BA.5.1.30 |
| S | V1133V BA.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | N1134N BA.5.1.30 |
| S | N1134N BA.5.1.30 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | I1169I BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | F43L BA.5.1.30 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | V90F BA.5.1.30 |
| intergenic | L94P BA.5.1.30 |
| ORF3a | L94P BA.5.1.30 |
| intergenic | P104S BA.5.1.30 |
| intergenic | T175I BA.5.1.30 |
| intergenic | T223I BA.2.12,BA.5.1.30 |
| intergenic | V256del BA.5.2.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | F4F BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L145L BA.5.1.30 |
| intergenic | D160N BA.5.1.30 |
| M | D160N BA.5.1.30 |
| intergenic | P165P BA.5.1.30 |
| intergenic | N203N BA.5.1.30 |
| intergenic | N207N BA.5.2.3,BA.5.1.30 |
| intergenic | D6G BA.5.1.30 |
| intergenic | V24I BA.5.1.30 |
| intergenic | L5F BA.5.1.30 |
| intergenic | C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | V93F BA.5.1.30 |
| intergenic | P99L BA.5.1.30 |
| intergenic | T120A BA.5.1.30 |
| ORF7a | T120A BA.5.1.30 |
| intergenic | F19L BA.4,BA.5.1.30 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | N38I BA.5.1.30 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30 |
| intergenic | V33F BA.5.1.30 |
| intergenic | V49A BA.5.1.30 |
| intergenic | S67F BA.5.1.10,BA.5.1.30 |
| intergenic | H112H BA.5.1.30 |
| ORF8 | H112H BA.2.3,BA.5.1.30 |
| intergenic | F120F BA.5.1.30 |
| intergenic | FI120VL BA.5.1.30 |
| intergenic | I121I BA.5.1.30 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | T49I BA.5,BA.5.1.30 |
| intergenic | T54T BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L56L BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | K65E BA.5.1.30 |
| N | K65E BA.5.1.30 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | G200C BA.5.1.30 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | Q289Q BA.5.1.24,BA.5.1.30 |
| N | Q289Q BA.5.1.24,BA.5.1.30 |
| intergenic | H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | F315F BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | g.A-11T BA.5.1.30 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | G49D BA.5.1.24,BA.5,BA.5.2.8,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D75N BQ.1.1.8 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T224I BQ.1.1.8 |
| ORF1a | T265A / NSP2 |
| intergenic | T265A BQ.1.1.8 |
| intergenic | S318L BA.5.1.1,BQ.1.1.8 |
| ORF1a | I368V / NSP2 |
| intergenic | I368V BQ.1.1.8 |
| intergenic | H374Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | V459V BA.5.2.8,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D466D BQ.1.1.8 |
| intergenic | S481S BA.5.1.10,BQ.1.1.8 |
| intergenic | Q556K BA.4,BA.5,BQ.1.1.8 |
| ORF1a | L590S / NSP2 |
| intergenic | L590S BQ.1.1.8 |
| intergenic | T609I BQ.1.1.8 |
| ORF1a | G638G / NSP2 |
| intergenic | G638G BQ.1.1.8 |
| intergenic | K669K BQ.1.1.8 |
| intergenic | A690A BQ.1.1.8 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L897L BQ.1.1.8 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L969F BQ.1.1.8 |
| intergenic | V1025V BQ.1.1.8 |
| ORF1a | N1037S / NSP3 |
| intergenic | N1037S BQ.1.1.8 |
| intergenic | A1049V BA.4.1.8,BQ.1.1.8 |
| intergenic | G1070G BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| ORF1a | I1206L / NSP3 |
| intergenic | I1206L BQ.1.1.8 |
| intergenic | D1273D BA.5,BQ.1.1.8 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | M1312I BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y1337Y BA.5,BA.5.1.2,BQ.1.1.8 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S1433S BQ.1.1.8 |
| ORF1a | Y1516H / NSP3 |
| intergenic | Y1516H BQ.1.1.8 |
| intergenic | T1589T BQ.1.1.8 |
| ORF1a | T1605I / NSP3 |
| intergenic | T1605I BQ.1.1.8 |
| intergenic | H1652H BQ.1.1.8 |
| intergenic | A1677T BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y1700Y BA.4.1,BQ.1.1.8 |
| intergenic | I1714I BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y1734Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | Q1758Q BQ.1.1.8 |
| intergenic | T2007T BA.5,BQ.1.1.8 |
| intergenic | V2019I BQ.1.1.8 |
| ORF1a | L2119L / NSP3 |
| intergenic | L2119L BQ.1.1.8 |
| intergenic | T2124I BQ.1.1.8 |
| intergenic | S2132G BQ.1.1.8 |
| ORF1a | T2137A / NSP3 |
| intergenic | T2137A BQ.1.1.8 |
| intergenic | F2172F BQ.1.1.8 |
| intergenic | L2211L BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y2245Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | A2508A BQ.1.1.8 |
| intergenic | P2605S BQ.1.1.8 |
| intergenic | N2714N BQ.1.1.8 |
| ORF1a | Q2749Q / NSP3 |
| intergenic | Q2749Q BQ.1.1.8 |
| intergenic | A2759V BQ.1.1.8 |
| intergenic | H2799H BQ.1.1.8 |
| intergenic | N2829N BQ.1.1.8 |
| intergenic | T2836I BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| intergenic | P2870P BA.5.2.34,BA.5,BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y2897Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | A2994V BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y3011Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8 |
| intergenic | N3081N BQ.1.1.8 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | E3176E BQ.1.1.8 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T3432T BQ.1.1.8 |
| ORF1a | S3570S / NSP6 |
| intergenic | S3570S BQ.1.1.8 |
| intergenic | H3580H BA.5.2.34,BQ.1.1.8 |
| intergenic | V3595V BQ.1.1.8 |
| intergenic | H3631H BQ.1.1.8 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | V3700V BQ.1.1.8 |
| intergenic | D3728D BA.4.1.8,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L3914L BQ.1.1.8 |
| intergenic | S3949N BQ.1.1.8 |
| intergenic | L3951F BQ.1.1.8 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y4080H BQ.1.1.8 |
| intergenic | T4202T BQ.1.1.8 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L4209L BA.4,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L4252L BQ.1.1.8 |
| intergenic | V4266V BQ.1.1.8 |
| intergenic | H4467H BA.5.1.10,BQ.1.1.8 |
| ORF1b | F4549F / NSP12 |
| intergenic | F4549F BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y4665H BQ.1.1.8 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T4948T BQ.1.1.8 |
| intergenic | A4977A BQ.1.1.8 |
| intergenic | T4996T BQ.1.1.8 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8 |
| intergenic | E5194E BQ.1.1.8 |
| intergenic | S5424S BQ.1.1.8 |
| intergenic | M5557I BQ.1.1.8 |
| intergenic | N5592S BQ.1.1.8 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | A5778V BQ.1.1.8 |
| ORF1b | D5907D / NSP13 |
| intergenic | D5907D BQ.1.1.8 |
| intergenic | P5949L BQ.1.1.8 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | P5995S BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y6122Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | P6128S BQ.1.1.8 |
| intergenic | T6175I BQ.1.1.8 |
| intergenic | S6299S BQ.1.1.8 |
| intergenic | L6308L BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| ORF1b | I6559M / NSP15 |
| intergenic | I6559M BQ.1.1.8 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D6584D BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | R6590H BQ.1.1.8 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| ORF1b | E6672K / NSP15 |
| intergenic | E6672K BQ.1.1.8 |
| ORF1b | V6688V / NSP15 |
| intergenic | V6688V BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y6730Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | M6840T BQ.1.1.8 |
| intergenic | L6852L BQ.1.1.8 |
| intergenic | R7014N BQ.1.1.8 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D53D BA.5,BA.5.1.1,BQ.1.1.8 |
| intergenic | A67_V70delinsSI BQ.1.1.8 |
| intergenic | H69del BQ.1.1.8 |
| intergenic | V70del BQ.1.1.8 |
| intergenic | T95A BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| S | T95A BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | W152R BQ.1.1.8 |
| intergenic | G184S BQ.1.1.8 |
| intergenic | F186F BA.5.1.2,BQ.1.1.8 |
| intergenic | R190K BQ.1.1.8 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L229V BQ.1.1.8 |
| S | L229V BQ.1.1.8 |
| intergenic | P230P BQ.1.1.8 |
| S | P230P BQ.1.1.8 |
| intergenic | S254A BQ.1.1.8 |
| S | S254A BQ.1.1.8 |
| intergenic | S255F BA.5,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T286I BQ.1.1.8 |
| intergenic | T307I BA.5.1.2,BQ.1.1.8 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | I410I BQ.1.1.8 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | K444T BQ.1.1.8 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T547K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T638I BQ.1.1.8 |
| S | T638I BQ.1.1.8 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S735L BQ.1.1.8 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | N856N BQ.1.1.8 |
| intergenic | T883T BQ.1.1.8 |
| intergenic | F888F BQ.1.1.8 |
| intergenic | D936Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | P1143L BA.2.86.1,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | P1162L BQ.1.1.8 |
| intergenic | D1165Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | N1178N BQ.1.1.8 |
| intergenic | G18V BA.5.1.24,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D22Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | G49C BQ.1.1.8 |
| intergenic | L65I BQ.1.1.8 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | V112V BA.5.2.3,BA.5,BQ.1.1.8 |
| intergenic | C130C BQ.1.1.8 |
| intergenic | I169I BQ.1.1.8 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8 |
| intergenic | P240S BA.4,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L119L BQ.1.1.8 |
| intergenic | G202G BA.5.2.34,BQ.1.1.8 |
| intergenic | R20S BQ.1.1.8 |
| ORF6 | R20S BQ.1.1.8 |
| intergenic | K53E BQ.1.1.8 |
| intergenic | T120I BQ.1.1.8 |
| intergenic | S5I BQ.1.1.8 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | H42Q BQ.1.1.8 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | I76V BQ.1.1.8 |
| intergenic | FI120VL BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | R10R BQ.1.1.8 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | P20S BQ.1.1.8 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T115T BQ.1.1.8 |
| intergenic | E136D BQ.1.1.8 |
| intergenic | D144N BQ.1.1.8 |
| intergenic | L161F BA.5,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S183S BQ.1.1.8 |
| intergenic | S187P BQ.1.1.8 |
| N | S187P BQ.1.1.8 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8 |
| intergenic | Q242Q BQ.1.1.8 |
| intergenic | S255T BQ.1.1.8 |
| N | S255T BQ.1.1.8 |
| intergenic | S255Y BQ.1.1.8 |
| N | S255Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | S327S BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y360Y BA.5.2.2,BA.5.2.3,BQ.1.1.8 |
| intergenic | E367E BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | g.G-15T BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| intergenic | g.GAC-15_-13TAT BQ.1.1.8 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | g.C-119T BA.5.1.10,DV.7.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1 |
| intergenic | G82_H83del DV.7.1 |
| intergenic | G82_M85delinsV DV.7.1 |
| intergenic | M85_V86del DV.7.1 |
| intergenic | M85del DV.7.1 |
| intergenic | E113E DV.7.1 |
| intergenic | K129R DV.7.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | N162N BA.4.1,DV.7.1 |
| intergenic | N188N BA.4.1.8,BA.4.1,DV.7.1 |
| intergenic | R226K BA.5.2.3,DV.7.1 |
| intergenic | V228V DV.7.1 |
| intergenic | N310D DV.7.1 |
| intergenic | R402R BA.5.2.34,DV.7.1 |
| intergenic | H417H DV.7.1 |
| intergenic | V424V DV.7.1 |
| intergenic | A427V BA.5.2.34,DV.7.1 |
| intergenic | D448D DV.7.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1 |
| intergenic | A540V BA.5.1.10,DV.7.1 |
| intergenic | T568I DV.7.1 |
| intergenic | T654T DV.7.1 |
| intergenic | A656V BA.1.14,BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | A690V DV.7.1 |
| intergenic | Y717Y BA.5,BA.4.1,DV.7.1 |
| intergenic | S723S DV.7.1 |
| intergenic | T753I BA.4.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | V757I DV.7.1 |
| intergenic | S771N DV.7.1 |
| intergenic | L791L DV.7.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | P885S DV.7.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | A964T BA.4,DV.7.1 |
| intergenic | D992D DV.7.1 |
| intergenic | T1001I BA.2.12,BA.5.1.10,DV.7.1 |
| intergenic | D1044D DV.7.1 |
| intergenic | V1057I DV.7.1 |
| intergenic | V1118V DV.7.1 |
| intergenic | V1177V DV.7.1 |
| intergenic | Q1198K DV.7.1 |
| intergenic | P1213L BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1 |
| intergenic | S1221L DV.7.1 |
| intergenic | K1247K DV.7.1 |
| intergenic | I1257I DV.7.1 |
| intergenic | I1276V DV.7.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | L1379L DV.7.1 |
| intergenic | A1397A BA.2.12,BA.5,DV.7.1 |
| intergenic | T1426T BA.5.2.2,DV.7.1 |
| intergenic | L1441L BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | H1500R DV.7.1 |
| intergenic | Y1619Y DV.7.1 |
| intergenic | P1640S DV.7.1 |
| intergenic | G1819S DV.7.1 |
| intergenic | S2030L DV.7.1 |
| intergenic | M2036V DV.7.1 |
| intergenic | S2242F BA.5.2.34,BA.5.2.8,BA.5.1.2,DV.7.1 |
| intergenic | F2351F BA.4.1,DV.7.1 |
| intergenic | I2385I BA.4,DV.7.1 |
| intergenic | N2523S DV.7.1 |
| intergenic | A2584V BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1 |
| intergenic | V2651I DV.7.1 |
| intergenic | L2778F DV.7.1 |
| intergenic | T2872M DV.7.1 |
| intergenic | T2988T DV.7.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | I3035I DV.7.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | A3143V DV.7.1 |
| intergenic | R3163R DV.7.1 |
| intergenic | S3173S DV.7.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | D3416D DV.7.1 |
| intergenic | D3439D BA.5.2.34,BA.5.1.1,DV.7.1 |
| intergenic | A3548V DV.7.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | V3660V DV.7.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | A3688V DV.7.1 |
| intergenic | I3731V DV.7.1 |
| intergenic | V3782F DV.7.1 |
| intergenic | L3828L BA.5,DV.7.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | L3829P DV.7.1 |
| intergenic | Q3859H DV.7.1 |
| intergenic | I3927M DV.7.1 |
| intergenic | Y3954Y BA.1.14,BA.4,DV.7.1 |
| intergenic | N4060S DV.7.1 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | S4112C DV.7.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | L4237L DV.7.1 |
| intergenic | L4365I DV.7.1 |
| intergenic | C4373C DV.7.1 |
| intergenic | Y4541Y DV.7.1 |
| intergenic | D4546Y DV.7.1 |
| intergenic | L4578L BA.5.1.10,DV.7.1 |
| intergenic | D4586G DV.7.1 |
| intergenic | G4620G DV.7.1 |
| intergenic | D4652D BA.4,DV.7.1 |
| intergenic | T4668M DV.7.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | R4905R DV.7.1 |
| intergenic | A4921V BA.5.2.3,DV.7.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | G5104G DV.7.1 |
| intergenic | D5109D DV.7.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | D5152D BA.5.1.24,DV.7.1 |
| intergenic | Y5220Y BA.5.2.34,BA.5.1.2,DV.7.1 |
| intergenic | D5271D DV.7.1 |
| intergenic | T5477N DV.7.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | M5598I DV.7.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | A5727A DV.7.1 |
| intergenic | A5829V DV.7.1 |
| intergenic | A5846A DV.7.1 |
| intergenic | H5951Y DV.7.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | P5995P DV.7.1 |
| intergenic | P6066T DV.7.1 |
| intergenic | V6107I DV.7.1 |
| intergenic | T6131T BA.2.12,DV.7.1 |
| intergenic | G6173S DV.7.1 |
| intergenic | V6242I DV.7.1 |
| intergenic | H6380Y BA.5.1.10,DV.7.1 |
| intergenic | Y6423Y DV.7.1 |
| intergenic | K6541R DV.7.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | D6580A DV.7.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | I6663I DV.7.1 |
| intergenic | P6805S DV.7.1 |
| intergenic | Q6826R DV.7.1 |
| intergenic | V6894A DV.7.1 |
| intergenic | V6937V DV.7.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | L54L DV.7.1 |
| intergenic | N99N DV.7.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | K147E DV.7.1 |
| intergenic | W152R BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | E180D DV.7.1 |
| intergenic | Q183K DV.7.1 |
| intergenic | N185D DV.7.1 |
| intergenic | I210V DV.7.1 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | T240I BA.1.14,DV.7.1 |
| intergenic | G257S DV.7.1 |
| intergenic | A292T DV.7.1 |
| intergenic | L296L BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | I358I DV.7.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | V382V DV.7.1 |
| intergenic | R403K BA.2.86.1,BA.5,DV.7.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | K444T BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | G446S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,DV.7.1 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | F486S DV.7.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | N603N BA.4.1.8,BA.5.1.10,DV.7.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | V622V DV.7.1 |
| intergenic | D627D DV.7.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | I692F DV.7.1 |
| intergenic | S698L BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | P812L DV.7.1 |
| intergenic | E819E DV.7.1 |
| intergenic | L858I DV.7.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | L981I DV.7.1 |
| intergenic | P1143P DV.7.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | D1184Y DV.7.1 |
| intergenic | L1200F DV.7.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1 |
| intergenic | T32I DV.7.1 |
| intergenic | F43S BA.5.1.10,DV.7.1 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1 |
| intergenic | L65F DV.7.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | A72T DV.7.1 |
| intergenic | A110V DV.7.1 |
| intergenic | L115S DV.7.1 |
| intergenic | S177N DV.7.1 |
| intergenic | Y189Y BA.4.1,DV.7.1 |
| intergenic | D210D DV.7.1 |
| intergenic | T223F DV.7.1 |
| intergenic | T223I DV.7.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | S108S DV.7.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1 |
| intergenic | L129L DV.7.1 |
| intergenic | R146H DV.7.1 |
| intergenic | R150R DV.7.1 |
| intergenic | I151V DV.7.1 |
| intergenic | M1? DV.7.1 |
| intergenic | D6_F7del DV.7.1 |
| intergenic | R20Q DV.7.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1 |
| intergenic | D61F DV.7.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1 |
| intergenic | T28I BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1 |
| intergenic | E121Q DV.7.1 |
| intergenic | A15A DV.7.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | T11K DV.7.1 |
| intergenic | P36P BA.1.14,BA.5.2.34,DV.7.1 |
| intergenic | P38P BA.5.2.34,DV.7.1 |
| intergenic | H40Y DV.7.1 |
| intergenic | S67F BA.5.1.10,BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | D22G BA.5.1.1,DV.7.1 |
| intergenic | T24A DV.7.1 |
| intergenic | S26I DV.7.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | A35S DV.7.1 |
| intergenic | R41R DV.7.1 |
| intergenic | D63D BA.5.1.10,DV.7.1 |
| intergenic | N75N BA.4.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | D82D BA.5,DV.7.1 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | T135A DV.7.1 |
| intergenic | K143K DV.7.1 |
| intergenic | T166I DV.7.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | A217S DV.7.1 |
| intergenic | L219F BA.5,DV.7.1 |
| intergenic | V270L DV.7.1 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1 |
| intergenic | D348H DV.7.1 |
| intergenic | T366I DV.7.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | D415D DV.7.1 |
| intergenic | g.C29686T DV.7.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | g.C29769T DV.7.1 |
| intergenic | g.T29793A DV.7.1 |
| intergenic | g.C-166T BA.5.2.20 |
| intergenic | g.C-149T BA.5.2.20 |
| intergenic | g.A-131G BA.5.2.20 |
| intergenic | g.A-88T BA.5.2.20 |
| intergenic | g.C-44T BA.5.2.20 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | V111V BA.5.2.20 |
| intergenic | V121F BA.5.1.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | SYG135RYS BA.5.2.20 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | Y182Y BA.5.2.20 |
| intergenic | N188N BA.4.1.8,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | T224I BQ.1.1.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | N434N BA.5.2.20 |
| intergenic | S443F BA.5.2.2,BF.41,BA.5.2.20 |
| intergenic | L454F BA.5.1.24,BA.5.2.20 |
| intergenic | L454L BA.5.2.20 |
| intergenic | R542C BA.5.2.20 |
| intergenic | S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20 |
| intergenic | A566V BA.5.2.20 |
| intergenic | G603S BA.5.2.20 |
| intergenic | N615N BA.4,BA.5.2.20 |
| intergenic | G638S BA.5.2.20 |
| intergenic | V649F BA.5.2.20 |
| intergenic | C657Y BA.5.2.20 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | G696G BA.5.2.20 |
| intergenic | P748L BA.5.1.10,BA.5.2.20 |
| intergenic | P748P BA.5.2.20 |
| intergenic | N810N BA.5.2.20 |
| intergenic | D828D BA.5.2.20 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | V852V BA.5.2.20 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | S966F BA.5.2.20 |
| intergenic | P971S BA.5.1.10,BA.4.1,BA.5.2.20 |
| ORF1a | Q991del / NSP3 |
| intergenic | Q991del BA.5.2.20 |
| intergenic | D996D BA.5.2.20 |
| intergenic | T1035T BA.5.2.20 |
| intergenic | V1056L BA.2.86.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | G1068E BA.5.2.20 |
| intergenic | H1108H BA.5.2.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | T1168I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.30,BA.5.2.20 |
| intergenic | V1295F BA.5.2.20 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| ORF1a | T1310T / NSP3 |
| intergenic | T1310T BA.5.2.20 |
| intergenic | T1322I BA.2.12,BA.5.2.20 |
| intergenic | N1335N BA.5.2.20 |
| intergenic | Y1337Y BA.5,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | V1345V BA.5.2.20 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | V1483V BA.5.2.20 |
| intergenic | D1547N BA.5.2.20 |
| intergenic | T1581T BA.1.17,BA.5.2.20 |
| intergenic | T1678T BA.5.2.20 |
| intergenic | T1682I BA.5.2.20 |
| intergenic | Y1734Y BQ.1.1.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | P1786S BA.5.2.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | H1835H BA.5.2.20 |
| intergenic | T1840I BA.5.2.20 |
| intergenic | Y1882Y BA.5.2.20 |
| intergenic | I1935I BA.5.2.20 |
| intergenic | P1977L BA.5.2.20 |
| intergenic | T2016I BA.5.2.20 |
| intergenic | S2024S BA.5.2.20 |
| intergenic | E2031K BA.5.2.20 |
| intergenic | E2031A BA.5.2.20 |
| intergenic | L2044P BA.5.2.20 |
| intergenic | E2070K BA.5.2.20 |
| intergenic | P2079L BA.5.2.20 |
| intergenic | N2147N BA.5.1.10,BA.5.2.20 |
| intergenic | S2242F BA.5.2.34,BA.5.2.8,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | T2283I BA.5.2.20 |
| ORF1a | V2340V / NSP3 |
| intergenic | V2340V BA.5.2.20 |
| ORF1a | A2344S / NSP3 |
| intergenic | A2344S BA.5.2.20 |
| intergenic | Y2489Y BA.5.2.20 |
| intergenic | K2497E BA.5.2.20 |
| intergenic | H2659Y BA.5.2.20 |
| intergenic | N2678N BA.5.2.8,BA.5.2.20 |
| ORF1a | D2717A / NSP3 |
| intergenic | D2717A BA.5.2.20 |
| intergenic | N2894N BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.2.20 |
| intergenic | D2907D BA.2.12,BA.5.2.20 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | C3232C BA.5.2.20 |
| intergenic | L3238L BA.5.2.20 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | T3284I BA.4,BA.5.2.20 |
| ORF1a | 3291 / NSP5 |
| intergenic | 3291 BA.5.2.20 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | L3338F BA.5.2.20 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | L3483F BA.5.2.20 |
| intergenic | R3542C BA.5.2.20 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | M3627I BA.5,BA.5.2.20 |
| intergenic | V3629V BA.5.2.20 |
| intergenic | A3648V BA.5.2.20 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | L3692L BA.5.2.20 |
| intergenic | A3726V BA.5.2.20 |
| intergenic | K3839K BA.4.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | V3847I BA.5.2.20 |
| intergenic | I3853I BA.5.1.10,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20 |
| intergenic | N3928N BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | N4060N BA.5.2.20 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | P4312P BA.5.2.20 |
| intergenic | T4364I BA.5.2.20 |
| intergenic | Y4430Y BA.2.86.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | D4545G BA.5.2.20 |
| intergenic | K4655K BA.5.2.20 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | N4795N BA.5.2.20 |
| intergenic | M4855I BA.5.2.2,BA.5.2.20 |
| intergenic | L4862L BA.5.2.20 |
| intergenic | L4862L BA.5.2.20 |
| intergenic | N4926N BA.5.2.20 |
| intergenic | A4946T BA.5.2.20 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | T5036T BA.5,BA.5.2.20 |
| intergenic | Y5066Y BA.5.2.20 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | Y5355Y BA.2.12,BA.5.2.20 |
| intergenic | T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | S5602S BA.5.2.20 |
| ORF1b | V5629A / NSP13 |
| intergenic | V5629A BA.5.2.20 |
| intergenic | Y5648H BA.5.2.20 |
| intergenic | V5711V BA.5.2.20 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | A5778V BQ.1.1.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | V5834V BA.5.2.20 |
| intergenic | A5922V BA.5.2.20 |
| intergenic | L5932L BA.5.2.34,BA.5.1.30,BA.5.2.20 |
| intergenic | I5967L BA.5.1.30,BA.5.2.20 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| ORF1b | R5978K / NSP14 |
| intergenic | R5978K BA.5.2.20 |
| ORF1b | N5988N / NSP14 |
| intergenic | N5988N BA.5.2.20 |
| intergenic | E6024E BA.5.2.20 |
| intergenic | P6046P BA.5.2.20 |
| intergenic | D6097D BA.2.12,BA.5.2.20 |
| intergenic | C6141C BA.5.2.20 |
| intergenic | D6249D BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | K6274N BA.5.1.30,BA.5.2.20 |
| intergenic | D6300D BA.5.2.20 |
| intergenic | DRYP6315EGCH BA.2.12,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20 |
| ORF1b | S6395S / NSP14 |
| intergenic | S6395S BA.5.2.20 |
| intergenic | L6444L BA.5.2.20 |
| intergenic | T6485I BA.5.2.20 |
| ORF1b | N6504N / NSP15 |
| intergenic | N6504N BA.5.2.20 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | T6566M BA.5.2.20 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | P6657S BA.5.2.20 |
| intergenic | S6740F BF.9,BA.5.2.20 |
| intergenic | V6807I BA.5.2.20 |
| ORF1b | S6907S / NSP16 |
| intergenic | S6907S BA.5.2.20 |
| intergenic | D6928D BA.5.2.20 |
| intergenic | T6938I BA.2.12,BA.5,BA.5.2.20 |
| intergenic | H6984Y BA.5.2.20 |
| intergenic | A7056A BA.5.2.20 |
| intergenic | L7072L BA.5.2.20 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | G75V BA.2.12,BA.4,BA.5.2.20 |
| intergenic | V130V BA.5.2.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | H207Y BA.5.2.20 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | G257S DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | V382V DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | K444R BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.2.20 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | E471Q BA.5.2.20 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | NSP679KFH BA.5.2.20 |
| intergenic | NSP679KSH BA.5.2.20 |
| intergenic | Y707Y BA.5.2.20 |
| intergenic | P715P BA.5.2.20 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | P807P BA.5.2.20 |
| intergenic | I818I BA.5.2.20 |
| intergenic | A890A BA.5.2.20 |
| intergenic | V952V BA.5.2.20 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | S967S BF.9,BA.5.2.20 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | V1060V BA.5.2.20 |
| intergenic | G1085A BA.5.2.20 |
| intergenic | H1101Y BF.41,BA.5.2.20 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | D1153N BA.5.2.20 |
| S | D1153N BA.5.2.20 |
| intergenic | I1169I BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20 |
| intergenic | Q38K BA.5.2.20 |
| intergenic | F43F BA.2.12,BA.5.2.20 |
| intergenic | L53F BA.5.2.20 |
| intergenic | L65F DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | H78H BA.5.2.20 |
| intergenic | H78Y BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.20 |
| intergenic | S166L BA.5.2.20 |
| intergenic | F207F BA.5.1.2,BA.5.2.20 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | F4F BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | V62F BA.5.2.20 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | L29F BA.5.2.20 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | L124L BA.2.12,BA.4,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20 |
| intergenic | S184S BA.5.2.20 |
| intergenic | N203N BA.5.1.30,BA.5.2.20 |
| intergenic | N207N BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20 |
| intergenic | I3I BA.5.2.20 |
| intergenic | T11K BA.5,BA.5.2.20 |
| intergenic | L17F BA.5.2.20 |
| intergenic | R25T BA.4.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9,BA.5.2.20 |
| intergenic | V74I BA.5,BA.5.2.20 |
| intergenic | S81S BA.5.2.20 |
| intergenic | A105V BA.5.2.20 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | H17Y BA.5.2.20 |
| intergenic | V62V BA.5.2.20 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | I71F BA.5.2.20 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.2.20 |
| intergenic | E31_G34delinsR BA.5.2.20 |
| intergenic | E31_S33del BA.5.2.20 |
| intergenic | F66F BA.5.2.20 |
| intergenic | P67L BA.2.12,BA.5.1.10,BA.5.2.20 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | P122P BA.5.2.20 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20 |
| intergenic | A173V BA.5.2.20 |
| intergenic | S183S BQ.1.1.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | P309P BA.4.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | P365L BA.5.2.20 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | g.C29708T BA.5.2.20 |
| intergenic | g.T29726G BA.5.2.20 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | g.C29769T DV.7.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | g.G-67T BF.28 |
| intergenic | g.G-47T BF.28 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | S3S BF.28 |
| intergenic | S17_L18delinsM BA.5.1.2,BF.28 |
| intergenic | Q44L BF.28 |
| intergenic | G52G BF.28 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34,BF.28 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | SYG135RYS BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | F263L BF.28 |
| intergenic | E269E BF.28 |
| intergenic | A307A BF.28 |
| intergenic | P309L BA.5.2.2,BF.28 |
| ORF1a | T340N / NSP2 |
| intergenic | T340N BF.28 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28 |
| intergenic | E342E BF.28 |
| intergenic | G379E BA.5.1.10,BF.28 |
| intergenic | R398C BF.28 |
| intergenic | H417H DV.7.1,BF.28 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28 |
| ORF1a | K468K / NSP2 |
| intergenic | K468K BF.28 |
| ORF1a | G507V / NSP2 |
| intergenic | G507V BF.28 |
| ORF1a | G572G / NSP2 |
| intergenic | G572G BF.28 |
| intergenic | V665I BF.28 |
| intergenic | T677T BF.28 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| ORF1a | V988F / NSP3 |
| intergenic | V988F BF.28 |
| intergenic | H1108Y BF.28 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | S1361P BF.28 |
| intergenic | Y1423Y BF.28 |
| intergenic | I1505V BF.28 |
| ORF1a | T1597S / NSP3 |
| intergenic | T1597S BF.28 |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2,BF.28 |
| intergenic | E1801E BF.28 |
| ORF1a | G1861G / NSP3 |
| intergenic | G1861G BF.28 |
| intergenic | Y1873Y BA.5.1.10,BF.9,BF.28 |
| intergenic | T1890T BF.28 |
| intergenic | F1925F BA.5.2.2,BF.28 |
| intergenic | N1995N BA.2.12,BF.28 |
| intergenic | T2021A BF.28 |
| ORF1a | Q2058Q / NSP3 |
| intergenic | Q2058Q BF.28 |
| intergenic | A2128A BF.28 |
| intergenic | V2238V BA.5,BF.20,BF.9,BF.28 |
| intergenic | A2249V BF.28 |
| intergenic | T2300I BF.28 |
| intergenic | Y2384Y BA.2.12,BF.28 |
| ORF1a | H2502R / NSP3 |
| intergenic | H2502R BF.28 |
| intergenic | A2529V BF.28 |
| intergenic | S2535L BF.28 |
| ORF1a | T2846A / NSP4 |
| intergenic | T2846A BF.28 |
| ORF1a | V2865V / NSP4 |
| intergenic | V2865V BF.28 |
| intergenic | F2884F BF.28 |
| intergenic | F3018F BA.4,BA.5,BF.28 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | V3248V BF.28 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | L3338F BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | N3414N BF.28 |
| intergenic | L3535L BA.2.12,BA.5.1.24,BF.28 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | T3772A BF.28 |
| intergenic | L3951F BQ.1.1.8,BF.28 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | R4387R BA.4,BA.5.1.30,BF.28 |
| ORF1b | V4422I / NSP12 |
| intergenic | V4422I BF.28 |
| intergenic | D4532D BF.28 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | T4736T BF.28 |
| intergenic | D4857D BF.28 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | T5131I BA.4.1,BF.28 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | P5377S BA.4,BA.5.1.24,BF.28 |
| ORF1b | E5460E / NSP13 |
| intergenic | E5460E BF.28 |
| ORF1b | V5481L / NSP13 |
| intergenic | V5481L BF.28 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | T5574I BF.28 |
| intergenic | L5580F BF.28 |
| intergenic | V5680V BA.4.1.8,BF.28 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | S5748S BA.4,BF.28 |
| ORF1b | V5803V / NSP13 |
| intergenic | V5803V BF.28 |
| intergenic | Y5839Y BF.28 |
| intergenic | A5844G BF.28 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | L6082F BA.2.12,BF.28 |
| intergenic | Y6160Y BF.28 |
| intergenic | F6251F BF.28 |
| intergenic | K6464K BF.28 |
| intergenic | D6488D BF.28 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | H6701H BA.2.86.1,BF.28 |
| intergenic | G6738S BF.28 |
| intergenic | S6739L BA.5.1.10,BF.28 |
| intergenic | V6772L BA.5.2.2,BA.5.1.1,BF.28 |
| intergenic | V11V BA.5.2.34,BA.1.18,BF.28 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | F32F BA.5.1.10,BA.5.1.2,BF.28 |
| intergenic | F55F BF.9,BF.28 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | R102R BF.28 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28 |
| intergenic | R190R BF.28 |
| S | R190R BF.28 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | T307I BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BF.28 |
| intergenic | Q314K BF.28 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | C432C BA.5,BF.28 |
| intergenic | A435S BF.28 |
| S | A435S BF.28 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | N450D BA.2.86.1,BF.28 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | T547I BA.5.2.3,BA.5,BF.28 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | P665P BA.5,BA.5.2.8,BF.28 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28 |
| intergenic | A701S BF.28 |
| S | A701S BF.28 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | T778T BF.28 |
| intergenic | P793P BF.28 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | E1202Q BA.4.1.8,BA.5.2.3,BF.28 |
| intergenic | Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BF.28 |
| intergenic | P1263L BA.5.2.34,BF.28 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | H78Y BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | P104P BF.28 |
| intergenic | Q185H BA.2.12,BF.28 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | F28F BF.28 |
| intergenic | T30T BF.28 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | V66L BF.28 |
| intergenic | T172T BA.5,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28 |
| intergenic | E54E BF.28 |
| intergenic | L9M BF.28 |
| intergenic | T14T BF.28 |
| intergenic | G38V BF.28 |
| intergenic | H47N BA.5,BF.28 |
| intergenic | L56L BF.28 |
| intergenic | C67S BF.28 |
| ORF7a | C67S BF.28 |
| intergenic | T120I BQ.1.1.8,BF.28 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | W45L BF.28 |
| intergenic | R115H BA.5.1.10,BF.28 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28 |
| intergenic | A55S BF.28 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | P199S BA.5,BF.28 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28 |
| intergenic | L221L BF.28 |
| N | L221L BF.28 |
| intergenic | R319H BF.28 |
| intergenic | T379I BF.28 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | D415D DV.7.1,BF.28 |
| intergenic | g.A-14G BF.28 |
| intergenic | g.C-8T BF.28 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28 |
| intergenic | g.C-160T BA.5.1.24,BE.1.1 |
| intergenic | g.G-68A BE.1.1 |
| intergenic | g.G-62T BE.1.1 |
| intergenic | g.C-44T BA.5.2.20,BE.1.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8,BE.1.1 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | V111A BA.5.1.1,BE.1.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | G227V BE.1.1 |
| intergenic | A385A BE.1.1 |
| intergenic | H417R BE.1.1 |
| ORF1a | A429T / NSP2 |
| intergenic | A429T BE.1.1 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1 |
| intergenic | Q556K BA.4,BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1 |
| intergenic | I569T BE.1.1 |
| intergenic | D644D BA.5.1.10,BA.5.2.34,BE.1.1 |
| intergenic | A690A BQ.1.1.8,BE.1.1 |
| intergenic | H712Q BE.1.1 |
| intergenic | G715G BE.1.1 |
| intergenic | L733L BE.1.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | A859A BA.5.2.3,BE.1.1 |
| ORF1a | 898 / NSP3 |
| intergenic | 898 BE.1.1 |
| intergenic | L897L BE.1.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | A1043V BA.4,BE.1.1 |
| intergenic | G1073E BE.1.1 |
| intergenic | R1170R BE.1.1 |
| intergenic | D1184D BE.1.1 |
| intergenic | K1202N BE.1.1 |
| intergenic | T1269T BE.1.1 |
| intergenic | K1281K BE.1.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | Y1325Y BE.1.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | V1391I BE.1.1 |
| intergenic | V1393V BE.1.1 |
| intergenic | D1585D BE.1.1 |
| ORF1a | R1628H / NSP3 |
| intergenic | R1628H BE.1.1 |
| intergenic | N1673N BA.5.1.10,BA.4,BE.1.1 |
| intergenic | Y1734Y BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BE.1.1 |
| intergenic | P1786S BA.5.2.8,BA.5.2.20,BE.1.1 |
| intergenic | D1849D BE.1.1 |
| intergenic | F1925F BA.5.2.2,BF.28,BE.1.1 |
| ORF1a | Q1943H / NSP3 |
| intergenic | Q1943H BE.1.1 |
| ORF1a | T2007A / NSP3 |
| intergenic | T2007A BE.1.1 |
| intergenic | A2033V BA.5.2.3,BA.5.2.8,BE.1.1 |
| ORF1a | D2037G / NSP3 |
| intergenic | D2037G BE.1.1 |
| intergenic | T2106T BE.1.1 |
| intergenic | W2135L BE.1.1 |
| intergenic | F2145F BE.1.1 |
| intergenic | N2162N BE.1.1 |
| intergenic | L2236S BE.1.1 |
| intergenic | S2500F BA.5.1.30,BE.1.1 |
| intergenic | K2589R BE.1.1 |
| ORF1a | G2814G / NSP4 |
| intergenic | G2814G BE.1.1 |
| intergenic | T2936T BE.1.1 |
| ORF1a | D2980E / NSP4 |
| intergenic | D2980E BE.1.1 |
| intergenic | E2982E BE.1.1 |
| intergenic | H2986H BE.1.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | V3048V BE.1.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | K3187K BE.1.1 |
| intergenic | Y3226Y BE.1.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2,BF.9,BE.1.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | N3414N BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | V3420V BA.2.12,BE.1.1 |
| intergenic | T3459T BA.5.1.1,BE.1.1 |
| intergenic | T3461I BE.1.1 |
| intergenic | R3485R BE.1.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | L3800L BE.1.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1 |
| intergenic | I3853I BA.5.1.10,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BE.1.1 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1 |
| intergenic | T4174I BA.1.14,BE.1.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | T4354I BE.1.1 |
| intergenic | T4371T BE.1.1 |
| intergenic | L4391F BA.5,BE.1.1 |
| intergenic | L4441L BE.1.1 |
| intergenic | V4596V BE.1.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | L4779L BA.4,BE.1.1 |
| ORF1b | F4832F / NSP12 |
| intergenic | F4832F BE.1.1 |
| intergenic | H5042H BE.1.1 |
| intergenic | A5080A BE.1.1 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| ORF1b | S5160S / NSP12 |
| intergenic | S5160S BE.1.1 |
| ORF1b | S5227S / NSP12 |
| intergenic | S5227S BE.1.1 |
| intergenic | C5374C BE.1.1 |
| intergenic | S5404G BA.5.1.2,BE.1.1 |
| ORF1b | R5485K / NSP13 |
| intergenic | R5485K BE.1.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | M5557I BQ.1.1.8,BE.1.1 |
| intergenic | S5583L BE.1.1 |
| intergenic | E5689D BE.1.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | K5801R BE.1.1 |
| intergenic | R5814R BE.1.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | N5996N BE.1.1 |
| intergenic | T6028T BA.5.2.2,BE.1.1 |
| intergenic | P6046P BA.5.2.20,BE.1.1 |
| intergenic | G6114G BE.1.1 |
| intergenic | A6206T BE.1.1 |
| intergenic | A6232T BE.1.1 |
| intergenic | L6254L BE.1.1 |
| intergenic | D6300D BA.5.2.20,BE.1.1 |
| intergenic | I6537I BE.1.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| ORF1b | G6699G / NSP15 |
| intergenic | G6699G BE.1.1 |
| intergenic | S6739S BE.1.1 |
| intergenic | L6819L BA.5.2.2,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BE.1.1 |
| intergenic | H6917H BE.1.1 |
| intergenic | N7083N BE.1.1 |
| intergenic | N7084N BA.5.1.30,BE.1.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | D53D BA.5,BA.5.1.1,BQ.1.1.8,BE.1.1 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | V130V BA.5.2.8,BA.5.2.20,BE.1.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | QP173NS BE.1.1 |
| S | QP173NS BE.1.1 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | I231T BA.5,BE.1.1 |
| intergenic | N234N BE.1.1 |
| intergenic | S255F BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | R346I BA.5.2.2,BE.1.1 |
| intergenic | R346K BA.1.18,BE.1.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | V534V BE.1.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | R646H BE.1.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | Q675H BA.5.1.24,BE.1.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | A701A BE.1.1 |
| S | A701A BE.1.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | T883T BQ.1.1.8,BE.1.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | K1149R BE.1.1 |
| intergenic | D1260N BE.1.1 |
| intergenic | D1260Y BE.1.1 |
| intergenic | g.T-1C BE.1.1 |
| intergenic | I20T BE.1.1 |
| intergenic | S40L BA.5.2.3,BE.1.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | V90A BE.1.1 |
| intergenic | L115F BE.1.1 |
| intergenic | W131C BE.1.1 |
| intergenic | H150R BE.1.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | S253S BA.2.12,BE.1.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | DS3NF BE.1.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | A104V BA.2.86.1,BE.1.1 |
| intergenic | T172T BA.5,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30,BE.1.1 |
| intergenic | G38E BE.1.1 |
| intergenic | H73Y BA.5.1.24,BA.5.2.8,BE.1.1 |
| intergenic | V93F BA.5.1.30,BE.1.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | V62V BA.5.2.20,BE.1.1 |
| intergenic | Y79C BE.1.1 |
| intergenic | L84L BE.1.1 |
| intergenic | C90Y BE.1.1 |
| intergenic | E106D BE.1.1 |
| ORF8 | E106D BE.1.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | N8D BE.1.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | S26N BE.1.1 |
| intergenic | Q28Q BE.1.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | R36R BE.1.1 |
| intergenic | R40C BE.1.1 |
| intergenic | F53F BE.1.1 |
| intergenic | N75N BA.4.1.8,DV.7.1,BE.1.1 |
| intergenic | D98D BE.1.1 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | K127K BE.1.1 |
| intergenic | E136D BQ.1.1.8,BE.1.1 |
| intergenic | N154N BE.1.1 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | P279Q BE.1.1 |
| intergenic | L291L BE.1.1 |
| intergenic | Y298Y BA.1.17,BE.1.1 |
| intergenic | S318S BE.1.1 |
| intergenic | R319R BA.5.1.24,BE.1.1 |
| intergenic | T329T BE.1.1 |
| intergenic | T334T BE.1.1 |
| N | T334T BE.1.1 |
| intergenic | D341D BA.4.1.8,BA.5,BE.1.1 |
| intergenic | P383P BA.5.2.34,BE.1.1 |
| intergenic | A398V BA.5.1.24,BE.1.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | g.C-13T BA.5.2.3,BE.1.1 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30,BE.1.1 |
| intergenic | g.G29688C BE.1.1 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | S3S BF.28,CH.1.1.28 |
| intergenic | S74S CH.1.1.28 |
| intergenic | V84_V86del CH.1.1.28 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | L140L CH.1.1.28 |
| intergenic | T183N CH.1.1.28 |
| intergenic | V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5,BF.9,CH.1.1.28 |
| intergenic | P361S CH.1.1.28 |
| ORF1a | Q575Q / NSP2 |
| intergenic | Q575Q CH.1.1.28 |
| intergenic | T708I CH.1.1.28 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | Y921H CH.1.1.28 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | E977E CH.1.1.28 |
| intergenic | E1007E CH.1.1.28 |
| intergenic | T1055I CH.1.1.28 |
| ORF1a | I1091I / NSP3 |
| intergenic | I1091I CH.1.1.28 |
| intergenic | V1177V DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | Q1198K DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | S1221L DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | L1441L BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | P1640S DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | D1849D BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | A1923V CH.1.1.28 |
| intergenic | T2087I CH.1.1.28 |
| ORF1a | P2302P / NSP3 |
| intergenic | P2302P CH.1.1.28 |
| intergenic | H2986H BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28 |
| intergenic | Q3373Q CH.1.1.28 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| ORF1a | M3695T / NSP6 |
| intergenic | M3695T CH.1.1.28 |
| intergenic | I3737T CH.1.1.28 |
| intergenic | F3753V BA.5.2.34,CH.1.1.28 |
| intergenic | N4060S DV.7.1,CH.1.1.28 |
| ORF1a | T4129T / NSP8 |
| intergenic | T4129T CH.1.1.28 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | F4584F CH.1.1.28 |
| intergenic | G4622G CH.1.1.28 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | V5029I CH.1.1.28 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | L5099L CH.1.1.28 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | D5152D BA.5.1.24,DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | V5493F CH.1.1.28 |
| intergenic | A5626A BA.2.12,CH.1.1.28 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | V6107I DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | E6415E CH.1.1.28 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | Q6826R DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | V83V BA.5.1.10,BA.5.1.2,CH.1.1.28 |
| intergenic | S112S CH.1.1.28 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | K147E DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | W152R BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | S161S CH.1.1.28 |
| S | S161S CH.1.1.28 |
| intergenic | I210V DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | G257S DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | K444T BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | G446S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | F486S DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | N856N BQ.1.1.8,CH.1.1.28 |
| intergenic | S875S CH.1.1.28 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | P1162S BA.5.2.3,BA.5,CH.1.1.28 |
| intergenic | N1194N CH.1.1.28 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | R68T CH.1.1.28 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | T270T CH.1.1.28 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | T77I CH.1.1.28 |
| M | T77I CH.1.1.28 |
| intergenic | T77T CH.1.1.28 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | F87S CH.1.1.28 |
| intergenic | L14fs CH.1.1.28 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | I26S CH.1.1.28 |
| intergenic | H37Y CH.1.1.28 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | E31_S33del CH.1.1.28 |
| intergenic | N29_S33delinsHG CH.1.1.28 |
| N | N29_S33delinsHG CH.1.1.28 |
| intergenic | G71G CH.1.1.28 |
| intergenic | G178G BA.5.1.2,CH.1.1.28 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28 |
| intergenic | P302P BA.5.2.34,BA.4.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | A28A CH.1.1.28 |
| intergenic | g.C29686T DV.7.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28 |
| intergenic | g.C-44T BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | D33N BF.26 |
| intergenic | R43C BA.5.2.3,BA.5,BF.26 |
| intergenic | Q66Q BA.5.1.24,BF.26 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | SYG135RYC BF.26 |
| intergenic | H165Y BF.26 |
| intergenic | F190F BF.26 |
| intergenic | L259S BF.26 |
| intergenic | F266F BA.5.2.34,BF.26 |
| ORF1a | P286T / NSP2 |
| intergenic | P286T BF.26 |
| ORF1a | V337A / NSP2 |
| intergenic | V337A BF.26 |
| intergenic | G345G BF.26 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BF.26 |
| intergenic | I473T BF.26 |
| intergenic | K518K BF.26 |
| intergenic | I569T BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | A599V BA.2.12,BF.26 |
| intergenic | P626S BF.26 |
| intergenic | E633E BF.26 |
| intergenic | V757V BA.5.2.34,BF.26 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | F871F BA.5,BF.26 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | G963S BF.26 |
| intergenic | P971L BA.5,BA.5.1.2,BF.26 |
| intergenic | E973K BF.26 |
| intergenic | D978D BF.26 |
| ORF1a | Q990Q / NSP3 |
| intergenic | Q990Q BF.26 |
| intergenic | E1015K BF.26 |
| intergenic | V1099M BF.26 |
| intergenic | V1118V DV.7.1,BF.26 |
| ORF1a | N1121Y / NSP3 |
| intergenic | N1121Y BF.26 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | E1341E BA.5.2.34,BF.26 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | A1485A BF.26 |
| intergenic | S1539N BF.26 |
| intergenic | F1544F BF.26 |
| intergenic | H1545H BF.26 |
| intergenic | S1612L BF.26 |
| intergenic | R1628C BF.26 |
| intergenic | M1647I BF.26 |
| intergenic | N1673N BA.5.1.10,BA.4,BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | D1742N BF.26 |
| intergenic | K1781K BA.5.2.8,BF.26 |
| ORF1a | C1789C / NSP3 |
| intergenic | C1789C BF.26 |
| intergenic | D1849N BF.26 |
| intergenic | D1849D BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | Y1868Y BA.4,BA.5.1.24,BF.26 |
| intergenic | N1871N BF.26 |
| intergenic | P2018L BF.26 |
| intergenic | L2062F BA.5.1.10,BF.26 |
| intergenic | A2123A BF.26 |
| intergenic | A2199V BF.26 |
| intergenic | S2285F BF.26 |
| intergenic | L2329L BF.26 |
| intergenic | F2334F BA.2.12,BF.26 |
| ORF1a | D2668D / NSP3 |
| intergenic | D2668D BF.26 |
| intergenic | P2685P BF.26 |
| intergenic | A2745V BF.26 |
| intergenic | S2797F BA.1.17,BF.26 |
| intergenic | H2799Y BA.4,BF.26 |
| ORF1a | D2819N / NSP4 |
| intergenic | D2819N BF.26 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | L3041L BF.26 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | A3061A BA.5.2.3,BF.26 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | D3222D BA.5.1.24,BF.26 |
| intergenic | L3238L BA.5.2.20,BF.26 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | G3278S BF.26 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | T3356I BF.26 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | A3615V BA.5.1.2,BF.26 |
| intergenic | A3620V BA.1.14,BF.26 |
| intergenic | P3642P BF.26 |
| intergenic | A3645V BF.26 |
| intergenic | 3676del BF.26 |
| intergenic | F3677del BF.26 |
| intergenic | S3675del BF.26 |
| intergenic | F3769F BA.5.1.30,BF.26 |
| ORF1a | A3837V / NSP6 |
| intergenic | A3837V BF.26 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | L4045L BA.4,BA.4.1,BF.26 |
| intergenic | T4161I BF.26 |
| intergenic | Y4172Y BA.5.1.2,BF.26 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | D4218D BF.26 |
| ORF1a | T4300T / NSP10 |
| intergenic | T4300T BF.26 |
| intergenic | T4302I BF.26 |
| ORF1a | E4319E / NSP10 |
| intergenic | E4319E BF.26 |
| intergenic | N4358N BA.2.86.1,BF.26 |
| intergenic | V4372V BA.5.2.8,BF.26 |
| intergenic | S4398L BA.1.17,BA.5.1.30,BF.26 |
| intergenic | Y4430Y BA.2.86.1,BA.5.2.20,BF.26 |
| intergenic | P4486L BA.5.2.34,BF.26 |
| intergenic | V4503I BF.26 |
| intergenic | D4532D BF.28,BF.26 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | G4777S BF.26 |
| intergenic | F4820F BA.5.1.10,BA.4.1,BF.26 |
| ORF1b | G5070G / NSP12 |
| intergenic | G5070G BF.26 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | T5093T BF.26 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | D5152D BA.5.1.24,DV.7.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.2,BF.26 |
| intergenic | Q5267Q BF.26 |
| intergenic | A5342V BA.4,BF.9,BF.26 |
| intergenic | T5451I BA.5.1.10,BF.26 |
| intergenic | H5488Y BF.26 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | A5626A BA.2.12,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | Y5648Y BF.26 |
| ORF1b | A5686A / NSP13 |
| intergenic | A5686A BF.26 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3,BA.5.1.30,BF.26 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | V5721V BF.26 |
| intergenic | I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5.2.8,BF.26 |
| intergenic | M5900I BF.26 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | D6104D BA.2.12,BF.26 |
| intergenic | V6106V BA.5.1.10,BF.26 |
| intergenic | T6140I BF.26 |
| intergenic | T6148T BF.26 |
| intergenic | G6190V BF.26 |
| intergenic | D6300D BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | DRYP6315EGCH BA.2.12,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.26 |
| intergenic | L6404L BF.26 |
| intergenic | R6513R BF.26 |
| intergenic | D6530D BF.26 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | C6742F BF.26 |
| intergenic | N6841N BF.26 |
| ORF1b | D6900D / NSP16 |
| intergenic | D6900D BF.26 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | T22I BF.26 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | F55F BF.9,BF.28,BF.26 |
| intergenic | H69del BA.5.1.30,BF.26 |
| intergenic | V70del BA.5.1.30,BF.26 |
| intergenic | D111N BF.26 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | A222V BF.26 |
| intergenic | I235I BF.26 |
| S | I235I BF.26 |
| intergenic | S256P BF.26 |
| intergenic | T333T BF.26 |
| intergenic | P337P BF.26 |
| S | P337P BF.26 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | R346S BA.4,BA.5.2.3,BF.26 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | I410I BQ.1.1.8,BF.26 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | C432C BA.5,BF.28,BF.26 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | Y495Y BF.26 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | E554Q BF.26 |
| intergenic | T572T BF.26 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | I624I BF.26 |
| intergenic | F643F BF.26 |
| S | F643F BF.26 |
| intergenic | A647S BA.5.1.24,BF.26 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | T676I BF.26 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | P728P BF.26 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | L877L BF.26 |
| intergenic | T883I BF.26 |
| intergenic | N925N BF.26 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | P1143H BF.26 |
| S | P1143H BF.26 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | Y1155F BF.26 |
| S | Y1155F BF.26 |
| intergenic | M1237I BF.26 |
| intergenic | I20I BA.1.17,BA.5.1.24,BF.26 |
| intergenic | V29F BF.26 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | L84L BF.26 |
| intergenic | T89I BF.26 |
| intergenic | V97I BF.26 |
| intergenic | Y107Y BF.26 |
| intergenic | T175I BA.5.1.30,BF.26 |
| intergenic | T176I BA.1.17,BF.26 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | T269T BF.26 |
| intergenic | S272G BF.26 |
| ORF3a | S272G BF.26 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | L17F BF.26 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | T172T BA.5,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26 |
| intergenic | Y199Y BF.26 |
| intergenic | g.G-1T BF.26 |
| intergenic | I36V BF.26 |
| intergenic | D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3,BF.41,BF.26 |
| intergenic | A8T BF.26 |
| intergenic | N52N BF.26 |
| intergenic | Q94H BF.26 |
| intergenic | Y97Y BF.26 |
| intergenic | V104I BF.26 |
| ORF7a | V104I BF.26 |
| intergenic | MI1? BF.26 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | P70P BF.26 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2,BF.26 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | Q9Q BF.26 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | T16M BF.26 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | G30_S33delinsF BF.26 |
| intergenic | Q28_S33delinsHNF BF.26 |
| N | Q28_S33delinsHNF BF.26 |
| intergenic | A50A BF.26 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | P258S BF.26 |
| N | P258S BF.26 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1,BF.26 |
| intergenic | P279Q BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | Y333Y BA.4,BF.26 |
| intergenic | H356H BF.26 |
| intergenic | A398V BA.5.1.24,BE.1.1,BF.26 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | g.C-17T BF.26 |
| intergenic | g.C-13A BF.26 |
| intergenic | P10L BF.26 |
| intergenic | g.T29682C BF.26 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26 |
| intergenic | g.C29769T DV.7.1,BA.5.2.20,BF.26 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | g.CGTCC-25_-21TGTCT BQ.1.13 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13 |
| intergenic | R77R BQ.1.13 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13 |
| intergenic | L92F BQ.1.13 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | L140L CH.1.1.28,BQ.1.13 |
| intergenic | S216S BA.4,BQ.1.13 |
| intergenic | R232C BQ.1.13 |
| intergenic | R232R BQ.1.13 |
| intergenic | L293L BQ.1.13 |
| intergenic | C316C BQ.1.13 |
| intergenic | H325Y BQ.1.13 |
| intergenic | S383N BQ.1.13 |
| intergenic | S481S BA.5.1.10,BQ.1.1.8,BQ.1.13 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13 |
| intergenic | S538L BA.5.1.24,BQ.1.13 |
| intergenic | A540V BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.13 |
| intergenic | Q556K BA.4,BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13 |
| intergenic | A599A BA.5.1.1,BQ.1.13 |
| intergenic | V627I BA.4,BQ.1.13 |
| intergenic | A656V BA.1.14,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.13 |
| intergenic | L681F BA.2.12,BQ.1.13 |
| intergenic | Y717Y BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13 |
| intergenic | N786N BA.5.2.34,BQ.1.13 |
| intergenic | M789I BQ.1.13 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | L897L BQ.1.1.8,BQ.1.13 |
| intergenic | M902V BQ.1.13 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| ORF1a | 1057 / NSP3 |
| intergenic | 1057 BQ.1.13 |
| intergenic | V1056V BQ.1.13 |
| intergenic | N1059N BA.4.1,BQ.1.13 |
| ORF1a | D1088N / NSP3 |
| intergenic | D1088N BQ.1.13 |
| intergenic | L1249F BQ.1.13 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| ORF1a | L1560F / NSP3 |
| intergenic | L1560F BQ.1.13 |
| intergenic | P1692S BA.4.1.8,BQ.1.13 |
| intergenic | L1725L BQ.1.13 |
| intergenic | I1785T BQ.1.13 |
| intergenic | D1903D BQ.1.13 |
| intergenic | A1997V BQ.1.13 |
| ORF1a | V2051V / NSP3 |
| intergenic | V2051V BQ.1.13 |
| intergenic | H2092Y BQ.1.13 |
| ORF1a | V2150I / NSP3 |
| intergenic | V2150I BQ.1.13 |
| intergenic | F2172F BQ.1.1.8,BQ.1.13 |
| intergenic | F2338F BQ.1.13 |
| intergenic | F2351F BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13 |
| ORF1a | D2579D / NSP3 |
| intergenic | D2579D BQ.1.13 |
| ORF1a | S2731G / NSP3 |
| intergenic | S2731G BQ.1.13 |
| intergenic | T2823I BQ.1.13 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | M3087I BQ.1.13 |
| intergenic | T3090I BA.5.2.2,BQ.1.13 |
| intergenic | L3238L BA.5.2.20,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | A3357A BA.4,BQ.1.13 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | A3497V BQ.1.13 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | L3644F BF.9,BQ.1.13 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13 |
| intergenic | I3758I BQ.1.13 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13 |
| intergenic | L3840L BQ.1.13 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13 |
| ORF1a | I4114V / NSP8 |
| intergenic | I4114V BQ.1.13 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | T4249I BQ.1.13 |
| intergenic | T4258I BQ.1.13 |
| intergenic | A4324A BQ.1.13 |
| intergenic | D4335N BQ.1.13 |
| intergenic | Y4665H BQ.1.1.8,BQ.1.13 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | A4972A BA.4,BQ.1.13 |
| intergenic | H5117H BA.4.1,BQ.1.13 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| ORF1b | C5191C / NSP12 |
| intergenic | C5191C BQ.1.13 |
| intergenic | M5557I BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13 |
| intergenic | N5592S BQ.1.1.8,BQ.1.13 |
| intergenic | L5619L BQ.1.13 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | P5971S BQ.1.13 |
| intergenic | P6164P BQ.1.13 |
| intergenic | H6298Y BQ.1.13 |
| ORF1b | S6299S / NSP14 |
| intergenic | S6299S BQ.1.1.8,BQ.1.13 |
| intergenic | F6302F BQ.1.13 |
| intergenic | V6314V BA.4,BQ.1.13 |
| intergenic | L6418F BQ.1.13 |
| intergenic | E6508E BQ.1.13 |
| intergenic | V6529V BQ.1.13 |
| intergenic | Y6540Y BQ.1.13 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | I6674S BQ.1.13 |
| ORF1b | I6674I / NSP15 |
| intergenic | I6674I BQ.1.13 |
| ORF1b | W6784L / NSP15 |
| intergenic | W6784L BQ.1.13 |
| ORF1b | V6842V / NSP16 |
| intergenic | V6842V BQ.1.13 |
| intergenic | N6853N BQ.1.13 |
| intergenic | L6961F BQ.1.13 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | L48L BQ.1.13 |
| intergenic | F58F BA.5.1.30,BQ.1.13 |
| intergenic | H69del BQ.1.13 |
| intergenic | I68_V70delinsT BQ.1.13 |
| intergenic | V70del BQ.1.13 |
| intergenic | G72R BQ.1.13 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | P174S BQ.1.13 |
| intergenic | N211_V213delinsIG BA.2.86.1,BQ.1.13 |
| intergenic | V213G BQ.1.13 |
| intergenic | S255F BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | K444T BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | T618K BQ.1.13 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | S704L BA.2.12,BQ.1.13 |
| intergenic | L727L BQ.1.13 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | S810L BQ.1.13 |
| intergenic | L841L BQ.1.13 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | I1232F BQ.1.13 |
| S | I1232F BQ.1.13 |
| intergenic | C1235F BQ.1.13 |
| intergenic | P36P BQ.1.13 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | L71L BA.5,BQ.1.13 |
| intergenic | C81F BQ.1.13 |
| ORF3a | C81F BQ.1.13 |
| intergenic | P104dup BQ.1.13 |
| intergenic | G172C BQ.1.13 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | L90L BQ.1.13 |
| intergenic | N117N BQ.1.13 |
| intergenic | D160D BQ.1.13 |
| intergenic | Y31Y BA.5.1.24,BA.5,BQ.1.13 |
| intergenic | D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3,BF.41,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | I10T BQ.1.13 |
| intergenic | C23F BQ.1.13 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9,BA.5.2.20,BQ.1.13 |
| intergenic | A55S BQ.1.13 |
| intergenic | Q94H BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | FI120VL BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BQ.1.13 |
| intergenic | I121fs BQ.1.13 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13 |
| intergenic | T54T BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.13 |
| intergenic | E136D BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | A251V BQ.1.13 |
| intergenic | P383P BA.5.2.34,BE.1.1,BQ.1.13 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13 |
| intergenic | N25S BQ.1.13 |
| ORF10 | N25S BQ.1.13 |
| intergenic | g.C29686T DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13 |
| intergenic | g.G29692T BA.5,BQ.1.13 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | V35V BF.9,DV.7.1.2 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.10,DV.7.1.2 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | Y185H DV.7.1.2 |
| intergenic | A427V BA.5.2.34,DV.7.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | V464I DV.7.1.2 |
| intergenic | S505S BA.4,BA.5.1.30,DV.7.1.2 |
| intergenic | S538P DV.7.1.2 |
| intergenic | L628F DV.7.1.2 |
| intergenic | T654T DV.7.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | T746T DV.7.1.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | A1151S DV.7.1.2 |
| intergenic | A1176V DV.7.1.2 |
| intergenic | V1177V DV.7.1.2 |
| intergenic | Q1198K DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | S1221L DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | I1257I DV.7.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | A1314V DV.7.1.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | L1379L DV.7.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | P1390P DV.7.1.2 |
| intergenic | L1441L BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | K1529R DV.7.1.2 |
| intergenic | P1640S DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | N1673N BA.5.1.10,BA.4,BE.1.1,BF.26,DV.7.1.2 |
| intergenic | K1855R DV.7.1.2 |
| intergenic | D1913D DV.7.1.2 |
| intergenic | P1921S BF.20,BA.5.1.30,DV.7.1.2 |
| intergenic | T1998T DV.7.1.2 |
| intergenic | G2035R DV.7.1.2 |
| intergenic | G2126D DV.7.1.2 |
| intergenic | A2129A DV.7.1.2 |
| intergenic | S2132G BQ.1.1.8,DV.7.1.2 |
| intergenic | S2246L DV.7.1.2 |
| intergenic | M2254T DV.7.1.2 |
| intergenic | M2259I DV.7.1.2 |
| intergenic | N2272N BA.2.12,DV.7.1.2 |
| intergenic | T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2 |
| intergenic | L2329L BF.26,DV.7.1.2 |
| intergenic | D2525D DV.7.1.2 |
| intergenic | A2891V DV.7.1.2 |
| intergenic | D2980D DV.7.1.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8,DV.7.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2 |
| intergenic | S3149S DV.7.1.2 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | G3458G DV.7.1.2 |
| intergenic | A3548V DV.7.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | L3591L DV.7.1.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | L3828L DV.7.1.2 |
| intergenic | D3836D DV.7.1.2 |
| intergenic | N4060S DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | N4078S DV.7.1.2 |
| intergenic | T4158A DV.7.1.2 |
| intergenic | A4162V DV.7.1.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | A4357A DV.7.1.2 |
| intergenic | T4364T DV.7.1.2 |
| intergenic | D4501G DV.7.1.2 |
| intergenic | R4589Q DV.7.1.2 |
| intergenic | Y4686Y BA.4.1.8,DV.7.1.2 |
| intergenic | C4698C DV.7.1.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | N4795N BA.5.2.20,DV.7.1.2 |
| intergenic | C4874Y DV.7.1.2 |
| intergenic | N4888N DV.7.1.2 |
| intergenic | A4921V BA.5.2.3,DV.7.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | T5035I DV.7.1.2 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | N5410N DV.7.1.2 |
| intergenic | A5620T BA.4,DV.7.1.2 |
| intergenic | R5716C DV.7.1.2 |
| intergenic | T5737I BA.5.1.24,DV.7.1.2 |
| intergenic | T5912I BA.5.1.10,DV.7.1.2 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | V6107I DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | T6140A DV.7.1.2 |
| intergenic | V6242I DV.7.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | A6269V DV.7.1.2 |
| intergenic | Q6471H DV.7.1.2 |
| intergenic | R6513R BF.26,DV.7.1.2 |
| intergenic | P6517P DV.7.1.2 |
| intergenic | K6541R DV.7.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | A6623V DV.7.1.2 |
| intergenic | Q6826R DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | V6902V DV.7.1.2 |
| intergenic | T6938I BA.2.12,BA.5,BA.5.2.20,DV.7.1.2 |
| intergenic | I6955V DV.7.1.2 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | T22T DV.7.1.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | V83F DV.7.1.2 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | K147E DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | W152R BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | A163V DV.7.1.2 |
| intergenic | N185D DV.7.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | N196N DV.7.1.2 |
| intergenic | I210V DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2 |
| intergenic | D253V DV.7.1.2 |
| intergenic | G257S DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | A262V DV.7.1.2 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | G413G DV.7.1.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | NL440KF DV.7.1.2 |
| intergenic | K444T BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | G446S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | N481N DV.7.1.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | F486S DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | N606N DV.7.1.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | T732T BA.4.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | L858I DV.7.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | L877L BF.26,DV.7.1.2 |
| intergenic | Q935Q DV.7.1.2 |
| intergenic | S937S DV.7.1.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | T961M DV.7.1.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | P1143P DV.7.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | D1163Y BA.5.2.2,DV.7.1.2 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | K21N BA.5.1.10,BA.5.1.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | A72T DV.7.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | S74F BA.4,DV.7.1.2 |
| intergenic | A110V DV.7.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | Y189Y BA.4.1,DV.7.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | D199fs DV.7.1.2 |
| intergenic | L203fs DV.7.1.2 |
| intergenic | Y212Y DV.7.1.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | P267L DV.7.1.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | L74L DV.7.1.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | V70I DV.7.1.2 |
| intergenic | F100F BA.5.1.24,DV.7.1.2 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | G202G BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1.2 |
| intergenic | M19K DV.7.1.2 |
| intergenic | R20R DV.7.1.2 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | E16E DV.7.1.2 |
| intergenic | L31L BA.5.1.2,BA.4.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | G38X DV.7.1.2 |
| intergenic | A55T DV.7.1.2 |
| intergenic | L96F DV.7.1.2 |
| intergenic | T120I BQ.1.1.8,BF.28,DV.7.1.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | I27T DV.7.1.2 |
| intergenic | I10V DV.7.1.2 |
| intergenic | S69P BA.5.1.2,DV.7.1.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | P122L DV.7.1.2 |
| intergenic | H145Y DV.7.1.2 |
| intergenic | S193I DV.7.1.2 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | T362I BA.5.1.24,BA.4.1,DV.7.1.2 |
| intergenic | D402D DV.7.1.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2 |
| intergenic | M1? DV.7.1.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2 |
| intergenic | g.C-160T BA.5.1.24,BE.1.1,BA.1.15 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | E311G BA.1.15 |
| intergenic | A735A BA.1.14,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | K856R BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | V879V BA.2.12,BA.1.15 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | T1168I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.1.15 |
| intergenic | T1426T BA.5.2.2,DV.7.1,BA.1.15 |
| ORF1a | S1587L / NSP3 |
| intergenic | S1587L BA.1.15 |
| intergenic | A1707A BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | M1769I BA.1.15 |
| ORF1a | C1833C / NSP3 |
| intergenic | C1833C BA.1.15 |
| intergenic | S2083_L2084delinsI BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | A2710T BA.2.86.1,BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | N2966N BA.1.15 |
| intergenic | F3018F BA.4,BA.5,BF.28,BA.1.15 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | L3290L BA.1.15 |
| intergenic | P3395H BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15 |
| intergenic | L3674_G3676del BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | I3758V BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | V4310V BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | T4668T BA.1.15 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | Y4875Y BA.1.15 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20,BA.1.15 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15 |
| intergenic | K5190K BA.1.15 |
| intergenic | A5315V BA.1.15 |
| intergenic | A5458S BA.1.15 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | K6236N BA.1.15 |
| intergenic | T6557T BA.1.15 |
| intergenic | D6912D BA.1.15 |
| ORF1b | V6916I / NSP16 |
| intergenic | V6916I BA.1.15 |
| intergenic | Y6930Y BA.5.1.10,BA.1.15 |
| intergenic | A6986A BA.1.15 |
| intergenic | V11V BA.5.2.34,BA.1.18,BF.28,BA.1.15 |
| intergenic | H69del BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | V70del BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | T95I BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | G142_Y145delinsD BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | N211_L212delinsI BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | R214_D215insEPE BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15 |
| intergenic | R346K BA.1.18,BE.1.1,BA.1.15 |
| intergenic | S371L BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | S375F BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | G446S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | Q493R BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | G496S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | T547K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BQ.1.1.8,BA.1.15 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | N856K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | L981F BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | P104dup BQ.1.13,BA.1.15 |
| intergenic | L106F BA.1.15 |
| intergenic | S165F BA.1.15 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | D3G BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | L90L BA.1.15 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15 |
| intergenic | D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3,BF.41,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24,BA.1.15 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | A35A BA.1.15 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15 |
| intergenic | D343G BA.1.15 |
| intergenic | g.C-17T BF.26,BA.1.15 |
| intergenic | g.C-126T BF.10 |
| intergenic | g.C-48T BF.10 |
| intergenic | g.G-47A BF.10 |
| intergenic | g.T-45C BF.10 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | G52G BF.28,BF.10 |
| intergenic | V54del BF.10 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10 |
| intergenic | V108V BF.10 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | G146D BF.10 |
| intergenic | T163I BF.10 |
| intergenic | R232H BF.10 |
| intergenic | V288V BF.10 |
| intergenic | T333M BA.4.1,BF.10 |
| intergenic | A354A BF.10 |
| intergenic | R402R BA.5.2.34,DV.7.1,BF.10 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BF.26,BF.10 |
| ORF1a | A486A / NSP2 |
| intergenic | A486A BF.10 |
| ORF1a | E525G / NSP2 |
| intergenic | E525G BF.10 |
| intergenic | T568I DV.7.1,BF.10 |
| intergenic | Y600Y BF.10 |
| ORF1a | G618S / NSP2 |
| intergenic | G618S BA.5.1.1,BF.10 |
| intergenic | N786N BA.5.2.34,BQ.1.13,BF.10 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | V886V BA.5.1.24,BF.10 |
| intergenic | Y906Y BF.10 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | P971L BA.5,BA.5.1.2,BF.26,BF.10 |
| intergenic | P1147S BF.10 |
| intergenic | F1190L BF.10 |
| intergenic | L1249F BQ.1.13,BF.10 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | P1330P BF.10 |
| intergenic | T1338T BF.10 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | F1353fs BA.5.1.10,BA.5,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.10 |
| intergenic | K1364K BF.10 |
| ORF1a | P1497H / NSP3 |
| intergenic | P1497H BF.10 |
| intergenic | D1554D BF.10 |
| ORF1a | M1588T / NSP3 |
| intergenic | M1588T BA.5.1.10,BF.10 |
| intergenic | N1673N BA.5.1.10,BA.4,BE.1.1,BF.26,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | K1720N BA.2.12,BF.10 |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10 |
| intergenic | I1785T BQ.1.13,BF.10 |
| intergenic | T2069I BF.10 |
| intergenic | F2172F BQ.1.1.8,BQ.1.13,BF.10 |
| intergenic | G2207S BF.10 |
| intergenic | V2238V BA.5,BF.20,BF.9,BF.28,BF.10 |
| intergenic | G2258G BF.10 |
| intergenic | V2421V BA.4,BF.10 |
| intergenic | L2609L BA.5.1.24,BF.10 |
| intergenic | T2648I BA.5.2.2,BF.10 |
| intergenic | A2759T BF.10 |
| ORF1a | T2920T / NSP4 |
| intergenic | T2920T BF.10 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | L3034L BF.10 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | L3086F BF.10 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | L3116F BF.10 |
| intergenic | R3163K BF.10 |
| intergenic | L3234L BA.1.17,BF.10 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | D3297D BF.10 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | L3321L BA.5.2.3,BA.4.1,BF.10 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10 |
| intergenic | C3380C BF.10 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | L3915F BF.10 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10 |
| intergenic | A4016V BF.10 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | V4463V BF.10 |
| intergenic | D4652D BA.4,DV.7.1,BF.10 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | Q4836Q BF.10 |
| intergenic | A4921V BA.5.2.3,DV.7.1,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | A4946V BF.10 |
| intergenic | A5077A BF.10 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | F5348F BF.10 |
| intergenic | N5375N BF.10 |
| intergenic | H5399H BF.10 |
| intergenic | Y5535Y BF.10 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10 |
| intergenic | A5636A BF.10 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3,BA.5.1.30,BF.26,BF.10 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10 |
| ORF1b | I5756V / NSP13 |
| intergenic | I5756V BF.10 |
| intergenic | V5776V BA.1.17,BF.10 |
| intergenic | T5912I BA.5.1.10,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | L6205L BA.5.1.10,BF.10 |
| intergenic | D6440D BF.10 |
| intergenic | Y6540Y BQ.1.13,BF.10 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | G6738V BF.10 |
| ORF1b | V6882V / NSP16 |
| intergenic | V6882V BF.10 |
| intergenic | D6931D BA.5.1.2,BF.10 |
| intergenic | F6948F BF.10 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | H245H BF.10 |
| intergenic | A262A BA.5.2.2,BF.10 |
| S | A262A BA.5.2.2,BF.10 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | R346S BA.4,BA.5.2.3,BF.26,BF.10 |
| intergenic | R357R BF.10 |
| S | R357R BF.10 |
| intergenic | S371F BF.10 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | D428D BF.10 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | K444M BF.10 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | F486I BF.10 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | Y508Y BA.4.1,BF.10 |
| intergenic | L518I BA.5.2.2,BF.10 |
| S | L518I BA.5.2.2,BF.10 |
| intergenic | T553I BF.10 |
| intergenic | I587I BF.10 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | N616N BF.10 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | V705F BF.10 |
| S | V705F BA.1,BF.10 |
| intergenic | A706V BA.1.14,BF.10 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | Q779K BF.10 |
| intergenic | E780D BF.10 |
| intergenic | L858L BF.10 |
| intergenic | P862P BF.10 |
| intergenic | N925N BF.26,BF.10 |
| intergenic | S929S BF.10 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | F1062Y BF.10 |
| S | F1062Y BF.10 |
| intergenic | L1063L BF.10 |
| S | L1063L BF.10 |
| intergenic | V1129I BF.10 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | L1218L BF.10 |
| intergenic | Q57H BF.9,BF.10 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | S74F BA.4,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | C133C BF.10 |
| intergenic | D199A BF.10 |
| ORF3a | D199A BF.10 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | E239D BF.10 |
| intergenic | g.G-18T BA.5.2.2,BF.10 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10 |
| intergenic | T9T BF.10 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | I161I BA.5.2.3,BF.10 |
| intergenic | T172T BA.5,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10 |
| intergenic | T11I BF.10 |
| intergenic | S37F BF.10 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10 |
| intergenic | L4L BF.10 |
| intergenic | D63Y BF.10 |
| intergenic | T87I BA.5.1.10,BF.10 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | N8N BF.10 |
| intergenic | P13F BA.5.1.10,BF.10 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | R36R BE.1.1,BF.10 |
| intergenic | S37P BF.10 |
| intergenic | T49I BA.5,BA.5.1.30,BF.10 |
| intergenic | R68R BA.1.14,BF.10 |
| intergenic | L113L BF.10 |
| intergenic | T148T BF.10 |
| intergenic | N192N BA.5.1.10,BA.4,BF.10 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10 |
| intergenic | G215G BF.10 |
| N | G215G BF.10 |
| intergenic | P309P BA.4.1,BA.5.2.20,BF.10 |
| intergenic | A336V BF.10 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | R24H BA.2.12,BF.10 |
| intergenic | g.G29688T BF.10 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10 |
| intergenic | g.G-142A BA.5.5 |
| intergenic | g.C-44T BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| ORF1a | A76V / NSP1 |
| intergenic | A76V BA.5.5 |
| intergenic | G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.5 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | L140L CH.1.1.28,BQ.1.13,BA.5.5 |
| intergenic | K141K BA.5.5 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | C213C BA.2.12,BA.5.5 |
| intergenic | G295G BA.5.5 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5 |
| intergenic | C344C BA.5.5 |
| intergenic | T350I BA.5.2.3,BA.5.5 |
| intergenic | S376L BA.5.2.3,BA.5.5 |
| intergenic | T512K BA.5.5 |
| intergenic | Q563H BA.5.5 |
| ORF1a | K634K / NSP2 |
| intergenic | K634K BA.5.5 |
| intergenic | L642F BA.4.1,BA.5.5 |
| intergenic | D644D BA.5.1.10,BA.5.2.34,BE.1.1,BA.5.5 |
| intergenic | D762D BA.5.5 |
| intergenic | V774V BA.5,BA.5.5 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | A903V BA.5.5 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | A1049V BA.4.1.8,BQ.1.1.8,BA.5.5 |
| intergenic | N1059N BA.4.1,BQ.1.13,BA.5.5 |
| ORF1a | N1080S / NSP3 |
| intergenic | N1080S BA.5.5 |
| intergenic | G1125C BA.5.5 |
| ORF1a | H1160H / NSP3 |
| intergenic | H1160H BA.5.5 |
| intergenic | I1232I BF.41,BA.5.5 |
| intergenic | D1273D BA.5,BQ.1.1.8,BA.5.5 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | A1397A BA.2.12,BA.5,DV.7.1,BA.5.5 |
| intergenic | Y1425Y BA.5.5 |
| intergenic | Y1486Y BA.5.5 |
| intergenic | T1542T BA.5.5 |
| intergenic | Y1619Y DV.7.1,BA.5.5 |
| intergenic | Y1675Y BA.5.5 |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | S1952L BA.5.5 |
| intergenic | T2152I BA.1.17,BA.5.5 |
| intergenic | F2172F BQ.1.1.8,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | N2201N BA.5.5 |
| intergenic | D2299D BA.4,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.5 |
| intergenic | T2306T BA.5.1.30,BA.5.5 |
| intergenic | M2374T BA.5.5 |
| ORF1a | F2390Y / NSP3 |
| intergenic | F2390Y BA.5.5 |
| ORF1a | C2404C / NSP3 |
| intergenic | C2404C BA.5.5 |
| intergenic | V2421V BA.4,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | I2490I BA.5.5 |
| intergenic | K2533R BA.5.5 |
| intergenic | M2565V BA.5.5 |
| intergenic | N2623S BA.5.5 |
| intergenic | D2687D BA.5.5 |
| intergenic | A2759V BQ.1.1.8,BA.5.5 |
| intergenic | V2857V BA.5.5 |
| intergenic | F2884F BF.28,BA.5.5 |
| intergenic | R2953R BA.5.5 |
| intergenic | T2967T BA.5.5 |
| intergenic | V2998V BA.5.5 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8,DV.7.1,DV.7.1.2,BA.5.5 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | F3153F BA.5.5 |
| intergenic | R3163K BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | L3338F BA.5.2.20,BF.28,BA.5.5 |
| intergenic | L3338L BA.5.5 |
| intergenic | V3367V BA.5.5 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | D3479D BA.5.2.8,BA.5.5 |
| intergenic | R3542C BA.5.2.20,BA.5.5 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | A3615V BA.5.1.2,BF.26,BA.5.5 |
| intergenic | L3636L BA.5.1.24,BA.4.1,BA.5.5 |
| intergenic | L3644F BF.9,BQ.1.13,BA.5.5 |
| intergenic | A3648V BA.5.2.20,BA.5.5 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | F3770F BA.5.5 |
| intergenic | Y3803Y BA.2.12,BA.5.2.8,BA.5.5 |
| intergenic | L3828L BA.5,DV.7.1,BA.5.5 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5 |
| intergenic | K3839K BA.4.1,BA.5.2.20,BA.5.5 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | G4178S BA.5.5 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | A4248A BA.5.5 |
| intergenic | T4249I BQ.1.13,BA.5.5 |
| intergenic | N4358N BA.2.86.1,BF.26,BA.5.5 |
| intergenic | L4391F BA.5,BE.1.1,BA.5.5 |
| intergenic | T4443I BA.5.5 |
| intergenic | R4447R BA.5.1.24,BA.5.5 |
| intergenic | K4483R BA.5,BA.5.5 |
| intergenic | P4486L BA.5.2.34,BF.26,BA.5.5 |
| ORF1b | P4504P / NSP12 |
| intergenic | P4504P BA.5.5 |
| intergenic | F4584F CH.1.1.28,BA.5.5 |
| intergenic | T4638I BF.9,BA.5.5 |
| ORF1b | V4707G / NSP12 |
| intergenic | V4707G BA.5.5 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| ORF1b | E4742G / NSP12 |
| intergenic | E4742G BA.5.5 |
| intergenic | P4770P BA.1.14,BA.5.5 |
| intergenic | L4779L BA.4,BE.1.1,BA.5.5 |
| intergenic | N4795N BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.5.5 |
| intergenic | N4851N BA.5.1.10,BA.5.5 |
| intergenic | D4915D BA.2.12,BA.5.5 |
| intergenic | A4921V BA.5.2.3,DV.7.1,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20,BA.1.15,BA.5.5 |
| ORF1b | V5067I / NSP12 |
| intergenic | V5067I BA.5.5 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | S5170S BA.5.5 |
| intergenic | V5481L BF.28,BA.5.5 |
| intergenic | G5530C BA.5.5 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5 |
| ORF1b | V5545F / NSP13 |
| intergenic | V5545F BA.5.5 |
| intergenic | A5636A BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | E5665D BA.5.5 |
| intergenic | E5689D BE.1.1,BA.5.5 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | P5726P BA.5,BA.5.5 |
| intergenic | H5806H BA.5.5 |
| intergenic | T5941I BA.5.5 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | D6097D BA.2.12,BA.5.2.20,BA.5.5 |
| intergenic | H6208H BA.5.5 |
| ORF1b | I6322I / NSP14 |
| intergenic | I6322I BA.5.5 |
| intergenic | Y6436Y BA.5.5 |
| intergenic | I6515T BA.5.5 |
| intergenic | A6533V BA.5.5 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | T6566T BA.5.5 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | F6628F BA.5,BA.5.5 |
| intergenic | N6651S BA.5.5 |
| intergenic | S6780S BA.5.5 |
| intergenic | A6802A BA.5.5 |
| ORF1b | T6908T / NSP16 |
| intergenic | T6908T BA.5.5 |
| ORF1b | G6946C / NSP16 |
| intergenic | G6946C BA.5.5 |
| intergenic | F6948F BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5 |
| intergenic | L8L BA.5.5 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | T76I BA.5.5 |
| intergenic | D88D BA.5.5 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | T250P BA.5.5 |
| S | T250P BA.5.5 |
| intergenic | V327V BA.5,BA.5.5 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | R346S BA.4,BA.5.2.3,BF.26,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | L629L BA.5.1.24,BF.9,BA.5.5 |
| S | L629L BA.5.1.24,BA.5.5,BF.9 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | A701V BA.1.17,BA.4.1,BA.5.5 |
| intergenic | L754L BA.5.5 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | L821L BA.5.5 |
| intergenic | T883I BF.26,BA.5.5 |
| intergenic | G932G BA.5.5 |
| intergenic | Q954H BA.5.5 |
| intergenic | Q954R BA.5.5 |
| S | Q954R BA.5.5 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | A1016S BA.5.5 |
| S | A1016S BA.5.5 |
| intergenic | K1073T BA.5.5 |
| S | K1073T BA.5.5 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | T1238T BA.5.5 |
| intergenic | V1264L BA.5.5 |
| intergenic | V1264V BA.5.5 |
| intergenic | D22Y BQ.1.1.8,BA.5.5 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | K67E BA.5.5 |
| intergenic | L85L BA.5.5 |
| intergenic | Y154Y BA.5.5 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | V256_N257delinsD BA.5.5 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | N41N BF.9,BA.5.5 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | N117N BQ.1.13,BA.5.5 |
| intergenic | I32T BA.5.5 |
| intergenic | I32I BA.5.5 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24,BA.1.15,BA.5.5 |
| intergenic | g.C-1T BA.5,BA.5.5 |
| intergenic | T11I BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | T14I BA.5.5 |
| intergenic | E33K BA.5.5 |
| intergenic | K53K BA.5.5 |
| intergenic | Y97Y BF.26,BA.5.5 |
| intergenic | S98S BA.5.5 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | P38S BA.5.5 |
| intergenic | V62L BF.41,BA.5.5 |
| intergenic | A65S BA.5.5 |
| intergenic | S67F BA.5.1.10,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.5 |
| intergenic | T87I BA.5.1.10,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5 |
| intergenic | P20P BA.5.5 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | N48N BA.5.5 |
| intergenic | Y86Y BA.2.12,BA.5.2.3,BA.5.5 |
| intergenic | L167F BA.5.5 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | M234I BA.4.1,BA.5.5 |
| intergenic | H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.5 |
| intergenic | S413L BA.5.5 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGT29734C BA.4,BA.5.5 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGT29734T BA.4,BA.5.5 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | R124C CK.2 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | H374Y BQ.1.1.8,CK.2 |
| intergenic | C420Y CK.2 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BF.26,BF.10,CK.2 |
| intergenic | A482V CK.2 |
| ORF1a | G728G / NSP2 |
| intergenic | G728G CK.2 |
| intergenic | I740I BA.2.12,BA.5,CK.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | V1056V CK.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | F1353fs BA.5.1.10,BA.5,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.10,CK.2 |
| intergenic | I1551I CK.2 |
| intergenic | L1643L CK.2 |
| intergenic | N1691N BA.5.1.24,CK.2 |
| intergenic | N1709N BA.1.18,CK.2 |
| intergenic | K2085_I2086del CK.2 |
| intergenic | S2103F BA.2.86.1,BF.9,CK.2 |
| intergenic | L2609L BA.5.1.24,BF.10,CK.2 |
| intergenic | T2823I BQ.1.13,CK.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | I3145V CK.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | N3358N CK.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | N3494N BA.4.1,CK.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | T3940T CK.2 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20,CK.2 |
| intergenic | T4159I CK.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20,CK.2 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| ORF1b | C5964S / NSP14 |
| intergenic | C5964S CK.2 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | I6012L CK.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | Y7026Y CK.2 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | K444N CK.2 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | D936Y BQ.1.1.8,CK.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | V987V CK.2 |
| intergenic | T1077T BA.4.1,CK.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | I7I CK.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | L106L BA.5.2.2,BA.5.1.10,CK.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | V62F BA.5.2.20,CK.2 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20,CK.2 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24,BA.1.15,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9,BA.5.2.20,BQ.1.13,CK.2 |
| intergenic | A66A CK.2 |
| intergenic | V74V CK.2 |
| intergenic | P84L BA.5.2.2,BA.4,BA.5,CK.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,CK.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2 |
| intergenic | g.C-104T BA.5,EG.10.1 |
| intergenic | g.C-63T BA.5.1.10,BA.4,EG.10.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13,EG.10.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | R207C BA.5.2.3,EG.10.1 |
| intergenic | R232H BF.10,EG.10.1 |
| intergenic | S308L EG.10.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | T882I BA.5.2.2,BA.5.1.10,EG.10.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | H1067H EG.10.1 |
| intergenic | S1106S EG.10.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1 |
| intergenic | A1923V CH.1.1.28,EG.10.1 |
| intergenic | I2086I EG.10.1 |
| intergenic | S2242F BA.5.2.34,BA.5.2.8,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,EG.10.1 |
| intergenic | Y2262Y EG.10.1 |
| intergenic | T2457I EG.10.1 |
| intergenic | V2703L EG.10.1 |
| intergenic | P2739P BA.5,EG.10.1 |
| intergenic | V2783F EG.10.1 |
| intergenic | V2816I EG.10.1 |
| intergenic | L2853L EG.10.1 |
| intergenic | S2981S EG.10.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | F3403F EG.10.1 |
| intergenic | P3613S EG.10.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | V3683I EG.10.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | D4344G EG.10.1 |
| intergenic | N4569K EG.10.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1 |
| intergenic | C5329C EG.10.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1 |
| intergenic | T5428T EG.10.1 |
| intergenic | T5538T EG.10.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | P5971S BQ.1.13,EG.10.1 |
| intergenic | G6018G EG.10.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1 |
| intergenic | P6517S EG.10.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | P6722P EG.10.1 |
| intergenic | A6997A BA.4,BA.5,BA.5.1.1,EG.10.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1 |
| intergenic | Q14H EG.10.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | G75A EG.10.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1 |
| intergenic | T299I BA.5,BA.5.1.2,EG.10.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1 |
| intergenic | A344T EG.10.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | R403K BA.2.86.1,BA.5,DV.7.1,EG.10.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1 |
| intergenic | S494P EG.10.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | S640F BA.4,EG.10.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | A701V BA.1.17,BA.4.1,BA.5.5,EG.10.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | V860L EG.10.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | H1101H EG.10.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | S74S EG.10.1 |
| intergenic | L96P EG.10.1 |
| intergenic | Y107Y BF.26,EG.10.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1 |
| intergenic | T11I BF.10,BA.5.5,EG.10.1 |
| intergenic | G38G EG.10.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | G8R EG.10.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1 |
| intergenic | H17Y BA.5.2.20,EG.10.1 |
| intergenic | V114F EG.10.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | P42P EG.10.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | Y298Y BA.1.17,BE.1.1,EG.10.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1 |
| intergenic | N25N EG.10.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1 |
| intergenic | g.C-174T BA.4.6 |
| intergenic | g.G-62A BA.4.6 |
| intergenic | g.G-58T BA.4.6 |
| intergenic | g.G-47A BF.10,BA.4.6 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | V38V BA.4.6 |
| intergenic | L39L BA.4.6 |
| intergenic | G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6 |
| intergenic | M85I BA.4.6 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13,BA.4.6 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BA.4.6 |
| intergenic | I114T BA.4.6 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6 |
| ORF1a | Q158Q / NSP1 |
| intergenic | Q158Q BA.4.6 |
| intergenic | N160N BA.4.6 |
| intergenic | S166G BA.5.1.2,BA.4.1,BA.4.6 |
| intergenic | N188N BA.4.1.8,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,BA.4.6 |
| intergenic | D203D BA.5.1.24,BA.4.6 |
| intergenic | P380S BA.4.6 |
| intergenic | P380L BA.4.6 |
| intergenic | L570L BA.5,BA.4.6 |
| intergenic | L578L BA.5,BA.4.6 |
| intergenic | L580L BA.5.1.24,BA.4.6 |
| intergenic | M584V BA.5.2.3,BF.9,BA.4.6 |
| intergenic | L595L BA.4.6 |
| intergenic | P626P BA.4.6 |
| intergenic | I652I BA.4.6 |
| intergenic | L703L BA.4.6 |
| intergenic | V710V BA.4.6 |
| intergenic | I740T BA.4.6 |
| intergenic | I740I BA.2.12,BA.5,CK.2,BA.4.6 |
| intergenic | G817G BA.5.1.1,BA.4.6 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | S944L BF.41,BA.4.6 |
| ORF1a | F1028_S1029delinsC / NSP3 |
| intergenic | F1028_S1029delinsC BA.4.6 |
| intergenic | V1046V BA.4.6 |
| intergenic | I1203T BA.4.6 |
| intergenic | P1220L BA.4.6 |
| intergenic | I1232I BF.41,BA.5.5,BA.4.6 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | Y1329Y BA.4.6 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | L1356L BA.4.6 |
| intergenic | L1438L BA.1.14,BA.5.2.2,BA.5.1.30,BA.4.6 |
| intergenic | N1540N BA.4.6 |
| intergenic | T1542T BA.5.5,BA.4.6 |
| intergenic | T1597I BF.9,BA.4.6 |
| intergenic | D1671D BA.4.6 |
| ORF1a | V1768I / NSP3 |
| intergenic | V1768I BA.4.6 |
| intergenic | T1788M BA.4.6 |
| intergenic | T1820I BA.4.6 |
| intergenic | T1854I BA.4.6 |
| intergenic | T1881I BA.4.6 |
| intergenic | P1921S BF.20,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BA.4.6 |
| intergenic | F1925F BA.5.2.2,BF.28,BE.1.1,BA.4.6 |
| intergenic | H2092Y BQ.1.13,BA.4.6 |
| intergenic | T2121T BA.4,BA.4.6 |
| intergenic | H2125Y BA.4.6 |
| intergenic | T2154I BA.4.6 |
| intergenic | K2200N BA.4.6 |
| intergenic | I2244I BA.5,BA.4.6 |
| intergenic | M2259I DV.7.1.2,BA.4.6 |
| intergenic | T2280T BA.4.6 |
| ORF1a | S2285C / NSP3 |
| intergenic | S2285C BA.4.6 |
| intergenic | D2402D BA.4.6 |
| intergenic | L2447L BA.4.6 |
| intergenic | D2472D BA.4.6 |
| intergenic | L2475L BA.4.6 |
| intergenic | S2625S BA.4,BA.5.2.3,BA.4.6 |
| intergenic | V2766del BA.4.6 |
| intergenic | D2980N BA.4.6 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| ORF1a | T3090S / NSP4 |
| intergenic | T3090S BA.4.6 |
| intergenic | L3238L BA.5.2.20,BF.26,BQ.1.13,BA.4.6 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| ORF1a | L3440L / NSP5 |
| intergenic | L3440L BA.4.6 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.4.6 |
| intergenic | L3583L BA.4.6 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6 |
| intergenic | I3663V BA.4.6 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | Y3744Y BA.5.1.24,BA.4.6 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6 |
| intergenic | L3935L BA.4.6 |
| intergenic | T3940T CK.2,BA.4.6 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BA.4.6 |
| intergenic | T4161I BF.26,BA.4.6 |
| intergenic | A4168A BA.5.1.30,BA.4.6 |
| intergenic | L4169L BA.4.6 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | I4429I BA.4.6 |
| intergenic | V4434I BA.4.6 |
| ORF1b | D4484D / NSP12 |
| intergenic | D4484D BA.4.6 |
| ORF1b | V4503V / NSP12 |
| intergenic | V4503V BA.4.6 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | L4763L BA.4.6 |
| intergenic | L4779L BA.4,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6 |
| intergenic | Y4875Y BA.1.15,BA.4.6 |
| intergenic | I4886I BA.4.6 |
| intergenic | N5020N BA.1.17,BA.5,BA.4.6 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6 |
| intergenic | T5131I BA.4.1,BF.28,BA.4.6 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | S5253S BA.4.6 |
| intergenic | S5393S BA.4.6 |
| intergenic | P5402S BA.4.6 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6 |
| intergenic | Y5577H BA.4.6 |
| intergenic | Y5601H BA.4.6 |
| intergenic | A5640A BA.4.6 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | P5732P BA.4.6 |
| intergenic | T5737I BA.5.1.24,DV.7.1.2,BA.4.6 |
| intergenic | L5762L BA.5.1.10,BA.5.1.30,BA.4.6 |
| intergenic | T5805T BA.4.6 |
| intergenic | T5912I BA.5.1.10,DV.7.1.2,BF.10,BA.4.6 |
| intergenic | I5940I BA.4.6 |
| intergenic | P5945P BA.4.6 |
| ORF1b | DI5966NV / NSP14 |
| intergenic | DI5966NV BA.4.6 |
| intergenic | I5967V BA.4.6 |
| intergenic | T6022I BA.4.6 |
| intergenic | A6044V BA.5,BA.4.6 |
| intergenic | L6102L BA.4.1,BA.4.6 |
| intergenic | V6161V BA.4.6 |
| intergenic | T6175I BQ.1.1.8,BA.4.6 |
| intergenic | P6267P BA.4.6 |
| intergenic | DRYP6315EGCH BA.2.12,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.26,BA.4.6 |
| intergenic | S6373S BA.4.6 |
| intergenic | Y6423Y DV.7.1,BA.4.6 |
| intergenic | S6428L BA.4.6 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | V6638V BA.5.1.2,BA.4.6 |
| intergenic | T6833I BA.4.6 |
| intergenic | L6892L BA.4.6 |
| intergenic | G7011N BA.5.1.1,BA.4.6 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | F32F BA.5.1.10,BA.5.1.2,BF.28,BA.4.6 |
| intergenic | H69del BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15,BA.4.6 |
| intergenic | V70del BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15,BA.4.6 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | H146Y BA.5,BA.4.6 |
| intergenic | K147I BA.4.6 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6 |
| intergenic | A264T BA.4.6 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | C432C BA.5,BF.28,BF.26,BA.4.6 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6 |
| intergenic | N460Y BA.4.6 |
| S | N460Y BA.4.6 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | V534V BE.1.1,BA.4.6 |
| intergenic | N606S BA.4.6 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | N658S BA.4,BA.4.6 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | I692I BA.5.1.10,BA.4.6 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | L1218L BA.4.6 |
| intergenic | C1250Y BA.4.6 |
| intergenic | L15F BA.4.6 |
| intergenic | K21N BA.5.1.10,BA.5.1.1,DV.7.1.2,BA.4.6 |
| intergenic | I35T BA.4.6 |
| intergenic | S60F BA.4.6 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | V90L BA.4.6 |
| intergenic | A99V BA.4.6 |
| intergenic | L101F BA.4.6 |
| intergenic | A110S BA.4.6 |
| intergenic | D155Y BA.1.18,BA.4.6 |
| intergenic | I169I BQ.1.1.8,BA.4.6 |
| intergenic | D210D DV.7.1,BA.4.6 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | V29V BA.4.6 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | T77T BA.4.6 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | P114P BA.4.6 |
| intergenic | H125Y BA.5,BA.5.1.1,BA.4.6 |
| intergenic | G153G BA.4.6 |
| M | G153G BA.4.6 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | H47N BA.5,BF.28,BA.4.6 |
| intergenic | H47Y BA.1.14,BA.2.12,BA.4.6 |
| intergenic | K72T BA.4.6 |
| ORF7a | K72T BA.4.6 |
| intergenic | Q94X BA.4.6 |
| intergenic | L11F BA.4,BA.4.1,BA.4.6 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | G8V BA.4.6 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | D63G BA.4.6 |
| intergenic | D103V BA.4.6 |
| N | D103V BA.4.6 |
| intergenic | N126N BF.9,BA.4.6 |
| intergenic | P151S BA.4,BA.5,BA.4.6 |
| intergenic | A156S BA.4.6 |
| intergenic | A173V BA.5.2.20,BA.4.6 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | G238V BA.4.6 |
| intergenic | P309P BA.4.1,BA.5.2.20,BF.10,BA.4.6 |
| intergenic | Y333Y BA.4,BF.26,BA.4.6 |
| intergenic | Q406Q BA.4.6 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | F8S EG.5.1.8 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | Y97Y BA.5.1.24,EG.5.1.8 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | F190F BF.26,EG.5.1.8 |
| intergenic | S318L BA.5.1.1,BQ.1.1.8,EG.5.1.8 |
| intergenic | K322T EG.5.1.8 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5,EG.5.1.8 |
| intergenic | S391P EG.5.1.8 |
| intergenic | S558S EG.5.1.8 |
| intergenic | R560H EG.5.1.8 |
| intergenic | V606V BA.5,BA.5.1.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | V665I BF.28,EG.5.1.8 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8 |
| intergenic | L778L EG.5.1.8 |
| intergenic | A801V EG.5.1.8 |
| intergenic | G817G BA.5.1.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | T861T EG.5.1.8 |
| intergenic | V874F EG.5.1.8 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | L1130F EG.5.1.8 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | P1640L BA.5.1.24,BA.5.1.30,EG.5.1.8 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | K1895K EG.5.1.8 |
| intergenic | S2022L EG.5.1.8 |
| intergenic | K2059K EG.5.1.8 |
| intergenic | D2060D EG.5.1.8 |
| intergenic | F2334F BA.2.12,BF.26,EG.5.1.8 |
| intergenic | A2379V BA.4.1.8,EG.5.1.8 |
| intergenic | A2379A EG.5.1.8 |
| intergenic | V2491I BA.5.1.24,EG.5.1.8 |
| intergenic | T2495I EG.5.1.8 |
| intergenic | P2739S EG.5.1.8 |
| intergenic | T2823T EG.5.1.8 |
| intergenic | T2836I BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.1.8 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | LT3027FA EG.5.1.8 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8,DV.7.1,DV.7.1.2,BA.5.5,EG.5.1.8 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | T3258T BA.5.2.8,EG.5.1.8 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | D3479D BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1.8 |
| intergenic | L3545L EG.5.1.8 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | A3615V BA.5.1.2,BF.26,BA.5.5,EG.5.1.8 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | V3683A EG.5.1.8 |
| intergenic | V3747V EG.5.1.8 |
| intergenic | M3752I EG.5.1.8 |
| intergenic | Q3942Q EG.5.1.8 |
| intergenic | A3945A EG.5.1.8 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | L4237L DV.7.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | D4317D BF.9,EG.5.1.8 |
| intergenic | F4342I EG.5.1.8 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | Y4848Y EG.5.1.8 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.2,BF.26,EG.5.1.8 |
| intergenic | C5332C BA.5,EG.5.1.8 |
| intergenic | V5358I EG.5.1.8 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | P5566P EG.5.1.8 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | A5727V BA.4.1.8,EG.5.1.8 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | V6107L EG.5.1.8 |
| intergenic | T6131T BA.2.12,DV.7.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | I6167V EG.5.1.8 |
| intergenic | G6173S DV.7.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | K6678K EG.5.1.8 |
| intergenic | H6686Y BA.5.1.1,BA.5.1.2,EG.5.1.8 |
| intergenic | L6848L EG.5.1.8 |
| intergenic | A6870G EG.5.1.8 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | T29I BA.5.1.2,EG.5.1.8 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8 |
| intergenic | H69Y EG.5.1.8 |
| intergenic | V83A EG.5.1.8 |
| intergenic | V83T EG.5.1.8 |
| intergenic | T95I BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,EG.5.1.8 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | V171V EG.5.1.8 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8 |
| intergenic | K310K EG.5.1.8 |
| intergenic | N334N EG.5.1.8 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | R346I BA.5.2.2,BE.1.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | EGF484ADP EG.5.1.8 |
| intergenic | EGF484AGP EG.5.1.8 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | EH654VY EG.5.1.8 |
| intergenic | H655Y EG.5.1.8 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | T887T EG.5.1.8 |
| intergenic | D936H EG.5.1.8 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | A1070V EG.5.1.8 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | X1274X EG.5.1.8 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | K16R EG.5.1.8 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | T89I BF.26,EG.5.1.8 |
| intergenic | H182R EG.5.1.8 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | V25V BA.5.1.24,BA.5.1.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | G141G EG.5.1.8 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | P57L EG.5.1.8 |
| intergenic | P57fs EG.5.1.8 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | G70G EG.5.1.8 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | T26A EG.5.1.8 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | G328A EG.5.1.8 |
| intergenic | D358D EG.5.1.8 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8 |
| intergenic | g.G29688C BE.1.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | g.G29711T EG.5.1.8 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | M85del BA.5.2.34,BA.5.1.24,EG.5.2.1 |
| intergenic | L92F BQ.1.13,EG.5.2.1 |
| intergenic | Y97Y BA.5.1.24,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | A138V EG.5.2.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1 |
| intergenic | N189N BA.5.1.10,BA.5.1.30,EG.5.2.1 |
| intergenic | T395N EG.5.2.1 |
| intergenic | V424A EG.5.2.1 |
| intergenic | L469I EG.5.2.1 |
| intergenic | S479F EG.5.2.1 |
| intergenic | M584V BA.5.2.3,BF.9,BA.4.6,EG.5.2.1 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | L893L EG.5.2.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | F962F EG.5.2.1 |
| intergenic | H1113Y BA.2.12,EG.5.2.1 |
| intergenic | N1123S EG.5.2.1 |
| intergenic | T1168I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.1.15,EG.5.2.1 |
| intergenic | T1303T EG.5.2.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | V1415V EG.5.2.1 |
| intergenic | D1575D EG.5.2.1 |
| intergenic | V1629V BA.5.2.34,EG.5.2.1 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | S1978F BA.5.2.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | T2087I CH.1.1.28,EG.5.2.1 |
| intergenic | N2155S EG.5.2.1 |
| intergenic | I2309I EG.5.2.1 |
| intergenic | R2336K EG.5.2.1 |
| intergenic | L2349L EG.5.2.1 |
| intergenic | Y2489Y BA.5.2.20,EG.5.2.1 |
| intergenic | Y2504Y EG.5.2.1 |
| intergenic | T2676T BA.2.86.1,EG.5.2.1 |
| intergenic | D2835N EG.5.2.1 |
| intergenic | V2975V EG.5.2.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | Y3216Y EG.5.2.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | A3456V EG.5.2.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | V3751V EG.5.2.1 |
| intergenic | L3776L EG.5.2.1 |
| intergenic | N3937N BA.5,EG.5.2.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | L4328L EG.5.2.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | S4956S EG.5.2.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | V5366V EG.5.2.1 |
| intergenic | P5371P BA.1.17,EG.5.2.1 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | P5828L EG.5.2.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | N5883N BA.5.1.30,EG.5.2.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | I6200T BA.5.2.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | E6227E EG.5.2.1 |
| intergenic | V6241F BF.9,EG.5.2.1 |
| intergenic | L6308L BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | S6379S EG.5.2.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | N6853N BQ.1.13,EG.5.2.1 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | G75A EG.10.1,EG.5.2.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | Q173Q EG.5.2.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | K1045N EG.5.2.1 |
| intergenic | T1136I EG.5.2.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | R6T EG.5.2.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | G100G EG.5.2.1 |
| intergenic | I118V EG.5.2.1 |
| intergenic | T151N EG.5.2.1 |
| intergenic | T175I BA.5.1.30,BF.26,EG.5.2.1 |
| intergenic | E194D EG.5.2.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | P267L DV.7.1.2,EG.5.2.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | L129L EG.5.2.1 |
| intergenic | M19K DV.7.1.2,EG.5.2.1 |
| intergenic | R20R DV.7.1.2,EG.5.2.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | R95C EG.5.2.1 |
| intergenic | I157I BA.4,BA.5.2.34,EG.5.2.1 |
| intergenic | L161F BA.5,BQ.1.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | A218V EG.5.2.1 |
| intergenic | T366I DV.7.1,EG.5.2.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1 |
| intergenic | g.C-166T BA.5.2.20,BQ.1.2.3 |
| intergenic | g.C-119T BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | g.T-84C BQ.1.2.3 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | I71I BQ.1.2.3 |
| intergenic | R73C BA.5,BQ.1.2.3 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3 |
| intergenic | V108I BQ.1.2.3 |
| intergenic | V121V BQ.1.2.3 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | F143L BQ.1.2.3 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | R226R BQ.1.2.3 |
| intergenic | A372V BQ.1.2.3 |
| intergenic | S443P BQ.1.2.3 |
| intergenic | L469F BQ.1.2.3 |
| intergenic | Q556K BA.4,BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3 |
| intergenic | A599A BA.5.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3 |
| intergenic | K636K BQ.1.2.3 |
| intergenic | T842I BQ.1.2.3 |
| intergenic | T891I BA.2.12,BA.5.1.24,BQ.1.2.3 |
| intergenic | L897L BQ.1.1.8,BQ.1.13,BQ.1.2.3 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | L960F BQ.1.2.3 |
| intergenic | L969P BQ.1.2.3 |
| intergenic | S1106N BQ.1.2.3 |
| ORF1a | T1250T / NSP3 |
| intergenic | T1250T BQ.1.2.3 |
| intergenic | H1264H BQ.1.2.3 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | Y1337Y BA.5,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BQ.1.2.3 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| ORF1a | G1369R / NSP3 |
| intergenic | G1369R BQ.1.2.3 |
| ORF1a | D1600D / NSP3 |
| intergenic | D1600D BQ.1.2.3 |
| ORF1a | V1629F / NSP3 |
| intergenic | V1629F BQ.1.2.3 |
| intergenic | R1703R BQ.1.2.3 |
| ORF1a | V1915V / NSP3 |
| intergenic | V1915V BQ.1.2.3 |
| intergenic | F1925F BA.5.2.2,BF.28,BE.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3 |
| intergenic | T2016T BQ.1.2.3 |
| intergenic | L2122F BQ.1.2.3 |
| intergenic | D2136G BQ.1.2.3 |
| intergenic | T2152I BA.1.17,BA.5.5,BQ.1.2.3 |
| intergenic | Y2245Y BQ.1.1.8,BQ.1.2.3 |
| ORF1a | L2292L / NSP3 |
| intergenic | L2292L BQ.1.2.3 |
| intergenic | V2324F BF.9,BQ.1.2.3 |
| intergenic | I2346I BQ.1.2.3 |
| intergenic | S2535L BF.28,BQ.1.2.3 |
| ORF1a | F2864S / NSP4 |
| intergenic | F2864S BQ.1.2.3 |
| intergenic | T2872M DV.7.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | Y2905Y BQ.1.2.3 |
| intergenic | P2929P BQ.1.2.3 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | L3034L BF.10,BQ.1.2.3 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8,DV.7.1,DV.7.1.2,BA.5.5,EG.5.1.8,BQ.1.2.3 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | Q3127Q BQ.1.2.3 |
| intergenic | S3244L BQ.1.2.3 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | F3329F BF.41,BQ.1.2.3 |
| ORF1a | M3345I / NSP5 |
| intergenic | M3345I BA.5.1.24,BQ.1.2.3 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3 |
| intergenic | N3358N CK.2,BQ.1.2.3 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| ORF1a | V3465I / NSP5 |
| intergenic | V3465I BQ.1.2.3 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | D3728D BA.4.1.8,BQ.1.1.8,BQ.1.2.3 |
| intergenic | Y3765C BA.5.1.24,BQ.1.2.3 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3 |
| intergenic | P3831P BQ.1.2.3 |
| intergenic | A3956V BQ.1.2.3 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3 |
| ORF1a | T4088T / NSP8 |
| intergenic | T4088T BQ.1.2.3 |
| intergenic | P4197L BQ.1.2.3 |
| intergenic | T4202A BQ.1.2.3 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | A4285T BQ.1.2.3 |
| intergenic | N4367N BQ.1.2.3 |
| intergenic | P4486S BQ.1.2.3 |
| intergenic | Y4665H BQ.1.1.8,BQ.1.13,BQ.1.2.3 |
| intergenic | D4696D BQ.1.2.3 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | N4795N BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.5.5,BQ.1.2.3 |
| intergenic | F4820F BA.5.1.10,BA.4.1,BF.26,BQ.1.2.3 |
| intergenic | N4883N BQ.1.2.3 |
| intergenic | T4978T BQ.1.2.3 |
| intergenic | H4991H BQ.1.2.3 |
| intergenic | T5072T BA.5.2.34,BQ.1.2.3 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | T5385T BQ.1.2.3 |
| intergenic | T5451T BQ.1.2.3 |
| intergenic | M5557I BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3 |
| ORF1b | T5691T / NSP13 |
| intergenic | T5691T BQ.1.2.3 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | V6045A BQ.1.2.3 |
| intergenic | P6066P BQ.1.2.3 |
| intergenic | D6327D BQ.1.2.3 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3 |
| ORF1b | V6435F / NSP14 |
| intergenic | V6435F BQ.1.2.3 |
| intergenic | D6539D BQ.1.2.3 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | A6623V DV.7.1.2,BQ.1.2.3 |
| intergenic | F6673F BQ.1.2.3 |
| intergenic | S6872S BQ.1.2.3 |
| ORF1b | T6970T / NSP16 |
| intergenic | T6970T BQ.1.2.3 |
| intergenic | R7014N BQ.1.1.8,BQ.1.2.3 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | D53D BA.5,BA.5.1.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.8,BQ.1.2.3 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3 |
| intergenic | L118F BQ.1.2.3 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | R190S BQ.1.2.3 |
| intergenic | V213G BQ.1.2.3 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3 |
| intergenic | Y369Y BQ.1.2.3 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | V395V BQ.1.2.3 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | K444T BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BQ.1.2.3 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | E619K BQ.1.2.3 |
| intergenic | V622F BQ.1.2.3 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | I666V BQ.1.2.3 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | Y789Y BQ.1.2.3 |
| intergenic | T791P BQ.1.2.3 |
| intergenic | P792P BQ.1.2.3 |
| intergenic | I882I BQ.1.2.3 |
| S | I882I BQ.1.2.3 |
| intergenic | G932G BA.5.5,BQ.1.2.3 |
| intergenic | I934V BQ.1.2.3 |
| intergenic | G946E BQ.1.2.3 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | L1244L BQ.1.2.3 |
| intergenic | C1248F BA.5.2.34,BQ.1.2.3 |
| intergenic | C1253C BA.5.2.2,BQ.1.2.3 |
| intergenic | T9K BA.5.1.2,BQ.1.2.3 |
| intergenic | D27Y BA.4.1.8,BA.5,BQ.1.2.3 |
| intergenic | I62I BQ.1.2.3 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | G100G EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | H150R BE.1.1,BQ.1.2.3 |
| ORF3a | H150R BE.1.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | V24L BQ.1.2.3 |
| intergenic | S50G BQ.1.2.3 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | L57L BQ.1.2.3 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | L93I BQ.1.2.3 |
| M | L93I BQ.1.2.3 |
| intergenic | H125Y BA.5,BA.5.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3 |
| intergenic | Y31Y BA.5.1.24,BA.5,BQ.1.13,BQ.1.2.3 |
| intergenic | Q94H BF.26,BQ.1.13,BQ.1.2.3 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3 |
| intergenic | P36S BA.5.1.10,BQ.1.2.3 |
| intergenic | C61C BQ.1.2.3 |
| intergenic | L95F BQ.1.2.3 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | G18V BQ.1.2.3 |
| intergenic | G25S BQ.1.2.3 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | Y111Y BQ.1.2.3 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | E136D BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3 |
| intergenic | P162S BQ.1.2.3 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | Y268Y BA.5.1.10,BA.5,BQ.1.2.3 |
| intergenic | T362I BA.5.1.24,BA.4.1,DV.7.1.2,BQ.1.2.3 |
| intergenic | D377G BQ.1.2.3 |
| intergenic | Q409L BQ.1.2.3 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | Q418H BQ.1.2.3 |
| intergenic | g.C-10T BA.5.1.10,BQ.1.2.3 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | g.C-160T BA.5.1.24,BE.1.1,BA.1.15,EG.5.1.3 |
| intergenic | g.A-96C EG.5.1.3 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13,EG.10.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | D75G EG.5.1.3 |
| intergenic | G112S EG.5.1.3 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| ORF1a | D264D / NSP2 |
| intergenic | V274L EG.5.1.3 |
| intergenic | I281I EG.5.1.3 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5,EG.5.1.8,EG.5.1.3 |
| ORF1a | S391S / NSP2 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3 |
| intergenic | R542C BA.5.2.20,EG.5.1.3 |
| intergenic | L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3 |
| intergenic | V627I BA.4,BQ.1.13,EG.5.1.3 |
| intergenic | E633G EG.5.1.3 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | P892S EG.5.1.3 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | L960L EG.5.1.3 |
| intergenic | G963D EG.5.1.3 |
| intergenic | D992Y EG.5.1.3 |
| intergenic | G1095E EG.5.1.3 |
| intergenic | K1202E EG.5.1.3 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | P1330P BF.10,EG.5.1.3 |
| intergenic | T1344I EG.5.1.3 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | I1359V EG.5.1.3 |
| intergenic | P1390P DV.7.1.2,EG.5.1.3 |
| intergenic | E1730E EG.5.1.3 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | Y1846C EG.5.1.3 |
| intergenic | Y1873Y BA.5.1.10,BF.9,BF.28,EG.5.1.3 |
| intergenic | K1895R EG.5.1.3 |
| intergenic | V1957I EG.5.1.3 |
| intergenic | S2015S BA.2.86.1,BA.2.12,EG.5.1.3 |
| intergenic | T2121I EG.5.1.3 |
| intergenic | E2268V EG.5.1.3 |
| intergenic | I2309I EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | H2357Y EG.5.1.3 |
| ORF1a | V2436I / NSP3 |
| intergenic | E2550A EG.5.1.3 |
| intergenic | Y2560Y BA.5,BF.41,EG.5.1.3 |
| intergenic | Y2594Y EG.5.1.3 |
| intergenic | T2872T EG.5.1.3 |
| intergenic | K2928K EG.5.1.3 |
| intergenic | T2988I EG.5.1.3 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8,DV.7.1,DV.7.1.2,BA.5.5,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | L3184L EG.5.1.3 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | A3209V BA.5.1.10,BA.5.2.34,EG.5.1.3 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| ORF1a | R3303R / NSP5 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | R3339R EG.5.1.3 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | D3439D BA.5.2.34,BA.5.1.1,DV.7.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | V3751V EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | L3879L EG.5.1.3 |
| intergenic | L4037F BA.5.2.8,EG.5.1.3 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BA.4.6,EG.5.1.3 |
| intergenic | T4158I EG.5.1.3 |
| intergenic | Y4171Y EG.5.1.3 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | P4261L EG.5.1.3 |
| intergenic | I4291I BA.5.1.10,EG.5.1.3 |
| intergenic | L4386L EG.5.1.3 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | L4779L BA.4,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3 |
| intergenic | F4920F EG.5.1.3 |
| intergenic | T4983I BA.5.1.24,EG.5.1.3 |
| intergenic | R5043C EG.5.1.3 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | D5152D BA.5.1.24,DV.7.1,CH.1.1.28,BF.26,EG.5.1.3 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | C5374C BE.1.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | S5404G BA.5.1.2,BE.1.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | F5457F EG.5.1.3 |
| intergenic | G5527C EG.5.1.3 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3 |
| intergenic | Q5605Q EG.5.1.3 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | G5818G EG.5.1.3 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | T5873T EG.5.1.3 |
| intergenic | L5943L EG.5.1.3 |
| intergenic | H5951Y DV.7.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | I5970T EG.5.1.3 |
| intergenic | T6028T BA.5.2.2,BE.1.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3 |
| intergenic | D6097D BA.2.12,BA.5.2.20,BA.5.5,EG.5.1.3 |
| intergenic | P6252S EG.5.1.3 |
| intergenic | L6344L EG.5.1.3 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | L6666L EG.5.1.3 |
| intergenic | V6772L BA.5.2.2,BA.5.1.1,BF.28,EG.5.1.3 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | T19I BA.5.2.2,BA.5.1.2,EG.5.1.3 |
| intergenic | T19L BA.5.2.2,BA.5.1.2,EG.5.1.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | T114T EG.5.1.3 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | L216F BA.2.86.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | A222D EG.5.1.3 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | Y269Y EG.5.1.3 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | C336C EG.5.1.3 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | L518L EG.5.1.3 |
| intergenic | P561H EG.5.1.3 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | T618T BA.1.14,BA.5.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | S637S EG.5.1.3 |
| intergenic | A647V EG.5.1.3 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | G769G EG.5.1.3 |
| intergenic | C840C EG.5.1.3 |
| intergenic | K921K EG.5.1.3 |
| S | K921K EG.5.1.3 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | H1101Y BF.41,BA.5.2.20,EG.5.1.3 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | F1148F EG.5.1.3 |
| intergenic | D1184G EG.5.1.3 |
| intergenic | S1261F EG.5.1.3 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | G11V EG.5.1.3 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | V88L EG.5.1.3 |
| intergenic | A110S BA.4.6,EG.5.1.3 |
| intergenic | S177I BA.5.1.2,EG.5.1.3 |
| intergenic | G187D EG.5.1.3 |
| intergenic | V202del EG.5.1.3 |
| intergenic | Q213K BA.2.12,EG.5.1.3 |
| intergenic | T223I BA.2.12,BA.5.1.30,EG.5.1.3 |
| intergenic | V256del BA.5.2.2,BA.5.1.30,EG.5.1.3 |
| intergenic | T269M EG.5.1.3 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | L21F EG.5.1.3 |
| E | N45D EG.5.1.3 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | G78S EG.5.1.3 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | N117N BQ.1.13,BA.5.5,EG.5.1.3 |
| intergenic | L129L DV.7.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | Y199Y BF.26,EG.5.1.3 |
| intergenic | N203N BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1.3 |
| intergenic | N207N BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1.3 |
| intergenic | S213S EG.5.1.3 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | N52N BF.26,EG.5.1.3 |
| intergenic | H73H EG.5.1.3 |
| intergenic | V74F EG.5.1.3 |
| intergenic | E91D EG.5.1.3 |
| intergenic | Q94X BA.4.6,EG.5.1.3 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | D35D EG.5.1.3 |
| intergenic | K44X EG.5.1.3 |
| intergenic | I47V EG.5.1.3 |
| intergenic | V49I EG.5.1.3 |
| intergenic | C102R EG.5.1.3 |
| intergenic | S103L BA.5.1.2,EG.5.1.3 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | P6T EG.5.1.3 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | V72I EG.5.1.3 |
| intergenic | G137G EG.5.1.3 |
| intergenic | T166A EG.5.1.3 |
| intergenic | S193N EG.5.1.3 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | L221M EG.5.1.3 |
| intergenic | L227L EG.5.1.3 |
| intergenic | S312S EG.5.1.3 |
| intergenic | P326S EG.5.1.3 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | D415D DV.7.1,BF.28,EG.5.1.3 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3 |
| intergenic | g.A29814G EG.5.1.3 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | S376L BA.5.2.3,BA.5.5,EG.5.1.9 |
| intergenic | H388Y BA.1.14,EG.5.1.9 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | V559M EG.5.1.9 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | P892P EG.5.1.9 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | D982G EG.5.1.9 |
| intergenic | T999T EG.5.1.9 |
| intergenic | K1197E EG.5.1.9 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | T2069T EG.5.1.9 |
| intergenic | P2079S EG.5.1.9 |
| intergenic | V2542I EG.5.1.9 |
| intergenic | V2624V BA.4,EG.5.1.9 |
| intergenic | N2894N BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.2.20,EG.5.1.9 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | T3696A EG.5.1.9 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | Y4845Y EG.5.1.9 |
| intergenic | L4852L EG.5.1.9 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | V5112V EG.5.1.9 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | C5332C BA.5,EG.5.1.8,EG.5.1.9 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | L5407L EG.5.1.9 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | D5907N EG.5.1.9 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | D6300D BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.5.1.9 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9 |
| intergenic | L176F BA.5.1.30,EG.5.1.9 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | N343N EG.5.1.9 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | E1195Q EG.5.1.9 |
| intergenic | C1247F EG.5.1.9 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | A54V EG.5.1.9 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | R61L BA.5.2.34,EG.5.1.9 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | L34F EG.5.1.9 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | R89T EG.5.1.9 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | A43A EG.5.1.9 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9 |
| intergenic | A217S DV.7.1,EG.5.1.9 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | g.C29774T BA.1.18,EG.5.1.9 |
| intergenic | g.G-139T FL.1.5 |
| intergenic | g.C-63T BA.5.1.10,BA.4,EG.10.1,FL.1.5 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34,BF.28,BE.1.1,FL.1.5 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| ORF1a | R175R / NSP1 |
| intergenic | F411F BA.5.1.30,FL.1.5 |
| intergenic | L454F BA.5.1.24,BA.5.2.20,FL.1.5 |
| intergenic | S479Y FL.1.5 |
| ORF1a | E553K / NSP2 |
| intergenic | E553K FL.1.5 |
| intergenic | A565S FL.1.5 |
| ORF1a | Y621Y / NSP2 |
| intergenic | Y621Y BA.4,FL.1.5 |
| intergenic | A735A BA.1.14,BA.1.18,BA.1.15,FL.1.5 |
| intergenic | P736P FL.1.5 |
| intergenic | P777P FL.1.5 |
| intergenic | E792K FL.1.5 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | T891I BA.2.12,BA.5.1.24,BQ.1.2.3,FL.1.5 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | G993S FL.1.5 |
| intergenic | G1119D FL.1.5 |
| intergenic | D1258D FL.1.5 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | P1330P BF.10,EG.5.1.3,FL.1.5 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | F1353fs BA.5.1.10,BA.5,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.10,CK.2,FL.1.5 |
| intergenic | A1397V BA.2.86.1,BA.2.12,FL.1.5 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.30,FL.1.5 |
| intergenic | V1535I FL.1.5 |
| ORF1a | V1570L / NSP3 |
| intergenic | V1570L BA.5.1.24,FL.1.5 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | N1871N BF.26,FL.1.5 |
| intergenic | A2128T FL.1.5 |
| intergenic | I2138M FL.1.5 |
| intergenic | T2181A FL.1.5 |
| intergenic | T2277T FL.1.5 |
| intergenic | T2495I EG.5.1.8,FL.1.5 |
| ORF1a | G2959D / NSP4 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | D3439D BA.5.2.34,BA.5.1.1,DV.7.1,EG.5.1.3,FL.1.5 |
| intergenic | D3508D FL.1.5 |
| ORF1a | L3525S / NSP5 |
| intergenic | L3525S FL.1.5 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5 |
| intergenic | E4019E FL.1.5 |
| intergenic | T4083M BA.5.1.1,BA.5.1.2,FL.1.5 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | N4235N BA.4,BA.5,BA.5.1.1,FL.1.5 |
| intergenic | A4408E FL.1.5 |
| intergenic | Y4424Y FL.1.5 |
| intergenic | D4432Y FL.1.5 |
| intergenic | T4618T FL.1.5 |
| intergenic | V4626V FL.1.5 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | S5073S FL.1.5 |
| intergenic | A5091S FL.1.5 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | Q5214H FL.1.5 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | A5662S FL.1.5 |
| intergenic | V5680V BA.4.1.8,BF.28,FL.1.5 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | I5723V FL.1.5 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | R6088C FL.1.5 |
| intergenic | Y6160Y BF.28,FL.1.5 |
| intergenic | Y6162Y FL.1.5 |
| ORF1b | A6232T / NSP14 |
| intergenic | P6252S EG.5.1.3,FL.1.5 |
| intergenic | L6308L BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.1.5 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | V6573V BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | S98F BA.5.1.10,FL.1.5 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | N164H FL.1.5 |
| intergenic | M177K FL.1.5 |
| intergenic | L179L FL.1.5 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | N188S FL.1.5 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | A264V FL.1.5 |
| intergenic | D294D BA.5.1.10,BA.5,FL.1.5 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | E516Q FL.1.5 |
| intergenic | P561P FL.1.5 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | A701V BA.1.17,BA.4.1,BA.5.5,EG.10.1,FL.1.5 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | L821L BA.5.5,FL.1.5 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| S | G1085A BA.5.2.20,FL.1.5.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BF.28,FL.1.5 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | T24I FL.1.5 |
| intergenic | G49V FL.1.5 |
| intergenic | L65F DV.7.1,BA.5.2.20,FL.1.5 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | S74F BA.4,DV.7.1.2,BF.10,FL.1.5 |
| intergenic | L85L FL.1.5 |
| intergenic | T89I BF.26,EG.5.1.8,FL.1.5 |
| intergenic | D210Y FL.1.5 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| ORF3a | E241D XBB.1.5,FL.1.5.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | P71L FL.1.5 |
| intergenic | L17F BF.26,FL.1.5 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | I24V FL.1.5 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | S94S FL.1.5 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | N47N FL.1.5 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | V82I FL.1.5 |
| intergenic | L116L BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | H17Y BA.5.2.20,EG.10.1,FL.1.5 |
| intergenic | P38S BA.5.5,FL.1.5 |
| intergenic | Y46Y FL.1.5 |
| intergenic | G50G FL.1.5 |
| intergenic | A55V BA.5.1.10,FL.1.5 |
| ORF8 | R115L BF.41,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,FL.1.5.1 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | P73P FL.1.5 |
| intergenic | S176S FL.1.5 |
| intergenic | RG203KL FL.1.5 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5 |
| intergenic | D343D FL.1.5 |
| intergenic | P365L BA.5.2.20,FL.1.5 |
| intergenic | P368P FL.1.5 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | X39YextX? FL.1.5 |
| intergenic | g.G29688C BE.1.1,EG.5.1.8,FL.1.5 |
| intergenic | g.G29706T FL.1.5 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5 |
| intergenic | g.C-222T BA.4,BA.5,EG.7 |
| intergenic | g.G-92T EG.7 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| ORF1a | D25G / NSP1 |
| intergenic | D25G EG.7 |
| intergenic | L27F EG.7 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | G82_M85delinsV DV.7.1,EG.7 |
| intergenic | M85del DV.7.1,EG.7 |
| intergenic | V106V EG.7 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | T183T EG.7 |
| intergenic | R184R EG.7 |
| intergenic | L450F EG.7 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7 |
| intergenic | V627I BA.4,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7 |
| intergenic | R643I EG.7 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | A859A BA.5.2.3,BE.1.1,EG.7 |
| intergenic | V879V BA.2.12,BA.1.15,EG.7 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | P959S BA.2.12,EG.7 |
| ORF1a | T999A / NSP3 |
| intergenic | T999A EG.7 |
| intergenic | D1179Y EG.7 |
| intergenic | S1218I EG.7 |
| intergenic | V1291I EG.7 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | T1426T BA.5.2.2,DV.7.1,BA.1.15,EG.7 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.30,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | N1540N BA.4.6,EG.7 |
| intergenic | T1543I BF.9,EG.7 |
| ORF1a | D1547G / NSP3 |
| intergenic | D1547G EG.7 |
| intergenic | E1724V EG.7 |
| intergenic | G1819S EG.7 |
| intergenic | P1916S EG.7 |
| intergenic | P1919P EG.7 |
| intergenic | V2047F EG.7 |
| intergenic | T2137I EG.7 |
| intergenic | T2300I BF.28,EG.7 |
| intergenic | S2312L EG.7 |
| intergenic | A2344A EG.7 |
| intergenic | N2531S EG.7 |
| intergenic | N2539N EG.7 |
| intergenic | A2575T EG.7 |
| intergenic | A2584V BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,EG.7 |
| intergenic | P2685T EG.7 |
| intergenic | Y2809Y EG.7 |
| intergenic | C2851C EG.7 |
| intergenic | R2991R EG.7 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | T3459T BA.5.1.1,BE.1.1,EG.7 |
| intergenic | L3525L EG.7 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | Y3813Y BF.9,EG.7 |
| intergenic | G3846S EG.7 |
| intergenic | L3873L EG.7 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | L4185L EG.7 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | L4234L EG.7 |
| intergenic | S4393A EG.7 |
| intergenic | T4412A BA.4.1,EG.7 |
| intergenic | K4552N EG.7 |
| intergenic | T4638T BA.5,BA.5.2.8,EG.7 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | V4733V EG.7 |
| intergenic | H4739H EG.7 |
| intergenic | P4804P BA.5.1.24,EG.7 |
| intergenic | N4883N BQ.1.2.3,EG.7 |
| intergenic | A4918V EG.7 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | V5092I EG.7 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | A5532A EG.7 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7 |
| intergenic | L5551L EG.7 |
| intergenic | V5680V BA.4.1.8,BF.28,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | T5923I EG.7 |
| intergenic | V5965F EG.7 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | A6063V EG.7 |
| intergenic | V6086I EG.7 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | L6501L EG.7 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | K6711K EG.7 |
| intergenic | D6752A EG.7 |
| intergenic | T6889M EG.7 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | N343N EG.5.1.9,EG.7 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | R403K BA.2.86.1,BA.5,DV.7.1,EG.10.1,EG.7 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | EGF484AGP EG.5.1.8,EG.7 |
| intergenic | EGF484ASP EG.7 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | L513F EG.7 |
| intergenic | F541F EG.7 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | G648G EG.7 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | R683R EG.7 |
| intergenic | I726V EG.7 |
| intergenic | S735S EG.7 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | N856N BQ.1.1.8,CH.1.1.28,EG.7 |
| intergenic | I896M EG.7 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | H1101H EG.10.1,EG.7 |
| intergenic | R1107M EG.7 |
| intergenic | T1117I EG.7 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | F1148F EG.5.1.3,EG.7 |
| intergenic | E1188D EG.7 |
| intergenic | C1253C BA.5.2.2,BQ.1.2.3,EG.7 |
| intergenic | D2Y EG.7 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | G44V EG.7 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | R68R EG.7 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | E266E EG.7 |
| ORF3a | E266E EG.7 |
| intergenic | T270T CH.1.1.28,EG.7 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | N207N BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1.3,EG.7 |
| intergenic | L4L BA.5.2.3,EG.7 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | E39D EG.7 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | C102F EG.7 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | A35S DV.7.1,EG.7 |
| intergenic | A173V BA.5.2.20,BA.4.6,EG.7 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | K237I EG.7 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | g.C-36T EG.5.1.4 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13,EG.10.1,EG.5.1.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | A79V EG.5.1.4 |
| intergenic | H81H EG.5.1.4 |
| intergenic | M85_E87delinsK EG.5.1.4 |
| intergenic | E91A EG.5.1.4 |
| intergenic | L92F BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4 |
| intergenic | V121I EG.5.1.4 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | L320L EG.5.1.4 |
| intergenic | R398C BF.28,EG.5.1.4 |
| intergenic | G400S EG.5.1.4 |
| intergenic | F548L EG.5.1.4 |
| intergenic | E673V EG.5.1.4 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4 |
| intergenic | V823I EG.5.1.4 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | V868L EG.5.1.4 |
| intergenic | A872A BA.5.1.2,EG.5.1.4 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | D930N EG.5.1.4 |
| intergenic | S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4 |
| intergenic | E961E EG.5.1.4 |
| intergenic | G1155C BA.5.1.2,EG.5.1.4 |
| intergenic | Y1174Y BA.5.2.34,EG.5.1.4 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | H1381Y EG.5.1.4 |
| intergenic | P1390P DV.7.1.2,EG.5.1.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | Y1831Y EG.5.1.4 |
| intergenic | L1884L EG.5.1.4 |
| intergenic | Y1906Y EG.5.1.4 |
| intergenic | A2033A EG.5.1.4 |
| intergenic | T2124I BQ.1.1.8,EG.5.1.4 |
| intergenic | S2151N EG.5.1.4 |
| intergenic | R2159W EG.5.1.4 |
| intergenic | S2188F EG.5.1.4 |
| intergenic | T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15,EG.5.1.4 |
| intergenic | S2389S EG.5.1.4 |
| intergenic | T2495I EG.5.1.8,FL.1.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | E2653K EG.5.1.4 |
| intergenic | M2674I EG.5.1.4 |
| intergenic | N2708N BA.5.2.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | P2792S EG.5.1.4 |
| intergenic | F2802L EG.5.1.4 |
| intergenic | D2835Y EG.5.1.4 |
| intergenic | P2929P BQ.1.2.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | V2955V EG.5.1.4 |
| intergenic | N3007N EG.5.1.4 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8,DV.7.1,DV.7.1.2,BA.5.5,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | A3061A BA.5.2.3,BF.26,EG.5.1.4 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | F3100F BA.5.2.3,BF.9,EG.5.1.4 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4 |
| intergenic | L3198I EG.5.1.4 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | H3233Y EG.5.1.4 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | A3392V EG.5.1.4 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | A3523A EG.5.1.4 |
| intergenic | S3530S EG.5.1.4 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | F3785F BF.9,EG.5.1.4 |
| intergenic | L3829L BA.5.2.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | D4344D EG.5.1.4 |
| intergenic | D4547G EG.5.1.4 |
| intergenic | P4619P EG.5.1.4 |
| intergenic | R4641K EG.5.1.4 |
| intergenic | Y4686Y BA.4.1.8,DV.7.1.2,EG.5.1.4 |
| intergenic | V4691I EG.5.1.4 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | L4779L BA.4,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | L4852L EG.5.1.9,EG.5.1.4 |
| intergenic | I4858V EG.5.1.4 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | I5171L EG.5.1.4 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | L5230L BA.4,EG.5.1.4 |
| intergenic | Y5279Y EG.5.1.4 |
| intergenic | L5283L BA.4,BA.4.1,EG.5.1.4 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | T5435I EG.5.1.4 |
| intergenic | L5456L EG.5.1.4 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4 |
| intergenic | L5580L EG.5.1.4 |
| intergenic | L5619I EG.5.1.4 |
| intergenic | D5668D EG.5.1.4 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | D5782D EG.5.1.4 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | L5905F EG.5.1.4 |
| intergenic | I5967V EG.5.1.4 |
| intergenic | A6021V EG.5.1.4 |
| intergenic | T6022T EG.5.1.4 |
| intergenic | P6046S BA.5.1.24,EG.5.1.4 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4 |
| intergenic | D6097D BA.2.12,BA.5.2.20,BA.5.5,EG.5.1.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | Y6160H EG.5.1.4 |
| intergenic | A6232T BE.1.1,EG.5.1.4 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | S6375N EG.5.1.4 |
| intergenic | T6485I BA.5.2.20,EG.5.1.4 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | A6623A EG.5.1.4 |
| intergenic | D6787D EG.5.1.4 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | R7085I EG.5.1.4 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | L24_A27delinsS EG.5.1.4 |
| intergenic | Q23_A27delinsKS EG.5.1.4 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4 |
| intergenic | S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | V70F EG.5.1.4 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | Q493L EG.5.1.4 |
| intergenic | G496S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,EG.5.1.4 |
| intergenic | QPTN498RPTY EG.5.1.4 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | P521S EG.5.1.4 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | T618T BA.1.14,BA.5.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | G639G EG.5.1.4 |
| intergenic | V642G EG.5.1.4 |
| intergenic | EH654KY EG.5.1.4 |
| intergenic | H655Y EG.5.1.4 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | V860I EG.5.1.4 |
| intergenic | A890A BA.5.2.20,EG.5.1.4 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | N978N EG.5.1.4 |
| S | N978N EG.5.1.4 |
| intergenic | G1035G EG.5.1.4 |
| intergenic | N1134S EG.5.1.4 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | D1153G EG.5.1.4 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | D22Y BQ.1.1.8,BA.5.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | Q57H BF.9,BF.10,EG.5.1.4 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | T89I BF.26,EG.5.1.8,FL.1.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | L106F BA.1.15,EG.5.1.4 |
| intergenic | Y107H EG.5.1.4 |
| intergenic | L115S DV.7.1,EG.5.1.4 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | P240L BA.5.1.2,EG.5.1.4 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | V47L EG.5.1.4 |
| intergenic | V58F EG.5.1.4 |
| intergenic | P71L FL.1.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | L56L BA.4,BA.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | Y71Y EG.5.1.4 |
| intergenic | G78C EG.5.1.4 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | Y20H EG.5.1.4 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | A55V EG.5.1.4 |
| intergenic | F87F EG.5.1.4 |
| intergenic | L116L BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | A15S BA.2.12,EG.5.1.4 |
| intergenic | 19 EG.5.1.4 |
| intergenic | L18L EG.5.1.4 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | H17H BA.5.2.34,BA.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | V62V BA.5.2.20,BE.1.1,EG.5.1.4 |
| intergenic | E64G EG.5.1.4 |
| intergenic | F120fs EG.5.1.4 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | P162P EG.5.1.4 |
| intergenic | A173V BA.5.2.20,BA.4.6,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4 |
| intergenic | H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | A419A BF.20,EG.5.1.4 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4 |
| intergenic | N25N EG.10.1,EG.5.1.4 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | g.G-92A FL.2.3 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | S40P FL.2.3 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34,BF.28,BE.1.1,FL.1.5,FL.2.3 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | C316C BQ.1.13,FL.2.3 |
| intergenic | G327S FL.2.3 |
| intergenic | K623R FL.2.3 |
| intergenic | L730L BA.4,FL.2.3 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | G1069E FL.2.3 |
| intergenic | V1177V DV.7.1,CH.1.1.28,FL.2.3 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | L1438L BA.1.14,BA.5.2.2,BA.5.1.30,BA.4.6,FL.2.3 |
| intergenic | T1538I FL.2.3 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | L2062F BA.5.1.10,BF.26,FL.2.3 |
| intergenic | T2124I BQ.1.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| ORF1a | Q2486Q / NSP3 |
| intergenic | Q2486Q FL.2.3 |
| intergenic | Y2561Y FL.2.3 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | L3234L BA.1.17,BF.10,FL.2.3 |
| intergenic | Y3250Y BA.4.1,FL.2.3 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | F3603F BA.5.1.10,FL.2.3 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3 |
| ORF1a | A3987V / NSP8 |
| intergenic | A3987V FL.2.3 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | L4267L FL.2.3 |
| intergenic | S4398L BA.1.17,BA.5.1.30,BF.26,FL.2.3 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | T4786M BA.5.2.8,FL.2.3 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | L5167L FL.2.3 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| ORF1b | G5391C / NSP13 |
| intergenic | G5391C FL.2.3 |
| intergenic | V5571V FL.2.3 |
| intergenic | G5606G FL.2.3 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | K5784R FL.2.3 |
| intergenic | K5848K FL.2.3 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3 |
| intergenic | S6180I FL.2.3 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | PT6563SI FL.2.3 |
| intergenic | T6564I FL.2.3 |
| intergenic | A6569V FL.2.3 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | L6924F BA.2.12,BA.5.1.10,FL.2.3 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | N234N BE.1.1,FL.2.3 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | T547I BA.5.2.3,BA.5,BF.28,FL.2.3 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | V1228L FL.2.3 |
| intergenic | D1260Y BE.1.1,FL.2.3 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | S180F BA.4.1.8,FL.2.3 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | g.T-40C FL.2.3 |
| intergenic | V10A FL.2.3 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | G25G FL.2.3 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | E135E FL.2.3 |
| intergenic | T175T FL.2.3 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | L40S FL.2.3 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | T61I FL.2.3 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3 |
| intergenic | g.27887_27913delAACGAACATGAAATTTCTTGTTTTCTT FL.2.3 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | F16L FL.2.3 |
| intergenic | Q18X BA.5,FL.2.3 |
| intergenic | I58T FL.2.3 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | A35A BA.1.15,FL.2.3 |
| intergenic | R189L FL.2.3 |
| N | R189L FL.2.3 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3 |
| intergenic | G236F FL.2.3 |
| N | G236F FL.2.3 |
| intergenic | G236V FL.2.3 |
| N | G236V XBB.1.5.15,FL.2.3 |
| N | G236V XBB.1.5.15,FL.2.3 |
| intergenic | D297D FL.2.3 |
| intergenic | Q303L FL.2.3 |
| intergenic | I337F FL.2.3 |
| intergenic | Q409L BQ.1.2.3,FL.2.3 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3 |
| intergenic | g.C-160T BA.5.1.24,BE.1.1,BA.1.15,EG.5.1.3 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| ORF1a | S17C / NSP1 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13,EG.10.1,EG.5.1.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | V56V EG.5.1 |
| intergenic | L92F BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4 |
| intergenic | Y97Y BA.5.1.24,EG.5.1.8,EG.5.2.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | A138A EG.5.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | N188N BA.4.1.8,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,BA.4.6,EG.5.1 |
| intergenic | F190F BF.26,EG.5.1.8 |
| intergenic | L198L EG.5.1 |
| intergenic | H234H EG.5.1 |
| ORF1a | K247R / NSP2 |
| intergenic | K247R EG.5.1 |
| ORF1a | K247N / NSP2 |
| ORF1a | D264D / NSP2 |
| intergenic | G268V EG.5.1 |
| intergenic | G268G EG.5.1 |
| ORF1a | L293P / NSP2 |
| intergenic | L293P EG.5.1 |
| intergenic | S318L BA.5.1.1,BQ.1.1.8,EG.5.1.8 |
| intergenic | A339A EG.5.1 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5,EG.5.1.8,EG.5.1.3 |
| intergenic | S376L BA.5.2.3,BA.5.5,EG.5.1.9 |
| intergenic | H388Y BA.1.14,EG.5.1.9 |
| intergenic | R398C BF.28,EG.5.1.4 |
| intergenic | H417Y EG.5.1 |
| ORF1a | N470S / NSP2 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9 |
| intergenic | V488M EG.5.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1 |
| intergenic | R542C BA.5.2.20,EG.5.1.3,EG.5.1 |
| intergenic | S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1 |
| intergenic | I569T BE.1.1,BF.26,EG.5.1 |
| intergenic | L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3 |
| intergenic | A599V BA.2.12,BF.26,EG.5.1 |
| intergenic | V606V BA.5,BA.5.1.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | P626P BA.4.6,EG.5.1 |
| intergenic | V627I BA.4,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7 |
| intergenic | L628F DV.7.1.2,EG.5.1 |
| ORF1a | A656T / NSP2 |
| intergenic | V665I BF.28,EG.5.1.8 |
| intergenic | C667S EG.5.1 |
| intergenic | K684K EG.5.1 |
| ORF1a | F685L / NSP2 |
| intergenic | F685L EG.5.1 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1 |
| intergenic | T753I BA.4.1.8,DV.7.1,EG.5.1 |
| intergenic | L815L EG.5.1 |
| intergenic | G817G BA.5.1.1,BA.4.6,EG.5.1.8 |
| intergenic | V839V BA.5.1.10,EG.5.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | A872A BA.5.1.2,EG.5.1.4 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | D928D EG.5.1 |
| ORF1a | D935D / NSP3 |
| intergenic | F941L EG.5.1 |
| intergenic | S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4 |
| ORF1a | D982G / NSP3 |
| intergenic | T987N EG.5.1 |
| ORF1a | T1022N / NSP3 |
| intergenic | T1022N EG.5.1 |
| intergenic | V1025V BQ.1.1.8,EG.5.1 |
| intergenic | P1054L EG.5.1 |
| intergenic | V1057I DV.7.1,EG.5.1 |
| intergenic | A1078A EG.5.1 |
| intergenic | S1102G EG.5.1 |
| intergenic | G1155C BA.5.1.2,EG.5.1.4 |
| intergenic | G1155D EG.5.1 |
| intergenic | Y1174Y BA.5.2.34,EG.5.1.4 |
| ORF1a | V1187F / NSP3 |
| intergenic | E1192V EG.5.1 |
| intergenic | P1207P EG.5.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | P1330P BF.10,EG.5.1.3,FL.1.5 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | P1390P DV.7.1.2,EG.5.1.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | L1441L BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1 |
| intergenic | A1473V EG.5.1 |
| intergenic | P1480L EG.5.1 |
| intergenic | D1513E EG.5.1 |
| intergenic | V1629V BA.5.2.34,EG.5.2.1,EG.5.1 |
| intergenic | P1640L BA.5.1.24,BA.5.1.30,EG.5.1.8 |
| intergenic | C1744C EG.5.1 |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10,BA.5.5,EG.5.1 |
| intergenic | V1765V EG.5.1 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | S1857L EG.5.1 |
| intergenic | Y1873Y BA.5.1.10,BF.9,BF.28,EG.5.1.3 |
| intergenic | P1950P EG.5.1 |
| intergenic | Y1972Y EG.5.1 |
| intergenic | S2015S BA.2.86.1,BA.2.12,EG.5.1.3 |
| ORF1a | F2025F / NSP3 |
| intergenic | F2025F EG.5.1 |
| intergenic | V2052L EG.5.1 |
| intergenic | D2101D BA.5.1.24,BA.5.1.2,BF.9,EG.5.1 |
| intergenic | T2124I BQ.1.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | H2125Y BA.4.6,EG.5.1 |
| intergenic | Y2168Y BA.5.1.10,EG.5.1 |
| intergenic | T2196T EG.5.1 |
| intergenic | A2249V BF.28,EG.5.1 |
| intergenic | L2253L EG.5.1 |
| intergenic | Y2262H EG.5.1 |
| intergenic | A2279V EG.5.1 |
| intergenic | T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | P2287L EG.5.1 |
| intergenic | D2299D BA.4,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1 |
| intergenic | T2300T EG.5.1 |
| intergenic | I2309I EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | F2334F BA.2.12,BF.26,EG.5.1.8 |
| intergenic | A2379V BA.4.1.8,EG.5.1.8 |
| ORF1a | I2426I / NSP3 |
| intergenic | I2490I BA.5.5,EG.5.1 |
| intergenic | V2491I BA.5.1.24,EG.5.1.8 |
| intergenic | T2495I EG.5.1.8,FL.1.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | Y2560Y BA.5,BF.41,EG.5.1.3 |
| intergenic | V2624V BA.4,EG.5.1.9 |
| intergenic | N2708N BA.5.2.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | I2806V EG.5.1 |
| intergenic | T2836I BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.1.8 |
| intergenic | N2847S EG.5.1 |
| ORF1a | A2856V / NSP4 |
| intergenic | A2856V BF.9,EG.5.1 |
| intergenic | R2875H EG.5.1 |
| intergenic | N2894N BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.2.20,EG.5.1.9 |
| intergenic | I2895I EG.5.1 |
| intergenic | T2906I EG.5.1 |
| intergenic | T2920T BF.10,EG.5.1 |
| ORF1a | S2926C / NSP4 |
| intergenic | P2929L EG.5.1 |
| intergenic | P2929P BQ.1.2.3,EG.5.1.4 |
| ORF1a | P2950P / NSP4 |
| intergenic | V2996L EG.5.1 |
| intergenic | N3007N EG.5.1.4,EG.5.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8,DV.7.1,DV.7.1.2,BA.5.5,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | C3059C EG.5.1 |
| intergenic | A3061A BA.5.2.3,BF.26,EG.5.1.4 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | F3100F BA.5.2.3,BF.9,EG.5.1.4 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1 |
| ORF1a | E3188D / NSP4 |
| intergenic | E3188D EG.5.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | A3209V BA.5.1.10,BA.5.2.34,EG.5.1.3 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | T3258T BA.5.2.8,EG.5.1.8 |
| intergenic | G3278S BF.26,EG.5.1 |
| intergenic | N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2,BF.9,BE.1.1,EG.5.1 |
| intergenic | D3297D BF.10,EG.5.1 |
| intergenic | Y3300Y EG.5.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | L3321F EG.5.1 |
| intergenic | L3338L BA.5.5,EG.5.1 |
| ORF1a | P3362P / NSP5 |
| intergenic | V3377V EG.5.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | F3397F EG.5.1 |
| intergenic | D3439D BA.5.2.34,BA.5.1.1,DV.7.1,EG.5.1.3,FL.1.5 |
| intergenic | D3479D BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1.8 |
| ORF1a | I3522L / NSP5 |
| intergenic | I3522L EG.5.1 |
| intergenic | T3579I EG.5.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3 |
| intergenic | A3615V BA.5.1.2,BF.26,BA.5.5,EG.5.1.8 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | L3694F EG.5.1 |
| intergenic | V3751V EG.5.2.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | F3785F BF.9,EG.5.1.4 |
| intergenic | L3829L BA.5.2.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | P3831P BQ.1.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | L3900L EG.5.1 |
| intergenic | L3914L BQ.1.1.8,EG.5.1 |
| intergenic | N3928N BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1 |
| intergenic | N3937S EG.5.1 |
| intergenic | N3937N BA.5,EG.5.2.1,EG.5.1 |
| intergenic | A4016V BF.10,EG.5.1 |
| intergenic | D4020D BA.5.1.2,EG.5.1 |
| intergenic | L4037F BA.5.2.8,EG.5.1.3 |
| intergenic | P4058P BA.4.1,BA.5.1.30,EG.5.1 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BA.4.6,EG.5.1.3 |
| intergenic | N4082N EG.5.1 |
| intergenic | T4175I EG.5.1 |
| intergenic | TT4174II EG.5.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | L4185L EG.7,EG.5.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | L4237L DV.7.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | I4291I BA.5.1.10,EG.5.1.3 |
| intergenic | D4317D BF.9,EG.5.1.8 |
| intergenic | A4357V BA.4,BA.5.2.3,EG.5.1 |
| ORF1a | A4357A / NSP10 |
| intergenic | A4357A DV.7.1.2,EG.5.1 |
| intergenic | V4372V BA.5.2.8,BF.26,EG.5.1 |
| intergenic | D4384D EG.5.1 |
| ORF1b | D4455N / NSP12 |
| intergenic | D4455N EG.5.1 |
| intergenic | Y4472Y EG.5.1 |
| ORF1b | D4553G / NSP12 |
| intergenic | Y4567Y BA.5,EG.5.1 |
| intergenic | V4582V EG.5.1 |
| intergenic | I4636M EG.5.1 |
| intergenic | Y4686Y BA.4.1.8,DV.7.1.2,EG.5.1.4 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| ORF1b | S4735S / NSP12 |
| intergenic | S4735S EG.5.1 |
| ORF1b | A4767T / NSP12 |
| intergenic | A4767T EG.5.1 |
| intergenic | L4779L BA.4,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | C4787C EG.5.1 |
| intergenic | N4795N BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.5.5,BQ.1.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | F4820F BA.5.1.10,BA.4.1,BF.26,BQ.1.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | L4852L EG.5.1.9,EG.5.1.4 |
| intergenic | D4857D BF.28,EG.5.1 |
| intergenic | R4947R EG.5.1 |
| ORF1b | T4978T / NSP12 |
| intergenic | T4978T BQ.1.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | T4983I BA.5.1.24,EG.5.1.3 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | E5136E EG.5.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | D5152D BA.5.1.24,DV.7.1,CH.1.1.28,BF.26,EG.5.1.3 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | L5167L FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | Y5218Y EG.5.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | L5230L BA.4,EG.5.1.4 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.2,BF.26,EG.5.1.8,EG.5.1 |
| intergenic | F5251F EG.5.1 |
| intergenic | L5283L BA.4,BA.4.1,EG.5.1.4,EG.5.1 |
| intergenic | N5303N EG.5.1 |
| intergenic | C5332C BA.5,EG.5.1.8,EG.5.1.9,EG.5.1 |
| intergenic | Y5355Y BA.2.12,BA.5.2.20,EG.5.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | P5371P BA.1.17,EG.5.2.1,EG.5.1 |
| intergenic | C5374C BE.1.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | P5377S BA.4,BA.5.1.24,BF.28,EG.5.1 |
| intergenic | S5404G BA.5.1.2,BE.1.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | H5488Y BF.26,EG.5.1 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1 |
| ORF1b | L5543L / NSP13 |
| ORF1b | V5571V / NSP13 |
| intergenic | A5636A BF.10,BA.5.5,EG.5.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | A5727V BA.4.1.8,EG.5.1.8 |
| intergenic | K5784R FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | A5829D EG.5.1 |
| intergenic | G5862G EG.5.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| ORF1b | I5889I / NSP13 |
| intergenic | I5889I EG.5.1 |
| intergenic | H5951Y DV.7.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | T6028T BA.5.2.2,BE.1.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | P6046S BA.5.1.24,EG.5.1.4 |
| intergenic | V6050V EG.5.1 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1 |
| intergenic | M6078I BA.4,EG.5.1 |
| intergenic | D6097D BA.2.12,BA.5.2.20,BA.5.5,EG.5.1.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | V6107I DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1 |
| intergenic | P6128P EG.5.1 |
| intergenic | T6131T BA.2.12,DV.7.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | G6173S DV.7.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | L6184L EG.5.1 |
| intergenic | V6188V BA.1.14,EG.5.1 |
| intergenic | N6191D EG.5.1 |
| intergenic | A6232T BE.1.1,EG.5.1.4 |
| intergenic | V6241I EG.5.1 |
| intergenic | P6252S EG.5.1.3,FL.1.5,EG.5.1 |
| intergenic | D6300D BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.5.1.9 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | T6485I BA.5.2.20,EG.5.1.4 |
| intergenic | A6511S EG.5.1 |
| ORF1b | A6560S / NSP15 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1 |
| intergenic | T6566M BA.5.2.20,EG.5.1 |
| ORF1b | V6583L / NSP15 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| ORF1b | Q6660P / NSP15 |
| intergenic | Q6660P EG.5.1 |
| intergenic | M6661I EG.5.1 |
| intergenic | H6686Y BA.5.1.1,BA.5.1.2,EG.5.1.8 |
| intergenic | G6738S BF.28,EG.5.1 |
| intergenic | V6772L BA.5.2.2,BA.5.1.1,BF.28,EG.5.1.3 |
| intergenic | Y6813Y EG.5.1 |
| intergenic | A6832V BA.5,EG.5.1 |
| intergenic | T6833I BA.4.6,EG.5.1 |
| intergenic | S6872S BQ.1.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | I6926V EG.5.1 |
| intergenic | K6935K EG.5.1 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | T19I BA.5.2.2,BA.5.1.2,EG.5.1.3,EG.5.1 |
| intergenic | T19L BA.5.2.2,BA.5.1.2,EG.5.1.3,EG.5.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | T29I BA.5.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1 |
| intergenic | F55F BF.9,BF.28,BF.26,EG.5.1 |
| intergenic | S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | T95I BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,EG.5.1.8 |
| intergenic | S116S EG.5.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | L176F BA.5.1.30,EG.5.1.9 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | D215Y EG.5.1 |
| intergenic | L216F BA.2.86.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | S255F BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,EG.5.1 |
| intergenic | A260D EG.5.1 |
| intergenic | G261V BA.5.1.1,EG.5.1 |
| intergenic | A288S EG.5.1 |
| S | A288S EG.5.1 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1 |
| intergenic | T323T EG.5.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | R346I BA.5.2.2,BE.1.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | N354H EG.5.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | D428D BF.10,EG.5.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | F490P EG.5.1 |
| intergenic | F490S EG.5.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3 |
| intergenic | S494P EG.10.1,EG.5.1 |
| intergenic | G496S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,EG.5.1.4 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | T573I EG.5.1 |
| intergenic | I584V EG.5.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | T618T BA.1.14,BA.5.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4 |
| intergenic | N710N BA.5.1.10,EG.5.1 |
| intergenic | T732I BA.2.12,EG.5.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| S | T791P BQ.1.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | L821L BA.5.5,FL.1.5,EG.5.1 |
| intergenic | A890A BA.5.2.20,EG.5.1.4 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | L981I DV.7.1,EG.5.1 |
| intergenic | V1061V EG.5.1 |
| intergenic | T1076S EG.5.1 |
| S | T1076S EG.5.1 |
| intergenic | E1092D EG.5.1 |
| intergenic | H1101Y BF.41,BA.5.2.20,EG.5.1.3 |
| intergenic | Q1113K EG.5.1 |
| intergenic | E1144Q EG.5.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | E1150Q EG.5.1 |
| S | E1150Q EG.5.1 |
| intergenic | N1187N EG.5.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | T12I EG.5.1 |
| intergenic | K21E EG.5.1 |
| intergenic | D22Y BQ.1.1.8,BA.5.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | D27H EG.5.1 |
| intergenic | I37T EG.5.1 |
| intergenic | A54A EG.5.1 |
| intergenic | Q57H BF.9,BF.10,EG.5.1.4 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | H78Y BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.20,BF.28,EG.5.1 |
| intergenic | T89I BF.26,EG.5.1.8,FL.1.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | Y91C EG.5.1 |
| intergenic | A98V EG.5.1 |
| intergenic | L101L BF.9,EG.5.1 |
| intergenic | L106F BA.1.15,EG.5.1.4 |
| intergenic | Y109C EG.5.1 |
| intergenic | A110S BA.4.6,EG.5.1.3 |
| intergenic | L115S DV.7.1,EG.5.1.4 |
| ORF3a | Q116K EG.5.1 |
| intergenic | S177I BA.5.1.2,EG.5.1.3 |
| intergenic | F207L EG.5.1 |
| intergenic | Q213K BA.2.12,EG.5.1.3 |
| intergenic | T223I BA.2.12,BA.5.1.30,EG.5.1.3 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | P240L BA.5.1.2,EG.5.1.4,EG.5.1 |
| intergenic | V256del BA.5.2.2,BA.5.1.30,EG.5.1.3 |
| intergenic | M260K BA.4.1.8,EG.5.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | F23F EG.5.1 |
| intergenic | V25V BA.5.1.24,BA.5.1.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | S55F BA.5.1.2,EG.5.1 |
| intergenic | R61L BA.5.2.34,EG.5.1.9 |
| intergenic | V62F BA.5.2.20,CK.2,EG.5.1 |
| intergenic | P71L FL.1.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | L56L BA.4,BA.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | T77T BA.4.6,EG.5.1 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1 |
| intergenic | L102L BA.5,EG.5.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | N117N BQ.1.13,BA.5.5,EG.5.1.3 |
| intergenic | H125Y BA.5,BA.5.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | L129L DV.7.1,EG.5.1.3 |
| intergenic | V143V BA.5.1.1,EG.5.1 |
| intergenic | R150R DV.7.1,EG.5.1 |
| intergenic | Y199Y BF.26,EG.5.1.3 |
| intergenic | N203N BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1.3 |
| intergenic | N207N BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1.3,EG.7 |
| intergenic | F2L EG.5.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | D61I EG.5.1 |
| ORF6 | D61I XBB.1.5.72,EG.5.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | A13T EG.5.1 |
| intergenic | G38G EG.5.1 |
| intergenic | S37F BF.10,EG.5.1 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | N52N BF.26,EG.5.1.3 |
| intergenic | S81L EG.5.1 |
| intergenic | Q94X BA.4.6,EG.5.1.3 |
| intergenic | I107M EG.5.1 |
| intergenic | L116L BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | X122fs EG.5.1 |
| intergenic | A15S BA.2.12,EG.5.1.4 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | H17H BA.5.2.34,BA.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | C37F EG.5.1 |
| intergenic | P38L EG.5.1 |
| intergenic | H40H EG.5.1 |
| intergenic | H40Q EG.5.1 |
| intergenic | G50R EG.5.1 |
| intergenic | I58T FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | C61C BQ.1.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | V62L BF.41,BA.5.5,EG.5.1 |
| intergenic | V62V BA.5.2.20,BE.1.1,EG.5.1.4 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1 |
| intergenic | S67F BA.5.1.10,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.5,EG.5.1 |
| intergenic | I71V EG.5.1 |
| intergenic | Q72P EG.5.1 |
| intergenic | T80I EG.5.1 |
| intergenic | S103L BA.5.1.2,EG.5.1.3 |
| intergenic | Y111Y EG.5.1 |
| intergenic | F120fs EG.5.1.4,EG.5.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | F53F BE.1.1,EG.5.1 |
| intergenic | S78S BA.5.1.2,EG.5.1 |
| intergenic | D98D BE.1.1,EG.5.1 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1 |
| intergenic | I157I BA.4,BA.5.2.34,EG.5.2.1,EG.5.1 |
| intergenic | L159I EG.5.1 |
| intergenic | A173V BA.5.2.20,BA.4.6,EG.7,EG.5.1.4 |
| intergenic | E174E BA.4,EG.5.1 |
| intergenic | N196N EG.5.1 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | G212R EG.5.1 |
| intergenic | G212G EG.5.1 |
| intergenic | A217S DV.7.1,EG.5.1.9 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1,BF.26,EG.5.1 |
| intergenic | H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.5,EG.5.1.4 |
| intergenic | F314F EG.5.1 |
| intergenic | T334R EG.5.1 |
| intergenic | F346F BA.5.2.34,EG.5.1 |
| N | K373Q EG.5.1 |
| intergenic | A381A EG.5.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | D415D DV.7.1,BF.28,EG.5.1.3,EG.5.1 |
| intergenic | A419A BF.20,EG.5.1.4 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1 |
| intergenic | N25N EG.10.1,EG.5.1.4 |
| intergenic | Q29R EG.5.1 |
| ORF10 | Q29R GJ.1.2,EG.5.1 |
| intergenic | g.C29675T EG.5.1 |
| intergenic | g.G29688C BE.1.1,EG.5.1.8,FL.1.5 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1 |
| intergenic | g.A29771G EG.5.1 |
| intergenic | g.C29774T BA.1.18,EG.5.1.9 |
| intergenic | g.G29779T EG.5.1 |
| intergenic | g.T-42C EU.1.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | H13H EU.1.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | V86F EU.1.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| ORF1a | L204I / NSP2 |
| intergenic | L204I EU.1.1 |
| intergenic | L219L EU.1.1 |
| intergenic | H388Y BA.1.14,EG.5.1.9,EU.1.1 |
| intergenic | C416C EU.1.1 |
| intergenic | S443S BA.5,EU.1.1 |
| intergenic | L454F BA.5.1.24,BA.5.2.20,FL.1.5,EU.1.1 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BF.26,BF.10,CK.2,EU.1.1 |
| ORF1a | F487L / NSP2 |
| intergenic | F487L EU.1.1 |
| intergenic | S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | A599V BA.2.12,BF.26,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | D795D EU.1.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| ORF1a | I895L / NSP3 |
| intergenic | I895L EU.1.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | T945I EU.1.1 |
| intergenic | Q990R EU.1.1 |
| intergenic | T1001I BA.2.12,BA.5.1.10,DV.7.1,EU.1.1 |
| intergenic | I1002T BA.5.1.24,EU.1.1 |
| intergenic | T1004I EU.1.1 |
| intergenic | T1246I EU.1.1 |
| intergenic | V1299V EU.1.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | D1323N EU.1.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| ORF1a | A1432T / NSP3 |
| intergenic | A1432T EU.1.1 |
| intergenic | A1473V EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | H1610H EU.1.1 |
| intergenic | T1638I EU.1.1 |
| intergenic | L1676I EU.1.1 |
| intergenic | Y1868Y BA.4,BA.5.1.24,BF.26,EU.1.1 |
| intergenic | V2052V EU.1.1 |
| intergenic | F2334F BA.2.12,BF.26,EG.5.1.8,EU.1.1 |
| intergenic | L2343F EU.1.1 |
| intergenic | D2467D EU.1.1 |
| ORF1a | T2746A / NSP3 |
| intergenic | T2746A EU.1.1 |
| intergenic | R2875R EU.1.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | P3134S EU.1.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | G3278S BF.26,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | A3454V EU.1.1 |
| intergenic | T3579I EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | F3603F BA.5.1.10,FL.2.3,EU.1.1 |
| intergenic | P3613S EG.10.1,EU.1.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1 |
| intergenic | P4075S EU.1.1 |
| intergenic | L4169V EU.1.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | N4358N BA.2.86.1,BF.26,BA.5.5,EU.1.1 |
| intergenic | S4398L BA.1.17,BA.5.1.30,BF.26,FL.2.3,EU.1.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| ORF1b | D4750N / NSP12 |
| intergenic | D4750N EU.1.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EU.1.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | I5239I EU.1.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| ORF1b | Y5394Y / NSP13 |
| intergenic | Y5394Y EU.1.1 |
| ORF1b | V5493V / NSP13 |
| intergenic | V5493V EU.1.1 |
| intergenic | A5620A EU.1.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | F5823F BA.4,EU.1.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | T5923I EG.7,EU.1.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | Y5976Y EU.1.1 |
| intergenic | H6020H EU.1.1 |
| intergenic | A6139A EU.1.1 |
| intergenic | A6296A EU.1.1 |
| intergenic | N6335N BA.5,EU.1.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | K6516E EU.1.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | V6573I EU.1.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | G7006G EU.1.1 |
| intergenic | L7010F EU.1.1 |
| intergenic | V7057V EU.1.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | T108T EU.1.1 |
| intergenic | L118F EU.1.1 |
| intergenic | S116S EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | N148N EU.1.1 |
| intergenic | F157S EU.1.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | T385I EU.1.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | RQI408SQV EU.1.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | Y453H EU.1.1 |
| S | Y453H EU.1.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | P521S EG.5.1.4,EU.1.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | L877L BF.26,DV.7.1.2,EU.1.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | A958A EU.1.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | D1118D EU.1.1 |
| S | D1118D EU.1.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | P1162P EU.1.1 |
| intergenic | L1203F EU.1.1 |
| intergenic | M1229L EU.1.1 |
| S | M1229L EU.1.1 |
| intergenic | K1245R EU.1.1 |
| intergenic | V1264L BA.5.5,EU.1.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | A23V BA.5.2.3,EU.1.1 |
| intergenic | V55F BA.4,EU.1.1 |
| ORF3a | V55F BA.4,EU.1.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | R122K EU.1.1 |
| ORF3a | R122K EU.1.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | V5I EU.1.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | P71L FL.1.5,EG.5.1.4,EU.1.1 |
| intergenic | g.T-26C BF.9,EU.1.1 |
| intergenic | S4_I8delinsF EU.1.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | R107H EU.1.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EU.1.1 |
| intergenic | T39I BA.5.1.1,EU.1.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | Q35X EU.1.1 |
| intergenic | N38N EU.1.1 |
| intergenic | g.C-1T EU.1.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | A51V BA.5.1.2,EU.1.1 |
| intergenic | V62V BA.5.2.20,BE.1.1,EG.5.1.4,EU.1.1 |
| intergenic | R115C EU.1.1 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | P13F BA.5.1.10,BF.10,EU.1.1 |
| intergenic | P13L BA.5.1.10,EU.1.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | G60G EU.1.1 |
| intergenic | L159L EU.1.1 |
| intergenic | A173V BA.5.2.20,BA.4.6,EG.7,EG.5.1.4,EU.1.1 |
| intergenic | G178D EU.1.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | A267V EU.1.1 |
| intergenic | T271I BA.5.1.10,EU.1.1 |
| intergenic | S310G EU.1.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1 |
| intergenic | P10P EU.1.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1 |
| intergenic | g.T29793A DV.7.1,EU.1.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| ORF1a | N348D / NSP2 |
| intergenic | N348D FL.14 |
| intergenic | G392G FL.14 |
| intergenic | I396V FL.14 |
| intergenic | S531N FL.14 |
| intergenic | A591V BA.5.1.10,BA.5.1.2,FL.14 |
| ORF1a | K636N / NSP2 |
| intergenic | K636N FL.14 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| ORF1a | N1076S / NSP3 |
| intergenic | N1076S FL.14 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| ORF1a | R1703R / NSP3 |
| intergenic | R1703R BQ.1.2.3,FL.14 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14 |
| intergenic | L2062F BA.5.1.10,BF.26,FL.2.3,FL.14 |
| intergenic | C2160Y FL.14 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| ORF1a | C4343C / NSP10 |
| intergenic | C4343C FL.14 |
| intergenic | Y4424Y FL.1.5,FL.14 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | C5332C BA.5,EG.5.1.8,EG.5.1.9,EG.5.1,FL.14 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | D5380D FL.14 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14 |
| intergenic | L5551L EG.7,FL.14 |
| intergenic | E5585D FL.14 |
| intergenic | S5674L FL.14 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | V5834V BA.5.2.20,FL.14 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | I5967V EG.5.1.4,FL.14 |
| intergenic | H6007H FL.14 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | R6709C FL.14 |
| intergenic | P6722S FL.14 |
| intergenic | V7086I FL.14 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | T76I BA.5.5,FL.14 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | L118L FL.14 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | I472I FL.14 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | V534I FL.14 |
| S | V534I FL.14 |
| intergenic | P561P FL.1.5,FL.14 |
| intergenic | I598I FL.14 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | T618T BA.1.14,BA.5.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | I692I BA.5.1.10,BA.4.6,FL.14 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | V1122M FL.14 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | A23V BA.5.2.3,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | H148Y FL.14 |
| intergenic | A195A FL.14 |
| intergenic | H3H FL.14 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | W45R FL.14 |
| intergenic | P93L FL.14 |
| ORF8 | P93L FL.14 |
| intergenic | V100L FL.14 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | R93S FL.14 |
| N | R93S FL.14 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | G238S FL.14 |
| intergenic | F346F BA.5.2.34,EG.5.1,FL.14 |
| intergenic | P364L FL.14 |
| intergenic | D371N FL.14 |
| N | D371N FL.14 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | L27L BA.5.1.24,FL.1.5.2 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | H81R FL.1.5.2 |
| intergenic | G112G BF.20,FL.1.5.2 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | A339T FL.1.5.2 |
| intergenic | V544A FL.1.5.2 |
| intergenic | T554I FL.1.5.2 |
| intergenic | Y621Y BA.4,FL.1.5,FL.1.5.2 |
| intergenic | V721V FL.1.5.2 |
| intergenic | S723F FL.1.5.2 |
| intergenic | N786N BA.5.2.34,BQ.1.13,BF.10,FL.1.5.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | G993S FL.1.5,FL.1.5.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | V1339I FL.1.5.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | 1529 FL.1.5.2 |
| intergenic | T1589I FL.1.5.2 |
| intergenic | N1709N BA.1.18,CK.2,FL.1.5.2 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | P2046S BA.1.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | K2219K FL.1.5.2 |
| intergenic | V2652A FL.1.5.2 |
| intergenic | A2828A FL.1.5.2 |
| intergenic | N2966K FL.1.5.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | S3402S FL.1.5.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | T4129I FL.1.5.2 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | N4235N BA.4,BA.5,BA.5.1.1,FL.1.5,FL.1.5.2 |
| intergenic | G4341G FL.1.5.2 |
| intergenic | K4348R FL.1.5.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | G5233G FL.1.5.2 |
| intergenic | Y5355Y BA.2.12,BA.5.2.20,EG.5.1,FL.1.5.2 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | P5377L FL.1.5.2 |
| intergenic | I5573I FL.1.5.2 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2 |
| intergenic | C6234C FL.1.5.2 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | P6605P FL.1.5.2 |
| intergenic | T6647T FL.1.5.2 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2 |
| intergenic | K7075R FL.1.5.2 |
| intergenic | L10L FL.1.5.2 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | D138E FL.1.5.2 |
| intergenic | F140_H146delinsLDVYQ FL.1.5.2 |
| intergenic | G142_H146delinsDVYK FL.1.5.2 |
| intergenic | G142_H146delinsDVYQ FL.1.5.2 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | N481K FL.1.5.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | F490P EG.5.1,FL.1.5.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | P561P FL.1.5,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | G667A FL.1.5.2 |
| intergenic | C671C FL.1.5.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | P681R BA.2.86.1,FL.1.5.2 |
| intergenic | A701V BA.1.17,BA.4.1,BA.5.5,EG.10.1,FL.1.5,FL.1.5.2 |
| intergenic | P715P BA.5.2.20,FL.1.5.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | G1131A FL.1.5.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | D27H EG.5.1,FL.1.5.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | P104dup BQ.1.13,BA.1.15,FL.1.5.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | T30I FL.1.5.2 |
| intergenic | V52I FL.1.5.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | L22L FL.1.5.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | T208I FL.1.5.2 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | L86L BA.5.1.2,FL.1.5.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | H37L FL.1.5.2 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | N228N FL.1.5.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | g.C-3T BA.5.2.2,FL.1.5.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | R24R BA.5,FK.1.1 |
| intergenic | E57K FK.1.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | N160N BA.4.6,FK.1.1 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5,EG.5.1.8,EG.5.1.3,FK.1.1 |
| intergenic | L397F FK.1.1 |
| intergenic | G400G FK.1.1 |
| intergenic | E472E FK.1.1 |
| intergenic | A599A BA.5.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,FK.1.1 |
| intergenic | Y717Y BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,FK.1.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | N869S FK.1.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | A1043V BA.4,BE.1.1,FK.1.1 |
| intergenic | A1060T FK.1.1 |
| intergenic | T1171I FK.1.1 |
| intergenic | Y1174Y BA.5.2.34,EG.5.1.4,FK.1.1 |
| intergenic | V1177V DV.7.1,CH.1.1.28,FL.2.3,FK.1.1 |
| intergenic | Q1198K DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1 |
| intergenic | S1221L DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | L1356L BA.4.6,FK.1.1 |
| intergenic | A1380A FK.1.1 |
| intergenic | R1421R FK.1.1 |
| intergenic | L1441L BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1,FK.1.1 |
| intergenic | Y1465C FK.1.1 |
| intergenic | T1504T FK.1.1 |
| intergenic | P1640S DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1 |
| intergenic | K1781R FK.1.1 |
| intergenic | Q1813Q FK.1.1 |
| intergenic | D1903D BQ.1.13,FK.1.1 |
| intergenic | S2015N FK.1.1 |
| intergenic | P2046S BA.1.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | T2068I FK.1.1 |
| intergenic | S2083I FK.1.1 |
| intergenic | I2244T FK.1.1 |
| intergenic | T2247T FK.1.1 |
| intergenic | F2386F FK.1.1 |
| intergenic | V2453I FK.1.1 |
| intergenic | A2508A BQ.1.1.8,FK.1.1 |
| intergenic | F2780L FK.1.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | Y3074Y FK.1.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | F3603F BA.5.1.10,FL.2.3,EU.1.1,FK.1.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | R3805R FK.1.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1 |
| intergenic | M3934I FK.1.1 |
| intergenic | L4045L BA.4,BA.4.1,BF.26,FK.1.1 |
| intergenic | N4060S DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | Y4329Y FK.1.1 |
| intergenic | N4358S FK.1.1 |
| intergenic | M4390T BA.5.1.1,FK.1.1 |
| intergenic | M4588I BA.4,FK.1.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | Q4749H FK.1.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | T5161N FK.1.1 |
| intergenic | C5353C BA.5.1.30,FK.1.1 |
| intergenic | M5392V FK.1.1 |
| ORF1b | G5442V / NSP13 |
| intergenic | G5442V FK.1.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | D5725D BA.5.2.8,FK.1.1 |
| intergenic | T5805M BA.5,FK.1.1 |
| intergenic | T5941I BA.5.5,FK.1.1 |
| ORF1b | G5942R / NSP14 |
| intergenic | G5942R FK.1.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | V6026I FK.1.1 |
| intergenic | Y6079Y FK.1.1 |
| intergenic | V6107I DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1,FK.1.1 |
| intergenic | T6131T BA.2.12,DV.7.1,EG.5.1.8,FK.1.1 |
| intergenic | V6188V BA.1.14,EG.5.1,FK.1.1 |
| intergenic | P6222S FK.1.1 |
| ORF1b | L6254I / NSP14 |
| intergenic | L6254I FK.1.1 |
| intergenic | E6272E FK.1.1 |
| intergenic | L6418F BQ.1.13,FK.1.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | T6566K FK.1.1 |
| intergenic | L6571F FK.1.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | V6638V BA.5.1.2,BA.4.6,FK.1.1 |
| intergenic | L6703L FK.1.1 |
| intergenic | T6733T FK.1.1 |
| intergenic | Q6826R DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1 |
| intergenic | G6911G FK.1.1 |
| intergenic | Y6930Y BA.5.1.10,BA.1.15,FK.1.1 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | L6981I FK.1.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | R78R FK.1.1 |
| intergenic | V83V BA.5.1.10,BA.5.1.2,CH.1.1.28,FK.1.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1 |
| intergenic | K147E DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1 |
| intergenic | W152R BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1 |
| intergenic | G181R FK.1.1 |
| intergenic | R190K BQ.1.1.8,FK.1.1 |
| intergenic | I210V DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,FK.1.1 |
| intergenic | D215G FK.1.1 |
| intergenic | G219S FK.1.1 |
| intergenic | S221S BA.2.12,FK.1.1 |
| intergenic | G257S DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | K444T BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FK.1.1 |
| intergenic | G446S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,BA.1.15,FK.1.1 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,FK.1.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | F486S DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | QD613HG FK.1.1 |
| intergenic | T618T BA.1.14,BA.5.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | A892V FK.1.1 |
| intergenic | G910G FK.1.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | A1190A FK.1.1 |
| intergenic | E1195Q EG.5.1.9,FK.1.1 |
| intergenic | A1222T FK.1.1 |
| intergenic | V1264L BA.5.5,EU.1.1,FK.1.1 |
| intergenic | 9 FK.1.1 |
| intergenic | F8F FK.1.1 |
| intergenic | A23A FK.1.1 |
| intergenic | I62I BQ.1.2.3,FK.1.1 |
| intergenic | I63T FK.1.1 |
| intergenic | L65F FK.1.1 |
| intergenic | T64T FK.1.1 |
| intergenic | K75N FK.1.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | g.-4delA FK.1.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | L27L FK.1.1 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10,BF.20,BA.5.1.2,FK.1.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1 |
| intergenic | S212G FK.1.1 |
| intergenic | L16L BA.5.1.1,BA.5.1.2,FK.1.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | K72N FK.1.1 |
| ORF7a | K72N FK.1.1 |
| intergenic | 19 EG.5.1.4,FK.1.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | R32_G34del FK.1.1 |
| intergenic | S37L FK.1.1 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1 |
| intergenic | R191R FK.1.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | D341G FK.1.1 |
| intergenic | S413R BA.5.1.24,FK.1.1 |
| intergenic | g.C-3T BA.5.2.2,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1 |
| intergenic | g.T-167C EG.6.1 |
| intergenic | g.C-63T BA.5.1.10,BA.4,EG.10.1,FL.1.5,EG.6.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1 |
| ORF1a | H165Y / NSP1 |
| intergenic | G192D EG.6.1 |
| intergenic | N310S EG.6.1 |
| intergenic | A405A EG.6.1 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1 |
| intergenic | I567V EG.6.1 |
| intergenic | L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.6.1 |
| intergenic | L580F BA.4,BA.5.1.24,EG.6.1 |
| intergenic | L628R EG.6.1 |
| intergenic | L681F BA.2.12,BQ.1.13,EG.6.1 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1 |
| intergenic | T711T BA.2.12,EG.6.1 |
| intergenic | N810N BA.5.2.20,EG.6.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| ORF1a | G865D / NSP3 |
| intergenic | P892S EG.5.1.3,EG.6.1 |
| intergenic | L897L EG.6.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | D992D DV.7.1,EG.6.1 |
| intergenic | E1024A EG.6.1 |
| intergenic | E1047D EG.6.1 |
| intergenic | I1091M EG.6.1 |
| intergenic | P1147P EG.6.1 |
| intergenic | K1247K DV.7.1,EG.6.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| ORF1a | A1485E / NSP3 |
| intergenic | T1504I EG.6.1 |
| intergenic | L1507F EG.6.1 |
| intergenic | T1543A EG.6.1 |
| ORF1a | L1559F / NSP3 |
| ORF1a | Y1634H / NSP3 |
| intergenic | L1643L BA.5.1.2,EG.6.1 |
| intergenic | D1671D BA.4.6,EG.6.1 |
| intergenic | Y1700Y BA.4.1,BQ.1.1.8,EG.6.1 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | L1853F EG.6.1 |
| intergenic | F1867F EG.6.1 |
| intergenic | Y1868Y BA.4,BA.5.1.24,BF.26,EU.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | Y1975Y EG.6.1 |
| intergenic | S1978F BA.5.2.8,EG.5.2.1,EG.6.1 |
| intergenic | D2026G EG.6.1 |
| intergenic | C2041S EG.6.1 |
| intergenic | P2079S EG.5.1.9,EG.6.1 |
| intergenic | D2094D EG.6.1 |
| intergenic | A2123V EG.6.1 |
| intergenic | P2221S EG.6.1 |
| intergenic | I2230T EG.6.1 |
| intergenic | T2247T FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | T2274I BA.5.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | S2493G BA.4,EG.6.1 |
| intergenic | A2584V BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,EG.7,EG.6.1 |
| intergenic | K2589R BE.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | F2780F EG.6.1 |
| ORF1a | T2977K / NSP4 |
| intergenic | T2977K EG.6.1 |
| ORF1a | V3024I / NSP4 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | M3030I EG.6.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | F3100F BA.5.2.3,BF.9,EG.5.1.4,EG.6.1 |
| intergenic | S3171S EG.6.1 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5,EG.6.1 |
| ORF1a | K3192R / NSP4 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | F3271F BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,EG.6.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | A3523V EG.6.1 |
| ORF1a | G3578V / NSP6 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | A3620V BA.1.14,BF.26,EG.6.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | A3730A BA.2.12,EG.6.1 |
| ORF1a | Y3765H / NSP6 |
| intergenic | Y4077Y EG.6.1 |
| intergenic | S4093S EG.6.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | F4196F EG.6.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | I4231I EG.6.1 |
| intergenic | I4308T EG.6.1 |
| intergenic | C4332S EG.6.1 |
| intergenic | V4361V EG.6.1 |
| intergenic | I4429I BA.4.6,EG.6.1 |
| intergenic | A4487V EG.6.1 |
| intergenic | D4562Y EG.6.1 |
| intergenic | P4619S EG.6.1 |
| intergenic | L4708L EG.6.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | V4802V EG.6.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | E5136D BA.4,EG.6.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | T5242T EG.6.1 |
| intergenic | P5310L BA.5.1.10,EG.6.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | P5401P EG.6.1 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1 |
| intergenic | S5583L BE.1.1,EG.6.1 |
| ORF1b | D5584G / NSP13 |
| intergenic | D5584G EG.6.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | V5834V BA.5.2.20,FL.14,EG.6.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | D6069D BA.2.12,BA.4.1,EG.6.1 |
| intergenic | L6102L BA.4.1,BA.4.6,EG.6.1 |
| intergenic | D6104D BA.2.12,BF.26,EG.6.1 |
| ORF1b | G6190G / NSP14 |
| intergenic | L6308L EG.6.1 |
| intergenic | D6315G BA.5,EG.6.1 |
| intergenic | Y6317Y EG.6.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | N6403N EG.6.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | V6583L EG.6.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | D6664D EG.6.1 |
| ORF1b | H6686R / NSP15 |
| intergenic | A6990A EG.6.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | I692I BA.5.1.10,BA.4.6,FL.14,EG.6.1 |
| S | V729V EG.6.1 |
| intergenic | C743C EG.6.1 |
| S | C743C EG.6.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | V772I EG.6.1 |
| intergenic | D808H EG.6.1 |
| intergenic | N856N BQ.1.1.8,CH.1.1.28,EG.7,EG.6.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | Y1067Y EG.6.1 |
| intergenic | Q1113R EG.6.1 |
| S | Q1113R EG.6.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | C1236F EG.6.1 |
| intergenic | F1256F EG.6.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | S74S EG.10.1,EG.6.1 |
| intergenic | V80I EG.6.1 |
| intergenic | V97I BF.26,EG.6.1 |
| intergenic | I123T EG.6.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | P262S EG.6.1 |
| intergenic | S6S EG.6.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | R146H DV.7.1,EG.6.1 |
| intergenic | L149L EG.6.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | Y49H EG.6.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1 |
| intergenic | T39I EG.6.1 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9,BA.5.2.20,BQ.1.13,CK.2,EG.6.1 |
| intergenic | I103fs EG.6.1 |
| intergenic | E3X EG.6.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | W29R EG.6.1 |
| intergenic | g.C-1T EU.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | P30P EG.6.1 |
| intergenic | C37R BF.9,EG.6.1 |
| intergenic | V62L BF.41,BA.5.5,EG.5.1,EG.6.1 |
| intergenic | G66V EG.6.1 |
| intergenic | Y73Y EG.6.1 |
| intergenic | I88_N89insRAG EG.6.1 |
| intergenic | C90Y BE.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | E110X EG.6.1 |
| intergenic | FI120VL BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BQ.1.13,EG.6.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | P6P EG.6.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | N192N BA.5.1.10,BA.4,BF.10,EG.6.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | G238C EG.6.1 |
| intergenic | S327S BQ.1.1.8,EG.6.1 |
| intergenic | L331L EG.6.1 |
| N | K372K EG.6.1 |
| intergenic | V392V EG.6.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1 |
| intergenic | g.C-3T BA.5.2.2,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | g.G29711T EG.5.1.8,EG.6.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | L27L BA.5.1.24,FL.1.5.2,FL.10.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | R119L FL.10.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | L140L CH.1.1.28,BQ.1.13,BA.5.5,FL.10.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | D147D FL.10.1 |
| intergenic | I222V BA.5.1.1,FL.10.1 |
| intergenic | R244R FL.10.1 |
| intergenic | L320F FL.10.1 |
| intergenic | G345S FL.10.1 |
| intergenic | N348N FL.10.1 |
| intergenic | Y387Y FL.10.1 |
| intergenic | P626H FL.10.1 |
| intergenic | C657Y BA.5.2.20,FL.10.1 |
| intergenic | L763L FL.10.1 |
| intergenic | N810N BA.5.2.20,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | Y906Y BF.10,FL.10.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | V1025V BQ.1.1.8,EG.5.1,FL.10.1 |
| intergenic | G1073R BA.5.2.34,FL.10.1 |
| intergenic | P1213L BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,FL.10.1 |
| intergenic | A1268A FL.10.1 |
| intergenic | D1273D BA.5,BQ.1.1.8,BA.5.5,FL.10.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | D1323D BA.5.1.24,FL.10.1 |
| intergenic | Y1337Y BA.5,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BQ.1.2.3,FL.10.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | Y1646Y FL.10.1 |
| intergenic | N1651N FL.10.1 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | F1925F BA.5.2.2,BF.28,BE.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,FL.10.1 |
| intergenic | P2195P FL.10.1 |
| intergenic | I2231V FL.10.1 |
| intergenic | S2246L DV.7.1.2,FL.10.1 |
| intergenic | A2248A FL.10.1 |
| intergenic | A2325A BA.5.1.1,FL.10.1 |
| intergenic | I2385I BA.4,DV.7.1,FL.10.1 |
| intergenic | V2421V BA.4,BF.10,BA.5.5,FL.10.1 |
| intergenic | N2526N FL.10.1 |
| intergenic | T2532A FL.10.1 |
| intergenic | A2584V BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,EG.7,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | A2701V FL.10.1 |
| intergenic | Y2809Y EG.7,FL.10.1 |
| intergenic | A2891V DV.7.1.2,FL.10.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | L3238L BA.5.2.20,BF.26,BQ.1.13,BA.4.6,FL.10.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | A3333T BA.4.1,FL.10.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | L3430L FL.10.1 |
| intergenic | R3542C BA.5.2.20,BA.5.5,FL.10.1 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | V3708V BA.5.1.1,FL.10.1 |
| intergenic | S3874A FL.10.1 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1 |
| intergenic | A3960A BA.4,FL.10.1 |
| ORF1a | T4035I / NSP8 |
| intergenic | T4035I FL.10.1 |
| intergenic | T4083M BA.5.1.1,BA.5.1.2,FL.1.5,FL.10.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | S4186S FL.10.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | V4260M FL.10.1 |
| intergenic | A4285V FL.10.1 |
| intergenic | P4360P FL.10.1 |
| intergenic | E4388K FL.10.1 |
| intergenic | N4605N FL.10.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | T4785T FL.10.1 |
| intergenic | Y4847Y BA.4,FL.10.1 |
| intergenic | A4946A FL.10.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | S5176S FL.10.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | H5274Y FL.10.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | R5502R FL.10.1 |
| intergenic | L5551L EG.7,FL.14,FL.10.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | Y5745Y FL.10.1 |
| intergenic | V5819V BA.5.2.3,BA.5.1.2,FL.10.1 |
| intergenic | K5848K FL.2.3,FL.10.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | H5951Y DV.7.1,EG.5.1.3,FL.10.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | D6097D BA.2.12,BA.5.2.20,BA.5.5,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.10.1 |
| intergenic | M6120T FL.10.1 |
| intergenic | T6144T FL.10.1 |
| intergenic | H6208H BA.5.5,FL.10.1 |
| intergenic | L6331L FL.10.1 |
| intergenic | Y6345Y FL.10.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | R6417R FL.10.1 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3,EG.5.1,FL.10.1 |
| intergenic | I6427T FL.10.1 |
| intergenic | K6512N FL.10.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | G6621E FL.10.1 |
| intergenic | A6832V BA.5,EG.5.1,FL.10.1 |
| intergenic | D6912D BA.1.15,FL.10.1 |
| intergenic | G7011N BA.5.1.1,BA.4.6,FL.10.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | S45S FL.10.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1 |
| intergenic | F175L FL.10.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | A344V FL.10.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | G413G DV.7.1.2,FL.10.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | K529N FL.10.1 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1,FL.10.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | L629L BA.5.1.24,BF.9,BA.5.5,FL.10.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | N679K FL.10.1 |
| intergenic | TN678IK FL.10.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | S691S FL.10.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | Q853K FL.10.1 |
| intergenic | A879V BA.5.2.34,FL.10.1 |
| intergenic | A892V FK.1.1,FL.10.1 |
| intergenic | A930A BA.1.14,FL.10.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | L966L FL.10.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | T1006A FL.10.1 |
| intergenic | R1107M EG.7,FL.10.1 |
| S | R1107M FL.10.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | G1219C BA.5.2.2,FL.10.1 |
| intergenic | g.T-2C FL.10.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | Y154Y BA.5.5,FL.10.1 |
| intergenic | Q213K BA.2.12,EG.5.1.3,FL.10.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | M260T FL.10.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | N41N BF.9,BA.5.5,FL.10.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | A104A FL.10.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | L120L FL.10.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | I32I BA.5.5,FL.10.1 |
| intergenic | E46E FL.10.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | T11A FL.10.1 |
| intergenic | T28T FL.10.1 |
| intergenic | V29L FL.10.1 |
| intergenic | R78G FL.10.1 |
| intergenic | F9F FL.10.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | H37Y CH.1.1.28,FL.10.1 |
| intergenic | H42H FL.10.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | P30P EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | S67F BA.5.1.10,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.5,EG.5.1,FL.10.1 |
| intergenic | V116A FL.10.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | P13F BA.5.1.10,BF.10,EU.1.1,FL.10.1 |
| intergenic | P13L BA.5.1.10,EU.1.1,FL.10.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | S197T FL.10.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | G275G FL.10.1 |
| intergenic | G287G FL.10.1 |
| intergenic | D288N FL.10.1 |
| intergenic | T296I BA.2.12,FL.10.1 |
| intergenic | S327S BQ.1.1.8,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | K361I FL.10.1 |
| intergenic | P364L FL.14,FL.10.1 |
| intergenic | S413H FL.10.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | A8V FL.10.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1 |
| intergenic | g.C-168T FD.1.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | P6S FD.1.1 |
| intergenic | L16F FD.1.1 |
| intergenic | V35V BF.9,DV.7.1.2,FD.1.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | P80L FD.1.1 |
| intergenic | G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,FD.1.1 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BA.4.6,FD.1.1 |
| intergenic | R99C BA.4.1.8,FD.1.1 |
| intergenic | L107L FD.1.1 |
| intergenic | A131V FD.1.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | G146G FD.1.1 |
| intergenic | Y182Y BA.5.2.20,FD.1.1 |
| ORF1a | R226M / NSP2 |
| intergenic | R226M FD.1.1 |
| intergenic | I281V FD.1.1 |
| intergenic | R550H FD.1.1 |
| intergenic | S558F FD.1.1 |
| ORF1a | V559L / NSP2 |
| intergenic | V559L FD.1.1 |
| intergenic | L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.6.1,FD.1.1 |
| intergenic | W630R FD.1.1 |
| intergenic | T814I FD.1.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | Y955Y FD.1.1 |
| intergenic | N997N FD.1.1 |
| intergenic | Y1183Y FD.1.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.30,FL.1.5,EG.7,FD.1.1 |
| intergenic | A1473V EG.5.1,EU.1.1,FD.1.1 |
| ORF1a | K1512R / NSP3 |
| intergenic | K1512R FD.1.1 |
| intergenic | T1543I BF.9,EG.7,FD.1.1 |
| intergenic | N1576N FD.1.1 |
| intergenic | T1589I FL.1.5.2,FD.1.1 |
| intergenic | I1607T FD.1.1 |
| intergenic | T1665I FD.1.1 |
| intergenic | N1673N BA.5.1.10,BA.4,BE.1.1,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,FD.1.1 |
| intergenic | Y1700Y BA.4.1,BQ.1.1.8,EG.6.1,FD.1.1 |
| ORF1a | A1716V / NSP3 |
| intergenic | A1716V FD.1.1 |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10,BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1 |
| intergenic | P1810S FD.1.1 |
| intergenic | P1977L BA.5.2.20,FD.1.1 |
| intergenic | S2015S BA.2.86.1,BA.2.12,EG.5.1.3,FD.1.1 |
| intergenic | H2092Y BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1 |
| intergenic | S2114F BA.5.1.30,FD.1.1 |
| intergenic | V2130I FD.1.1 |
| intergenic | L2250L FD.1.1 |
| intergenic | L2253L FD.1.1 |
| intergenic | N2275D FD.1.1 |
| intergenic | T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15,EG.5.1.4,FL.2.3,FD.1.1 |
| intergenic | I2286M FD.1.1 |
| intergenic | S2293G FD.1.1 |
| intergenic | S2303F BA.5.1.30,FD.1.1 |
| intergenic | L2318L FD.1.1 |
| intergenic | A2470A BA.5.1.24,FD.1.1 |
| intergenic | T2495I EG.5.1.8,FL.1.5,EG.5.1.4,FD.1.1 |
| intergenic | D2544D FD.1.1 |
| intergenic | P2568S FD.1.1 |
| ORF1a | L2773L / NSP4 |
| intergenic | L2773L FD.1.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | H3076Y FD.1.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | T3202T FD.1.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | I3257I FD.1.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | L3313L FD.1.1 |
| intergenic | L3338L BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1 |
| intergenic | D3355D FD.1.1 |
| intergenic | T3374T BA.5.1.10,FD.1.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | A3473A FD.1.1 |
| intergenic | A3523A EG.5.1.4,FD.1.1 |
| intergenic | A3615V BA.5.1.2,BF.26,BA.5.5,EG.5.1.8,FD.1.1 |
| ORF1a | M3661T / NSP6 |
| intergenic | M3661T FD.1.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | Y3744Y BA.5.1.24,BA.4.6,FD.1.1 |
| intergenic | F3769F BA.5.1.30,BF.26,FD.1.1 |
| intergenic | F3770F BA.5.5,FD.1.1 |
| intergenic | F3785F BF.9,EG.5.1.4,FD.1.1 |
| intergenic | R3802C FD.1.1 |
| intergenic | L3829L BA.5.2.3,EG.5.1.4,FD.1.1 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | A3967A FD.1.1 |
| intergenic | D4020D BA.5.1.2,EG.5.1,FD.1.1 |
| intergenic | S4027S FD.1.1 |
| intergenic | T4031I FD.1.1 |
| intergenic | T4159I CK.2,FD.1.1 |
| intergenic | T4174I BA.1.14,BE.1.1,FD.1.1 |
| intergenic | K4192K FD.1.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| ORF1a | V4225V / NSP9 |
| intergenic | V4225V FD.1.1 |
| intergenic | L4237L DV.7.1,EG.5.1.8,FD.1.1 |
| intergenic | A4408V FD.1.1 |
| ORF1b | V4520V / NSP12 |
| intergenic | V4520V FD.1.1 |
| ORF1b | N4550N / NSP12 |
| intergenic | N4550N FD.1.1 |
| intergenic | N4605N FL.10.1,FD.1.1 |
| ORF1b | Q4684E / NSP12 |
| intergenic | Q4684E FD.1.1 |
| intergenic | Y4686Y BA.4.1.8,DV.7.1.2,EG.5.1.4,FD.1.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | V4745I FD.1.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EU.1.1,FD.1.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | G5231G FD.1.1 |
| intergenic | G5233G FL.1.5.2,FD.1.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| ORF1b | P5499P / NSP13 |
| intergenic | P5499P FD.1.1 |
| intergenic | L5551L FD.1.1 |
| intergenic | E5585G FD.1.1 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | F5746F BA.2.12,BA.5.2.3,FD.1.1 |
| ORF1b | G5763V / NSP13 |
| intergenic | G5763V FD.1.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | L5905F EG.5.1.4,FD.1.1 |
| intergenic | T5956I BA.5.2.2,BA.5,FD.1.1 |
| intergenic | I5967V EG.5.1.4,FL.14,FD.1.1 |
| intergenic | IP5967VL FD.1.1 |
| intergenic | E6024E BA.5.2.20,FD.1.1 |
| intergenic | R6137I FD.1.1 |
| intergenic | S6180I FL.2.3,FD.1.1 |
| intergenic | H6208Y FD.1.1 |
| intergenic | V6241I EG.5.1,FD.1.1 |
| ORF1b | N6259N / NSP14 |
| intergenic | N6259N FD.1.1 |
| intergenic | L6308L BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.1.5,FD.1.1 |
| intergenic | DRYP6315EGCH BA.2.12,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.26,BA.4.6,FD.1.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | G6406S FD.1.1 |
| intergenic | T6485I BA.5.2.20,EG.5.1.4,FD.1.1 |
| ORF1b | T6500T / NSP15 |
| intergenic | T6500T FD.1.1 |
| intergenic | Y6540Y BQ.1.13,BF.10,FD.1.1 |
| intergenic | A6544V FD.1.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| ORF1b | F6868F / NSP16 |
| intergenic | F6868F FD.1.1 |
| intergenic | L7042L BA.5.1.24,FD.1.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1 |
| intergenic | T19I BA.5.2.2,BA.5.1.2,EG.5.1.3,EG.5.1,FD.1.1 |
| intergenic | T19L BA.5.2.2,BA.5.1.2,EG.5.1.3,EG.5.1,FD.1.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | I68T FD.1.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | S98F BA.5.1.10,FL.1.5,FD.1.1 |
| intergenic | R102G FD.1.1 |
| S | R102G FD.1.1 |
| intergenic | S116S EG.5.1,EU.1.1,FD.1.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1 |
| intergenic | D178N BA.5.1.2,FD.1.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | VR213EH FD.1.1 |
| S | VR213EH FD.1.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | N343N EG.5.1.9,EG.7,FD.1.1 |
| intergenic | R346T FD.1.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | I410I BQ.1.1.8,BF.26,FD.1.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | A570V BA.2.86.1,FD.1.1 |
| intergenic | T572I FD.1.1 |
| intergenic | E583Q FD.1.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | P812L DV.7.1,FD.1.1 |
| intergenic | S940S FD.1.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | A1020V FD.1.1 |
| intergenic | D1041D FD.1.1 |
| intergenic | Y1110Y FD.1.1 |
| intergenic | 1148 FD.1.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | K1149K FD.1.1 |
| intergenic | D1153Y BA.5,FD.1.1 |
| intergenic | S1196S FD.1.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | I20I BA.1.17,BA.5.1.24,BF.26,FD.1.1 |
| intergenic | F43F BA.2.12,BA.5.2.20,FD.1.1 |
| intergenic | I62T FD.1.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | A72T DV.7.1,DV.7.1.2,FD.1.1 |
| intergenic | T89I BF.26,EG.5.1.8,FL.1.5,EG.5.1.4,FD.1.1 |
| intergenic | P104L BA.5.2.3,FD.1.1 |
| intergenic | A143A FD.1.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | G254R FD.1.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | T30T BF.28,FD.1.1 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10,BF.20,BA.5.1.2,FK.1.1,FD.1.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | A69S FD.1.1 |
| M | A69S FD.1.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | H155H FD.1.1 |
| intergenic | I161I BA.5.2.3,BF.10,FD.1.1 |
| intergenic | T208I FL.1.5.2,FD.1.1 |
| intergenic | L16L BA.5.1.1,BA.5.1.2,FK.1.1,FD.1.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | M1? FD.1.1 |
| intergenic | L12F FD.1.1 |
| intergenic | T28I BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,FD.1.1 |
| intergenic | G38V BF.28,FD.1.1 |
| intergenic | Q62_F63delinsH FD.1.1 |
| intergenic | S60_V74del FD.1.1 |
| ORF7a | S60_V74del FD.1.1 |
| intergenic | Q94N FD.1.1 |
| ORF7a | Q94N FD.1.1 |
| intergenic | P99L BA.5.1.30,FD.1.1 |
| intergenic | E3X FD.1.1 |
| intergenic | X122SextX? FD.1.1 |
| ORF7b | g.GATTG-136_-132CATTT FD.1.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | g.A-6T FD.1.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | V32A FD.1.1 |
| intergenic | P85S FD.1.1 |
| intergenic | C102R EG.5.1.3,FD.1.1 |
| ORF8 | C102R FD.1.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | R40R FD.1.1 |
| intergenic | T49I BA.5,BA.5.1.30,BF.10,FD.1.1 |
| intergenic | S190G FD.1.1 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1 |
| intergenic | RGT203KRI FD.1.1 |
| intergenic | Q240Q FD.1.1 |
| N | Q240Q FD.1.1 |
| intergenic | A254A FD.1.1 |
| intergenic | D377D FD.1.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13,FD.1.1 |
| intergenic | g.G29690T FD.1.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1 |
| intergenic | g.G-56T BA.5.6 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | M85V BA.5.6 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | E87D BA.5.6 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | P305L BA.5.6 |
| intergenic | P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.6 |
| intergenic | R402R BA.5.2.34,DV.7.1,BF.10,BA.5.6 |
| intergenic | I431M BA.5.6 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6 |
| intergenic | D629G BA.5.6 |
| intergenic | A656V BA.1.14,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.13,BA.5.6 |
| intergenic | C667S EG.5.1,BA.5.6 |
| intergenic | L729L BA.5.6 |
| intergenic | K734N BA.5.6 |
| intergenic | P748P BA.5.2.20,BA.5.6 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | T861I BA.5.6 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | D928D EG.5.1,BA.5.6 |
| intergenic | G934S BA.5.6 |
| intergenic | V1085V BA.5.6 |
| ORF1a | G1155G / NSP3 |
| intergenic | G1155G BA.5.6 |
| intergenic | Y1174Y BA.5.2.34,EG.5.1.4,FK.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | D1184D BE.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | T1240I BA.5.6 |
| ORF1a | Y1285Y / NSP3 |
| intergenic | Y1285Y BA.5.6 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | P1321P BA.5.6 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | D1547D BA.5.6 |
| ORF1a | L1621L / NSP3 |
| intergenic | L1621L BA.5.6 |
| intergenic | Y1675Y BA.5.5,BA.5.6 |
| intergenic | E1724E BA.5.6 |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10,BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | I1935I BA.5.2.20,BA.5.6 |
| intergenic | N1999N BA.5.6 |
| intergenic | V2047V BA.5.6 |
| ORF1a | K2200K / NSP3 |
| intergenic | K2200K BA.5.6 |
| ORF1a | R2336R / NSP3 |
| intergenic | R2336R BA.5.6 |
| intergenic | S2433S BA.5.6 |
| intergenic | S2500F BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | L2527L BA.5.6 |
| intergenic | P2568S FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | I2873M BA.5.6 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | G3219G BA.5.6 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | T3308T BA.5.6 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | N3414N BF.28,BE.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | D3450D BA.5.6 |
| intergenic | L3535L BA.2.12,BA.5.1.24,BF.28,BA.5.6 |
| intergenic | L3588F BA.5.6 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6 |
| intergenic | L3636L BA.5.1.24,BA.4.1,BA.5.5,BA.5.6 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| ORF1a | V3747L / NSP6 |
| intergenic | V3747L BA.5.6 |
| intergenic | F3769F BA.5.1.30,BF.26,FD.1.1,BA.5.6 |
| ORF1a | L3872L / NSP7 |
| intergenic | L3872L BA.5.6 |
| intergenic | N3937N BA.5,EG.5.2.1,EG.5.1,BA.5.6 |
| intergenic | P3952S BA.5.6 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BA.4.6,EG.5.1.3,BA.5.6 |
| intergenic | P4120S BA.5.6 |
| intergenic | S4145S BA.5.6 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | A4285T BQ.1.2.3,BA.5.6 |
| intergenic | N4338N BA.5.6 |
| ORF1b | R4508R / NSP12 |
| intergenic | R4508R BA.5.6 |
| intergenic | D4532D BF.28,BF.26,BA.5.6 |
| intergenic | N4560N BA.5,BA.5.6 |
| ORF1b | R4575R / NSP12 |
| intergenic | R4575R BA.5.6 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | V4746V BA.5.6 |
| intergenic | N4752N BA.5.6 |
| intergenic | V4887V BA.5.1.24,BA.5.6 |
| ORF1b | K4903K / NSP12 |
| intergenic | K4903K BA.5.6 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20,BA.1.15,BA.5.5,BA.5.6 |
| intergenic | V5067V BA.5.6 |
| intergenic | D5132D BA.5.6 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | S5160S BE.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | V5478A BA.5.6 |
| intergenic | H5488Y BF.26,EG.5.1,BA.5.6 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | Y5601Y BA.5.6 |
| ORF1b | C5682C / NSP13 |
| intergenic | C5682C BA.5.6 |
| intergenic | A5713V BF.9,BA.5.6 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | N5843N BA.5.6 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6 |
| intergenic | R6060R BA.5.6 |
| intergenic | D6097D BA.2.12,BA.5.2.20,BA.5.5,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.10.1,BA.5.6 |
| intergenic | Y6160Y BF.28,FL.1.5,BA.5.6 |
| intergenic | N6231N BA.5.6 |
| intergenic | M6240I BA.5.6 |
| intergenic | N6259N FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | G6598S BA.5,BA.5.6 |
| ORF1b | E6643D / NSP15 |
| intergenic | E6643D BA.5.6 |
| intergenic | P6657S BA.5.2.20,BA.5.6 |
| intergenic | D6724D BA.4.1,BA.5.6 |
| intergenic | Y6845Y BA.5.1.10,BA.5.6 |
| intergenic | T6938I BA.2.12,BA.5,BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.5.6 |
| intergenic | R7014N BQ.1.1.8,BQ.1.2.3,BA.5.6 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6 |
| intergenic | S112L BA.5.6 |
| intergenic | L117L BA.5.6 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6 |
| intergenic | E156D BA.5.6 |
| S | E156D BA.5.6 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,FK.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | S247N BA.5.6 |
| intergenic | S316S BA.5.6 |
| S | S316S BA.5.6 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6 |
| intergenic | R346S BA.4,BA.5.2.3,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.5.6 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,FK.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | Y505H BA.5.6 |
| intergenic | F541F EG.7,BA.5.6 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | E619K BQ.1.2.3,BA.5.6 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | I7I CK.2,BA.5.6 |
| intergenic | G11_L15del BA.5.6 |
| ORF3a | G11_L15del BA.5.6 |
| intergenic | I20T BE.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | L71L BA.5,BQ.1.13,BA.5.6 |
| intergenic | L73F BF.9,BA.5.6 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | V225V BA.5.6 |
| ORF3a | V225V BA.5.6 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | A68A BA.5.6 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | N113N BA.5.6 |
| intergenic | N117N BQ.1.13,BA.5.5,EG.5.1.3,BA.5.6 |
| intergenic | S211S BA.5.6 |
| intergenic | L4L BA.5.2.3,EG.7,BA.5.6 |
| intergenic | Y31Y BA.5.1.24,BA.5,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BA.5.6 |
| intergenic | C35C BA.5.6 |
| intergenic | H73Y BA.5.1.24,BA.5.2.8,BE.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | S83L BA.5.6 |
| intergenic | E121V BA.5.6 |
| ORF7a | E121V BA.5.6 |
| intergenic | L14fs CH.1.1.28,BA.5.6 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6 |
| intergenic | G50V BA.5.6 |
| intergenic | V62L BF.41,BA.5.5,EG.5.1,EG.6.1,BA.5.6 |
| intergenic | C83F BA.5.6 |
| intergenic | FI120VL BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BQ.1.13,EG.6.1,BA.5.6 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | S37S BA.5.6 |
| intergenic | R88R BA.5.6 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1,BA.5.6 |
| intergenic | T135I BA.5.6 |
| intergenic | P142S BA.4,BA.5.6 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1,BF.26,EG.5.1,BA.5.6 |
| intergenic | Y333Y BA.4,BF.26,BA.4.6,BA.5.6 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | g.C-23T BA.5.6 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13,FD.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | A28V BA.2.12,BA.5.6 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1,EU.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | N1094S FL.20.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | T1788M BA.4.6,FL.20.2 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2 |
| intergenic | I2010V FL.20.2 |
| intergenic | S2255P FL.20.2 |
| intergenic | A2379V BA.4.1.8,EG.5.1.8,FL.20.2 |
| intergenic | S2500F BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | D3042D FL.20.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | A3523A EG.5.1.4,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | A3956S FL.20.2 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | F4584F CH.1.1.28,BA.5.5,FL.20.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20,BA.1.15,BA.5.5,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | A5727A DV.7.1,FL.20.2 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | L6102L BA.4.1,BA.4.6,EG.6.1,FL.20.2 |
| intergenic | T6131T BA.2.12,DV.7.1,EG.5.1.8,FK.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | N6497N FL.20.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | A6858S FL.20.2 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | Q173Q EG.5.2.1,FL.20.2 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | L452M FL.20.2 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | V29I BA.2.12,FL.20.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | A72T DV.7.1,DV.7.1.2,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | S74F BA.4,DV.7.1.2,BF.10,FL.1.5,FL.20.2 |
| intergenic | L108F BA.4,FL.20.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | V256del BA.5.2.2,BA.5.1.30,EG.5.1.3,FL.20.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | S81L EG.5.1,FL.20.2 |
| intergenic | F101_I103del FL.20.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | F19F FL.20.2 |
| intergenic | Q35X EU.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | L56L BA.4.1,BA.5.1.30,FL.20.2 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | T282T BA.1.17,FL.20.2 |
| intergenic | F315F BA.5.1.1,BA.5.1.30,FL.20.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | g.T-17C GA.4.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | I280V GA.4.1 |
| intergenic | L469F BQ.1.2.3,GA.4.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | N1059N BA.4.1,BQ.1.13,BA.5.5,GA.4.1 |
| intergenic | N1080D GA.4.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | H1610Y GA.4.1 |
| intergenic | Y1675Y BA.5.5,BA.5.6,GA.4.1 |
| intergenic | T1760I BA.5.1.2,GA.4.1 |
| intergenic | N1995N BA.2.12,BF.28,GA.4.1 |
| intergenic | T2007T BA.5,BQ.1.1.8,GA.4.1 |
| intergenic | S2553F GA.4.1 |
| intergenic | L2721L GA.4.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | L3352F GA.4.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | A3730A BA.2.12,EG.6.1,GA.4.1 |
| intergenic | P3767L GA.4.1 |
| intergenic | I3779T GA.4.1 |
| intergenic | I4049V GA.4.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | N4704N GA.4.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | T5131I BA.4.1,BF.28,BA.4.6,GA.4.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | V6637I GA.4.1 |
| intergenic | V6688I GA.4.1 |
| intergenic | A6986S GA.4.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | Q115Q GA.4.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | D215H BA.5.1.1,GA.4.1 |
| intergenic | H245Y GA.4.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | K356T BA.2.86.1,GA.4.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | E661D GA.4.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4,GA.4.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | V1228L FL.2.3,GA.4.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | D53D GA.4.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | A106A GA.4.1 |
| intergenic | C12C GA.4.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | D34D GA.4.1 |
| intergenic | K94E GA.4.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | S193I DV.7.1.2,GA.4.1 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1 |
| intergenic | A208V GA.4.1 |
| intergenic | L230L GA.4.1 |
| intergenic | A251V BQ.1.13,GA.4.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | G180G FL.15.1.1 |
| intergenic | G400V FL.15.1.1 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6,FL.15.1.1 |
| intergenic | A516G FL.15.1.1 |
| intergenic | Q575H FL.15.1.1 |
| intergenic | E637K FL.15.1.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | V1391V FL.15.1.1 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1 |
| intergenic | T2007I FL.15.1.1 |
| intergenic | L2039F FL.15.1.1 |
| intergenic | S2185N FL.15.1.1 |
| intergenic | T2910T FL.15.1.1 |
| intergenic | P2929S FL.15.1.1 |
| intergenic | S2981S EG.10.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | D3009D FL.15.1.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5,EG.6.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | T3506I FL.15.1.1 |
| intergenic | T3555A FL.15.1.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | L4209L FL.15.1.1 |
| intergenic | Y4424Y FL.1.5,FL.14,FL.15.1.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | D5216S FL.15.1.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | D6069D BA.2.12,BA.4.1,EG.6.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | G6406S FD.1.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | Q6627H FL.15.1.1 |
| intergenic | V6638I FL.15.1.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | S116S EG.5.1,EU.1.1,FD.1.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | G252V FL.15.1.1 |
| intergenic | PG251HV FL.15.1.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | A475V FL.15.1.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | E484V BA.5.2.3,FL.15.1.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | E583K FL.15.1.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | N709N FL.15.1.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | T176I BA.1.17,BF.26,FL.15.1.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | R191R FK.1.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | g.T-121C EG.5.1.6 |
| intergenic | g.C-104T BA.5,EG.10.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | G82_H83del BA.5.1.24,EG.5.1.6 |
| intergenic | E87D BA.5.6,EG.5.1.6 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | S166G BA.5.1.2,BA.4.1,BA.4.6,EG.5.1.6 |
| intergenic | L204L BF.41,EG.5.1.6 |
| intergenic | D220D BA.5.1.24,BA.4.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | P309S EG.5.1.6 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | Q556R EG.5.1.6 |
| intergenic | L642F BA.4.1,BA.5.5,EG.5.1.6 |
| intergenic | I659I EG.5.1.6 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | T829I EG.5.1.6 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6 |
| intergenic | Y955Y FD.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | L1034F EG.5.1.6 |
| intergenic | L1130F EG.5.1.8,EG.5.1.6 |
| intergenic | D1273D BA.5,BQ.1.1.8,BA.5.5,FL.10.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | N1324T EG.5.1.6 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | N1578N EG.5.1.6 |
| intergenic | A1679V EG.5.1.6 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | S1857L EG.5.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | I1935I BA.5.2.20,BA.5.6,EG.5.1.6 |
| intergenic | E1954D EG.5.1.6 |
| intergenic | P2046S BA.1.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | V2047F EG.7,EG.5.1.6 |
| intergenic | A2139A EG.5.1.6 |
| intergenic | W2232C EG.5.1.6 |
| ORF1a | L2250L / NSP3 |
| intergenic | L2250L EG.5.1.6 |
| intergenic | G2265D EG.5.1.6 |
| intergenic | S2273P EG.5.1.6 |
| intergenic | P2483L EG.5.1.6 |
| intergenic | I2490I BA.5.5,EG.5.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | S2493I EG.5.1.6 |
| intergenic | S2625S BA.4,BA.5.2.3,BA.4.6,EG.5.1.6 |
| intergenic | S2635S EG.5.1.6 |
| ORF1a | E2653K / NSP3 |
| intergenic | S2797F BA.1.17,BF.26,EG.5.1.6 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | L3041F EG.5.1.6 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | Y3226Y BE.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.4.6,EG.5.1.6 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | Y3701Y EG.5.1.6 |
| intergenic | S3742S BA.5.2.34,EG.5.1.6 |
| intergenic | F3770F BA.5.5,FD.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | M3862I EG.5.1.6 |
| intergenic | S3885T EG.5.1.6 |
| intergenic | S4093S EG.6.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | D4190G EG.5.1.6 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | R4214R EG.5.1.6 |
| intergenic | T4265I EG.5.1.6 |
| intergenic | D4335Y EG.5.1.6 |
| intergenic | V4372V BA.5.2.8,BF.26,EG.5.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | G4620S EG.5.1.6 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | V4765V EG.5.1.6 |
| intergenic | V4865F EG.5.1.6 |
| intergenic | V4885V EG.5.1.6 |
| intergenic | E5002D EG.5.1.6 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | Y5276Y BF.9,EG.5.1.6 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | P5371P BA.1.17,EG.5.2.1,EG.5.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | K5738R EG.5.1.6 |
| intergenic | G5739S EG.5.1.6 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | L5905F EG.5.1.4,FD.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | L5952F EG.5.1.6 |
| intergenic | V5954V EG.5.1.6 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | T5975T EG.5.1.6 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6 |
| ORF1b | V6124M / NSP14 |
| intergenic | Q6187Q EG.5.1.6 |
| intergenic | K6236N BA.1.15,EG.5.1.6 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | A6832V BA.5,EG.5.1,FL.10.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | G6953G BA.4.1.8,BA.5,EG.5.1.6 |
| intergenic | L10L FL.1.5.2,EG.5.1.6 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | T22I BF.26,EG.5.1.6 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6 |
| intergenic | V70V EG.5.1.6 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6 |
| intergenic | G142_Y144delinsDF EG.5.1.6 |
| S | G142_Y144delinsDF EG.5.1.6 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | N211I EG.5.1.6 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | H245Y GA.4.1,EG.5.1.6 |
| S | R246G EG.5.1.6 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | T333T BF.26,EG.5.1.6 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | S494P EG.10.1,EG.5.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | N606N DV.7.1.2,EG.5.1.6 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | P715P BA.5.2.20,FL.1.5.2,EG.5.1.6 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | A783A EG.5.1.6 |
| S | A783A EG.5.1.6 |
| intergenic | E819E DV.7.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | S937S DV.7.1.2,EG.5.1.6 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | S1051S EG.5.1.6 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | D1165G EG.5.1.6 |
| intergenic | X1274X EG.5.1.6 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | A23S BA.5,EG.5.1.6 |
| intergenic | F56L EG.5.1.6 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | S74S EG.10.1,EG.6.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | V112F EG.5.1.6 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | F230F EG.5.1.6 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | P132P BA.5.2.8,EG.5.1.6 |
| intergenic | S213S EG.5.1.3,EG.5.1.6 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | 40 EG.5.1.6 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | D69D BA.1.14,BA.5.2.8,EG.5.1.6 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | g.C-1T EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | H17Y BA.5.2.20,EG.10.1,FL.1.5,EG.5.1.6 |
| intergenic | E110X EG.6.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | R115C EU.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | D103Y EG.5.1.6 |
| intergenic | A138A EG.5.1.6 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | G243C EG.5.1.6 |
| intergenic | G287G FL.10.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | I351V EG.5.1.6 |
| intergenic | P383L EG.5.1.6 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | g.G29825A EG.5.1.6 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | R232H BF.10,EG.10.1,FL.8 |
| intergenic | P309S EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | A372V BQ.1.2.3,FL.8 |
| intergenic | G392G FL.14,FL.8 |
| intergenic | A498T FL.8 |
| intergenic | Y799Y FL.8 |
| intergenic | L815L EG.5.1,FL.8 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | I1045V FL.8 |
| intergenic | K1051K FL.8 |
| intergenic | M1193V FL.8 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | T1542I FL.8 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | S2024L BA.5.2.2,FL.8 |
| intergenic | V2090F FL.8 |
| ORF1a | M2380V / NSP3 |
| intergenic | M2380V FL.8 |
| intergenic | V2577A FL.8 |
| ORF1a | T2597T / NSP3 |
| intergenic | T2597T FL.8 |
| intergenic | V2857V BA.5.5,FL.8 |
| intergenic | F2884F BF.28,BA.5.5,FL.8 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | D3508D FL.1.5,FL.8 |
| intergenic | T3555A FL.15.1.1,FL.8 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | M3712V FL.8 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8 |
| intergenic | V4073V FL.8 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | L4252L BQ.1.1.8,FL.8 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| ORF1b | A4775A / NSP12 |
| intergenic | A4775A FL.8 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.2,BF.26,EG.5.1.8,EG.5.1,FL.8 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | A5616A FL.8 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| ORF1b | N6041D / NSP14 |
| intergenic | N6041D FL.8 |
| intergenic | N6333N FL.8 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | F55F BF.9,BF.28,BF.26,EG.5.1,FL.8 |
| intergenic | A67S FL.8 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8 |
| intergenic | M177I BA.1.17,FL.8 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | L368I FL.8 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | V610V FL.8 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | I670I FL.8 |
| S | I670I FL.8 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | D1084Y FL.8 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | M1237I BF.26,FL.8 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | I62F FL.8 |
| ORF3a | I62F FL.8 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | T175T FL.2.3,FL.8 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | T24I BA.5.2.34,BF.9,FL.8 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | P46S FL.8 |
| intergenic | N126K FL.8 |
| N | N126K FL.8 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | T379N FL.8 |
| N | T379N FL.8 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8 |
| intergenic | g.C29708T BA.5.2.20,FL.8 |
| intergenic | g.C-119T BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.2.3,FL.15 |
| intergenic | g.G-68T FL.15 |
| intergenic | g.C-63T BA.5.1.10,BA.4,EG.10.1,FL.1.5,EG.6.1,FL.15 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | g.C-12T FL.15 |
| intergenic | H45Y BA.4,FL.15 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | P62S FL.15 |
| intergenic | L122L FL.15 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | K210K BA.4,FL.15 |
| intergenic | G268G EG.5.1,FL.15 |
| intergenic | H388Y BA.1.14,EG.5.1.9,EU.1.1,FL.15 |
| intergenic | G400S EG.5.1.4,FL.15 |
| ORF1a | G400V / NSP2 |
| intergenic | G400V FL.15.1.1,FL.15 |
| intergenic | R402R BA.5.2.34,DV.7.1,BF.10,BA.5.6,FL.15 |
| intergenic | H417Y EG.5.1,FL.15 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15 |
| intergenic | A537A FL.15 |
| intergenic | L580L BA.5.1.24,BA.4.6,FL.15 |
| intergenic | A599T FL.15 |
| intergenic | A599A BA.5.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,FK.1.1,FL.15 |
| intergenic | S610L FL.15 |
| intergenic | E637K FL.15.1.1,FL.15 |
| intergenic | K669E FL.15 |
| intergenic | C720Y FL.15 |
| intergenic | S723S DV.7.1,FL.15 |
| intergenic | L730F FL.15 |
| ORF1a | E775G / NSP2 |
| intergenic | E775G FL.15 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | D1044D DV.7.1,FL.15 |
| intergenic | P1096L FL.15 |
| intergenic | V1104I FL.15 |
| intergenic | S1188L FL.15 |
| intergenic | I1276I FL.15 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | A1397A BA.2.12,BA.5,DV.7.1,BA.5.5,FL.15 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.30,FL.1.5,EG.7,FD.1.1,FL.15 |
| intergenic | D1554D BF.10,FL.15 |
| intergenic | F1632F FL.15 |
| intergenic | Y1675Y BA.5.5,BA.5.6,GA.4.1,FL.15 |
| intergenic | L1748L FL.15 |
| intergenic | Q1813Q FK.1.1,FL.15 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | V1957I EG.5.1.3,FL.15 |
| intergenic | T1998I FL.15 |
| intergenic | T2007T BA.5,BQ.1.1.8,GA.4.1,FL.15 |
| intergenic | V2090I FL.15 |
| intergenic | S2132G BQ.1.1.8,DV.7.1.2,FL.15 |
| intergenic | V2133A FL.15 |
| intergenic | S2185N FL.15.1.1,FL.15 |
| intergenic | L2235L FL.15 |
| ORF1a | S2313A / NSP3 |
| intergenic | S2313A FL.15 |
| intergenic | F2338F BQ.1.13,FL.15 |
| intergenic | I2490I BA.5.5,EG.5.1,EG.5.1.6,FL.15 |
| intergenic | K2533R BA.5.5,FL.15 |
| intergenic | N2539S FL.15 |
| intergenic | S2822P FL.15 |
| intergenic | S2822S FL.15 |
| intergenic | D2907D BA.2.12,BA.5.2.20,FL.15 |
| intergenic | S2981S EG.10.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | I3052V BA.2.12,FL.15 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | P3134S EU.1.1,FL.15 |
| ORF1a | T3150A / NSP4 |
| intergenic | T3150A FL.15 |
| intergenic | V3166V FL.15 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5,EG.6.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | N3239N BA.5.1.2,FL.15 |
| intergenic | Y3250Y BA.4.1,FL.2.3,FL.15 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | A3454A FL.15 |
| intergenic | D3508D FL.1.5,FL.8,FL.15 |
| intergenic | L3583L FL.15 |
| intergenic | V3593A FL.15 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15 |
| intergenic | M3616I FL.15 |
| ORF1a | M3627V / NSP6 |
| intergenic | M3627V FL.15 |
| intergenic | P3642P BF.26,FL.15 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | I3758V BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,FL.15 |
| intergenic | G3849G FL.15 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15 |
| intergenic | L4045L BA.4,BA.4.1,BF.26,FK.1.1,FL.15 |
| intergenic | I4049I FL.15 |
| intergenic | A4168A BA.5.1.30,BA.4.6,FL.15 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | L4209L FL.15.1.1,FL.15 |
| intergenic | N4235N BA.4,BA.5,BA.5.1.1,FL.1.5,FL.1.5.2,FL.15 |
| intergenic | T4249I BQ.1.13,BA.5.5,FL.15 |
| intergenic | K4346K FL.15 |
| intergenic | A4357V BA.4,BA.5.2.3,EG.5.1,FL.15 |
| intergenic | D4384D EG.5.1,FL.15 |
| intergenic | R4387R BA.4,BA.5.1.30,BF.28,FL.15 |
| intergenic | Y4424Y FL.1.5,FL.14,FL.15.1.1 |
| intergenic | D4556G FL.15 |
| intergenic | A4568A BA.5,FL.15 |
| intergenic | I4593I FL.15 |
| intergenic | Y4686Y BA.4.1.8,DV.7.1.2,EG.5.1.4,FD.1.1,FL.15 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | N4808N FL.15 |
| intergenic | D4891D FL.15 |
| intergenic | I5024V FL.15 |
| intergenic | A5031A FL.15 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | R5118R FL.15 |
| intergenic | E5121E FL.15 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | I5229I FL.15 |
| intergenic | N5303N EG.5.1,FL.15 |
| intergenic | Y5355Y BA.2.12,BA.5.2.20,EG.5.1,FL.1.5.2,FL.15 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | V5366V EG.5.2.1,FL.15 |
| intergenic | P5371P BA.1.17,EG.5.2.1,EG.5.1,EG.5.1.6,FL.15 |
| intergenic | P5377S BA.4,BA.5.1.24,BF.28,EG.5.1,FL.15 |
| intergenic | S5490L BA.5.2.34,BA.5.1.24,FL.15 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | V5565V FL.15 |
| intergenic | D5584Y FL.15 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | A5727A DV.7.1,FL.20.2,FL.15 |
| intergenic | V5749V FL.15 |
| intergenic | A5793V FL.15 |
| intergenic | Q5842Q FL.15 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | Y5867Y FL.15 |
| intergenic | T5890T FL.15 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | K5986K FL.15 |
| intergenic | P5995L FL.15 |
| intergenic | L6032I FL.15 |
| intergenic | T6038I BF.9,FL.15 |
| intergenic | D6069D BA.2.12,BA.4.1,EG.6.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | V6107I DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1,FK.1.1,FL.15 |
| ORF1b | S6180R / NSP14 |
| intergenic | S6180R FL.15 |
| intergenic | H6239H FL.15 |
| intergenic | E6290E FL.15 |
| intergenic | A6296V FL.15 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | E6378D FL.15 |
| intergenic | G6406S FD.1.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | G6581S FL.15 |
| ORF1b | R6590C / NSP15 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | A6623V DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FL.15 |
| intergenic | T6733T FK.1.1,FL.15 |
| ORF1b | D6734D / NSP15 |
| intergenic | K6933K FL.15 |
| intergenic | G7011S FL.15 |
| intergenic | V11V BA.5.2.34,BA.1.18,BF.28,BA.1.15,FL.15 |
| intergenic | Q14R FL.15 |
| intergenic | Q14H EG.10.1,FL.15 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | F43F FL.15 |
| intergenic | H49Y FL.15 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.15 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | R102G FD.1.1,FL.15 |
| intergenic | S116S EG.5.1,EU.1.1,FD.1.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8 |
| intergenic | N148T FL.15 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | F186S FL.15 |
| intergenic | V193L BA.5.1.10,FL.15 |
| intergenic | I197V FL.15 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | L249L FL.15 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | V341I FL.15 |
| intergenic | A344S FL.15 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | Y421Y FL.15 |
| S | Y421Y FL.15 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | N481S FL.15 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | E484V BA.5.2.3,FL.15.1.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | L517F FL.15 |
| intergenic | F562F BA.5.2.34,FL.15 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | S691S FL.10.1,FL.15 |
| intergenic | L754F FL.15 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | T778T BF.28,FL.15 |
| intergenic | P807S FL.15 |
| intergenic | A852A FL.15 |
| intergenic | N856N BQ.1.1.8,CH.1.1.28,EG.7,EG.6.1,FL.15 |
| intergenic | Y917Y FL.15 |
| S | Y917Y FL.15 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | R1014K FL.15 |
| intergenic | Y1067Y EG.6.1,FL.15 |
| intergenic | I1114I FL.15 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | F1148F EG.5.1.3,EG.7,FL.15 |
| intergenic | M1237I BF.26,FL.8,FL.15 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | T12I EG.5.1,FL.15 |
| intergenic | K21N BA.5.1.10,BA.5.1.1,DV.7.1.2,BA.4.6,FL.15 |
| intergenic | V29A FL.15 |
| intergenic | I35T BA.4.6,FL.15 |
| intergenic | L52F FL.15 |
| intergenic | L65P FL.15 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | P104S BA.5.1.30,FL.15 |
| intergenic | Y107Y BF.26,EG.10.1,FL.15 |
| intergenic | A110V DV.7.1,DV.7.1.2,FL.15 |
| intergenic | W131C BE.1.1,FL.15 |
| intergenic | C148C BA.5.1.10,BA.5,FL.15 |
| intergenic | T176I BA.1.17,BF.26,FL.15.1.1 |
| intergenic | P178L FL.15 |
| intergenic | W193X FL.15 |
| ORF3a | W193X FL.15 |
| intergenic | V202L FL.15 |
| intergenic | Q213K BA.2.12,EG.5.1.3,FL.10.1,FL.15 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | T229I FL.15 |
| intergenic | P240P FL.15 |
| intergenic | H247H FL.15 |
| intergenic | S3T FL.15 |
| intergenic | S6S EG.6.1,FL.15 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | T30A FL.15 |
| intergenic | V58L FL.15 |
| intergenic | N66S FL.15 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | Y71Y EG.5.1.4,FL.15 |
| intergenic | T77T BA.4.6,EG.5.1,FL.15 |
| intergenic | A98A FL.15 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | N117N BQ.1.13,BA.5.5,EG.5.1.3,BA.5.6,FL.15 |
| intergenic | L120L FL.10.1,FL.15 |
| intergenic | N207N BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1.3,EG.7,FL.15 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | I3S FL.15 |
| ORF7a | I3S FL.15 |
| intergenic | G38E BE.1.1,FL.15 |
| intergenic | N52S FL.15 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | P56L FL.15 |
| intergenic | S67F BA.5.1.10,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.5,EG.5.1,FL.10.1,FL.15 |
| intergenic | I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9,FL.15 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | D63D BA.5.1.10,DV.7.1,FL.15 |
| intergenic | S78G FL.15 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1,FL.15 |
| intergenic | T135I BA.5.6,FL.15 |
| intergenic | L139L FL.15 |
| intergenic | A155S FL.15 |
| intergenic | L161F BA.5,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.15 |
| intergenic | T166I DV.7.1,FL.15 |
| N | R185C FL.15 |
| intergenic | R191H FL.15 |
| intergenic | R191R FL.15 |
| intergenic | R191R FK.1.1,FL.15.1.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | D225D FL.15 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1,BF.26,EG.5.1,BA.5.6,FL.15 |
| intergenic | P302P BA.5.2.34,BA.4.1,CH.1.1.28,FL.15 |
| intergenic | A313A FL.15 |
| intergenic | R319H BF.28,FL.15 |
| intergenic | M322I FL.15 |
| intergenic | Y360Y BA.5.2.2,BA.5.2.3,BQ.1.1.8,FL.15 |
| intergenic | P383P BA.5.2.34,BE.1.1,BQ.1.13,FL.15 |
| intergenic | Q409H FL.15 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15 |
| intergenic | R20X FL.15 |
| ORF10 | R20X FL.15 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.6,FL.15 |
| intergenic | g.T29710A FL.15 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15 |
| intergenic | g.C29769T DV.7.1,BA.5.2.20,BF.26,FL.15 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | g.CGTCC-25_-21TGTCA FY.3.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | H374H BA.5.1.10,FY.3.1 |
| ORF1a | T568K / NSP2 |
| intergenic | T568K FY.3.1 |
| intergenic | E750K FY.3.1 |
| intergenic | E755E FY.3.1 |
| intergenic | V757V BA.5.2.34,BF.26,FY.3.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | D930E FY.3.1 |
| intergenic | H1141H FY.3.1 |
| intergenic | P1220S FY.3.1 |
| ORF1a | D1282Y / NSP3 |
| intergenic | D1282Y FY.3.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| ORF1a | D1624D / NSP3 |
| intergenic | D1624D FY.3.1 |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10,BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BA.5.6,FY.3.1 |
| intergenic | T1760I BA.5.1.2,GA.4.1,FY.3.1 |
| intergenic | P1921L FY.3.1 |
| intergenic | I1990V FY.3.1 |
| ORF1a | E2031A / NSP3 |
| intergenic | E2031A BA.5.2.20,FY.3.1 |
| intergenic | T2154I BA.4.6,FY.3.1 |
| intergenic | D2299N FY.3.1 |
| ORF1a | F2314S / NSP3 |
| intergenic | F2314S FY.3.1 |
| intergenic | D2693D BA.5.1.30,FY.3.1 |
| intergenic | P2739L FY.3.1 |
| intergenic | I2806I BA.5.1.24,FY.3.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | G3565G FY.3.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | L3717L BA.2.12,FY.3.1 |
| intergenic | G3846S EG.7,FY.3.1 |
| intergenic | L3980L FY.3.1 |
| intergenic | A4094A FY.3.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | P4312P BA.5.2.20,FY.3.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | L4779L BA.4,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FY.3.1 |
| intergenic | Y4871Y BA.5.1.1,FY.3.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | P5310L BA.5.1.10,EG.6.1,FY.3.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | A6192S FY.3.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | V6385V FY.3.1 |
| ORF1b | S6549Y / NSP15 |
| intergenic | S6549Y FY.3.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| ORF1b | I6758T / NSP15 |
| intergenic | I6758T FY.3.1 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1 |
| intergenic | A6997A BA.4,BA.5,BA.5.1.1,EG.10.1,FY.3.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | K77T FY.3.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | Q115Q GA.4.1,FY.3.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | Y200C FY.3.1 |
| intergenic | K206K FY.3.1 |
| intergenic | I210T FY.3.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | L244_H245delinsF FY.3.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | R403K BA.2.86.1,BA.5,DV.7.1,EG.10.1,EG.7,FY.3.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | Q493L EG.5.1.4,FY.3.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.5.2.3,FY.3.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | A684V BA.5,FY.3.1 |
| intergenic | P715P BA.5.2.20,FL.1.5.2,EG.5.1.6,FY.3.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | A33S FY.3.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | P71L FL.1.5,EG.5.1.4,EU.1.1,FY.3.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | F6S FY.3.1 |
| intergenic | T39I BA.5.1.1,EU.1.1,FY.3.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | D35Y FY.3.1 |
| intergenic | R52I FY.3.1 |
| intergenic | G66_K68delinsE BA.2.12,BA.4,FY.3.1 |
| intergenic | S103P FY.3.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | T135I BA.5.6,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | g.C-8T BF.28,FY.3.1 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1 |
| intergenic | g.C29708T BA.5.2.20,FL.8,FY.3.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | G132S FL.25 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25 |
| intergenic | D223D FL.25 |
| ORF1a | K247N / NSP2 |
| intergenic | K247N BA.2.12,FL.25 |
| intergenic | A354V FL.25 |
| intergenic | G400S EG.5.1.4,FL.15,FL.25 |
| intergenic | Q455K FL.25 |
| intergenic | V544V FL.25 |
| intergenic | A591V BA.5.1.10,BA.5.1.2,FL.14,FL.25 |
| intergenic | G604S FL.25 |
| intergenic | T677I FL.25 |
| intergenic | L747F FL.25 |
| intergenic | I793I FL.25 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | P943P FL.25 |
| intergenic | S1150S FL.25 |
| intergenic | K1233T FL.25 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | L1438L BA.1.14,BA.5.2.2,BA.5.1.30,BA.4.6,FL.2.3,FL.25 |
| intergenic | S1510F FL.25 |
| intergenic | N1578N EG.5.1.6,FL.25 |
| intergenic | V1584V FL.25 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25 |
| intergenic | S2352S FL.25 |
| intergenic | R2985R BF.9,FL.25 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | I3145T FL.25 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | A3333V FL.25 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| ORF1a | Q3569Q / NSP5 |
| intergenic | Q3569Q FL.25 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25 |
| intergenic | A4194T FL.25 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| ORF1b | V4423V / NSP12 |
| intergenic | V4423V FL.25 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | S5041L FL.25 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | A5189A FL.25 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | L5283L BA.4,BA.4.1,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.25 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | F5823F BA.4,EU.1.1,FL.25 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | L6099F FL.25 |
| intergenic | P6128S BQ.1.1.8,FL.25 |
| intergenic | H6208H BA.5.5,FL.10.1,FL.25 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | A6544V FD.1.1,FL.25 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | K6711K EG.7,FL.25 |
| intergenic | S6739L BA.5.1.10,BF.28,FL.25 |
| intergenic | A6919V FL.25 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | D80D BA.5.1.1,FL.25 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25 |
| intergenic | S151N FL.25 |
| intergenic | F157S EU.1.1,FL.25 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | STP477NKH FL.25 |
| S | STP477NKH FL.25 |
| intergenic | E484A FL.25 |
| intergenic | VE483AA FL.25 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1,FL.25 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | A623A FL.25 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | L53F BA.5.2.20,FL.25 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | A99A FL.25 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10,BF.20,BA.5.1.2,FK.1.1,FD.1.1,FL.25 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | F22_D30del BA.5.1.24,FL.25 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | L9L FL.25 |
| intergenic | A13T EG.5.1,FL.25 |
| intergenic | L116L BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.25 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | H37L FL.1.5.2,FL.25 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | P85S FD.1.1,FL.25 |
| intergenic | P85L FL.25 |
| intergenic | N89D FL.25 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | RG203KQ FL.25 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | L331F FL.25 |
| intergenic | F346F BA.5.2.34,EG.5.1,FL.14,FL.25 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | g.A-24C FL.25 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25 |
| intergenic | g.C-147T BA.5.2.2,FU.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | V38V BA.4.6,FU.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| ORF1a | E65E / NSP1 |
| intergenic | E65E FU.1 |
| intergenic | V111M FU.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| ORF1a | N178S / NSP1 |
| intergenic | L251F FU.1 |
| intergenic | S302F BA.5.1.24,BF.9,FU.1 |
| intergenic | N310N FU.1 |
| ORF1a | L360L / NSP2 |
| intergenic | L360L FU.1 |
| intergenic | V365A FU.1 |
| ORF1a | E386E / NSP2 |
| ORF1a | E444D / NSP2 |
| intergenic | R542C BA.5.2.20,EG.5.1.3,EG.5.1,FU.1 |
| intergenic | T554T FU.1 |
| intergenic | G604S FL.25,FU.1 |
| intergenic | T666N FU.1 |
| intergenic | F741F BA.5.1.2,FU.1 |
| intergenic | L815L EG.5.1,FL.8,FU.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | P885P FU.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | A967V BA.4,FU.1 |
| intergenic | G989V FU.1 |
| intergenic | I1023_E1024delinsK FU.1 |
| intergenic | D1179D BA.4,FU.1 |
| intergenic | S1221P FU.1 |
| intergenic | D1275D FU.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | A1397A BA.2.12,BA.5,DV.7.1,BA.5.5,FL.15,FU.1 |
| intergenic | V1453I FU.1 |
| intergenic | G1456G BA.5,FU.1 |
| intergenic | T1567I FU.1 |
| ORF1a | M1588V / NSP3 |
| intergenic | M1588V FU.1 |
| intergenic | L1627L BA.5.1.30,FU.1 |
| intergenic | G1790S FU.1 |
| intergenic | T1822I BA.1.18,BA.4.1,FU.1 |
| intergenic | F1907F FU.1 |
| intergenic | I1935I BA.5.2.20,BA.5.6,EG.5.1.6,FU.1 |
| intergenic | Q2058Q BF.28,FU.1 |
| intergenic | T2264I FU.1 |
| intergenic | S2389L BF.41,FU.1 |
| intergenic | C2459S FU.1 |
| intergenic | I2490V FU.1 |
| intergenic | A2529V BF.28,FU.1 |
| intergenic | P2867P FU.1 |
| intergenic | D2980N BA.4.6,FU.1 |
| intergenic | V3005I FU.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | L3092L BA.4,FU.1 |
| intergenic | K3192R FU.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | L3290L BA.1.15,FU.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | V3367I FU.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| ORF1a | L3591I / NSP6 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1 |
| intergenic | T3646T FU.1 |
| intergenic | Y3654Y FU.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | I3768I FU.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BA.4.6,EG.5.1.3,BA.5.6,FU.1 |
| intergenic | A4155A FU.1 |
| intergenic | T4175A FU.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | N4263N FU.1 |
| ORF1a | A4276T / NSP10 |
| intergenic | T4364I BA.5.2.20,FU.1 |
| ORF1b | G4436V / NSP12 |
| ORF1b | T4540A / NSP12 |
| intergenic | T4540A FU.1 |
| intergenic | V4574A FU.1 |
| intergenic | L4637L FU.1 |
| intergenic | T4668M DV.7.1,FU.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | N4796D FU.1 |
| intergenic | V4864V FU.1 |
| ORF1b | N4881N / NSP12 |
| intergenic | N4881N FU.1 |
| intergenic | F4920F EG.5.1.3,FU.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | Y5355Y BA.2.12,BA.5.2.20,EG.5.1,FL.1.5.2,FL.15,FU.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | V5366V EG.5.2.1,FL.15,FU.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1 |
| intergenic | V5680V BA.4.1.8,BF.28,FL.1.5,EG.7,FU.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | G6035G FU.1 |
| intergenic | D6147Y FU.1 |
| intergenic | V6215V FU.1 |
| intergenic | D6283D FU.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | H6466H FU.1 |
| intergenic | V6483I FU.1 |
| intergenic | V6487F FU.1 |
| intergenic | K6516E EU.1.1,FU.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | V6573V BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,FU.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | R6676R FU.1 |
| S | V16F FU.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1 |
| intergenic | E180V FU.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | T274I FU.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | T547I BA.5.2.3,BA.5,BF.28,FL.2.3,FU.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | N703Y FU.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | R815R FU.1 |
| S | R815R FU.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | K1086R FU.1 |
| intergenic | E1092E FU.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | V29V FU.1 |
| intergenic | Q57H BF.9,BF.10,EG.5.1.4,FU.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | C130C BQ.1.1.8,FU.1 |
| intergenic | D173N FU.1 |
| intergenic | T176I BA.1.17,BF.26,FL.15.1.1,FU.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | T229I FL.15,FU.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | P71S FU.1 |
| intergenic | S4F FU.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | A69V BA.2.12,FU.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | L145L BA.5.1.30,FU.1 |
| intergenic | R200R FU.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | g.C-1T BA.5,BA.5.5,FU.1 |
| intergenic | L96F DV.7.1.2,FU.1 |
| ORF7a | C113Y FU.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | L22I FU.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | T11I FU.1 |
| ORF8 | L95V FU.1 |
| intergenic | L118V FU.1 |
| intergenic | F120fs EG.5.1.4,EG.5.1,FU.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | Q58Q FU.1 |
| intergenic | H145H BA.5,FU.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | S235S BF.9,FU.1 |
| intergenic | R276R FU.1 |
| intergenic | Y360Y BA.5.2.2,BA.5.2.3,BQ.1.1.8,FL.15,FU.1 |
| intergenic | D371D FU.1 |
| intergenic | T379I BF.28,FU.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | P10T FU.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | Y359Y FY.4.1.1 |
| intergenic | R560H EG.5.1.8,FY.4.1.1 |
| intergenic | E832K FY.4.1.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| ORF1a | C2041Y / NSP3 |
| intergenic | C2041Y FY.4.1.1 |
| intergenic | V2703V FY.4.1.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | F3271F BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,EG.6.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | S3273S BA.5.1.2,FY.4.1.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | T4654A FY.4.1.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | T5321A FY.4.1.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | Y6160Y BF.28,FL.1.5,BA.5.6,FY.4.1.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | P6722S FL.14,FY.4.1.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | Y200C FY.3.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | Y451H FY.4.1.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | S494P EG.10.1,EG.5.1,EG.5.1.6,FY.4.1.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4,GA.4.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | D1139H FY.4.1.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | P42L FY.4.1.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | W131L FY.4.1.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | D265D FY.4.1.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | H125R FY.4.1.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | P46S FL.8,FY.4.1.1 |
| intergenic | A152V FY.4.1.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | A218A FY.4.1.1 |
| intergenic | Y298H FY.4.1.1 |
| intergenic | A313A FL.15,FY.4.1.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | V26V BA.5,FU.2 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | P153P FU.2 |
| intergenic | D187D FU.2 |
| intergenic | P193L BA.5.2.34,FU.2 |
| intergenic | D335G FU.2 |
| intergenic | L349F FU.2 |
| intergenic | S376L BA.5.2.3,BA.5.5,EG.5.1.9,FU.2 |
| intergenic | S443S BA.5,EU.1.1,FU.2 |
| ORF1a | F467F / NSP2 |
| intergenic | F467F FU.2 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2 |
| intergenic | I523V FU.2 |
| intergenic | A537T FU.2 |
| intergenic | N615N BA.4,BA.5.2.20,FU.2 |
| intergenic | F617L FU.2 |
| ORF1a | P626L / NSP2 |
| intergenic | P626L FU.2 |
| intergenic | C655Y FU.2 |
| ORF1a | T677T / NSP2 |
| intergenic | T677T BF.28,FU.2 |
| intergenic | M731I FU.2 |
| intergenic | I740I BA.2.12,BA.5,CK.2,BA.4.6,FU.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| ORF1a | S858F / NSP3 |
| intergenic | S858F FU.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | D928Y FU.2 |
| intergenic | A1049V BA.4.1.8,BQ.1.1.8,BA.5.5,FU.2 |
| intergenic | V1056V CK.2,FU.2 |
| intergenic | N1059N BA.4.1,BQ.1.13,BA.5.5,GA.4.1,FU.2 |
| intergenic | T1168I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.1.15,EG.5.2.1,FU.2 |
| intergenic | E1251Q FU.2 |
| intergenic | I1276T FU.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | K1364R FU.2 |
| intergenic | L1438L BA.1.14,BA.5.2.2,BA.5.1.30,BA.4.6,FL.2.3,FL.25,FU.2 |
| intergenic | T1543I BF.9,EG.7,FD.1.1,FU.2 |
| intergenic | H1545H BF.26,FU.2 |
| ORF1a | V1550I / NSP3 |
| intergenic | V1550I FU.2 |
| intergenic | L1627L BA.5.1.30,FU.1,FU.2 |
| intergenic | N1651N FL.10.1,FU.2 |
| intergenic | Y1700Y BA.4.1,BQ.1.1.8,EG.6.1,FD.1.1,FU.2 |
| intergenic | N1830N FU.2 |
| intergenic | F1907F FU.1,FU.2 |
| intergenic | F1960F FU.2 |
| intergenic | R2115I FU.2 |
| intergenic | T2124I BQ.1.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,FU.2 |
| intergenic | T2247I BA.5.2.3,FU.2 |
| intergenic | T2280A FU.2 |
| intergenic | T2300T EG.5.1,FU.2 |
| intergenic | D2525D DV.7.1.2,FU.2 |
| intergenic | S2535L BF.28,BQ.1.2.3,FU.2 |
| intergenic | L2609L BA.5.1.24,BF.10,CK.2,FU.2 |
| intergenic | L2675L BA.5.2.3,BA.5,FU.2 |
| intergenic | Y2809Y EG.7,FL.10.1,FU.2 |
| intergenic | C2851C EG.7,FU.2 |
| intergenic | L2869L FU.2 |
| intergenic | T2952A FU.2 |
| intergenic | G2995G FU.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | L3101L FU.2 |
| intergenic | F3153F BA.5.5,FU.2 |
| intergenic | L3198L BA.2.12,BA.5.2.8,FU.2 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | T3202T FD.1.1,FU.2 |
| intergenic | D3222D BA.5.1.24,BF.26,FU.2 |
| intergenic | L3234L BA.1.17,BF.10,FL.2.3,FU.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | A3357V FU.2 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6,FU.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2 |
| intergenic | A3625V FU.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | V3683I EG.10.1,FU.2 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2 |
| intergenic | L3919F BA.5.1.2,FU.2 |
| intergenic | F3991F FU.2 |
| intergenic | N4051N FU.2 |
| intergenic | A4155A FU.1,FU.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | D4218D BF.26,FU.2 |
| intergenic | K4483E BA.5.1.24,FU.2 |
| ORF1b | A4489S / NSP12 |
| intergenic | A4489S FU.2 |
| intergenic | T4668A BA.5.2.2,FU.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | V4864V FU.1,FU.2 |
| intergenic | T4983T FU.2 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20,BA.1.15,BA.5.5,BA.5.6,FL.20.2,FU.2 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | V5067I BA.5.5,FU.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| ORF1b | T5321I / NSP12 |
| intergenic | T5321I FU.2 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | T5435I EG.5.1.4,FU.2 |
| intergenic | V5550L FU.2 |
| intergenic | L5551L EG.7,FL.14,FL.10.1,FU.2 |
| intergenic | R5656R FU.2 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | R5766R FU.2 |
| intergenic | V5819V BA.5.2.3,BA.5.1.2,FL.10.1,FU.2 |
| intergenic | K5848R FU.2 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | T5912I BA.5.1.10,DV.7.1.2,BF.10,BA.4.6,FU.2 |
| intergenic | N5920N FU.2 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | N6055N FU.2 |
| intergenic | D6147Y FU.1,FU.2 |
| intergenic | V6306V FU.2 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3,EG.5.1,FL.10.1,FU.2 |
| intergenic | V6536V BA.1.14,FU.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | F6710L FU.2 |
| intergenic | L6749L FU.2 |
| intergenic | P6860P BA.5.1.1,FU.2 |
| intergenic | L6981I FK.1.1,FU.2 |
| intergenic | H6984Q FU.2 |
| intergenic | I7035F FU.2 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | G75V BA.2.12,BA.4,BA.5.2.20,FU.2 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | N87N FU.2 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | N148T FL.15,FU.2 |
| intergenic | E180V FU.1,FU.2 |
| intergenic | KQ182EE FU.2 |
| intergenic | Q183E FU.2 |
| intergenic | I210V DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1,FU.2 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | D215G FK.1.1,FU.2 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | E298E FU.2 |
| intergenic | P330S FU.2 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | VG445SS FU.2 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | T523T FU.2 |
| intergenic | T547I BA.5.2.3,BA.5,BF.28,FL.2.3,FU.1,FU.2 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1,FL.25,FU.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | V622L FU.2 |
| intergenic | V642G EG.5.1.4,FU.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | A668S FU.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | I692I BA.5.1.10,BA.4.6,FL.14,EG.6.1,FU.2 |
| intergenic | T739R FU.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | E780Q FU.2 |
| intergenic | V785I FU.2 |
| intergenic | A845S FU.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | I980I FU.2 |
| intergenic | A1022A FU.2 |
| S | A1022A FU.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | P42L FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | T64I FU.2 |
| intergenic | T64T FU.2 |
| intergenic | E102G FU.2 |
| intergenic | R134H FU.2 |
| intergenic | P138P BA.5.2.8,FU.2 |
| intergenic | A143V FU.2 |
| intergenic | Y154Y BA.5.5,FL.10.1,FU.2 |
| intergenic | N161N FU.2 |
| intergenic | E194K FU.2 |
| intergenic | Q213K BA.2.12,EG.5.1.3,FL.10.1,FL.15,FU.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | E239D BF.10,FU.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | I73M FU.2 |
| intergenic | I76I FU.2 |
| intergenic | F100F BA.5.1.24,DV.7.1.2,FU.2 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | P114P BA.4.6,FU.2 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | I32I BA.5.5,FL.10.1,FU.2 |
| intergenic | P57L BF.20,FU.2 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | I10T BQ.1.13,FU.2 |
| intergenic | V82F FU.2 |
| intergenic | E3fs FU.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | P36L BA.5,FU.2 |
| intergenic | H40Y DV.7.1,FU.2 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,FU.2 |
| intergenic | A65_K68delinsVE FU.2 |
| intergenic | I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9,FL.15,FU.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | Q58Q FU.1,FU.2 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2 |
| intergenic | A211V FU.2 |
| intergenic | A251A FU.2 |
| intergenic | F346F BA.5.2.34,EG.5.1,FL.14,FL.25,FU.2 |
| intergenic | D358D EG.5.1.8,FU.2 |
| intergenic | T362I BA.5.1.24,BA.4.1,DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FU.2 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,FU.2 |
| intergenic | g.T29685C FU.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2 |
| intergenic | g.C-222T BA.4,BA.5,EG.7,BA.2.3 |
| intergenic | g.C-174T BA.4.6,BA.2.3 |
| intergenic | g.A-137G BA.2.3 |
| intergenic | g.C-80T BA.5.1.1,BA.2.3 |
| intergenic | g.G-47A BF.10,BA.4.6,BA.2.3 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3 |
| intergenic | L92L BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.2.3 |
| intergenic | S135R BA.2.3 |
| intergenic | L140L CH.1.1.28,BQ.1.13,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3 |
| intergenic | G146G FD.1.1,BA.2.3 |
| intergenic | I222V BA.5.1.1,FL.10.1,BA.2.3 |
| intergenic | S302F BA.5.1.24,BF.9,FU.1,BA.2.3 |
| intergenic | A307V BA.2.3 |
| intergenic | S330L BA.2.3 |
| intergenic | G392G FL.14,FL.8,BA.2.3 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,BA.2.3 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | L631F BA.2.3 |
| ORF1a | S674R / NSP2 |
| intergenic | S674R BA.2.3 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3 |
| intergenic | A735A BA.1.14,BA.1.18,BA.1.15,FL.1.5,BA.2.3 |
| intergenic | I793I FL.25,BA.2.3 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | A872V BA.2.3 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | T1000I BA.2.3 |
| intergenic | T1168I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.1.15,EG.5.2.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | D1228Y BA.2.3 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | Y1425Y BA.5.5,BA.2.3 |
| intergenic | G1451G BA.2.3 |
| intergenic | D1547D BA.5.6,BA.2.3 |
| intergenic | D1575D EG.5.2.1,BA.2.3 |
| ORF1a | E1801K / NSP3 |
| intergenic | E1801K BA.2.3 |
| ORF1a | K2029R / NSP3 |
| intergenic | K2029R BA.2.3 |
| intergenic | D2043G BA.2.3 |
| intergenic | H2092Y BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.2.3 |
| intergenic | H2125Y BA.4.6,EG.5.1,BA.2.3 |
| intergenic | T2300T EG.5.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | P2376P BA.5,BA.2.3 |
| intergenic | V2421V BA.4,BF.10,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3 |
| intergenic | S2535L BF.28,BQ.1.2.3,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | A2909V BA.2.12,BA.2.3 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | A3235V BA.2.3 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | I3306I BA.2.3 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | P3447S BA.2.3 |
| ORF1a | V3510I / NSP5 |
| intergenic | V3510I BA.2.3 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | D3668D BA.2.3 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | A3730A BA.2.12,EG.6.1,GA.4.1,BA.2.3 |
| intergenic | T4087I BA.1.14,BA.2.3 |
| intergenic | A4156A BA.2.3 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | D4335D BA.2.3 |
| intergenic | V4623I BA.2.3 |
| intergenic | T4651I BA.2.3 |
| ORF1b | L4674I / NSP12 |
| intergenic | L4674I BA.2.3 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | F4820F BA.5.1.10,BA.4.1,BF.26,BQ.1.2.3,EG.5.1,BA.2.3 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | Y5355Y BA.2.12,BA.5.2.20,EG.5.1,FL.1.5.2,FL.15,FU.1,BA.2.3 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3 |
| intergenic | Q5605Q EG.5.1.3,BA.2.3 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | F5746F BA.2.12,BA.5.2.3,FD.1.1,BA.2.3 |
| intergenic | N5827N BA.2.3 |
| intergenic | S5859S BA.2.3 |
| intergenic | L5932L BA.5.2.34,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.2.3 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | L6034L BA.2.3 |
| ORF1b | K6072R / NSP14 |
| intergenic | K6072R BA.2.3 |
| intergenic | S6386L BA.2.3 |
| ORF1b | Y6419Y / NSP14 |
| intergenic | Y6419Y BA.2.3 |
| intergenic | T6449I BA.5.2.2,BA.2.3 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | D6753D BA.2.3 |
| intergenic | R7014R BA.5.2.34,BA.2.3 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3 |
| intergenic | M153T BA.2.3 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,FK.1.1,BA.5.6,BA.2.3 |
| intergenic | L296L BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.2.3 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BA.2.3 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | Q493R BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.2.3 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | L821L BA.5.5,FL.1.5,EG.5.1,BA.2.3 |
| intergenic | L877L BF.26,DV.7.1.2,EU.1.1,BA.2.3 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | T961M DV.7.1.2,BA.2.3 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | A1070T BA.2.3 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | K1157R BA.2.3 |
| S | K1157R BA.2.3 |
| intergenic | S1239G BA.2.3 |
| intergenic | C1243F BA.2.3 |
| intergenic | T34A BA.2.3 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3 |
| intergenic | L140F BA.4,BA.2.3 |
| intergenic | F207F BA.5.1.2,BA.5.2.20,BA.2.3 |
| intergenic | Q213K BA.2.12,EG.5.1.3,FL.10.1,FL.15,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | T217I BA.2.3 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | T268M BA.2.3 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | S55F BA.5.1.2,EG.5.1,BA.2.3 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | Y71Y EG.5.1.4,FL.15,BA.2.3 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | L120L FL.10.1,FL.15,BA.2.3 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | Q51Q BA.2.3 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | T39T BA.2.3 |
| intergenic | P45L BA.2.3 |
| intergenic | F46L BA.2.3 |
| intergenic | V74V CK.2,BA.2.3 |
| intergenic | K117K BA.2.3 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | E64G EG.5.1.4,BA.2.3 |
| intergenic | H112H BA.5.1.30,BA.2.3 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1,BA.2.3 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | G5E BA.5,BA.2.3 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | A50A BF.26,BA.2.3 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1,FL.15,BA.2.3 |
| intergenic | D144N BQ.1.1.8,BA.2.3 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.5,EG.5.1.4,BA.2.3 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | g.C29769T DV.7.1,BA.5.2.20,BF.26,FL.15,BA.2.3 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | g.G-1A GJ.1 |
| intergenic | Q22H GJ.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1 |
| intergenic | I71I BQ.1.2.3,GJ.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1 |
| intergenic | T224I BQ.1.1.8,BA.5.2.20,GJ.1 |
| intergenic | S428S GJ.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | E937G GJ.1 |
| intergenic | S944_D954del GJ.1 |
| intergenic | P1147P EG.6.1,GJ.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | D1323D BA.5.1.24,FL.10.1,GJ.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | P1810L GJ.1 |
| intergenic | T1854I BA.4.6,GJ.1 |
| intergenic | K1981K GJ.1 |
| intergenic | G2091S GJ.1 |
| intergenic | F2334F BA.2.12,BF.26,EG.5.1.8,EU.1.1,GJ.1 |
| intergenic | A2994A GJ.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | E3764G GJ.1 |
| intergenic | I4205V GJ.1 |
| intergenic | T4477I BA.5.1.10,GJ.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | I4954I GJ.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1 |
| intergenic | Y5111Y GJ.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | N5182N BA.5.1.1,GJ.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1 |
| ORF1b | S5560N / NSP13 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1 |
| intergenic | L5932L BA.5.2.34,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | T5950T GJ.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | G6018G EG.10.1,GJ.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1 |
| intergenic | Y6540Y BQ.1.13,BF.10,FD.1.1,GJ.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | V6617V GJ.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1 |
| intergenic | KQ182NE GJ.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1 |
| intergenic | D253G GJ.1 |
| S | T307S BA.5.1.30,GJ.1.2 |
| S | T307S BA.5.1.30,GJ.1.2 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1 |
| intergenic | G339Y GJ.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1,FL.25,FU.2,GJ.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | A1078A GJ.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1 |
| intergenic | R30H BA.5.1.24,GJ.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | A13V GJ.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | E106Q GJ.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | Q9H BA.5.1.24,GJ.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| N | P122S BA.5.1.24,GJ.1.2 |
| intergenic | N192N BA.5.1.10,BA.4,BF.10,EG.6.1,GJ.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | g.G29706T FL.1.5,GJ.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1 |
| intergenic | g.C-83T GK.2.1 |
| intergenic | g.T-71C GK.2.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | Q66Q BA.5.1.24,BF.26,GK.2.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | G150C GK.2.1 |
| intergenic | G192S GK.2.1 |
| intergenic | P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.6,GK.2.1 |
| intergenic | A535V GK.2.1 |
| intergenic | A540V BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.13,GK.2.1 |
| intergenic | L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.6.1,FD.1.1,GK.2.1 |
| intergenic | L624I GK.2.1 |
| intergenic | T654I GK.2.1 |
| intergenic | D762D BA.5.5,GK.2.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | L853L GK.2.1 |
| intergenic | P892L GK.2.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6,GK.2.1 |
| intergenic | S1106N BQ.1.2.3,GK.2.1 |
| intergenic | AG1306SS GK.2.1 |
| intergenic | G1307S GK.2.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | D1547N BA.5.2.20,GK.2.1 |
| intergenic | I1607V GK.2.1 |
| intergenic | P1786S BA.5.2.8,BA.5.2.20,BE.1.1,GK.2.1 |
| intergenic | D2074D GK.2.1 |
| intergenic | H2092H GK.2.1 |
| intergenic | F2172F BQ.1.1.8,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,GK.2.1 |
| intergenic | S2433S BA.5.6,GK.2.1 |
| intergenic | P2483S GK.2.1 |
| intergenic | S2720A GK.2.1 |
| intergenic | D2824D GK.2.1 |
| intergenic | T2872T EG.5.1.3,GK.2.1 |
| intergenic | V3005I FU.1,GK.2.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | Q3332R GK.2.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | L3641S GK.2.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | N3774N GK.2.1 |
| intergenic | A4068S GK.2.1 |
| intergenic | D4166D GK.2.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1 |
| intergenic | L4228L GK.2.1 |
| intergenic | D4384D EG.5.1,FL.15,GK.2.1 |
| intergenic | I4498T GK.2.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | R4975K GK.2.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | S5164C GK.2.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1 |
| intergenic | P5377S BA.4,BA.5.1.24,BF.28,EG.5.1,FL.15,GK.2.1 |
| intergenic | I5403V GK.2.1 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | L5850L GK.2.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | L6102L BA.4.1,BA.4.6,EG.6.1,FL.20.2,GK.2.1 |
| intergenic | P6128S BQ.1.1.8,FL.25,GK.2.1 |
| intergenic | L6308L BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.1.5,FD.1.1,GK.2.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1 |
| intergenic | K6980N GK.2.1 |
| intergenic | R7014H BA.5.2.34,GK.2.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | S45S FL.10.1,GK.2.1 |
| intergenic | G72R BQ.1.13,GK.2.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1 |
| intergenic | I210del GK.2.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | L216F BA.2.86.1,EG.5.1.3,GK.2.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1 |
| intergenic | E281G GK.2.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | V511I GK.2.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | E702E GK.2.1 |
| intergenic | L727L BQ.1.13,GK.2.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | P1162S GK.2.1 |
| intergenic | S1161S GK.2.1 |
| intergenic | C1243F BA.2.3,GK.2.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | H78Y BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.20,BF.28,EG.5.1,GK.2.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | H247H FL.15,GK.2.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | S68F GK.2.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | A8E GK.2.1 |
| intergenic | T28I BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,FD.1.1,GK.2.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | L25F GK.2.1 |
| intergenic | L34L BA.5.2.34,GK.2.1 |
| intergenic | E39X GK.2.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1 |
| intergenic | T11I FU.1,GK.2.1 |
| intergenic | Q27X GK.2.1 |
| intergenic | P38S BA.5.5,FL.1.5,GK.2.1 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1,BA.2.3,GK.2.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | G34G GK.2.1 |
| intergenic | A50A BF.26,BA.2.3,GK.2.1 |
| intergenic | A152S BA.5.1.10,BA.5.1.2,GK.2.1 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | g.G29688T BF.10,GK.2.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1 |
| intergenic | g.A-96G FL.20 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | V28I FL.20 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | I114T BA.4.6,FL.20 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | G192D EG.6.1,FL.20 |
| intergenic | L320L EG.5.1.4,FL.20 |
| intergenic | R402C FL.20 |
| intergenic | S443F BA.5.2.2,BF.41,BA.5.2.20,FL.20 |
| intergenic | A541T FL.20 |
| intergenic | A541V FL.20 |
| intergenic | S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1,EU.1.1,FL.20.2,FL.20 |
| intergenic | E553K FL.1.5,FL.20 |
| intergenic | V605V FL.20 |
| intergenic | V639V FL.20 |
| intergenic | Y799Y FL.8,FL.20 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | P1147S BF.10,FL.20 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | T1543T FL.20 |
| intergenic | T1788M BA.4.6,FL.20.2 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20 |
| intergenic | Y1920Y FL.20 |
| intergenic | P1989P FL.20 |
| intergenic | I2010V FL.20.2,FL.20 |
| intergenic | S2024L BA.5.2.2,FL.8,FL.20 |
| intergenic | A2379V BA.4.1.8,EG.5.1.8,FL.20.2 |
| intergenic | A2470A BA.5.1.24,FD.1.1,FL.20 |
| intergenic | S2500F BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.6,FL.20.2 |
| intergenic | T2676T BA.2.86.1,EG.5.2.1,FL.20 |
| intergenic | C2851C EG.7,FU.2,FL.20 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | D3042D FL.20.2,FL.20 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2,BF.9,BE.1.1,EG.5.1,FL.20 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | F3329F BF.41,BQ.1.2.3,FL.20 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | F3397F EG.5.1,FL.20 |
| intergenic | A3497T FL.20 |
| intergenic | A3523A EG.5.1.4,FD.1.1,FL.20.2,FL.20 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20 |
| intergenic | T4035T FL.20 |
| intergenic | V4073V FL.8,FL.20 |
| intergenic | A4168A BA.5.1.30,BA.4.6,FL.15,FL.20 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | Q4392Q FL.20 |
| intergenic | A4408V FD.1.1,FL.20 |
| intergenic | V4488I FL.20 |
| intergenic | F4584F CH.1.1.28,BA.5.5,FL.20.2,FL.20 |
| intergenic | T4685I FL.20 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20,BA.1.15,BA.5.5,BA.5.6,FL.20.2,FU.2 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | G5215G FL.20 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.2,BF.26,EG.5.1.8,EG.5.1,FL.8,FL.20 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | A5727A DV.7.1,FL.20.2,FL.15 |
| intergenic | P5828L EG.5.2.1,FL.20 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | L5909L FL.20 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | L6102L BA.4.1,BA.4.6,EG.6.1,FL.20.2,GK.2.1 |
| intergenic | T6131T BA.2.12,DV.7.1,EG.5.1.8,FK.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | A6278S FL.20 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3,EG.5.1,FL.10.1,FU.2,FL.20 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | T6833I BA.4.6,EG.5.1,FL.20 |
| intergenic | A6914V BA.5.1.2,FL.20 |
| intergenic | L6961F BQ.1.13,FL.20 |
| intergenic | P9L FL.20 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.15,FL.20 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | S98F BA.5.1.10,FL.1.5,FD.1.1,FL.20 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20 |
| intergenic | Q173Q EG.5.2.1,FL.20.2 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | V193A FL.20 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | P337S FL.20 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | A352V FL.20 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | H519Q FL.20 |
| intergenic | T553I BF.10,FL.20 |
| intergenic | L560L BA.5.1.24,FL.20 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4,GA.4.1,FY.4.1.1,FL.20 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | V29I BA.2.12,FL.20.2 |
| intergenic | 66 FL.20 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | A72T DV.7.1,DV.7.1.2,FD.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | S74F BA.4,DV.7.1.2,BF.10,FL.1.5,FL.20.2 |
| intergenic | V88L EG.5.1.3,FL.20 |
| intergenic | L106F BA.1.15,EG.5.1.4,FL.20 |
| intergenic | L108F BA.4,FL.20.2,FL.20 |
| intergenic | Y145Y FL.20 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | V256del BA.5.2.2,BA.5.1.30,EG.5.1.3,FL.20.2 |
| intergenic | g.C-17T FL.20 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | S68F GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | D3G BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,FL.20 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | C33F FL.20 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | T77T BA.4.6,EG.5.1,FL.15,FL.20 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | S81L EG.5.1,FL.20.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | Q35X EU.1.1,FL.20.2 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | A55V BA.5.1.10,FL.1.5,FL.20 |
| intergenic | V62V BA.5.2.20,BE.1.1,EG.5.1.4,EU.1.1,FL.20 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | L56L BA.4.1,BA.5.1.30,FL.20.2 |
| intergenic | S194L BA.5.2.8,FL.20 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20 |
| intergenic | K249K FL.20 |
| intergenic | T282T BA.1.17,FL.20.2 |
| intergenic | F315F BA.5.1.1,BA.5.1.30,FL.20.2 |
| intergenic | T393S FL.20 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,FU.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | D33N BF.26,GJ.1.2.6 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | S135K GJ.1.2.6 |
| intergenic | S135R GJ.1.2.6 |
| intergenic | S428S GJ.1,GJ.1.2.6 |
| intergenic | M731V GJ.1.2.6 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | D1282D GJ.1.2.6 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | D1323D BA.5.1.24,FL.10.1,GJ.1,GJ.1.2.6 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | A1420V GJ.1.2.6 |
| intergenic | N1487N BA.5,GJ.1.2.6 |
| intergenic | G2091S GJ.1,GJ.1.2.6 |
| intergenic | D2506D BA.2.12,GJ.1.2.6 |
| intergenic | L2518L BA.5.1.30,GJ.1.2.6 |
| intergenic | A2811A GJ.1.2.6 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | S3344F GJ.1.2.6 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | T3487T GJ.1.2.6 |
| intergenic | H3631H BQ.1.1.8,GJ.1.2.6 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | I4205V GJ.1,GJ.1.2.6 |
| intergenic | V4350V GJ.1.2.6 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | S5398P GJ.1.2.6 |
| intergenic | V5511I GJ.1.2.6 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | L6034L BA.2.3,GJ.1.2.6 |
| intergenic | V6161V BA.4.6,GJ.1.2.6 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | Y6540Y BQ.1.13,BF.10,FD.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | T6572T GJ.1.2.6 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | L6961L GJ.1.2.6 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6 |
| intergenic | KQ182NE GJ.1,GJ.1.2.6 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | D253G GJ.1,GJ.1.2.6 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | P715P BA.5.2.20,FL.1.5.2,EG.5.1.6,FY.3.1,GJ.1.2.6 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | D843D GJ.1.2.6 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | V1230V GJ.1.2.6 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | T175I BA.5.1.30,BF.26,EG.5.2.1,GJ.1.2.6 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | A13V GJ.1,GJ.1.2.6 |
| intergenic | P84S BA.2.12,GJ.1.2.6 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | E106Q GJ.1,GJ.1.2.6 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | g.G29706T FL.1.5,GJ.1,GJ.1.2.6 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6 |
| intergenic | g.C-63T BA.5.1.10,BA.4,EG.10.1,FL.1.5,EG.6.1,FL.15,GK.1.3 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3 |
| intergenic | R287G GK.1.3 |
| intergenic | L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.6.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3 |
| ORF1a | E633A / NSP2 |
| intergenic | E633A GK.1.3 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | V879V BA.2.12,BA.1.15,EG.7,GK.1.3 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| ORF1a | A1049A / NSP3 |
| intergenic | A1049A GK.1.3 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| ORF1a | L1627P / NSP3 |
| intergenic | L1627P GK.1.3 |
| intergenic | D1671N GK.1.3 |
| ORF1a | N2023S / NSP3 |
| intergenic | N2023S GK.1.3 |
| intergenic | A2249V BF.28,EG.5.1,GK.1.3 |
| intergenic | T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15,EG.5.1.4,FL.2.3,FD.1.1,GK.1.3 |
| intergenic | S2433S BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3 |
| intergenic | A2584V BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,EG.7,EG.6.1,FL.10.1,GK.1.3 |
| intergenic | I2634V BA.5.1.24,GK.1.3 |
| intergenic | D2824D GK.2.1,GK.1.3 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | A3610A GK.1.3 |
| intergenic | 3676del GK.1.3 |
| intergenic | F3677del GK.1.3 |
| intergenic | S3675del GK.1.3 |
| ORF1a | L3914I / NSP7 |
| intergenic | L3914I GK.1.3 |
| intergenic | P3952S BA.5.6,GK.1.3 |
| intergenic | A4068S GK.2.1,GK.1.3 |
| intergenic | T4090I GK.1.3 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3 |
| intergenic | G4380G BA.5.1.24,GK.1.3 |
| intergenic | R4387R BA.4,BA.5.1.30,BF.28,FL.15,GK.1.3 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | D4813Y GK.1.3 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3 |
| intergenic | D5531G GK.1.3 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | L6717L GK.1.3 |
| intergenic | Y6845Y BA.5.1.10,BA.5.6,GK.1.3 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | S94A GK.1.3 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | E156Q GK.1.3 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | D215G FK.1.1,FU.2,GK.1.3 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | T573I EG.5.1,GK.1.3 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | I692I BA.5.1.10,BA.4.6,FL.14,EG.6.1,FU.2,GK.1.3 |
| intergenic | S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4,GA.4.1,FY.4.1.1,FL.20,GK.1.3 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | D936D BA.5.1.2,GK.1.3 |
| intergenic | S937S DV.7.1.2,EG.5.1.6,GK.1.3 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | S1161S GK.2.1,GK.1.3 |
| intergenic | K1266R GK.1.3 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | T89I BF.26,EG.5.1.8,FL.1.5,EG.5.1.4,FD.1.1,GK.1.3 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | F4F BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,GK.1.3 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | A63T GK.1.3 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | P45L BA.2.3,GK.1.3 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3 |
| intergenic | H17Y BA.5.2.20,EG.10.1,FL.1.5,EG.5.1.6,GK.1.3 |
| intergenic | P38S BA.5.5,FL.1.5,GK.2.1,GK.1.3 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | P46L GK.1.3 |
| intergenic | Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | Q281L GK.1.3 |
| intergenic | T366A GK.1.3 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2,GK.1.3 |
| intergenic | K375K GK.1.3 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | T12T GK.1.3 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | g.C-222T BA.4,BA.5,EG.7,BA.2.3,BQ.1 |
| intergenic | g.T-179C BQ.1 |
| intergenic | g.C-166T BA.5.2.20,BQ.1.2.3 |
| intergenic | g.C-119T BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.2.3,FL.15 |
| intergenic | g.G-62A BA.4.6,BQ.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13,EG.10.1,EG.5.1.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | G49D BA.5.1.24,BA.5,BA.5.2.8,BQ.1.1.8 |
| ORF1a | K72K / NSP1 |
| intergenic | K72K BA.5.2.34,BQ.1 |
| intergenic | R73C BA.5,BQ.1.2.3 |
| intergenic | G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,FD.1.1,BQ.1 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BA.4.6,FD.1.1 |
| ORF1a | G94S / NSP1 |
| intergenic | G94S BQ.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | L140L CH.1.1.28,BQ.1.13,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3 |
| intergenic | K141K BA.5.5,BQ.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1 |
| intergenic | R184H BQ.1 |
| intergenic | G192S GK.2.1,BQ.1 |
| intergenic | S216S BA.4,BQ.1.13 |
| intergenic | L219L EU.1.1,BQ.1 |
| intergenic | T265I BQ.1 |
| intergenic | S318L BA.5.1.1,BQ.1.1.8,EG.5.1.8 |
| ORF1a | G327S / NSP2 |
| intergenic | G327S FL.2.3,BQ.1 |
| intergenic | S376P BQ.1 |
| intergenic | T403I BA.5.1.10,BQ.1 |
| ORF1a | G445G / NSP2 |
| intergenic | G445G BQ.1 |
| intergenic | V459V BA.5.2.8,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S481S BA.5.1.10,BQ.1.1.8,BQ.1.13 |
| intergenic | E504E BQ.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | A520A BQ.1 |
| intergenic | P532P BQ.1 |
| intergenic | S538L BA.5.1.24,BQ.1.13 |
| intergenic | A540V BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.13,GK.2.1 |
| intergenic | S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1,EU.1.1,FL.20.2,FL.20,BQ.1 |
| intergenic | Q556K BA.4,BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BQ.1 |
| intergenic | R560C BQ.1 |
| intergenic | R560H EG.5.1.8,FY.4.1.1,BQ.1 |
| intergenic | A599A BA.5.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,FK.1.1,FL.15 |
| intergenic | N615N BA.4,BA.5.2.20,FU.2,BQ.1 |
| intergenic | V627I BA.4,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7 |
| intergenic | A656V BA.1.14,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.13,BA.5.6 |
| ORF1a | T666N / NSP2 |
| intergenic | T666N FU.1,BQ.1 |
| intergenic | L681F BA.2.12,BQ.1.13,EG.6.1 |
| intergenic | Y717Y BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,FK.1.1 |
| intergenic | N786N BA.5.2.34,BQ.1.13,BF.10,FL.1.5.2 |
| intergenic | N810N BA.5.2.20,EG.6.1,FL.10.1,BQ.1 |
| intergenic | L815L EG.5.1,FL.8,FU.1,BQ.1 |
| ORF1a | A819V / NSP3 |
| intergenic | A819V BQ.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | T891I BA.2.12,BA.5.1.24,BQ.1.2.3,FL.1.5 |
| intergenic | L897L BQ.1.1.8,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BQ.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | S966S BQ.1 |
| intergenic | L980L BQ.1 |
| intergenic | T999I BQ.1 |
| intergenic | A1049V BA.4.1.8,BQ.1.1.8,BA.5.5,FU.2 |
| intergenic | N1059N BA.4.1,BQ.1.13,BA.5.5,GA.4.1,FU.2 |
| intergenic | G1070G BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L1130L BQ.1 |
| intergenic | I1203I BA.5.1.2,BQ.1 |
| intergenic | T1240I BA.5.6,BQ.1 |
| intergenic | D1273D BA.5,BQ.1.1.8,BA.5.5,FL.10.1,EG.5.1.6,BQ.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | P1321P BA.5.6,BQ.1 |
| intergenic | Y1337Y BA.5,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BQ.1.2.3,FL.10.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | F1353fs BA.5.1.10,BA.5,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.10,CK.2,FL.1.5,BQ.1 |
| intergenic | R1376R BQ.1 |
| intergenic | E1413D BQ.1 |
| ORF1a | F1618L / NSP3 |
| intergenic | F1618L BQ.1 |
| intergenic | T1637I BQ.1 |
| intergenic | P1692S BA.4.1.8,BQ.1.13 |
| intergenic | Y1700Y BA.4.1,BQ.1.1.8,EG.6.1,FD.1.1,FU.2 |
| ORF1a | V1728V / NSP3 |
| intergenic | V1728V BQ.1 |
| ORF1a | P1786H / NSP3 |
| intergenic | P1786H BQ.1 |
| intergenic | T1822I BA.1.18,BA.4.1,FU.1,BQ.1 |
| intergenic | Y1868Y BA.4,BA.5.1.24,BF.26,EU.1.1,EG.6.1,BQ.1 |
| intergenic | F1925F BA.5.2.2,BF.28,BE.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,FL.10.1 |
| intergenic | T2007T BA.5,BQ.1.1.8,GA.4.1,FL.15,BQ.1 |
| intergenic | E2089D BQ.1 |
| intergenic | L2105F BQ.1 |
| intergenic | T2152I BA.1.17,BA.5.5,BQ.1.2.3 |
| intergenic | V2157I BQ.1 |
| intergenic | F2172F BQ.1.1.8,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,GK.2.1 |
| intergenic | Y2245Y BQ.1.1.8,BQ.1.2.3 |
| intergenic | D2299D BA.4,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1,BQ.1 |
| intergenic | V2324F BF.9,BQ.1.2.3 |
| intergenic | F2351F BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13 |
| intergenic | A2375S BQ.1 |
| intergenic | F2386F FK.1.1,BQ.1 |
| intergenic | T2532A FL.10.1,BQ.1 |
| intergenic | S2535L BF.28,BQ.1.2.3,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | Y2561Y FL.2.3,BQ.1 |
| intergenic | V2604I BQ.1 |
| intergenic | T2836I BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.1.8 |
| intergenic | P2870P BA.5.2.34,BA.5,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T2872M DV.7.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | V2943I BQ.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | L3034L BF.10,BQ.1.2.3 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8,DV.7.1,DV.7.1.2,BA.5.5,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | T3090I BA.5.2.2,BQ.1.13 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | TV3090II BQ.1 |
| intergenic | Y3109Y BQ.1 |
| intergenic | F3132F BQ.1 |
| ORF1a | V3197L / NSP4 |
| intergenic | V3197L BQ.1 |
| intergenic | E3228E BQ.1 |
| intergenic | L3238L BA.5.2.20,BF.26,BQ.1.13,BA.4.6,FL.10.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | F3329F BF.41,BQ.1.2.3,FL.20 |
| intergenic | L3338L BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BQ.1 |
| ORF1a | M3345I / NSP5 |
| intergenic | M3345I BA.5.1.24,BQ.1.2.3 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3 |
| intergenic | A3357A BA.4,BQ.1.13 |
| intergenic | N3358N CK.2,BQ.1.2.3 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6,FU.2,BA.2.3,BQ.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | D3492D BA.5.2.2,BQ.1 |
| intergenic | D3508D FL.1.5,FL.8,FL.15,BQ.1 |
| intergenic | H3580H BA.5.2.34,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1,BQ.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1 |
| intergenic | V3629V BA.5.2.20,BQ.1 |
| intergenic | H3633H BQ.1 |
| intergenic | L3644F BF.9,BQ.1.13,BA.5.5 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1 |
| intergenic | D3728D BA.4.1.8,BQ.1.1.8,BQ.1.2.3 |
| intergenic | A3730A BA.2.12,EG.6.1,GA.4.1,BA.2.3,BQ.1 |
| intergenic | T3750I BA.5.2.34,BA.4.1,BQ.1 |
| ORF1a | M3761V / NSP6 |
| intergenic | M3761V BQ.1 |
| intergenic | Y3765C BA.5.1.24,BQ.1.2.3 |
| intergenic | F3769F BA.5.1.30,BF.26,FD.1.1,BA.5.6,BQ.1 |
| intergenic | F3785F BF.9,EG.5.1.4,FD.1.1,BQ.1 |
| intergenic | C3790F BQ.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1 |
| ORF1a | L3829S / NSP6 |
| intergenic | L3829S BQ.1 |
| intergenic | V3871I BQ.1 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20 |
| intergenic | T3940T CK.2,BA.4.6,BQ.1 |
| intergenic | Y3954Y BA.1.14,BA.4,DV.7.1,BQ.1 |
| intergenic | A3956V BQ.1.2.3,BQ.1 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1 |
| intergenic | N3970S BQ.1 |
| intergenic | L4001L BQ.1 |
| intergenic | T4065I BQ.1 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BA.4.6,EG.5.1.3,BA.5.6,FU.1 |
| ORF1a | D4117G / NSP8 |
| intergenic | D4117G BQ.1 |
| ORF1a | N4134N / NSP8 |
| intergenic | N4134N BQ.1 |
| intergenic | T4161I BF.26,BA.4.6,BQ.1 |
| intergenic | N4173N BA.5,BQ.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | L4209L BA.4,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T4258I BQ.1.13,BQ.1 |
| intergenic | V4369I BQ.1 |
| intergenic | D4432G BQ.1 |
| intergenic | H4467H BA.5.1.10,BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y4567Y BA.5,EG.5.1,BQ.1 |
| intergenic | Y4665H BQ.1.1.8,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BQ.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | N4795N BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.5.5,BQ.1.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | N4796S BQ.1 |
| intergenic | F4820F BA.5.1.10,BA.4.1,BF.26,BQ.1.2.3,EG.5.1,BA.2.3 |
| intergenic | N4889N BQ.1 |
| intergenic | A4972A BA.4,BQ.1.13 |
| intergenic | T5072T BA.5.2.34,BQ.1.2.3 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EU.1.1,FD.1.1 |
| intergenic | T5093T BF.26,BQ.1 |
| intergenic | Y5111Y GJ.1,BQ.1 |
| intergenic | H5117H BA.4.1,BQ.1.13 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | D5152D BA.5.1.24,DV.7.1,CH.1.1.28,BF.26,EG.5.1.3,BQ.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | Y5162Y BQ.1 |
| ORF1b | Q5267Q / NSP12 |
| intergenic | Q5267Q BF.26,BQ.1 |
| intergenic | F5348F BF.10,BQ.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1 |
| intergenic | M5557I BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BQ.1 |
| intergenic | N5592S BQ.1.1.8,BQ.1.13,BQ.1 |
| intergenic | Y5630Y BQ.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | P5828L EG.5.2.1,FL.20,BQ.1 |
| intergenic | D5904D BQ.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | F6058F BQ.1 |
| intergenic | R6088C FL.1.5,BQ.1 |
| intergenic | F6123C BQ.1 |
| intergenic | T6131T BA.2.12,DV.7.1,EG.5.1.8,FK.1.1,FL.20.2,BQ.1 |
| intergenic | L6205L BA.5.1.10,BF.10,BQ.1 |
| ORF1b | M6240V / NSP14 |
| intergenic | M6240V BQ.1 |
| intergenic | S6299S BQ.1.1.8,BQ.1.13 |
| intergenic | L6308L BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.1.5,FD.1.1,GK.2.1 |
| intergenic | V6314V BA.4,BQ.1.13 |
| intergenic | DRYP6315EGCH BA.2.12,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.26,BA.4.6,FD.1.1,BQ.1 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3,EG.5.1,FL.10.1,FU.2,FL.20,BQ.1 |
| ORF1b | N6526N / NSP15 |
| intergenic | N6526N BQ.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| ORF1b | I6567V / NSP15 |
| intergenic | I6567V BQ.1 |
| intergenic | D6584D BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | A6623V DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FL.15 |
| intergenic | P6722L BQ.1 |
| intergenic | Y6813Y EG.5.1,BQ.1 |
| intergenic | D6928D BA.5.2.20,BQ.1 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1 |
| intergenic | S6964S BQ.1 |
| intergenic | R7014N BQ.1.1.8,BQ.1.2.3,BA.5.6 |
| intergenic | Q7036H BQ.1 |
| intergenic | Q7036Y BQ.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | Y28Y BQ.1 |
| intergenic | D53D BA.5,BA.5.1.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | F58F BA.5.1.30,BQ.1.13 |
| intergenic | S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1 |
| intergenic | T95A BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| S | T95A BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| intergenic | E96D BQ.1 |
| intergenic | S98F BA.5.1.10,FL.1.5,FD.1.1,FL.20,BQ.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | H146H BA.2.12,BA.5.2.34,BF.9,BQ.1 |
| intergenic | N185D DV.7.1,DV.7.1.2,BQ.1 |
| intergenic | F186F BA.5.1.2,BQ.1.1.8 |
| intergenic | N188N BQ.1 |
| intergenic | Y200Y BQ.1 |
| intergenic | N211_V213delinsIG BA.2.86.1,BQ.1.13 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,FK.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1 |
| intergenic | P251H BA.5,BQ.1 |
| intergenic | S255F BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,EG.5.1 |
| intergenic | S256L BA.5.1.2,BQ.1 |
| intergenic | T307I BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BF.28 |
| intergenic | I312I BQ.1 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | A419A BQ.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | K444T BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FK.1.1,BQ.1 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,FK.1.1,BA.5.6,BQ.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.5.2.3,FY.3.1,BQ.1 |
| intergenic | T547K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BQ.1.1.8,BA.1.15 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | E619K BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1 |
| intergenic | E619E BQ.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4,GA.4.1,FY.4.1.1,FL.20,GK.1.3 |
| intergenic | S708S BQ.1 |
| S | S708S BQ.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | T883I BF.26,BA.5.5,BQ.1 |
| intergenic | G932G BA.5.5,BQ.1.2.3 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | L984L BQ.1 |
| S | L984L BQ.1 |
| intergenic | V1122L BQ.1 |
| intergenic | P1143L BA.2.86.1,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | T1238A BQ.1 |
| S | T1238A BQ.1 |
| intergenic | C1248F BA.5.2.34,BQ.1.2.3 |
| intergenic | C1253C BA.5.2.2,BQ.1.2.3,EG.7 |
| intergenic | T9K BA.5.1.2,BQ.1.2.3 |
| intergenic | G18V BA.5.1.24,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D27Y BA.4.1.8,BA.5,BQ.1.2.3 |
| intergenic | A31A BQ.1 |
| intergenic | P36P BQ.1.13,BQ.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | R68I BQ.1 |
| intergenic | L71L BA.5,BQ.1.13,BA.5.6 |
| intergenic | L85F BQ.1 |
| intergenic | G100G EG.5.2.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | V112V BA.5.2.3,BA.5,BQ.1.1.8 |
| intergenic | F114V BQ.1 |
| ORF3a | F114V BQ.1 |
| intergenic | H150R BE.1.1,BQ.1.2.3 |
| ORF3a | H150R BE.1.1,BQ.1.2.3 |
| intergenic | T151I BQ.1 |
| intergenic | E194G BA.5,BQ.1 |
| ORF3a | E194G BA.5,BQ.1 |
| intergenic | E194D EG.5.2.1,BQ.1 |
| ORF3a | E194D BQ.1 |
| intergenic | Y206Y BA.4,BA.5,BQ.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | P240S BA.4,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S272S BA.5,BQ.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1 |
| intergenic | A104V BA.2.86.1,BE.1.1,BQ.1 |
| intergenic | L120L FL.10.1,FL.15,BA.2.3,BQ.1 |
| intergenic | H125Y BA.5,BA.5.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,EG.5.1 |
| intergenic | H155N BQ.1 |
| intergenic | H155Y BQ.1 |
| intergenic | Y196Y BQ.1 |
| intergenic | G202G BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1.2 |
| intergenic | Y31Y BA.5.1.24,BA.5,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BA.5.6 |
| intergenic | D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3,BF.41,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15 |
| intergenic | F6S FY.3.1,BQ.1 |
| intergenic | L7S BQ.1 |
| intergenic | A13A BQ.1 |
| intergenic | C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9,BA.5.2.20,BQ.1.13,CK.2,EG.6.1 |
| intergenic | Q94H BF.26,BQ.1.13,BQ.1.2.3 |
| intergenic | I2S BQ.1 |
| intergenic | A15S BA.2.12,EG.5.1.4,BQ.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1 |
| intergenic | P36S BA.5.1.10,BQ.1.2.3 |
| intergenic | P38S BA.5.5,FL.1.5,GK.2.1,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | V62V BA.5.2.20,BE.1.1,EG.5.1.4,EU.1.1,FL.20,BQ.1 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,FU.2,BQ.1 |
| intergenic | S69P BA.5.1.2,DV.7.1.2,BQ.1 |
| intergenic | I76I BQ.1 |
| intergenic | FI120VL BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BQ.1.13,EG.6.1,BA.5.6 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | Q39L BQ.1 |
| intergenic | T54T BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.13 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1,BA.5.6 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3 |
| intergenic | E136D BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BQ.1 |
| intergenic | A155S FL.15,BQ.1 |
| intergenic | L161F BA.5,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.15 |
| intergenic | T198T BQ.1 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | G214G BQ.1 |
| intergenic | Y268Y BA.5.1.10,BA.5,BQ.1.2.3 |
| intergenic | H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.5,EG.5.1.4,BA.2.3,BQ.1 |
| intergenic | P309P BA.4.1,BA.5.2.20,BF.10,BA.4.6,BQ.1 |
| intergenic | F315F BA.5.1.1,BA.5.1.30,FL.20.2,BQ.1 |
| intergenic | Y360Y BA.5.2.2,BA.5.2.3,BQ.1.1.8,FL.15,FU.1 |
| intergenic | T362I BA.5.1.24,BA.4.1,DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FU.2 |
| intergenic | E367E BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| intergenic | P383P BA.5.2.34,BE.1.1,BQ.1.13,FL.15 |
| intergenic | T391I BQ.1 |
| intergenic | L407L BQ.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | g.G-15T BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| intergenic | g.C-10T BA.5.1.10,BQ.1.2.3 |
| intergenic | g.C-3T BA.5.2.2,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,BQ.1 |
| intergenic | A8V FL.10.1,BQ.1 |
| intergenic | I13M BQ.1 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,FU.2,BQ.1 |
| intergenic | g.C29686T DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13 |
| intergenic | g.G29692T BA.5,BQ.1.13 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1 |
| intergenic | g.C-63T BA.5.1.10,BA.4,EG.10.1,FL.1.5,EG.6.1,FL.15,GK.1.3 |
| intergenic | g.C-59T GK.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | L16F FD.1.1,GK.1 |
| intergenic | V28A GK.1 |
| intergenic | E41K GK.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.10,DV.7.1.2,GK.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | D147G GK.1 |
| intergenic | I222I GK.1 |
| intergenic | T346I GK.1 |
| intergenic | P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.6,GK.2.1,GK.1 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BF.26,BF.10,CK.2,EU.1.1,GK.1 |
| intergenic | K458Q GK.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1 |
| intergenic | I523V FU.2,GK.1 |
| intergenic | L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.6.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | I573V GK.1 |
| intergenic | F617L FU.2,GK.1 |
| intergenic | L642F BA.4.1,BA.5.5,EG.5.1.6,GK.1 |
| intergenic | I740I BA.2.12,BA.5,CK.2,BA.4.6,FU.2,GK.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | V879V BA.2.12,BA.1.15,EG.7,GK.1.3 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | D928D EG.5.1,BA.5.6,GK.1 |
| intergenic | H1113Y BA.2.12,EG.5.2.1,GK.1 |
| intergenic | N1121T GK.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | L1441L BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1,FK.1.1,GK.1 |
| intergenic | L1457L GK.1 |
| intergenic | S1515S GK.1 |
| intergenic | T1597I BF.9,BA.4.6,GK.1 |
| intergenic | T1605T GK.1 |
| intergenic | N1709N BA.1.18,CK.2,FL.1.5.2,GK.1 |
| intergenic | K1781K BA.5.2.8,BF.26,GK.1 |
| intergenic | N1927N GK.1 |
| intergenic | T2007I FL.15.1.1,GK.1 |
| intergenic | P2046S BA.1.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.5.1.6,GK.1 |
| intergenic | D2060N GK.1 |
| intergenic | L2175L GK.1 |
| intergenic | G2207S BF.10,GK.1 |
| intergenic | S2214L GK.1 |
| intergenic | A2249V BF.28,EG.5.1,GK.1.3 |
| intergenic | T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15,EG.5.1.4,FL.2.3,FD.1.1,GK.1.3 |
| intergenic | M2374T BA.5.5,GK.1 |
| intergenic | S2433S BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | T2463T GK.1 |
| intergenic | I2501V GK.1 |
| intergenic | S2556S GK.1 |
| intergenic | A2584V BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,EG.7,EG.6.1,FL.10.1,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | D2592Y BA.5.2.3,GK.1 |
| intergenic | I2634V BA.5.1.24,GK.1.3 |
| intergenic | I2634I GK.1 |
| intergenic | V2715I GK.1 |
| intergenic | D2801D GK.1 |
| intergenic | D2824D GK.2.1,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | F3018F BA.4,BA.5,BF.28,BA.1.15,GK.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | S3218S GK.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | T3287I GK.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | K3577K GK.1 |
| intergenic | L3588L GK.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | I3737T CH.1.1.28,GK.1 |
| intergenic | V3748I GK.1 |
| intergenic | T3749A GK.1 |
| intergenic | A3755A GK.1 |
| intergenic | F3785S GK.1 |
| intergenic | V3810V GK.1 |
| intergenic | A3924A GK.1 |
| intergenic | P3952S BA.5.6,GK.1.3 |
| intergenic | D3994D GK.1 |
| intergenic | A4068S GK.2.1,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | T4129I FL.1.5.2,GK.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | M4316T GK.1 |
| intergenic | G4380G BA.5.1.24,GK.1.3 |
| intergenic | R4387R BA.4,BA.5.1.30,BF.28,FL.15,GK.1.3 |
| intergenic | P4486L BA.5.2.34,BF.26,BA.5.5,GK.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | G4737G GK.1 |
| intergenic | I4928I BA.5.2.3,GK.1 |
| intergenic | D5015D GK.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | T5193I GK.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | R5250R GK.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | P5377P GK.1 |
| intergenic | G5378S BA.4,GK.1 |
| intergenic | S5404G BA.5.1.2,BE.1.1,EG.5.1.3,GK.1 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | I5700V GK.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | G5818G EG.5.1.3,GK.1 |
| intergenic | N5827K GK.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | I5889I EG.5.1,GK.1 |
| intergenic | L5952L GK.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | I5999V GK.1 |
| intergenic | P6046S BA.5.1.24,EG.5.1.4,GK.1 |
| intergenic | I6075T GK.1 |
| intergenic | S6143S GK.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | T6618I GK.1 |
| intergenic | A6623V DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FL.15,GK.1 |
| intergenic | L6666L EG.5.1.3,GK.1 |
| intergenic | C6823C GK.1 |
| intergenic | Y6845Y BA.5.1.10,BA.5.6,GK.1.3 |
| intergenic | I6926V EG.5.1,GK.1 |
| intergenic | P7034P GK.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | T76N GK.1 |
| intergenic | D80D BA.5.1.1,FL.25,GK.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | N185D DV.7.1,DV.7.1.2,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | F186L GK.1 |
| intergenic | K187I GK.1 |
| intergenic | I210I GK.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | D215G FK.1.1,FU.2,GK.1.3 |
| intergenic | A222P GK.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | T299I BA.5,BA.5.1.2,EG.10.1,GK.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | A475V FL.15.1.1,GK.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | C525C GK.1 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1,FL.25,FU.2,GJ.1,GK.1 |
| intergenic | T573I EG.5.1,GK.1.3 |
| intergenic | E583Q FD.1.1,GK.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | Q677H GK.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | I692I BA.5.1.10,BA.4.6,FL.14,EG.6.1,FU.2,GK.1.3 |
| intergenic | S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4,GA.4.1,FY.4.1.1,FL.20,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | D936D BA.5.1.2,GK.1.3 |
| intergenic | S937S DV.7.1.2,EG.5.1.6,GK.1.3 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,GK.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | H1101H EG.10.1,EG.7,GK.1 |
| intergenic | T1117I EG.7,GK.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | S1161S GK.2.1,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | L1270L GK.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | T89I GK.1 |
| intergenic | TV89II GK.1 |
| intergenic | T89I BF.26,EG.5.1.8,FL.1.5,EG.5.1.4,FD.1.1,GK.1.3 |
| intergenic | L95F BA.5.1.1,GK.1 |
| intergenic | A99A FL.25,GK.1 |
| intergenic | R134H FU.2,GK.1 |
| intergenic | Y212Y DV.7.1.2,GK.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | T229I FL.15,FU.1,GK.1 |
| intergenic | F4F BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,GK.1.3 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | L34F EG.5.1.9,GK.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | L124L BA.2.12,BA.4,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.20,GK.1 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | I14M GK.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | T28I BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1 |
| intergenic | P45L BA.2.3,GK.1.3 |
| intergenic | G70S GK.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | W29fs GK.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | H17Y BA.5.2.20,EG.10.1,FL.1.5,EG.5.1.6,GK.1.3 |
| intergenic | P38S BA.5.5,FL.1.5,GK.2.1,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,FU.2,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | L95L GK.1 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1,BA.2.3,GK.2.1,GK.1 |
| intergenic | I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9,FL.15,FU.2,GK.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | S23T GK.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3 |
| intergenic | D98D BE.1.1,EG.5.1,GK.1 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1 |
| intergenic | G179S GK.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | P344P GK.1 |
| N | P344P GK.1 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2,GK.1.3 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,GK.1 |
| intergenic | N25N EG.10.1,EG.5.1.4,GK.1 |
| intergenic | F35Y GK.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1 |
| intergenic | g.G-56A GK.3.1 |
| intergenic | g.T-42C EU.1.1,GK.3.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | I95I GK.3.1 |
| intergenic | S100S GK.3.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | L204F BA.5.1.24,GK.3.1 |
| intergenic | Y229H GK.3.1 |
| intergenic | E256E GK.3.1 |
| intergenic | V274I GK.3.1 |
| intergenic | T403I BA.5.1.10,BQ.1,GK.3.1 |
| intergenic | A498V BA.5.1.1,GK.3.1 |
| intergenic | L562L GK.3.1 |
| intergenic | L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.6.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | E658E GK.3.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | A876S GK.3.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6,GK.2.1,GK.3.1 |
| intergenic | G1155C BA.5.1.2,EG.5.1.4,GK.3.1 |
| intergenic | D1273D BA.5,BQ.1.1.8,BA.5.5,FL.10.1,EG.5.1.6,BQ.1,GK.3.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | R1464R GK.3.1 |
| intergenic | R1628C BF.26,GK.3.1 |
| intergenic | A1707A BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,GK.3.1 |
| intergenic | Y1868Y BA.4,BA.5.1.24,BF.26,EU.1.1,EG.6.1,BQ.1,GK.3.1 |
| intergenic | P1977P BA.5.1.30,GK.3.1 |
| intergenic | T2007T BA.5,BQ.1.1.8,GA.4.1,FL.15,BQ.1,GK.3.1 |
| intergenic | A2033A EG.5.1.4,GK.3.1 |
| intergenic | F2334F BA.2.12,BF.26,EG.5.1.8,EU.1.1,GJ.1,GK.3.1 |
| intergenic | S2433S BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | D2650D GK.3.1 |
| intergenic | A2696A GK.3.1 |
| intergenic | D2824D GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | L2869F BA.5.2.8,GK.3.1 |
| intergenic | T2910I GK.3.1 |
| intergenic | A2994V BQ.1.1.8,GK.3.1 |
| intergenic | F3018F BA.4,BA.5,BF.28,BA.1.15,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | V3021V GK.3.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2,BF.9,BE.1.1,EG.5.1,FL.20,GK.3.1 |
| intergenic | P3302P GK.3.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | G3334V GK.3.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | D3479D BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1.8,GK.3.1 |
| intergenic | P3504L BA.5,GK.3.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | F3769F BA.5.1.30,BF.26,FD.1.1,BA.5.6,BQ.1,GK.3.1 |
| intergenic | A4068S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | D4117D GK.3.1 |
| intergenic | L4139L GK.3.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | T4355I BA.5,GK.3.1 |
| intergenic | P4619L BF.9,GK.3.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | T4786M BA.5.2.8,FL.2.3,GK.3.1 |
| intergenic | Q4884Q GK.3.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | T5195I BA.5.2.8,GK.3.1 |
| intergenic | 5227 GK.3.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | L5500F GK.3.1 |
| intergenic | P5566P EG.5.1.8,GK.3.1 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | R5766R FU.2,GK.3.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | P6065L GK.3.1 |
| intergenic | L6102L BA.4.1,BA.4.6,EG.6.1,FL.20.2,GK.2.1,GK.3.1 |
| intergenic | M6166V GK.3.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3,EG.5.1,FL.10.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GK.3.1 |
| intergenic | Y6540Y BQ.1.13,BF.10,FD.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GK.3.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | D6719N GK.3.1 |
| intergenic | S6739L BA.5.1.10,BF.28,FL.25,GK.3.1 |
| intergenic | L6749L FU.2,GK.3.1 |
| intergenic | S6964S BQ.1,GK.3.1 |
| intergenic | PR7013LN BA.5.1.10,GK.3.1 |
| intergenic | Q14E GK.3.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | S50P GK.3.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | S98F BA.5.1.10,FL.1.5,FD.1.1,FL.20,BQ.1,GK.3.1 |
| intergenic | V127I GK.3.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | G142_Y145delinsDD GK.3.1 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | A222S GK.3.1 |
| intergenic | H245Y GA.4.1,EG.5.1.6,GK.3.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | I312I BQ.1,GK.3.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | G381R GK.3.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | A475V FL.15.1.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | L753L GK.3.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | P809S GK.3.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | S1021S GK.3.1 |
| intergenic | G1085V GK.3.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | S1161S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BF.28,FL.1.5,GK.3.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | A39A GK.3.1 |
| intergenic | I63T FK.1.1,GK.3.1 |
| intergenic | T64T FK.1.1,GK.3.1 |
| intergenic | S166L BA.5.2.20,GK.3.1 |
| intergenic | T217T GK.3.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | D61L GK.3.1 |
| intergenic | D61_X62del GK.3.1 |
| intergenic | T11T GK.3.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | P38S BA.5.5,FL.1.5,GK.2.1,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | H40Q EG.5.1,GK.3.1 |
| intergenic | I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9,FL.15,FU.2,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | Q9Q BF.26,GK.3.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | S184F GK.3.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | T334T BE.1.1,GK.3.1 |
| intergenic | R385I GK.3.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | Q418L GK.3.1 |
| intergenic | g.C29719T GK.3.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.6.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | A876S GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | G1308G GK.3.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | S2433S BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | D2824D GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | A4068S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | T6500I GK.3.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | Y6645Y BA.5.2.2,GK.3.2 |
| intergenic | R7014R BA.5.2.34,BA.2.3,GK.3.2 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | D287Y GK.3.2 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | T572I FD.1.1,GK.3.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | S1161S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3,GK.3.2 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | P38S BA.5.5,FL.1.5,GK.2.1,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | L92L BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.2.3,GW.5 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | S302F BA.5.1.24,BF.9,FU.1,BA.2.3,GW.5 |
| intergenic | V597I GW.5 |
| intergenic | I694V GW.5 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | A964A BA.1.18,GW.5 |
| intergenic | D1127D GW.5 |
| intergenic | H1160Y BA.4.1.8,BA.4.1,GW.5 |
| intergenic | A1204V GW.5 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | H1545Y GW.5 |
| intergenic | I2057V GW.5 |
| ORF1a | P2079Q / NSP3 |
| intergenic | P2079Q GW.5 |
| ORF1a | L2084_T2087delinsS / NSP3 |
| intergenic | E2089G GW.5 |
| intergenic | F2172F BQ.1.1.8,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,GK.2.1,GW.5 |
| intergenic | R2726Q GW.5 |
| intergenic | T2872T EG.5.1.3,GK.2.1,GW.5 |
| intergenic | V2975V EG.5.2.1,GW.5 |
| intergenic | L3027F GW.5 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | S3259S GW.5 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1,BQ.1,GW.5 |
| intergenic | L3588F BA.5.6,GW.5 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | L3691L GW.5 |
| intergenic | F3769F BA.5.1.30,BF.26,FD.1.1,BA.5.6,BQ.1,GK.3.1,GW.5 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5 |
| intergenic | P3831P BQ.1.2.3,EG.5.1,GW.5 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BA.4.6,EG.5.1.3,BA.5.6,FU.1,GW.5 |
| intergenic | P4120L GW.5 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | P4220L BA.5.1.24,BA.5.1.1,GW.5 |
| intergenic | R4251R GW.5 |
| intergenic | L4481S GW.5 |
| intergenic | K4483K GW.5 |
| intergenic | D4532D BF.28,BF.26,BA.5.6,GW.5 |
| intergenic | Y4548Y GW.5 |
| intergenic | V4594V GW.5 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | V4802V EG.6.1,GW.5 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | I5475V GW.5 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | Y6682Y GW.5 |
| intergenic | P6714S GW.5 |
| intergenic | L6848L EG.5.1.8,GW.5 |
| intergenic | N7033N GW.5 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | S98S GW.5 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | QG183EA GW.5 |
| intergenic | N185_F186delinsI GW.5 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | A475V FL.15.1.1,GK.1,GK.3.1,GW.5 |
| intergenic | ST477NI GW.5 |
| intergenic | N481K FL.1.5.2,GW.5 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1,FL.25,FU.2,GJ.1,GK.1,GW.5 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | S735L BQ.1.1.8,GW.5 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | N824N BA.4.1,GW.5 |
| intergenic | L828L GW.5 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | M1050I GW.5 |
| intergenic | H1101H EG.10.1,EG.7,GK.1,GW.5 |
| intergenic | G1124A GW.5 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | G100S GW.5 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | L29F BA.5.2.20,GW.5 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | F30C GW.5 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | L60L GW.5 |
| intergenic | V62V BA.5.2.20,BE.1.1,EG.5.1.4,EU.1.1,FL.20,BQ.1,GW.5 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | L56L BA.4.1,BA.5.1.30,FL.20.2,GW.5 |
| intergenic | P80S GW.5 |
| intergenic | D82D BA.5,DV.7.1,GW.5 |
| intergenic | G96D GW.5 |
| intergenic | K100Q GW.5 |
| intergenic | N150N GW.5 |
| N | T165T GJ.1.2,GW.5 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | T379I BF.28,FU.1,GW.5 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | A419A BF.20,EG.5.1.4,GW.5 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1,GK.3.2,GW.5 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5 |
| intergenic | g.G29810T GW.5 |
| intergenic | g.T-65C GS.3 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | T403I BA.5.1.10,BQ.1,GK.3.1,GS.3 |
| intergenic | I463I GS.3 |
| intergenic | S505S BA.4,BA.5.1.30,DV.7.1.2,GS.3 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3 |
| intergenic | L790L GS.3 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | S1106N BQ.1.2.3,GK.2.1,GS.3 |
| intergenic | D1258D FL.1.5,GS.3 |
| intergenic | L1296L GS.3 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | 1324 GS.3 |
| intergenic | D1323D GS.3 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | L1523L BA.5.2.34,GS.3 |
| intergenic | D1532N GS.3 |
| intergenic | L1627L BA.5.1.30,FU.1,FU.2,GS.3 |
| intergenic | Q1759R GS.3 |
| intergenic | G2091S GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3 |
| intergenic | T2093I GS.3 |
| intergenic | V2866M GS.3 |
| intergenic | A2891A GS.3 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | L3338L BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BQ.1,GS.3 |
| intergenic | P3371S BF.41,GS.3 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | L3588F BA.5.6,GW.5,GS.3 |
| intergenic | M3616T GS.3 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | A4276S GS.3 |
| intergenic | F4448F GS.3 |
| intergenic | T4668T BA.1.15,GS.3 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | T4794T GS.3 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | I5239I EU.1.1,GS.3 |
| intergenic | D5425D GS.3 |
| intergenic | Y5444Y BA.5.1.10,GS.3 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | E6002D GS.3 |
| intergenic | N6333N FL.8,GS.3 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | F6459L GS.3 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | F6731L GS.3 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | R190S BQ.1.2.3,GS.3 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | D253G GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | I818I BA.5.2.20,GS.3 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | F28F BF.28,GS.3 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | A13V GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3 |
| intergenic | K72N FK.1.1,GS.3 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | F66F BA.5.2.20,GS.3 |
| intergenic | N154Y GS.3 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3 |
| intergenic | g.G29706T FL.1.5,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | G82D GS.4 |
| intergenic | L107L FD.1.1,GS.4 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | A181T GS.4 |
| intergenic | D203G GS.4 |
| intergenic | K322R GS.4 |
| intergenic | S443S BA.5,EU.1.1,FU.2,GS.4 |
| intergenic | V627F BA.5,BA.4.1,GS.4 |
| intergenic | K684K EG.5.1,GS.4 |
| intergenic | L686L GS.4 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | P892L GK.2.1,GS.4 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6,GK.2.1,GK.3.1,GS.4 |
| intergenic | D954Y GS.4 |
| intergenic | S1106S EG.10.1,GS.4 |
| intergenic | V1173V GS.4 |
| intergenic | I1203T BA.4.6,GS.4 |
| intergenic | D1266D GS.4 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | D1323D BA.5.1.24,FL.10.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.4 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | R1467K GS.4 |
| intergenic | D1585D BE.1.1,GS.4 |
| intergenic | H1652H BQ.1.1.8,GS.4 |
| intergenic | T1788M BA.4.6,FL.20.2,GS.4 |
| intergenic | S2024L BA.5.2.2,FL.8,FL.20,GS.4 |
| intergenic | L2028L GS.4 |
| intergenic | G2091S GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4 |
| intergenic | T2124I BQ.1.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,FU.2,GS.4 |
| intergenic | V2252V GS.4 |
| intergenic | A2345V GS.4 |
| intergenic | A2557A BA.1.14,GS.4 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | D3222D BA.5.1.24,BF.26,FU.2,GS.4 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | Y3300Y EG.5.1,GS.4 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | F3397F EG.5.1,FL.20,GS.4 |
| intergenic | L3591L DV.7.1.2,GS.4 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | R3756R GS.4 |
| intergenic | G3757S BA.4.1,GS.4 |
| intergenic | F3797F GS.4 |
| intergenic | D4166A GS.4 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | T4355I BA.5,GK.3.1,GS.4 |
| intergenic | R4565H GS.4 |
| intergenic | T4640T BA.5.1.1,GS.4 |
| intergenic | T4668T BA.1.15,GS.3,GS.4 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | V4797F GS.4 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | T5563I GS.4 |
| intergenic | I5582I GS.4 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | L5762L BA.5.1.10,BA.5.1.30,BA.4.6,GS.4 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | Y6160Y BF.28,FL.1.5,BA.5.6,FY.4.1.1,GS.4 |
| intergenic | A6192A GS.4 |
| intergenic | V6241I EG.5.1,FD.1.1,GS.4 |
| intergenic | R6316R GS.4 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | D6374G GS.4 |
| intergenic | Y6540Y BQ.1.13,BF.10,FD.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GK.3.1,GS.4 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | A6997A BA.4,BA.5,BA.5.1.1,EG.10.1,FY.3.1,GS.4 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | Y28Y BQ.1,GS.4 |
| intergenic | L56L GS.4 |
| intergenic | T76I BA.5.5,FL.14,GS.4 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | L216L GS.4 |
| intergenic | D253G GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | S735S EG.7,GS.4 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | T827I GS.4 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | Y1110Y FD.1.1,GS.4 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | E1262E GS.4 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | A103A GS.4 |
| intergenic | G172C BQ.1.13,GS.4 |
| intergenic | T175I BA.5.1.30,BF.26,EG.5.2.1,GJ.1.2.6,GS.4 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | V244V GS.4 |
| intergenic | S253S BA.2.12,BE.1.1,GS.4 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | L21F EG.5.1.3,GS.4 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | A104V BA.2.86.1,BE.1.1,BQ.1,GS.4 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | L29L BA.5,GS.4 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | A13V GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4 |
| intergenic | H47N BA.5,BF.28,BA.4.6,GS.4 |
| intergenic | A79A GS.4 |
| intergenic | E91D EG.5.1.3,GS.4 |
| intergenic | I110I GS.4 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | L32F BA.4,GS.4 |
| intergenic | Q91X GS.4 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | G30_S33delinsA GS.4 |
| intergenic | H145Y DV.7.1.2,GS.4 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | Q242R GS.4 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | g.GG29705GT GS.4 |
| intergenic | g.GG29705TT GS.4 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | g.CG-25_-24TA GK.2 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | G49G BA.5.1.24,GK.2 |
| intergenic | Q66Q BA.5.1.24,BF.26,GK.2.1 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,GK.2 |
| intergenic | G98D GK.2 |
| intergenic | R124C CK.2,GK.2 |
| intergenic | A131T GK.2 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | D144D GK.2 |
| intergenic | D203D BA.5.1.24,BA.4.6,GK.2 |
| intergenic | R226G GK.2 |
| intergenic | P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.6,GK.2.1,GK.1 |
| intergenic | I475T GK.2 |
| intergenic | A540V BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.13,GK.2.1 |
| intergenic | L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.6.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2 |
| intergenic | I616I BF.9,GK.2 |
| intergenic | D762D BA.5.5,GK.2.1 |
| intergenic | A776A GK.2 |
| intergenic | K798N GK.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | L853L GK.2.1,GK.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6,GK.2.1,GK.3.1,GS.4 |
| intergenic | Q990Q BF.26,GK.2 |
| intergenic | P1010T GK.2 |
| intergenic | S1106N BQ.1.2.3,GK.2.1,GS.3 |
| intergenic | R1170H GK.2 |
| intergenic | D1184D BE.1.1,BA.5.6,GK.2 |
| intergenic | N1252N GK.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | L1441L BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1,FK.1.1,GK.1,GK.2 |
| intergenic | S1476S GK.2 |
| intergenic | S1510F FL.25,GK.2 |
| intergenic | N1540N BA.4.6,EG.7,GK.2 |
| intergenic | D1547N BA.5.2.20,GK.2.1 |
| intergenic | R1628C BF.26,GK.3.1,GK.2 |
| intergenic | T1638A GK.2 |
| intergenic | Q1757Q GK.2 |
| intergenic | P1786S BA.5.2.8,BA.5.2.20,BE.1.1,GK.2.1 |
| intergenic | I2010T GK.2 |
| intergenic | S2015S BA.2.86.1,BA.2.12,EG.5.1.3,FD.1.1,GK.2 |
| intergenic | P2018P GK.2 |
| intergenic | N2065S GK.2 |
| intergenic | P2079L BA.5.2.20,GK.2 |
| intergenic | G2091S GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | L2117L GK.2 |
| intergenic | F2172F BQ.1.1.8,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,GK.2.1,GW.5 |
| intergenic | P2221S EG.6.1,GK.2 |
| intergenic | I2231V FL.10.1,GK.2 |
| intergenic | T2274I BA.5.1.1,EG.6.1,GK.2 |
| intergenic | A2279V EG.5.1,GK.2 |
| intergenic | F2338L GK.2 |
| intergenic | I2385I BA.4,DV.7.1,FL.10.1,GK.2 |
| intergenic | S2433S BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2 |
| intergenic | D2492A GK.2 |
| intergenic | S2500S GK.2 |
| intergenic | G2640G GK.2 |
| intergenic | S2797F BA.1.17,BF.26,EG.5.1.6,GK.2 |
| intergenic | D2824D GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2 |
| intergenic | Y2845Y GK.2 |
| intergenic | T2872T EG.5.1.3,GK.2.1,GW.5 |
| intergenic | T2978T GK.2 |
| intergenic | F2979F GK.2 |
| intergenic | V3005I FU.1,GK.2.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | I3126I GK.2 |
| intergenic | L3198L BA.2.12,BA.5.2.8,FU.2,GK.2 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | N3243N GK.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | L3313L FD.1.1,GK.2 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2 |
| intergenic | P3359P GK.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | F3397F EG.5.1,FL.20,GS.4,GK.2 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1,BQ.1,GW.5,GK.2 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2 |
| ORF1a | H3631H / NSP6 |
| intergenic | H3631H BQ.1.1.8,GJ.1.2.6,GK.2 |
| intergenic | T3646T FU.1,GK.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | M3752I EG.5.1.8,GK.2 |
| intergenic | N3896N BA.5.1.1,GK.2 |
| intergenic | A4068S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2 |
| intergenic | Q4151R BA.5.2.8,GK.2 |
| intergenic | L4185L EG.7,EG.5.1,GK.2 |
| intergenic | D4190D GK.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | A4357A DV.7.1.2,EG.5.1,GK.2 |
| intergenic | D4384D EG.5.1,FL.15,GK.2.1 |
| intergenic | T4640T BA.5.1.1,GS.4,GK.2 |
| intergenic | T4711I GK.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | N4748N GK.2 |
| intergenic | G4824G GK.2 |
| intergenic | I4886I BA.4.6,GK.2 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| ORF1b | S5164C / NSP12 |
| intergenic | T5195T GK.2 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | Q5324Q GK.2 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2 |
| intergenic | P5377S BA.4,BA.5.1.24,BF.28,EG.5.1,FL.15,GK.2.1 |
| intergenic | T5435I EG.5.1.4,FU.2,GK.2 |
| intergenic | S5588S GK.2 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | F5746F BA.2.12,BA.5.2.3,FD.1.1,BA.2.3,GK.2 |
| intergenic | K5784R FL.2.3,EG.5.1,GK.2 |
| intergenic | K5832K GK.2 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | F6014C GK.2 |
| intergenic | M6094I GK.2 |
| intergenic | L6102L BA.4.1,BA.4.6,EG.6.1,FL.20.2,GK.2.1,GK.3.1 |
| intergenic | P6128S BQ.1.1.8,FL.25,GK.2.1 |
| intergenic | H6239H FL.15,GK.2 |
| intergenic | L6308L BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.1.5,FD.1.1,GK.2.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | P6368S BA.5.1.24,GK.2 |
| intergenic | D6440D BF.10,GK.2 |
| intergenic | V6474L GK.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | V6573V BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,FU.1,GK.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | V6688I GA.4.1,GK.2 |
| intergenic | P6714L GK.2 |
| intergenic | S6739L BA.5.1.10,BF.28,FL.25,GK.3.1,GK.2 |
| intergenic | V6772L BA.5.2.2,BA.5.1.1,BF.28,EG.5.1.3,GK.2 |
| intergenic | M6782T GK.2 |
| intergenic | Y6794H GK.2 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1 |
| intergenic | A6960A GK.2 |
| intergenic | R7014H BA.5.2.34,GK.2.1 |
| intergenic | I7065T GK.2 |
| intergenic | I7079T GK.2 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | S45S FL.10.1,GK.2.1 |
| intergenic | H69Y EG.5.1.8,GK.2 |
| intergenic | G72R BQ.1.13,GK.2.1 |
| intergenic | V83A GK.2 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5,GK.2 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2 |
| intergenic | S151I GK.2 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | L216F BA.2.86.1,EG.5.1.3,GK.2.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2 |
| intergenic | P330S FU.2,GK.2 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | R346T FD.1.1,GK.2 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4 |
| intergenic | N354N GK.2 |
| intergenic | N354S GK.2 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2 |
| intergenic | N481D GK.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | S494P EG.10.1,EG.5.1,EG.5.1.6,FY.4.1.1,GK.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | V511I GK.2.1,GK.2 |
| intergenic | N606N DV.7.1.2,EG.5.1.6,GK.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | F643del GK.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | P681R BA.2.86.1,FL.1.5.2,GK.2 |
| intergenic | R683Q GK.2 |
| intergenic | S691S FL.10.1,FL.15,GK.2 |
| intergenic | L727L BQ.1.13,GK.2.1,GK.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | P809S GK.3.1,GK.2 |
| intergenic | S816S GK.2 |
| intergenic | I834V GK.2 |
| intergenic | T912T GK.2 |
| intergenic | S929I GK.2 |
| intergenic | I931I GK.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | P1162L GK.2 |
| intergenic | S1161S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2 |
| intergenic | I1169I BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,GK.2 |
| intergenic | C1243F BA.2.3,GK.2.1 |
| intergenic | D1260N BE.1.1,GK.2 |
| intergenic | T1273I GK.2 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1,EG.5.1.6,GK.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | H78Y BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.20,BF.28,EG.5.1,GK.2.1 |
| intergenic | V97I BF.26,EG.6.1,GK.2 |
| intergenic | G100C BA.5.1.24,GK.2 |
| intergenic | L106L BA.5.2.2,BA.5.1.10,CK.2,GK.2 |
| intergenic | S171L GK.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | H247H FL.15,GK.2.1,GK.2 |
| intergenic | S253S BA.2.12,BE.1.1,GS.4,GK.2 |
| intergenic | X276X GK.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10,BF.20,BA.5.1.2,FK.1.1,FD.1.1,FL.25,GK.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | W75L GK.2 |
| intergenic | T77T BA.4.6,EG.5.1,FL.15,FL.20,GK.2 |
| intergenic | A85V GK.2 |
| intergenic | I97T GK.2 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | L129M GK.2 |
| intergenic | S136N GK.2 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | E55D GK.2 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | g.G-4T GK.2 |
| ORF7a | A8E GK.2 |
| intergenic | T28I BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9,BA.5.2.20,BQ.1.13,CK.2,EG.6.1,GK.2 |
| intergenic | Q90Q GK.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | L34L BA.5.2.34,GK.2.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2 |
| intergenic | T11I FU.1,GK.2.1 |
| intergenic | Y31H GK.2 |
| intergenic | P38S BA.5.5,FL.1.5,GK.2.1,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2 |
| intergenic | C90Y BE.1.1,EG.6.1,GK.2 |
| intergenic | C102F EG.7,GK.2 |
| intergenic | C102Y GK.2 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1,BA.2.3,GK.2.1,GK.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | P20P BA.5.5,GK.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2 |
| intergenic | A50A BF.26,BA.2.3,GK.2.1 |
| intergenic | F66F BA.5.2.20,GS.3,GK.2 |
| intergenic | A90S GK.2 |
| intergenic | A152S BA.5.1.10,BA.5.1.2,GK.2.1 |
| intergenic | T166I DV.7.1,FL.15,GK.2 |
| intergenic | P168S GK.2 |
| intergenic | R195K GK.2 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | A208A GK.2 |
| intergenic | T271I BA.5.1.10,EU.1.1,GK.2 |
| intergenic | P309P BA.4.1,BA.5.2.20,BF.10,BA.4.6,BQ.1,GK.2 |
| intergenic | L353L BA.5.2.34,GK.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | Q418L GK.3.1,GK.2 |
| intergenic | g.C-12T GK.2 |
| intergenic | g.G29688T BF.10,GK.2.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | S74S CH.1.1.28,GZ.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | S302F BA.5.1.24,BF.9,FU.1,BA.2.3,GW.5,GZ.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | N869S FK.1.1,GZ.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | S994N GZ.1 |
| intergenic | T1055I CH.1.1.28,GZ.1 |
| intergenic | N1109N GZ.1 |
| ORF1a | K1194K / NSP3 |
| intergenic | K1194K GZ.1 |
| intergenic | V1211L GZ.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | D1323D BA.5.1.24,FL.10.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.4,GZ.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| ORF1a | S1400L / NSP3 |
| intergenic | S1400L GZ.1 |
| intergenic | Q1412Q GZ.1 |
| intergenic | G2091S GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| ORF1a | P2134H / NSP3 |
| intergenic | P2134H GZ.1 |
| intergenic | S2224F GZ.1 |
| intergenic | L2318L GZ.1 |
| ORF1a | A2925A / NSP4 |
| intergenic | A2925A GZ.1 |
| intergenic | H2986H BE.1.1,CH.1.1.28,GZ.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | L3198L BA.2.12,BA.5.2.8,FU.2,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | N3801N BA.5.2.34,GZ.1 |
| intergenic | S3834S GZ.1 |
| intergenic | D3936D BA.5.1.2,GZ.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | T4217I BA.5.1.2,GZ.1 |
| intergenic | P4619L BF.9,GK.3.1,GZ.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | T4736I BA.5.1.30,GZ.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | H5488Y BF.26,EG.5.1,BA.5.6,GZ.1 |
| ORF1b | T5675A / NSP13 |
| intergenic | T5675A GZ.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | M6166T GZ.1 |
| ORF1b | P6267P / NSP14 |
| intergenic | P6267P BA.4.6,GZ.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | I6537I BE.1.1,GZ.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| ORF1b | D6762Y / NSP15 |
| intergenic | D6762Y GZ.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | QG183EV GZ.1 |
| intergenic | F186L GK.1,GZ.1 |
| intergenic | D198G GZ.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | D253G GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1 |
| intergenic | L368I GZ.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | ST477NQ GZ.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | N501Y GZ.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | T768S GZ.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | T1009I GZ.1 |
| intergenic | V1129I BF.10,GZ.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6,GZ.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | A13V GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1 |
| intergenic | 19 EG.5.1.4,FK.1.1,GZ.1 |
| intergenic | L18L EG.5.1.4,GZ.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | N27K GZ.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | A273S BA.5.2.34,GZ.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | g.C-13A BF.26,GZ.1 |
| intergenic | g.G29706T FL.1.5,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GZ.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | R171R HK.7 |
| intergenic | P193S HK.7 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | Q990L HK.7 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | H1500R DV.7.1,HK.7 |
| intergenic | R1701R HK.7 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7 |
| intergenic | T1908R HK.7 |
| intergenic | F1960F FU.2,HK.7 |
| intergenic | S2015N FK.1.1,HK.7 |
| intergenic | H2092H GK.2.1,HK.7 |
| intergenic | L2371F HK.7 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | Q3536L HK.7 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | G4222S HK.7 |
| intergenic | D4455N EG.5.1,HK.7 |
| intergenic | R4510C HK.7 |
| intergenic | E4669V HK.7 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | T5198I HK.7 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7 |
| intergenic | Y5593H HK.7 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | V6607I HK.7 |
| intergenic | P6810S HK.7 |
| intergenic | A7002S HK.7 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.15,FL.20,HK.7 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | N148T FL.15,FU.2,HK.7 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | P384P HK.7 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | I692I BA.5.1.10,BA.4.6,FL.14,EG.6.1,FU.2,GK.1.3,HK.7 |
| intergenic | N703K HK.7 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | T961T HK.7 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | G1267R HK.7 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1,EG.5.1.6,GK.2,HK.7 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | T151I BQ.1,HK.7 |
| intergenic | S166L BA.5.2.20,GK.3.1,HK.7 |
| intergenic | DT222GI HK.7 |
| intergenic | T223I HK.7 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | I161I BA.5.2.3,BF.10,FD.1.1,HK.7 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7 |
| intergenic | 19 EG.5.1.4,FK.1.1,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | L18L EG.5.1.4,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | F3L HK.7 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7 |
| intergenic | P85S FD.1.1,FL.25,HK.7 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | PR13LC HK.7 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1,BF.26,EG.5.1,BA.5.6,FL.15,HK.7 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7 |
| intergenic | Y26Y HK.7 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7 |
| intergenic | g.C-166T BA.5.2.20,BQ.1.2.3,GK.1.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | E37D GK.1.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | S74S CH.1.1.28,GZ.1,GK.1.1 |
| intergenic | G82_M85delinsV BF.20,GK.1.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1 |
| intergenic | K261R GK.1.1 |
| intergenic | G295C GK.1.1 |
| intergenic | G295G BA.5.5,GK.1.1 |
| intergenic | H374H BA.5.1.10,FY.3.1,GK.1.1 |
| intergenic | K468E GK.1.1 |
| intergenic | K492Q GK.1.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1 |
| intergenic | L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.6.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1 |
| intergenic | P626P BA.4.6,EG.5.1,GK.1.1 |
| intergenic | G645S GK.1.1 |
| intergenic | Q663Q GK.1.1 |
| intergenic | L766L GK.1.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | P943S GK.1.1 |
| intergenic | V1056V CK.2,FU.2,GK.1.1 |
| intergenic | L1243L GK.1.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | H1545H BF.26,FU.2,GK.1.1 |
| intergenic | K1569R GK.1.1 |
| intergenic | N1576N FD.1.1,GK.1.1 |
| intergenic | P1810L GJ.1,GK.1.1 |
| intergenic | P1811P GK.1.1 |
| intergenic | P2018S GK.1.1 |
| intergenic | S2030L DV.7.1,GK.1.1 |
| intergenic | L2122F BQ.1.2.3,GK.1.1 |
| intergenic | S2433S BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1 |
| intergenic | D2525D DV.7.1.2,FU.2,GK.1.1 |
| intergenic | V2665F GK.1.1 |
| intergenic | D2717N GK.1.1 |
| intergenic | D2824D GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | A3079V GK.1.1 |
| intergenic | F3085F GK.1.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | L3198L BA.2.12,BA.5.2.8,FU.2,GK.2,GZ.1,GK.1.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2,BF.9,BE.1.1,EG.5.1,FL.20,GK.3.1,GK.1.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | A3357A BA.4,BQ.1.13,GK.1.1 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1 |
| intergenic | A3379V GK.1.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1 |
| intergenic | R3662C GK.1.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | L3754L GK.1.1 |
| intergenic | L3781I GK.1.1 |
| intergenic | E3932G GK.1.1 |
| intergenic | T3940T CK.2,BA.4.6,BQ.1,GK.1.1 |
| intergenic | L4059L GK.1.1 |
| intergenic | I4061T GK.1.1 |
| intergenic | A4068S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1 |
| intergenic | T4158N GK.1.1 |
| intergenic | T4175A FU.1,GK.1.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | L4779L BA.4,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FY.3.1,GK.1.1 |
| intergenic | F4811F BA.2.12,GK.1.1 |
| intergenic | V4865I GK.1.1 |
| intergenic | D4891D FL.15,GK.1.1 |
| intergenic | L4919L GK.1.1 |
| intergenic | A4972A BA.4,BQ.1.13,GK.1.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | N5105N GK.1.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | S5160N GK.1.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | I5229I FL.15,GK.1.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1 |
| intergenic | H5635H GK.1.1 |
| intergenic | V5680V BA.4.1.8,BF.28,FL.1.5,EG.7,FU.1,GK.1.1 |
| intergenic | I5694M GK.1.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | V5808F GK.1.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | L5932L BA.5.2.34,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.2.3,GJ.1,GK.1.1 |
| intergenic | T5956I BA.5.2.2,BA.5,FD.1.1,GK.1.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | L6082F BA.2.12,BF.28,GK.1.1 |
| intergenic | V6215I GK.1.1 |
| intergenic | I6263V GK.1.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | L6454L GK.1.1 |
| intergenic | G6469E GK.1.1 |
| intergenic | A6560A GK.1.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | A6623A EG.5.1.4,GK.1.1 |
| intergenic | F6628F BA.5,BA.5.5,GK.1.1 |
| intergenic | P6642P GK.1.1 |
| intergenic | Q6850Q GK.1.1 |
| intergenic | T6854I BA.4,GK.1.1 |
| intergenic | P7049P GK.1.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS GK.1.1 |
| intergenic | P25_A27del GK.1.1 |
| intergenic | F32L GK.1.1 |
| S | F32L GK.1.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | S94A GK.1.3,GK.1.1 |
| intergenic | S98F BA.5.1.10,FL.1.5,FD.1.1,FL.20,BQ.1,GK.3.1,GK.1.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5,GK.2,GK.1.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | S256L BA.5.1.2,BQ.1,GK.1.1 |
| intergenic | A264S GK.1.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.1.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | STP477NKL GK.1.1 |
| intergenic | EGF484AGP EG.5.1.8,EG.7,GK.1.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | F559F GK.1.1 |
| intergenic | T573I EG.5.1,GK.1.3,GK.1.1 |
| intergenic | E583D GK.1.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | A626S GK.1.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4,GA.4.1,FY.4.1.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.1.1 |
| intergenic | P728P BF.26,GK.1.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | N824N BA.4.1,GW.5,GK.1.1 |
| intergenic | D936D BA.5.1.2,GK.1.3,GK.1.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | G1124V BF.9,GK.1.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | S1161S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1 |
| intergenic | N1178N BQ.1.1.8,GK.1.1 |
| intergenic | K1191R GK.1.1 |
| intergenic | I1216M GK.1.1 |
| intergenic | S1252A GK.1.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | D27H EG.5.1,FL.1.5.2,GK.1.1 |
| intergenic | D27D GK.1.1 |
| intergenic | A54V EG.5.1.9,GK.1.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | T89I BF.26,EG.5.1.8,FL.1.5,EG.5.1.4,FD.1.1,GK.1.3,GK.1.1 |
| intergenic | T175I BA.5.1.30,BF.26,EG.5.2.1,GJ.1.2.6,GS.4,GK.1.1 |
| intergenic | H182Y GK.1.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1 |
| intergenic | Y264Y GK.1.1 |
| intergenic | D265D FY.4.1.1,GK.1.1 |
| intergenic | S272S BA.5,BQ.1,GK.1.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | N15N GK.1.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | Y71Y EG.5.1.4,FL.15,BA.2.3,GK.1.1 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3,GK.3.2,GK.1.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1 |
| intergenic | L181L BA.5.1.24,GK.1.1 |
| intergenic | L16L BA.5.1.1,BA.5.1.2,FK.1.1,FD.1.1,GK.1.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | Y31Y BA.5.1.24,BA.5,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BA.5.6,GK.1.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | P34S GK.1.1 |
| intergenic | H47N BA.5,BF.28,BA.4.6,GS.4,GK.1.1 |
| intergenic | G70C GK.1.1 |
| intergenic | A15S BA.2.12,EG.5.1.4,BQ.1,GK.1.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1 |
| intergenic | L32F BA.4,GS.4,GK.1.1 |
| intergenic | A43V BF.41,GK.1.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | GI8X GK.1.1 |
| intergenic | H28R GK.1.1 |
| intergenic | D35Y FY.3.1,GK.1.1 |
| intergenic | P38S BA.5.5,FL.1.5,GK.2.1,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1 |
| intergenic | R52I FY.3.1,GK.1.1 |
| intergenic | S69S GK.1.1 |
| intergenic | Q72H GK.1.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | D22A GK.1.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | F53F BE.1.1,EG.5.1,GK.1.1 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1,BA.5.6,GK.1.1 |
| intergenic | P117P BA.2.12,GK.1.1 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1,GK.1.1 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1,FL.15,BA.2.3,GK.1.1 |
| intergenic | P162L GK.1.1 |
| intergenic | A173V BA.5.2.20,BA.4.6,EG.7,EG.5.1.4,EU.1.1,GK.1.1 |
| intergenic | Q181K GK.1.1 |
| intergenic | T198I GK.1.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | G287G FL.10.1,EG.5.1.6,GK.1.1 |
| intergenic | T379T GK.1.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,FU.2,BQ.1,GK.1.1 |
| intergenic | g.G29706A BA.5.1.2,GK.1.1 |
| intergenic | g.CACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29730CACC GK.1.1 |
| intergenic | g.CACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29730TACC GK.1.1 |
| intergenic | g.C-160T BA.5.1.24,BE.1.1,BA.1.15,EG.5.1.3,GY.5 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | M297I GY.5 |
| intergenic | G327D GY.5 |
| intergenic | S443F BA.5.2.2,BF.41,BA.5.2.20,FL.20,GY.5 |
| intergenic | E444E GY.5 |
| intergenic | L450F EG.7,GY.5 |
| intergenic | V606I BF.9,GY.5 |
| intergenic | G715G BE.1.1,GY.5 |
| ORF1a | A735S / NSP2 |
| intergenic | A735S GY.5 |
| intergenic | I740I BA.2.12,BA.5,CK.2,BA.4.6,FU.2,GK.1,GY.5 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | E913D GY.5 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | P926H GY.5 |
| intergenic | S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6,GK.2.1,GK.3.1,GS.4,GY.5 |
| ORF1a | D954D / NSP3 |
| intergenic | D954D GY.5 |
| intergenic | E1142K GY.5 |
| intergenic | R1170R BE.1.1,GY.5 |
| ORF1a | S1195N / NSP3 |
| intergenic | S1195N GY.5 |
| intergenic | E1205D GY.5 |
| intergenic | E1209E GY.5 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| ORF1a | T1474T / NSP3 |
| intergenic | T1474T GY.5 |
| intergenic | T1496I GY.5 |
| intergenic | I1505T GY.5 |
| intergenic | D1513N GY.5 |
| intergenic | R1628C BF.26,GK.3.1,GK.2,GY.5 |
| intergenic | Q1758Q BQ.1.1.8,GY.5 |
| intergenic | P1786L BA.5,GY.5 |
| intergenic | T1822I BA.1.18,BA.4.1,FU.1,BQ.1,GY.5 |
| intergenic | I2010V FL.20.2,FL.20,GY.5 |
| ORF1a | M2036L / NSP3 |
| intergenic | M2036L GY.5 |
| intergenic | V2061F GY.5 |
| intergenic | H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5 |
| ORF1a | A2097T / NSP3 |
| intergenic | A2097T GY.5 |
| intergenic | N2272N BA.2.12,DV.7.1.2,GY.5 |
| intergenic | S2312L EG.7,GY.5 |
| intergenic | I2368L GY.5 |
| intergenic | D2592N GY.5 |
| ORF1a | A2704A / NSP3 |
| intergenic | A2704A GY.5 |
| intergenic | G2871G BA.5.1.2,GY.5 |
| intergenic | F2884F BF.28,BA.5.5,FL.8,GY.5 |
| intergenic | P2950P GY.5 |
| intergenic | V2975V EG.5.2.1,GW.5,GY.5 |
| intergenic | S2981S EG.10.1,FL.15.1.1,GY.5 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| ORF1a | A3049V / NSP4 |
| intergenic | A3049V GY.5 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | V3056A GY.5 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | D3355D FD.1.1,GY.5 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | A3523A EG.5.1.4,FD.1.1,FL.20.2,FL.20,GY.5 |
| intergenic | T3579I EG.5.1,EU.1.1,GY.5 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | A3610I GY.5 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | L3829F GY.5 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5 |
| intergenic | 4157 GY.5 |
| intergenic | A4155A FU.1,FU.2,GY.5 |
| intergenic | T4202T BQ.1.1.8,GY.5 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | N4358N BA.2.86.1,BF.26,BA.5.5,EU.1.1,GY.5 |
| intergenic | S4470S GY.5 |
| intergenic | A4577V BA.5.1.30,GY.5 |
| intergenic | V4625I GY.5 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | V4864V FU.1,FU.2,GY.5 |
| intergenic | V4865F GY.5 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | L5197P GY.5 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | Y5276Y BF.9,EG.5.1.6,GY.5 |
| intergenic | L5283L BA.4,BA.4.1,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.25,GY.5 |
| intergenic | H5290H GY.5 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | S5398L GY.5 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | D5790E GY.5 |
| intergenic | M5798I GY.5 |
| intergenic | Y5839Y BF.28,GY.5 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | K5908E GY.5 |
| intergenic | V5929V GY.5 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| ORF1b | L6032L / NSP14 |
| intergenic | L6032L GY.5 |
| intergenic | V6040I GY.5 |
| intergenic | A6044V BA.5,BA.4.6,GY.5 |
| intergenic | C6141C BA.5.2.20,GY.5 |
| intergenic | D6147Y FU.1,FU.2,GY.5 |
| intergenic | K6274K GY.5 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3,EG.5.1,FL.10.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GK.3.1,GY.5 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | Y6645Y BA.5.2.2,GK.3.2,GY.5 |
| intergenic | R6658R GY.5 |
| intergenic | V6del GY.5 |
| S | V6del GY.5 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5 |
| intergenic | L54L DV.7.1,GY.5 |
| intergenic | H69Y EG.5.1.8,GK.2,GY.5 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | N164I GY.5 |
| intergenic | E180V FU.1,FU.2,GY.5 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | Q218P GY.5 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | V433V GY.5 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | VG445SS FU.2,GY.5 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5 |
| intergenic | EGF484AGP EG.5.1.8,EG.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | P621S BA.2.86.1,GY.5 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | P1112S GY.5 |
| S | P1112S GY.5 |
| intergenic | D1139Y GY.5 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | V13L GY.5 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1,EG.5.1.6,GK.2,HK.7,GY.5 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | Q70H GY.5 |
| intergenic | V90V GY.5 |
| intergenic | L95F BA.5.1.1,GK.1,GY.5 |
| intergenic | L106L BA.5.2.2,BA.5.1.10,CK.2,GK.2,GY.5 |
| intergenic | W131C BE.1.1,FL.15,GY.5 |
| intergenic | V202V GY.5 |
| intergenic | T223I BA.2.12,BA.5.1.30,EG.5.1.3,GY.5 |
| intergenic | H227N GY.5 |
| intergenic | T268M BA.2.3,GY.5 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | H148Y FL.14,GY.5 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5 |
| intergenic | F59V GY.5 |
| ORF7a | F59V GY.5 |
| intergenic | D69D BA.1.14,BA.5.2.8,EG.5.1.6,GY.5 |
| intergenic | R118S GY.5 |
| intergenic | T120I BQ.1.1.8,BF.28,DV.7.1.2,GY.5 |
| intergenic | 19 EG.5.1.4,FK.1.1,GZ.1,HK.7,GY.5 |
| intergenic | L18L EG.5.1.4,GZ.1,HK.7,GY.5 |
| intergenic | X44QextX? GY.5 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | C37S GY.5 |
| intergenic | Q91X GS.4,GY.5 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | H145Y DV.7.1.2,GS.4,GY.5 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | S206F GY.5 |
| intergenic | A208V GA.4.1,GY.5 |
| intergenic | K248K BA.5.2.8,GY.5 |
| intergenic | V270V GY.5 |
| intergenic | D288D GY.5 |
| intergenic | T325I BA.5.1.24,GY.5 |
| intergenic | D343Y GY.5 |
| intergenic | T362I BA.5.1.24,BA.4.1,DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FU.2,GY.5 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5 |
| intergenic | T379I BF.28,FU.1,GW.5,GY.5 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5 |
| intergenic | P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,GK.1,GY.5 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.6,FL.15,GY.5 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5 |
| intergenic | g.C-160G GE.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | L16L BA.5.1.2,GE.1 |
| intergenic | V20I GE.1 |
| intergenic | R24S GE.1 |
| intergenic | L27L BA.5.1.24,FL.1.5.2,FL.10.1,GE.1 |
| ORF1a | F31L / NSP1 |
| intergenic | F31L GE.1 |
| intergenic | V38I GE.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GE.1 |
| intergenic | H81H BA.5.2.2,GE.1 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,GE.1 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BA.4.6,FD.1.1,GE.1 |
| intergenic | E91K GE.1 |
| intergenic | E93K GE.1 |
| intergenic | Y97Y BA.5.1.24,EG.5.1.8,EG.5.2.1,GE.1 |
| intergenic | G112G BF.20,FL.1.5.2,GE.1 |
| intergenic | A117T BA.5,GE.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| ORF1a | D139G / NSP1 |
| intergenic | D139G GE.1 |
| intergenic | E176K GE.1 |
| intergenic | L177F GE.1 |
| intergenic | R226K BA.5.2.3,DV.7.1,GE.1 |
| intergenic | C230C GE.1 |
| intergenic | H234H EG.5.1,GE.1 |
| intergenic | S248S BA.5.2.3,GE.1 |
| intergenic | A260A GE.1 |
| intergenic | P309L BA.5.2.2,BF.28,GE.1 |
| ORF1a | K322N / NSP2 |
| intergenic | K322N GE.1 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5,EG.5.1.8,EG.5.1.3,FK.1.1,GE.1 |
| intergenic | P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.6,GK.2.1,GK.1,GE.1 |
| intergenic | E441E BA.1.14,GE.1 |
| intergenic | G442V GE.1 |
| intergenic | S443S BA.5,EU.1.1,FU.2,GS.4,GE.1 |
| intergenic | G445V GE.1 |
| intergenic | A482A GE.1 |
| intergenic | A516V BF.9,GE.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1 |
| intergenic | A537A FL.15,GE.1 |
| intergenic | Q556K BA.4,BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BQ.1,GE.1 |
| intergenic | D571D GE.1 |
| intergenic | L613L GE.1 |
| intergenic | I616I BF.9,GK.2,GE.1 |
| intergenic | G661S GE.1 |
| intergenic | H712H BA.5.2.34,GE.1 |
| ORF1a | T727T / NSP2 |
| intergenic | T727T GE.1 |
| intergenic | L730L BA.4,FL.2.3,GE.1 |
| intergenic | E745K GE.1 |
| intergenic | L778L GE.1 |
| intergenic | L778L EG.5.1.8,GE.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | L864L BA.5.1.24,GE.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | A967V BA.4,FU.1,GE.1 |
| intergenic | T987T GE.1 |
| intergenic | P1010S GE.1 |
| intergenic | Y1064H GE.1 |
| intergenic | N1080N GE.1 |
| intergenic | A1082A GE.1 |
| intergenic | N1094K GE.1 |
| intergenic | V1104I FL.15,GE.1 |
| intergenic | L1110F GE.1 |
| intergenic | G1155C BA.5.1.2,EG.5.1.4,GK.3.1,GE.1 |
| intergenic | D1157H GE.1 |
| intergenic | Y1174Y BA.5.2.34,EG.5.1.4,FK.1.1,BA.5.6,GE.1 |
| intergenic | I1203S GE.1 |
| intergenic | P1207L GE.1 |
| intergenic | L1243L GE.1 |
| intergenic | N1252N GK.2,GE.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | D1323D BA.5.1.24,FL.10.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.4,GZ.1,GE.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | L1441L BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1,FK.1.1,GK.1,GK.2,GE.1 |
| intergenic | T1454T GE.1 |
| intergenic | D1481D GE.1 |
| intergenic | A1508T GE.1 |
| intergenic | L1523L BA.5.2.34,GS.3,GE.1 |
| intergenic | I1525V BA.5.2.3,GE.1 |
| intergenic | P1541P BA.4.1,GE.1 |
| intergenic | K1557R GE.1 |
| intergenic | T1597I BF.9,BA.4.6,GK.1,GE.1 |
| intergenic | L1643L BA.5.1.2,EG.6.1,GE.1 |
| intergenic | N1691S GE.1 |
| intergenic | A1716A GE.1 |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10,BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BA.5.6,FY.3.1,GE.1 |
| intergenic | P1786L BA.5,GY.5,GE.1 |
| intergenic | Y1814Y GE.1 |
| intergenic | T1822I BA.1.18,BA.4.1,FU.1,BQ.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | P1894P GE.1 |
| intergenic | N1922N BA.5,GE.1 |
| intergenic | Q1943Q GE.1 |
| intergenic | S1952L BA.5.5,GE.1 |
| intergenic | S1978P GE.1 |
| intergenic | K2029K GE.1 |
| intergenic | V2047V BA.5.6,GE.1 |
| intergenic | L2062F BA.5.1.10,BF.26,FL.2.3,FL.14,GE.1 |
| intergenic | G2091S GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GE.1 |
| intergenic | T2093I GS.3,GE.1 |
| intergenic | L2105F BQ.1,GE.1 |
| intergenic | L2146F BA.5.2.34,GE.1 |
| intergenic | L2240I GE.1 |
| intergenic | I2244T FK.1.1,GE.1 |
| intergenic | G2265D EG.5.1.6,GE.1 |
| intergenic | A2279V EG.5.1,GK.2,GE.1 |
| intergenic | S2285F BF.26,GE.1 |
| intergenic | S2303A GE.1 |
| intergenic | F2390F GE.1 |
| ORF1a | R2417R / NSP3 |
| intergenic | R2417R GE.1 |
| intergenic | N2482N GE.1 |
| intergenic | D2525D DV.7.1.2,FU.2,GK.1.1,GE.1 |
| intergenic | L2675L BA.5.2.3,BA.5,FU.2,GE.1 |
| intergenic | N2678N BA.5.2.8,BA.5.2.20,GE.1 |
| intergenic | V2680V BA.5.2.2,GE.1 |
| intergenic | P2685T EG.7,GE.1 |
| intergenic | N2708N BA.5.2.3,EG.5.1.4,GE.1 |
| intergenic | A2784V BA.5.1.1,GE.1 |
| intergenic | A2785T GE.1 |
| intergenic | T2791I GE.1 |
| intergenic | D2801D GK.1,GE.1 |
| intergenic | D2813E GE.1 |
| intergenic | D2835D GE.1 |
| intergenic | S2839S GE.1 |
| intergenic | Y2845C GE.1 |
| ORF1a | V2930L / NSP4 |
| intergenic | P2950P GY.5,GE.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | 3055 GE.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8,DV.7.1,DV.7.1.2,BA.5.5,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,GE.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | TV3090II BQ.1,GE.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | T3258T BA.5.2.8,EG.5.1.8,GE.1 |
| intergenic | P3272P GE.1 |
| intergenic | G3278G GE.1 |
| intergenic | T3308T BA.5.6,GE.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | P3359S BA.5.1.10,BA.5.1.2,GE.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | D3439D BA.5.2.34,BA.5.1.1,DV.7.1,EG.5.1.3,FL.1.5,GE.1 |
| intergenic | Y3472Y GE.1 |
| intergenic | D3479D BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1.8,GK.3.1,GE.1 |
| intergenic | T3488I GE.1 |
| intergenic | G3514G GE.1 |
| ORF1a | L3549L / NSP5 |
| intergenic | L3549L GE.1 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1,BQ.1,GW.5,GK.2,GE.1 |
| intergenic | L3588F BA.5.6,GW.5,GS.3,GE.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | N3609N GE.1 |
| intergenic | L3641S GK.2.1,GE.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | I3737T CH.1.1.28,GK.1,GE.1 |
| intergenic | F3785F BF.9,EG.5.1.4,FD.1.1,BQ.1,GE.1 |
| intergenic | L3796L BA.2.12,BA.5,GE.1 |
| intergenic | K3832K GE.1 |
| intergenic | K3839K BA.4.1,BA.5.2.20,BA.5.5,GE.1 |
| intergenic | L3899L BA.5.1.30,GE.1 |
| intergenic | T3940I GE.1 |
| intergenic | V4072I GE.1 |
| intergenic | P4120S BA.5.6,GE.1 |
| intergenic | T4174I BA.1.14,BE.1.1,FD.1.1,GE.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| ORF1a | M4241V / NSP9 |
| intergenic | S4325S GE.1 |
| intergenic | Y4349Y GE.1 |
| intergenic | R4387R BA.4,BA.5.1.30,BF.28,FL.15,GK.1.3,GE.1 |
| ORF1a | ML4390IF / NSP10 |
| intergenic | ML4390IF GE.1 |
| intergenic | Y4424Y FL.1.5,FL.14,FL.15.1.1,GE.1 |
| intergenic | F4437F GE.1 |
| intergenic | H4467H BA.5.1.10,BQ.1.1.8,GE.1 |
| intergenic | D4499D GE.1 |
| intergenic | N4550N FD.1.1,GE.1 |
| intergenic | A4587A GE.1 |
| intergenic | T4640I GE.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | V4722V GE.1 |
| intergenic | N4748N GK.2,GE.1 |
| intergenic | L4779L BA.4,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FY.3.1,GK.1.1,GE.1 |
| intergenic | T4786M BA.5.2.8,FL.2.3,GK.3.1,GE.1 |
| intergenic | V4864V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1 |
| intergenic | H5034H GE.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | T5093T BF.26,BQ.1,GE.1 |
| intergenic | E5136D BA.4,EG.6.1,GE.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | Y5162Y BQ.1,GE.1 |
| intergenic | G5166S GE.1 |
| intergenic | K5172R GE.1 |
| intergenic | P5222P GE.1 |
| intergenic | 5227 GK.3.1,GE.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.2,BF.26,EG.5.1.8,EG.5.1,FL.8,FL.20,GE.1 |
| intergenic | I5248V GE.1 |
| intergenic | T5262I GE.1 |
| ORF1b | H5284H / NSP12 |
| intergenic | H5284H GE.1 |
| ORF1b | R5306R / NSP12 |
| intergenic | R5306R GE.1 |
| intergenic | P5319P GE.1 |
| intergenic | V5326V GE.1 |
| intergenic | F5348F BF.10,BQ.1,GE.1 |
| intergenic | P5377S BA.4,BA.5.1.24,BF.28,EG.5.1,FL.15,GK.2.1,GE.1 |
| intergenic | A5447A GE.1 |
| intergenic | T5451I BA.5.1.10,BF.26,GE.1 |
| intergenic | T5477N DV.7.1,GE.1 |
| intergenic | P5498P GE.1 |
| intergenic | T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.1.24,GE.1 |
| intergenic | L5580L EG.5.1.4,GE.1 |
| intergenic | S5583L BE.1.1,EG.6.1,GE.1 |
| intergenic | A5616A FL.8,GE.1 |
| intergenic | L5619L BQ.1.13,GE.1 |
| intergenic | H5635H GK.1.1,GE.1 |
| intergenic | V5672V GE.1 |
| intergenic | A5692A GE.1 |
| intergenic | A5703A GE.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | I5804V GE.1 |
| intergenic | P5853L BA.2.12,GE.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | IP5967VH GE.1 |
| intergenic | G6018G EG.10.1,GJ.1,GE.1 |
| intergenic | T6038I BF.9,FL.15,GE.1 |
| intergenic | K6080R GE.1 |
| intergenic | P6128S BQ.1.1.8,FL.25,GK.2.1,GE.1 |
| intergenic | T6175I BQ.1.1.8,BA.4.6,GE.1 |
| intergenic | C6204C GE.1 |
| ORF1b | E6209E / NSP14 |
| intergenic | E6209E GE.1 |
| intergenic | A6244A GE.1 |
| intergenic | L6254L BE.1.1,GE.1 |
| intergenic | D6256D BA.5.2.2,BA.5,GE.1 |
| intergenic | I6257V GE.1 |
| intergenic | A6285V GE.1 |
| intergenic | S6294F GE.1 |
| intergenic | L6331L FL.10.1,GE.1 |
| intergenic | N6333N FL.8,GS.3,GE.1 |
| ORF1b | 6355 / NSP14 |
| intergenic | 6355 GE.1 |
| intergenic | P6354P GE.1 |
| intergenic | I6388V GE.1 |
| ORF1b | T6482A / NSP15 |
| intergenic | T6482A GE.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| ORF1b | E6712G / NSP15 |
| intergenic | E6712G GE.1 |
| intergenic | N6729N GE.1 |
| intergenic | F6731F GE.1 |
| intergenic | C6742F BF.26,GE.1 |
| intergenic | T6777I BA.5,GE.1 |
| intergenic | A6802A BA.5.5,GE.1 |
| intergenic | S6831S GE.1 |
| intergenic | A6832V BA.5,EG.5.1,FL.10.1,EG.5.1.6,GE.1 |
| intergenic | T6889M EG.7,GE.1 |
| ORF1b | Q6956R / NSP16 |
| intergenic | Q6956R GE.1 |
| intergenic | G7011N BA.5.1.1,BA.4.6,FL.10.1,GE.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1 |
| intergenic | V47F GE.1 |
| S | V47F GE.1 |
| intergenic | T51I GE.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | E96G GE.1 |
| S | E96G GE.1 |
| intergenic | S116S EG.5.1,EU.1.1,FD.1.1,FL.15.1.1,GE.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | M153I BA.5.2.3,GE.1 |
| intergenic | R158G GE.1 |
| intergenic | M177T GE.1 |
| intergenic | E180V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | N185_F186delinsI GW.5,GE.1 |
| intergenic | E191E GE.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | A222V BF.26,GE.1 |
| intergenic | Y248H GE.1 |
| intergenic | D253G GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GE.1 |
| intergenic | D287N GE.1 |
| intergenic | R328R GE.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1 |
| intergenic | G482R GE.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | P521S GE.1 |
| intergenic | F541F EG.7,BA.5.6,GE.1 |
| intergenic | E554D GE.1 |
| intergenic | E583D GK.1.1,GE.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | T632T BA.4.1,GE.1 |
| intergenic | T638I BQ.1.1.8,GE.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | I666I GE.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | S691S FL.10.1,FL.15,GK.2,GE.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | P812S GE.1 |
| intergenic | S943G GE.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | H1048H GE.1 |
| intergenic | E1111Q GE.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | G1219G GE.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | K16N GE.1 |
| intergenic | E19Q GE.1 |
| intergenic | D27N GE.1 |
| intergenic | 44 GE.1 |
| intergenic | F43F GE.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | L84L BA.4,GE.1 |
| intergenic | S92L GE.1 |
| intergenic | H150H GE.1 |
| intergenic | Y212Y DV.7.1.2,GK.1,GE.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1 |
| intergenic | H247H FL.15,GK.2.1,GK.2,GE.1 |
| intergenic | V256del BA.5.2.2,BA.5.1.30,EG.5.1.3,FL.20.2,GE.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | L18I GE.1 |
| intergenic | V17V BA.5,GE.1 |
| intergenic | F20F GE.1 |
| intergenic | P54P GE.1 |
| intergenic | S68F GK.2.1,FL.20,GE.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6,GZ.1,GE.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3,GK.3.2,GK.1.1,GE.1 |
| intergenic | A98S GE.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | R146H DV.7.1,EG.6.1,GE.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | Y31Y BA.5.1.24,BA.5,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BA.5.6,GK.1.1,GE.1 |
| intergenic | I32I BA.5.5,FL.10.1,FU.2,GE.1 |
| intergenic | Y49S GE.1 |
| intergenic | P57L BF.20,FU.2,GE.1 |
| intergenic | P57P BA.4.1,GE.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | D61P GE.1 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EU.1.1,GE.1 |
| intergenic | A13V GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GE.1 |
| intergenic | G26V GE.1 |
| intergenic | T28I BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1,GE.1 |
| intergenic | E33K BA.5.5,GE.1 |
| intergenic | K72_L77del GE.1 |
| intergenic | L116L BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.25,GE.1 |
| intergenic | X122fs EG.5.1,GE.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1 |
| intergenic | C41fs GE.1 |
| intergenic | I9T GE.1 |
| intergenic | Q18E GE.1 |
| intergenic | C25F GE.1 |
| intergenic | D34D GA.4.1,GE.1 |
| intergenic | P38L EG.5.1,GE.1 |
| intergenic | G50E GE.1 |
| intergenic | R52G GE.1 |
| ORF8 | R52G GE.1 |
| intergenic | L60X GE.1 |
| intergenic | P93L FL.14,GE.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | D3D GE.1 |
| intergenic | N8D BE.1.1,GE.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | T115T BQ.1.1.8,GE.1 |
| intergenic | G120E GE.1 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | I157I BA.4,BA.5.2.34,EG.5.2.1,EG.5.1,GE.1 |
| intergenic | A173V BA.5.2.20,BA.4.6,EG.7,EG.5.1.4,EU.1.1,GK.1.1,GE.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | L224F GE.1 |
| intergenic | S250Y GE.1 |
| intergenic | Y268Y BA.5.1.10,BA.5,BQ.1.2.3,GE.1 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1,BF.26,EG.5.1,BA.5.6,FL.15,HK.7,GE.1 |
| intergenic | Y298Y BA.1.17,BE.1.1,EG.10.1,GE.1 |
| intergenic | H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.5,EG.5.1.4,BA.2.3,BQ.1,GE.1 |
| intergenic | P302P BA.5.2.34,BA.4.1,CH.1.1.28,FL.15,GE.1 |
| intergenic | P309P BA.4.1,BA.5.2.20,BF.10,BA.4.6,BQ.1,GK.2,GE.1 |
| intergenic | P365L BA.5.2.20,FL.1.5,GE.1 |
| intergenic | P383P BA.5.2.34,BE.1.1,BQ.1.13,FL.15,GE.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1 |
| intergenic | S416L GE.1 |
| intergenic | I4V GE.1 |
| intergenic | g.G29706T FL.1.5,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GZ.1,GE.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | A76A HK.11 |
| intergenic | G105G HK.11 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | G465G HK.11 |
| intergenic | S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1,EU.1.1,FL.20.2,FL.20,BQ.1,HK.11 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11 |
| intergenic | G696G BA.5.2.20,HK.11 |
| intergenic | E755V HK.11 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | V886V BA.5.1.24,BF.10,HK.11 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | N1094S FL.20.2,HK.11 |
| intergenic | H1113H HK.11 |
| intergenic | G1155C BA.5.1.2,EG.5.1.4,GK.3.1,GE.1,HK.11 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | A1508A HK.11 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11 |
| intergenic | C2041C BA.5.1.24,HK.11 |
| intergenic | H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5,HK.11 |
| intergenic | T2154I BA.4.6,FY.3.1,HK.11 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | V3048V BE.1.1,HK.11 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | A3209S HK.11 |
| intergenic | L3238I HK.11 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | F3271F BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,EG.6.1,FY.4.1.1,HK.11 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | Y3502Y HK.11 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | V3917V HK.11 |
| intergenic | P3952S BA.5.6,GK.1.3,HK.11 |
| intergenic | D4117D GK.3.1,HK.11 |
| intergenic | A4156A BA.2.3,HK.11 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24,BA.5.2.3,HK.11 |
| intergenic | F4321F BA.2.12,HK.11 |
| intergenic | A4408V FD.1.1,FL.20,HK.11 |
| intergenic | A4435A HK.11 |
| intergenic | D4455N EG.5.1,HK.7,HK.11 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11 |
| intergenic | N5370N BA.2.12,HK.11 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | A6990T HK.11 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.15,FL.20,HK.7,HK.11 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11 |
| intergenic | QG183ES HK.11 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | T430I HK.11 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11 |
| intergenic | E484A BA.5,BA.4.1,HK.11 |
| intergenic | VE483FA HK.11 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | Y789Y BQ.1.2.3,HK.11 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | S1051S EG.5.1.6,HK.11 |
| intergenic | V1065L HK.11 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | A59T HK.11 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1,EG.5.1.6,GK.2,HK.7,GY.5,HK.11 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | S171L GK.2,HK.11 |
| intergenic | G187V HK.11 |
| intergenic | T223I BA.2.12,BA.5.1.30,EG.5.1.3,GY.5,HK.11 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | R69X HK.11 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | A38S HK.11 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11 |
| intergenic | Q90L HK.11 |
| intergenic | V108V HK.11 |
| intergenic | T111K HK.11 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11 |
| intergenic | G77G HK.11 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1,FL.15,BA.2.3,GK.1.1,HK.11 |
| intergenic | N154S HK.11 |
| intergenic | A155A HK.11 |
| intergenic | S194A HK.11 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | P383S BA.4.1,HK.11 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| ORF1a | H81Q / NSP1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | N348N FL.10.1,GV.1 |
| intergenic | T350I BA.5.2.3,BA.5.5,GV.1 |
| intergenic | A482V CK.2,GV.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1 |
| intergenic | L530R GV.1 |
| intergenic | K672N GV.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | L853L GK.2.1,GK.2,GV.1 |
| intergenic | P885S DV.7.1,GV.1 |
| intergenic | L893L GV.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | S984I BF.20,GV.1 |
| ORF1a | E1024_V1025del / NSP3 |
| intergenic | E1024_V1025del GV.1 |
| intergenic | V1025V GV.1 |
| intergenic | L1148L GV.1 |
| intergenic | R1170R BE.1.1,GY.5,GV.1 |
| ORF1a | Y1174C / NSP3 |
| intergenic | Y1174C GV.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | T1589A GV.1 |
| intergenic | P1596L GV.1 |
| intergenic | S1857L EG.5.1,EG.5.1.6,GV.1 |
| intergenic | S2048F GV.1 |
| intergenic | P2079S EG.5.1.9,EG.6.1,GV.1 |
| intergenic | H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1 |
| intergenic | N2256S GV.1 |
| intergenic | T2877I GV.1 |
| intergenic | N3007N EG.5.1.4,EG.5.1,GV.1 |
| intergenic | P3015S GV.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | D3196G GV.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | L3313L FD.1.1,GK.2,GV.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | T3459T BA.5.1.1,BE.1.1,EG.7,GV.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1 |
| ORF1a | A3645S / NSP6 |
| intergenic | A3645S GV.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | Y3793Y GV.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | A4774V GV.1 |
| intergenic | P4804S GV.1 |
| intergenic | F4820F BA.5.1.10,BA.4.1,BF.26,BQ.1.2.3,EG.5.1,BA.2.3,GV.1 |
| intergenic | N5020N BA.1.17,BA.5,BA.4.6,GV.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1 |
| intergenic | V5493F CH.1.1.28,GV.1 |
| intergenic | N5503N GV.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | T5956I BA.5.2.2,BA.5,FD.1.1,GK.1.1,GV.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | G5969C GV.1 |
| intergenic | A6044V BA.5,BA.4.6,GY.5,GV.1 |
| intergenic | D6069D BA.2.12,BA.4.1,EG.6.1,FL.15.1.1,GV.1 |
| intergenic | D6226D GV.1 |
| intergenic | H6239H FL.15,GK.2,GV.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | V3A GV.1 |
| intergenic | T19I BA.5.2.2,BA.5.1.2,EG.5.1.3,EG.5.1,FD.1.1,GV.1 |
| intergenic | T19L BA.5.2.2,BA.5.1.2,EG.5.1.3,EG.5.1,FD.1.1,GV.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | T29T GV.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | D215H BA.5.1.1,GA.4.1,GV.1 |
| intergenic | Q218R GV.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1 |
| intergenic | C336C EG.5.1.3,GV.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | R466R GV.1 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | P521Q GV.1 |
| intergenic | P579P BA.2.12,GV.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | NSP679KAH GV.1 |
| intergenic | NSP679KSH BA.5.2.20,GV.1 |
| intergenic | V687I GV.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | E780E GV.1 |
| intergenic | Y789Y BQ.1.2.3,HK.11,GV.1 |
| intergenic | V951V GV.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | A1056A GV.1 |
| intergenic | V1060V BA.5.2.20,GV.1 |
| S | V1060V BA.5.2.20,GV.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BF.28,FL.1.5,GK.3.1,GV.1 |
| intergenic | P1263L BA.5.2.34,BF.28,GV.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | N119N GV.1 |
| ORF3a | N119N GV.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1 |
| intergenic | P240S BA.4,BQ.1.1.8,GV.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | E12D GV.1 |
| M | E12D GV.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | V29L FL.10.1,GV.1 |
| intergenic | I7I GV.1 |
| intergenic | F19L BA.4,BA.5.1.30,GV.1 |
| intergenic | F6_G8delinsX GV.1 |
| intergenic | G8X GV.1 |
| intergenic | K44R GV.1 |
| intergenic | T87fs GV.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | PR13LH GV.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | R68P GV.1 |
| intergenic | A134V GV.1 |
| intergenic | T148T BF.10,GV.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1 |
| intergenic | g.TG29710T BA.4,GV.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | G1101D HF.1.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | L1963L HF.1.1 |
| intergenic | T2121I EG.5.1.3,HF.1.1 |
| intergenic | T2247T FK.1.1,EG.6.1,HF.1.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | F3241F HF.1.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1 |
| intergenic | A4155A FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | A4577V BA.5.1.30,GY.5,HF.1.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | A4791T HF.1.1 |
| intergenic | C4856Y HF.1.1 |
| intergenic | V4864V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | Y5223Y BA.5,HF.1.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | V5629L HF.1.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | D5774D HF.1.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | G5895G HF.1.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | D6147Y FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | T6500I GK.3.2,HF.1.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | D6752N HF.1.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1 |
| intergenic | E180V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | E224Q HF.1.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | S254S BA.5.1.10,HF.1.1 |
| intergenic | K304N HF.1.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | A845S FU.2,HF.1.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | D1084N HF.1.1 |
| intergenic | H1101Y BF.41,BA.5.2.20,EG.5.1.3,HF.1.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | F1148F EG.5.1.3,EG.7,FL.15,HF.1.1 |
| intergenic | D1163Y BA.5.2.2,DV.7.1.2,HF.1.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | T175T HF.1.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1 |
| intergenic | G8X HF.1.1 |
| intergenic | T11I FU.1,GK.2.1,HF.1.1 |
| intergenic | S67S HF.1.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | P6L HF.1.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | A35T HF.1.1 |
| intergenic | Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | N213N HF.1.1 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | V5F HK.1 |
| intergenic | H45Q HK.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.1 |
| intergenic | Q526H HK.1 |
| intergenic | S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1,EU.1.1,FL.20.2,FL.20,BQ.1,HK.11 |
| intergenic | G604S FL.25,FU.1,HK.1 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1 |
| intergenic | G696G BA.5.2.20,HK.11 |
| intergenic | L758L HK.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | V886V BA.5.1.24,BF.10,HK.11 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | P927L HK.1 |
| intergenic | N1094S FL.20.2,HK.11 |
| intergenic | G1155C BA.5.1.2,EG.5.1.4,GK.3.1,GE.1,HK.11 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1 |
| intergenic | T1881I BA.4.6,HK.1 |
| intergenic | C2041C BA.5.1.24,HK.11 |
| intergenic | H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HK.1 |
| intergenic | T2154I BA.4.6,FY.3.1,HK.11 |
| intergenic | D2525D DV.7.1.2,FU.2,GK.1.1,GE.1,HK.1 |
| intergenic | N2628N HK.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | V3048V BE.1.1,HK.11 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | F3271F BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,EG.6.1,FY.4.1.1,HK.11 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | F3838F HK.1 |
| intergenic | P3952S BA.5.6,GK.1.3,HK.11 |
| intergenic | D4117D GK.3.1,HK.11 |
| intergenic | A4156A BA.2.3,HK.11 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1 |
| intergenic | D4190D GK.2,HK.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24,BA.5.2.3,HK.11 |
| intergenic | C4299C HK.1 |
| intergenic | F4321F BA.2.12,HK.11 |
| intergenic | L4391F BA.5,BE.1.1,BA.5.5,HK.1 |
| intergenic | A4408V FD.1.1,FL.20,HK.11 |
| intergenic | D4455N EG.5.1,HK.7,HK.11,HK.1 |
| intergenic | V4558V HK.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | T5193T HK.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | V5326V GE.1,HK.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | N5370N BA.2.12,HK.11 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1 |
| intergenic | L5580L EG.5.1.4,GE.1,HK.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | Q52H HK.1 |
| intergenic | Q52Y HK.1 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.15,FL.20,HK.7,HK.11 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | G142_Y145delinsDD GK.3.1,HK.1 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | G257V BF.41,HK.1 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | SAS371FAP HK.1 |
| intergenic | SAS371FVP HK.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1 |
| intergenic | E484A BA.5,BA.4.1,HK.11 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | S494P EG.10.1,EG.5.1,EG.5.1.6,FY.4.1.1,GK.2,HK.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | S659S HK.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | Y789Y BQ.1.2.3,HK.11,GV.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | S1051S EG.5.1.6,HK.11 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | P1263L BA.5.2.34,BF.28,GV.1,HK.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | I20T BE.1.1,BA.5.6,HK.1 |
| intergenic | V48del HK.1 |
| intergenic | A54S HK.1 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1,EG.5.1.6,GK.2,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | L106L BA.5.2.2,BA.5.1.10,CK.2,GK.2,GY.5,HK.1 |
| intergenic | S171L GK.2,HK.11 |
| intergenic | T223I BA.2.12,BA.5.1.30,EG.5.1.3,GY.5,HK.11 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1 |
| intergenic | S81P HK.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | A43V BF.41,GK.1.1,HK.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1,FL.15,BA.2.3,GK.1.1,HK.11 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | P383S BA.4.1,HK.11 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1 |
| intergenic | g.G29701T HK.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | G7S BA.1.17,HF.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | P109P HF.1 |
| intergenic | L122F HF.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1 |
| intergenic | N188N BA.4.1.8,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,BA.4.6,EG.5.1,HF.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1 |
| ORF1a | M806I / NSP2 |
| intergenic | M806I HF.1 |
| intergenic | P820S HF.1 |
| intergenic | T842I BQ.1.2.3,HF.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | D898D HF.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | Q1009Q HF.1 |
| intergenic | G1101D HF.1.1,HF.1 |
| intergenic | S1106S EG.10.1,GS.4,HF.1 |
| intergenic | P1158S BF.41,HF.1 |
| intergenic | E1192G HF.1 |
| intergenic | E1205E HF.1 |
| intergenic | P1220L BA.4.6,HF.1 |
| intergenic | V1300V HF.1 |
| intergenic | G1307S HF.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | Y1325Y BE.1.1,HF.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | T1496I GY.5,HF.1 |
| intergenic | Y1598Y HF.1 |
| intergenic | E1633D HF.1 |
| intergenic | L1680L BA.5.1.24,HF.1 |
| intergenic | T1682I BA.5.2.20,HF.1 |
| intergenic | M1771L HF.1 |
| intergenic | Y1868Y BA.4,BA.5.1.24,BF.26,EU.1.1,EG.6.1,BQ.1,GK.3.1,HF.1 |
| intergenic | P1919P EG.7,HF.1 |
| ORF1a | S2015R / NSP3 |
| ORF1a | S2015R / NSP3 |
| intergenic | S2015R HF.1 |
| intergenic | T2121I EG.5.1.3,HF.1.1 |
| intergenic | F2172F BQ.1.1.8,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,GK.2.1,GW.5,HF.1 |
| intergenic | T2181I HF.1 |
| intergenic | T2197I BA.5.1.2,HF.1 |
| intergenic | T2247T FK.1.1,EG.6.1,HF.1.1 |
| intergenic | P2287T HF.1 |
| intergenic | L2349L EG.5.2.1,HF.1 |
| intergenic | V2421V BA.4,BF.10,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3,HF.1 |
| intergenic | A2584A HF.1 |
| intergenic | K2761K HF.1 |
| intergenic | F2787F HF.1 |
| intergenic | I2806I BA.5.1.24,FY.3.1,HF.1 |
| intergenic | F2881L HF.1 |
| intergenic | V2943I BQ.1,HF.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | H3076Y FD.1.1,HF.1 |
| intergenic | T3090I BA.5.2.2,BQ.1.13,HF.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | L3161I HF.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | L3234L BA.1.17,BF.10,FL.2.3,FU.2,HF.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | P3302P GK.3.1,HF.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| ORF1a | M3345I / NSP5 |
| intergenic | M3345I BA.5.1.24,BQ.1.2.3,HF.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | K3532K HF.1 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.4.6,EG.5.1.6,HF.1 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1,BQ.1,GW.5,GK.2,GE.1,HF.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1,HF.1 |
| intergenic | M3921I HF.1 |
| intergenic | M3997I HF.1 |
| intergenic | N4050N HF.1 |
| intergenic | P4058P BA.4.1,BA.5.1.30,EG.5.1,HF.1 |
| intergenic | T4090A HF.1 |
| intergenic | A4155A FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1 |
| intergenic | Y4172Y BA.5.1.2,BF.26,HF.1 |
| intergenic | K4176K HF.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | G4378V HF.1 |
| intergenic | D4562N HF.1 |
| intergenic | A4568T HF.1 |
| intergenic | A4577V BA.5.1.30,GY.5,HF.1.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | V4733I HF.1 |
| intergenic | Y4738H BA.4,HF.1 |
| intergenic | V4864V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | Y5223H HF.1 |
| intergenic | Y5223Y BA.5,HF.1.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | A5342V BA.4,BF.9,BF.26,HF.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | G5378V HF.1 |
| intergenic | T5465I BA.5.1.24,HF.1 |
| intergenic | L5551L EG.7,FL.14,FL.10.1,FU.2,HF.1 |
| intergenic | L5576L HF.1 |
| ORF1b | V5629L / NSP13 |
| intergenic | V5629L HF.1.1,HF.1 |
| intergenic | T5691A HF.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | G5895G HF.1.1,HF.1 |
| intergenic | L5932L BA.5.2.34,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.2.3,GJ.1,GK.1.1,HF.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | A6021V EG.5.1.4,HF.1 |
| intergenic | P6067S HF.1 |
| intergenic | L6102L BA.4.1,BA.4.6,EG.6.1,FL.20.2,GK.2.1,GK.3.1,HF.1 |
| intergenic | D6147Y FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1 |
| intergenic | F6251F BF.28,HF.1 |
| intergenic | L6254F HF.1 |
| intergenic | S6294F GE.1,HF.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | T6500I GK.3.2,HF.1.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | Y6645Y BA.5.2.2,GK.3.2,GY.5,HF.1 |
| intergenic | F6684F HF.1 |
| intergenic | T6773T HF.1 |
| intergenic | L6893F HF.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | G75V BA.2.12,BA.4,BA.5.2.20,FU.2,HF.1 |
| intergenic | V83A GK.2,HF.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | T95T HF.1 |
| intergenic | K113K HF.1 |
| intergenic | E132K HF.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV HF.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsNV HF.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | P174P HF.1 |
| intergenic | E180V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | D215D HF.1 |
| intergenic | S221L HF.1 |
| intergenic | P230P BQ.1.1.8,HF.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | S254S BA.5.1.10,HF.1.1 |
| intergenic | K304N HF.1.1,HF.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | GST476SNR HF.1 |
| intergenic | ST477NK HF.1 |
| intergenic | ST477NR HF.1 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | S494P EG.10.1,EG.5.1,EG.5.1.6,FY.4.1.1,GK.2,HK.1,HF.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | L518P HF.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | A845S FU.2,HF.1.1 |
| intergenic | L865F HF.1 |
| S | L865F HF.1 |
| intergenic | T883T BQ.1.1.8,BE.1.1,HF.1 |
| intergenic | T941T HF.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | H1101Y BF.41,BA.5.2.20,EG.5.1.3,HF.1.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | F1148F EG.5.1.3,EG.7,FL.15,HF.1.1,HF.1 |
| intergenic | P1162L BQ.1.1.8,HF.1 |
| intergenic | D1163Y BA.5.2.2,DV.7.1.2,HF.1.1 |
| intergenic | C1236F EG.6.1,HF.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1,EG.5.1.6,GK.2,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | P159P HF.1 |
| ORF3a | P159P HF.1 |
| intergenic | T164T HF.1 |
| intergenic | Q185H BA.2.12,BF.28,HF.1 |
| intergenic | T223I BA.2.12,BA.5.1.30,EG.5.1.3,GY.5,HK.11,HF.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | M260V HF.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | A2V HF.1 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,HF.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | W75L GK.2,HF.1 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3,GK.3.2,GK.1.1,GE.1,HF.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | E13X HF.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | P57fs HF.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | R25T BA.4.1,BA.5.2.20,HF.1 |
| intergenic | N52N BF.26,EG.5.1.3,HF.1 |
| intergenic | A79A GS.4,HF.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1 |
| intergenic | T11I FU.1,GK.2.1,HF.1.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.5.2.3,BA.5,HF.1 |
| intergenic | g.CTA-5_-3TTT BA.5.2.3,BA.5,HF.1 |
| intergenic | g.TA-4_-3CT HF.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | D22G BA.5.1.1,DV.7.1,HF.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | A35T HF.1.1,HF.1 |
| intergenic | Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1 |
| intergenic | Q70Q HF.1 |
| intergenic | G164E HF.1 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | G321S HF.1 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1 |
| intergenic | g.C-126A HK.6 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | V108V BF.10,HK.6 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | L140L CH.1.1.28,BQ.1.13,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3,HK.6 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | G146G FD.1.1,BA.2.3,HK.6 |
| intergenic | K292N HK.6 |
| intergenic | P309S EG.5.1.6,FL.8,HK.6 |
| intergenic | S318L BA.5.1.1,BQ.1.1.8,EG.5.1.8,HK.6 |
| intergenic | S558P HK.6 |
| intergenic | S610S HK.6 |
| intergenic | I648I HK.6 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6 |
| intergenic | L766L HK.6 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6 |
| intergenic | E910D HK.6 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | E940G HK.6 |
| intergenic | A1074A HK.6 |
| intergenic | G1155C BA.5.1.2,EG.5.1.4,GK.3.1,GE.1,HK.11,HK.6 |
| intergenic | K1202N BE.1.1,HK.6 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | T1788M BA.4.6,FL.20.2,GS.4,HK.6 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6 |
| intergenic | Y1873Y BA.5.1.10,BF.9,BF.28,EG.5.1.3,HK.6 |
| intergenic | A1923T HK.6 |
| intergenic | H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HK.1,HK.6 |
| intergenic | N2275S HK.6 |
| intergenic | T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15,EG.5.1.4,FL.2.3,FD.1.1,GK.1.3,HK.6 |
| intergenic | M2374I HK.6 |
| intergenic | L2609L BA.5.1.24,BF.10,CK.2,FU.2,HK.6 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5,EG.6.1,FL.15.1.1,HK.6 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | G3342G HK.6 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | Y3500Y HK.6 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | A3730T HK.6 |
| intergenic | F3753V BA.5.2.34,CH.1.1.28,HK.6 |
| intergenic | L3935L BA.4.6,HK.6 |
| intergenic | Y4171Y EG.5.1.3,HK.6 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | H4301Y HK.6 |
| intergenic | D4455N EG.5.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6 |
| intergenic | T4640T BA.5.1.1,GS.4,GK.2,HK.6 |
| intergenic | D4652D BA.4,DV.7.1,BF.10,HK.6 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | Y4908Y BA.5.1.10,HK.6 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | H5399H BF.10,HK.6 |
| intergenic | G5494G HK.6 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6 |
| intergenic | S5602S BA.5.2.20,HK.6 |
| intergenic | G5611G HK.6 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | R5767R HK.6 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6 |
| intergenic | P6128L BA.2.12,HK.6 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | A6429T HK.6 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | L6585V HK.6 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | N6729N GE.1,HK.6 |
| intergenic | G6738V BF.10,HK.6 |
| intergenic | g.A-1T HK.6 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6 |
| intergenic | Q14H EG.10.1,FL.15,HK.6 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.15,FL.20,HK.7,HK.11,HK.6 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6 |
| intergenic | L110L HK.6 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | N164S HK.6 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | H207Y BA.5.2.20,HK.6 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | L242_L244del HK.6 |
| intergenic | GD252VG HK.6 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6 |
| intergenic | G482S HK.6 |
| intergenic | EGF484AGP EG.5.1.8,EG.7,GK.1.1,GY.5,HK.6 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | V622F BQ.1.2.3,HK.6 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | E819E DV.7.1,EG.5.1.6,HK.6 |
| intergenic | T883T BQ.1.1.8,BE.1.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | L1166L HK.6 |
| intergenic | C1240Y HK.6 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | I10T HK.6 |
| intergenic | A54_F56del HK.6 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1,EG.5.1.6,GK.2,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6 |
| intergenic | g.C-23T BA.5.2.3,HK.6 |
| intergenic | g.G-18T BA.5.2.2,BF.10,HK.6 |
| intergenic | S6S EG.6.1,FL.15,HK.6 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | F100L HK.6 |
| intergenic | 113 HK.6 |
| intergenic | F112F HK.6 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6 |
| intergenic | S44S HK.6 |
| intergenic | E95K HK.6 |
| intergenic | P99L BA.5.1.30,FD.1.1,HK.6 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | H37Y CH.1.1.28,FL.10.1,HK.6 |
| intergenic | G8S HK.6 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | Q27X GK.2.1,HK.6 |
| intergenic | S67F BA.5.1.10,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.5,EG.5.1,FL.10.1,FL.15,HK.6 |
| intergenic | Y73Y EG.6.1,HK.6 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | S21P HK.6 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | G60R HK.6 |
| intergenic | Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | D63N HK.6 |
| intergenic | P80S GW.5,HK.6 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | P302P BA.5.2.34,BA.4.1,CH.1.1.28,FL.15,GE.1,HK.6 |
| intergenic | I320V HK.6 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | Q418H BQ.1.2.3,HK.6 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1,GK.3.2,GW.5,HK.6 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | E148A HK.3.2 |
| intergenic | Y196Y HK.3.2 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BF.26,BF.10,CK.2,EU.1.1,GK.1,HK.3.2 |
| intergenic | T614I BA.5.1.10,HK.3.2 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | F813F BA.5.1.24,HK.3.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.30,FL.1.5,EG.7,FD.1.1,FL.15,HK.3.2 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | L2117L HK.3.2 |
| intergenic | Q2510K HK.3.2 |
| intergenic | I2786I HK.3.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | T3258T BA.5.2.8,EG.5.1.8,GE.1,HK.3.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | K3324R HK.3.2 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HK.3.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.4.6,EG.5.1.6,HF.1,HK.3.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | T3750I BA.5.2.34,BA.4.1,BQ.1,HK.3.2 |
| intergenic | I3898T HK.3.2 |
| intergenic | T3940T CK.2,BA.4.6,BQ.1,GK.1.1,HK.3.2 |
| intergenic | L4045L BA.4,BA.4.1,BF.26,FK.1.1,FL.15,HK.3.2 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | D4335D BA.2.3,HK.3.2 |
| intergenic | D4455N EG.5.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | D4499A HK.3.2 |
| intergenic | V4707V HK.3.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | K4830K HK.3.2 |
| intergenic | V4864I HK.3.2 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | G5494S HK.3.2 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | A5636A BF.10,BA.5.5,EG.5.1,HK.3.2 |
| intergenic | E5689E HK.3.2 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | T5740T HK.3.2 |
| intergenic | S5748S BA.4,BF.28,HK.3.2 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | E6290E FL.15,HK.3.2 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | T6777I BA.5,GE.1,HK.3.2 |
| intergenic | S6831S GE.1,HK.3.2 |
| intergenic | T6846T HK.3.2 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | Q14K HK.3.2 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS GK.1.1,HK.3.2 |
| intergenic | P25_A27del GK.1.1,HK.3.2 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.15,FL.20,HK.7,HK.11,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | C131C HK.3.2 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | Q677H GK.1,HK.3.2 |
| intergenic | NSP679KFH BA.5.2.20,HK.3.2 |
| intergenic | NSP679KSH BA.5.2.20,GV.1,HK.3.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | Y873H HK.3.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | D1259D BA.2.12,HK.3.2 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1,EG.5.1.6,GK.2,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | Y154Y BA.5.5,FL.10.1,FU.2,HK.3.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2 |
| intergenic | F2L EG.5.1,HK.3.2 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | R25T BA.4.1,BA.5.2.20,HF.1,HK.3.2 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | G70G EG.5.1.8,HK.3.2 |
| intergenic | E92E HK.3.2 |
| intergenic | 19 HK.3.2 |
| intergenic | L18L HK.3.2 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | A55T HK.3.2 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1,BA.2.3,GK.2.1,GK.1,HK.3.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | g.C-3T BA.5.2.2,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,BQ.1,HK.3.2 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2 |
| intergenic | g.C29721T HK.3.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2 |
| intergenic | g.G-92A FL.2.3,GS.4.1 |
| intergenic | g.C-48T BF.10,GS.4.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | T12A GS.4.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GE.1,GS.4.1 |
| intergenic | V89I GS.4.1 |
| intergenic | E113K GS.4.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1 |
| intergenic | E159K GS.4.1 |
| intergenic | A181T GS.4,GS.4.1 |
| intergenic | D203Y GS.4.1 |
| intergenic | S212P GS.4.1 |
| intergenic | F266F BA.5.2.34,BF.26,GS.4.1 |
| intergenic | A354T GS.4.1 |
| intergenic | H374Y BQ.1.1.8,CK.2,GS.4.1 |
| intergenic | C433R GS.4.1 |
| intergenic | R542C BA.5.2.20,EG.5.1.3,EG.5.1,FU.1,GS.4.1 |
| intergenic | T654T DV.7.1,DV.7.1.2,GS.4.1 |
| intergenic | I671V GS.4.1 |
| intergenic | K722K BA.5.2.2,GS.4.1 |
| intergenic | E743E GS.4.1 |
| intergenic | P769H GS.4.1 |
| intergenic | I793I FL.25,BA.2.3,GS.4.1 |
| intergenic | T824I GS.4.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | EE973GQ GS.4.1 |
| intergenic | N1080N GE.1,GS.4.1 |
| intergenic | D1089Y GS.4.1 |
| intergenic | L1144L GS.4.1 |
| intergenic | I1203I BA.5.1.2,BQ.1,GS.4.1 |
| intergenic | V1287V GS.4.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | D1323D BA.5.1.24,FL.10.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | S1478F GS.4.1 |
| intergenic | V1750V GS.4.1 |
| intergenic | P1803T GS.4.1 |
| intergenic | T2007T BA.5,BQ.1.1.8,GA.4.1,FL.15,BQ.1,GK.3.1,GS.4.1 |
| intergenic | G2091S GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GE.1,GS.4.1 |
| intergenic | M2096T GS.4.1 |
| intergenic | T2124I BQ.1.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,FU.2,GS.4,GS.4.1 |
| intergenic | N2272N BA.2.12,DV.7.1.2,GY.5,GS.4.1 |
| intergenic | D2299D BA.4,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1,BQ.1,GS.4.1 |
| intergenic | S2488F GS.4.1 |
| intergenic | M2606V GS.4.1 |
| intergenic | N2678N BA.5.2.8,BA.5.2.20,GE.1,GS.4.1 |
| intergenic | I2692I GS.4.1 |
| intergenic | H2799Y BA.4,BF.26,GS.4.1 |
| intergenic | P2950P GY.5,GE.1,GS.4.1 |
| intergenic | N2966N BA.1.15,GS.4.1 |
| intergenic | Y2968Y GS.4.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8,DV.7.1,DV.7.1.2,BA.5.5,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,GE.1,GS.4.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | V3170F GS.4.1 |
| intergenic | M3189L GS.4.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1,BQ.1,GW.5,GK.2,GE.1,HF.1,GS.4.1 |
| intergenic | V3653I GS.4.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | S3920S GS.4.1 |
| intergenic | L4070L GS.4.1 |
| intergenic | D4165N BA.5.2.34,GS.4.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | A4254V GS.4.1 |
| intergenic | C4404S GS.4.1 |
| intergenic | A4489V GS.4.1 |
| intergenic | G4529S GS.4.1 |
| intergenic | P4619L BF.9,GK.3.1,GZ.1,GS.4.1 |
| intergenic | T4668T BA.1.15,GS.3,GS.4,GS.4.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | T5035I DV.7.1.2,GS.4.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | L5167L FL.2.3,EG.5.1,GS.4.1 |
| intergenic | T5198A GS.4.1 |
| intergenic | G5200G GS.4.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | I5229I FL.15,GK.1.1,GS.4.1 |
| intergenic | H5264Q GS.4.1 |
| intergenic | N5448N GS.4.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1 |
| intergenic | V5550V GS.4.1 |
| intergenic | Y5623Y GS.4.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | I5940T GS.4.1 |
| intergenic | Q5947H BA.4.1.8,GS.4.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | V6043F GS.4.1 |
| intergenic | D6256D BA.5.2.2,BA.5,GE.1,GS.4.1 |
| intergenic | N6333N FL.8,GS.3,GE.1,GS.4.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | Y6436Y BA.5.5,GS.4.1 |
| intergenic | D6530D BF.26,GS.4.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | V6573V BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,FU.1,GK.2,GS.4.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | V6770A GS.4.1 |
| intergenic | P6860P BA.5.1.1,FU.2,GS.4.1 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1 |
| intergenic | N30N GS.4.1 |
| intergenic | V70V EG.5.1.6,GS.4.1 |
| intergenic | S71F GS.4.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | L118F BQ.1.2.3,GS.4.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | R158G GE.1,GS.4.1 |
| intergenic | M177T GE.1,GS.4.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | N185D DV.7.1,DV.7.1.2,BQ.1,GK.1,GS.4.1 |
| intergenic | R190R BF.28,GS.4.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | P217S GS.4.1 |
| intergenic | A222S GK.3.1,GS.4.1 |
| intergenic | P251H BA.5,BQ.1,GS.4.1 |
| intergenic | D253G GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1 |
| intergenic | W258R GS.4.1 |
| intergenic | L296L BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.2.3,GS.4.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GS.4.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | S640F BA.4,EG.10.1,GS.4.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1 |
| intergenic | A684A GS.4.1 |
| intergenic | D737Y GS.4.1 |
| intergenic | T747I GS.4.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | I834T GS.4.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | A103A GS.4,GS.4.1 |
| intergenic | A110S BA.4.6,EG.5.1.3,GS.4.1 |
| intergenic | L127F GS.4.1 |
| intergenic | G172C BQ.1.13,GS.4,GS.4.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | P240S BA.4,BQ.1.1.8,GV.1,GS.4.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | K14R GS.4.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | A104V BA.2.86.1,BE.1.1,BQ.1,GS.4,GS.4.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | L181L BA.5.1.24,GK.1.1,GS.4.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | A13V GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1 |
| intergenic | G38V BF.28,FD.1.1,GS.4.1 |
| intergenic | Y40N GS.4.1 |
| intergenic | L96F DV.7.1.2,FU.1,GS.4.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | G30_S33delinsA GS.4,GS.4.1 |
| intergenic | A35V BA.2.86.1,GS.4.1 |
| intergenic | A50A BF.26,BA.2.3,GK.2.1,GS.4.1 |
| intergenic | G175G BA.2.12,BA.5.2.3,GS.4.1 |
| intergenic | RG203KL FL.1.5,GS.4.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | P258P GS.4.1 |
| intergenic | N285N GS.4.1 |
| intergenic | H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.5,EG.5.1.4,BA.2.3,BQ.1,GE.1,GS.4.1 |
| intergenic | S327S BQ.1.1.8,EG.6.1,FL.10.1,GS.4.1 |
| intergenic | T362I BA.5.1.24,BA.4.1,DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FU.2,GY.5,GS.4.1 |
| intergenic | P365L BA.5.2.20,FL.1.5,GE.1,GS.4.1 |
| intergenic | A398V BA.5.1.24,BE.1.1,BF.26,GS.4.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1,GK.3.2,GW.5,HK.6,GS.4.1 |
| intergenic | g.G29706T FL.1.5,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GZ.1,GE.1,GS.4.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | g.C-160T BA.5.1.24,BE.1.1,BA.1.15,EG.5.1.3,GY.5 |
| intergenic | g.C-63T BA.5.1.10,BA.4,EG.10.1,FL.1.5,EG.6.1,FL.15,GK.1.3,BA.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | D203D BA.5.1.24,BA.4.6,GK.2,BA.1 |
| intergenic | T654I GK.2.1,BA.1 |
| intergenic | A735A BA.1.14,BA.1.18,BA.1.15,FL.1.5,BA.2.3,BA.1 |
| intergenic | K856R BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1 |
| intergenic | V879V BA.2.12,BA.1.15,EG.7,GK.1.3,BA.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | A1072A BA.1 |
| intergenic | T1168I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.1.15,EG.5.2.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | D1184D BE.1.1,BA.5.6,GK.2,BA.1 |
| intergenic | T1426T BA.5.2.2,DV.7.1,BA.1.15,EG.7 |
| intergenic | T1496I GY.5,HF.1,BA.1 |
| intergenic | A1707A BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,GK.3.1,BA.1 |
| intergenic | V1750V GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | Y1770Y BA.1.14,BA.1 |
| intergenic | I2010T GK.2,BA.1 |
| intergenic | S2083_L2084delinsI BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1 |
| intergenic | T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15,EG.5.1.4,FL.2.3,FD.1.1,GK.1.3,HK.6 |
| intergenic | A2710T BA.2.86.1,BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15,BA.1 |
| intergenic | H2794Y BA.2.12,BA.1 |
| intergenic | F3018F BA.4,BA.5,BF.28,BA.1.15,GK.1,GK.3.1 |
| intergenic | I3055T BA.1 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5,EG.6.1,FL.15.1.1,HK.6 |
| intergenic | L3198L BA.2.12,BA.5.2.8,FU.2,GK.2,GZ.1,GK.1.1,BA.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | P3395H BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1 |
| intergenic | D3450D BA.5.6,BA.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1 |
| intergenic | L3674_G3676del BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1 |
| intergenic | D3728D BA.4.1.8,BQ.1.1.8,BQ.1.2.3,BA.1 |
| intergenic | I3758V BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,FL.15,BA.1 |
| intergenic | V3782I BA.1 |
| intergenic | C4163C BA.4,BA.1 |
| intergenic | V4310V BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20,BA.1.15,BA.5.5,BA.5.6,FL.20.2,FU.2,BA.1 |
| intergenic | F5133F BA.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | L5167L FL.2.3,EG.5.1,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | Y5444Y BA.5.1.10,GS.3,BA.1 |
| intergenic | G5494S HK.3.2,BA.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | T5690T BA.1 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3,BA.5.1.30,BF.26,BF.10 |
| intergenic | R5766R FU.2,GK.3.1,BA.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | S6180S BA.1 |
| intergenic | Y6930Y BA.5.1.10,BA.1.15,FK.1.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1 |
| intergenic | V11V BA.5.2.34,BA.1.18,BF.28,BA.1.15,FL.15 |
| intergenic | H69del BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15,BA.4.6,BA.1 |
| intergenic | V70del BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15,BA.4.6,BA.1 |
| intergenic | T95I BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,EG.5.1.8,BA.1 |
| intergenic | G142_Y145delinsD BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1 |
| intergenic | Y170Y BA.1 |
| intergenic | N211_L212delinsI BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1 |
| intergenic | R214_D215insEPE BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,BA.1 |
| intergenic | R346K BA.1.18,BE.1.1,BA.1.15,BA.1 |
| intergenic | S371L BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | S375F BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | G446S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,BA.1.15,FK.1.1,BA.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | Q493R BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.2.3,BA.1 |
| intergenic | G496S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,EG.5.1.4,BA.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | T547K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BQ.1.1.8,BA.1.15,BA.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | V705F BF.10,BA.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | A831A BA.1 |
| intergenic | N856K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,GK.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | L981F BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | P104dup BQ.1.13,BA.1.15,FL.1.5.2 |
| intergenic | G174D BA.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | D3G BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,FL.20,BA.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | L34F EG.5.1.9,GK.1,BA.1 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6,GZ.1,GE.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | A104V BA.2.86.1,BE.1.1,BQ.1,GS.4,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | T106T BA.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3,BF.41,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EU.1.1,GE.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1 |
| intergenic | G124S BA.1 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1,FL.15,BA.2.3,GK.1.1,HK.11,BA.1 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1,HK.6 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1 |
| intergenic | g.C-17T BF.26,BA.1.15 |
| intergenic | N25N EG.10.1,EG.5.1.4,GK.1,BA.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | L27F EG.7,HK.8 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | T319T HK.8 |
| intergenic | K351N HK.8 |
| intergenic | P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.6,GK.2.1,GK.1,GE.1,HK.8 |
| intergenic | T554I FL.1.5.2,HK.8 |
| intergenic | A656V BA.1.14,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.13,BA.5.6,HK.8 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8 |
| intergenic | H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8 |
| intergenic | G2207G HK.8 |
| intergenic | L2271F HK.8 |
| intergenic | S2488F GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | F3329F BF.41,BQ.1.2.3,FL.20,HK.8 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | A3518V HK.8 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | F3838F HK.1,HK.8 |
| intergenic | L3919F BA.5.1.2,FU.2,HK.8 |
| intergenic | A4008V HK.8 |
| intergenic | MD4116LN HK.8 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | D4455N EG.5.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8 |
| intergenic | A4587V HK.8 |
| intergenic | D4696D BQ.1.2.3,HK.8 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8 |
| intergenic | V5511L HK.8 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | Y5720H HK.8 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | R6060K HK.8 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8 |
| intergenic | E6116D HK.8 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | H6380Y BA.5.1.10,DV.7.1,HK.8 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | L6892L BA.4.6,HK.8 |
| intergenic | V6894V HK.8 |
| intergenic | E7015A HK.8 |
| intergenic | N7084N BA.5.1.30,BE.1.1,HK.8 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | F43F FL.15,HK.8 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.15,FL.20,HK.7,HK.11,HK.6,HK.3.2,HK.8 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | G142D HK.8 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV HK.8 |
| intergenic | L141_Y144del HK.8 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | I358I DV.7.1,HK.8 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2,HK.8 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | Q836R HK.8 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | N978N EG.5.1.4,HK.8 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | D1153Y BA.5,FD.1.1,HK.8 |
| intergenic | K1245R EU.1.1,HK.8 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1,EG.5.1.6,GK.2,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | S171L GK.2,HK.11,HK.8 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | L29I HK.8 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8 |
| intergenic | T49I BA.5,BA.5.1.30,BF.10,FD.1.1,HK.8 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1,HK.6,HK.8 |
| intergenic | I292I HK.8 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | g.CGTCC-25_-21TGTCT BQ.1.13,GJ.1.2 |
| intergenic | g.C-12T FL.15,GJ.1.2 |
| intergenic | Q22H GJ.1,GJ.1.2 |
| intergenic | D33N BF.26,GJ.1.2.6 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | V84A GJ.1.2 |
| intergenic | Y97Y BA.5.1.24,EG.5.1.8,EG.5.2.1,GE.1,GJ.1.2 |
| intergenic | A117T BA.5,GE.1,GJ.1.2 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | L149F GJ.1.2 |
| ORF1a | A181A / NSP2 |
| intergenic | R207C BA.5.2.3,EG.10.1,GJ.1.2 |
| intergenic | C231C BA.4.1,GJ.1.2 |
| intergenic | H388Y BA.1.14,EG.5.1.9,EU.1.1,FL.15,GJ.1.2 |
| intergenic | A405A EG.6.1,GJ.1.2 |
| intergenic | S428S GJ.1,GJ.1.2.6,GJ.1.2 |
| intergenic | S443S BA.5,EU.1.1,FU.2,GS.4,GE.1,GJ.1.2 |
| intergenic | L446F BA.5.1.2,GJ.1.2 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.1,GJ.1.2 |
| intergenic | T484I GJ.1.2 |
| intergenic | I523V FU.2,GK.1,GJ.1.2 |
| intergenic | F536F BA.4.1.8,GJ.1.2 |
| intergenic | L578L BA.5,BA.4.6,GJ.1.2 |
| intergenic | V627I BA.4,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,GJ.1.2 |
| ORF1a | F651C / NSP2 |
| intergenic | F651C GJ.1.2 |
| ORF1a | G662V / NSP2 |
| ORF1a | A668E / NSP2 |
| intergenic | P748P BA.5.2.20,BA.5.6,GJ.1.2 |
| intergenic | A773A GJ.1.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | H919Y GJ.1.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | D992D DV.7.1,EG.6.1,GJ.1.2 |
| intergenic | P1018L GJ.1.2 |
| intergenic | A1049V BA.4.1.8,BQ.1.1.8,BA.5.5,FU.2,GJ.1.2 |
| intergenic | V1057I DV.7.1,EG.5.1,GJ.1.2 |
| intergenic | G1069E FL.2.3,GJ.1.2 |
| intergenic | T1093I GJ.1.2 |
| intergenic | V1143I GJ.1.2 |
| intergenic | L1148L GV.1,GJ.1.2 |
| intergenic | K1197K GJ.1.2 |
| intergenic | I1203I BA.5.1.2,BQ.1,GS.4.1,GJ.1.2 |
| intergenic | A1204V GW.5,GJ.1.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | D1323D BA.5.1.24,FL.10.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | N1487N BA.5,GJ.1.2.6 |
| intergenic | P1497S GJ.1.2 |
| intergenic | V1535V GJ.1.2 |
| intergenic | L1546L GJ.1.2 |
| ORF1a | T1581R / NSP3 |
| intergenic | H1636H GJ.1.2 |
| intergenic | H1652H BQ.1.1.8,GS.4,GJ.1.2 |
| intergenic | Y1700Y BA.4.1,BQ.1.1.8,EG.6.1,FD.1.1,FU.2,GJ.1.2 |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10,BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BA.5.6,FY.3.1,GE.1,GJ.1.2 |
| intergenic | V1751V GJ.1.2 |
| ORF1a | Y1831Y / NSP3 |
| intergenic | Y1831Y EG.5.1.4,GJ.1.2 |
| intergenic | Y1868Y BA.4,BA.5.1.24,BF.26,EU.1.1,EG.6.1,BQ.1,GK.3.1,HF.1,GJ.1.2 |
| intergenic | Y1873Y BA.5.1.10,BF.9,BF.28,EG.5.1.3,HK.6,GJ.1.2 |
| ORF1a | D1893N / NSP3 |
| ORF1a | K1988K / NSP3 |
| intergenic | K2029K GE.1,GJ.1.2 |
| intergenic | L2044L GJ.1.2 |
| ORF1a | N2082T / NSP3 |
| intergenic | N2082T GJ.1.2 |
| intergenic | G2091S GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2 |
| intergenic | H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | M2096V GJ.1.2 |
| intergenic | L2127L GJ.1.2 |
| intergenic | N2155N GJ.1.2 |
| intergenic | I2244T FK.1.1,GE.1,GJ.1.2 |
| intergenic | C2282C GJ.1.2 |
| intergenic | T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15,EG.5.1.4,FL.2.3,FD.1.1,GK.1.3,HK.6,GJ.1.2 |
| intergenic | S2303F BA.5.1.30,FD.1.1,GJ.1.2 |
| intergenic | T2306T BA.5.1.30,BA.5.5,GJ.1.2 |
| ORF1a | F2358F / NSP3 |
| intergenic | Y2391Y GJ.1.2 |
| intergenic | I2490V FU.1,GJ.1.2 |
| intergenic | D2506D BA.2.12,GJ.1.2.6 |
| intergenic | L2518L BA.5.1.30,GJ.1.2.6,GJ.1.2 |
| intergenic | K2555K GJ.1.2 |
| intergenic | A2584V BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,EG.7,EG.6.1,FL.10.1,GK.1.3,GK.1,GJ.1.2 |
| intergenic | R2875C GJ.1.2 |
| intergenic | H2986H BE.1.1,CH.1.1.28,GZ.1,GJ.1.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | R3163K BF.10,BA.5.5,GJ.1.2 |
| intergenic | S3171S EG.6.1,GJ.1.2 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | D3222N GJ.1.2 |
| ORF1a | S3244T / NSP4 |
| intergenic | S3244T GJ.1.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| ORF1a | T3289T / NSP5 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | T3356I BF.26,GJ.1.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | P3395Y BA.5,GJ.1.2 |
| intergenic | F3397F EG.5.1,FL.20,GS.4,GK.2,GJ.1.2 |
| intergenic | D3450D BA.5.6,BA.1,GJ.1.2 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2 |
| ORF1a | M3621I / NSP6 |
| intergenic | M3621I GJ.1.2 |
| intergenic | H3631H BQ.1.1.8,GJ.1.2.6,GK.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | V3721V GJ.1.2 |
| intergenic | T3741T GJ.1.2 |
| intergenic | F3769F BA.5.1.30,BF.26,FD.1.1,BA.5.6,BQ.1,GK.3.1,GW.5,GJ.1.2 |
| intergenic | F3785F BF.9,EG.5.1.4,FD.1.1,BQ.1,GE.1,GJ.1.2 |
| ORF1a | T3807T / NSP6 |
| intergenic | T3807T GJ.1.2 |
| intergenic | C3867C BA.5.1.24,GJ.1.2 |
| intergenic | L3951L GJ.1.2 |
| intergenic | T4010T GJ.1.2 |
| intergenic | L4040L GJ.1.2 |
| intergenic | T4158T GJ.1.2 |
| intergenic | C4163C BA.4,BA.1,GJ.1.2 |
| intergenic | I4205V GJ.1,GJ.1.2.6,GJ.1.2 |
| intergenic | L4237I GJ.1.2 |
| intergenic | L4252L BQ.1.1.8,FL.8,GJ.1.2 |
| ORF1a | A4277T / NSP10 |
| intergenic | H4301H BA.2.12,GJ.1.2 |
| intergenic | D4317E GJ.1.2 |
| ORF1b | D4547N / NSP12 |
| intergenic | Y4548C GJ.1.2 |
| intergenic | Y4567Y BA.5,EG.5.1,BQ.1,GJ.1.2 |
| intergenic | G4612G GJ.1.2 |
| intergenic | A4642T GJ.1.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| ORF1b | R4905R / NSP12 |
| intergenic | R4905R DV.7.1,GJ.1.2 |
| intergenic | Q5053Q GJ.1.2 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| ORF1b | H5202H / NSP12 |
| intergenic | H5202H GJ.1.2 |
| intergenic | S5206S GJ.1.2 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | Q5335Q GJ.1.2 |
| intergenic | V5381I GJ.1.2 |
| intergenic | S5398P GJ.1.2.6,GJ.1.2 |
| intergenic | D5437D GJ.1.2 |
| intergenic | N5501N GJ.1.2 |
| ORF1b | V5511I / NSP13 |
| intergenic | V5511I GJ.1.2.6,GJ.1.2 |
| ORF1b | S5560N / NSP13 |
| intergenic | S5560N GJ.1.2 |
| intergenic | V5565M GJ.1.2 |
| intergenic | D5698D GJ.1.2 |
| ORF1b | A5703T / NSP13 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| ORF1b | K5832R / NSP13 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | D5955E BA.5.1.24,GJ.1.2 |
| intergenic | T5956I BA.5.2.2,BA.5,FD.1.1,GK.1.1,GV.1,GJ.1.2 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | N5988N BA.5.2.20,GJ.1.2 |
| intergenic | R6001R GJ.1.2 |
| intergenic | G6018G EG.10.1,GJ.1,GE.1,GJ.1.2 |
| intergenic | L6034L BA.2.3,GJ.1.2.6 |
| intergenic | D6051D BA.5.2.8,BA.5.1.30,GJ.1.2 |
| intergenic | L6102F GJ.1.2 |
| intergenic | V6161V BA.4.6,GJ.1.2.6 |
| intergenic | H6239H FL.15,GK.2,GV.1,GJ.1.2 |
| intergenic | Q6279H GJ.1.2 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | H6466Y GJ.1.2 |
| intergenic | Y6540Y BQ.1.13,BF.10,FD.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GK.3.1,GS.4,GJ.1.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | F6628F BA.5,BA.5.5,GK.1.1,GJ.1.2 |
| intergenic | P6714S GW.5,GJ.1.2 |
| intergenic | T6733T FK.1.1,FL.15,GJ.1.2 |
| intergenic | S6760S BA.5,GJ.1.2 |
| intergenic | M6815I GJ.1.2 |
| intergenic | D6824D GJ.1.2 |
| intergenic | F6985F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,GJ.1.2 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | V62L GJ.1.2 |
| intergenic | V62A GJ.1.2 |
| S | H66D GJ.1.2 |
| intergenic | V70V EG.5.1.6,GS.4.1,GJ.1.2 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | T95I BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,EG.5.1.8,BA.1,GJ.1.2 |
| intergenic | A123A GJ.1.2 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6,GJ.1.2 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8 |
| intergenic | K150I GJ.1.2 |
| intergenic | M153I BA.5.2.3,GE.1,GJ.1.2 |
| intergenic | KQ182NE GJ.1,GJ.1.2.6,GJ.1.2 |
| intergenic | R190M GJ.1.2 |
| intergenic | I197T GJ.1.2 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | A222V BF.26,GE.1,GJ.1.2 |
| intergenic | D253G GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2 |
| S | T307S BA.5.1.30,GJ.1.2 |
| S | T307S BA.5.1.30,GJ.1.2 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | S349P GJ.1.2 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | D398D GJ.1.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | Y473Y GJ.1.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GS.4.1,GJ.1.2 |
| intergenic | N542N GJ.1.2 |
| intergenic | N556N GJ.1.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | T618K BQ.1.13,GJ.1.2 |
| intergenic | P631P BA.5.2.8,GJ.1.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | Q675K GJ.1.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | S689I GJ.1.2 |
| intergenic | I692I BA.5.1.10,BA.4.6,FL.14,EG.6.1,FU.2,GK.1.3,HK.7,GJ.1.2 |
| intergenic | A701V BA.1.17,BA.4.1,BA.5.5,EG.10.1,FL.1.5,FL.1.5.2,GJ.1.2 |
| intergenic | P715P BA.5.2.20,FL.1.5.2,EG.5.1.6,FY.3.1,GJ.1.2.6 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | A845V GJ.1.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | V991V GJ.1.2 |
| intergenic | A1080A GJ.1.2 |
| intergenic | T1117I EG.7,GK.1,GJ.1.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | D22D GJ.1.2 |
| intergenic | A23A FK.1.1,GJ.1.2 |
| intergenic | F56F GJ.1.2 |
| intergenic | S60T GJ.1.2 |
| intergenic | T64I FU.2,GJ.1.2 |
| intergenic | T64T FU.2,GJ.1.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8 |
| intergenic | S74F BA.4,DV.7.1.2,BF.10,FL.1.5,FL.20.2,GJ.1.2 |
| intergenic | S74S EG.10.1,EG.6.1,EG.5.1.6,GJ.1.2 |
| intergenic | L95F BA.5.1.1,GK.1,GY.5,GJ.1.2 |
| intergenic | G100D GJ.1.2 |
| intergenic | L101L BF.9,EG.5.1,GJ.1.2 |
| intergenic | L106F BA.1.15,EG.5.1.4,FL.20,GJ.1.2 |
| intergenic | L108P GJ.1.2 |
| intergenic | V112V BA.5.2.3,BA.5,BQ.1.1.8,GJ.1.2 |
| intergenic | Y154Y BA.5.5,FL.10.1,FU.2,HK.3.2,GJ.1.2 |
| intergenic | T175I BA.5.1.30,BF.26,EG.5.2.1,GJ.1.2.6,GS.4,GK.1.1 |
| intergenic | F207F BA.5.1.2,BA.5.2.20,BA.2.3,GJ.1.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | D238D GJ.1.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | g.T-25G GJ.1.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | A40S GJ.1.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | 113 HK.6,GJ.1.2 |
| intergenic | F112F HK.6,GJ.1.2 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | H125Y BA.5,BA.5.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,EG.5.1,GJ.1.2 |
| intergenic | V9A GJ.1.2 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| ORF6 | L44P GJ.1.2 |
| intergenic | P57L BF.20,FU.2,GE.1,GJ.1.2 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | A13V GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2 |
| ORF7a | G38X GJ.1.2 |
| intergenic | T39I BA.5.1.1,EU.1.1,FY.3.1,GJ.1.2 |
| intergenic | D51G GJ.1.2 |
| intergenic | D69D BA.1.14,BA.5.2.8,EG.5.1.6,GY.5,GJ.1.2 |
| intergenic | P84S BA.2.12,GJ.1.2.6 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | L32F BA.4,GS.4,GK.1.1,GJ.1.2 |
| ORF8 | F16fs GJ.1.2 |
| intergenic | Q18X BA.5,FL.2.3,GJ.1.2 |
| intergenic | I74I GJ.1.2 |
| intergenic | E106Q GJ.1,GJ.1.2.6,GJ.1.2 |
| ORF8 | V117_I121delinsL GJ.1.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2 |
| intergenic | R36R BE.1.1,BF.10,GJ.1.2 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1,BA.5.6,GK.1.1,GJ.1.2 |
| intergenic | Y111Y BQ.1.2.3,GJ.1.2 |
| N | P122S BA.5.1.24,GJ.1.2 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,GY.5,GE.1,GJ.1.2 |
| intergenic | T148T BF.10,GV.1,GJ.1.2 |
| intergenic | P199S BA.5,BF.28,GJ.1.2 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2 |
| intergenic | A217A GJ.1.2 |
| intergenic | K249K FL.20,GJ.1.2 |
| intergenic | H300R GJ.1.2 |
| N | H300R GJ.1.2 |
| intergenic | N345N GJ.1.2 |
| intergenic | I357V GJ.1.2 |
| intergenic | T362I BA.5.1.24,BA.4.1,DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FU.2,GY.5,GS.4.1,GJ.1.2 |
| intergenic | Q409R GJ.1.2 |
| intergenic | S413R BA.5.1.24,FK.1.1,GJ.1.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | g.G29688C BE.1.1,EG.5.1.8,FL.1.5,GJ.1.2 |
| intergenic | g.G29706T FL.1.5,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2 |
| intergenic | g.G-92T EG.7,HN.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | L16F FD.1.1,GK.1,HN.1 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13,EG.10.1,EG.5.1.3,EG.5.1.4,HN.1 |
| intergenic | L27L BA.5.1.24,FL.1.5.2,FL.10.1,GE.1,HN.1 |
| intergenic | E37D GK.1.1,HN.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | V108V BF.10,HK.6,HN.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | R175R HN.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1 |
| ORF1a | Y621Y / NSP2 |
| intergenic | Y621Y BA.4,FL.1.5,FL.1.5.2,HN.1 |
| intergenic | I664I HN.1 |
| intergenic | T727I BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,HN.1 |
| intergenic | D795D EU.1.1,HN.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | G993S FL.1.5,FL.1.5.2,HN.1 |
| intergenic | V1025A HN.1 |
| intergenic | D1127Y HN.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | I1367V HN.1 |
| intergenic | R1464R GK.3.1,HN.1 |
| intergenic | A1679V EG.5.1.6,HN.1 |
| intergenic | I1714I BQ.1.1.8,HN.1 |
| intergenic | P1810L GJ.1,GK.1.1,HN.1 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1 |
| intergenic | D1849D BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,HN.1 |
| intergenic | T1874I HN.1 |
| intergenic | I1935V HN.1 |
| intergenic | K2143K BA.5.2.3,HN.1 |
| intergenic | G2207S BF.10,GK.1,HN.1 |
| intergenic | A2344T HN.1 |
| intergenic | S2488F GS.4.1,HK.8,HN.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | T3579A HN.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | T3710I HN.1 |
| intergenic | L3814L HN.1 |
| intergenic | I3853I BA.5.1.10,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BE.1.1,HN.1 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1,HF.1,HN.1 |
| intergenic | A4016V BF.10,EG.5.1,HN.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1 |
| intergenic | N4235N BA.4,BA.5,BA.5.1.1,FL.1.5,FL.1.5.2,FL.15,HN.1 |
| intergenic | D4335D BA.2.3,HK.3.2,HN.1 |
| intergenic | L4662L HN.1 |
| intergenic | A4703S HN.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | K4870N HN.1 |
| intergenic | S4910L HN.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | D5152D BA.5.1.24,DV.7.1,CH.1.1.28,BF.26,EG.5.1.3,BQ.1,HN.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | K5175K HN.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | S5360P HN.1 |
| intergenic | N5581N HN.1 |
| intergenic | F5586Y HN.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | L5779L HN.1 |
| intergenic | A5833V HN.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | L5932L BA.5.2.34,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.2.3,GJ.1,GK.1.1,HF.1,HN.1 |
| intergenic | D5955D HN.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | G5969G BA.5.1.30,HN.1 |
| intergenic | T6022I BA.4.6,HN.1 |
| intergenic | L6247S HN.1 |
| intergenic | L6308L BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.1.5,FD.1.1,GK.2.1,HN.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | D6543Y HN.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | S6599I HN.1 |
| ORF1b | Y6677F / NSP15 |
| intergenic | Y6677F HN.1 |
| intergenic | L6924L HN.1 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HN.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | A67S FL.8,HN.1 |
| intergenic | V70V EG.5.1.6,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | N99N DV.7.1,HN.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | E554D GE.1,HN.1 |
| intergenic | D574D HN.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | S691F HN.1 |
| intergenic | A701V BA.1.17,BA.4.1,BA.5.5,EG.10.1,FL.1.5,FL.1.5.2,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | G842S HN.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | R1185R HN.1 |
| intergenic | T1238T BA.5.5,HN.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1 |
| intergenic | G76S HN.1 |
| intergenic | T89I BF.26,EG.5.1.8,FL.1.5,EG.5.1.4,FD.1.1,GK.1.3,GK.1.1,HN.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | N41N BF.9,BA.5.5,FL.10.1,HN.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | I76T HN.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1 |
| intergenic | T10I HN.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | R25T BA.4.1,BA.5.2.20,HF.1,HK.3.2,HN.1 |
| intergenic | Q62H HN.1 |
| intergenic | A66A CK.2,HN.1 |
| intergenic | S5L HN.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | A43A EG.5.1.9,HN.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1 |
| intergenic | P30P EG.6.1,FL.10.1,HN.1 |
| intergenic | S54X HN.1 |
| intergenic | L84L HN.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | F66F BA.5.2.20,GS.3,GK.2,HN.1 |
| intergenic | H145H BA.5,FU.1,HN.1 |
| intergenic | G179S GK.1,HN.1 |
| intergenic | S190I HN.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1 |
| intergenic | L230F HN.1 |
| intergenic | I292I HK.8,HN.1 |
| intergenic | K387Q HN.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1 |
| intergenic | P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,GK.1,GY.5,HN.1 |
| intergenic | V30L HN.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733T HN.1 |
| intergenic | g.C-63T BA.5.1.10,BA.4,EG.10.1,FL.1.5,EG.6.1,FL.15,GK.1.3,BA.1,FY.5 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | H13H EU.1.1,FY.5 |
| intergenic | E37K FY.5 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5 |
| intergenic | R207C BA.5.2.3,EG.10.1,GJ.1.2,FY.5 |
| intergenic | L578L BA.5,BA.4.6,GJ.1.2,FY.5 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| ORF1a | A876V / NSP3 |
| intergenic | A876V FY.5 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| ORF1a | G934D / NSP3 |
| intergenic | G934D FY.5 |
| intergenic | S944S FY.5 |
| intergenic | P1120P FY.5 |
| intergenic | L1130F EG.5.1.8,EG.5.1.6,FY.5 |
| intergenic | L1249I FY.5 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | E1363G FY.5 |
| intergenic | V1391V FL.15.1.1,FY.5 |
| intergenic | L1438L BA.1.14,BA.5.2.2,BA.5.1.30,BA.4.6,FL.2.3,FL.25,FU.2,FY.5 |
| intergenic | I1551V FY.5 |
| intergenic | T1637I BQ.1,FY.5 |
| intergenic | L1683I FY.5 |
| ORF1a | Q1918Q / NSP3 |
| intergenic | Q1918Q FY.5 |
| intergenic | I2075V FY.5 |
| intergenic | L2095L FY.5 |
| intergenic | L2117L HK.3.2,FY.5 |
| intergenic | T2121I EG.5.1.3,HF.1.1,FY.5 |
| intergenic | K2204N FY.5 |
| ORF1a | L2295L / NSP3 |
| intergenic | L2295L FY.5 |
| ORF1a | T2310N / NSP3 |
| intergenic | T2310N FY.5 |
| intergenic | A2325V FY.5 |
| intergenic | M2796I BA.5.1.10,BA.5,FY.5 |
| intergenic | MS2796IF FY.5 |
| intergenic | P2950S FY.5 |
| intergenic | V2975V EG.5.2.1,GW.5,GY.5,FY.5 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| ORF1a | T3117T / NSP4 |
| intergenic | T3117T FY.5 |
| intergenic | M3129I FY.5 |
| intergenic | L3184L EG.5.1.3,FY.5 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | T3287I GK.1,FY.5 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| ORF1a | A3523T / NSP5 |
| intergenic | A3523T FY.5 |
| intergenic | V3647I FY.5 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | M3712I FY.5 |
| intergenic | A3726V BA.5.2.20,FY.5 |
| intergenic | V4137V FY.5 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5 |
| intergenic | T4249I BQ.1.13,BA.5.5,FL.15,FY.5 |
| intergenic | T4258I BQ.1.13,BQ.1,FY.5 |
| intergenic | V4369A BA.5.2.34,FY.5 |
| intergenic | D4532D BF.28,BF.26,BA.5.6,GW.5,FY.5 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | N4778S FY.5 |
| intergenic | F4920F EG.5.1.3,FU.1,FY.5 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | Y5066Y BA.5.2.20,FY.5 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | V5219V FY.5 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | T5321T FY.5 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5 |
| intergenic | T5449T FY.5 |
| intergenic | Q5567Q FY.5 |
| intergenic | K5669R FY.5 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | T5946A FY.5 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| ORF1b | G6048G / NSP14 |
| intergenic | G6048G FY.5 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | P6605S FY.5 |
| intergenic | L6697L BA.5.2.8,FY.5 |
| intergenic | L6749L FU.2,GK.3.1,FY.5 |
| intergenic | V6790V FY.5 |
| intergenic | F6868L FY.5 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HN.1,FY.5 |
| intergenic | L7010F EU.1.1,FY.5 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | T33I FY.5 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV HK.8,FY.5 |
| intergenic | L141_Y144del HK.8,FY.5 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | L176F BA.5.1.30,EG.5.1.9,FY.5 |
| intergenic | KQ182QE FY.5 |
| intergenic | Q183E FU.2,FY.5 |
| intergenic | Y200C FY.3.1,FY.4.1.1,FY.5 |
| intergenic | N211Y FY.5 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | ST477KR FY.5 |
| S | ST477KR FY.5 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | Y505H FY.5 |
| intergenic | T549T FY.5 |
| intergenic | T572I FD.1.1,GK.3.2,FY.5 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | T1006T BA.5.1.10,FY.5 |
| intergenic | I1114I FL.15,FY.5 |
| intergenic | V1137V FY.5 |
| S | V1137V FY.5 |
| intergenic | D1139D FY.5 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | V1264V BA.5.5,FY.5 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | R30C FY.5 |
| ORF3a | R30C FY.5 |
| intergenic | P42L FY.4.1.1,FU.2,FY.5 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5 |
| intergenic | H78Y BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.20,BF.28,EG.5.1,GK.2.1,FY.5 |
| intergenic | H78H BA.5.1.24,FY.5 |
| intergenic | DT222GI HK.7,FY.5 |
| ORF3a | DT222GI FY.5 |
| intergenic | T223I HK.7,FY.5 |
| intergenic | F230F EG.5.1.6,FY.5 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5 |
| intergenic | L133L FY.5 |
| intergenic | I168I FY.5 |
| intergenic | L16L BA.5.1.1,BA.5.1.2,FK.1.1,FD.1.1,GK.1.1,FY.5 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | S37F BF.10,EG.5.1,FY.5 |
| intergenic | D69G FY.5 |
| intergenic | A105V BA.5.2.20,FY.5 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5 |
| intergenic | P38L EG.5.1,GE.1,FY.5 |
| intergenic | I39F FY.5 |
| intergenic | S82F FY.5 |
| intergenic | T87I BA.5.1.10,BF.10,BA.5.5,FY.5 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1,BA.2.3,GK.2.1,GK.1,HK.3.2,FY.5 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | 10 FY.5 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | R41R DV.7.1,FY.5 |
| intergenic | S78S BA.5.1.2,EG.5.1,FY.5 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5 |
| intergenic | Y360Y BA.5.2.2,BA.5.2.3,BQ.1.1.8,FL.15,FU.1,FY.5 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5 |
| intergenic | g.C-3T BA.5.2.2,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,BQ.1,HK.3.2,FY.5 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5 |
| intergenic | g.C29774T BA.1.18,EG.5.1.9,FY.5 |
| intergenic | g.G-56T BA.5.6,HK.3.3 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | E36D HK.3.3 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | T1395T HK.3.3 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3 |
| intergenic | Q2034H HK.3.3 |
| intergenic | H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3 |
| intergenic | N2187S HK.3.3 |
| intergenic | K2810K BA.4.1,HK.3.3 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | A3958A HK.3.3 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | D4455N EG.5.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | N5083N HK.3.3 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | A5432V HK.3.3 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | L6034L BA.2.3,GJ.1.2.6,HK.3.3 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | Q6801K HK.3.3 |
| intergenic | Y6930Y BA.5.1.10,BA.1.15,FK.1.1,HK.3.3 |
| intergenic | D7018G HK.3.3 |
| intergenic | V11V BA.5.2.34,BA.1.18,BF.28,BA.1.15,FL.15,HK.3.3 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.15,FL.20,HK.7,HK.11,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3 |
| intergenic | R190K BQ.1.1.8,FK.1.1,HK.3.3 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | S256L BA.5.1.2,BQ.1,GK.1.1,HK.3.3 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | C391C HK.3.3 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2,HK.8,HK.3.3 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | A647A HK.3.3 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | G1124V BF.9,GK.1.1,HK.3.3 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | A39A GK.3.1,HK.3.3 |
| intergenic | L52F FL.15,HK.3.3 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1,EG.5.1.6,GK.2,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | N41N BF.9,BA.5.5,FL.10.1,HN.1,HK.3.3 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | I58del HK.3.3 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | P364L FL.14,FL.10.1,HK.3.3 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | V28I FL.20,HY.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | G49D BA.5.1.24,BA.5,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,HY.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | A138T HY.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1 |
| intergenic | V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5,BF.9,CH.1.1.28,HY.1 |
| intergenic | P197S HY.1 |
| intergenic | L204F BA.5.1.24,GK.3.1,HY.1 |
| intergenic | R207C BA.5.2.3,EG.10.1,GJ.1.2,FY.5,HY.1 |
| intergenic | R232H BF.10,EG.10.1,FL.8,HY.1 |
| intergenic | A354V FL.25,HY.1 |
| intergenic | S443S BA.5,EU.1.1,FU.2,GS.4,GE.1,GJ.1.2,HY.1 |
| intergenic | N460N HY.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1 |
| intergenic | T614I BA.5.1.10,HK.3.2,HY.1 |
| intergenic | T727T GE.1,HY.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | V852I HY.1 |
| ORF1a | S918A / NSP3 |
| intergenic | S918A HY.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | L1016F HY.1 |
| intergenic | V1143F HY.1 |
| intergenic | D1273D BA.5,BQ.1.1.8,BA.5.5,FL.10.1,EG.5.1.6,BQ.1,GK.3.1,HY.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | N1458N HY.1 |
| intergenic | T1542T BA.5.5,BA.4.6,HY.1 |
| intergenic | H1580H HY.1 |
| intergenic | N1672N BA.4.1,HY.1 |
| intergenic | M1769V HY.1 |
| intergenic | Y1846C EG.5.1.3,HY.1 |
| intergenic | E1858E HY.1 |
| intergenic | A2097V HY.1 |
| intergenic | T2264I FU.1,HY.1 |
| intergenic | V2469V HY.1 |
| intergenic | Y2560Y BA.5,BF.41,EG.5.1.3,HY.1 |
| ORF1a | S2926Y / NSP4 |
| intergenic | S2926Y HY.1 |
| intergenic | V2998V BA.5.5,HY.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | S3046S HY.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | Y3098Y HY.1 |
| ORF1a | S3099S / NSP4 |
| intergenic | S3099S HY.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| ORF1a | F3448F / NSP5 |
| intergenic | F3448F HY.1 |
| intergenic | D3450D BA.5.6,BA.1,GJ.1.2,HY.1 |
| intergenic | P3504L BA.5,GK.3.1,HY.1 |
| intergenic | A3610V HY.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | V3751V EG.5.2.1,EG.5.1.3,HY.1 |
| intergenic | S3860S HY.1 |
| intergenic | S3920S GS.4.1,HY.1 |
| intergenic | D3992D HY.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | V4520A HY.1 |
| intergenic | R4565R HY.1 |
| intergenic | P4619P EG.5.1.4,HY.1 |
| intergenic | S4647S HY.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | A4774T HY.1 |
| intergenic | T4854T HY.1 |
| intergenic | P4897P BF.9,HY.1 |
| intergenic | Y4922Y HY.1 |
| intergenic | D5010D HY.1 |
| intergenic | H5042N HY.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | V5092V HY.1 |
| intergenic | N5105N GK.1.1,HY.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | V5240L HY.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | P5371L BA.5.1.10,BA.5.2.8,HY.1 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1,HY.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | L6034L BA.2.3,GJ.1.2.6,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | P6222L BA.5,HY.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | K6358R HY.1 |
| intergenic | L6501L HY.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | I6620V HY.1 |
| intergenic | A6623A EG.5.1.4,GK.1.1,HY.1 |
| intergenic | A6832V BA.5,EG.5.1,FL.10.1,EG.5.1.6,GE.1,HY.1 |
| intergenic | P6878P HY.1 |
| intergenic | I7079T GK.2,HY.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | F32L HY.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6,GJ.1.2,HY.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HY.1 |
| intergenic | H146H HY.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | A243A HY.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | C432C BA.5,BF.28,BF.26,BA.4.6,HY.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | A475V FL.15.1.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,HY.1 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | L518L EG.5.1.3,HY.1 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1,FL.25,FU.2,GJ.1,GK.1,GW.5,HY.1 |
| intergenic | N606N DV.7.1.2,EG.5.1.6,GK.2,HY.1 |
| intergenic | D614G HY.1 |
| intergenic | QD613HG FK.1.1,HY.1 |
| intergenic | T618S HY.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | T768T HY.1 |
| intergenic | T778T BF.28,FL.15,HY.1 |
| intergenic | P793S HY.1 |
| intergenic | I850V HY.1 |
| intergenic | A871A HY.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | V1122M FL.14,HY.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | F43F BA.2.12,BA.5.2.20,FD.1.1,HY.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | L71I BA.5.2.3,HY.1 |
| intergenic | C81Y HY.1 |
| intergenic | L101P HY.1 |
| intergenic | I179T HY.1 |
| intergenic | F207F BA.5.1.2,BA.5.2.20,BA.2.3,GJ.1.2,HY.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | P240L BA.5.1.2,EG.5.1.4,EG.5.1,HY.1 |
| intergenic | E261E HY.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | V10V HY.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | A69A HY.1 |
| intergenic | Y71Y EG.5.1.4,FL.15,BA.2.3,GK.1.1,HY.1 |
| intergenic | W75L GK.2,HF.1,HY.1 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3,GK.3.2,GK.1.1,GE.1,HF.1,HY.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | L124L BA.2.12,BA.4,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.20,GK.1,HY.1 |
| intergenic | V187V HY.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | D61F DV.7.1,HY.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | A43V BF.41,GK.1.1,HK.1,HY.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | K53K HY.1 |
| intergenic | C90F HY.1 |
| intergenic | X122KextX? HY.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | G60G EU.1.1,HY.1 |
| intergenic | D82D BA.5,DV.7.1,GW.5,HY.1 |
| intergenic | D98D BE.1.1,EG.5.1,GK.1,HY.1 |
| intergenic | D103A HY.1 |
| N | D103A HY.1 |
| intergenic | N153N HY.1 |
| intergenic | A155V BA.5.2.34,BA.5.1.2,HY.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | E253D HY.1 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1,BF.26,EG.5.1,BA.5.6,FL.15,HK.7,GE.1,HY.1 |
| intergenic | Y298Y BA.1.17,BE.1.1,EG.10.1,GE.1,HY.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | g.C-13A BF.26,GZ.1,HY.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | L149L JD.1.1.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | S994N GZ.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | L2211L BQ.1.1.8,JD.1.1.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | A3730A BA.2.12,EG.6.1,GA.4.1,BA.2.3,BQ.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | I3779T GA.4.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | T4164I JD.1.1.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | N4607N JD.1.1.1 |
| intergenic | A4642V JD.1.1.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | V4790V JD.1.1.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | L5551L FD.1.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | Y5722Y JD.1.1.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | C6307C BA.5.2.34,JD.1.1.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | V6408V JD.1.1.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | S6739L BA.5.1.10,BF.28,FL.25,GK.3.1,GK.2,JD.1.1.1 |
| intergenic | H7023H JD.1.1.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | Y248H GE.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | A475V FL.15.1.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | T229I FL.15,FU.1,GK.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | P240L BA.5.1.2,EG.5.1.4,EG.5.1,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,FU.2,BQ.1,GK.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9,FL.15,FU.2,GK.1,GK.3.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | D3D GE.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | Y333Y BA.4,BF.26,BA.4.6,BA.5.6,JD.1.1.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | g.C-41T JD.1.1.2 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | K262K JD.1.1.2 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | Y600Y BF.10,JD.1.1.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | L2211L BQ.1.1.8,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | T2648N JD.1.1.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | D4344D EG.5.1.4,JD.1.1.2 |
| intergenic | N4607N JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | A4642V JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | V4790V JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | L5006L JD.1.1.2 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | Y6160Y BF.28,FL.1.5,BA.5.6,FY.4.1.1,GS.4,JD.1.1.2 |
| intergenic | C6307C BA.5.2.34,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | S6375N EG.5.1.4,JD.1.1.2 |
| intergenic | V6408V JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | A475V FL.15.1.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | E583D GK.1.1,GE.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | T89I BF.26,EG.5.1.8,FL.1.5,EG.5.1.4,FD.1.1,GK.1.3,GK.1.1,HN.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | A12T BA.5.1.24,JD.1.1.2 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,FU.2,BQ.1,GK.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | D3D GE.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | G60G EU.1.1,HY.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1,BA.5.6,GK.1.1,GJ.1.2,JD.1.1.2 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | g.C-76T EG.5.1.1 |
| intergenic | g.C-63T BA.5.1.10,BA.4,EG.10.1,FL.1.5,EG.6.1,FL.15,GK.1.3,BA.1,FY.5,EG.5.1.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | E2K EG.5.1.1 |
| ORF1a | S17C / NSP1 |
| intergenic | S17C EG.5.1.1 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13,EG.10.1,EG.5.1.3,EG.5.1.4,HN.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | V60I BA.4,EG.5.1.1 |
| intergenic | M85del BA.5.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | Y97Y BA.5.1.24,EG.5.1.8,EG.5.2.1,GE.1,GJ.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | G105G HK.11,EG.5.1.1 |
| intergenic | A117S EG.5.1.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| ORF1a | T170N / NSP1 |
| intergenic | N178S EG.5.1.1 |
| ORF1a | T214N / NSP2 |
| intergenic | T214N EG.5.1.1 |
| intergenic | S216F EG.5.1.1 |
| intergenic | P254P EG.5.1.1 |
| intergenic | P271S BA.5.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | I284V EG.5.1.1 |
| intergenic | S302F BA.5.1.24,BF.9,FU.1,BA.2.3,GW.5,GZ.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | T319T HK.8,EG.5.1.1 |
| intergenic | S376L BA.5.2.3,BA.5.5,EG.5.1.9,FU.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | G392D EG.5.1.1 |
| intergenic | S443F BA.5.2.2,BF.41,BA.5.2.20,FL.20,GY.5,EG.5.1.1 |
| intergenic | L454F BA.5.1.24,BA.5.2.20,FL.1.5,EU.1.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | A498V BA.5.1.1,GK.3.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | A537V EG.5.1.1 |
| intergenic | V561V EG.5.1.1 |
| intergenic | G604S FL.25,FU.1,HK.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | L642F BA.4.1,BA.5.5,EG.5.1.6,GK.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | Q676H EG.5.1.1 |
| ORF1a | K684R / NSP2 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1 |
| intergenic | V710V BA.4.6,EG.5.1.1 |
| intergenic | N811N BA.5.2.34,EG.5.1.1 |
| intergenic | L815L EG.5.1,FL.8,FU.1,BQ.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | V830V EG.5.1.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | G934D FY.5,EG.5.1.1 |
| intergenic | D935N EG.5.1.1 |
| intergenic | S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6,GK.2.1,GK.3.1,GS.4,GY.5,EG.5.1.1 |
| intergenic | Q986K EG.5.1.1 |
| intergenic | T1017I EG.5.1.1 |
| intergenic | L1075L EG.5.1.1 |
| intergenic | P1096L FL.15,EG.5.1.1 |
| ORF1a | A1146T / NSP3 |
| intergenic | A1146T EG.5.1.1 |
| ORF1a | K1212R / NSP3 |
| ORF1a | I1259V / NSP3 |
| intergenic | A1268A FL.10.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | L1313L EG.5.1.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | T1429I EG.5.1.1 |
| intergenic | L1507F EG.6.1,EG.5.1.1 |
| ORF1a | T1542N / NSP3 |
| intergenic | F1544F BF.26,EG.5.1.1 |
| intergenic | T1567I FU.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | T1589I FL.1.5.2,FD.1.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | P1596L GV.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | I1607T FD.1.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | R1703R BQ.1.2.3,FL.14,EG.5.1.1 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1 |
| intergenic | T1881I BA.4.6,HK.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | N1922N BA.5,GE.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | F1925F BA.5.2.2,BF.28,BE.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,FL.10.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | N1934N EG.5.1.1 |
| intergenic | E2070G EG.5.1.1 |
| intergenic | H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,EG.5.1.1 |
| intergenic | D2101D BA.5.1.24,BA.5.1.2,BF.9,EG.5.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | F2172F BQ.1.1.8,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,GK.2.1,GW.5,HF.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | K2204N FY.5,EG.5.1.1 |
| intergenic | S2407S EG.5.1.1 |
| intergenic | L2473L EG.5.1.1 |
| intergenic | G2509S EG.5.1.1 |
| intergenic | G2509D EG.5.1.1 |
| ORF1a | H2516R / NSP3 |
| intergenic | H2516R EG.5.1.1 |
| ORF1a | V2542I / NSP3 |
| ORF1a | V2542V / NSP3 |
| intergenic | H2659Y BA.5.2.20,EG.5.1.1 |
| ORF1a | K2771T / NSP4 |
| intergenic | Y2845H EG.5.1.1 |
| intergenic | A2917A EG.5.1.1 |
| intergenic | F2922L EG.5.1.1 |
| intergenic | S2981S EG.10.1,FL.15.1.1,GY.5,EG.5.1.1 |
| intergenic | H2986H BE.1.1,CH.1.1.28,GZ.1,GJ.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | V3021V GK.3.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,EG.5.1.1 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5,EG.6.1,FL.15.1.1,HK.6,EG.5.1.1 |
| intergenic | L3198L BA.2.12,BA.5.2.8,FU.2,GK.2,GZ.1,GK.1.1,BA.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | T3288T EG.5.1.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | N3358N CK.2,BQ.1.2.3,EG.5.1.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | V3420V BA.2.12,BE.1.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | D3479D BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1.8,GK.3.1,GE.1,EG.5.1.1 |
| ORF1a | T3487N / NSP5 |
| intergenic | A3523A EG.5.1.4,FD.1.1,FL.20.2,FL.20,GY.5,EG.5.1.1 |
| intergenic | G3578G EG.5.1.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | P3613S EG.10.1,EU.1.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | A3615V BA.5.1.2,BF.26,BA.5.5,EG.5.1.8,FD.1.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | L3641L EG.5.1.1 |
| intergenic | L3644L EG.5.1.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | F3769F BA.5.1.30,BF.26,FD.1.1,BA.5.6,BQ.1,GK.3.1,GW.5,GJ.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | L3796L BA.2.12,BA.5,GE.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | Y3811Y EG.5.1.1 |
| intergenic | L3828L BA.5,DV.7.1,BA.5.5,EG.5.1.1 |
| intergenic | L3829L BA.5.2.3,EG.5.1.4,FD.1.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | F3838F HK.1,HK.8,EG.5.1.1 |
| intergenic | K3839K BA.4.1,BA.5.2.20,BA.5.5,GE.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | Q3966H EG.5.1.1 |
| intergenic | Y4013Y EG.5.1.1 |
| intergenic | P4058P BA.4.1,BA.5.1.30,EG.5.1,HF.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | A4136A EG.5.1.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1 |
| intergenic | G4178V BA.5.1.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | P4220S EG.5.1.1 |
| intergenic | T4355I BA.5,GK.3.1,GS.4,EG.5.1.1 |
| ORF1b | D4455N / NSP12 |
| intergenic | D4455N EG.5.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1 |
| intergenic | H4467H BA.5.1.10,BQ.1.1.8,GE.1,EG.5.1.1 |
| ORF1b | I4506T / NSP12 |
| intergenic | I4506T EG.5.1.1 |
| intergenic | V4558V HK.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | D4627D EG.5.1.1 |
| ORF1b | E4669V / NSP12 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | A4774V GV.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | N4808N FL.15,EG.5.1.1 |
| intergenic | F4820F BA.5.1.10,BA.4.1,BF.26,BQ.1.2.3,EG.5.1,BA.2.3,GV.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | I4858T EG.5.1.1 |
| intergenic | L4861L EG.5.1.1 |
| ORF1b | GG5062CS / NSP12 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | N5135S EG.5.1.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | D5152D BA.5.1.24,DV.7.1,CH.1.1.28,BF.26,EG.5.1.3,BQ.1,HN.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | D5196D EG.5.1.1 |
| intergenic | Q5214Q EG.5.1.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | C5343C EG.5.1.1 |
| intergenic | Y5355Y BA.2.12,BA.5.2.20,EG.5.1,FL.1.5.2,FL.15,FU.1,BA.2.3,EG.5.1.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | T5451I BA.5.1.10,BF.26,GE.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | V5550V GS.4.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | L5551L EG.7,FL.14,FL.10.1,FU.2,HF.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | Y5593Y EG.5.1.1 |
| intergenic | T5691A HF.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | A5703A GE.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | A5846A DV.7.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | G5862G EG.5.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | H5878H EG.5.1.1 |
| intergenic | D5955D HN.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | D6015D EG.5.1.1 |
| intergenic | G6018G EG.10.1,GJ.1,GE.1,GJ.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1 |
| ORF1b | S6103S / NSP14 |
| intergenic | S6103S EG.5.1.1 |
| intergenic | D6104D BA.2.12,BF.26,EG.6.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | P6128H EG.5.1.1 |
| intergenic | P6128L BA.2.12,HK.6,EG.5.1.1 |
| intergenic | C6210C EG.5.1.1 |
| intergenic | L6228L EG.5.1.1 |
| intergenic | K6236K EG.5.1.1 |
| intergenic | F6302F BQ.1.13,EG.5.1.1 |
| intergenic | G6341G EG.5.1.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | K6486E EG.5.1.1 |
| intergenic | G6528C EG.5.1.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | V6579F EG.5.1.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | A6623V DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FL.15,GK.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | L6706L EG.5.1.1 |
| intergenic | F6715L EG.5.1.1 |
| ORF1b | V6755I / NSP15 |
| intergenic | V6755I EG.5.1.1 |
| intergenic | K6759K EG.5.1.1 |
| intergenic | H6984H EG.5.1.1 |
| intergenic | V6995V EG.5.1.1 |
| intergenic | R7030R EG.5.1.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | Q14R FL.15,EG.5.1.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | T22N EG.5.1.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | F32F BA.5.1.10,BA.5.1.2,BF.28,BA.4.6,EG.5.1.1 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.15,FL.20,HK.7,HK.11,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| S | T95N EG.5.1.1 |
| intergenic | K113K HF.1,EG.5.1.1 |
| S | Q134Q EG.5.1.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6,GJ.1.2,HY.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDA EG.5.1.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | KQ182EE FU.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | Q183E FU.2,FY.5,EG.5.1.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | S256L BA.5.1.2,BQ.1,GK.1.1,HK.3.3,EG.5.1.1 |
| intergenic | L276L BA.5.1.30,EG.5.1.1 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | N343N EG.5.1.9,EG.7,FD.1.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | K356T BA.2.86.1,GA.4.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | L452L EG.5.1.1 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.5.2.3,FY.3.1,BQ.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | G639G EG.5.1.4,EG.5.1.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | I692I BA.5.1.10,BA.4.6,FL.14,EG.6.1,FU.2,GK.1.3,HK.7,GJ.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | A845S FU.2,HF.1.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | I909V EG.5.1.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | A1080A GJ.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | D1084Y FL.8,EG.5.1.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | N1158N EG.5.1.1 |
| intergenic | H1159H EG.5.1.1 |
| intergenic | Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BF.28,FL.1.5,GK.3.1,GV.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | 9 FK.1.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | F8F FK.1.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | V13L GY.5,EG.5.1.1 |
| intergenic | K21N BA.5.1.10,BA.5.1.1,DV.7.1.2,BA.4.6,FL.15,EG.5.1.1 |
| intergenic | S26L EG.5.1.1 |
| intergenic | V29L EG.5.1.1 |
| intergenic | P36P BQ.1.13,BQ.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | F43F BA.2.12,BA.5.2.20,FD.1.1,HY.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | V50I EG.5.1.1 |
| intergenic | L53F BA.5.2.20,FL.25,EG.5.1.1 |
| intergenic | S60F BA.4.6,EG.5.1.1 |
| intergenic | S60S EG.5.1.1 |
| intergenic | 66 FL.20,EG.5.1.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | V97I BF.26,EG.6.1,GK.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | A99D EG.5.1.1 |
| intergenic | P104S BA.5.1.30,FL.15,EG.5.1.1 |
| intergenic | S117I EG.5.1.1 |
| intergenic | Y145Y FL.20,EG.5.1.1 |
| intergenic | L203L EG.5.1.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | E239D BF.10,FU.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | P240S BA.4,BQ.1.1.8,GV.1,GS.4.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | T269T BF.26,EG.5.1.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | T30A FL.15,EG.5.1.1 |
| intergenic | N48N EG.5.1.1 |
| intergenic | S68F GK.2.1,FL.20,GE.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | T9T BF.10,EG.5.1.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | F26C EG.5.1.1 |
| intergenic | L29L EG.5.1.1 |
| intergenic | N41N BF.9,BA.5.5,FL.10.1,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6,GZ.1,GE.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | N74T EG.5.1.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | N117N BQ.1.13,BA.5.5,EG.5.1.3,BA.5.6,FL.15,EG.5.1.1 |
| ORF6 | V9G EG.5.1.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | I3T EG.5.1.1 |
| ORF7a | L5V EG.5.1.1 |
| intergenic | L17F BA.5.2.20,EG.5.1.1 |
| intergenic | T28I BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1,GE.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | GI8X GK.1.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | V62V BA.5.2.20,BE.1.1,EG.5.1.4,EU.1.1,FL.20,BQ.1,GW.5,EG.5.1.1 |
| intergenic | T87I BA.5.1.10,BF.10,BA.5.5,FY.5,EG.5.1.1 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1,BA.2.3,GK.2.1,GK.1,HK.3.2,FY.5,EG.5.1.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | T24I BA.5.2.34,BF.9,FL.8,EG.5.1.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | K38N EG.5.1.1 |
| intergenic | N75N BA.4.1.8,DV.7.1,BE.1.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | R107R EG.5.1.1 |
| intergenic | T148T BF.10,GV.1,GJ.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | T166T EG.5.1.1 |
| intergenic | G170G EG.5.1.1 |
| intergenic | A182S EG.5.1.1 |
| intergenic | P199S BA.5,BF.28,GJ.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1,HK.6,HK.8,EG.5.1.1 |
| intergenic | A211V FU.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | G214D EG.5.1.1 |
| intergenic | E231G EG.5.1.1 |
| intergenic | G328G EG.5.1.1 |
| intergenic | T366I DV.7.1,EG.5.2.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | E367E BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.1.1 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,EG.5.1.1 |
| intergenic | T379I BF.28,FU.1,GW.5,GY.5,EG.5.1.1 |
| intergenic | K387K EG.5.1.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | T417A EG.5.1.1 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1 |
| intergenic | g.C29686A EG.5.1.1 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1,GK.3.2,GW.5,HK.6,GS.4.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1 |
| intergenic | g.C29774T BA.1.18,EG.5.1.9,FY.5,EG.5.1.1 |
| intergenic | g.T29804C EG.5.1.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | N430N JG.1 |
| intergenic | R542C BA.5.2.20,EG.5.1.3,EG.5.1,FU.1,GS.4.1,JG.1 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | L1438L BA.1.14,BA.5.2.2,BA.5.1.30,BA.4.6,FL.2.3,FL.25,FU.2,FY.5,JG.1 |
| intergenic | R1464W JG.1 |
| intergenic | T1589A GV.1,JG.1 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | N1917N BA.4.1,JG.1 |
| intergenic | T2512I JG.1 |
| intergenic | V2586F JG.1 |
| intergenic | R2638R JG.1 |
| intergenic | N2708N BA.5.2.3,EG.5.1.4,GE.1,JG.1 |
| intergenic | I2854T JG.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | T3459M JG.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | D3992D HY.1,JG.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | N4235N BA.4,BA.5,BA.5.1.1,FL.1.5,FL.1.5.2,FL.15,HN.1,JG.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3,BA.5.1.30,BF.26,BF.10,JG.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | D6543Y HN.1,JG.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | I6721V JG.1 |
| intergenic | Y6813Y EG.5.1,BQ.1,JG.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.15,FL.20,HK.7,HK.11,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | C336C EG.5.1.3,GV.1,JG.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | T732I BA.2.12,EG.5.1,JG.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | C148C BA.5.1.10,BA.5,FL.15,JG.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | P99L BA.5.1.30,FD.1.1,HK.6,JG.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | L139S JG.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1 |
| intergenic | g.C-156T FL.1.5.1 |
| intergenic | g.T-64C FL.1.5.1 |
| intergenic | g.C-44T BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,FL.1.5.1 |
| intergenic | g.C-36T EG.5.1.4,FL.1.5.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GE.1,GS.4.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | K120N BA.5.2.3,FL.1.5.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | G146G FD.1.1,BA.2.3,HK.6,FL.1.5.1 |
| intergenic | N160N BA.4.6,FK.1.1,FL.1.5.1 |
| ORF1a | R175R / NSP1 |
| intergenic | N178N FL.1.5.1 |
| intergenic | V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5,BF.9,CH.1.1.28,HY.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | P193H FL.1.5.1 |
| intergenic | P197S HY.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | S216S BA.4,BQ.1.13,FL.1.5.1 |
| intergenic | L219L EU.1.1,BQ.1,FL.1.5.1 |
| ORF1a | T253T / NSP2 |
| intergenic | T253T FL.1.5.1 |
| intergenic | P276P FL.1.5.1 |
| intergenic | Y304Y BA.5.1.24,FL.1.5.1 |
| intergenic | G345C FL.1.5.1 |
| intergenic | T350I BA.5.2.3,BA.5.5,GV.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | T403I BA.5.1.10,BQ.1,GK.3.1,GS.3,FL.1.5.1 |
| intergenic | S443S BA.5,EU.1.1,FU.2,GS.4,GE.1,GJ.1.2,HY.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | V488V FL.1.5.1 |
| intergenic | S549F FL.1.5.1 |
| intergenic | L552F FL.1.5.1 |
| intergenic | T554N BA.5.2.3,FL.1.5.1 |
| intergenic | T602T FL.1.5.1 |
| ORF1a | Y621Y / NSP2 |
| intergenic | Y621Y BA.4,FL.1.5,FL.1.5.2,HN.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | V649F BA.5.2.20,FL.1.5.1 |
| intergenic | I659I EG.5.1.6,FL.1.5.1 |
| ORF1a | A776D / NSP2 |
| intergenic | D795D EU.1.1,HN.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| ORF1a | D877G / NSP3 |
| intergenic | D877G FL.1.5.1 |
| intergenic | P892P EG.5.1.9,FL.1.5.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | C936C FL.1.5.1 |
| ORF1a | L969H / NSP3 |
| intergenic | G993S FL.1.5,FL.1.5.2,HN.1,FL.1.5.1 |
| ORF1a | I1023_N1026del / NSP3 |
| intergenic | H1113Y BA.2.12,EG.5.2.1,GK.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | D1127D GW.5,FL.1.5.1 |
| intergenic | G1155C BA.5.1.2,EG.5.1.4,GK.3.1,GE.1,HK.11,HK.6,FL.1.5.1 |
| intergenic | Y1174Y BA.5.2.34,EG.5.1.4,FK.1.1,BA.5.6,GE.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | V1271I FL.1.5.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | L1313L EG.5.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | Y1337Y BA.5,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BQ.1.2.3,FL.10.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | I1360I FL.1.5.1 |
| intergenic | L1507F EG.6.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | G1548D FL.1.5.1 |
| intergenic | H1652H BQ.1.1.8,GS.4,GJ.1.2,FL.1.5.1 |
| intergenic | E1724E BA.5.6,FL.1.5.1 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| ORF1a | Y1836Y / NSP3 |
| intergenic | L1852L FL.1.5.1 |
| intergenic | F1907F FU.1,FU.2,FL.1.5.1 |
| ORF1a | D1933A / NSP3 |
| intergenic | D1933A FL.1.5.1 |
| intergenic | P1977P BA.5.1.30,GK.3.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | S1978F BA.5.2.8,EG.5.2.1,EG.6.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | A2001T FL.1.5.1 |
| intergenic | S2022P FL.1.5.1 |
| intergenic | D2043N FL.1.5.1 |
| intergenic | D2060D EG.5.1.8,FL.1.5.1 |
| intergenic | W2232C EG.5.1.6,FL.1.5.1 |
| intergenic | M2259I DV.7.1.2,BA.4.6,FL.1.5.1 |
| intergenic | G2269D FL.1.5.1 |
| intergenic | L2298L FL.1.5.1 |
| intergenic | A2379V BA.4.1.8,EG.5.1.8,FL.20.2,FL.1.5.1 |
| intergenic | S2500S GK.2,FL.1.5.1 |
| intergenic | V2522I FL.1.5.1 |
| intergenic | D2525D DV.7.1.2,FU.2,GK.1.1,GE.1,HK.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | Y2560Y BA.5,BF.41,EG.5.1.3,HY.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | A2618V BA.2.12,FL.1.5.1 |
| intergenic | V2629V FL.1.5.1 |
| intergenic | A2701G FL.1.5.1 |
| intergenic | S2731G BQ.1.13,FL.1.5.1 |
| ORF1a | Q2772L / NSP4 |
| intergenic | Q2772L FL.1.5.1 |
| intergenic | F2780_V2783del FL.1.5.1 |
| intergenic | I2806I BA.5.1.24,FY.3.1,HF.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | T2823I BQ.1.13,CK.2,FL.1.5.1 |
| intergenic | A2917A EG.5.1.1,FL.1.5.1 |
| ORF1a | G2959D / NSP4 |
| intergenic | T2967I BA.2.12,FL.1.5.1 |
| intergenic | T2967T BA.5.5,FL.1.5.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | A3061A BA.5.2.3,BF.26,EG.5.1.4,FL.1.5.1 |
| ORF1a | A3070V / NSP4 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | D3240D FL.1.5.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| ORF1a | M3428I / NSP5 |
| ORF1a | V3572M / NSP6 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | A3625V FU.2,FL.1.5.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | L3694F EG.5.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | A3730A BA.2.12,EG.6.1,GA.4.1,BA.2.3,BQ.1,JD.1.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | P3767S FL.1.5.1 |
| intergenic | L3828L BA.5,DV.7.1,BA.5.5,EG.5.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1 |
| ORF1a | F3838C / NSP6 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1,HF.1,HN.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | A3987A FL.1.5.1 |
| intergenic | K4039K FL.1.5.1 |
| intergenic | T4129I FL.1.5.2,GK.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | 4206 FL.1.5.1 |
| intergenic | I4205I FL.1.5.1 |
| intergenic | 4238 FL.1.5.1 |
| intergenic | N4235N BA.4,BA.5,BA.5.1.1,FL.1.5,FL.1.5.2,FL.15,HN.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | F4269F FL.1.5.1 |
| intergenic | M4390I FL.1.5.1 |
| intergenic | D4499N FL.1.5.1 |
| intergenic | D4545Y FL.1.5.1 |
| ORF1b | Q4576Q / NSP12 |
| ORF1b | Y4609Y / NSP12 |
| intergenic | Y4609Y FL.1.5.1 |
| intergenic | P4624S FL.1.5.1 |
| intergenic | H4648Y FL.1.5.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | F4820F BA.5.1.10,BA.4.1,BF.26,BQ.1.2.3,EG.5.1,BA.2.3,GV.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | Y4847Y BA.4,FL.10.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | V4887V BA.5.1.24,BA.5.6,FL.1.5.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | V5092V HY.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | Y5259Y FL.1.5.1 |
| intergenic | N5303N EG.5.1,FL.15,FL.1.5.1 |
| intergenic | S5305L FL.1.5.1 |
| intergenic | F5348F BF.10,BQ.1,GE.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | C5353C BA.5.1.30,FK.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | A5434T FL.1.5.1 |
| intergenic | H5488Y BF.26,EG.5.1,BA.5.6,GZ.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | G5494G HK.6,FL.1.5.1 |
| intergenic | L5500L FL.1.5.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | V5565M GJ.1.2,FL.1.5.1 |
| intergenic | A5703A GE.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| ORF1b | D5790Y / NSP13 |
| intergenic | D5790Y FL.1.5.1 |
| intergenic | A5833S FL.1.5.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| ORF1b | N5886N / NSP13 |
| intergenic | N5886N FL.1.5.1 |
| intergenic | G5942G FL.1.5.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| ORF1b | N5992D / NSP14 |
| intergenic | T6131T BA.2.12,DV.7.1,EG.5.1.8,FK.1.1,FL.20.2,BQ.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | C6132C FL.1.5.1 |
| intergenic | T6175I BQ.1.1.8,BA.4.6,GE.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | G6176C FL.1.5.1 |
| intergenic | T6218I FL.1.5.1 |
| ORF1b | A6232T / NSP14 |
| intergenic | H6239H FL.15,GK.2,GV.1,GJ.1.2,FL.1.5.1 |
| intergenic | Q6268Q FL.1.5.1 |
| intergenic | Y6317Y EG.6.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | Y6372Y FL.1.5.1 |
| ORF1b | A6396T / NSP14 |
| ORF1b | E6415D / NSP14 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3,EG.5.1,FL.10.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GK.3.1,GY.5,FL.1.5.1 |
| intergenic | A6532V BA.4.1.8,FL.1.5.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | T6566T BA.5.5,FL.1.5.1 |
| intergenic | V6573V BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,FU.1,GK.2,GS.4.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | V6579F EG.5.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | S6599I HN.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | S6606F FL.1.5.1 |
| intergenic | L6614F BA.5.2.8,FL.1.5.1 |
| intergenic | S6695I FL.1.5.1 |
| ORF1b | D6719G / NSP15 |
| intergenic | D6719G FL.1.5.1 |
| intergenic | I6721T FL.1.5.1 |
| intergenic | M6723I FL.1.5.1 |
| intergenic | C6742F BF.26,GE.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | L6848L EG.5.1.8,GW.5,FL.1.5.1 |
| intergenic | N6899N FL.1.5.1 |
| intergenic | L6924L HN.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | C6952C FL.1.5.1 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HN.1,FY.5,FL.1.5.1 |
| intergenic | R7014H FL.1.5.1 |
| intergenic | R7014N BQ.1.1.8,BQ.1.2.3,BA.5.6,FL.1.5.1 |
| intergenic | H7023H JD.1.1.1,FL.1.5.1 |
| ORF1b | I7069V / NSP16 |
| intergenic | N7095N FL.1.5.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | F43F FL.15,HK.8,FL.1.5.1 |
| intergenic | D53D BA.5,BA.5.1.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.2.3,FL.1.5.1 |
| intergenic | L54L DV.7.1,GY.5,FL.1.5.1 |
| intergenic | H69Y EG.5.1.8,GK.2,GY.5,FL.1.5.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6,GJ.1.2,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | KQ182EE FU.2,EG.5.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | Q183E FU.2,FY.5,EG.5.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | R190K BQ.1.1.8,FK.1.1,HK.3.3,FL.1.5.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | D215Y EG.5.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | Q218E FL.1.5.1 |
| intergenic | S221S BA.2.12,FK.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | GD252VG HK.6,FL.1.5.1 |
| intergenic | GD252VN FL.1.5.1 |
| intergenic | S256P BF.26,FL.1.5.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | S494P EG.10.1,EG.5.1,EG.5.1.6,FY.4.1.1,GK.2,HK.1,HF.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1,FL.25,FU.2,GJ.1,GK.1,GW.5,HY.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | N556N GJ.1.2,FL.1.5.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | A672V BA.4.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | A701V BA.1.17,BA.4.1,BA.5.5,EG.10.1,FL.1.5,FL.1.5.2,GJ.1.2,HN.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | NRA764KRS FL.1.5.1 |
| intergenic | T768N FL.1.5.1 |
| intergenic | N777N BF.41,FL.1.5.1 |
| intergenic | Q836K FL.1.5.1 |
| S | Q913Q FL.1.5.1 |
| intergenic | S939S FL.1.5.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | G1085A BA.5.2.20,FL.1.5.1 |
| S | G1085A BA.5.2.20,FL.1.5.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | M1229I FL.1.5.1 |
| intergenic | V1264L BA.5.5,EU.1.1,FK.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | T24I FL.1.5,FL.1.5.1 |
| intergenic | A54V EG.5.1.9,GK.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | A99V BA.4.6,FL.1.5.1 |
| intergenic | L106L BA.5.2.2,BA.5.1.10,CK.2,GK.2,GY.5,HK.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | R126M FL.1.5.1 |
| intergenic | D210Y FL.1.5,FL.1.5.1 |
| ORF3a | L214L FL.1.5.1 |
| intergenic | T221I FL.1.5.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | E241D FL.1.5.1 |
| ORF3a | E241D XBB.1.5,FL.1.5.1 |
| intergenic | N257N FL.1.5.1 |
| intergenic | g.G-10T FL.1.5.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | I76I FU.2,FL.1.5.1 |
| intergenic | I80F FL.1.5.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | N117N BQ.1.13,BA.5.5,EG.5.1.3,BA.5.6,FL.15,EG.5.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | L124L BA.2.12,BA.4,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.20,GK.1,HY.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | L138L FL.1.5.1 |
| intergenic | G202G BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1.2,FL.1.5.1 |
| ORF6 | F7Y FL.1.5.1 |
| intergenic | A12T BA.5.1.24,JD.1.1.2,FL.1.5.1 |
| intergenic | L15L FL.1.5.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | N34N FL.1.5.1 |
| intergenic | N47N FL.1.5,FL.1.5.1 |
| intergenic | D53D GA.4.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | L5P FL.1.5.1 |
| intergenic | T14I BA.5.5,FL.1.5.1 |
| intergenic | A79A GS.4,HF.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | F19L BA.4,BA.5.1.30,GV.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | A43V BF.41,GK.1.1,HK.1,HY.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | T11I FU.1,GK.2.1,HF.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | T87I BA.5.1.10,BF.10,BA.5.5,FY.5,EG.5.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | F104S FL.1.5.1 |
| intergenic | Y105Y BA.5.1.1,BA.4.1,FL.1.5.1 |
| ORF8 | R115L BF.41,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,FL.1.5.1 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1,BA.2.3,GK.2.1,GK.1,HK.3.2,FY.5,EG.5.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | P6P EG.6.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.5.2.20,FL.1.5.1 |
| intergenic | R32_G34del FK.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | G34G GK.2.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | F66F BA.5.2.20,GS.3,GK.2,HN.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | Y86Y BA.2.12,BA.5.2.3,BA.5.5,FL.1.5.1 |
| intergenic | P122S BA.5.1.24,FL.1.5.1 |
| N | Q163R FL.1.5.1 |
| intergenic | R185C FL.1.5.1 |
| intergenic | S193N EG.5.1.3,FL.1.5.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1 |
| N | A208G FL.1.5.1 |
| intergenic | S232N FL.1.5.1 |
| intergenic | Q281L GK.1.3,FL.1.5.1 |
| intergenic | P302P BA.5.2.34,BA.4.1,CH.1.1.28,FL.15,GE.1,HK.6,FL.1.5.1 |
| intergenic | P326S EG.5.1.3,FL.1.5.1 |
| intergenic | I337V FL.1.5.1 |
| intergenic | D341D BA.4.1.8,BA.5,BE.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | P365S FL.1.5.1 |
| intergenic | T366I DV.7.1,EG.5.2.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | P383L EG.5.1.6,FL.1.5.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | N22K FL.1.5.1 |
| intergenic | R24C BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | A28V BA.2.12,BA.5.6,FL.1.5.1 |
| intergenic | g.C29675A FL.1.5.1 |
| intergenic | g.G29690T FD.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | g.C29721T HK.3.2,FL.1.5.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1 |
| intergenic | g.C29769T DV.7.1,BA.5.2.20,BF.26,FL.15,BA.2.3,FL.1.5.1 |
| intergenic | g.G29779T EG.5.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | g.G-47T BF.28,HR.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13,EG.10.1,EG.5.1.3,EG.5.1.4,HN.1,EG.5.1.1,HR.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | M85_E87delinsK EG.5.1.4,HR.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | A138A EG.5.1,HR.1 |
| intergenic | G150C GK.2.1,HR.1 |
| intergenic | I453T HR.1 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.1,GJ.1.2,HR.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1 |
| ORF1a | K714N / NSP2 |
| intergenic | K714N HR.1 |
| intergenic | G728S HR.1 |
| intergenic | I785V HR.1 |
| intergenic | T814I FD.1.1,HR.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | L893L GV.1,HR.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | P926P HR.1 |
| intergenic | Y949C HR.1 |
| intergenic | A964A BA.1.18,GW.5,HR.1 |
| intergenic | L1034F EG.5.1.6,HR.1 |
| intergenic | A1049V BA.4.1.8,BQ.1.1.8,BA.5.5,FU.2,GJ.1.2,HR.1 |
| intergenic | V1122_N1123del HR.1 |
| intergenic | D1273D BA.5,BQ.1.1.8,BA.5.5,FL.10.1,EG.5.1.6,BQ.1,GK.3.1,HY.1,HR.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | E1341E BA.5.2.34,BF.26,HR.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | L1356L BA.4.6,FK.1.1,HR.1 |
| intergenic | Y1425Y BA.5.5,BA.2.3,HR.1 |
| intergenic | H1738Y HR.1 |
| intergenic | F1907F FU.1,FU.2,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | D1971D HR.1 |
| intergenic | P1977L BA.5.2.20,FD.1.1,HR.1 |
| intergenic | L2341I HR.1 |
| intergenic | A2375A HR.1 |
| intergenic | S2406S HR.1 |
| intergenic | Y2489Y BA.5.2.20,EG.5.2.1,HR.1 |
| intergenic | S2500S GK.2,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | L2524L HR.1 |
| intergenic | S2625S BA.4,BA.5.2.3,BA.4.6,EG.5.1.6,HR.1 |
| ORF1a | I2729M / NSP3 |
| intergenic | I2729M HR.1 |
| intergenic | I2873M BA.5.6,HR.1 |
| intergenic | R2875R EU.1.1,HR.1 |
| intergenic | D2980N BA.4.6,FU.1,HR.1 |
| ORF1a | E2982D / NSP4 |
| intergenic | E2982D HR.1 |
| intergenic | A2994T HR.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5,EG.6.1,FL.15.1.1,HK.6,EG.5.1.1,HR.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | L3313L FD.1.1,GK.2,GV.1,HR.1 |
| intergenic | V3367I FU.1,HR.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | D3450D BA.5.6,BA.1,GJ.1.2,HY.1,HR.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | H3633H BQ.1,HR.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | L3736I HR.1 |
| intergenic | L3796L BA.2.12,BA.5,GE.1,EG.5.1.1,HR.1 |
| intergenic | C3867C BA.5.1.24,GJ.1.2,HR.1 |
| intergenic | N4042S HR.1 |
| intergenic | T4090I GK.1.3,HR.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | S4186S FL.10.1,HR.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1 |
| intergenic | A4247V HR.1 |
| intergenic | K4483R BA.5,BA.5.5,HR.1 |
| intergenic | D4545D HR.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | F4986F BA.5.1.10,HR.1 |
| intergenic | L5028F HR.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | T5131I BA.4.1,BF.28,BA.4.6,GA.4.1,HR.1 |
| intergenic | 5152 HR.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | K5172R GE.1,HR.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | H5320H HR.1 |
| intergenic | C5353C BA.5.1.30,FK.1.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | N5426N HR.1 |
| intergenic | D5437D GJ.1.2,HR.1 |
| intergenic | V5550L FU.2,HR.1 |
| intergenic | I5582I GS.4,HR.1 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,HR.1 |
| intergenic | S5634S HR.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | I6156I HR.1 |
| intergenic | P6252L HR.1 |
| intergenic | D6304G HR.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | D6440D BF.10,GK.2,HR.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | N6615N HR.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | A67S FL.8,HN.1,HR.1 |
| S | A67S HN.1,HR.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | G142_Y145delinsDD GK.3.1,HK.1,HR.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | K304N HF.1.1,HF.1,HR.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | D578D HR.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | A623V BA.5.2.3,HR.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | NSP679KSH BA.5.2.20,GV.1,HK.3.2,HR.1 |
| intergenic | NSP679KSY HR.1 |
| intergenic | V736V HR.1 |
| S | V736V HR.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | E780D BF.10,HR.1 |
| intergenic | P897P HR.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | V88A HR.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | P262T HR.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | S68F GK.2.1,FL.20,GE.1,EG.5.1.1,HR.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | I161I BA.5.2.3,BF.10,FD.1.1,HK.7,HR.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | L17F BA.5.2.20,EG.5.1.1,HR.1 |
| intergenic | S44L HR.1 |
| intergenic | N52N BF.26,EG.5.1.3,HF.1,HR.1 |
| intergenic | Y97N HR.1 |
| intergenic | P99P HR.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | A43L HR.1 |
| intergenic | H42H FL.10.1,HR.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9,FL.15,FU.2,GK.1,GK.3.1,JD.1.1.1,HR.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1 |
| intergenic | P80L HR.1 |
| intergenic | D98D BE.1.1,EG.5.1,GK.1,HY.1,HR.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | I292V HR.1 |
| intergenic | S310N HR.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1 |
| intergenic | A414A HR.1 |
| intergenic | Q418H BQ.1.2.3,HK.6,HR.1 |
| intergenic | g.C-17T BF.26,BA.1.15,HR.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | F70F JD.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1 |
| intergenic | Y600Y BF.10,JD.1.1.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | S994N GZ.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | P1158L BA.1.14,JD.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | I2076T JD.1 |
| intergenic | L2211L BQ.1.1.8,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | A3730A BA.2.12,EG.6.1,GA.4.1,BA.2.3,BQ.1,JD.1.1.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | I3779T GA.4.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | D4344D EG.5.1.4,JD.1.1.2 |
| intergenic | V4372I BA.5.1.1,JD.1 |
| intergenic | L4391F BA.5,BE.1.1,BA.5.5,HK.1,JD.1 |
| intergenic | N4607N JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1 |
| intergenic | A4642V JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | V4790V JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.2,BF.26,EG.5.1.8,EG.5.1,FL.8,FL.20,GE.1,JD.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | L5551L FD.1.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,HR.1,JD.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | Y6160Y BF.28,FL.1.5,BA.5.6,FY.4.1.1,GS.4,JD.1.1.2 |
| intergenic | C6307C BA.5.2.34,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | F6326F JD.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | S6375N EG.5.1.4,JD.1.1.2 |
| intergenic | V6408V JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | S6739L BA.5.1.10,BF.28,FL.25,GK.3.1,GK.2,JD.1.1.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,JD.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | Y248H GE.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | T323I JD.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JD.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | A475V FL.15.1.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | E583D GK.1.1,GE.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | T89I BF.26,EG.5.1.8,FL.1.5,EG.5.1.4,FD.1.1,GK.1.3,GK.1.1,HN.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | T229I FL.15,FU.1,GK.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | P240L BA.5.1.2,EG.5.1.4,EG.5.1,HY.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | A12T BA.5.1.24,JD.1.1.2,FL.1.5.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,FU.2,BQ.1,GK.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1 |
| intergenic | I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9,FL.15,FU.2,GK.1,GK.3.1,JD.1.1.1,HR.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | D3D GE.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | G60G EU.1.1,HY.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1,BA.5.6,GK.1.1,GJ.1.2,JD.1.1.2 |
| intergenic | D144D BA.5.2.2,JD.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | A267V EU.1.1,JD.1 |
| intergenic | Y333Y BA.4,BF.26,BA.4.6,BA.5.6,JD.1.1.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | G192D EG.6.1,FL.20,JD.1.2 |
| intergenic | C230C GE.1,JD.1.2 |
| intergenic | K564N JD.1.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | D846D JD.1.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | P971H JD.1.2 |
| intergenic | V1143F HY.1,JD.1.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | R1566K JD.1.2 |
| intergenic | V1957V JD.1.2 |
| intergenic | L2211L BQ.1.1.8,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | L2527L JD.1.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | V3048V BE.1.1,HK.11,JD.1.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | M3733I JD.1.2 |
| intergenic | S4186S FL.10.1,HR.1,JD.1.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | A4568A BA.5,FL.15,JD.1.2 |
| intergenic | N4607N JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | D4661G JD.1.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | V4790V JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | A5091S FL.1.5,JD.1.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | G5215S JD.1.2 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | I5229I FL.15,GK.1.1,GS.4.1,JD.1.2 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | D6057E JD.1.2 |
| intergenic | D6069Y BA.5.1.24,JD.1.2 |
| intergenic | V6306V FU.2,JD.1.2 |
| intergenic | L6336F JD.1.2 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | V6408V JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | A6802T JD.1.2 |
| intergenic | Y6930Y BA.5.1.10,BA.1.15,FK.1.1,HK.3.3,JD.1.2 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | N148T FL.15,FU.2,HK.7,JD.1.2 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | R237R JD.1.2 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | E554Q BF.26,JD.1.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | L822F JD.1.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | P1162S BA.5.2.3,BA.5,CH.1.1.28,JD.1.2 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | P274P JD.1.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | T10T BA.4.1.8,JD.1.2 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | F87F EG.5.1.4,JD.1.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,FU.2,BQ.1,GK.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | D3D GE.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,GY.5,GE.1,GJ.1.2,JD.1.2 |
| intergenic | E136D BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BQ.1,JD.1.2 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | P365L BA.5.2.20,FL.1.5,GE.1,GS.4.1,JD.1.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,JD.1.2 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | G30S JJ.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | F548F JJ.1 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | L1797L JJ.1 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1 |
| intergenic | S1924N JJ.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | P3395Y BA.5,GJ.1.2,JJ.1 |
| intergenic | F3650C JJ.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JJ.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | H4467H BA.5.1.10,BQ.1.1.8,GE.1,EG.5.1.1,JJ.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HN.1,FY.5,FL.1.5.1,JJ.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.15,FL.20,HK.7,HK.11,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | I47V JJ.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | P240L BA.5.1.2,EG.5.1.4,EG.5.1,HY.1,JD.1.1.1,JJ.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1 |
| intergenic | g.G29779T EG.5.1,FL.1.5.1,JJ.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | K120N BA.5.2.3,FL.1.5.1,JN.2 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2 |
| intergenic | A211D BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | M598I JN.2 |
| intergenic | Y621C JN.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | V1056L BA.2.86.1,BA.5.2.20,JN.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | A1679V EG.5.1.6,HN.1,JN.2 |
| intergenic | Y1796Y JN.2 |
| intergenic | K1817N JN.2 |
| intergenic | K1973R BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | N1999S JN.2 |
| intergenic | N2526S BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | T2676T BA.2.86.1,EG.5.2.1,FL.20,JN.2 |
| intergenic | A2710T BA.2.86.1,BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15,BA.1,JN.2 |
| intergenic | A2828V JN.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | I3043V JN.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2 |
| intergenic | T3520T JN.2 |
| intergenic | V3593F BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2 |
| intergenic | V3968A JN.2 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | L4184L BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | N4358N BA.2.86.1,BF.26,BA.5.5,EU.1.1,GY.5,JN.2 |
| intergenic | K4483E BA.5.1.24,FU.2,JN.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | S4953S JN.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | S5164S BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | P5319P GE.1,JN.2 |
| intergenic | T5439I BA.5.2.2,JN.2 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | L5762L BA.5.1.10,BA.5.1.30,BA.4.6,GS.4,JN.2 |
| intergenic | N5827S JN.2 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | D6051D BA.5.2.8,BA.5.1.30,GJ.1.2,JN.2 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | P6128S BQ.1.1.8,FL.25,GK.2.1,GE.1,JN.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | S6800S JN.2 |
| intergenic | P6888P JN.2 |
| intergenic | T6889M EG.7,GE.1,JN.2 |
| intergenic | V16_N17insMPLF BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | TTR19ITT BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | S50L BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,EG.5.1.1,JN.2 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,EG.5.1.1,JN.2 |
| intergenic | V127F BA.2.86.1,BA.5.2.2,JN.2 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | FR157SG BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | N164N JN.2 |
| intergenic | N211_V213delinsIG BA.2.86.1,BQ.1.13,JN.2 |
| intergenic | L216F BA.2.86.1,EG.5.1.3,GK.2.1,JN.2 |
| intergenic | S221L HF.1,JN.2 |
| intergenic | H245N BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | HR245NI JN.2 |
| intergenic | A264D BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | V289L JN.2 |
| intergenic | I332V BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | K356T BA.2.86.1,GA.4.1,EG.5.1.1,JN.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | R403K BA.2.86.1,BA.5,DV.7.1,EG.10.1,EG.7,FY.3.1,JN.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | VG445HS BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | N450D BA.2.86.1,BF.28,JN.2 |
| intergenic | L452W BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | N481_E484delinsKGK BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | N481_E484delinsKVK JN.2 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1,FL.25,FU.2,GJ.1,GK.1,GW.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2 |
| intergenic | A570V BA.2.86.1,FD.1.1,JN.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | P621S BA.2.86.1,GY.5,JN.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | P681R BA.2.86.1,FL.1.5.2,GK.2,JN.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | T859I JN.2 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,GK.1,JN.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | P1140S JN.2 |
| intergenic | P1143L BA.2.86.1,BQ.1.1.8,JN.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | Y1206F JN.2 |
| intergenic | Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BF.28,FL.1.5,GK.3.1,GV.1,EG.5.1.1,JN.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | A99V BA.4.6,FL.1.5.1,JN.2 |
| intergenic | D155H JN.2 |
| intergenic | S171L GK.2,HK.11,HK.8,JN.2 |
| intergenic | Q213K BA.2.12,EG.5.1.3,FL.10.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,JN.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | H227R JN.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | D3H BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | V23L JN.2 |
| intergenic | T30A BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6,GZ.1,GE.1,EG.5.1.1,JN.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | A104V BA.2.86.1,BE.1.1,BQ.1,GS.4,GS.4.1,BA.1,JN.2 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | V62M JN.2 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1,BA.2.3,GK.2.1,GK.1,HK.3.2,FY.5,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JN.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | Q9L JN.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1,FL.15,BA.2.3,GK.1.1,HK.11,BA.1,JN.2 |
| intergenic | D144Y JN.2 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | Q229K BA.2.86.1,JN.2 |
| intergenic | P302P BA.5.2.34,BA.4.1,CH.1.1.28,FL.15,GE.1,HK.6,FL.1.5.1,JN.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2 |
| intergenic | g.C-222T BA.4,BA.5,EG.7,BA.2.3,BQ.1,JG.3 |
| intergenic | g.C-80T BA.5.1.1,BA.2.3,JG.3 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | L4L JG.3 |
| intergenic | V23I JG.3 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | L107F JG.3 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | N189N BA.5.1.10,BA.5.1.30,EG.5.2.1,JG.3 |
| intergenic | A211A JG.3 |
| intergenic | S302F BA.5.1.24,BF.9,FU.1,BA.2.3,GW.5,GZ.1,EG.5.1.1,JG.3 |
| intergenic | H325Y BQ.1.13,JG.3 |
| intergenic | G334G BA.5.1.10,JG.3 |
| intergenic | V438V JG.3 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BF.26,BF.10,CK.2,EU.1.1,GK.1,HK.3.2,JG.3 |
| intergenic | R542C BA.5.2.20,EG.5.1.3,EG.5.1,FU.1,GS.4.1,JG.1,JG.3 |
| intergenic | N593N JG.3 |
| intergenic | I601L JG.3 |
| intergenic | C667Y JG.3 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | V751M JG.3 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | T861T EG.5.1.8,JG.3 |
| intergenic | F871F BA.5,BF.26,JG.3 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | E940D JG.3 |
| intergenic | S966F BA.5.2.20,JG.3 |
| intergenic | P1120S JG.3 |
| intergenic | K1230N JG.3 |
| intergenic | T1242S JG.3 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | T1322A JG.3 |
| intergenic | P1330P BF.10,EG.5.1.3,FL.1.5,JG.3 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | T1504T FK.1.1,JG.3 |
| intergenic | T1581T BA.1.17,BA.5.2.20,JG.3 |
| intergenic | A1679A JG.3 |
| intergenic | A1702A JG.3 |
| intergenic | N1709N BA.1.18,CK.2,FL.1.5.2,GK.1,JG.3 |
| intergenic | Q1758R JG.3 |
| intergenic | T1794I JG.3 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | N1922N BA.5,GE.1,EG.5.1.1,JG.3 |
| intergenic | P2079S EG.5.1.9,EG.6.1,GV.1,JG.3 |
| intergenic | T2087I CH.1.1.28,EG.5.2.1,JG.3 |
| intergenic | H2092Y BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.2.3,JG.3 |
| intergenic | A2098V JG.3 |
| intergenic | D2136N JG.3 |
| intergenic | P2144S JG.3 |
| intergenic | T2196T EG.5.1,JG.3 |
| intergenic | M2259I DV.7.1.2,BA.4.6,FL.1.5.1,JG.3 |
| intergenic | T2274I BA.5.1.1,EG.6.1,GK.2,JG.3 |
| intergenic | S2285F BF.26,GE.1,JG.3 |
| intergenic | S2312S JG.3 |
| intergenic | M2365I BA.4,JG.3 |
| intergenic | A2388A JG.3 |
| intergenic | S2556L JG.3 |
| intergenic | L2620L JG.3 |
| intergenic | N2682N JG.3 |
| intergenic | A2690V BA.1.17,JG.3 |
| intergenic | V2754I BA.4,JG.3 |
| intergenic | A2832S JG.3 |
| intergenic | F3018F BA.4,BA.5,BF.28,BA.1.15,GK.1,GK.3.1,JG.3 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | L3060I JG.3 |
| intergenic | R3066K JG.3 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | L3238I HK.11,JG.3 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | V3299V JG.3 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3 |
| intergenic | S3384L JG.3 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3 |
| intergenic | H3426H JG.3 |
| intergenic | P3447S BA.2.3,JG.3 |
| intergenic | A3456T JG.3 |
| intergenic | A3497V BQ.1.13,JG.3 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3 |
| intergenic | I3618V JG.3 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | V3683I EG.10.1,FU.2,JG.3 |
| intergenic | R3706R JG.3 |
| intergenic | A3730A BA.2.12,EG.6.1,GA.4.1,BA.2.3,BQ.1,JD.1.1.1,FL.1.5.1,JG.3 |
| intergenic | I3853I BA.5.1.10,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BE.1.1,HN.1,JG.3 |
| intergenic | I4098V JG.3 |
| intergenic | Y4172Y BA.5.1.2,BF.26,HF.1,JG.3 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | E4313E JG.3 |
| intergenic | M4502V JG.3 |
| intergenic | A4642V JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JG.3 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | F4718F JG.3 |
| intergenic | F4811F BA.2.12,GK.1.1,JG.3 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | A5098T JG.3 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | Y5276Y BF.9,EG.5.1.6,GY.5,JG.3 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | D5437D GJ.1.2,HR.1,JG.3 |
| intergenic | S5490L BA.5.2.34,BA.5.1.24,FL.15,JG.3 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2,JG.3 |
| intergenic | Y5622Y JG.3 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | P5726P BA.5,BA.5.5,JG.3 |
| intergenic | L5762L BA.5.1.10,BA.5.1.30,BA.4.6,GS.4,JN.2,JG.3 |
| intergenic | D5790D JG.3 |
| intergenic | V5819V BA.5.2.3,BA.5.1.2,FL.10.1,FU.2,JG.3 |
| intergenic | P5828L EG.5.2.1,FL.20,BQ.1,JG.3 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | Y5867H JG.3 |
| intergenic | T5941I BA.5.5,FK.1.1,JG.3 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | P5995S BQ.1.1.8,JG.3 |
| intergenic | A6044V BA.5,BA.4.6,GY.5,GV.1,JG.3 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | P6083L BA.5,JG.3 |
| intergenic | Y6160Y BF.28,FL.1.5,BA.5.6,FY.4.1.1,GS.4,JD.1.1.2,JG.3 |
| intergenic | A6192V JG.3 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | G6469R JG.3 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | A6669S JG.3 |
| intergenic | P7049L JG.3 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | T22I BF.26,EG.5.1.6,JG.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | F32F BA.5.1.10,BA.5.1.2,BF.28,BA.4.6,EG.5.1.1,JG.3 |
| intergenic | R34L JG.3 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.15,FL.20,HK.7,HK.11,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | H69Y EG.5.1.8,GK.2,GY.5,FL.1.5.1,JG.3 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3 |
| intergenic | L176F BA.5.1.30,EG.5.1.9,FY.5,JG.3 |
| intergenic | G181V JG.3 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | G261V BA.5.1.1,EG.5.1,JG.3 |
| intergenic | T299I BA.5,BA.5.1.2,EG.10.1,GK.1,JG.3 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | T307I JG.3 |
| intergenic | C336C EG.5.1.3,GV.1,JG.1,JG.3 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | I410I BQ.1.1.8,BF.26,FD.1.1,JG.3 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | F429F JG.3 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | N450D BA.2.86.1,BF.28,JN.2,JG.3 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | A688V BA.5.2.34,BA.5,BA.5.1.30,JG.3 |
| intergenic | S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4,GA.4.1,FY.4.1.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,JG.3 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | K786R JG.3 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | D1127G JG.3 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | P1162S BA.5.2.3,BA.5,CH.1.1.28,JD.1.2,JG.3 |
| intergenic | Y1272Y JG.3 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | S74S EG.10.1,EG.6.1,EG.5.1.6,GJ.1.2,JG.3 |
| intergenic | L140F BA.4,BA.2.3,JG.3 |
| intergenic | C157C JG.3 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | S253S BA.2.12,BE.1.1,GS.4,GK.2,JG.3 |
| intergenic | T268T JG.3 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | V47L EG.5.1.4,JG.3 |
| intergenic | D72G JG.3 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | F28F BF.28,GS.3,JG.3 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | L129L EG.5.2.1,JG.3 |
| intergenic | I140I JG.3 |
| intergenic | N203N BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1.3,JG.3 |
| intergenic | H3fs JG.3 |
| intergenic | L4L BA.5.2.3,EG.7,BA.5.6,JG.3 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | T28I BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1,GE.1,EG.5.1.1,JG.3 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | H47R JG.3 |
| intergenic | N52N BF.26,EG.5.1.3,HF.1,HR.1,JG.3 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | T11K DV.7.1,JG.3 |
| intergenic | Q18X BA.5,FL.2.3,GJ.1.2,JG.3 |
| intergenic | T26I JG.3 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | P13F BA.5.1.10,BF.10,EU.1.1,FL.10.1,JG.3 |
| intergenic | P13L BA.5.1.10,EU.1.1,FL.10.1,JG.3 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | A35V BA.2.86.1,GS.4.1,JG.3 |
| intergenic | A90T JG.3 |
| intergenic | L104L JG.3 |
| intergenic | Y111Y BQ.1.2.3,GJ.1.2,JG.3 |
| intergenic | N126N BF.9,BA.4.6,JG.3 |
| intergenic | A134V GV.1,JG.3 |
| intergenic | P151L BA.5,JG.3 |
| intergenic | Q163P JG.3 |
| intergenic | R185R JG.3 |
| intergenic | S190G FD.1.1,JG.3 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | N213N HF.1.1,JG.3 |
| intergenic | T245T JG.3 |
| intergenic | E290G JG.3 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | T170I JN.1 |
| intergenic | A211D BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | F499L JN.1 |
| intergenic | P769S JN.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | V1056L BA.2.86.1,BA.5.2.20,JN.2,JN.1 |
| intergenic | G1100G JN.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | A1397A BA.2.12,BA.5,DV.7.1,BA.5.5,FL.15,FU.1,JN.1 |
| intergenic | K1973R BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | N2526S BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | T2676T BA.2.86.1,EG.5.2.1,FL.20,JN.2,JN.1 |
| intergenic | A2710T BA.2.86.1,BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15,BA.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | V3593F BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | R3821K JN.1 |
| intergenic | L3828L BA.5,DV.7.1,BA.5.5,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JN.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | L4184L BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | K4348R FL.1.5.2,JN.1 |
| intergenic | N4358N BA.2.86.1,BF.26,BA.5.5,EU.1.1,GY.5,JN.2,JN.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | A4921V BA.5.2.3,DV.7.1,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,JN.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | S5164S BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | G5527C EG.5.1.3,JN.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | A6063A JN.1 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | C6210C EG.5.1.1,JN.1 |
| intergenic | T6535I JN.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | V16_N17insMPLF BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | TTR19ITT BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | S50L BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | V127F BA.2.86.1,BA.5.2.2,JN.2,JN.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | FR157SG BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | N211_V213delinsIG BA.2.86.1,BQ.1.13,JN.2,JN.1 |
| intergenic | L216F BA.2.86.1,EG.5.1.3,GK.2.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | H245N BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | A264D BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | I332V BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | K356T BA.2.86.1,GA.4.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | R403K BA.2.86.1,BA.5,DV.7.1,EG.10.1,EG.7,FY.3.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | VG445HS BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | N450D BA.2.86.1,BF.28,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | L452W BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | L455S JN.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | N481_E484delinsKGK BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1,FL.25,FU.2,GJ.1,GK.1,GW.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | A570V BA.2.86.1,FD.1.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | P621S BA.2.86.1,GY.5,JN.2,JN.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | P681R BA.2.86.1,FL.1.5.2,GK.2,JN.2,JN.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,GK.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | P1143L BA.2.86.1,BQ.1.1.8,JN.2,JN.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BF.28,FL.1.5,GK.3.1,GV.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | D3H BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | T30A BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6,GZ.1,GE.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | A104V BA.2.86.1,BE.1.1,BQ.1,GS.4,GS.4.1,BA.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | S83L BA.5.6,JN.1 |
| intergenic | Q94H BF.26,BQ.1.13,BQ.1.2.3,JN.1 |
| intergenic | F19L BA.4,BA.5.1.30,GV.1,FL.1.5.1,JN.1 |
| intergenic | L98F JN.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | P168S GK.2,JN.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | Q229K BA.2.86.1,JN.2,JN.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | M85del BA.5.2.34,BA.5.1.24,EG.5.2.1,JN.3 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | A211D BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | V1056L BA.2.86.1,BA.5.2.20,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | Q1792Q JN.3 |
| intergenic | K1973R BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | Q2034H HK.3.3,JN.3 |
| intergenic | T2087I CH.1.1.28,EG.5.2.1,JG.3,JN.3 |
| intergenic | N2526S BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | T2676T BA.2.86.1,EG.5.2.1,FL.20,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | A2710T BA.2.86.1,BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15,BA.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3,JN.3 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | V3593F BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | L4184L BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | N4358N BA.2.86.1,BF.26,BA.5.5,EU.1.1,GY.5,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | Y4738Y JN.3 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | S5164S BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | V16_N17insMPLF BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | TTR19ITT BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | Y38Y BA.1.14,JN.3 |
| intergenic | S50L BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | V127F BA.2.86.1,BA.5.2.2,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | FR157SG BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | N211_V213delinsIG BA.2.86.1,BQ.1.13,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | L216F BA.2.86.1,EG.5.1.3,GK.2.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | H245N BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | A264D BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | I332V BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | K356T BA.2.86.1,GA.4.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | R403K BA.2.86.1,BA.5,DV.7.1,EG.10.1,EG.7,FY.3.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | VG445HS BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | N450D BA.2.86.1,BF.28,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | L452W BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | N481_E484delinsKGK BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1,FL.25,FU.2,GJ.1,GK.1,GW.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | A570V BA.2.86.1,FD.1.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | P621S BA.2.86.1,GY.5,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | P681R BA.2.86.1,FL.1.5.2,GK.2,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,GK.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | P1143L BA.2.86.1,BQ.1.1.8,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BF.28,FL.1.5,GK.3.1,GV.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | D3H BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | T30A BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6,GZ.1,GE.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | A104V BA.2.86.1,BE.1.1,BQ.1,GS.4,GS.4.1,BA.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | Q229K BA.2.86.1,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | g.CGTC-25_-22TGTT BF.9,JD.1.1 |
| intergenic | g.CGTCC-25_-21TGTCT BQ.1.13,GJ.1.2,JD.1.1 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13,EG.10.1,EG.5.1.3,EG.5.1.4,HN.1,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | G82G JD.1.1 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34,BF.28,BE.1.1,FL.1.5,FL.2.3,JD.1.1 |
| intergenic | N126N JD.1.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1 |
| intergenic | P153S JD.1.1 |
| intergenic | C213R JD.1.1 |
| intergenic | P371P JD.1.1 |
| intergenic | E489K JD.1.1 |
| intergenic | K500K JD.1.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1 |
| intergenic | R550C JD.1.1 |
| intergenic | V559M EG.5.1.9,JD.1.1 |
| intergenic | Y600Y BF.10,JD.1.1.2 |
| intergenic | V660I JD.1.1 |
| intergenic | A687T JD.1.1 |
| intergenic | L730L BA.4,FL.2.3,GE.1,JD.1.1 |
| intergenic | V757V BA.5.2.34,BF.26,FY.3.1,JD.1.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | D928Y FU.2,JD.1.1 |
| intergenic | P971L BA.5,BA.5.1.2,BF.26,BF.10,JD.1.1 |
| intergenic | S994N GZ.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | E1015K BF.26,JD.1.1 |
| intergenic | Q1021H JD.1.1 |
| intergenic | N1094K GE.1,JD.1.1 |
| intergenic | P1147P EG.6.1,GJ.1,JD.1.1 |
| intergenic | R1170H GK.2,JD.1.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | A1314V DV.7.1.2,JD.1.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | T1426N JD.1.1 |
| intergenic | Y1489Y JD.1.1 |
| intergenic | L1523L BA.5.2.34,GS.3,GE.1,JD.1.1 |
| intergenic | V1565V JD.1.1 |
| intergenic | G1591R JD.1.1 |
| intergenic | H1652R JD.1.1 |
| intergenic | T1682I BA.5.2.20,HF.1,JD.1.1 |
| intergenic | I1714V JD.1.1 |
| intergenic | L1853I JD.1.1 |
| intergenic | D1940G JD.1.1 |
| intergenic | V2019F JD.1.1 |
| intergenic | E2049A JD.1.1 |
| intergenic | L2119L BQ.1.1.8,JD.1.1 |
| intergenic | L2211L BQ.1.1.8,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2,JD.1.1 |
| intergenic | F2215L JD.1.1 |
| intergenic | L2226L JD.1.1 |
| intergenic | L2271L JD.1.1 |
| intergenic | S2273F JD.1.1 |
| intergenic | T2274I BA.5.1.1,EG.6.1,GK.2,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | F2334F BA.2.12,BF.26,EG.5.1.8,EU.1.1,GJ.1,GK.3.1,JD.1.1 |
| intergenic | R2336K EG.5.2.1,JD.1.1 |
| intergenic | S2433S BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,JD.1.1 |
| intergenic | S2535L BF.28,BQ.1.2.3,FU.2,BA.2.3,JD.1.1 |
| intergenic | A2618D JD.1.1 |
| intergenic | D2693D BA.5.1.30,FY.3.1,JD.1.1 |
| intergenic | F2787F HF.1,JD.1.1 |
| intergenic | T2859T JD.1.1 |
| intergenic | D2880N JD.1.1 |
| intergenic | A2994A GJ.1,JD.1.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | S3046S HY.1,JD.1.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | A3061V JD.1.1 |
| intergenic | A3079A JD.1.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | F3100F BA.5.2.3,BF.9,EG.5.1.4,EG.6.1,JD.1.1 |
| intergenic | Y3115Y JD.1.1 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5,EG.6.1,FL.15.1.1,HK.6,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | A3357A BA.4,BQ.1.13,GK.1.1,JD.1.1 |
| intergenic | P3362P JD.1.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | F3397F EG.5.1,FL.20,GS.4,GK.2,GJ.1.2,JD.1.1 |
| intergenic | D3439D BA.5.2.34,BA.5.1.1,DV.7.1,EG.5.1.3,FL.1.5,GE.1,JD.1.1 |
| intergenic | V3475I JD.1.1 |
| intergenic | T3506I FL.15.1.1,JD.1.1 |
| intergenic | A3523V EG.6.1,JD.1.1 |
| intergenic | A3625V FU.2,FL.1.5.1,JD.1.1 |
| intergenic | T3646I BA.5.2.2,JD.1.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | S3687L JD.1.1 |
| intergenic | A3730A BA.2.12,EG.6.1,GA.4.1,BA.2.3,BQ.1,JD.1.1.1,FL.1.5.1,JG.3 |
| intergenic | T3750I BA.5.2.34,BA.4.1,BQ.1,HK.3.2,JD.1.1 |
| intergenic | I3779T GA.4.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1 |
| intergenic | I3898V JD.1.1 |
| intergenic | L3951F BQ.1.1.8,BF.28,JD.1.1 |
| intergenic | T4031I FD.1.1,JD.1.1 |
| intergenic | N4047N JD.1.1 |
| intergenic | N4082S JD.1.1 |
| intergenic | G4086S JD.1.1 |
| intergenic | P4120S BA.5.6,GE.1,JD.1.1 |
| intergenic | N4121D JD.1.1 |
| intergenic | T4161I BF.26,BA.4.6,BQ.1,JD.1.1 |
| intergenic | D4166D GK.2.1,JD.1.1 |
| intergenic | A4168A BA.5.1.30,BA.4.6,FL.15,FL.20,JD.1.1 |
| intergenic | N4173N BA.5,BQ.1,JD.1.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | V4216V JD.1.1 |
| intergenic | T4265I EG.5.1.6,JD.1.1 |
| intergenic | D4344D EG.5.1.4,JD.1.1.2 |
| intergenic | K4451N JD.1.1 |
| intergenic | D4454G JD.1.1 |
| intergenic | D4518D JD.1.1 |
| intergenic | D4532D BF.28,BF.26,BA.5.6,GW.5,FY.5,JD.1.1 |
| intergenic | N4607N JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2,JD.1.1 |
| intergenic | A4642V JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | D4666D JD.1.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | P4720P JD.1.1 |
| intergenic | F4740F JD.1.1 |
| intergenic | V4790V JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2,JD.1.1 |
| intergenic | F4820F BA.5.1.10,BA.4.1,BF.26,BQ.1.2.3,EG.5.1,BA.2.3,GV.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1 |
| intergenic | A4946S JD.1.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | V5092I EG.7,JD.1.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | T5195I BA.5.2.8,GK.3.1,JD.1.1 |
| intergenic | K5199K JD.1.1 |
| intergenic | Q5214H FL.1.5,JD.1.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | L5551L FD.1.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,HR.1,JD.1,JD.1.2,JD.1.1 |
| intergenic | S5625S JD.1.1 |
| intergenic | V5684V JD.1.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | G5724G JD.1.1 |
| intergenic | A5727A DV.7.1,FL.20.2,FL.15,JD.1.1 |
| intergenic | I5756L JD.1.1 |
| intergenic | D5774D HF.1.1,JD.1.1 |
| intergenic | L5779L JD.1.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | S5913N JD.1.1 |
| intergenic | T5923T BA.5.2.2,JD.1.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | P6128S BQ.1.1.8,FL.25,GK.2.1,GE.1,JN.2,JD.1.1 |
| intergenic | Y6160Y BF.28,FL.1.5,BA.5.6,FY.4.1.1,GS.4,JD.1.1.2,JG.3 |
| intergenic | D6183D JD.1.1 |
| intergenic | L6184L JD.1.1 |
| intergenic | V6241I EG.5.1,FD.1.1,GS.4,JD.1.1 |
| intergenic | A6296V FL.15,JD.1.1 |
| intergenic | 6309 JD.1.1 |
| intergenic | C6307C BA.5.2.34,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | S6375N EG.5.1.4,JD.1.1.2 |
| intergenic | V6408V JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2,JD.1.1 |
| intergenic | N6414S JD.1.1 |
| intergenic | V6462L JD.1.1 |
| intergenic | L6501L EG.7,JD.1.1 |
| intergenic | G6528G JD.1.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | S6613I JD.1.1 |
| intergenic | R6658S BA.5.2.34,JD.1.1 |
| intergenic | Y6682Y GW.5,JD.1.1 |
| intergenic | F6715L EG.5.1.1,JD.1.1 |
| intergenic | N6729N GE.1,HK.6,JD.1.1 |
| intergenic | S6739L BA.5.1.10,BF.28,FL.25,GK.3.1,GK.2,JD.1.1.1 |
| intergenic | G6871S JD.1.1 |
| intergenic | I7005I JD.1.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | R21K JD.1.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | F32F BA.5.1.10,BA.5.1.2,BF.28,BA.4.6,EG.5.1.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6,GJ.1.2,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HY.1,JD.1.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1 |
| intergenic | M153V JD.1.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | Y248H GE.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | T307T JD.1.1 |
| intergenic | K310K EG.5.1.8,JD.1.1 |
| intergenic | Q321Q JD.1.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | VG445PI JD.1.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | I468T JD.1.1 |
| intergenic | A475V FL.15.1.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | AGST475VGNK JD.1.1 |
| intergenic | AGST475VSNK JD.1.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | E484V BA.5.2.3,FL.15.1.1,JD.1.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | D578D HR.1,JD.1.1 |
| intergenic | E583D GK.1.1,GE.1,JD.1.1.2,JD.1.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | N679K FL.10.1,JD.1.1 |
| intergenic | TN678IK FL.10.1,JD.1.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | T778T BF.28,FL.15,HY.1,JD.1.1 |
| intergenic | T791I JD.1.1 |
| intergenic | P812S GE.1,JD.1.1 |
| intergenic | C840C EG.5.1.3,JD.1.1 |
| intergenic | S937T JD.1.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | D979D JD.1.1 |
| intergenic | T1027T JD.1.1 |
| intergenic | D1084Y FL.8,EG.5.1.1,JD.1.1 |
| intergenic | R1107S JD.1.1 |
| intergenic | T1117I EG.7,GK.1,GJ.1.2,JD.1.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | D1153H JD.1.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | S58G JD.1.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | L73F BF.9,BA.5.6,JD.1.1 |
| intergenic | T89I BF.26,EG.5.1.8,FL.1.5,EG.5.1.4,FD.1.1,GK.1.3,GK.1.1,HN.1,JD.1.1.2,JD.1.1 |
| intergenic | Y141Y JD.1.1 |
| intergenic | S180F BA.4.1.8,FL.2.3,JD.1.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | T229I FL.15,FU.1,GK.1,JD.1.1.1 |
| intergenic | F230F EG.5.1.6,FY.5,JD.1.1 |
| intergenic | P240L BA.5.1.2,EG.5.1.4,EG.5.1,HY.1,JD.1.1.1,JJ.1 |
| intergenic | M260K BA.4.1.8,EG.5.1,JD.1.1 |
| intergenic | P267Q JD.1.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1 |
| intergenic | Y42Y JD.1.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | L27L JD.1.1 |
| intergenic | A40A JD.1.1 |
| intergenic | L57L BQ.1.2.3,JD.1.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | I73M FU.2,JD.1.1 |
| intergenic | A104V BA.2.86.1,BE.1.1,BQ.1,GS.4,GS.4.1,BA.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | H125Y BA.5,BA.5.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,EG.5.1,GJ.1.2,JD.1.1 |
| intergenic | A12S JD.1.1 |
| intergenic | A12T BA.5.1.24,JD.1.1.2,FL.1.5.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | V29L FL.10.1,GV.1,JD.1.1 |
| intergenic | K85N JD.1.1 |
| intergenic | Y97Y BF.26,BA.5.5,JD.1.1 |
| intergenic | A105A JD.1.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | G8X JD.1.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3 |
| intergenic | V13I JD.1.1 |
| intergenic | H17H BA.5.2.34,BA.5,EG.5.1.4,JD.1.1 |
| intergenic | D34A JD.1.1 |
| intergenic | P38fs JD.1.1 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,FU.2,BQ.1,GK.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2,JD.1.1 |
| intergenic | S103L BA.5.1.2,EG.5.1.3,JD.1.1 |
| intergenic | Y111C JD.1.1 |
| intergenic | I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9,FL.15,FU.2,GK.1,GK.3.1,JD.1.1.1,HR.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | D3D GE.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2,JD.1.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | T16T JD.1.1 |
| intergenic | P20P BA.5.5,GK.2,JD.1.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | E31_S33del BA.5.2.20,FL.1.5.1,JD.1.1 |
| intergenic | R32_G34del FK.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1 |
| intergenic | G60G EU.1.1,HY.1,JD.1.1.2 |
| intergenic | P67T JD.1.1 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1,BA.5.6,GK.1.1,GJ.1.2,JD.1.1.2,JD.1.1 |
| intergenic | T141K JD.1.1 |
| intergenic | A173V BA.5.2.20,BA.4.6,EG.7,EG.5.1.4,EU.1.1,GK.1.1,GE.1,JD.1.1 |
| intergenic | E174E BA.4,EG.5.1,JD.1.1 |
| intergenic | G200_G204delinsDLFSKR JD.1.1 |
| intergenic | RG203KR JD.1.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | G243S JD.1.1 |
| intergenic | V246V JD.1.1 |
| intergenic | A267S JD.1.1 |
| intergenic | Y333Y BA.4,BF.26,BA.4.6,BA.5.6,JD.1.1.1 |
| intergenic | L353L BA.5.2.34,GK.2,JD.1.1 |
| intergenic | T362K JD.1.1 |
| intergenic | Q406R JD.1.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | g.G-5T BA.5.1.2,JD.1.1 |
| intergenic | T12A JD.1.1 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.6,FL.15,GY.5,JD.1.1 |
| intergenic | g.A29683T JD.1.1 |
| intergenic | g.A29716T JD.1.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1 |
| intergenic | g.G29779T EG.5.1,FL.1.5.1,JJ.1,JD.1.1 |
| intergenic | g.T29816C JD.1.1 |
| intergenic | g.T-54C XBB.1.16.15 |
| intergenic | g.C-44T BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T12I XBB.1.16.15 |
| intergenic | G32G XBB.1.16.15 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | I71I BQ.1.2.3,GJ.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S74P XBB.1.16.15 |
| intergenic | A79V EG.5.1.4,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G82_M85delinsV BF.20,GK.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | N189N BA.5.1.10,BA.5.1.30,EG.5.2.1,JG.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T214N EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S302S XBB.1.16.15 |
| intergenic | P309L BA.5.2.2,BF.28,GE.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T333T XBB.1.16.15 |
| intergenic | G334G BA.5.1.10,JG.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P361T XBB.1.16.15 |
| intergenic | S376L BA.5.2.3,BA.5.5,EG.5.1.9,FU.2,EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A385A BE.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G392G FL.14,FL.8,BA.2.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | R402R BA.5.2.34,DV.7.1,BF.10,BA.5.6,FL.15,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A540V BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.13,GK.2.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T551I XBB.1.16.15 |
| intergenic | G572R XBB.1.16.15 |
| intergenic | L580F BA.4,BA.5.1.24,EG.6.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | M598I JN.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D629D XBB.1.16.15 |
| intergenic | I740I BA.2.12,BA.5,CK.2,BA.4.6,FU.2,GK.1,GY.5,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T753I BA.4.1.8,DV.7.1,EG.5.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A872T XBB.1.16.15 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6,GK.2.1,GK.3.1,GS.4,GY.5,EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L960L EG.5.1.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A968V XBB.1.16.15 |
| intergenic | P971S BA.5.1.10,BA.4.1,BA.5.2.20,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T1001I BA.2.12,BA.5.1.10,DV.7.1,EU.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G1069R XBB.1.16.15 |
| intergenic | H1113Y BA.2.12,EG.5.2.1,GK.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G1119C XBB.1.16.15 |
| intergenic | P1158L BA.1.14,JD.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S1189S XBB.1.16.15 |
| intergenic | I1203I BA.5.1.2,BQ.1,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A1268A FL.10.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | K1428R XBB.1.16.15 |
| intergenic | P1472S XBB.1.16.15 |
| intergenic | S1517F XBB.1.16.15 |
| intergenic | G1548C XBB.1.16.15 |
| intergenic | V1629A XBB.1.16.15 |
| intergenic | D1639D XBB.1.16.15 |
| intergenic | K1655N BA.5.2.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | N1672S XBB.1.16.15 |
| intergenic | A1694A XBB.1.16.15 |
| intergenic | T1828I XBB.1.16.15 |
| intergenic | I1892I XBB.1.16.15 |
| intergenic | N1922N BA.5,GE.1,EG.5.1.1,JG.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | F1925F BA.5.2.2,BF.28,BE.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,FL.10.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S2024L BA.5.2.2,FL.8,FL.20,GS.4,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S2030L DV.7.1,GK.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G2126S XBB.1.16.15 |
| intergenic | I2229V XBB.1.16.15 |
| intergenic | G2265S XBB.1.16.15 |
| intergenic | P2287H XBB.1.16.15 |
| intergenic | F2338F BQ.1.13,FL.15,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T2512I JG.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L2518L BA.5.1.30,GJ.1.2.6,GJ.1.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A2554A XBB.1.16.15 |
| intergenic | S2631P XBB.1.16.15 |
| intergenic | D2687D BA.5.5,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P2950H XBB.1.16.15 |
| intergenic | M2957V XBB.1.16.15 |
| intergenic | V2996I XBB.1.16.15 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G3169S XBB.1.16.15 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2,BF.9,BE.1.1,EG.5.1,FL.20,GK.3.1,GK.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | N3326N XBB.1.16.15 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D3439D BA.5.2.34,BA.5.1.1,DV.7.1,EG.5.1.3,FL.1.5,GE.1,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| ORF1a | A3497A / NSP5 |
| intergenic | A3497A XBB.1.16.15 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.4.6,EG.5.1.6,HF.1,HK.3.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | V3708V BA.5.1.1,FL.10.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | M3752I EG.5.1.8,GK.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | I3758S XBB.1.16.15 |
| intergenic | Y3765C BA.5.1.24,BQ.1.2.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1,HF.1,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | E4019E FL.1.5,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P4058P BA.4.1,BA.5.1.30,EG.5.1,HF.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | N4142N XBB.1.16.15 |
| intergenic | A4155A FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G4178V BA.5.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | R4214G XBB.1.16.15 |
| intergenic | T4249I BQ.1.13,BA.5.5,FL.15,FY.5,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T4477I BA.5.1.10,GJ.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | N4601N XBB.1.16.15 |
| intergenic | N4605N FL.10.1,FD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | R4641M XBB.1.16.15 |
| intergenic | K4655N XBB.1.16.15 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | V4864V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | M5147L XBB.1.16.15 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T5198A GS.4.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.2,BF.26,EG.5.1.8,EG.5.1,FL.8,FL.20,GE.1,JD.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P5310P XBB.1.16.15 |
| intergenic | C5353C BA.5.1.30,FK.1.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P5371L BA.5.1.10,BA.5.2.8,HY.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S5398L GY.5,XBB.1.16.15 |
| intergenic | Q5412Q XBB.1.16.15 |
| intergenic | V5478L XBB.1.16.15 |
| intergenic | N5581N HN.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | V5680V BA.4.1.8,BF.28,FL.1.5,EG.7,FU.1,GK.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | V5711V BA.5.2.20,XBB.1.16.15 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G5724G JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | K5738K XBB.1.16.15 |
| intergenic | M5798V XBB.1.16.15 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T5923I EG.7,EU.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | I5967V EG.5.1.4,FL.14,FD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | E6002D GS.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D6147Y FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S6180I FL.2.3,FD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A6192V JG.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D6249D BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,XBB.1.16.15 |
| intergenic | H6255H XBB.1.16.15 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T6397T XBB.1.16.15 |
| intergenic | W6434R XBB.1.16.15 |
| intergenic | V6474L GK.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D6530Y XBB.1.16.15 |
| intergenic | A6546T XBB.1.16.15 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | N6729S XBB.1.16.15 |
| intergenic | K6741_V6743delinsM XBB.1.16.15 |
| intergenic | P7034P GK.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L54L DV.7.1,GY.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| S | HK146QN XBB.2.3.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | HK146QN XBB.1.16.15 |
| S | HK146QN XBB.2.3.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | E180V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S255F BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,EG.5.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L276L BA.5.1.30,EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G566S XBB.1.16.15 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | NSP679KSH BA.5.2.20,GV.1,HK.3.2,HR.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | I692I BA.5.1.10,BA.4.6,FL.14,EG.6.1,FU.2,GK.1.3,HK.7,GJ.1.2,EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T732I BA.2.12,EG.5.1,JG.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | Q836L XBB.1.16.15 |
| intergenic | C840C EG.5.1.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | Q853Q XBB.1.16.15 |
| intergenic | G932G BA.5.5,BQ.1.2.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G1093G XBB.1.16.15 |
| intergenic | I1114I FL.15,FY.5,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | K1191K XBB.1.16.15 |
| intergenic | G1219C BA.5.2.2,FL.10.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D27Y BA.4.1.8,BA.5,BQ.1.2.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A51V XBB.1.16.15 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S74S EG.10.1,EG.6.1,EG.5.1.6,GJ.1.2,JG.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A103V XBB.1.16.15 |
| intergenic | D155H JN.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | F207F BA.5.1.2,BA.5.2.20,BA.2.3,GJ.1.2,HY.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T269T BF.26,EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | V62F BA.5.2.20,CK.2,EG.5.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D3D XBB.1.16.15 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S108S DV.7.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | N121N BA.5.1.10,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P132P BA.5.2.8,EG.5.1.6,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20,CK.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | I10V XBB.1.16.15 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9,BA.5.2.20,BQ.1.13,CK.2,EG.6.1,GK.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | E92D XBB.1.16.15 |
| intergenic | A15V XBB.1.16.15 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | V13I JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | Q23Q XBB.1.16.15 |
| intergenic | C102F EG.7,GK.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | F120_I121del XBB.1.16.15 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P6P EG.6.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L45L XBB.1.16.15 |
| intergenic | Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T115T BQ.1.1.8,GE.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G129G XBB.1.16.15 |
| intergenic | P168S GK.2,JN.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S194P BA.5.1.10,XBB.1.16.15 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A211S XBB.1.16.15 |
| intergenic | S318S BE.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T362K JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | E367Q XBB.1.16.15 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1,GK.3.2,GW.5,HK.6,GS.4.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGT29734C BA.4,BA.5.5,XBB.1.16.15 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGT29734T BA.4,BA.5.5,XBB.1.16.15 |
| intergenic | g.C-160T BA.5.1.24,BE.1.1,BA.1.15,EG.5.1.3,GY.5,XBB.1.16.17 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | g.CG-25_-24TA GK.2,XBB.1.16.17 |
| intergenic | R24R BA.5,FK.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | P80P XBB.1.16.17 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Y229Y BA.2.12,XBB.1.16.17 |
| intergenic | S279S XBB.1.16.17 |
| intergenic | P286S XBB.1.16.17 |
| intergenic | D335G FU.2,XBB.1.16.17 |
| intergenic | T350I BA.5.2.3,BA.5.5,GV.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | E472D XBB.1.16.17 |
| intergenic | R545L XBB.1.16.17 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | S858S XBB.1.16.17 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Q991R XBB.1.16.17 |
| intergenic | V1177F XBB.1.16.17 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | E1413E XBB.1.16.17 |
| intergenic | K1606K XBB.1.16.17 |
| intergenic | F1690F XBB.1.16.17 |
| intergenic | P1921L FY.3.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | D1962D XBB.1.16.17 |
| intergenic | H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Y2489Y BA.5.2.20,EG.5.2.1,HR.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | S2731S XBB.1.16.17 |
| intergenic | F2881F XBB.1.16.17 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | R3066K JG.3,XBB.1.16.17 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5,EG.6.1,FL.15.1.1,HK.6,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | G3437G BA.4,BA.5,XBB.1.16.17 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | V3690V BA.4.1.8,XBB.1.16.17 |
| intergenic | D3728D BA.4.1.8,BQ.1.1.8,BQ.1.2.3,BA.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1,HF.1,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | T3940I GE.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | G4086S JD.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | A4155A FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Y4424Y FL.1.5,FL.14,FL.15.1.1,GE.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | H4467H BA.5.1.10,BQ.1.1.8,GE.1,EG.5.1.1,JJ.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | T4477A XBB.1.16.17 |
| intergenic | M4516I XBB.1.16.17 |
| intergenic | C4698C DV.7.1.2,XBB.1.16.17 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | N4748N GK.2,GE.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | L4779L BA.4,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FY.3.1,GK.1.1,GE.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | V4864V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | N4881N FU.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | T5193N XBB.1.16.17 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| ORF1b | R5306S / NSP12 |
| intergenic | R5306S XBB.1.16.17 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | P5371P BA.1.17,EG.5.2.1,EG.5.1,EG.5.1.6,FL.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3,BA.5.1.30,BF.26,BF.10,JG.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | P5971S BQ.1.13,EG.10.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | A6044V BA.5,BA.4.6,GY.5,GV.1,JG.3,XBB.1.16.17 |
| intergenic | D6147Y FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | F6302F BQ.1.13,EG.5.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Y6682Y GW.5,JD.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | R6709C FL.14,XBB.1.16.17 |
| intergenic | A6802A BA.5.5,GE.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | S6831I XBB.1.16.17 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | N137D XBB.1.16.17 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Q173R XBB.1.16.17 |
| intergenic | E180V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | KQ182NE XBB.1.16.17 |
| intergenic | KQ182QE FY.5,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Q183E FU.2,FY.5,EG.5.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | F186S FL.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | D215H BA.5.1.1,GA.4.1,GV.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Q239R XBB.1.16.17 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | T259I XBB.1.16.17 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1,FL.25,FU.2,GJ.1,GK.1,GW.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17 |
| intergenic | E554Q BF.26,JD.1.2,XBB.1.16.17 |
| intergenic | N556K XBB.1.16.17 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | C649C XBB.1.16.17 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Y660H XBB.1.16.17 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | A684V BA.5,FY.3.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | A701V BA.1.17,BA.4.1,BA.5.5,EG.10.1,FL.1.5,FL.1.5.2,GJ.1.2,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | N1178N BQ.1.1.8,GK.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | L1224L XBB.1.16.17 |
| intergenic | I7V XBB.1.16.17 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Y109C EG.5.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | S55F BA.5.1.2,EG.5.1,BA.2.3,XBB.1.16.17 |
| intergenic | L17F BF.26,FL.1.5,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | L124L BA.2.12,BA.4,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.20,GK.1,HY.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | D53Y XBB.1.16.17 |
| intergenic | D61L XBB.1.16.17 |
| intergenic | E59_D61delinsL XBB.1.16.17 |
| intergenic | Q94K XBB.1.16.17 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | L25F GK.2.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9,FL.15,FU.2,GK.1,GK.3.1,JD.1.1.1,HR.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | P46S FL.8,FY.4.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | F66F BA.5.2.20,GS.3,GK.2,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | N192N BA.5.1.10,BA.4,BF.10,EG.6.1,GJ.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | P279P XBB.1.16.17 |
| intergenic | I320L XBB.1.16.17 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | P383S BA.4.1,HK.11,XBB.1.16.17 |
| intergenic | V392V EG.6.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | g.C-160T BA.5.1.24,BE.1.1,BA.1.15,EG.5.1.3,GY.5,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | L27L BA.5.1.24,FL.1.5.2,FL.10.1,GE.1,HN.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| ORF1a | H165Y / NSP1 |
| intergenic | H165Y BF.26,XBB.1.16.2 |
| intergenic | D220N XBB.1.16.2 |
| ORF1a | K225E / NSP2 |
| intergenic | F275F XBB.1.16.2 |
| intergenic | I461I XBB.1.16.2 |
| intergenic | A540V BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.13,GK.2.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2 |
| intergenic | A599A BA.5.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,FK.1.1,FL.15,XBB.1.16.2 |
| intergenic | D644D BA.5.1.10,BA.5.2.34,BE.1.1,BA.5.5,XBB.1.16.2 |
| intergenic | Y717Y BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,FK.1.1,XBB.1.16.2 |
| ORF1a | S771N / NSP2 |
| intergenic | A819V BQ.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | P926H GY.5,XBB.1.16.2 |
| ORF1a | D935N / NSP3 |
| intergenic | H1113Y BA.2.12,EG.5.2.1,GK.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2 |
| ORF1a | G1125V / NSP3 |
| intergenic | G1125V XBB.1.16.2 |
| intergenic | L1182F XBB.1.16.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| ORF1a | N1324I / NSP3 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | P1497L XBB.1.16.2 |
| intergenic | S1510F FL.25,GK.2,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T1589I FL.1.5.2,FD.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.2 |
| ORF1a | N1672S / NSP3 |
| ORF1a | V2133I / NSP3 |
| intergenic | V2133I XBB.1.16.2 |
| ORF1a | M2259T / NSP3 |
| intergenic | M2259T XBB.1.16.2 |
| ORF1a | F2337V / NSP3 |
| intergenic | F2337V XBB.1.16.2 |
| intergenic | S2625S BA.4,BA.5.2.3,BA.4.6,EG.5.1.6,HR.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | N2678N BA.5.2.8,BA.5.2.20,GE.1,GS.4.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | M2719I XBB.1.16.2 |
| intergenic | G2814G BE.1.1,XBB.1.16.2 |
| ORF1a | D2835N / NSP4 |
| intergenic | D2835N EG.5.2.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | I2854T JG.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | V2938V XBB.1.16.2 |
| ORF1a | E2982G / NSP4 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| ORF1a | V3048A / NSP4 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | L3234L BA.1.17,BF.10,FL.2.3,FU.2,HF.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | K3351R BA.5.1.2,XBB.1.16.2 |
| intergenic | Y3364Y XBB.1.16.2 |
| intergenic | F3366F XBB.1.16.2 |
| intergenic | V3388V BA.5.1.24,XBB.1.16.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | C3563C XBB.1.16.2 |
| intergenic | I3663V BA.4.6,XBB.1.16.2 |
| intergenic | 3676del BF.26,XBB.1.16.2 |
| intergenic | F3677del BF.26,XBB.1.16.2 |
| intergenic | S3675_K3678delinsN XBB.1.16.2 |
| intergenic | S3675del BF.26,XBB.1.16.2 |
| intergenic | L3829F GY.5,XBB.1.16.2 |
| intergenic | N3833S XBB.1.16.2 |
| ORF1a | C3852C / NSP6 |
| intergenic | H3895H XBB.1.16.2 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1,HF.1,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | L3899L BA.5.1.30,GE.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T3905T XBB.1.16.2 |
| intergenic | A3987V FL.2.3,XBB.1.16.2 |
| intergenic | A4155A FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | L4386F BA.5.1.30,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T4640I GE.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T4668T BA.1.15,GS.3,GS.4,GS.4.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | A4771S XBB.1.16.2 |
| intergenic | F4820F BA.5.1.10,BA.4.1,BF.26,BQ.1.2.3,EG.5.1,BA.2.3,GV.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | V4864V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| ORF1b | K4937K / NSP12 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | Y5223H HF.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | F5348F BF.10,BQ.1,GE.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | C5353C BA.5.1.30,FK.1.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T5737I BA.5.1.24,DV.7.1.2,BA.4.6,XBB.1.16.2 |
| intergenic | F5823F BA.4,EU.1.1,FL.25,XBB.1.16.2 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | A6044V BA.5,BA.4.6,GY.5,GV.1,JG.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | L6074L XBB.1.16.2 |
| intergenic | P6128L BA.2.12,HK.6,EG.5.1.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | D6147Y FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | F6251F BF.28,HF.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | C6307C BA.5.2.34,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | H6466H FU.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | A6569V FL.2.3,XBB.1.16.2 |
| ORF1b | V6579I / NSP15 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| ORF1b | D6753D / NSP15 |
| ORF1b | K6768N / NSP15 |
| ORF1b | N7008N / NSP16 |
| ORF1b | S7046I / NSP16 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.2 |
| intergenic | P25_A27del GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.2 |
| intergenic | S50S XBB.1.16.2 |
| intergenic | S60A XBB.1.16.2 |
| S | S60A XBB.1.16.2 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| S | F140_Y144delinsLDV XBB.1.16.2 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | A163A XBB.1.16.2 |
| intergenic | D178H XBB.1.16.2 |
| intergenic | D178N BA.5.1.2,FD.1.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | E180V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| S | V227V XBB.1.16.2 |
| intergenic | I233I XBB.1.16.2 |
| S | I233I XBB.1.16.2 |
| intergenic | L244L XBB.1.16.2 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T323R XBB.1.16.2 |
| S | T323R XBB.1.16.2 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| S | L492V XBB.1.16.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | N556Y XBB.1.16.2 |
| S | N556Y XBB.1.16.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | A688V BA.5.2.34,BA.5,BA.5.1.30,JG.3,XBB.1.16.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| S | T881I XBB.1.16.2 |
| intergenic | A942V XBB.1.16.2 |
| S | A942V XBB.1.16.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | A1020A XBB.1.16.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | G1219A XBB.1.16.2 |
| S | G1219A XBB.1.16.2 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | V13L GY.5,EG.5.1.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1,EG.5.1.6,GK.2,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | H78Y BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.20,BF.28,EG.5.1,GK.2.1,FY.5,XBB.1.16.2 |
| intergenic | A99V BA.4.6,FL.1.5.1,JN.2,XBB.1.16.2 |
| intergenic | Y107H EG.5.1.4,XBB.1.16.2 |
| intergenic | S135S XBB.1.16.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | S6S EG.6.1,FL.15,HK.6,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | D72Y XBB.1.16.2 |
| E | D72Y XBB.1.16.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3,GK.3.2,GK.1.1,GE.1,HF.1,HY.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | L102L BA.5,EG.5.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2 |
| ORF7a | E41V XBB.1.16.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | L25F GK.2.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | I27I XBB.1.16.2 |
| intergenic | X44fs XBB.1.16.2 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | F120L XBB.1.16.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T198T BQ.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| N | V392L XBB.1.16.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | g.G-15C XBB.1.16.2 |
| intergenic | g.A29712T XBB.1.16.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | g.T-113C JF.1 |
| intergenic | g.G-92A FL.2.3,GS.4.1,JF.1 |
| intergenic | g.G-92T EG.7,HN.1,JF.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | g.C-12T FL.15,GJ.1.2,JF.1 |
| intergenic | E37D GK.1.1,HN.1,JF.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | I71I BQ.1.2.3,GJ.1,XBB.1.16.15,JF.1 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.10,DV.7.1.2,GK.1,JF.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | P153S JD.1.1,JF.1 |
| intergenic | H417Y EG.5.1,FL.15,JF.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.15,JF.1 |
| intergenic | A540V BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.13,GK.2.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | T609I BQ.1.1.8,JF.1 |
| intergenic | S610L FL.15,JF.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | N1181N JF.1 |
| intergenic | I1203I BA.5.1.2,BQ.1,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.15,JF.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | P1330P BF.10,EG.5.1.3,FL.1.5,JG.3,JF.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | T1395I JF.1 |
| intergenic | N1578N EG.5.1.6,FL.25,JF.1 |
| intergenic | N1673N BA.5.1.10,BA.4,BE.1.1,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,FD.1.1,JF.1 |
| intergenic | L1741L JF.1 |
| intergenic | P2005S JF.1 |
| intergenic | K2017R JF.1 |
| intergenic | S2030L DV.7.1,GK.1.1,XBB.1.16.15,JF.1 |
| intergenic | G2035E JF.1 |
| intergenic | D2060D EG.5.1.8,FL.1.5.1,JF.1 |
| intergenic | P2110L JF.1 |
| intergenic | C2239C JF.1 |
| intergenic | S2246L DV.7.1.2,FL.10.1,JF.1 |
| intergenic | V2276A JF.1 |
| intergenic | A2614V JF.1 |
| intergenic | N2894N BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.2.20,EG.5.1.9,JF.1 |
| intergenic | T2967T BA.5.5,FL.1.5.1,JF.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | V3053M JF.1 |
| intergenic | V3053V JF.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | T3150I BA.5.1.30,JF.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | D3508D FL.1.5,FL.8,FL.15,BQ.1,JF.1 |
| intergenic | K3532K HF.1,JF.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.15,JF.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1 |
| intergenic | A3688T JF.1 |
| intergenic | F3770F BA.5.5,FD.1.1,EG.5.1.6,JF.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1 |
| intergenic | V3858L JF.1 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1,HF.1,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | A4044A JF.1 |
| intergenic | A4155A FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | D4165G JF.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | V4216V JD.1.1,JF.1 |
| intergenic | D4218D BF.26,FU.2,JF.1 |
| intergenic | P4389L JF.1 |
| intergenic | N4550S JF.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | L4779L BA.4,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FY.3.1,GK.1.1,GE.1,XBB.1.16.17,JF.1 |
| intergenic | P4804P BA.5.1.24,EG.7,JF.1 |
| intergenic | V4864V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | V5322V BA.5,JF.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | L5367V JF.1 |
| intergenic | P5377L FL.1.5.2,JF.1 |
| intergenic | S5398L GY.5,XBB.1.16.15,JF.1 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,HR.1,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,JF.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | H5951Y DV.7.1,EG.5.1.3,FL.10.1,JF.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | E6017E BA.5,JF.1 |
| intergenic | P6076L BA.5.2.3,JF.1 |
| intergenic | R6137K JF.1 |
| intergenic | D6147Y FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | K6358R HY.1,JF.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | V6916L JF.1 |
| intergenic | Q14H EG.10.1,FL.15,HK.6,JF.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1 |
| intergenic | F43F FL.15,HK.8,FL.1.5.1,JF.1 |
| intergenic | F65F JF.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | S98F BA.5.1.10,FL.1.5,FD.1.1,FL.20,BQ.1,GK.3.1,GK.1.1,JF.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6,GJ.1.2,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,JF.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,XBB.1.16.17,JF.1 |
| intergenic | E180V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.1.1,JF.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,JF.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | A475V FL.15.1.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JF.1 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | G482R GE.1,JF.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | A688V BA.5.2.34,BA.5,BA.5.1.30,JG.3,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | P715P BA.5.2.20,FL.1.5.2,EG.5.1.6,FY.3.1,GJ.1.2.6,JF.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | D808D JF.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | S1051S EG.5.1.6,HK.11,JF.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | V1230M JF.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | V97I BF.26,EG.6.1,GK.2,EG.5.1.1,JF.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | I249I BA.5.2.8,JF.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | L17F BF.26,FL.1.5,XBB.1.16.17,JF.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | D190E JF.1 |
| intergenic | D209Y JF.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | T21T JF.1 |
| intergenic | S25P JF.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | Q62H HN.1,JF.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | V99I JF.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | Q28R JF.1 |
| intergenic | E31_S33del JF.1 |
| intergenic | G30_S33delinsA GS.4,GS.4.1,JF.1 |
| intergenic | A35A BA.1.15,FL.2.3,JF.1 |
| intergenic | Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,GY.5,GE.1,GJ.1.2,JD.1.2,JF.1 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1,HK.6,HK.8,EG.5.1.1,JF.1 |
| intergenic | L221F JF.1 |
| intergenic | P364L FL.14,FL.10.1,HK.3.3,JF.1 |
| intergenic | P365A JF.1 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | L407L JF.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | V30I JF.1 |
| intergenic | g.C29724A JF.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | g.G29779T EG.5.1,FL.1.5.1,JJ.1,JD.1.1,JF.1 |
| intergenic | g.C-73T XBB.1.16.23 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | E37A XBB.1.16.23 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34,BF.28,BE.1.1,FL.1.5,FL.2.3,JD.1.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | R175C XBB.1.16.23 |
| intergenic | D203D BA.5.1.24,BA.4.6,GK.2,BA.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | K261K XBB.1.16.23 |
| intergenic | F275L XBB.1.16.23 |
| intergenic | I453T HR.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.1,GJ.1.2,HR.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | L570I XBB.1.16.23 |
| intergenic | T708I CH.1.1.28,XBB.1.16.23 |
| intergenic | V839V BA.5.1.10,EG.5.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | A1793A XBB.1.16.23 |
| intergenic | T1874I HN.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | L2211L BQ.1.1.8,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | S2488F GS.4.1,HK.8,HN.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | K2589K XBB.1.16.23 |
| intergenic | F2633F XBB.1.16.23 |
| intergenic | Q2660R XBB.1.16.23 |
| intergenic | H2698H XBB.1.16.23 |
| intergenic | K2771K XBB.1.16.23 |
| intergenic | A2909T XBB.1.16.23 |
| intergenic | L2939L XBB.1.16.23 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3,JN.3,XBB.1.16.23 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | A3436A XBB.1.16.23 |
| intergenic | A3523V EG.6.1,JD.1.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | D3728D BA.4.1.8,BQ.1.1.8,BQ.1.2.3,BA.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.23 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1,HF.1,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | A4155A FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | T4685I FL.20,XBB.1.16.23 |
| intergenic | N4689S XBB.1.16.23 |
| intergenic | N4706N XBB.1.16.23 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | Q4749Q XBB.1.16.23 |
| intergenic | V4864V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | D5132D BA.5.6,XBB.1.16.23 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | C5343C EG.5.1.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | N5673N XBB.1.16.23 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | R5919R XBB.1.16.23 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | D6147Y FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | Y6221Y XBB.1.16.23 |
| intergenic | M6240V BQ.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | T6297I XBB.1.16.23 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | F6459L GS.3,XBB.1.16.23 |
| intergenic | V6521V XBB.1.16.23 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | V7086F XBB.1.16.23 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6,GJ.1.2,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | G142_Y145delinsDD GK.3.1,HK.1,HR.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23 |
| intergenic | N148T FL.15,FU.2,HK.7,JD.1.2,XBB.1.16.23 |
| intergenic | E180V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | K304Q XBB.1.16.23 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | I692I BA.5.1.10,BA.4.6,FL.14,EG.6.1,FU.2,GK.1.3,HK.7,GJ.1.2,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.23 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | L1063L BF.10,XBB.1.16.23 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | F1148F EG.5.1.3,EG.7,FL.15,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | R30L XBB.1.16.23 |
| intergenic | Q38Q BA.5.2.3,XBB.1.16.23 |
| intergenic | F43F BA.2.12,BA.5.2.20,FD.1.1,HY.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | A103V XBB.1.16.15,XBB.1.16.23 |
| intergenic | P104S BA.5.1.30,FL.15,EG.5.1.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | H247Y BA.5.1.10,XBB.1.16.23 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6,GZ.1,GE.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.23 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | A66S XBB.1.16.23 |
| intergenic | I7V XBB.1.16.23 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | E39Q XBB.1.16.23 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | V62V BA.5.2.20,BE.1.1,EG.5.1.4,EU.1.1,FL.20,BQ.1,GW.5,EG.5.1.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | S67S HF.1.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23 |
| intergenic | Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | Y172Y BA.5.2.3,XBB.1.16.23 |
| intergenic | R185P XBB.1.16.23 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1,BF.26,EG.5.1,BA.5.6,FL.15,HK.7,GE.1,HY.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | g.G29779T EG.5.1,FL.1.5.1,JJ.1,JD.1.1,JF.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | D33D XBB.1.41.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | C230C GE.1,JD.1.2,XBB.1.41.1 |
| intergenic | T403I BA.5.1.10,BQ.1,GK.3.1,GS.3,FL.1.5.1,XBB.1.41.1 |
| intergenic | P732P XBB.1.41.1 |
| intergenic | I739V XBB.1.41.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | A1092A XBB.1.41.1 |
| intergenic | P1220L BA.4.6,HF.1,XBB.1.41.1 |
| intergenic | F1248F XBB.1.41.1 |
| intergenic | H1264H BQ.1.2.3,XBB.1.41.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | L1441L BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1,FK.1.1,GK.1,GK.2,GE.1,XBB.1.41.1 |
| intergenic | T1589I FL.1.5.2,FD.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.41.1 |
| intergenic | L1627L BA.5.1.30,FU.1,FU.2,GS.3,XBB.1.41.1 |
| intergenic | A1851V XBB.1.41.1 |
| intergenic | T2106I XBB.1.41.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | S3246A XBB.1.41.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | T3356I BF.26,GJ.1.2,XBB.1.41.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | L3829L BA.5.2.3,EG.5.1.4,FD.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.41.1 |
| intergenic | S3834S GZ.1,XBB.1.41.1 |
| intergenic | L3951L GJ.1.2,XBB.1.41.1 |
| intergenic | I4127V XBB.1.41.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | Y4461Y XBB.1.41.1 |
| intergenic | A4568T HF.1,XBB.1.41.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | E4914G XBB.1.41.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | G5231G FD.1.1,XBB.1.41.1 |
| intergenic | D5271G BF.20,XBB.1.41.1 |
| intergenic | A5315A XBB.1.41.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | G5606G FL.2.3,XBB.1.41.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | D6097D BA.2.12,BA.5.2.20,BA.5.5,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.10.1,BA.5.6,XBB.1.41.1 |
| intergenic | L6205L BA.5.1.10,BF.10,BQ.1,XBB.1.41.1 |
| intergenic | D6249Y XBB.1.41.1 |
| intergenic | I6322V XBB.1.41.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | D6576D BA.5,XBB.1.41.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | S6613I JD.1.1,XBB.1.41.1 |
| intergenic | D6897D XBB.1.41.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | N148T FL.15,FU.2,HK.7,JD.1.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | L335S XBB.1.41.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | R403K BA.2.86.1,BA.5,DV.7.1,EG.10.1,EG.7,FY.3.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.41.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | EH654DY XBB.1.41.1 |
| intergenic | H655Y XBB.1.41.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | S929T XBB.1.41.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | G1046G XBB.1.41.1 |
| intergenic | L1063L XBB.1.41.1 |
| intergenic | D1139N XBB.1.41.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | T32I DV.7.1,XBB.1.41.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | C130C BQ.1.1.8,FU.1,XBB.1.41.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | H17Y BA.5.2.20,EG.10.1,FL.1.5,EG.5.1.6,GK.1.3,XBB.1.41.1 |
| intergenic | S103A XBB.1.41.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | N4N XBB.1.41.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | F53F BE.1.1,EG.5.1,GK.1.1,XBB.1.41.1 |
| intergenic | N126N BF.9,BA.4.6,JG.3,XBB.1.41.1 |
| intergenic | A182T BA.5.1.1,XBB.1.41.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.5,EG.5.1.4,BA.2.3,BQ.1,GE.1,GS.4.1,XBB.1.41.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | g.G29690T FD.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.41.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733T HN.1,XBB.1.41.1 |
| intergenic | g.C29769T DV.7.1,BA.5.2.20,BF.26,FL.15,BA.2.3,FL.1.5.1,XBB.1.41.1 |
| intergenic | g.C-119T BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.2.3,FL.15,XBB.1.16.8 |
| intergenic | g.T-89C BA.5.1.24,XBB.1.16.8 |
| intergenic | g.C-25T XBB.1.16.8 |
| intergenic | g.GTTTC-29_-25TTTTT XBB.1.16.8 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | V54del BF.10,XBB.1.16.8 |
| intergenic | F70F JD.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GE.1,GS.4.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,GE.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BA.4.6,FD.1.1,GE.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L140L CH.1.1.28,BQ.1.13,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3,HK.6,XBB.1.16.8 |
| intergenic | G146D BF.10,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T333M BA.4.1,BF.10,XBB.1.16.8 |
| intergenic | S376L BA.5.2.3,BA.5.5,EG.5.1.9,FU.2,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T403A XBB.1.16.8 |
| intergenic | S428S GJ.1,GJ.1.2.6,GJ.1.2,XBB.1.16.8 |
| intergenic | V438I XBB.1.16.8 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | Y949C HR.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T951T XBB.1.16.8 |
| intergenic | H1108Y BF.28,XBB.1.16.8 |
| intergenic | R1170R BE.1.1,GY.5,GV.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T1216T XBB.1.16.8 |
| intergenic | D1275D FU.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | N1436N BA.5.2.3,XBB.1.16.8 |
| intergenic | H1455H XBB.1.16.8 |
| intergenic | T1638I EU.1.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | R1645R XBB.1.16.8 |
| intergenic | T1678T BA.5.2.20,XBB.1.16.8 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.8 |
| intergenic | D1849D BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,HN.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | S1857L EG.5.1,EG.5.1.6,GV.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | V1967V XBB.1.16.8 |
| intergenic | V2047F EG.7,EG.5.1.6,XBB.1.16.8 |
| intergenic | S2273S XBB.1.16.8 |
| intergenic | V2290A XBB.1.16.8 |
| intergenic | I2346V XBB.1.16.8 |
| ORF1a | A2418V / NSP3 |
| intergenic | A2418V XBB.1.16.8 |
| intergenic | N2523N BA.5.1.2,BA.5.1.30,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L2609L BA.5.1.24,BF.10,CK.2,FU.2,HK.6,XBB.1.16.8 |
| intergenic | V2766I XBB.1.16.8 |
| intergenic | H2831Q XBB.1.16.8 |
| intergenic | S2926F XBB.1.16.8 |
| intergenic | D2951D XBB.1.16.8 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | A3178A XBB.1.16.8 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5,EG.6.1,FL.15.1.1,HK.6,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | F3271F BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,EG.6.1,FY.4.1.1,HK.11,XBB.1.16.8 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | Y3389Y XBB.1.16.8 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | A3620V BA.1.14,BF.26,EG.6.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1,HF.1,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L3935L XBB.1.16.8 |
| intergenic | S3950S BA.1.14,XBB.1.16.8 |
| intergenic | A3995V XBB.1.16.8 |
| intergenic | A4155A FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | G4287G XBB.1.16.8 |
| intergenic | N4367T XBB.1.16.8 |
| intergenic | S4398L BA.1.17,BA.5.1.30,BF.26,FL.2.3,EU.1.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T4418I XBB.1.16.8 |
| intergenic | D4428D XBB.1.16.8 |
| intergenic | A4591T XBB.1.16.8 |
| intergenic | T4640T BA.5.1.1,GS.4,GK.2,HK.6,XBB.1.16.8 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | V4864V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | N5105N GK.1.1,HY.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | D5130D BA.5.1.24,BA.5.1.2,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | H5290H GY.5,XBB.1.16.8 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | V5366V EG.5.2.1,FL.15,FU.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | Y5444Y BA.5.1.10,GS.3,BA.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.8 |
| intergenic | D5698D GJ.1.2,XBB.1.16.8 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | IP5967VS XBB.1.16.8 |
| intergenic | A6010A XBB.1.16.8 |
| intergenic | D6147Y FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8 |
| intergenic | D6300D BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.5.1.9,XBB.1.16.8 |
| intergenic | A6355V XBB.1.16.8 |
| intergenic | Y6436Y BA.5.5,GS.4.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L6614F BA.5.2.8,FL.1.5.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | R6658S BA.5.2.34,JD.1.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | P6714S GW.5,GJ.1.2,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L6819L BA.5.2.2,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BE.1.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T19I BA.5.2.2,BA.5.1.2,EG.5.1.3,EG.5.1,FD.1.1,GV.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T19L BA.5.2.2,BA.5.1.2,EG.5.1.3,EG.5.1,FD.1.1,GV.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | Y28Y BQ.1,GS.4,XBB.1.16.8 |
| intergenic | V42V XBB.1.16.8 |
| intergenic | V62V XBB.1.16.8 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV XBB.1.16.8 |
| intergenic | P139_Y145del XBB.1.16.8 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | E180V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | D198G GZ.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T323I JD.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | F329L XBB.1.16.8 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | F400F XBB.1.16.8 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L517L XBB.1.16.8 |
| S | L517L XBB.1.16.8 |
| intergenic | L518L EG.5.1.3,HY.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T588I XBB.1.16.8 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | A647T XBB.1.16.8 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | S689I GJ.1.2,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T732I BA.2.12,EG.5.1,JG.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.8 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | S974S XBB.1.16.8 |
| intergenic | G1124V BF.9,GK.1.1,HK.3.3,XBB.1.16.8 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | D1146E XBB.1.16.8 |
| intergenic | Q1208H XBB.1.16.8 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | I35T BA.4.6,FL.15,XBB.1.16.8 |
| intergenic | I63T FK.1.1,GK.3.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T64T FK.1.1,GK.3.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | N82N XBB.1.16.8 |
| intergenic | V112F EG.5.1.6,XBB.1.16.8 |
| ORF3a | V112F BA.5.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | V163L XBB.1.16.8 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | N41N BF.9,BA.5.5,FL.10.1,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T10I HN.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | I3T EG.5.1.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L7L XBB.1.16.8 |
| intergenic | Y75_L77delinsX XBB.1.16.8 |
| ORF7a | Y75_L77delinsX XBB.1.9.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L14fs XBB.1.16.8 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L20F XBB.1.16.8 |
| intergenic | G8L XBB.1.16.8 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | GI8X GK.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | A15V XBB.1.16.8 |
| intergenic | D34D GA.4.1,GE.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | S67F BA.5.1.10,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.5,EG.5.1,FL.10.1,FL.15,HK.6,XBB.1.16.8 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1,BA.2.3,GK.2.1,GK.1,HK.3.2,FY.5,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JN.2,XBB.1.16.8 |
| intergenic | I121L XBB.1.16.8 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | P6L HF.1.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | A35A BA.1.15,FL.2.3,JF.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8 |
| intergenic | Y86Y BA.2.12,BA.5.2.3,BA.5.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | G178D EU.1.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | S180S XBB.1.16.8 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8 |
| intergenic | P383S BA.4.1,HK.11,XBB.1.16.17,XBB.1.16.8 |
| intergenic | S410S BA.4.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | S413L BA.5.5,XBB.1.16.8 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | g.C-13T BA.5.2.3,BE.1.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | g.C-222T BA.4,BA.5,EG.7,BA.2.3,BQ.1,JG.3,HK.3 |
| intergenic | g.G-56T BA.5.6,HK.3.3 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | P80S HK.3 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34,BF.28,BE.1.1,FL.1.5,FL.2.3,JD.1.1,XBB.1.16.23,HK.3 |
| intergenic | A117V HK.3 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,HK.3 |
| intergenic | V169V HK.3 |
| intergenic | D223D FL.25,HK.3 |
| intergenic | Y229H GK.3.1,HK.3 |
| intergenic | R232S HK.3 |
| intergenic | G268W HK.3 |
| intergenic | P309L BA.5.2.2,BF.28,GE.1,XBB.1.16.15,HK.3 |
| intergenic | T340I HK.3 |
| intergenic | E342G HK.3 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BF.26,BF.10,CK.2,EU.1.1,GK.1,HK.3.2,JG.3 |
| intergenic | D466N HK.3 |
| intergenic | R542H HK.3 |
| intergenic | F548F JJ.1,HK.3 |
| intergenic | A599V BA.2.12,BF.26,EG.5.1,EU.1.1,HK.3 |
| intergenic | T614I BA.5.1.10,HK.3.2,HY.1 |
| intergenic | L628F DV.7.1.2,EG.5.1,HK.3 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | S723S DV.7.1,FL.15,HK.3 |
| intergenic | V757V BA.5.2.34,BF.26,FY.3.1,JD.1.1,HK.3 |
| intergenic | F813F BA.5.1.24,HK.3.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | V879V BA.2.12,BA.1.15,EG.7,GK.1.3,BA.1,HK.3 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6,GK.2.1,GK.3.1,GS.4,GY.5,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,HK.3 |
| intergenic | Q990L HK.7,HK.3 |
| intergenic | G1068R HK.3 |
| intergenic | V1085F HK.3 |
| intergenic | G1155C BA.5.1.2,EG.5.1.4,GK.3.1,GE.1,HK.11,HK.6,FL.1.5.1,HK.3 |
| intergenic | V1211F HK.3 |
| intergenic | L1249L HK.3 |
| intergenic | D1258D FL.1.5,GS.3,HK.3 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | T1426T BA.5.2.2,DV.7.1,BA.1.15,EG.7,HK.3 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.30,FL.1.5,EG.7,FD.1.1,FL.15,HK.3.2 |
| intergenic | N1442N HK.3 |
| intergenic | I1505I HK.3 |
| intergenic | P1541P BA.4.1,GE.1,HK.3 |
| intergenic | Q1593H HK.3 |
| intergenic | H1610Y GA.4.1,HK.3 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | I1935I BA.5.2.20,BA.5.6,EG.5.1.6,FU.1,HK.3 |
| intergenic | S2024S BA.5.2.20,HK.3 |
| intergenic | A2033A EG.5.1.4,GK.3.1,HK.3 |
| intergenic | E2063A HK.3 |
| intergenic | P2079L BA.5.2.20,GK.2,HK.3 |
| intergenic | A2080V HK.3 |
| intergenic | H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.17,HK.3 |
| intergenic | L2211L BQ.1.1.8,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,XBB.1.16.23,HK.3 |
| intergenic | N2222S HK.3 |
| intergenic | R2336S HK.3 |
| intergenic | L2364F HK.3 |
| intergenic | Y2489Y BA.5.2.20,EG.5.2.1,HR.1,XBB.1.16.17,HK.3 |
| intergenic | S2500S GK.2,FL.1.5.1,HR.1,HK.3 |
| intergenic | N2523N BA.5.1.2,BA.5.1.30,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | E2617E HK.3 |
| intergenic | R2638R JG.1,HK.3 |
| intergenic | P2685P BF.26,HK.3 |
| intergenic | K2810K BA.4.1,HK.3.3 |
| intergenic | C2851C EG.7,FU.2,FL.20,HK.3 |
| intergenic | I2858T HK.3 |
| intergenic | T2906N HK.3 |
| intergenic | Y2983Y HK.3 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | I3108V HK.3 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | Y3250Y BA.4.1,FL.2.3,FL.15,HK.3 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | T3258T BA.5.2.8,EG.5.1.8,GE.1,HK.3.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | A3333V FL.25,HK.3 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3,JN.3,XBB.1.16.23,HK.3 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.15,HK.3 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | A3523V EG.6.1,JD.1.1,XBB.1.16.23,HK.3 |
| intergenic | A3523A EG.5.1.4,FD.1.1,FL.20.2,FL.20,GY.5,EG.5.1.1,HK.3 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.4.6,EG.5.1.6,HF.1,HK.3.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | H3581H HK.3 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.16.23,HK.3 |
| intergenic | L3636L BA.5.1.24,BA.4.1,BA.5.5,BA.5.6,HK.3 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | D3728D BA.4.1.8,BQ.1.1.8,BQ.1.2.3,BA.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.23,HK.3 |
| intergenic | A3730A BA.2.12,EG.6.1,GA.4.1,BA.2.3,BQ.1,JD.1.1.1,FL.1.5.1,JG.3,HK.3 |
| intergenic | I3737V HK.3 |
| intergenic | T3750I BA.5.2.34,BA.4.1,BQ.1,HK.3.2,JD.1.1 |
| intergenic | L3930F HK.3 |
| intergenic | A3939V HK.3 |
| intergenic | T3940T CK.2,BA.4.6,BQ.1,GK.1.1,HK.3.2 |
| intergenic | L4045L BA.4,BA.4.1,BF.26,FK.1.1,FL.15,HK.3.2 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3 |
| intergenic | G4201R HK.3 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | L4252L BQ.1.1.8,FL.8,GJ.1.2,HK.3 |
| intergenic | V4266V BQ.1.1.8,HK.3 |
| intergenic | D4335D BA.2.3,HK.3.2,HN.1 |
| intergenic | P4353P HK.3 |
| ORF1b | D4455N / NSP12 |
| intergenic | D4455N EG.5.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,HK.3 |
| intergenic | S4470A HK.3 |
| intergenic | D4484N HK.3 |
| intergenic | V4566I HK.3 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | A4775T HK.3 |
| intergenic | A4791T HF.1.1,HK.3 |
| intergenic | Y4875Y BA.1.15,BA.4.6,HK.3 |
| intergenic | Y4908Y BA.5.1.10,HK.6,HK.3 |
| intergenic | L4967L HK.3 |
| intergenic | H5005H HK.3 |
| intergenic | S5039R HK.3 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | E5121D HK.3 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | P5222P GE.1,HK.3 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | A5258A HK.3 |
| intergenic | T5300I HK.3 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | L5564L HK.3 |
| intergenic | A5636A BF.10,BA.5.5,EG.5.1,HK.3.2 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | R5733R HK.3 |
| intergenic | S5748S BA.4,BF.28,HK.3.2 |
| intergenic | V5845V HK.3 |
| intergenic | I5849I HK.3 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | D5907D BQ.1.1.8,HK.3 |
| intergenic | H5944H HK.3 |
| intergenic | H5951Y DV.7.1,EG.5.1.3,FL.10.1,JF.1,HK.3 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | IP5967VL HK.3 |
| intergenic | P5971S BQ.1.13,EG.10.1,XBB.1.16.17,HK.3 |
| intergenic | L6034L BA.2.3,GJ.1.2.6,HK.3.3,HY.1 |
| intergenic | P6053S HK.3 |
| ORF1b | R6060K / NSP14 |
| intergenic | P6076P HK.3 |
| intergenic | P6076S HK.3 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3 |
| intergenic | L6082F BA.2.12,BF.28,GK.1.1,HK.3 |
| intergenic | K6236N BA.1.15,EG.5.1.6,HK.3 |
| intergenic | E6290E FL.15,HK.3.2 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3,EG.5.1,FL.10.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GK.3.1,GY.5,FL.1.5.1,HK.3 |
| intergenic | T6482T HK.3 |
| intergenic | I6537I BE.1.1,GZ.1,HK.3 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | V6573V BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,FU.1,GK.2,GS.4.1,FL.1.5.1,HK.3 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | G6598D HK.3 |
| intergenic | H6686H HK.3 |
| intergenic | P6714S GW.5,GJ.1.2,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | V6772L BA.5.2.2,BA.5.1.1,BF.28,EG.5.1.3,GK.2,HK.3 |
| intergenic | T6777I BA.5,GE.1,HK.3.2 |
| intergenic | A6802A BA.5.5,GE.1,XBB.1.16.17,HK.3 |
| intergenic | S6831S GE.1,HK.3.2 |
| intergenic | I6838V BA.2.12,HK.3 |
| intergenic | Y6930Y BA.5.1.10,BA.1.15,FK.1.1,HK.3.3,JD.1.2 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HN.1,FY.5,FL.1.5.1,JJ.1 |
| intergenic | I7005I JD.1.1,HK.3 |
| intergenic | I7065I HK.3 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | V11V BA.5.2.34,BA.1.18,BF.28,BA.1.15,FL.15,HK.3.3 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.2 |
| intergenic | P25_A27del GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.2 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.15,FL.20,HK.7,HK.11,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3 |
| intergenic | F65F JF.1,HK.3 |
| intergenic | H66Y HK.3 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,XBB.1.16.17,JF.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | R190K BQ.1.1.8,FK.1.1,HK.3.3,FL.1.5.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | N234N BE.1.1,FL.2.3,HK.3 |
| intergenic | L249F HK.3 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | S256L BA.5.1.2,BQ.1,GK.1.1,HK.3.3,EG.5.1.1 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,HK.3 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | A348S HK.3 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,JF.1,HK.3 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | Y508Y BA.4.1,BF.10,HK.3 |
| intergenic | R567R HK.3 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | P631P BA.5.2.8,GJ.1.2,HK.3 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | Q677H GK.1,HK.3.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | NSP679KFH BA.5.2.20,HK.3.2 |
| intergenic | NSP679KSH BA.5.2.20,GV.1,HK.3.2,HR.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | A688T HK.3 |
| intergenic | I692I BA.5.1.10,BA.4.6,FL.14,EG.6.1,FU.2,GK.1.3,HK.7,GJ.1.2,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.23,HK.3 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | T778T BF.28,FL.15,HY.1,JD.1.1,HK.3 |
| intergenic | P809S GK.3.1,GK.2,HK.3 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | V1061V EG.5.1,HK.3 |
| intergenic | A1070V EG.5.1.8,HK.3 |
| intergenic | F1103S HK.3 |
| intergenic | G1124V BF.9,GK.1.1,HK.3.3,XBB.1.16.8 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | R1185C HK.3 |
| intergenic | G1219C BA.5.2.2,FL.10.1,XBB.1.16.15,HK.3 |
| intergenic | D1259D BA.2.12,HK.3.2 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | E19D HK.3 |
| intergenic | K21N BA.5.1.10,BA.5.1.1,DV.7.1.2,BA.4.6,FL.15,EG.5.1.1,HK.3 |
| intergenic | T34A BA.2.3,HK.3 |
| intergenic | A39A GK.3.1,HK.3.3 |
| intergenic | L52F FL.15,HK.3.3 |
| intergenic | L52I HK.3 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1,EG.5.1.6,GK.2,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,XBB.1.16.2,HK.3 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3 |
| intergenic | W69L HK.3 |
| intergenic | A110V DV.7.1,DV.7.1.2,FL.15,HK.3 |
| intergenic | V112V BA.5.2.3,BA.5,BQ.1.1.8,GJ.1.2,HK.3 |
| intergenic | R134H FU.2,GK.1,HK.3 |
| intergenic | Y154Y BA.5.5,FL.10.1,FU.2,HK.3.2,GJ.1.2,HK.3 |
| intergenic | K192Q HK.3 |
| intergenic | Y212Y DV.7.1.2,GK.1,GE.1,HK.3 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | P240L BA.5.1.2,EG.5.1.4,EG.5.1,HY.1,JD.1.1.1,JJ.1,HK.3 |
| intergenic | G251V HK.3 |
| intergenic | T269T BF.26,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,HK.3 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | L19I HK.3 |
| intergenic | A22A HK.3 |
| intergenic | Y42H HK.3 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | C33F FL.20,HK.3 |
| intergenic | N41N BF.9,BA.5.5,FL.10.1,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | L87F HK.3 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | I140I JG.3,HK.3 |
| intergenic | D190D HK.3 |
| intergenic | F2L EG.5.1,HK.3.2 |
| intergenic | L4L BA.5.2.3,EG.7,BA.5.6,JG.3,HK.3 |
| intergenic | V9A GJ.1.2,HK.3 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | I26V HK.3 |
| intergenic | P57P BA.4.1,GE.1,HK.3 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | I3T EG.5.1.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | Y20H EG.5.1.4,HK.3 |
| intergenic | R25T BA.4.1,BA.5.2.20,HF.1,HK.3.2,HN.1 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3 |
| intergenic | G70G EG.5.1.8,HK.3.2 |
| intergenic | A79A GS.4,HF.1,FL.1.5.1,HK.3 |
| intergenic | S98F HK.3 |
| intergenic | P99S BA.5.2.8,HK.3 |
| intergenic | I107T HK.3 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | H42Y HK.3 |
| intergenic | H42H FL.10.1,HR.1,HK.3 |
| intergenic | G8X HK.3 |
| intergenic | M1fs HK.3 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | Q23Q XBB.1.16.15,HK.3 |
| intergenic | P30L HK.3 |
| intergenic | V62V BA.5.2.20,BE.1.1,EG.5.1.4,EU.1.1,FL.20,BQ.1,GW.5,EG.5.1.1,XBB.1.16.23,HK.3 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,FU.2,BQ.1,GK.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,HK.3 |
| intergenic | A65A HK.3 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1,BA.2.3,GK.2.1,GK.1,HK.3.2,FY.5,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JN.2,XBB.1.16.8 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | T135I BA.5.6,FL.15,FY.3.1,HK.3 |
| intergenic | A173V BA.5.2.20,BA.4.6,EG.7,EG.5.1.4,EU.1.1,GK.1.1,GE.1,JD.1.1,HK.3 |
| intergenic | N192D HK.3 |
| intergenic | S197P HK.3 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | L223L HK.3 |
| intergenic | D225D FL.15,HK.3 |
| intergenic | I292I HK.8,HN.1,HK.3 |
| intergenic | Y298Y BA.1.17,BE.1.1,EG.10.1,GE.1,HY.1,HK.3 |
| intergenic | T334I BA.5.2.34,HK.3 |
| intergenic | A336V BF.10,HK.3 |
| intergenic | P364L FL.14,FL.10.1,HK.3.3,JF.1 |
| intergenic | T366I DV.7.1,EG.5.2.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HK.3 |
| intergenic | Q389H BA.2.12,HK.3 |
| intergenic | L395L HK.3 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | g.C-3T BA.5.2.2,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,BQ.1,HK.3.2,FY.5 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | g.T29765C HK.3 |
| intergenic | g.G-67A BA.5,XBB.1.17.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.10,DV.7.1.2,GK.1,JF.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | G130G XBB.1.17.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | G137D XBB.1.17.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.17.1 |
| ORF1a | E176A / NSP1 |
| intergenic | E176A XBB.1.17.1 |
| intergenic | L219L EU.1.1,BQ.1,FL.1.5.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | V274V XBB.1.17.1 |
| intergenic | R287R XBB.1.17.1 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5,EG.5.1.8,EG.5.1.3,FK.1.1,GE.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | N363N XBB.1.17.1 |
| intergenic | I368V BQ.1.1.8,XBB.1.17.1 |
| intergenic | L469F BQ.1.2.3,GA.4.1,XBB.1.17.1 |
| ORF1a | A482A / NSP2 |
| intergenic | A482A GE.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | S528L XBB.1.17.1 |
| intergenic | R542H HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1,EU.1.1,FL.20.2,FL.20,BQ.1,HK.11,XBB.1.17.1 |
| intergenic | E622G BA.5,XBB.1.17.1 |
| ORF1a | K669Q / NSP2 |
| intergenic | K669Q XBB.1.17.1 |
| ORF1a | T746T / NSP2 |
| intergenic | T746T DV.7.1.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | D762D BA.5.5,GK.2.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | A776V XBB.1.17.1 |
| ORF1a | E792A / NSP2 |
| intergenic | E792A XBB.1.17.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | A967A XBB.1.17.1 |
| intergenic | G989C XBB.1.17.1 |
| intergenic | E1024K XBB.1.17.1 |
| intergenic | F1214S XBB.1.17.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | P1330P BF.10,EG.5.1.3,FL.1.5,JG.3,JF.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | T1429I EG.5.1.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | S1468F XBB.1.17.1 |
| intergenic | Y1486Y BA.5.5,XBB.1.17.1 |
| ORF1a | I1686L / NSP3 |
| intergenic | I1686L XBB.1.17.1 |
| ORF1a | I1848V / NSP3 |
| intergenic | I1848V XBB.1.17.1 |
| intergenic | N1871N BF.26,FL.1.5,XBB.1.17.1 |
| intergenic | T1876I XBB.1.17.1 |
| intergenic | T1881I BA.4.6,HK.1,EG.5.1.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | P1921L FY.3.1,XBB.1.16.17,XBB.1.17.1 |
| intergenic | D1962E XBB.1.17.1 |
| intergenic | S2103F BA.2.86.1,BF.9,CK.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | L2113L BA.5.1.24,XBB.1.17.1 |
| intergenic | I2278T XBB.1.17.1 |
| intergenic | A2320A XBB.1.17.1 |
| ORF1a | N2439S / NSP3 |
| intergenic | N2439S XBB.1.17.1 |
| intergenic | S2625S BA.4,BA.5.2.3,BA.4.6,EG.5.1.6,HR.1,XBB.1.16.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | N2671N XBB.1.17.1 |
| intergenic | T2977I XBB.1.17.1 |
| intergenic | Y3011Y BQ.1.1.8,XBB.1.17.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | T3058I XBB.1.17.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| ORF1a | V3136I / NSP4 |
| intergenic | V3136I XBB.1.17.1 |
| intergenic | V3197V XBB.1.17.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | D3296D XBB.1.17.1 |
| intergenic | D3297D BF.10,EG.5.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| ORF1a | V3367F / NSP5 |
| intergenic | V3367F XBB.1.17.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | V3411A XBB.1.17.1 |
| intergenic | A3523V EG.6.1,JD.1.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1,BQ.1,GW.5,GK.2,GE.1,HF.1,GS.4.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | A3615A XBB.1.17.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | T3750I BA.5.2.34,BA.4.1,BQ.1,HK.3.2,JD.1.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | L3796L BA.2.12,BA.5,GE.1,EG.5.1.1,HR.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | Q3890R XBB.1.17.1 |
| intergenic | D4117G BQ.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | T4159I CK.2,FD.1.1,XBB.1.17.1 |
| ORF1a | L4169L / NSP9 |
| intergenic | L4169L BA.4.6,XBB.1.17.1 |
| intergenic | D4187D XBB.1.17.1 |
| intergenic | L4191F XBB.1.17.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | T4249I BQ.1.13,BA.5.5,FL.15,FY.5,XBB.1.16.15,XBB.1.17.1 |
| ORF1b | C4404R / NSP12 |
| intergenic | C4404R XBB.1.17.1 |
| intergenic | V4520I XBB.1.17.1 |
| ORF1b | R4573L / NSP12 |
| intergenic | R4573L XBB.1.17.1 |
| ORF1b | T4654I / NSP12 |
| intergenic | T4654I BA.5,XBB.1.17.1 |
| intergenic | F4667F XBB.1.17.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | N4899N XBB.1.17.1 |
| ORF1b | K4924K / NSP12 |
| intergenic | K4924K XBB.1.17.1 |
| intergenic | Y4987Y XBB.1.17.1 |
| ORF1b | M5058T / NSP12 |
| intergenic | M5058T XBB.1.17.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | V5092L XBB.1.17.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | E5194E BQ.1.1.8,XBB.1.17.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| ORF1b | D5285D / NSP12 |
| intergenic | D5285D XBB.1.17.1 |
| intergenic | P5319P GE.1,JN.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| ORF1b | A5459S / NSP13 |
| intergenic | A5459S XBB.1.17.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | F5746F BA.2.12,BA.5.2.3,FD.1.1,BA.2.3,GK.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5.2.8,BF.26,XBB.1.17.1 |
| intergenic | V5834V BA.5.2.20,FL.14,EG.6.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | G5969G BA.5.1.30,HN.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | D6051D BA.5.2.8,BA.5.1.30,GJ.1.2,JN.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | A6063A JN.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | D6069D BA.2.12,BA.4.1,EG.6.1,FL.15.1.1,GV.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | L6082F BA.2.12,BF.28,GK.1.1,HK.3,XBB.1.17.1 |
| ORF1b | Y6149Y / NSP14 |
| intergenic | Y6149Y XBB.1.17.1 |
| intergenic | H6239H FL.15,GK.2,GV.1,GJ.1.2,FL.1.5.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | F6251F BF.28,HF.1,XBB.1.16.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | G6258G XBB.1.17.1 |
| intergenic | A6319A XBB.1.17.1 |
| intergenic | K6348R XBB.1.17.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | S6375N EG.5.1.4,JD.1.1.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | D6491E XBB.1.17.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | D6584D BA.5.1.30,BQ.1.1.8,XBB.1.17.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | F6628F BA.5,BA.5.5,GK.1.1,GJ.1.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | V6637I GA.4.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | M6723V XBB.1.17.1 |
| ORF1b | S6767S / NSP15 |
| intergenic | S6767S XBB.1.17.1 |
| intergenic | LT18FI XBB.1.17.1 |
| intergenic | T19I XBB.1.17.1 |
| intergenic | TT19IA XBB.1.17.1 |
| S | TT19IA XBB.1.17.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | F32F BA.5.1.10,BA.5.1.2,BF.28,BA.4.6,EG.5.1.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | V36I XBB.1.17.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | N148T FL.15,FU.2,HK.7,JD.1.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | GKQG181VKEV XBB.1.17.1 |
| intergenic | M177_Q183delinsKE XBB.1.17.1 |
| intergenic | Q183E XBB.1.17.1 |
| intergenic | QG183ED XBB.1.17.1 |
| S | QG183ED XBB.1.17.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | D215H BA.5.1.1,GA.4.1,GV.1,XBB.1.16.17,XBB.1.17.1 |
| intergenic | Q218R GV.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | A222A XBB.1.17.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | L296L BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.2.3,GS.4.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | A348T XBB.1.17.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,JF.1,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | P463P XBB.1.17.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | S494P EG.10.1,EG.5.1,EG.5.1.6,FY.4.1.1,GK.2,HK.1,HF.1,FL.1.5.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.15,XBB.1.17.1 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1,FL.25,FU.2,GJ.1,GK.1,GW.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.17.1 |
| intergenic | F562F BA.5.2.34,FL.15,XBB.1.17.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | A684V BA.5,FY.3.1,XBB.1.16.17,XBB.1.17.1 |
| intergenic | M740V XBB.1.17.1 |
| intergenic | L763L XBB.1.17.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | A852T XBB.1.17.1 |
| intergenic | I923I XBB.1.17.1 |
| intergenic | N925N BF.26,BF.10,XBB.1.17.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | V1094V XBB.1.17.1 |
| intergenic | H1101H EG.10.1,EG.7,GK.1,GW.5,XBB.1.17.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | P1162S BA.5.2.3,BA.5,CH.1.1.28,JD.1.2,JG.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | I1198I XBB.1.17.1 |
| intergenic | D1259Y XBB.1.17.1 |
| intergenic | D1259D BA.2.12,HK.3.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | T14N XBB.1.17.1 |
| intergenic | I20I BA.1.17,BA.5.1.24,BF.26,FD.1.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | V90F BA.5.1.30,XBB.1.17.1 |
| intergenic | C130C BQ.1.1.8,FU.1,XBB.1.41.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | A143V FU.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | S166P XBB.1.17.1 |
| intergenic | T170T BA.5,XBB.1.17.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | P240L BA.5.1.2,EG.5.1.4,EG.5.1,HY.1,JD.1.1.1,JJ.1,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | S252P XBB.1.17.1 |
| intergenic | T269T BF.26,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | S68F GK.2.1,FL.20,GE.1,EG.5.1.1,HR.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | A2S XBB.1.17.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | T30I XBB.1.17.1 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10,BF.20,BA.5.1.2,FK.1.1,FD.1.1,FL.25,GK.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | L102L BA.5,EG.5.1,XBB.1.16.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | H125Y BA.5,BA.5.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,EG.5.1,GJ.1.2,JD.1.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | R146H DV.7.1,EG.6.1,GE.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | R158C XBB.1.17.1 |
| M | R158C XBB.1.17.1 |
| intergenic | L16L BA.5.1.1,BA.5.1.2,FK.1.1,FD.1.1,GK.1.1,FY.5,XBB.1.17.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | T11T GK.3.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | P34L BA.5.2.8,BA.4.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | L56L BF.28,XBB.1.17.1 |
| intergenic | L86L BA.5.1.2,FL.1.5.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | I88V XBB.1.17.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1 |
| intergenic | H17H BA.5.2.34,BA.5,EG.5.1.4,JD.1.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | D34D GA.4.1,GE.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1 |
| intergenic | V62L BF.41,BA.5.5,EG.5.1,EG.6.1,BA.5.6,XBB.1.17.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | N4H XBB.1.17.1 |
| intergenic | N8S XBB.1.17.1 |
| intergenic | P13F BA.5.1.10,BF.10,EU.1.1,FL.10.1,JG.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | P13L BA.5.1.10,EU.1.1,FL.10.1,JG.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | S26N BE.1.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | E31_S33del JF.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | G30_S33delinsA GS.4,GS.4.1,JF.1,XBB.1.17.1 |
| N | G30_S33delinsA XBB.2.3.11,XBB.1.17.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | A55A XBB.1.17.1 |
| intergenic | S78S BA.5.1.2,EG.5.1,FY.5,XBB.1.17.1 |
| intergenic | D98D BE.1.1,EG.5.1,GK.1,HY.1,HR.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | A134V GV.1,JG.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | I157I BA.4,BA.5.2.34,EG.5.2.1,EG.5.1,GE.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | L161F BA.5,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.15,XBB.1.17.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | G215S XBB.1.17.1 |
| intergenic | R262R XBB.1.17.1 |
| N | R262R XBB.1.17.1 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1,BF.26,EG.5.1,BA.5.6,FL.15,HK.7,GE.1,HY.1,XBB.1.16.23,XBB.1.17.1 |
| intergenic | I337V FL.1.5.1,XBB.1.17.1 |
| N | I337V XBB.1.17.1 |
| intergenic | T379I BF.28,FU.1,GW.5,GY.5,EG.5.1.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | g.G-15T BA.2.12,BQ.1.1.8,XBB.1.17.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,JD.1.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GE.1,GS.4.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L140L CH.1.1.28,BQ.1.13,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3,HK.6,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L145L XBB.1.16.11 |
| intergenic | Y241Y XBB.1.16.11 |
| intergenic | E269V XBB.1.16.11 |
| intergenic | G295C GK.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T340I HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5,EG.5.1.8,EG.5.1.3,FK.1.1,GE.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | G379E BA.5.1.10,BF.28,XBB.1.16.11 |
| intergenic | H388Y BA.1.14,EG.5.1.9,EU.1.1,FL.15,GJ.1.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N434S XBB.1.16.11 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BF.26,BF.10,CK.2,EU.1.1,GK.1,HK.3.2,JG.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A486V XBB.1.16.11 |
| intergenic | V488V FL.1.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | S528L XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A540A BA.4,XBB.1.16.11 |
| intergenic | F548S BA.5,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A599A BA.5.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,FK.1.1,FL.15,XBB.1.16.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A656V BA.1.14,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.13,BA.5.6,HK.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | K734K XBB.1.16.11 |
| intergenic | L815L EG.5.1,FL.8,FU.1,BQ.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | E863E XBB.1.16.11 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | E933A XBB.1.16.11 |
| intergenic | S944P XBB.1.16.11 |
| intergenic | Q1003_I1023del XBB.1.16.11 |
| intergenic | P1054L EG.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V1211F HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | F1278F XBB.1.16.11 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P1330P BF.10,EG.5.1.3,FL.1.5,JG.3,JF.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | E1413E XBB.1.16.17,XBB.1.16.11 |
| ORF1a | T1437T / NSP3 |
| intergenic | R1628C BF.26,GK.3.1,GK.2,GY.5,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T1638I EU.1.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V1661V BF.9,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N1673N BA.5.1.10,BA.4,BE.1.1,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,FD.1.1,JF.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Y1700Y BA.4.1,BQ.1.1.8,EG.6.1,FD.1.1,FU.2,GJ.1.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | E1706E XBB.1.16.11 |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10,BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BA.5.6,FY.3.1,GE.1,GJ.1.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | K1763R BA.2.86.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Y1770H XBB.1.16.11 |
| intergenic | Y1873Y BA.5.1.10,BF.9,BF.28,EG.5.1.3,HK.6,GJ.1.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | K2078K XBB.1.16.11 |
| intergenic | P2079S EG.5.1.9,EG.6.1,GV.1,JG.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | H2092Y BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.2.3,JG.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.17,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N2147N BA.5.1.10,BA.5.2.20,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T2154I BA.4.6,FY.3.1,HK.11,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T2264A XBB.1.16.11 |
| intergenic | E2268G XBB.1.16.11 |
| intergenic | H2357Y EG.5.1.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | M2365V XBB.1.16.11 |
| intergenic | V2494V XBB.1.16.11 |
| intergenic | A2529V BF.28,FU.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | I2709V XBB.1.16.11 |
| intergenic | V2751I XBB.1.16.11 |
| intergenic | L2778F DV.7.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | I2806I BA.5.1.24,FY.3.1,HF.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V2865V BF.28,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T2936T BE.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | R2949R BA.4.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | S2972F XBB.1.16.11 |
| intergenic | V2976L XBB.1.16.11 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | C3059C EG.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3,XBB.1.16.11 |
| ORF1a | G3169D / NSP4 |
| intergenic | G3169D XBB.1.16.11 |
| intergenic | N3186N XBB.1.16.11 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T3258T BA.5.2.8,EG.5.1.8,GE.1,HK.3.2,XBB.1.16.11 |
| ORF1a | C3279C / NSP5 |
| intergenic | C3279C XBB.1.16.11 |
| ORF1a | T3284T / NSP5 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N3443N XBB.1.16.11 |
| intergenic | D3508D FL.1.5,FL.8,FL.15,BQ.1,JF.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V3595V BQ.1.1.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | I3693I XBB.1.16.11 |
| intergenic | A3730A BA.2.12,EG.6.1,GA.4.1,BA.2.3,BQ.1,JD.1.1.1,FL.1.5.1,JG.3,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | S3742S BA.5.2.34,EG.5.1.6,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1,HF.1,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N3928N BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T4010T GJ.1.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Q4015R XBB.1.16.11 |
| intergenic | A4155A FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| ORF1a | T4219I / NSP9 |
| intergenic | L4298L XBB.1.16.11 |
| intergenic | P4389P XBB.1.16.11 |
| intergenic | A4489V GS.4.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | R4573C XBB.1.16.11 |
| intergenic | P4619L BF.9,GK.3.1,GZ.1,GS.4.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T4638T BA.5,BA.5.2.8,EG.7,XBB.1.16.11 |
| intergenic | R4641K EG.5.1.4,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T4644I XBB.1.16.11 |
| intergenic | A4645A XBB.1.16.11 |
| intergenic | D4666D JD.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V4864V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V4885I XBB.1.16.11 |
| intergenic | V4887V BA.5.1.24,BA.5.6,FL.1.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L4890L XBB.1.16.11 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D5130D BA.5.1.24,BA.5.1.2,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D5196D EG.5.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.2,BF.26,EG.5.1.8,EG.5.1,FL.8,FL.20,GE.1,JD.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L5283L BA.4,BA.4.1,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.25,GY.5,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A5342A XBB.1.16.11 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P5607P XBB.1.16.11 |
| intergenic | I5617I XBB.1.16.11 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | E5771E XBB.1.16.11 |
| intergenic | I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5.2.8,BF.26,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A5892V XBB.1.16.11 |
| intergenic | T5912I BA.5.1.10,DV.7.1.2,BF.10,BA.4.6,FU.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | G5969D XBB.1.16.11 |
| intergenic | V6016V BA.5.1.1,XBB.1.16.11 |
| ORF1b | G6068G / NSP14 |
| intergenic | D6147Y FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A6150A XBB.1.16.11 |
| intergenic | P6164P BQ.1.13,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V6188I XBB.1.16.11 |
| intergenic | I6230V XBB.1.16.11 |
| intergenic | V6253I XBB.1.16.11 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V6573V BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,FU.1,GK.2,GS.4.1,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A6589T XBB.1.16.11 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T6777I BA.5,GE.1,HK.3.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T6889T XBB.1.16.11 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V70L XBB.1.16.11 |
| intergenic | G72E XBB.1.16.11 |
| S | G72E XBB.1.16.11 |
| intergenic | R78K XBB.1.16.11 |
| intergenic | D80D BA.5.1.1,FL.25,GK.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | G142_H146delinsDVYK XBB.1.16.11 |
| intergenic | G142_H146delinsDVYQ XBB.1.16.11 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HY.1,JD.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | GVYYH142DVYYQ XBB.1.16.11 |
| S | GVYYH142DVYYQ XBB.1.16.11 |
| intergenic | L176F BA.5.1.30,EG.5.1.9,FY.5,JG.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | E180V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | KQ182NE GJ.1,GJ.1.2.6,GJ.1.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Q183E XBB.1.16.11 |
| intergenic | F186L GK.1,GZ.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | K187E XBB.1.16.11 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | S255F BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,EG.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.11 |
| intergenic | S256L BA.5.1.2,BQ.1,GK.1.1,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | G257S DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | S359S BA.5.1.10,XBB.1.16.11 |
| S | S359S BA.5.1.10,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | R403K BA.2.86.1,BA.5,DV.7.1,EG.10.1,EG.7,FY.3.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.41.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P521T XBB.1.16.11 |
| intergenic | T572I FD.1.1,GK.3.2,FY.5,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Q675H BA.5.1.24,BE.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Q675Q BA.5.2.34,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T676T XBB.1.16.11 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | I692I BA.5.1.10,BA.4.6,FL.14,EG.6.1,FU.2,GK.1.3,HK.7,GJ.1.2,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T732T BA.4.1,DV.7.1.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | G857G XBB.1.16.11 |
| intergenic | S929T XBB.1.41.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D936D BA.5.1.2,GK.1.3,GK.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V952V BA.5.2.20,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T961M DV.7.1.2,BA.2.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P1162S BA.5.2.3,BA.5,CH.1.1.28,JD.1.2,JG.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | E1188E XBB.1.16.11 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | I35K XBB.1.16.11 |
| intergenic | IP35KL XBB.1.16.11 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P104L BA.5.2.3,FD.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T175I BA.5.1.30,BF.26,EG.5.2.1,GJ.1.2.6,GS.4,GK.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | S253S BA.2.12,BE.1.1,GS.4,GK.2,JG.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | C44F XBB.1.16.11 |
| intergenic | S67S XBB.1.16.11 |
| intergenic | g.T-27C XBB.1.16.11 |
| intergenic | g.T-19A XBB.1.16.11 |
| intergenic | A2S XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T30I XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L4L BA.5.2.3,EG.7,BA.5.6,JG.3,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L16L BA.5.1.1,BA.5.1.2,FK.1.1,FD.1.1,GK.1.1,FY.5,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EU.1.1,GE.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T14I BA.5.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | C15F XBB.1.16.11 |
| intergenic | T39I BA.5.1.1,EU.1.1,FY.3.1,GJ.1.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9,BA.5.2.20,BQ.1.13,CK.2,EG.6.1,GK.2,XBB.1.16.15,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D69N XBB.1.16.11 |
| intergenic | A79A GS.4,HF.1,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L20R XBB.1.16.11 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | C20Y XBB.1.16.11 |
| intergenic | C25S BA.5.2.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | E64D XBB.1.16.11 |
| intergenic | G66_K68delinsE BA.2.12,BA.4,FY.3.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | S69P BA.5.1.2,DV.7.1.2,BQ.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V117A XBB.1.16.11 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P6L HF.1.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | E31_S33del JF.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | G30_S33delinsV XBB.1.16.11 |
| intergenic | Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,GY.5,GE.1,GJ.1.2,JD.1.2,JF.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P162L GK.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | G200D XBB.1.16.11 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T205T XBB.1.16.11 |
| intergenic | P326T XBB.1.16.11 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T379I BF.28,FU.1,GW.5,GY.5,EG.5.1.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P396P XBB.1.16.11 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | I4T XBB.1.16.11 |
| intergenic | A8A XBB.1.16.11 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | g.G29779T EG.5.1,FL.1.5.1,JJ.1,JD.1.1,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.11 |
| intergenic | g.C-160T BA.5.1.24,BE.1.1,BA.1.15,EG.5.1.3,GY.5,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | g.C-44T BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1 |
| intergenic | g.C-33T XBB.1.16.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | g.CG-25_-24TA GK.2,XBB.1.16.17 |
| intergenic | L18L XBB.1.16.1 |
| intergenic | R24R BA.5,FK.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | I71I BQ.1.2.3,GJ.1,XBB.1.16.15,JF.1 |
| intergenic | R73H XBB.1.16.1 |
| intergenic | A79V EG.5.1.4,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GE.1,GS.4.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | G82_M85delinsV BF.20,GK.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | V111V BA.5.2.20,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L123L XBB.1.16.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| ORF1a | L140I / NSP1 |
| intergenic | L140I XBB.1.16.1 |
| intergenic | L140L CH.1.1.28,BQ.1.13,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3,HK.6,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | N189N BA.5.1.10,BA.5.1.30,EG.5.2.1,JG.3,XBB.1.16.15 |
| ORF1a | A206A / NSP2 |
| intergenic | A206A XBB.1.16.1 |
| intergenic | T214N EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | Y229Y BA.2.12,XBB.1.16.17 |
| intergenic | A260A GE.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P286S XBB.1.16.17,XBB.1.16.1 |
| ORF1a | P286P / NSP2 |
| intergenic | P286P XBB.1.16.1 |
| ORF1a | V288V / NSP2 |
| intergenic | G295C GK.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P309L BA.5.2.2,BF.28,GE.1,XBB.1.16.15,HK.3 |
| intergenic | G334G BA.5.1.10,JG.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D335G FU.2,XBB.1.16.17 |
| intergenic | T340I HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5,EG.5.1.8,EG.5.1.3,FK.1.1,GE.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T350I BA.5.2.3,BA.5.5,GV.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | G358C XBB.1.16.1 |
| intergenic | H374H BA.5.1.10,FY.3.1,GK.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | S376L BA.5.2.3,BA.5.5,EG.5.1.9,FU.2,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.8 |
| intergenic | G379E BA.5.1.10,BF.28,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A385A BE.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1 |
| intergenic | H388Y BA.1.14,EG.5.1.9,EU.1.1,FL.15,GJ.1.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | G392G FL.14,FL.8,BA.2.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | R402R BA.5.2.34,DV.7.1,BF.10,BA.5.6,FL.15,XBB.1.16.15 |
| intergenic | V424I XBB.1.16.1 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BF.26,BF.10,CK.2,EU.1.1,GK.1,HK.3.2,JG.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V488V FL.1.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | S528L XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A540V BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.13,GK.2.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1 |
| intergenic | A540A BA.4,XBB.1.16.11 |
| intergenic | F548S BA.5,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L580F BA.4,BA.5.1.24,EG.6.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | M598I JN.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A599A BA.5.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,FK.1.1,FL.15,XBB.1.16.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L631L XBB.1.16.1 |
| intergenic | R643I EG.7,XBB.1.16.1 |
| ORF1a | D644G / NSP2 |
| intergenic | D644G XBB.1.16.1 |
| intergenic | A656V BA.1.14,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.13,BA.5.6,HK.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L716L XBB.1.16.1 |
| intergenic | I740I BA.2.12,BA.5,CK.2,BA.4.6,FU.2,GK.1,GY.5,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P748P BA.5.2.20,BA.5.6,GJ.1.2,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T753I BA.4.1.8,DV.7.1,EG.5.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | V757V BA.5.2.34,BF.26,FY.3.1,JD.1.1,HK.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T770I XBB.1.16.1 |
| intergenic | L815L EG.5.1,FL.8,FU.1,BQ.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | A876T BA.5.2.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | V879V BA.2.12,BA.1.15,EG.7,GK.1.3,BA.1,HK.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | E929G XBB.1.16.1 |
| intergenic | S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6,GK.2.1,GK.3.1,GS.4,GY.5,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,HK.3 |
| intergenic | L960L EG.5.1.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P971S BA.5.1.10,BA.4.1,BA.5.2.20,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T987T GE.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T1001I BA.2.12,BA.5.1.10,DV.7.1,EU.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P1054L EG.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V1056L BA.2.86.1,BA.5.2.20,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | H1113Y BA.2.12,EG.5.2.1,GK.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2 |
| intergenic | G1119G XBB.1.16.1 |
| intergenic | G1155D EG.5.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P1158L BA.1.14,JD.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | K1194N XBB.1.16.1 |
| intergenic | K1202N BE.1.1,HK.6,XBB.1.16.1 |
| intergenic | I1203I BA.5.1.2,BQ.1,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.15,JF.1 |
| intergenic | V1211F HK.3,XBB.1.16.11 |
| ORF1a | K1226K / NSP3 |
| intergenic | K1226K XBB.1.16.1 |
| intergenic | H1264H BQ.1.2.3,XBB.1.41.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | A1268A FL.10.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P1330P BF.10,EG.5.1.3,FL.1.5,JG.3,JF.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V1345V BA.5.2.20,XBB.1.16.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | R1386R XBB.1.16.1 |
| intergenic | V1391V FL.15.1.1,FY.5,XBB.1.16.1 |
| intergenic | V1393V BE.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | E1413E XBB.1.16.17,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Y1425Y BA.5.5,BA.2.3,HR.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P1497L XBB.1.16.2,XBB.1.16.1 |
| intergenic | D1554D BF.10,FL.15,XBB.1.16.1 |
| intergenic | M1586L XBB.1.16.1 |
| intergenic | T1617T XBB.1.16.1 |
| intergenic | R1628C BF.26,GK.3.1,GK.2,GY.5,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T1638I EU.1.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | K1655N BA.5.2.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | V1661V BF.9,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N1673N BA.5.1.10,BA.4,BE.1.1,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,FD.1.1,JF.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Y1700Y BA.4.1,BQ.1.1.8,EG.6.1,FD.1.1,FU.2,GJ.1.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L1741L XBB.1.16.1 |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10,BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BA.5.6,FY.3.1,GE.1,GJ.1.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Q1759Q XBB.1.16.1 |
| intergenic | K1763R BA.2.86.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T1788M BA.4.6,FL.20.2,GS.4,HK.6,XBB.1.16.1 |
| intergenic | F1804F XBB.1.16.1 |
| ORF1a | A1812A / NSP3 |
| intergenic | Y1873Y BA.5.1.10,BF.9,BF.28,EG.5.1.3,HK.6,GJ.1.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P1921L FY.3.1,XBB.1.16.17,XBB.1.17.1 |
| intergenic | N1922N BA.5,GE.1,EG.5.1.1,JG.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | F1925F BA.5.2.2,BF.28,BE.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,FL.10.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | F1960F FU.2,HK.7,XBB.1.16.1 |
| intergenic | S2024L BA.5.2.2,FL.8,FL.20,GS.4,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S2030P XBB.1.16.1 |
| intergenic | S2030L DV.7.1,GK.1.1,XBB.1.16.15,JF.1 |
| intergenic | P2079S EG.5.1.9,EG.6.1,GV.1,JG.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T2087I CH.1.1.28,EG.5.2.1,JG.3,JN.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | H2092Y BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.2.3,JG.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.17,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P2144S JG.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | N2147N BA.5.1.10,BA.5.2.20,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T2154I BA.4.6,FY.3.1,HK.11,XBB.1.16.11 |
| intergenic | C2239C JF.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T2319T BA.5.1.30,XBB.1.16.1 |
| intergenic | F2338F BQ.1.13,FL.15,XBB.1.16.15 |
| intergenic | H2357Y EG.5.1.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Y2489Y BA.5.2.20,EG.5.2.1,HR.1,XBB.1.16.17,HK.3 |
| intergenic | T2512I JG.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L2518L BA.5.1.30,GJ.1.2.6,GJ.1.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A2529V BF.28,FU.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L2609L BA.5.1.24,BF.10,CK.2,FU.2,HK.6,XBB.1.16.8,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T2648I BA.5.2.2,BF.10,XBB.1.16.1 |
| intergenic | N2682N JG.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | D2687D BA.5.5,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L2778F DV.7.1,XBB.1.16.11 |
| ORF1a | F2780_F2782del / NSP4 |
| intergenic | I2806I BA.5.1.24,FY.3.1,HF.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N2829N BQ.1.1.8,XBB.1.16.1 |
| intergenic | C2851C EG.7,FU.2,FL.20,HK.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | V2865V BF.28,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T2936T BE.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | R2949R BA.4.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | C3059C EG.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | R3066K JG.3,XBB.1.16.17 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5,EG.6.1,FL.15.1.1,HK.6,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.8 |
| intergenic | C3181C XBB.1.16.1 |
| intergenic | K3192R FU.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T3258T BA.5.2.8,EG.5.1.8,GE.1,HK.3.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2,BF.9,BE.1.1,EG.5.1,FL.20,GK.3.1,GK.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L3338L BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BQ.1,GS.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.15,HK.3 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | G3437G BA.4,BA.5,XBB.1.16.17 |
| intergenic | D3439D BA.5.2.34,BA.5.1.1,DV.7.1,EG.5.1.3,FL.1.5,GE.1,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A3456V EG.5.2.1,XBB.1.16.1 |
| ORF1a | A3497A / NSP5 |
| intergenic | D3508D FL.1.5,FL.8,FL.15,BQ.1,JF.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.4.6,EG.5.1.6,HF.1,HK.3.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1,BQ.1,GW.5,GK.2,GE.1,HF.1,GS.4.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | V3595V BQ.1.1.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | M3621T XBB.1.16.1 |
| intergenic | L3644F BF.9,BQ.1.13,BA.5.5,XBB.1.16.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | V3690V BA.4.1.8,XBB.1.16.17 |
| intergenic | V3708V BA.5.1.1,FL.10.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D3728D BA.4.1.8,BQ.1.1.8,BQ.1.2.3,BA.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.23,HK.3 |
| intergenic | A3730A BA.2.12,EG.6.1,GA.4.1,BA.2.3,BQ.1,JD.1.1.1,FL.1.5.1,JG.3,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | I3738I BA.5.2.8,BA.5.1.30,XBB.1.16.1 |
| intergenic | S3742S BA.5.2.34,EG.5.1.6,XBB.1.16.11 |
| intergenic | M3752I EG.5.1.8,GK.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | Y3765C BA.5.1.24,BQ.1.2.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | F3769F BA.5.1.30,BF.26,FD.1.1,BA.5.6,BQ.1,GK.3.1,GW.5,GJ.1.2,EG.5.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L3829F GY.5,XBB.1.16.2,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1,HF.1,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L3918L XBB.1.16.1 |
| intergenic | N3928N BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L3935M XBB.1.16.1 |
| intergenic | N3937N BA.5,EG.5.2.1,EG.5.1,BA.5.6,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T3940I GE.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | D3992D HY.1,JG.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T4010T GJ.1.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | E4019E FL.1.5,XBB.1.16.15 |
| ORF1a | R4053R / NSP8 |
| intergenic | R4053R XBB.1.16.1 |
| intergenic | P4058P BA.4.1,BA.5.1.30,EG.5.1,HF.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BA.4.6,EG.5.1.3,BA.5.6,FU.1,GW.5,XBB.1.16.1 |
| intergenic | G4086S JD.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | L4149L BA.5,XBB.1.16.1 |
| intergenic | A4155A FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | G4178V BA.5.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| ORF1a | P4197L / NSP9 |
| intergenic | P4197L BQ.1.2.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| ORF1a | E4210E / NSP9 |
| intergenic | N4238N XBB.1.16.1 |
| intergenic | T4249I BQ.1.13,BA.5.5,FL.15,FY.5,XBB.1.16.15,XBB.1.17.1 |
| intergenic | Y4329Y FK.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | M4390V XBB.1.16.1 |
| intergenic | S4398S XBB.1.16.1 |
| intergenic | Y4424Y FL.1.5,FL.14,FL.15.1.1,GE.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | H4467H BA.5.1.10,BQ.1.1.8,GE.1,EG.5.1.1,JJ.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | T4477I BA.5.1.10,GJ.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A4489V GS.4.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D4499D GE.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | I4563V XBB.1.16.1 |
| intergenic | N4605N FL.10.1,FD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T4618T FL.1.5,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P4619L BF.9,GK.3.1,GZ.1,GS.4.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T4638T BA.5,BA.5.2.8,EG.7,XBB.1.16.11 |
| intergenic | R4641K EG.5.1.4,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D4666D JD.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T4685I FL.20,XBB.1.16.23,XBB.1.16.1 |
| intergenic | C4698C DV.7.1.2,XBB.1.16.17 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | V4733V EG.7,XBB.1.16.1 |
| intergenic | N4748N GK.2,GE.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | L4779L BA.4,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FY.3.1,GK.1.1,GE.1,XBB.1.16.17,JF.1 |
| ORF1b | Q4836R / NSP12 |
| ORF1b | D4844D / NSP12 |
| intergenic | D4844D XBB.1.16.1 |
| intergenic | V4864V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | N4881N FU.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | V4887V BA.5.1.24,BA.5.6,FL.1.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A4942A XBB.1.16.1 |
| intergenic | N4944N XBB.1.16.1 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20,BA.1.15,BA.5.5,BA.5.6,FL.20.2,FU.2,BA.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | H5005Y XBB.1.16.1 |
| ORF1b | T5035K / NSP12 |
| intergenic | G5063S XBB.1.16.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N5105N GK.1.1,HY.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.1 |
| intergenic | D5130D BA.5.1.24,BA.5.1.2,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | D5152D BA.5.1.24,DV.7.1,CH.1.1.28,BF.26,EG.5.1.3,BQ.1,HN.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | D5196D EG.5.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T5198A GS.4.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.2,BF.26,EG.5.1.8,EG.5.1,FL.8,FL.20,GE.1,JD.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L5283L BA.4,BA.4.1,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.25,GY.5,XBB.1.16.11 |
| intergenic | C5353C BA.5.1.30,FK.1.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P5371L BA.5.1.10,BA.5.2.8,HY.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P5371P BA.1.17,EG.5.2.1,EG.5.1,EG.5.1.6,FL.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | S5398L GY.5,XBB.1.16.15,JF.1 |
| intergenic | P5402S BA.4.6,XBB.1.16.1 |
| intergenic | N5448N GS.4.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | N5581N HN.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | V5680V BA.4.1.8,BF.28,FL.1.5,EG.7,FU.1,GK.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3,BA.5.1.30,BF.26,BF.10,JG.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | V5711V BA.5.2.20,XBB.1.16.15 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | Y5722Y JD.1.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | G5724G JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5.2.8,BF.26,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P5828S BA.5.2.34,BA.5.1.2,XBB.1.16.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T5871T XBB.1.16.1 |
| intergenic | T5874T XBB.1.16.1 |
| intergenic | T5912I BA.5.1.10,DV.7.1.2,BF.10,BA.4.6,FU.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T5923I EG.7,EU.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | I5967V EG.5.1.4,FL.14,FD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P5971S BQ.1.13,EG.10.1,XBB.1.16.17,HK.3 |
| intergenic | E6002D GS.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | V6016V BA.5.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A6044V BA.5,BA.4.6,GY.5,GV.1,JG.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | V6092L XBB.1.16.1 |
| intergenic | C6141C BA.5.2.20,GY.5,XBB.1.16.1 |
| intergenic | D6147Y FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P6164P BQ.1.13,XBB.1.16.11 |
| ORF1b | G6176G / NSP14 |
| intergenic | G6176G XBB.1.16.1 |
| intergenic | S6180I FL.2.3,FD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A6192V JG.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L6205L BA.5.1.10,BF.10,BQ.1,XBB.1.41.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | D6249D BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,XBB.1.16.15 |
| intergenic | F6302F BQ.1.13,EG.5.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | G6406S FD.1.1,FL.15.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | H6411H XBB.1.16.1 |
| intergenic | D6440D BF.10,GK.2,HR.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L6444L BA.5.2.20,XBB.1.16.1 |
| intergenic | V6474L GK.2,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1 |
| intergenic | A6532A XBB.1.16.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T6566M BA.5.2.20,EG.5.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | V6573V BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,FU.1,GK.2,GS.4.1,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | G6598S BA.5,BA.5.6,XBB.1.16.1 |
| intergenic | Y6645Y BA.5.2.2,GK.3.2,GY.5,HF.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L6666L EG.5.1.3,GK.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | Y6682Y GW.5,JD.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | R6709C FL.14,XBB.1.16.17 |
| intergenic | T6777I BA.5,GE.1,HK.3.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | G6788G XBB.1.16.1 |
| intergenic | A6802A BA.5.5,GE.1,XBB.1.16.17,HK.3 |
| intergenic | T6938I BA.2.12,BA.5,BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.5.6,XBB.1.16.1 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HN.1,FY.5,FL.1.5.1,JJ.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P7034P GK.1,XBB.1.16.15 |
| ORF1b | R7085R / NSP16 |
| intergenic | R7085R XBB.1.16.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | F32L GK.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | S45S FL.10.1,GK.2.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L54L DV.7.1,GY.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D80D BA.5.1.1,FL.25,GK.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T124T XBB.1.16.1 |
| S | T124T XBB.1.16.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HY.1,JD.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1 |
| S | HK146QN XBB.2.3.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,XBB.1.16.17,JF.1 |
| S | HK146QN XBB.2.3.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | E156Q GK.1.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L176F BA.5.1.30,EG.5.1.9,FY.5,JG.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | E180V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | KQ182QE FY.5,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Q183E FU.2,FY.5,EG.5.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | KQ182NE GJ.1,GJ.1.2.6,GJ.1.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | F186S FL.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | F186L GK.1,GZ.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | D215H BA.5.1.1,GA.4.1,GV.1,XBB.1.16.17,XBB.1.17.1 |
| intergenic | S221S BA.2.12,FK.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L226L XBB.1.16.1 |
| intergenic | G232G XBB.1.16.1 |
| intergenic | I233V XBB.1.16.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | S254F XBB.1.16.1 |
| intergenic | S255F BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,EG.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.11 |
| intergenic | S256L BA.5.1.2,BQ.1,GK.1.1,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | G257S DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L276L BA.5.1.30,EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D287A XBB.1.16.1 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,HK.3 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | A352S XBB.1.16.1 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.1.1,JF.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | S359S BA.5.1.10,XBB.1.16.11 |
| S | S359S BA.5.1.10,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| S | F392F XBB.1.16.1 |
| intergenic | R403K BA.2.86.1,BA.5,DV.7.1,EG.10.1,EG.7,FY.3.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.41.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.15,XBB.1.17.1 |
| intergenic | T547I BA.5.2.3,BA.5,BF.28,FL.2.3,FU.1,FU.2,XBB.1.16.1 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1,FL.25,FU.2,GJ.1,GK.1,GW.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | E554Q BF.26,JD.1.2,XBB.1.16.17 |
| intergenic | D571D XBB.1.16.1 |
| intergenic | T572I FD.1.1,GK.3.2,FY.5,XBB.1.16.11 |
| intergenic | E583D GK.1.1,GE.1,JD.1.1.2,JD.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | D614G HY.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | QD613HG FK.1.1,HY.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A647S BA.5.1.24,BF.26,XBB.1.16.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | Q675H BA.5.1.24,BE.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Q675Q BA.5.2.34,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | NSP679KSH BA.5.2.20,GV.1,HK.3.2,HR.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | A684V BA.5,FY.3.1,XBB.1.16.17,XBB.1.17.1 |
| intergenic | I692I BA.5.1.10,BA.4.6,FL.14,EG.6.1,FU.2,GK.1.3,HK.7,GJ.1.2,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A701V BA.1.17,BA.4.1,BA.5.5,EG.10.1,FL.1.5,FL.1.5.2,GJ.1.2,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | T732I BA.2.12,EG.5.1,JG.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T732T BA.4.1,DV.7.1.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | Y789Y BQ.1.2.3,HK.11,GV.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L821L BA.5.5,FL.1.5,EG.5.1,BA.2.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | C840C EG.5.1.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S929T XBB.1.41.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | G932G BA.5.5,BQ.1.2.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D936D BA.5.1.2,GK.1.3,GK.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V952V BA.5.2.20,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T961M DV.7.1.2,BA.2.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | V1068F XBB.1.16.1 |
| S | V1068F XBB.1.16.1 |
| intergenic | Y1110Y FD.1.1,GS.4,XBB.1.16.1 |
| intergenic | I1114I FL.15,FY.5,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P1162S BA.5.2.3,BA.5,CH.1.1.28,JD.1.2,JG.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | N1178N BQ.1.1.8,GK.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BF.28,FL.1.5,GK.3.1,GV.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | G1219C BA.5.2.2,FL.10.1,XBB.1.16.15,HK.3 |
| intergenic | A1222T FK.1.1,XBB.1.16.1 |
| S | G1251R BA.5.1.10,XBB.1.16.1 |
| intergenic | S1252P BA.5.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | K21N BA.5.1.10,BA.5.1.1,DV.7.1.2,BA.4.6,FL.15,EG.5.1.1,HK.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | D27Y BA.4.1.8,BA.5,BQ.1.2.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | I37T EG.5.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | R68K XBB.1.16.1 |
| intergenic | S74S EG.10.1,EG.6.1,EG.5.1.6,GJ.1.2,JG.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G100C BA.5.1.24,GK.2,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P104L BA.5.2.3,FD.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Y107H EG.5.1.4,XBB.1.16.2,XBB.1.16.1 |
| intergenic | Y109C EG.5.1,XBB.1.16.17 |
| ORF3a | L127I XBB.1.16.1 |
| intergenic | D155H JN.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T175I BA.5.1.30,BF.26,EG.5.2.1,GJ.1.2.6,GS.4,GK.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | S180P BA.5.2.8,XBB.1.16.1 |
| intergenic | C200C XBB.1.16.1 |
| intergenic | F207F BA.5.1.2,BA.5.2.20,BA.2.3,GJ.1.2,HY.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | S253S BA.2.12,BE.1.1,GS.4,GK.2,JG.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T269T BF.26,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | A32A XBB.1.16.1 |
| intergenic | S55F BA.5.1.2,EG.5.1,BA.2.3,XBB.1.16.17 |
| intergenic | V62F BA.5.2.20,CK.2,EG.5.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | g.T-26C BF.9,EU.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | A2S XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L17F BF.26,FL.1.5,XBB.1.16.17,JF.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T30I XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A63T XBB.1.16.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T77T BA.4.6,EG.5.1,FL.15,FL.20,GK.2,XBB.1.16.1 |
| intergenic | S108S DV.7.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | N117N BQ.1.13,BA.5.5,EG.5.1.3,BA.5.6,FL.15,EG.5.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | N121N BA.5.1.10,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L124L BA.2.12,BA.4,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.20,GK.1,HY.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | P132P BA.5.2.8,EG.5.1.6,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20,CK.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L164L XBB.1.16.1 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | L4L BA.5.2.3,EG.7,BA.5.6,JG.3,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L16L BA.5.1.1,BA.5.1.2,FK.1.1,FD.1.1,GK.1.1,FY.5,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EU.1.1,GE.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L5F BA.5.1.30,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T14I BA.5.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P34S GK.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T39I BA.5.1.1,EU.1.1,FY.3.1,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9,BA.5.2.20,BQ.1.13,CK.2,EG.6.1,GK.2,XBB.1.16.15,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A79A GS.4,HF.1,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | F87F EG.5.1.4,JD.1.2,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P99S BA.5.2.8,HK.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T111T XBB.1.16.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L25F GK.2.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | E39Q XBB.1.16.23,XBB.1.16.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | V13I JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | Q18X BA.5,FL.2.3,GJ.1.2,JG.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | C25S BA.5.2.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | R48fs XBB.1.16.1 |
| ORF8 | R48fs XBB.1.16.1 |
| intergenic | V49L XBB.1.16.1 |
| intergenic | R52I FY.3.1,GK.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | G66_K68delinsE BA.2.12,BA.4,FY.3.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | S69P BA.5.1.2,DV.7.1.2,BQ.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | C102F EG.7,GK.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9,FL.15,FU.2,GK.1,GK.3.1,JD.1.1.1,HR.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P6L HF.1.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P6P EG.6.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | E31_S33del JF.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P46S FL.8,FY.4.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | F66F BA.5.2.20,GS.3,GK.2,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | P73P FL.1.5,XBB.1.16.1 |
| N | P73P XBB.1.16.1 |
| intergenic | T115T BQ.1.1.8,GE.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D128N XBB.1.16.1 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,GY.5,GE.1,GJ.1.2,JD.1.2,JF.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P162L GK.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T166I DV.7.1,FL.15,GK.2,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P168S GK.2,JN.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P168P XBB.1.16.1 |
| intergenic | N192N BA.5.1.10,BA.4,BF.10,EG.6.1,GJ.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | S194P BA.5.1.10,XBB.1.16.15 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1,HK.6,HK.8,EG.5.1.1,JF.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| N | G212V XBB.1.16.1 |
| intergenic | H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.5,EG.5.1.4,BA.2.3,BQ.1,GE.1,GS.4.1,XBB.1.41.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | A313A FL.15,FY.4.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | S318S BE.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | M322I FL.15,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P344P GK.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T362I BA.5.1.24,BA.4.1,DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FU.2,GY.5,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T362K JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T366I DV.7.1,EG.5.2.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T379I BF.28,FU.1,GW.5,GY.5,EG.5.1.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T379T GK.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P383S BA.4.1,HK.11,XBB.1.16.17,XBB.1.16.8 |
| intergenic | K387K EG.5.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | V392V EG.6.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | S413R XBB.1.16.1 |
| intergenic | SS412IR XBB.1.16.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Q29X BA.4,XBB.1.16.1 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1,GK.3.2,GW.5,HK.6,GS.4.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGT29734C BA.4,BA.5.5,XBB.1.16.15 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGT29734T BA.4,BA.5.5,XBB.1.16.15 |
| intergenic | g.G29779A XBB.1.16.1 |
| intergenic | g.G29779T EG.5.1,FL.1.5.1,JJ.1,JD.1.1,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | g.C-80T BA.5.1.1,BA.2.3,JG.3,XBB.1.5.70 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13,EG.10.1,EG.5.1.3,EG.5.1.4,HN.1,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | R124C CK.2,GK.2,XBB.1.5.70 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | A138A EG.5.1,HR.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.6.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L642F BA.4.1,BA.5.5,EG.5.1.6,GK.1,EG.5.1.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | C657Y BA.5.2.20,FL.10.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | F709L XBB.1.5.70 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | P959S BA.2.12,EG.7,XBB.1.5.70 |
| intergenic | P971T XBB.1.5.70 |
| intergenic | S994G XBB.1.5.70 |
| intergenic | H1160H BA.5.5,XBB.1.5.70 |
| intergenic | I1203I BA.5.1.2,BQ.1,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | N1555S XBB.1.5.70 |
| ORF1a | P1596Q / NSP3 |
| intergenic | P1596Q XBB.1.5.70 |
| intergenic | Y1619Y DV.7.1,BA.5.5,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L1627L BA.5.1.30,FU.1,FU.2,GS.3,XBB.1.41.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | T1678T BA.5.2.20,XBB.1.16.8,XBB.1.5.70 |
| intergenic | I2010V FL.20.2,FL.20,GY.5,XBB.1.5.70 |
| intergenic | N2023S GK.1.3,XBB.1.5.70 |
| intergenic | G2091G BF.9,XBB.1.5.70 |
| intergenic | Y2266Y XBB.1.5.70 |
| intergenic | T2274I BA.5.1.1,EG.6.1,GK.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | S2433S BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,JD.1.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | G2440G XBB.1.5.70 |
| intergenic | V2613I XBB.1.5.70 |
| intergenic | A2710T BA.2.86.1,BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15,BA.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.5.70 |
| intergenic | D2824D GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | M3129I FY.5,XBB.1.5.70 |
| intergenic | P3134S EU.1.1,FL.15,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| ORF1a | A3220S / NSP4 |
| intergenic | A3220S XBB.1.5.70 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | V3349I XBB.1.5.70 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L3711F BA.2.86.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | I3768V XBB.1.5.70 |
| intergenic | F3789L XBB.1.5.70 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70 |
| intergenic | V3892V XBB.1.5.70 |
| intergenic | A4068S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L4252L BQ.1.1.8,FL.8,GJ.1.2,HK.3,XBB.1.5.70 |
| ORF1a | A4273T / NSP10 |
| intergenic | A4273T XBB.1.5.70 |
| intergenic | D4317D BF.9,EG.5.1.8,XBB.1.5.70 |
| ORF1a | P4337Q / NSP10 |
| intergenic | P4337Q XBB.1.5.70 |
| intergenic | T4618T FL.1.5,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | A4642V JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | D4891D FL.15,GK.1.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70 |
| intergenic | S5101S XBB.1.5.70 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | S5227S BE.1.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | K5513R XBB.1.5.70 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,HR.1,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,JF.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | T5737I BA.5.1.24,DV.7.1.2,BA.4.6,XBB.1.16.2,XBB.1.5.70 |
| intergenic | P5828L EG.5.2.1,FL.20,BQ.1,JG.3,XBB.1.5.70 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | G5942G FL.1.5.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | V6043V XBB.1.5.70 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L6614F BA.5.2.8,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,XBB.1.5.70 |
| intergenic | Q6639L XBB.1.5.70 |
| intergenic | E6680E XBB.1.5.70 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | Q52Q XBB.1.5.70 |
| intergenic | T76I BA.5.5,FL.14,GS.4,XBB.1.5.70 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | E156D BA.5.6,XBB.1.5.70 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | N185I XBB.1.5.70 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | Q218E FL.1.5.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | N331S XBB.1.5.70 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | S371F BF.10,XBB.1.5.70 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | N450D BA.2.86.1,BF.28,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.5.70 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,JF.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | A475V FL.15.1.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JF.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1,FL.25,FU.2,GJ.1,GK.1,GW.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | N556K XBB.1.16.17,XBB.1.5.70 |
| intergenic | E583A XBB.1.5.70 |
| S | E583A XBB.1.5.70 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L727L BQ.1.13,GK.2.1,GK.2,XBB.1.5.70 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | S929T XBB.1.41.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | N960N BA.5,XBB.1.5.70 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | V1133A XBB.1.5.70 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | S1161S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | H93Y XBB.1.5.70 |
| intergenic | N137N XBB.1.5.70 |
| intergenic | D199D XBB.1.5.70 |
| intergenic | D210D DV.7.1,BA.4.6,XBB.1.5.70 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | Q245K XBB.1.5.70 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | P71R XBB.1.5.70 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | I49I XBB.1.5.70 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L16L BA.5.1.1,BA.5.1.2,FK.1.1,FD.1.1,GK.1.1,FY.5,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | I33M XBB.1.5.70 |
| intergenic | E55Q XBB.1.5.70 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L49L XBB.1.5.70 |
| intergenic | T120I BQ.1.1.8,BF.28,DV.7.1.2,GY.5,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L34L XBB.1.5.70 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | P38S BA.5.5,FL.1.5,GK.2.1,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | Y42Y XBB.1.5.70 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | D3G XBB.1.5.70 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | A35A BA.1.15,FL.2.3,JF.1,XBB.1.16.8,XBB.1.5.70 |
| intergenic | H145H BA.5,FU.1,HN.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | P199S BA.5,BF.28,GJ.1.2,EG.5.1.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70 |
| intergenic | A251A FU.2,XBB.1.5.70 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1,BF.26,EG.5.1,BA.5.6,FL.15,HK.7,GE.1,HY.1,XBB.1.16.23,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | F315F BA.5.1.1,BA.5.1.30,FL.20.2,BQ.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | H356H BF.26,XBB.1.5.70 |
| intergenic | Q389Q XBB.1.5.70 |
| N | Q389Q XBB.1.5.70 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.10,DV.7.1.2,GK.1,JF.1,XBB.1.17.1,JA.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | A181T GS.4,GS.4.1,JA.1 |
| intergenic | C230C GE.1,JD.1.2,XBB.1.41.1,JA.1 |
| intergenic | S248N JA.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | D1323D BA.5.1.24,FL.10.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | T1538I FL.2.3,JA.1 |
| intergenic | Y1700Y BA.4.1,BQ.1.1.8,EG.6.1,FD.1.1,FU.2,GJ.1.2,XBB.1.16.11,JA.1 |
| intergenic | T1822I BA.1.18,BA.4.1,FU.1,BQ.1,GY.5,GE.1,JA.1 |
| intergenic | G2091S GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1 |
| intergenic | T2936T BE.1.1,XBB.1.16.11,JA.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.4.6,EG.5.1.6,HF.1,HK.3.2,XBB.1.16.15,JA.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | T4164I JD.1.1.1,JA.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | N4808K JA.1 |
| intergenic | V5059I JA.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | P6722L BQ.1,JA.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,XBB.1.16.17,JF.1,JA.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | D253G GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1 |
| intergenic | R273S JA.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.15,XBB.1.17.1,JA.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | A688V BA.5.2.34,BA.5,BA.5.1.30,JG.3,XBB.1.16.2,JF.1,JA.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | N777N BF.41,FL.1.5.1,JA.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | T1117I EG.7,GK.1,GJ.1.2,JD.1.1,JA.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | A13V GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1 |
| intergenic | R80I BA.4,JA.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | A50A BF.26,BA.2.3,GK.2.1,GS.4.1,JA.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | g.G29706T FL.1.5,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | g.C-104T BA.5,EG.10.1,EG.5.1.6,BA.5.1 |
| intergenic | g.G-81T BA.5.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,FD.1.1,BQ.1,BA.5.1 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GE.1,GS.4.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,BA.5.1 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,GE.1,XBB.1.16.8,BA.5.1 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BA.4.6,FD.1.1,GE.1,XBB.1.16.8,BA.5.1 |
| intergenic | M85del BA.5.2.34,BA.5.1.24,EG.5.2.1,JN.3 |
| intergenic | E87D BA.5.6,EG.5.1.6,BA.5.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,BA.5.1 |
| intergenic | D147N BA.5.1 |
| intergenic | V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5,BF.9,CH.1.1.28,HY.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | N189N BA.5.1.10,BA.5.1.30,EG.5.2.1,JG.3,XBB.1.16.15 |
| ORF1a | D223N / NSP2 |
| intergenic | D223N BA.5.1 |
| ORF1a | P271P / NSP2 |
| intergenic | P271P BA.5.1.24,BA.5.1 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5,EG.5.1.8,EG.5.1.3,FK.1.1,GE.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T346I GK.1,BA.5.1 |
| intergenic | P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.6,GK.2.1,GK.1,GE.1,HK.8 |
| intergenic | A385A BE.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1,BA.5.1 |
| intergenic | H417Y EG.5.1,FL.15,JF.1,BA.5.1 |
| ORF1a | C433G / NSP2 |
| intergenic | C433G BA.5.1 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BF.26,BF.10,CK.2,EU.1.1,GK.1,HK.3.2,JG.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | S505S BA.4,BA.5.1.30,DV.7.1.2,GS.3 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.17.1,BA.5.1 |
| intergenic | S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1,EU.1.1,FL.20.2,FL.20,BQ.1,HK.11,XBB.1.17.1 |
| intergenic | L580F BA.4,BA.5.1.24,EG.6.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A591V BA.5.1.10,BA.5.1.2,FL.14,FL.25 |
| intergenic | T592A BA.5.1 |
| intergenic | V606V BA.5,BA.5.1.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | T614I BA.5.1.10,HK.3.2,HY.1,BA.5.1 |
| intergenic | P626S BF.26,BA.5.1 |
| intergenic | A656V BA.1.14,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.13,BA.5.6,HK.8,XBB.1.16.11 |
| ORF1a | E658D / NSP2 |
| intergenic | E658D BA.5.1 |
| intergenic | T727I BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,HN.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | T882I BA.5.2.2,BA.5.1.10,EG.10.1 |
| intergenic | T891I BA.2.12,BA.5.1.24,BQ.1.2.3,FL.1.5 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6,GK.2.1,GK.3.1,GS.4,GY.5,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,HK.3,BA.5.1 |
| intergenic | P971L BA.5,BA.5.1.2,BF.26,BF.10,JD.1.1 |
| intergenic | T1001I BA.2.12,BA.5.1.10,DV.7.1,EU.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D1036D BA.5.1 |
| intergenic | V1071V BA.5.1 |
| intergenic | K1112K BA.5.1.24,BA.5.1 |
| intergenic | C1114F BA.5.1 |
| intergenic | T1168I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.1.15,EG.5.2.1,FU.2,BA.2.3 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | D1323D BA.5.1.24,FL.10.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | Y1337Y BA.5,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BQ.1.2.3,FL.10.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | F1353fs BA.5.1.10,BA.5,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.10,CK.2,FL.1.5,BQ.1 |
| ORF1a | E1377E / NSP3 |
| intergenic | E1377E BA.5.1 |
| intergenic | L1438L BA.1.14,BA.5.2.2,BA.5.1.30,BA.4.6,FL.2.3,FL.25,FU.2,FY.5,JG.1 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.30,FL.1.5,EG.7,FD.1.1,FL.15,HK.3.2 |
| intergenic | T1444A BA.5,BA.5.1 |
| intergenic | T1589I FL.1.5.2,FD.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.41.1,BA.5.1 |
| intergenic | P1640L BA.5.1.24,BA.5.1.30,EG.5.1.8 |
| intergenic | S1743F BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | C1847C BA.5,BA.5.1.2 |
| intergenic | Y1868Y BA.4,BA.5.1.24,BF.26,EU.1.1,EG.6.1,BQ.1,GK.3.1,HF.1,GJ.1.2 |
| intergenic | P1921S BF.20,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BA.4.6 |
| intergenic | N1995N BA.2.12,BF.28,GA.4.1,BA.5.1 |
| intergenic | V2047V BA.5.6,GE.1,BA.5.1 |
| intergenic | K2085K BA.5.1 |
| intergenic | D2101D BA.5.1.24,BA.5.1.2,BF.9,EG.5.1,EG.5.1.1 |
| ORF1a | T2197I / NSP3 |
| intergenic | S2242F BA.5.2.34,BA.5.2.8,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,EG.10.1 |
| intergenic | D2299D BA.4,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1,BQ.1,GS.4.1 |
| intergenic | C2445C BA.4.1.8,BA.5.1.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | S2500F BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.6,FL.20.2,BA.5.1 |
| intergenic | N2523N BA.5.1.2,BA.5.1.30,XBB.1.16.8,HK.3 |
| ORF1a | Q2639P / NSP3 |
| intergenic | Q2639P BA.5.1 |
| intergenic | D2687D BA.5.5,XBB.1.16.15,BA.5.1 |
| intergenic | K2761K HF.1,BA.5.1 |
| intergenic | N2894N BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.2.20,EG.5.1.9,JF.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | S3099L BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.30 |
| intergenic | A3209V BA.5.1.10,BA.5.2.34,EG.5.1.3,BA.5.1 |
| intergenic | D3240D FL.1.5.1,BA.5.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2,BF.9,BE.1.1,EG.5.1,FL.20,GK.3.1,GK.1.1,XBB.1.16.15,BA.5.1 |
| intergenic | D3297D BF.10,EG.5.1,XBB.1.17.1,BA.5.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3,JN.3,XBB.1.16.23,HK.3,BA.5.1 |
| intergenic | P3359S BA.5.1.10,BA.5.1.2,GE.1 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.15,HK.3 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | N3414N BF.28,BE.1.1,BA.5.6,BA.5.1 |
| intergenic | D3439D BA.5.2.34,BA.5.1.1,DV.7.1,EG.5.1.3,FL.1.5,GE.1,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D3479D BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1.8,GK.3.1,GE.1,EG.5.1.1,BA.5.1 |
| intergenic | D3492D BA.5.2.2,BQ.1,BA.5.1 |
| intergenic | D3511D BA.4,BA.5.1 |
| intergenic | L3535L BA.2.12,BA.5.1.24,BF.28,BA.5.6 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.4.6,EG.5.1.6,HF.1,HK.3.2,XBB.1.16.15,JA.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,BA.5.1 |
| ORF1a | F3614F / NSP6 |
| intergenic | F3614F BA.5.1 |
| intergenic | I3618V JG.3,BA.5.1 |
| intergenic | A3645A BA.5,BA.5.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | I3738I BA.5.2.8,BA.5.1.30,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T3750I BA.5.2.34,BA.4.1,BQ.1,HK.3.2,JD.1.1,XBB.1.17.1,BA.5.1 |
| intergenic | A3837T BA.2.12,BA.5.1 |
| intergenic | I3853I BA.5.1.10,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BE.1.1,HN.1,JG.3 |
| intergenic | M3862I EG.5.1.6,BA.5.1 |
| intergenic | S3950S BA.1.14,XBB.1.16.8,BA.5.1 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1 |
| intergenic | D4020D BA.5.1.2,EG.5.1,FD.1.1,BA.5.1 |
| intergenic | P4058P BA.4.1,BA.5.1.30,EG.5.1,HF.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1,BA.5.1 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BA.4.6,EG.5.1.3,BA.5.6,FU.1,GW.5,XBB.1.16.1,BA.5.1 |
| intergenic | T4083M BA.5.1.1,BA.5.1.2,FL.1.5,FL.10.1 |
| intergenic | E4097K BA.5.1 |
| intergenic | T4161I BF.26,BA.4.6,BQ.1,JD.1.1,BA.5.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | P4220L BA.5.1.24,BA.5.1.1,GW.5 |
| intergenic | N4235N BA.4,BA.5,BA.5.1.1,FL.1.5,FL.1.5.2,FL.15,HN.1,JG.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24,BA.5.2.3,HK.11 |
| intergenic | R4387R BA.4,BA.5.1.30,BF.28,FL.15,GK.1.3,GE.1 |
| intergenic | S4398L BA.1.17,BA.5.1.30,BF.26,FL.2.3,EU.1.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | A4408V FD.1.1,FL.20,HK.11,BA.5.1 |
| ORF1b | D4553Y / NSP12 |
| intergenic | D4553Y BA.5.1 |
| intergenic | P4715F BA.5.2.2,BA.4,BA.5,BA.5.1 |
| intergenic | P4715L BA.5.2.2,BA.4,BA.5,BA.5.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | D4769D BA.5.1.24,BA.5.1.2,BF.9 |
| intergenic | L4779L BA.4,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FY.3.1,GK.1.1,GE.1,XBB.1.16.17,JF.1,BA.5.1 |
| intergenic | S4843R BA.5.1 |
| ORF1b | V4865I / NSP12 |
| intergenic | V4865I GK.1.1,BA.5.1 |
| ORF1b | I4954V / NSP12 |
| intergenic | I4954V BA.5.1 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20,BA.1.15,BA.5.5,BA.5.6,FL.20.2,FU.2,BA.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L5030F BA.5.1 |
| intergenic | V5059I JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EU.1.1,FD.1.1,BA.5.1 |
| intergenic | D5130D BA.5.1.24,BA.5.1.2,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | D5152D BA.5.1.24,DV.7.1,CH.1.1.28,BF.26,EG.5.1.3,BQ.1,HN.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.1,BA.5.1 |
| intergenic | Y5180Y BA.5,BA.5.1 |
| intergenic | Y5220Y BA.5.2.34,BA.5.1.2,DV.7.1 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.2,BF.26,EG.5.1.8,EG.5.1,FL.8,FL.20,GE.1,JD.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A5342V BA.4,BF.9,BF.26,HF.1,BA.5.1 |
| intergenic | C5343C EG.5.1.1,XBB.1.16.23,BA.5.1 |
| intergenic | F5348F BF.10,BQ.1,GE.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.2,BA.5.1 |
| intergenic | C5353C BA.5.1.30,FK.1.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,BA.5.1 |
| intergenic | H5357H BA.5.1 |
| intergenic | P5371L BA.5.1.10,BA.5.2.8,HY.1,XBB.1.16.15,BA.5.1 |
| intergenic | P5377S BA.4,BA.5.1.24,BF.28,EG.5.1,FL.15,GK.2.1,GE.1 |
| intergenic | Y5388Y BA.2.12,BA.5.1.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | S5398P GJ.1.2.6,GJ.1.2,BA.5.1 |
| intergenic | N5426S BA.5.1 |
| intergenic | G5474G BA.5.1 |
| intergenic | S5490L BA.5.2.34,BA.5.1.24,FL.15,JG.3 |
| ORF1b | Y5529F / NSP13 |
| intergenic | Y5529F BA.5.1 |
| intergenic | T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.1.24,GE.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.8,HK.3,BA.5.1 |
| intergenic | S5583L BE.1.1,EG.6.1,GE.1,BA.5.1 |
| intergenic | Y5648C BA.5.1 |
| intergenic | S5674L FL.14,BA.5.1 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3,BA.5.1.30,BF.26,BF.10,JG.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | L5736L BA.5.1 |
| intergenic | L5762L BA.5.1.10,BA.5.1.30,BA.4.6,GS.4,JN.2,JG.3 |
| intergenic | I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5.2.8,BF.26,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,BA.5.1 |
| ORF1b | V5808A / NSP13 |
| intergenic | V5808A BA.5.1 |
| intergenic | V5819V BA.5.2.3,BA.5.1.2,FL.10.1,FU.2,JG.3 |
| intergenic | P5828S BA.5.2.34,BA.5.1.2,XBB.1.16.1 |
| intergenic | M5900I BF.26,BA.5.1 |
| ORF1b | A5926S / NSP14 |
| intergenic | A5926S BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | L5932L BA.5.2.34,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.2.3,GJ.1,GK.1.1,HF.1,HN.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | M5987I BA.5.1 |
| intergenic | D6051D BA.5.2.8,BA.5.1.30,GJ.1.2,JN.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | P6065S BA.4.1,BA.5.1 |
| intergenic | A6296A EU.1.1,BA.5.1 |
| ORF1b | S6299A / NSP14 |
| intergenic | S6299A BA.5.1 |
| intergenic | D6304N BA.5.1 |
| intergenic | F6370F BA.5.1.24,BA.5.1 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3,EG.5.1,FL.10.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GK.3.1,GY.5,FL.1.5.1,HK.3 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | H6686Y BA.5.1.1,BA.5.1.2,EG.5.1.8 |
| ORF1b | F6715F / NSP15 |
| intergenic | F6715F BA.5.1 |
| intergenic | V6772L BA.5.2.2,BA.5.1.1,BF.28,EG.5.1.3,GK.2,HK.3 |
| intergenic | L6819L BA.5.2.2,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BE.1.1,XBB.1.16.8,BA.5.1 |
| intergenic | V6894V HK.8,BA.5.1 |
| intergenic | L6924F BA.2.12,BA.5.1.10,FL.2.3 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HN.1,FY.5,FL.1.5.1,JJ.1,XBB.1.16.1,BA.5.1 |
| intergenic | F6985F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,GJ.1.2 |
| intergenic | A6990T HK.11,BA.5.1 |
| intergenic | A6997A BA.4,BA.5,BA.5.1.1,EG.10.1,FY.3.1,GS.4 |
| intergenic | R7014S BA.5.1 |
| intergenic | R7014H BA.5.2.34,GK.2.1,BA.5.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1 |
| intergenic | T19I BA.5.2.2,BA.5.1.2,EG.5.1.3,EG.5.1,FD.1.1,GV.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T19L BA.5.2.2,BA.5.1.2,EG.5.1.3,EG.5.1,FD.1.1,GV.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | F32F BA.5.1.10,BA.5.1.2,BF.28,BA.4.6,EG.5.1.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | D53D BA.5,BA.5.1.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.2.3,FL.1.5.1 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,BA.5.1 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,BA.5.1 |
| intergenic | V83V BA.5.1.10,BA.5.1.2,CH.1.1.28,FK.1.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6,GJ.1.2,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,JF.1,XBB.1.16.23,BA.5.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | G181V JG.3,BA.5.1 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,FK.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,BA.5.1 |
| intergenic | S255S BA.5.1 |
| intergenic | T259I XBB.1.16.17,BA.5.1 |
| intergenic | L296L BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.2.3,GS.4.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | T299I BA.5,BA.5.1.2,EG.10.1,GK.1,JG.3 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,BA.1,BA.5.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | K444R BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.2.20,BA.5.1 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,FK.1.1,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.5.2.3,FY.3.1,BQ.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | N603N BA.4.1.8,BA.5.1.10,DV.7.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | G652G BA.5.1 |
| S | G652G BA.5.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | A688V BA.5.2.34,BA.5,BA.5.1.30,JG.3,XBB.1.16.2,JF.1,JA.1 |
| intergenic | S691S FL.10.1,FL.15,GK.2,GE.1,BA.5.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | L877L BF.26,DV.7.1.2,EU.1.1,BA.2.3,BA.5.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | A1020S BA.4,BA.5.2.8,BA.5.1 |
| S | V1133V BA.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | I1169I BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,GK.2 |
| intergenic | Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BF.28,FL.1.5,GK.3.1,GV.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | I20I BA.1.17,BA.5.1.24,BF.26,FD.1.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | K21N BA.5.1.10,BA.5.1.1,DV.7.1.2,BA.4.6,FL.15,EG.5.1.1,HK.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | F43F BA.2.12,BA.5.2.20,FD.1.1,HY.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.23,BA.5.1 |
| intergenic | G49V FL.1.5,BA.5.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | S74S EG.10.1,EG.6.1,EG.5.1.6,GJ.1.2,JG.3,XBB.1.16.15,BA.5.1 |
| intergenic | H93H BA.5.1 |
| intergenic | L94I BA.5.1.24,BA.5.1.1 |
| intergenic | L106L BA.5.2.2,BA.5.1.10,CK.2,GK.2,GY.5,HK.1,FL.1.5.1 |
| intergenic | A110S BA.4.6,EG.5.1.3,GS.4.1,BA.5.1 |
| intergenic | V112F EG.5.1.6,XBB.1.16.8,BA.5.1 |
| intergenic | W131C BE.1.1,FL.15,GY.5,BA.5.1 |
| intergenic | D155Y BA.1.18,BA.4.6,BA.5.1 |
| intergenic | T223I BA.2.12,BA.5.1.30,EG.5.1.3,GY.5,HK.11,HF.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | V256del BA.5.2.2,BA.5.1.30,EG.5.1.3,FL.20.2,GE.1 |
| intergenic | F4F BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,GK.1.3 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | V25V BA.5.1.24,BA.5.1.1,EG.5.1.8 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,HF.1,BA.5.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | F26F BA.5.1 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10,BF.20,BA.5.1.2,FK.1.1,FD.1.1,FL.25,GK.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6,GZ.1,GE.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.23,BA.5.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3,GK.3.2,GK.1.1,GE.1,HF.1,HY.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | N113N BA.5.6,BA.5.1 |
| intergenic | L120L FL.10.1,FL.15,BA.2.3,BQ.1,BA.5.1 |
| intergenic | L124L BA.2.12,BA.4,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.20,GK.1,HY.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | H125Y BA.5,BA.5.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,EG.5.1,GJ.1.2,JD.1.1,XBB.1.17.1 |
| intergenic | N207N BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1.3,EG.7,FL.15 |
| intergenic | V5I BA.5.1.24,BA.5.1.2 |
| intergenic | D6G BA.5.1.30,BA.5.1 |
| intergenic | L16L BA.5.1.1,BA.5.1.2,FK.1.1,FD.1.1,GK.1.1,FY.5,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70 |
| intergenic | Y31Y BA.5.1.24,BA.5,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BA.5.6,GK.1.1,GE.1,BA.5.1 |
| intergenic | E54E BF.28,BA.5.1 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EU.1.1,GE.1,XBB.1.16.11,BA.5.1 |
| intergenic | L7V BA.5.1 |
| intergenic | C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1,BA.5.1 |
| intergenic | A79A GS.4,HF.1,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1 |
| intergenic | I88T BA.5.1 |
| intergenic | L96F DV.7.1.2,FU.1,GS.4.1,BA.5.1 |
| intergenic | L116F BA.4.1.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | F13L BA.5.1 |
| intergenic | F19L BA.4,BA.5.1.30,GV.1,FL.1.5.1,JN.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | A43V BF.41,GK.1.1,HK.1,HY.1,FL.1.5.1,BA.5.1 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1 |
| intergenic | S67F BA.5.1.10,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.5,EG.5.1,FL.10.1,FL.15,HK.6,XBB.1.16.8 |
| intergenic | I71T BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | L109fs BA.5.1 |
| ORF8 | H112H BA.2.3,BA.5.1.30 |
| intergenic | I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9,FL.15,FU.2,GK.1,GK.3.1,JD.1.1.1,HR.1,XBB.1.16.17,BA.5.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | P20P BA.5.5,GK.2,JD.1.1,BA.5.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | G30_S33delinsC BA.5.1 |
| intergenic | T49I BA.5,BA.5.1.30,BF.10,FD.1.1,HK.8 |
| intergenic | F53F BE.1.1,EG.5.1,GK.1.1,XBB.1.41.1,BA.5.1 |
| intergenic | T54T BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.13,BA.5.1 |
| intergenic | L56L BA.4.1,BA.5.1.30,FL.20.2,GW.5 |
| intergenic | D63D BA.5.1.10,DV.7.1,FL.15,BA.5.1 |
| intergenic | P67L BA.2.12,BA.5.1.10,BA.5.2.20 |
| intergenic | N75N BA.4.1.8,DV.7.1,BE.1.1,EG.5.1.1,BA.5.1 |
| intergenic | S79I BA.5.1 |
| intergenic | S79N BA.5.1 |
| intergenic | Y86Y BA.2.12,BA.5.2.3,BA.5.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,BA.5.1 |
| intergenic | D98D BE.1.1,EG.5.1,GK.1,HY.1,HR.1,XBB.1.17.1,BA.5.1 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1,BA.5.6,GK.1.1,GJ.1.2,JD.1.1.2,JD.1.1,BA.5.1 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,GY.5,GE.1,GJ.1.2,JD.1.2,JF.1,XBB.1.16.11,BA.5.1 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1,FL.15,BA.2.3,GK.1.1,HK.11,BA.1,JN.2 |
| intergenic | T135I BA.5.6,FL.15,FY.3.1,HK.3,BA.5.1 |
| intergenic | A152S BA.5.1.10,BA.5.1.2,GK.2.1 |
| intergenic | A155V BA.5.2.34,BA.5.1.2,HY.1 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1,HK.6,HK.8,EG.5.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,BA.5.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | T245I BA.5.2.2,BA.5.1.24 |
| intergenic | Q289Q BA.5.1.24,BA.5.1.30 |
| N | Q289Q BA.5.1.24,BA.5.1.30 |
| intergenic | H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.5,EG.5.1.4,BA.2.3,BQ.1,GE.1,GS.4.1,XBB.1.41.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | F315F BA.5.1.1,BA.5.1.30,FL.20.2,BQ.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | S318S BE.1.1,XBB.1.16.15,BA.5.1 |
| intergenic | Y333Y BA.4,BF.26,BA.4.6,BA.5.6,JD.1.1.1,BA.5.1 |
| intergenic | I337I BA.5.2.34,BA.5.1 |
| intergenic | D377Y BA.5.1.24,BA.5.1 |
| intergenic | A381A EG.5.1,BA.5.1 |
| intergenic | V392V EG.6.1,XBB.1.16.17,BA.5.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1 |
| intergenic | g.A-6G BA.5.1 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,FU.2,BQ.1,GK.1.1,BA.5.1 |
| intergenic | R24C BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4.1,FL.1.5.1,BA.5.1 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.6,FL.15,GY.5,JD.1.1,BA.5.1 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1,GK.3.2,GW.5,HK.6,GS.4.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,BA.5.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,XBB.1.17.1,BA.5.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,JD.1.2,XBB.1.17.1,BA.5.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| ORF1a | V20G / NSP1 |
| intergenic | V20G XBB.1.5.37 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G59G XBB.1.5.37 |
| intergenic | M85_E87delinsK EG.5.1.4,HR.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S100N XBB.1.5.37 |
| intergenic | E102E XBB.1.5.37 |
| intergenic | K120N BA.5.2.3,FL.1.5.1,JN.2,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L140L CH.1.1.28,BQ.1.13,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3,HK.6,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | E148G XBB.1.5.37 |
| intergenic | A206T XBB.1.5.37 |
| ORF1a | N278S / NSP2 |
| intergenic | N278S XBB.1.5.37 |
| intergenic | Q314K XBB.1.5.37 |
| intergenic | H374H BA.5.1.10,FY.3.1,GK.1.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | H388Y BA.1.14,EG.5.1.9,EU.1.1,FL.15,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37 |
| intergenic | A498V BA.5.1.1,GK.3.1,EG.5.1.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T554I FL.1.5.2,HK.8,XBB.1.5.37 |
| intergenic | A599A BA.5.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,FK.1.1,FL.15,XBB.1.16.2,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T609I BQ.1.1.8,JF.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | I694V GW.5,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L766L HK.6,XBB.1.5.37 |
| intergenic | D795N XBB.1.5.37 |
| intergenic | P804L XBB.1.5.37 |
| intergenic | S838I XBB.1.5.37 |
| intergenic | IT841VI BA.5.1.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T842I BA.5.1.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | A872A BA.5.1.2,EG.5.1.4,XBB.1.5.37 |
| intergenic | P892S EG.5.1.3,EG.6.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6,GK.2.1,GK.3.1,GS.4,GY.5,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | Q1021R XBB.1.5.37 |
| ORF1a | V1038I / NSP3 |
| intergenic | V1038I XBB.1.5.37 |
| intergenic | A1043V BA.4,BE.1.1,FK.1.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | A1074T XBB.1.5.37 |
| intergenic | S1161S XBB.1.5.37 |
| intergenic | P1213L BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,FL.10.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V1291I EG.7,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | A1352A XBB.1.5.37 |
| intergenic | A1352V XBB.1.5.37 |
| intergenic | I1360I FL.1.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S1361P BF.28,XBB.1.5.37 |
| intergenic | P1541P BA.4.1,GE.1,HK.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L1556F XBB.1.5.37 |
| intergenic | D1600D BQ.1.2.3,XBB.1.5.37 |
| ORF1a | Q1759Q / NSP3 |
| intergenic | Q1759Q XBB.1.16.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V1765I XBB.1.5.37 |
| intergenic | T1822I BA.1.18,BA.4.1,FU.1,BQ.1,GY.5,GE.1,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | Y1920Y FL.20,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S2030L DV.7.1,GK.1.1,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | D2060D EG.5.1.8,FL.1.5.1,JF.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | A2080V HK.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | I2086I EG.10.1,XBB.1.5.37 |
| ORF1a | L2095I / NSP3 |
| intergenic | L2095I XBB.1.5.37 |
| intergenic | V2130I FD.1.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | D2136N JG.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G2207G HK.8,XBB.1.5.37 |
| intergenic | C2239C JF.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G2258D XBB.1.5.37 |
| intergenic | T2264I FU.1,HY.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T2424I XBB.1.5.37 |
| intergenic | A2554V XBB.1.5.37 |
| intergenic | V2559V XBB.1.5.37 |
| intergenic | D2627Y XBB.1.5.37 |
| intergenic | N2678N BA.5.2.8,BA.5.2.20,GE.1,GS.4.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.37 |
| ORF1a | N2737S / NSP3 |
| intergenic | N2737S XBB.1.5.37 |
| intergenic | T2859I XBB.1.5.37 |
| intergenic | D3022D XBB.1.5.37 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | Y3098Y HY.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L3116F BF.10,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T3284I BA.4,BA.5.2.20,XBB.1.5.37 |
| intergenic | D3297D BF.10,EG.5.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L3313L FD.1.1,GK.2,GV.1,HR.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3,JN.3,XBB.1.16.23,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | D3450D BA.5.6,BA.1,GJ.1.2,HY.1,HR.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T3459T BA.5.1.1,BE.1.1,EG.7,GV.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G3546S XBB.1.5.37 |
| ORF1a | T3646I / NSP6 |
| intergenic | T3646I BA.5.2.2,JD.1.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | I3693I XBB.1.16.11,XBB.1.5.37 |
| intergenic | A3726V BA.5.2.20,FY.5,XBB.1.5.37 |
| intergenic | M3733I JD.1.2,XBB.1.5.37 |
| intergenic | Q3818Q XBB.1.5.37 |
| intergenic | L4045L BA.4,BA.4.1,BF.26,FK.1.1,FL.15,HK.3.2,XBB.1.5.37 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V4463I XBB.1.5.37 |
| intergenic | T4477I BA.5.1.10,GJ.1,XBB.1.16.15,XBB.1.5.37 |
| intergenic | P4486L BA.5.2.34,BF.26,BA.5.5,GK.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| ORF1b | Q4836Q / NSP12 |
| intergenic | Q4836Q BF.10,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V4865V XBB.1.5.37 |
| ORF1b | K4870K / NSP12 |
| intergenic | K4870K XBB.1.5.37 |
| intergenic | D5010D HY.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | M5021T XBB.1.5.37 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | P5069P XBB.1.5.37 |
| intergenic | V5092V HY.1,FL.1.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L5283L BA.4,BA.4.1,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.25,GY.5,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37 |
| intergenic | C5332C BA.5,EG.5.1.8,EG.5.1.9,EG.5.1,FL.14,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37 |
| intergenic | D5443D XBB.1.5.37 |
| intergenic | L5559L XBB.1.5.37 |
| intergenic | S5560N GJ.1.2,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L5564L HK.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | E5568E XBB.1.5.37 |
| intergenic | Y5593C XBB.1.5.37 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,HR.1,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,JF.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37 |
| intergenic | P5650L XBB.1.5.37 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T5737T XBB.1.5.37 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T5941I BA.5.5,FK.1.1,JG.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G5942W BA.5.1.10,XBB.1.5.37 |
| intergenic | P5945P BA.4.6,XBB.1.5.37 |
| intergenic | P5949L BQ.1.1.8,XBB.1.5.37 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G6018G EG.10.1,GJ.1,GE.1,GJ.1.2,EG.5.1.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T6028T BA.5.2.2,BE.1.1,EG.5.1.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L6034L BA.2.3,GJ.1.2.6,HK.3.3,HY.1,XBB.1.5.37 |
| ORF1b | I6089V / NSP14 |
| intergenic | I6089V XBB.1.5.37 |
| intergenic | L6102F GJ.1.2,XBB.1.5.37 |
| intergenic | H6193H XBB.1.5.37 |
| ORF1b | A6199A / NSP14 |
| intergenic | A6199A XBB.1.5.37 |
| ORF1b | H6255R / NSP14 |
| intergenic | H6255R XBB.1.5.37 |
| intergenic | L6291L XBB.1.5.37 |
| intergenic | S6299F XBB.1.5.37 |
| intergenic | N6333N FL.8,GS.3,GE.1,GS.4.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V6362I XBB.1.5.37 |
| intergenic | H6411Y XBB.1.5.37 |
| ORF1b | N6414N / NSP14 |
| intergenic | N6414N XBB.1.5.37 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3,EG.5.1,FL.10.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GK.3.1,GY.5,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T6441I BA.5.2.34,XBB.1.5.37 |
| ORF1b | I6531V / NSP15 |
| intergenic | I6531V XBB.1.5.37 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V6573V BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,FU.1,GK.2,GS.4.1,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T6618A XBB.1.5.37 |
| ORF1b | K6625R / NSP15 |
| intergenic | K6625R XBB.1.5.37 |
| intergenic | S6695I FL.1.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G6705G XBB.1.5.37 |
| intergenic | V6772L BA.5.2.2,BA.5.1.1,BF.28,EG.5.1.3,GK.2,HK.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L6819L BA.5.2.2,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BE.1.1,XBB.1.16.8,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V6894V HK.8,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | D6931D BA.5.1.2,BF.10,XBB.1.5.37 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HN.1,FY.5,FL.1.5.1,JJ.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S7000S XBB.1.5.37 |
| intergenic | P7034P GK.1,XBB.1.16.15,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | F32F BA.5.1.10,BA.5.1.2,BF.28,BA.4.6,EG.5.1.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.17.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S45S FL.10.1,GK.2.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L56L GS.4,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G75S XBB.1.5.37 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | R102R BF.28,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T108T EU.1.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L110L HK.6,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L118F BQ.1.2.3,GS.4.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | K129R XBB.1.5.37 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HY.1,JD.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37 |
| intergenic | N148T FL.15,FU.2,HK.7,JD.1.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.17.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | F168F XBB.1.5.37 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | P217L XBB.1.5.37 |
| intergenic | F220L XBB.1.5.37 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37 |
| intergenic | N282N XBB.1.5.37 |
| intergenic | T284I XBB.1.5.37 |
| intergenic | T333T BF.26,EG.5.1.6,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | A475V FL.15.1.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JF.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | F486L XBB.1.5.37 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | H519H BA.1.17,XBB.1.5.37 |
| intergenic | I587I BF.10,XBB.1.5.37 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | NSP679KSH BA.5.2.20,GV.1,HK.3.2,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.5.37 |
| intergenic | Y707Y BA.5.2.20,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T739I XBB.1.5.37 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V826V BA.5.2.34,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S940S FD.1.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S982S XBB.1.5.37 |
| S | S982S XBB.1.5.37 |
| intergenic | K1045R XBB.1.5.37 |
| intergenic | H1064H XBB.1.5.37 |
| intergenic | T1117I EG.7,GK.1,GJ.1.2,JD.1.1,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L1197L XBB.1.5.37 |
| intergenic | I1198I XBB.1.17.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T1238T BA.5.5,HN.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S1252F XBB.1.5.37 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | A39T XBB.1.5.37 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L73L BA.5.1.2,XBB.1.5.37 |
| intergenic | K75R XBB.1.5.37 |
| intergenic | T89I BF.26,EG.5.1.8,FL.1.5,EG.5.1.4,FD.1.1,GK.1.3,GK.1.1,HN.1,JD.1.1.2,JD.1.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G100G EG.5.2.1,BQ.1.2.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L106F BA.1.15,EG.5.1.4,FL.20,GJ.1.2,XBB.1.5.37 |
| intergenic | W131C BE.1.1,FL.15,GY.5,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | R134H FU.2,GK.1,HK.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | C148C BA.5.1.10,BA.5,FL.15,JG.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | K198R XBB.1.5.37 |
| ORF3a | K198R XBB.1.5.37 |
| intergenic | Q218R XBB.1.5.37 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V256F XBB.1.5.37 |
| intergenic | g.A-20G XBB.1.5.37 |
| intergenic | g.T-16C XBB.1.5.37 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | F23F EG.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | I76V XBB.1.5.37 |
| intergenic | G78S EG.5.1.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | R158H XBB.1.5.37 |
| intergenic | G182G XBB.1.5.37 |
| M | G182G XBB.1.5.37 |
| intergenic | A195A FL.14,XBB.1.5.37 |
| intergenic | D6G BA.5.1.30,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | E22D XBB.1.5.37 |
| intergenic | T28I BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1,GE.1,EG.5.1.1,JG.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G70G EG.5.1.8,HK.3.2,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T120I BQ.1.1.8,BF.28,DV.7.1.2,GY.5,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37 |
| intergenic | A15S XBB.1.5.37 |
| intergenic | L14fs XBB.1.5.37 |
| intergenic | L17V XBB.1.5.37 |
| intergenic | L18L EG.5.1.4,GZ.1,HK.7,GY.5,XBB.1.5.37 |
| intergenic | A43A EG.5.1.9,HN.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T11K DV.7.1,JG.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | H17Y BA.5.2.20,EG.10.1,FL.1.5,EG.5.1.6,GK.1.3,XBB.1.41.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | I39T XBB.1.5.37 |
| intergenic | W45L BF.28,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V62L BF.41,BA.5.5,EG.5.1,EG.6.1,BA.5.6,XBB.1.17.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | A65S BA.5.5,XBB.1.5.37 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,FU.2,BQ.1,GK.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | Q72H GK.1.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | C90F HY.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | C102F EG.7,GK.2,XBB.1.16.15,XBB.1.5.37 |
| intergenic | R115L XBB.1.5.37 |
| ORF8 | R115L BF.41,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,FL.1.5.1 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1,BA.2.3,GK.2.1,GK.1,HK.3.2,FY.5,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JN.2,XBB.1.16.8,XBB.1.5.37 |
| intergenic | I121L XBB.1.16.8,XBB.1.5.37 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | R41Q XBB.1.5.37 |
| intergenic | A50S XBB.1.5.37 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1,BA.5.6,GK.1.1,GJ.1.2,JD.1.1.2,JD.1.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T141I XBB.1.5.37 |
| intergenic | A156A XBB.1.5.37 |
| intergenic | T165T XBB.1.5.37 |
| intergenic | R189C XBB.1.5.37 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | N213D XBB.1.5.37 |
| intergenic | G236S XBB.1.5.37 |
| intergenic | G243C EG.5.1.6,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T271T XBB.1.5.37 |
| intergenic | G287G FL.10.1,EG.5.1.6,GK.1.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | A381A EG.5.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | A28V BA.2.12,BA.5.6,FL.1.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1,GK.3.2,GW.5,HK.6,GS.4.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | g.G29703T XBB.1.5.37 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | g.C-44T BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1,XCL |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | Q66R XCL |
| intergenic | M85del BA.5.2.34,BA.5.1.24,EG.5.2.1,JN.3,XCL |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | A516D XCL |
| intergenic | K669N XCL |
| intergenic | E673K XCL |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL |
| intergenic | P885P FU.1,XCL |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | A1043S XCL |
| intergenic | V1295A XCL |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | L1313L EG.5.1.1,FL.1.5.1,XCL |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL |
| intergenic | K1364K BF.10,XCL |
| intergenic | I1935V HN.1,XCL |
| intergenic | N1964S XCL |
| intergenic | V2072L XCL |
| intergenic | Y2384Y BA.2.12,BF.28,XCL |
| intergenic | F2598L XCL |
| intergenic | E2617D XCL |
| intergenic | G2959G XCL |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | L3201F XCL |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | A3357A BA.4,BQ.1.13,GK.1.1,JD.1.1,XCL |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | T3543I XCL |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1,BQ.1,GW.5,GK.2,GE.1,HF.1,GS.4.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XCL |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | S3950S BA.1.14,XBB.1.16.8,BA.5.1,XCL |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | K4348R FL.1.5.2,JN.1,XCL |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | T5035I DV.7.1.2,GS.4.1,XCL |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | D5103D XCL |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | S5164C GK.2.1,XCL |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.8,HK.3,BA.5.1,XCL |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,HR.1,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,JF.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | V5672V GE.1,XCL |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | A5727A DV.7.1,FL.20.2,FL.15,JD.1.1,XCL |
| intergenic | T5755I BA.5.1.24,XCL |
| intergenic | T5805M BA.5,FK.1.1,XCL |
| intergenic | P5828L EG.5.2.1,FL.20,BQ.1,JG.3,XBB.1.5.70,XCL |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | G6225S XCL |
| intergenic | D6249Y XBB.1.41.1,XCL |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,XBB.1.16.17,JF.1,JA.1,XCL |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XCL |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,JF.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,XCL |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | V511I GK.2.1,GK.2,XCL |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | E619D XCL |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL |
| intergenic | L727L BQ.1.13,GK.2.1,GK.2,XBB.1.5.70,XCL |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | F1148F EG.5.1.3,EG.7,FL.15,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.23,XCL |
| intergenic | P1162S GK.2.1,XCL |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | D238G XCL |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | A83A XCL |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.70,XCL |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | P45L BA.2.3,GK.1.3,XCL |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL |
| intergenic | A43V BF.41,GK.1.1,HK.1,HY.1,FL.1.5.1,BA.5.1,XCL |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | P38S BA.5.5,FL.1.5,GK.2.1,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70,XCL |
| intergenic | G96S XCL |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | S413C XCL |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL |
| intergenic | g.G-92T EG.7,HN.1,JF.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | g.-25delC XBB.1.42.1 |
| intergenic | g.C-25T XBB.1.42.1 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13,EG.10.1,EG.5.1.3,EG.5.1.4,HN.1,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.5.70,XBB.1.42.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | G82_M85delinsV BF.20,GK.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.42.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1 |
| intergenic | T170N XBB.1.42.1 |
| intergenic | Y182Y BA.5.2.20,FD.1.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | P271L XBB.1.42.1 |
| intergenic | M297I GY.5,XBB.1.42.1 |
| intergenic | T333M BA.4.1,BF.10,XBB.1.16.8,XBB.1.42.1 |
| intergenic | Q362P XBB.1.42.1 |
| intergenic | R398C BF.28,EG.5.1.4,XBB.1.42.1 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.1,GJ.1.2,HR.1,XBB.1.16.23,XBB.1.42.1 |
| intergenic | K518K BF.26,XBB.1.42.1 |
| intergenic | I573T XBB.1.42.1 |
| intergenic | N811N BA.5.2.34,EG.5.1.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | T829A XBB.1.42.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6,GK.2.1,GK.3.1,GS.4,GY.5,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1 |
| intergenic | F962V XBB.1.42.1 |
| intergenic | D1044D DV.7.1,FL.15,XBB.1.42.1 |
| intergenic | V1052V XBB.1.42.1 |
| ORF1a | P1096L / NSP3 |
| intergenic | P1096L FL.15,EG.5.1.1,XBB.1.42.1 |
| ORF1a | D1228Y / NSP3 |
| intergenic | D1228Y BA.2.3,XBB.1.42.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | A1397A BA.2.12,BA.5,DV.7.1,BA.5.5,FL.15,FU.1,JN.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | I1525V BA.5.2.3,GE.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | S1612L BF.26,XBB.1.42.1 |
| intergenic | I1935S XBB.1.42.1 |
| intergenic | L2062F BA.5.1.10,BF.26,FL.2.3,FL.14,GE.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | S2104I XBB.1.42.1 |
| intergenic | T2154I BA.4.6,FY.3.1,HK.11,XBB.1.16.11,XBB.1.42.1 |
| intergenic | S2193F BF.9,XBB.1.42.1 |
| intergenic | L2211L BQ.1.1.8,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.42.1 |
| intergenic | P2287L EG.5.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | C2455C XBB.1.42.1 |
| intergenic | N2523N BA.5.1.2,BA.5.1.30,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.42.1 |
| intergenic | P2685T EG.7,GE.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | K3162R XBB.1.42.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | D3903D XBB.1.42.1 |
| intergenic | V3917V HK.11,XBB.1.42.1 |
| intergenic | P4058P BA.4.1,BA.5.1.30,EG.5.1,HF.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.42.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| ORF1a | N4256N / NSP10 |
| intergenic | N4256N XBB.1.42.1 |
| intergenic | N4263N FU.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | V4372I BA.5.1.1,JD.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | R4510C HK.7,XBB.1.42.1 |
| intergenic | V4520I XBB.1.17.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | T4651I BA.2.3,XBB.1.42.1 |
| intergenic | Y4686Y BA.4.1.8,DV.7.1.2,EG.5.1.4,FD.1.1,FL.15,XBB.1.42.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | D4782D XBB.1.42.1 |
| intergenic | Q4836H XBB.1.42.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | V5236V XBB.1.42.1 |
| intergenic | A5342V BA.4,BF.9,BF.26,HF.1,BA.5.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | T5435A XBB.1.42.1 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3,XBB.1.42.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.8,HK.3,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | L5564L HK.3,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1 |
| intergenic | T5675I XBB.1.42.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | V5868V XBB.1.42.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | I5970M XBB.1.42.1 |
| intergenic | T6175I BQ.1.1.8,BA.4.6,GE.1,FL.1.5.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | V6212F XBB.1.42.1 |
| intergenic | A6285S XBB.1.42.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | R6417R FL.10.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | D6530D BF.26,GS.4.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | D6543G XBB.1.42.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | L6614F BA.5.2.8,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,XBB.1.5.70,XBB.1.42.1 |
| intergenic | P7034P GK.1,XBB.1.16.15,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1 |
| intergenic | S12A XBB.1.42.1 |
| S | S12A XBB.1.42.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | S45S FL.10.1,GK.2.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1 |
| intergenic | D53D BA.5,BA.5.1.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.2.3,FL.1.5.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | T76I BA.5.5,FL.14,GS.4,XBB.1.5.70,XBB.1.42.1 |
| intergenic | D80G XBB.1.42.1 |
| intergenic | V83A GK.2,HF.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HY.1,JD.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,XBB.1.16.17,JF.1,JA.1,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | Q183D XBB.1.42.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | Q218R GV.1,XBB.1.17.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | I358I DV.7.1,HK.8,XBB.1.42.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | V595I XBB.1.42.1 |
| intergenic | QD613HG FK.1.1,HY.1,XBB.1.16.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | H625Y XBB.1.42.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | I870V XBB.1.42.1 |
| intergenic | A879A BA.5,XBB.1.42.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | V1065L HK.11,XBB.1.42.1 |
| intergenic | A1078S XBB.1.42.1 |
| intergenic | H1101H EG.10.1,EG.7,GK.1,GW.5,XBB.1.17.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | D1127N XBB.1.42.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | D1153N BA.5.2.20,XBB.1.42.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | Y212Y DV.7.1.2,GK.1,GE.1,HK.3,XBB.1.42.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | H243R XBB.1.42.1 |
| ORF3a | H243R XBB.1.42.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | L27L FK.1.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | L164L XBB.1.16.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | D209Y JF.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | I32T BA.5.5,XBB.1.42.1 |
| intergenic | S41F XBB.1.42.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | F13del XBB.1.42.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | P38S BA.5.5,FL.1.5,GK.2.1,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9,FL.15,FU.2,GK.1,GK.3.1,JD.1.1.1,HR.1,XBB.1.16.17,BA.5.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | R41Q XBB.1.5.37,XBB.1.42.1 |
| intergenic | A50S XBB.1.5.37,XBB.1.42.1 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1,BA.5.6,GK.1.1,GJ.1.2,JD.1.1.2,JD.1.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1 |
| intergenic | I157I BA.4,BA.5.2.34,EG.5.2.1,EG.5.1,GE.1,XBB.1.17.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | g.G-15T BA.2.12,BQ.1.1.8,XBB.1.17.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | T12M XBB.1.42.1 |
| intergenic | A28V BA.2.12,BA.5.6,FL.1.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1 |
| intergenic | N36I XBB.1.42.1 |
| ORF10 | N36I XBB.1.42.1 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1,GK.3.2,GW.5,HK.6,GS.4.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V28I FL.20,HY.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V60V XBB.1.5.15 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.10,DV.7.1.2,GK.1,JF.1,XBB.1.17.1,JA.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | M85del XBB.1.5.15 |
| intergenic | A131V FD.1.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P197S HY.1,FL.1.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5,EG.5.1.8,EG.5.1.3,FK.1.1,GE.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L590F BA.5.2.3,XBB.1.5.15 |
| intergenic | N704N XBB.1.5.15 |
| intergenic | E726G XBB.1.5.15 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L845L XBB.1.5.15 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P971L BA.5,BA.5.1.2,BF.26,BF.10,JD.1.1,XBB.1.5.15 |
| ORF1a | Q1011P / NSP3 |
| intergenic | Q1011P XBB.1.5.15 |
| intergenic | L1016F HY.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V1038V XBB.1.5.15 |
| ORF1a | A1049S / NSP3 |
| intergenic | A1049S XBB.1.5.15 |
| intergenic | N1123N XBB.1.5.15 |
| intergenic | D1127D GW.5,FL.1.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | K1202K XBB.1.5.15 |
| intergenic | I1203I BA.5.1.2,BQ.1,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T1269A XBB.1.5.15 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | I1360V XBB.1.5.15 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.30,FL.1.5,EG.7,FD.1.1,FL.15,HK.3.2,XBB.1.5.15 |
| intergenic | S1539N BF.26,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T1542I FL.8,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T1638I EU.1.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15 |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10,BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BA.5.6,FY.3.1,GE.1,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L1797L JJ.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L1896L XBB.1.5.15 |
| ORF1a | F1928F / NSP3 |
| intergenic | F1928F XBB.1.5.15 |
| intergenic | P1977P BA.5.1.30,GK.3.1,FL.1.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | E2031K BA.5.2.20,XBB.1.5.15 |
| intergenic | C2041C BA.5.1.24,HK.11,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T2300I BF.28,EG.7,XBB.1.5.15 |
| intergenic | I2385I BA.4,DV.7.1,FL.10.1,GK.2,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V2421V BA.4,BF.10,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3,HF.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V2436V XBB.1.5.15 |
| intergenic | E2617A XBB.1.5.15 |
| ORF1a | M2674L / NSP3 |
| intergenic | M2674L XBB.1.5.15 |
| intergenic | K2764K XBB.1.5.15 |
| intergenic | T2846I XBB.1.5.15 |
| intergenic | A2994V BQ.1.1.8,GK.3.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | A3061T XBB.1.5.15 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| ORF1a | I3146V / NSP4 |
| intergenic | I3146V XBB.1.5.15 |
| intergenic | F3156F XBB.1.5.15 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5,EG.6.1,FL.15.1.1,HK.6,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.8,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | D3297D BF.10,EG.5.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T3308T BA.5.6,GE.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L3313L FD.1.1,GK.2,GV.1,HR.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15 |
| intergenic | S3344F GJ.1.2.6,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| ORF1a | A3457T / NSP5 |
| intergenic | A3457T XBB.1.5.15 |
| intergenic | P3504L BA.5,GK.3.1,HY.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | D3508D FL.1.5,FL.8,FL.15,BQ.1,JF.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15 |
| intergenic | M3652T XBB.1.5.15 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V3759G XBB.1.5.15 |
| intergenic | I3771V XBB.1.5.15 |
| intergenic | Y3813Y BF.9,EG.7,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V3871V BA.5.1.24,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L3899L BA.5.1.30,GE.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P4058P BA.4.1,BA.5.1.30,EG.5.1,HF.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | A4092A XBB.1.5.15 |
| ORF1a | S4093S / NSP8 |
| intergenic | S4093S EG.6.1,EG.5.1.6,XBB.1.5.15 |
| intergenic | A4168A BA.5.1.30,BA.4.6,FL.15,FL.20,JD.1.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | Y4172Y BA.5.1.2,BF.26,HF.1,JG.3,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P4197S BA.5.2.3,XBB.1.5.15 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| ORF1a | T4364A / NSP10 |
| intergenic | T4364A XBB.1.5.15 |
| intergenic | S4398L BA.1.17,BA.5.1.30,BF.26,FL.2.3,EU.1.1,XBB.1.16.8,XBB.1.5.15 |
| intergenic | I4429I BA.4.6,EG.6.1,XBB.1.5.15 |
| ORF1b | K4483N / NSP12 |
| intergenic | K4483N BA.5.2.8,XBB.1.5.15 |
| ORF1b | D4562A / NSP12 |
| intergenic | D4562A XBB.1.5.15 |
| intergenic | D4613D XBB.1.5.15 |
| intergenic | Y4657Y XBB.1.5.15 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| ORF1b | G4719G / NSP12 |
| intergenic | G4719G XBB.1.5.15 |
| intergenic | Y4908Y BA.5.1.10,HK.6,HK.3,XBB.1.5.15 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EU.1.1,FD.1.1,BA.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | N5105N GK.1.1,HY.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | D5152D BA.5.1.24,DV.7.1,CH.1.1.28,BF.26,EG.5.1.3,BQ.1,HN.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T5198I HK.7,XBB.1.5.15 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | G5231G FD.1.1,XBB.1.41.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | S5588S GK.2,XBB.1.5.15 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,HR.1,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,JF.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V5680V BA.4.1.8,BF.28,FL.1.5,EG.7,FU.1,GK.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.5.15 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | N5843N BA.5.6,XBB.1.5.15 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | A5948S XBB.1.5.15 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L6099F FL.25,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P6128S BQ.1.1.8,FL.25,GK.2.1,GE.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V6306V FU.2,JD.1.2,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | D6468G XBB.1.5.15 |
| intergenic | Y6540Y BQ.1.13,BF.10,FD.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GK.3.1,GS.4,GJ.1.2,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V6624I XBB.1.5.15 |
| intergenic | N6729N GE.1,HK.6,JD.1.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HN.1,FY.5,FL.1.5.1,JJ.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L6959L BA.4.1,XBB.1.5.15 |
| ORF1b | S7074I / NSP16 |
| intergenic | S7074I XBB.1.5.15 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | D40D XBB.1.5.15 |
| intergenic | V70F EG.5.1.4,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15 |
| intergenic | Q173K XBB.1.5.15 |
| intergenic | L179L FL.1.5,XBB.1.5.15 |
| intergenic | G181V JG.3,BA.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | N185D DV.7.1,DV.7.1.2,BQ.1,GK.1,GS.4.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L241L XBB.1.5.15 |
| S | L241L XBB.1.5.15 |
| intergenic | H245Y GA.4.1,EG.5.1.6,GK.3.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | A262V DV.7.1.2,XBB.1.5.15 |
| S | A262V XBB.1.5.15 |
| intergenic | T302T XBB.1.5.15 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | C391C HK.3.3,XBB.1.5.15 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | K458N XBB.1.5.15 |
| S | K458N XBB.1.5.15 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V539V XBB.1.5.15 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | N679K FL.10.1,JD.1.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | N679R XBB.1.5.15 |
| intergenic | TN678IK FL.10.1,JD.1.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T732T BA.4.1,DV.7.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | I805M XBB.1.5.15 |
| intergenic | D830D XBB.1.5.15 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V1008V XBB.1.5.15 |
| intergenic | D1084Y FL.8,EG.5.1.1,JD.1.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | H1101Y BF.41,BA.5.2.20,EG.5.1.3,HF.1.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V1104L BA.5.2.34,XBB.1.5.15 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P1162S BA.5.2.3,BA.5,CH.1.1.28,JD.1.2,JG.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | D1165N XBB.1.5.15 |
| S | D1165N XBB.1.5.15 |
| intergenic | I1179V XBB.1.5.15 |
| S | I1179V XBB.1.5.15 |
| intergenic | E1188A XBB.1.5.15 |
| S | E1188A XBB.1.5.15 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | Y91Y BA.5,XBB.1.5.15 |
| intergenic | A99P XBB.1.5.15 |
| ORF3a | A99P XBB.1.5.15 |
| intergenic | A99V BA.4.6,FL.1.5.1,JN.2,XBB.1.16.2,XBB.1.5.15 |
| intergenic | A110S BA.4.6,EG.5.1.3,GS.4.1,BA.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | N137N XBB.1.5.70,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T176I BA.1.17,BF.26,FL.15.1.1,FU.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V256_N257delinsD BA.5.5,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T269M EG.5.1.3,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | S16N XBB.1.5.15 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | I82I XBB.1.5.15 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3,GK.3.2,GK.1.1,GE.1,HF.1,HY.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.15 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L124L BA.2.12,BA.4,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.20,GK.1,HY.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.15 |
| intergenic | I128V XBB.1.5.15 |
| intergenic | V5V XBB.1.5.15 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | I3I BA.5.2.20,XBB.1.5.15 |
| intergenic | I10T BQ.1.13,FU.2,XBB.1.5.15 |
| intergenic | H47Y BA.1.14,BA.2.12,BA.4.6,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T115I XBB.1.5.15 |
| intergenic | T120I BQ.1.1.8,BF.28,DV.7.1.2,GY.5,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15 |
| intergenic | F13L BA.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | I9I XBB.1.5.15 |
| intergenic | H17Y BA.5.2.20,EG.10.1,FL.1.5,EG.5.1.6,GK.1.3,XBB.1.41.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V62L BF.41,BA.5.5,EG.5.1,EG.6.1,BA.5.6,XBB.1.17.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P85L FL.25,XBB.1.5.15 |
| intergenic | Q91K XBB.1.5.15 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | PR13LC HK.7,XBB.1.5.15 |
| intergenic | E31_S33del JF.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15 |
| intergenic | G30_S33delinsA GS.4,GS.4.1,JF.1,XBB.1.17.1,XBB.1.5.15 |
| N | G30_S33delinsA XBB.2.3.11,XBB.1.17.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | A35A BA.1.15,FL.2.3,JF.1,XBB.1.16.8,XBB.1.5.70,XBB.1.5.15 |
| intergenic | G85G BA.4.1.8,XBB.1.5.15 |
| N | G85G BA.4.1.8,XBB.1.5.15 |
| intergenic | Y86Y BA.2.12,BA.5.2.3,BA.5.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,BA.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | G236V XBB.1.5.15 |
| intergenic | Y268Y BA.5.1.10,BA.5,BQ.1.2.3,GE.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | R277R XBB.1.5.15 |
| intergenic | S318S BE.1.1,XBB.1.16.15,BA.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | F346F BA.5.2.34,EG.5.1,FL.14,FL.25,FU.2,XBB.1.5.15 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | A8V FL.10.1,BQ.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | A28V BA.2.12,BA.5.6,FL.1.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | g.G29706T FL.1.5,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | g.C29769T DV.7.1,BA.5.2.20,BF.26,FL.15,BA.2.3,FL.1.5.1,XBB.1.41.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | g.A29782G XBB.1.5.15 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | S135M XCH |
| intergenic | S135R GJ.1.2.6,XCH |
| intergenic | R287G GK.1.3,XCH |
| intergenic | Y359Y FY.4.1.1,XCH |
| intergenic | L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.6.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70,XCH |
| intergenic | L590S BQ.1.1.8,XCH |
| intergenic | E633A GK.1.3,XCH |
| intergenic | I652I BA.4.6,XCH |
| intergenic | C720Y FL.15,XCH |
| intergenic | A735T XCH |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | S1102G EG.5.1,XCH |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | S1476S GK.2,XCH |
| intergenic | A1679V EG.5.1.6,HN.1,JN.2,XCH |
| intergenic | E1870E XCH |
| intergenic | V1968V XCH |
| intergenic | A2033V BA.5.2.3,BA.5.2.8,BE.1.1,XCH |
| intergenic | L2095L FY.5,XCH |
| intergenic | V2133V XCH |
| intergenic | T2158I XCH |
| intergenic | S2433S BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,JD.1.1,XBB.1.5.70,XCH |
| intergenic | K2442R XCH |
| intergenic | D2824D GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70,XCH |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3,JN.3,XBB.1.16.23,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCH |
| intergenic | K3353N BA.5.2.2,XCH |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | D3552D XCH |
| intergenic | A3615A XBB.1.17.1,XCH |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | C3762C XCH |
| intergenic | Q3878R XCH |
| intergenic | A4068S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70,XCH |
| intergenic | P4197S BA.5.2.3,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | A4577V BA.5.1.30,GY.5,HF.1.1,XCH |
| intergenic | D4627D EG.5.1.1,XCH |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | D5531G GK.1.3,XCH |
| intergenic | S5553S XCH |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,HR.1,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,JF.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | T5631I XCH |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | L6082F BA.2.12,BF.28,GK.1.1,HK.3,XBB.1.17.1,XCH |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | N6443N BA.5.1.2,XCH |
| intergenic | N6534N XCH |
| intergenic | I6537I BE.1.1,GZ.1,HK.3,XCH |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | T51I GE.1,XCH |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,XBB.1.16.17,JF.1,JA.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | L296L BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.2.3,GS.4.1,XBB.1.17.1,XCH |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XCL,XCH |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | KVG444TPS XCH |
| intergenic | VG445PS XCH |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,JF.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,XCL,XCH |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | T573I EG.5.1,GK.1.3,GK.1.1,XCH |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | V635F XCH |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | G700G XCH |
| intergenic | S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4,GA.4.1,FY.4.1.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,JG.3,XCH |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | V1096V XCH |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | I1198V XCH |
| intergenic | C1243C XCH |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | G100S GW.5,XCH |
| intergenic | T175K XCH |
| intergenic | Q185H BA.2.12,BF.28,HF.1,XCH |
| intergenic | F207F BA.5.1.2,BA.5.2.20,BA.2.3,GJ.1.2,HY.1,XBB.1.16.15,XCH |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | Q245Q XCH |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | L129L DV.7.1,EG.5.1.3,XCH |
| intergenic | L4L BA.5.2.3,EG.7,BA.5.6,JG.3,HK.3,XBB.1.16.11,XCH |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | L116L BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.25,GE.1,XCH |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | P6T EG.5.1.3,XCH |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XCH |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH |
| intergenic | 129 XCH |
| intergenic | D128D XCH |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | Y333Y BA.4,BF.26,BA.4.6,BA.5.6,JD.1.1.1,BA.5.1,XCH |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | L37L XCH |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| ORF1a | G7C / NSP1 |
| intergenic | G7C XBB.1.5.10 |
| intergenic | L27L BA.5.1.24,FL.1.5.2,FL.10.1,GE.1,HN.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.10 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | G82_M85delinsV BF.20,GK.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10 |
| intergenic | N160N BA.4.6,FK.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | K225K XBB.1.5.10 |
| intergenic | V228V DV.7.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T333M BA.4.1,BF.10,XBB.1.16.8,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T350I BA.5.2.3,BA.5.5,GV.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.10 |
| ORF1a | A482S / NSP2 |
| ORF1a | S485I / NSP2 |
| intergenic | S485I XBB.1.5.10 |
| intergenic | E489K JD.1.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | G493S XBB.1.5.10 |
| intergenic | A516A XBB.1.5.10 |
| intergenic | T551I XBB.1.16.15,XBB.1.5.10 |
| intergenic | V606V BA.5,BA.5.1.1,EG.5.1.8,XBB.1.5.10 |
| intergenic | V627V XBB.1.5.10 |
| ORF1a | G638S / NSP2 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.5.10 |
| intergenic | A702A XBB.1.5.10 |
| intergenic | V839V BA.5.1.10,EG.5.1,XBB.1.16.23,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Y925H XBB.1.5.10 |
| intergenic | D930D XBB.1.5.10 |
| intergenic | P971S BA.5.1.10,BA.4.1,BA.5.2.20,XBB.1.16.15,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Q1021H JD.1.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | A1078T XBB.1.5.10 |
| intergenic | L1130F EG.5.1.8,EG.5.1.6,FY.5,XBB.1.5.10 |
| intergenic | H1141Y BA.5,BA.5.2.8,XBB.1.5.10 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| ORF1a | R1318G / NSP3 |
| intergenic | R1318G XBB.1.5.10 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| ORF1a | A1397P / NSP3 |
| intergenic | A1397P XBB.1.5.10 |
| intergenic | I1411I XBB.1.5.10 |
| intergenic | K1428K BA.5.2.34,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L1441L BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1,FK.1.1,GK.1,GK.2,GE.1,XBB.1.41.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L1507F EG.6.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T1542T BA.5.5,BA.4.6,HY.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | H1545Q XBB.1.5.10 |
| ORF1a | A1739V / NSP3 |
| ORF1a | K1763N / NSP3 |
| intergenic | K1763N XBB.1.5.10 |
| intergenic | I1785T BQ.1.13,BF.10,XBB.1.5.10 |
| ORF1a | P1803H / NSP3 |
| intergenic | P1803H XBB.1.5.10 |
| ORF1a | D1897E / NSP3 |
| intergenic | D1897E XBB.1.5.10 |
| intergenic | N1917N BA.4.1,JG.1,XBB.1.5.10 |
| ORF1a | I1970V / NSP3 |
| ORF1a | D2032G / NSP3 |
| intergenic | D2032G XBB.1.5.10 |
| intergenic | S2103F BA.2.86.1,BF.9,CK.2,XBB.1.17.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T2152I BA.1.17,BA.5.5,BQ.1.2.3,XBB.1.5.10 |
| ORF1a | S2246P / NSP3 |
| intergenic | S2246P XBB.1.5.10 |
| intergenic | A2344V XBB.1.5.10 |
| intergenic | A2345V GS.4,XBB.1.5.10 |
| intergenic | N2523N BA.5.1.2,BA.5.1.30,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | N2526N FL.10.1,XBB.1.5.10 |
| ORF1a | T2532N / NSP3 |
| intergenic | T2532N XBB.1.5.10 |
| intergenic | V2646I XBB.1.5.10 |
| intergenic | S2661F XBB.1.5.10 |
| ORF1a | A2785A / NSP4 |
| intergenic | A2785A XBB.1.5.10 |
| intergenic | A2821V XBB.1.5.10 |
| intergenic | S2822S FL.15,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T2846I XBB.1.5.15,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T2936I XBB.1.5.10 |
| intergenic | L2948L XBB.1.5.10 |
| intergenic | N3007N EG.5.1.4,EG.5.1,GV.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | S3309S XBB.1.5.10 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | V3420V BA.2.12,BE.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Y3424Y BA.5.1.10,XBB.1.5.10 |
| ORF1a | F3444F / NSP5 |
| intergenic | F3444F XBB.1.5.10 |
| intergenic | I3476T XBB.1.5.10 |
| intergenic | Y3500Y HK.6,XBB.1.5.10 |
| ORF1a | T3506A / NSP5 |
| intergenic | T3506A XBB.1.5.10 |
| ORF1a | Q3536Q / NSP5 |
| intergenic | Q3536Q XBB.1.5.10 |
| intergenic | T3543T XBB.1.5.10 |
| intergenic | C3563C XBB.1.16.2,XBB.1.5.10 |
| intergenic | G3617S XBB.1.5.10 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | R3706R JG.3,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L3717I XBB.1.5.10 |
| intergenic | T3750I BA.5.2.34,BA.4.1,BQ.1,HK.3.2,JD.1.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Y3813Y BF.9,EG.7,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L3919L XBB.1.5.10 |
| intergenic | S3950S BA.1.14,XBB.1.16.8,BA.5.1,XCL,XBB.1.5.10 |
| intergenic | V4072I GE.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | V4073V FL.8,FL.20,XBB.1.5.10 |
| intergenic | G4086S JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Y4171Y EG.5.1.3,HK.6,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Q4189H BA.5.1.10,XBB.1.5.10 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | A4257V XBB.1.5.10 |
| intergenic | R4387R BA.4,BA.5.1.30,BF.28,FL.15,GK.1.3,GE.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T4418I XBB.1.16.8,XBB.1.5.10 |
| ORF1b | Y4555Y / NSP12 |
| intergenic | T4644I XBB.1.16.11,XBB.1.5.10 |
| intergenic | P4656S BA.4.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| ORF1b | D4917D / NSP12 |
| intergenic | D4917D XBB.1.5.10 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | V5155V XBB.1.5.10 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| ORF1b | V5168V / NSP12 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | C5332C BA.5,EG.5.1.8,EG.5.1.9,EG.5.1,FL.14,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10 |
| intergenic | N5333K XBB.1.5.10 |
| intergenic | F5348F BF.10,BQ.1,GE.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.2,BA.5.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | A5591V XBB.1.5.10 |
| intergenic | G5606G FL.2.3,XBB.1.41.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,HR.1,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,JF.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | V5672V GE.1,XCL,XBB.1.5.10 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | D5725D BA.5.2.8,FK.1.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | I5940I BA.4.6,XBB.1.5.10 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | A6044V BA.5,BA.4.6,GY.5,GV.1,JG.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.5.10 |
| intergenic | V6241I EG.5.1,FD.1.1,GS.4,JD.1.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | D6256D BA.5.2.2,BA.5,GE.1,GS.4.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | K6301R XBB.1.5.10 |
| intergenic | F6302F BQ.1.13,EG.5.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.10 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | S6386L BA.2.3,XBB.1.5.10 |
| intergenic | C6402C XBB.1.5.10 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | V6573V BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,FU.1,GK.2,GS.4.1,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | V6600I XBB.1.5.10 |
| intergenic | E6712K XBB.1.5.10 |
| intergenic | P6722S FL.14,FY.4.1.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | A6802T JD.1.2,XBB.1.5.10 |
| intergenic | R7014R BA.5.2.34,BA.2.3,GK.3.2,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Y7020C XBB.1.5.10 |
| ORF1b | L7072L / NSP16 |
| intergenic | L7072L BA.5.2.20,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L8F XBB.1.5.10 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | N99N DV.7.1,HN.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6,GJ.1.2,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,JF.1,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HY.1,JD.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10 |
| intergenic | E154A XBB.1.5.10 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Q183K DV.7.1,XBB.1.5.10 |
| S | Q183K XBB.1.5.10 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | H245Y GA.4.1,EG.5.1.6,GK.3.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L335L XBB.1.5.10 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| S | VG445LS XBB.1.5.10 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | I472I FL.14,XBB.1.5.10 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Y508Y BA.4.1,BF.10,HK.3,XBB.1.5.10 |
| intergenic | A522A XBB.1.5.10 |
| intergenic | I569V XBB.1.5.10 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Q675H BA.5.1.24,BE.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.10 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T791I JD.1.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | S810S XBB.1.5.10 |
| intergenic | E819E DV.7.1,EG.5.1.6,HK.6,XBB.1.5.10 |
| intergenic | D936Y BQ.1.1.8,CK.2,XBB.1.5.10 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,GK.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | I980I FU.2,XBB.1.5.10 |
| intergenic | H1101H EG.10.1,EG.7,GK.1,GW.5,XBB.1.17.1,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | E1202Q BA.4.1.8,BA.5.2.3,BF.28,XBB.1.5.10 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L52F FL.15,HK.3.3,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | N144N XBB.1.5.10 |
| intergenic | C200C XBB.1.16.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Y206Y BA.4,BA.5,BQ.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | S216S XBB.1.5.10 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L164L XBB.1.16.1,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L7X XBB.1.5.10 |
| intergenic | L96F DV.7.1.2,FU.1,GS.4.1,BA.5.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T115I XBB.1.5.15,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | G8R EG.10.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | S21N XBB.1.5.10 |
| intergenic | I39T XBB.1.5.37,XBB.1.5.10 |
| intergenic | D63N XBB.1.5.10 |
| intergenic | P85L FL.25,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Y111C JD.1.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | R115L XBB.1.5.37,XBB.1.5.10 |
| ORF8 | R115L BF.41,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,FL.1.5.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | G60G EU.1.1,HY.1,JD.1.1.2,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T148T BF.10,GV.1,GJ.1.2,EG.5.1.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | A208V GA.4.1,GY.5,XBB.1.5.10 |
| intergenic | F315F BA.5.1.1,BA.5.1.30,FL.20.2,BQ.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.10 |
| intergenic | P365L BA.5.2.20,FL.1.5,GE.1,GS.4.1,JD.1.2,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Q390del XBB.1.5.10 |
| N | Q390del XBB.1.5.10 |
| intergenic | Q409L BQ.1.2.3,FL.2.3,XBB.1.5.10 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | SA413RS XBB.1.5.10 |
| intergenic | Q418R XBB.1.5.10 |
| N | Q418R XBB.1.5.10 |
| intergenic | g.C29686T DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,XBB.1.5.10 |
| intergenic | g.G29690T FD.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.41.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | G130E XBB.2.3.5 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | S142S XBB.2.3.5 |
| intergenic | P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.6,GK.2.1,GK.1,GE.1,HK.8,XBB.2.3.5 |
| intergenic | N508S XBB.2.3.5 |
| intergenic | A591V BA.5.1.10,BA.5.1.2,FL.14,FL.25,XBB.2.3.5 |
| intergenic | T614I BA.5.1.10,HK.3.2,HY.1,BA.5.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | E775A XBB.2.3.5 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | N1076N XBB.2.3.5 |
| intergenic | D1167D XBB.2.3.5 |
| intergenic | L1175L XBB.2.3.5 |
| intergenic | S1267S XBB.2.3.5 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | D1323D BA.5.1.24,FL.10.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,BA.5.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | E1383E XBB.2.3.5 |
| intergenic | T1542T BA.5.5,BA.4.6,HY.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | P1596L GV.1,EG.5.1.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | T1822I BA.1.18,BA.4.1,FU.1,BQ.1,GY.5,GE.1,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.5 |
| ORF1a | I1892M / NSP3 |
| intergenic | I1892M XBB.2.3.5 |
| intergenic | V1931V BA.5.2.8,XBB.2.3.5 |
| ORF1a | K1988R / NSP3 |
| intergenic | K1988R XBB.2.3.5 |
| ORF1a | L2028Q / NSP3 |
| intergenic | L2028Q XBB.2.3.5 |
| intergenic | G2091S GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | S2132S XBB.2.3.5 |
| intergenic | S2500S GK.2,FL.1.5.1,HR.1,HK.3,XBB.2.3.5 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | Y3098Y HY.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.5 |
| intergenic | Q3127Q BQ.1.2.3,XBB.2.3.5 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| ORF1a | Q3370R / NSP5 |
| intergenic | Q3370R XBB.2.3.5 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | Y3502Y HK.11,XBB.2.3.5 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | L3919I XBB.2.3.5 |
| intergenic | D3926G XBB.2.3.5 |
| intergenic | I4127V XBB.1.41.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | Y4172Y BA.5.1.2,BF.26,HF.1,JG.3,XBB.1.5.15,XBB.2.3.5 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | L4519L XBB.2.3.5 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | V4952V XBB.2.3.5 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.8,HK.3,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | G5618G XBB.2.3.5 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| ORF1b | A5793S / NSP13 |
| intergenic | A5793S XBB.2.3.5 |
| intergenic | A5811A XBB.2.3.5 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | P6065T XBB.2.3.5 |
| intergenic | L6102L BA.4.1,BA.4.6,EG.6.1,FL.20.2,GK.2.1,GK.3.1,HF.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | Y6160Y BF.28,FL.1.5,BA.5.6,FY.4.1.1,GS.4,JD.1.1.2,JG.3,XBB.2.3.5 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | D6440D BF.10,GK.2,HR.1,XBB.1.16.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | F6628F BA.5,BA.5.5,GK.1.1,GJ.1.2,XBB.1.17.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | N87N FU.2,XBB.2.3.5 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,XBB.1.16.17,JF.1,JA.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.2.3.5 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | D253G GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | A262S XBB.2.3.5 |
| intergenic | T302T XBB.1.5.15,XBB.2.3.5 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | N460K XBB.2.3.5 |
| intergenic | ST477NN XBB.2.3.5 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | Q493L EG.5.1.4,FY.3.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.15,XBB.1.17.1,JA.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4,GA.4.1,FY.4.1.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,JG.3,XCH,XBB.2.3.5 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | V225F XBB.2.3.5 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | H125Y BA.5,BA.5.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,EG.5.1,GJ.1.2,JD.1.1,XBB.1.17.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | A13V GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | H40D XBB.2.3.5 |
| intergenic | A55V BA.5.1.10,FL.1.5,FL.20,XBB.2.3.5 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | S21S BF.41,XBB.2.3.5 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,GY.5,GE.1,GJ.1.2,JD.1.2,JF.1,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | G129D XBB.2.3.5 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | G287G FL.10.1,EG.5.1.6,GK.1.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.5 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | g.G29706T FL.1.5,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.5 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5 |
| intergenic | g.-187delA XBB.1.9.2 |
| intergenic | g.C-126T BF.10,XBB.1.9.2 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| ORF1a | D33Y / NSP1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| ORF1a | R77R / NSP1 |
| intergenic | H81R FL.1.5.2,XBB.1.9.2 |
| intergenic | V86I XBB.1.9.2 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | D139N XBB.1.9.2 |
| intergenic | L140L CH.1.1.28,BQ.1.13,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3,HK.6,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37,XBB.1.9.2 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.9.2 |
| intergenic | D144D GK.2,XBB.1.9.2 |
| intergenic | Y241Y XBB.1.16.11,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T265I BQ.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T265T XBB.1.9.2 |
| intergenic | V274L EG.5.1.3,XBB.1.9.2 |
| intergenic | S279S XBB.1.16.17,XBB.1.9.2 |
| ORF1a | M315T / NSP2 |
| ORF1a | C316F / NSP2 |
| intergenic | C316F XBB.1.9.2 |
| ORF1a | D324A / NSP2 |
| intergenic | G334G BA.5.1.10,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T346I GK.1,BA.5.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T350I BA.5.2.3,BA.5.5,GV.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2 |
| intergenic | N389N XBB.1.9.2 |
| intergenic | R398R XBB.1.9.2 |
| intergenic | L450I XBB.1.9.2 |
| intergenic | A478A XBB.1.9.2 |
| ORF1a | N522S / NSP2 |
| intergenic | N522S XBB.1.9.2 |
| ORF1a | E539K / NSP2 |
| intergenic | E539K XBB.1.9.2 |
| intergenic | F548S BA.5,XBB.1.16.11,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T554I FL.1.5.2,HK.8,XBB.1.5.37,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L624F XBB.1.9.2 |
| intergenic | T708I CH.1.1.28,XBB.1.16.23,XBB.1.9.2 |
| intergenic | G728C BA.5.1.10,XBB.1.9.2 |
| ORF1a | L752L / NSP2 |
| intergenic | L752L XBB.1.9.2 |
| intergenic | A773A GJ.1.2,XBB.1.9.2 |
| intergenic | K798K XBB.1.9.2 |
| ORF1a | D828N / NSP3 |
| intergenic | D828N XBB.1.9.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | V879V BA.2.12,BA.1.15,EG.7,GK.1.3,BA.1,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P971L BA.5,BA.5.1.2,BF.26,BF.10,JD.1.1,XBB.1.5.15,XBB.1.9.2 |
| intergenic | V1057F XBB.1.9.2 |
| intergenic | S1106S EG.10.1,GS.4,HF.1,XBB.1.9.2 |
| ORF1a | E1244E / NSP3 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| ORF1a | S1427S / NSP3 |
| intergenic | S1427S XBB.1.9.2 |
| intergenic | T1542I FL.8,XBB.1.5.15,XBB.1.9.2 |
| ORF1a | G1548G / NSP3 |
| intergenic | G1548G XBB.1.9.2 |
| intergenic | F1594F XBB.1.9.2 |
| intergenic | E1630E XBB.1.9.2 |
| intergenic | A1670V XBB.1.9.2 |
| ORF1a | A1712A / NSP3 |
| intergenic | A1712A XBB.1.9.2 |
| intergenic | N1719N XBB.1.9.2 |
| intergenic | Q1759R GS.3,XBB.1.9.2 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P1921Q XBB.1.9.2 |
| intergenic | T1945A XBB.1.9.2 |
| intergenic | K1980R XBB.1.9.2 |
| intergenic | L2044L GJ.1.2,XBB.1.9.2 |
| intergenic | S2048S XBB.1.9.2 |
| ORF1a | A2097S / NSP3 |
| intergenic | L2119F XBB.1.9.2 |
| intergenic | L2122F BQ.1.2.3,GK.1.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | A2128S XBB.1.9.2 |
| intergenic | P2134H GZ.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | A2142A XBB.1.9.2 |
| intergenic | P2260H XBB.1.9.2 |
| intergenic | S2273S XBB.1.16.8,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T2306T BA.5.1.30,BA.5.5,GJ.1.2,XBB.1.9.2 |
| intergenic | Y2435Y XBB.1.9.2 |
| ORF1a | I2490V / NSP3 |
| intergenic | I2490V FU.1,GJ.1.2,XBB.1.9.2 |
| ORF1a | K2497N / NSP3 |
| intergenic | K2497N XBB.1.9.2 |
| ORF1a | N2498N / NSP3 |
| intergenic | N2498N XBB.1.9.2 |
| intergenic | N2523N BA.5.1.2,BA.5.1.30,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L2609F XBB.1.9.2 |
| intergenic | V2629I XBB.1.9.2 |
| ORF1a | F2641V / NSP3 |
| intergenic | F2641V XBB.1.9.2 |
| intergenic | T2777_L2778del XBB.1.9.2 |
| intergenic | V2865V BF.28,XBB.1.16.11,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T2872M DV.7.1,BQ.1.2.3,XBB.1.9.2 |
| intergenic | I2895I EG.5.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T2906I EG.5.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P2929S FL.15.1.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | I3052V BA.2.12,FL.15,XBB.1.9.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| ORF1a | C3059Y / NSP4 |
| intergenic | N3081N BQ.1.1.8,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | I3257I FD.1.1,XBB.1.9.2 |
| ORF1a | T3287T / NSP5 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | V3349I XBB.1.5.70,XBB.1.9.2 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3,JN.3,XBB.1.16.23,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCH,XBB.1.9.2 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.15,HK.3,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | F3397F EG.5.1,FL.20,GS.4,GK.2,GJ.1.2,JD.1.1,XBB.1.9.2 |
| ORF1a | C3419S / NSP5 |
| intergenic | C3419S XBB.1.9.2 |
| intergenic | V3420V BA.2.12,BE.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2 |
| ORF1a | V3496M / NSP5 |
| intergenic | A3497A XBB.1.16.15,XBB.1.9.2 |
| intergenic | Y3502Y HK.11,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | A3523V EG.6.1,JD.1.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | C3563C XBB.1.16.2,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2 |
| ORF1a | P3613A / NSP6 |
| intergenic | P3613A XBB.1.9.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | F3770F BA.5.5,FD.1.1,EG.5.1.6,JF.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | R3802R XBB.1.9.2 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1,HF.1,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | S3920S GS.4.1,HY.1,XBB.1.9.2 |
| ORF1a | A3943A / NSP8 |
| intergenic | A3943A XBB.1.9.2 |
| ORF1a | K4069R / NSP8 |
| intergenic | T4090I GK.1.3,HR.1,XBB.1.9.2 |
| ORF1a | E4143E / NSP9 |
| intergenic | E4143E XBB.1.9.2 |
| intergenic | T4161I BF.26,BA.4.6,BQ.1,JD.1.1,BA.5.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | S4398S XBB.1.16.1,XBB.1.9.2 |
| ORF1b | A4438S / NSP12 |
| intergenic | A4438S XBB.1.9.2 |
| ORF1b | D4545G / NSP12 |
| intergenic | D4545G BA.5.2.20,XBB.1.9.2 |
| ORF1b | W4554C / NSP12 |
| intergenic | W4554C XBB.1.9.2 |
| intergenic | Y4686Y BA.4.1.8,DV.7.1.2,EG.5.1.4,FD.1.1,FL.15,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| ORF1b | S4717S / NSP12 |
| intergenic | K4803K XBB.1.9.2 |
| intergenic | N5003N XBB.1.9.2 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | V5092I EG.7,JD.1.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T5195I BA.5.2.8,GK.3.1,JD.1.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | Y5276Y BF.9,EG.5.1.6,GY.5,JG.3,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L5287L XBB.1.9.2 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P5371P BA.1.17,EG.5.2.1,EG.5.1,EG.5.1.6,FL.15,XBB.1.16.17,XBB.1.9.2 |
| intergenic | N5375N BF.10,XBB.1.9.2 |
| intergenic | A5432A XBB.1.9.2 |
| ORF1b | K5455K / NSP13 |
| intergenic | E5466E XBB.1.9.2 |
| intergenic | N5501N GJ.1.2,XBB.1.9.2 |
| intergenic | Y5522Y XBB.1.9.2 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | Y5548Y XBB.1.9.2 |
| intergenic | C5633C BA.4.1.8,XBB.1.9.2 |
| ORF1b | A5703S / NSP13 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L5762L BA.5.1.10,BA.5.1.30,BA.4.6,GS.4,JN.2,JG.3,XBB.1.9.2 |
| intergenic | K5784R FL.2.3,EG.5.1,GK.2,XBB.1.9.2 |
| ORF1b | K5801K / NSP13 |
| intergenic | K5801K XBB.1.9.2 |
| intergenic | T5805M BA.5,FK.1.1,XCL,XBB.1.9.2 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | I5967V EG.5.1.4,FL.14,FD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.9.2 |
| intergenic | R6023I XBB.1.9.2 |
| intergenic | P6067L XBB.1.9.2 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.9.2 |
| intergenic | D6097D BA.2.12,BA.5.2.20,BA.5.5,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.10.1,BA.5.6,XBB.1.41.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P6128L BA.2.12,HK.6,EG.5.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.9.2 |
| intergenic | A6139A EU.1.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | C6141C BA.5.2.20,GY.5,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | G6157G XBB.1.9.2 |
| intergenic | S6180S BA.1,XBB.1.9.2 |
| ORF1b | H6208N / NSP14 |
| intergenic | H6208N XBB.1.9.2 |
| intergenic | N6333N FL.8,GS.3,GE.1,GS.4.1,XBB.1.5.37,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | H6466Y GJ.1.2,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T6566M BA.5.2.20,EG.5.1,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T6572T GJ.1.2.6,XBB.1.9.2 |
| intergenic | D6584D BA.5.1.30,BQ.1.1.8,XBB.1.17.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| ORF1b | D6897D / NSP16 |
| intergenic | L6981L XBB.1.9.2 |
| ORF1b | A6986T / NSP16 |
| intergenic | A6997A BA.4,BA.5,BA.5.1.1,EG.10.1,FY.3.1,GS.4,XBB.1.9.2 |
| intergenic | G7063S XBB.1.9.2 |
| intergenic | N7084N BA.5.1.30,BE.1.1,HK.8,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2 |
| intergenic | Q14H EG.10.1,FL.15,HK.6,JF.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | D40D XBB.1.5.15,XBB.1.9.2 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.15,FL.20,HK.7,HK.11,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3,XBB.1.9.2 |
| intergenic | G75V BA.2.12,BA.4,BA.5.2.20,FU.2,HF.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HY.1,JD.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2 |
| intergenic | H146H HY.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L216F BA.2.86.1,EG.5.1.3,GK.2.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.9.2 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T286T XBB.1.9.2 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,HK.3,XBB.1.9.2 |
| intergenic | I312I BQ.1,GK.3.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | C336C EG.5.1.3,GV.1,JG.1,JG.3,XBB.1.9.2 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| S | A411T XBB.1.9.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2 |
| intergenic | A475A XBB.1.9.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | E583Q FD.1.1,GK.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | E583D GK.1.1,GE.1,JD.1.1.2,JD.1.1,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T588I XBB.1.16.8,XBB.1.9.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | R646H BE.1.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P715P BA.5.2.20,FL.1.5.2,EG.5.1.6,FY.3.1,GJ.1.2.6,JF.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L752F XBB.1.9.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | K825K XBB.1.9.2 |
| S | K825K XBB.1.9.2 |
| intergenic | D848D XBB.1.9.2 |
| intergenic | A852S XBB.1.9.2 |
| intergenic | D867D BA.4.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | A1016V XBB.1.9.2 |
| S | A1016V XBB.1.9.2 |
| intergenic | H1101H EG.10.1,EG.7,GK.1,GW.5,XBB.1.17.1,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2 |
| intergenic | V1122L BQ.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | K1149K FD.1.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | N1178N BQ.1.1.8,GK.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.9.2 |
| intergenic | D1260E XBB.1.9.2 |
| intergenic | V1264L BA.5.5,EU.1.1,FK.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | M5T BA.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | A23V BA.5.2.3,EU.1.1,FL.14,XBB.1.9.2 |
| intergenic | V29L EG.5.1.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L41L XBB.1.9.2 |
| intergenic | S60F BA.4.6,EG.5.1.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | F105F XBB.1.9.2 |
| intergenic | M125I BA.5.2.34,XBB.1.9.2 |
| intergenic | C148C BA.5.1.10,BA.5,FL.15,JG.1,XBB.1.5.37,XBB.1.9.2 |
| intergenic | Y215C XBB.1.9.2 |
| ORF3a | Y215C XBB.1.9.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P240S BA.4,BQ.1.1.8,GV.1,GS.4.1,EG.5.1.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | D250N XBB.1.9.2 |
| ORF3a | D250N XBB.1.9.2 |
| intergenic | T269M EG.5.1.3,XBB.1.5.15,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T271I XBB.1.9.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | F23F EG.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.9.2 |
| E | N66K XBB.1.9.2 |
| intergenic | A2A XBB.1.9.2 |
| intergenic | K15N XBB.1.9.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | M91L XBB.1.9.2 |
| M | M91L XBB.1.9.2 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L181L BA.5.1.24,GK.1.1,GS.4.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EU.1.1,GE.1,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L56fs XBB.1.9.2 |
| ORF7a | L56fs XBB.1.9.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | F3S XBB.1.9.2 |
| ORF8 | F3S XBB.1.9.2 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2 |
| intergenic | V13L XBB.1.9.2 |
| intergenic | P36P BA.1.14,BA.5.2.34,DV.7.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P38L EG.5.1,GE.1,FY.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | S43F XBB.1.9.2 |
| intergenic | A55V BA.5.1.10,FL.1.5,FL.20,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P70P BF.26,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P85S FD.1.1,FL.25,HK.7,XBB.1.9.2 |
| intergenic | S97G XBB.1.9.2 |
| ORF8 | S97G XBB.1.9.2 |
| intergenic | D113D BA.1.17,XBB.1.9.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P20P BA.5.5,GK.2,JD.1.1,BA.5.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | D22G BA.5.1.1,DV.7.1,HF.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T49I BA.5,BA.5.1.30,BF.10,FD.1.1,HK.8,XBB.1.9.2 |
| intergenic | F53F BE.1.1,EG.5.1,GK.1.1,XBB.1.41.1,BA.5.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2 |
| N | P67H XBB.1.9.2 |
| intergenic | P80Q XBB.1.9.2 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1,BA.5.6,GK.1.1,GJ.1.2,JD.1.1.2,JD.1.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P122H XBB.1.9.2 |
| N | P122H XBB.1.9.2 |
| intergenic | P142S BA.4,BA.5.6,XBB.1.9.2 |
| intergenic | I146I XBB.1.9.2 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1,HK.6,HK.8,EG.5.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | A211T XBB.1.9.2 |
| intergenic | L219F BA.5,DV.7.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | G287G FL.10.1,EG.5.1.6,GK.1.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | G321S HF.1,XBB.1.9.2 |
| N | I351V XBB.1.9.2 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | F7F XBB.1.9.2 |
| intergenic | g.A29684G XBB.1.9.2 |
| intergenic | g.A29695G XBB.1.9.2 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1,GK.3.2,GW.5,HK.6,GS.4.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | g.C-222T BA.4,BA.5,EG.7,BA.2.3,BQ.1,JG.3,HK.3,XCH.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | G7G XCH.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | M85del BA.5.2.34,BA.5.1.24,EG.5.2.1,JN.3,XCL,XCH.1 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34,BF.28,BE.1.1,FL.1.5,FL.2.3,JD.1.1,XBB.1.16.23,HK.3,XCH.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | G137V XCH.1 |
| intergenic | R287G GK.1.3,XCH,XCH.1 |
| intergenic | L454F BA.5.1.24,BA.5.2.20,FL.1.5,EU.1.1,EG.5.1.1,XCH.1 |
| intergenic | L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.6.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70,XCH,XCH.1 |
| intergenic | L580L BA.5.1.24,BA.4.6,FL.15,XCH.1 |
| intergenic | E633A GK.1.3,XCH,XCH.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | E940G HK.6,XCH.1 |
| intergenic | D981Y XCH.1 |
| intergenic | H1067Y XCH.1 |
| intergenic | L1144L GS.4.1,XCH.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | V1629I XCH.1 |
| intergenic | N1922N BA.5,GE.1,EG.5.1.1,JG.3,XBB.1.16.15,XCH.1 |
| intergenic | G2091C XCH.1 |
| intergenic | T2124T XCH.1 |
| intergenic | S2433S BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,JD.1.1,XBB.1.5.70,XCH,XCH.1 |
| intergenic | C2445C BA.4.1.8,BA.5.1.2,BA.5.1.30,XCH.1 |
| intergenic | D2824D GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70,XCH,XCH.1 |
| intergenic | R2985R BF.9,FL.25,XCH.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3,XBB.1.16.11,XCH.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | A3229A XCH.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | F3271F BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,EG.6.1,FY.4.1.1,HK.11,XBB.1.16.8,XCH.1 |
| intergenic | N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2,BF.9,BE.1.1,EG.5.1,FL.20,GK.3.1,GK.1.1,XBB.1.16.15,BA.5.1,XCH.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3,JN.3,XBB.1.16.23,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCH,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | N3494N BA.4.1,CK.2,XCH.1 |
| intergenic | A3648A XCH.1 |
| intergenic | L3667L XCH.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,XCH.1 |
| intergenic | V3875I XCH.1 |
| intergenic | A4068S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70,XCH,XCH.1 |
| intergenic | L4149L BA.5,XBB.1.16.1,XCH.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | K4377N BA.5,XCH.1 |
| intergenic | V4488I FL.20,XCH.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | A5094A XCH.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | E5249E XCH.1 |
| intergenic | E5314E XCH.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | D5531G GK.1.3,XCH,XCH.1 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,HR.1,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,JF.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XCH.1 |
| intergenic | T5675I XBB.1.42.1,XCH.1 |
| intergenic | A5703A GE.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,XCH.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | V5721V BF.26,XCH.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1 |
| intergenic | D5973D XCH.1 |
| intergenic | I6167I XCH.1 |
| intergenic | V6188V BA.1.14,EG.5.1,FK.1.1,XCH.1 |
| intergenic | L6228L EG.5.1.1,XCH.1 |
| intergenic | L6308L BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.1.5,FD.1.1,GK.2.1,HN.1,XCH.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | V6634F XCH.1 |
| intergenic | P6878P HY.1,XCH.1 |
| intergenic | R7014S BA.5.1,XCH.1 |
| intergenic | Q7036H XCH.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.2,XCH.1 |
| intergenic | P25_A27del GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.2,XCH.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,XBB.1.16.17,JF.1,JA.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.2.3.5,XCH.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | S305S XCH.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XCL,XCH,XCH.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,JF.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,XCL,XCH,XCH.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.42.1,XCH.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | T573I EG.5.1,GK.1.3,GK.1.1,XCH,XCH.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | Q677H GK.1,HK.3.2,XCH.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | G700G XCH,XCH.1 |
| intergenic | S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4,GA.4.1,FY.4.1.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,JG.3,XCH,XBB.2.3.5,XCH.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | Q1201K XCH.1 |
| intergenic | C1247F EG.5.1.9,XCH.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | Q185H BA.2.12,BF.28,HF.1,XCH,XCH.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | S68P XCH.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | T77T BA.4.6,EG.5.1,FL.15,FL.20,GK.2,XBB.1.16.1,XCH.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | L129L DV.7.1,EG.5.1.3,XCH,XCH.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | L116L XCH.1 |
| intergenic | T115I XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XCH.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | S37S BA.5.6,XCH.1 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,GY.5,GE.1,GJ.1.2,JD.1.2,JF.1,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.2.3.5,XCH.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1 |
| intergenic | W330L XCH.1 |
| intergenic | I337I BA.5.2.34,BA.5.1,XCH.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | g.G-6A XBB.1.5.72 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G59S XBB.1.5.72 |
| intergenic | P62H XBB.1.5.72 |
| intergenic | G82V XBB.1.5.72 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GE.1,GS.4.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G94S BQ.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72 |
| ORF1a | G150S / NSP1 |
| intergenic | G150S XBB.1.5.72 |
| intergenic | G150G XBB.1.5.72 |
| intergenic | T170T XBB.1.5.72 |
| intergenic | V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5,BF.9,CH.1.1.28,HY.1,FL.1.5.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | N189N BA.5.1.10,BA.5.1.30,EG.5.2.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.5.72 |
| ORF1a | K247K / NSP2 |
| intergenic | P305L BA.5.6,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G445S XBB.1.5.72 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.1,GJ.1.2,HR.1,XBB.1.16.23,XBB.1.42.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | E525E XBB.1.5.72 |
| intergenic | F548L EG.5.1.4,XBB.1.5.72 |
| intergenic | N593N JG.3,XBB.1.5.72 |
| intergenic | I740I BA.2.12,BA.5,CK.2,BA.4.6,FU.2,GK.1,GY.5,XBB.1.16.15,XBB.1.5.72 |
| intergenic | E743D XBB.1.5.72 |
| intergenic | IT841VI BA.5.1.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T842I BA.5.1.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.72 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | P926S XBB.1.5.72 |
| intergenic | V1071I XBB.1.5.72 |
| intergenic | N1123N XBB.1.5.15,XBB.1.5.72 |
| ORF1a | L1131L / NSP3 |
| intergenic | T1168T XBB.1.5.72 |
| intergenic | V1173V GS.4,XBB.1.5.72 |
| intergenic | A1176V DV.7.1.2,XBB.1.5.72 |
| ORF1a | F1190C / NSP3 |
| intergenic | F1190C XBB.1.5.72 |
| ORF1a | E1192_K1194del / NSP3 |
| intergenic | E1192_K1194del XBB.1.5.72 |
| intergenic | K1197N XBB.1.5.72 |
| intergenic | I1203T BA.4.6,GS.4,XBB.1.5.72 |
| intergenic | P1207S XBB.1.5.72 |
| intergenic | P1213S XBB.1.5.72 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G1509S XBB.1.5.72 |
| intergenic | S1510S XBB.1.5.72 |
| intergenic | N1691N BA.5.1.24,CK.2,XBB.1.5.72 |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10,BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BA.5.6,FY.3.1,GE.1,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,XBB.1.5.72 |
| intergenic | V1751V GJ.1.2,XBB.1.5.72 |
| intergenic | N1830S XBB.1.5.72 |
| intergenic | A1938S XBB.1.5.72 |
| intergenic | D2074D GK.2.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G2091G BF.9,XBB.1.5.70,XBB.1.5.72 |
| intergenic | H2092Y BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.2.3,JG.3,XBB.1.16.11,XBB.1.5.72 |
| intergenic | H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.17,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.5.72 |
| intergenic | S2103F BA.2.86.1,BF.9,CK.2,XBB.1.17.1,XBB.1.5.10,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L2113L BA.5.1.24,XBB.1.17.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L2117L HK.3.2,FY.5,XBB.1.5.72 |
| intergenic | S2214S XBB.1.5.72 |
| intergenic | T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15,EG.5.1.4,FL.2.3,FD.1.1,GK.1.3,HK.6,GJ.1.2,XBB.1.5.72 |
| ORF1a | L2329L / NSP3 |
| intergenic | L2329L XBB.1.5.72 |
| ORF1a | L2329L / NSP3 |
| ORF1a | V2356A / NSP3 |
| intergenic | V2356A XBB.1.5.72 |
| intergenic | P2376P BA.5,BA.2.3,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G2443G XBB.1.5.72 |
| ORF1a | F2602F / NSP3 |
| intergenic | F2602F XBB.1.5.72 |
| intergenic | A2614V JF.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | I2806V EG.5.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G2871G BA.5.1.2,GY.5,XBB.1.5.72 |
| intergenic | V2955V EG.5.1.4,XBB.1.5.72 |
| ORF1a | V2996V / NSP4 |
| intergenic | V2996V XBB.1.5.72 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| ORF1a | H3152H / NSP4 |
| intergenic | H3152H XBB.1.5.72 |
| intergenic | N3186N XBB.1.16.11,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L3313L FD.1.1,GK.2,GV.1,HR.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.72 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3,JN.3,XBB.1.16.23,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCH,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L3378L XBB.1.5.72 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D3479D BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1.8,GK.3.1,GE.1,EG.5.1.1,BA.5.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L3602L XBB.1.5.72 |
| intergenic | A3645A BA.5,BA.5.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L3828L BA.5,DV.7.1,BA.5.5,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JN.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | I3927T XBB.1.5.72 |
| intergenic | A3943A XBB.1.9.2,XBB.1.5.72 |
| intergenic | V4073V FL.8,FL.20,XBB.1.5.10,XBB.1.5.72 |
| intergenic | V4101V XBB.1.5.72 |
| intergenic | V4137V FY.5,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T4159I CK.2,FD.1.1,XBB.1.17.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D4166D GK.2.1,JD.1.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | N4367N BQ.1.2.3,XBB.1.5.72 |
| intergenic | S4398S XBB.1.16.1,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G4417G BA.5,XBB.1.5.72 |
| intergenic | A4577A XBB.1.5.72 |
| intergenic | S4621N XBB.1.5.72 |
| intergenic | R4641K EG.5.1.4,XBB.1.16.11,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D4666D JD.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.72 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | F4740F JD.1.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | H4773H XBB.1.5.72 |
| intergenic | A4815V XBB.1.5.72 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | N5105N GK.1.1,HY.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | N5182N BA.5.1.1,GJ.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D5383A XBB.1.5.72 |
| ORF1b | H5569H / NSP13 |
| intergenic | H5569H XBB.1.5.72 |
| intergenic | T5574I BF.28,XBB.1.5.72 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,HR.1,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,JF.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D5668G XBB.1.5.72 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G5818G EG.5.1.3,GK.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | P6076L BA.5.2.3,JF.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L6367L XBB.1.5.72 |
| intergenic | P6368S BA.5.1.24,GK.2,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T6833I BA.4.6,EG.5.1,FL.20,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T6854I BA.4,GK.1.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | V6859I XBB.1.5.72 |
| intergenic | A6997A BA.4,BA.5,BA.5.1.1,EG.10.1,FY.3.1,GS.4,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72 |
| intergenic | V3G BA.4.1.8,BA.4.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV XBB.1.5.72 |
| intergenic | G142_Y145delinsDD XBB.1.5.72 |
| intergenic | L141_Y144del XBB.1.5.72 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | F192F XBB.1.5.72 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | S254F XBB.1.16.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T259I XBB.1.16.17,BA.5.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L296L BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.2.3,GS.4.1,XBB.1.17.1,XCH,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | K356T BA.2.86.1,GA.4.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | Y789Y BQ.1.2.3,HK.11,GV.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D1139D FY.5,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | I1198V XCH,XBB.1.5.72 |
| S | S1242G XBB.1.5.72 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T12I EG.5.1,FL.15,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L15F BA.4.6,XBB.1.5.72 |
| intergenic | S40P BA.4.1.8,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L85F BQ.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | H93Y XBB.1.5.70,XBB.1.5.72 |
| intergenic | Y107Y BF.26,EG.10.1,FL.15,XBB.1.5.72 |
| intergenic | V112V BA.5.2.3,BA.5,BQ.1.1.8,GJ.1.2,HK.3,XBB.1.5.72 |
| intergenic | I167I XBB.1.5.72 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T268M BA.2.3,GY.5,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6,GZ.1,GE.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | P165P BA.5.1.30,XBB.1.5.72 |
| M | P165P BA.5.1.30,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y196Y BQ.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | N203N BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1.3,JG.3,XBB.1.5.72 |
| intergenic | V5V XBB.1.5.15,XBB.1.5.72 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | I26T XBB.1.5.72 |
| ORF6 | I26T XBB.1.5.72 |
| intergenic | D61I EG.5.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | g.C-1T BA.5,BA.5.5,FU.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | Y20Y XBB.1.5.72 |
| intergenic | C35C BA.5.6,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D69D BA.1.14,BA.5.2.8,EG.5.1.6,GY.5,GJ.1.2,XBB.1.5.72 |
| intergenic | V71A XBB.1.5.72 |
| intergenic | Y97Y BF.26,BA.5.5,JD.1.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L116L BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.25,GE.1,XCH,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | A43A EG.5.1.9,HN.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.72 |
| intergenic | X44QextX? GY.5,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L57L XBB.1.5.72 |
| intergenic | V62V BA.5.2.20,BE.1.1,EG.5.1.4,EU.1.1,FL.20,BQ.1,GW.5,EG.5.1.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G66_K68delinsE BA.2.12,BA.4,FY.3.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.72 |
| intergenic | S67F XBB.1.5.72 |
| intergenic | T80I EG.5.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | N89D FL.25,XBB.1.5.72 |
| ORF8 | N89D XBB.1.5.72 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | Q7R XBB.1.5.72 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T24I BA.5.2.34,BF.9,FL.8,EG.5.1.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | Q39K XBB.1.5.72 |
| intergenic | P42P EG.10.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | P67L BA.2.12,BA.5.1.10,BA.5.2.20,XBB.1.5.72 |
| intergenic | N126N BF.9,BA.4.6,JG.3,XBB.1.41.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T135I BA.5.6,FL.15,FY.3.1,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | P142P XBB.1.5.72 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | K257K XBB.1.5.72 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1,BF.26,EG.5.1,BA.5.6,FL.15,HK.7,GE.1,HY.1,XBB.1.16.23,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.72 |
| intergenic | P364Q XBB.1.5.72 |
| intergenic | K372R XBB.1.5.72 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | g.G29711T EG.5.1.8,EG.6.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | g.T-177C XBB.1.16.6 |
| intergenic | g.C-160T BA.5.1.24,BE.1.1,BA.1.15,EG.5.1.3,GY.5,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | g.C-115T XBB.1.16.6 |
| intergenic | g.A-79T XBB.1.16.6 |
| intergenic | g.G-50T XBB.1.16.6 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G52G BF.28,BF.10,XBB.1.16.6 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.10,DV.7.1.2,GK.1,JF.1,XBB.1.17.1,JA.1,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V106V EG.7,XBB.1.16.6 |
| intergenic | S135R BA.2.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | S212L XBB.1.16.6 |
| ORF1a | E237D / NSP2 |
| intergenic | E237D XBB.1.16.6 |
| intergenic | G268R XBB.1.16.6 |
| intergenic | G268G EG.5.1,FL.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V303A XBB.1.16.6 |
| intergenic | P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.6,GK.2.1,GK.1,GE.1,HK.8,XBB.2.3.5,XBB.1.16.6 |
| intergenic | R402R BA.5.2.34,DV.7.1,BF.10,BA.5.6,FL.15,XBB.1.16.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | R426L XBB.1.16.6 |
| intergenic | I431M BA.5.6,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A540V BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.13,GK.2.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | R560C BQ.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L580L BA.5.1.24,BA.4.6,FL.15,XCH.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N593N JG.3,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L628F DV.7.1.2,EG.5.1,HK.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T654T DV.7.1,DV.7.1.2,GS.4.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | E673K XCL,XBB.1.16.6 |
| intergenic | Y717Y BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,FK.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T753I BA.4.1.8,DV.7.1,EG.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N811N BA.5.2.34,EG.5.1.1,XBB.1.42.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P820P XBB.1.16.6 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V886V BA.5.1.24,BF.10,HK.11,XBB.1.16.6 |
| ORF1a | D896D / NSP3 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T951I XBB.1.16.6 |
| intergenic | P971S BA.5.1.10,BA.4.1,BA.5.2.20,XBB.1.16.15,XBB.1.5.10,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V1118V DV.7.1,BF.26,XBB.1.16.6 |
| intergenic | H1141H FY.3.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P1158L BA.1.14,JD.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L1191F XBB.1.16.6 |
| intergenic | E1196G XBB.1.16.6 |
| ORF1a | K1202M / NSP3 |
| intergenic | K1202M XBB.1.16.6 |
| intergenic | P1207L GE.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | F1214L XBB.1.16.6 |
| intergenic | D1273D BA.5,BQ.1.1.8,BA.5.5,FL.10.1,EG.5.1.6,BQ.1,GK.3.1,HY.1,HR.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L1438L BA.1.14,BA.5.2.2,BA.5.1.30,BA.4.6,FL.2.3,FL.25,FU.2,FY.5,JG.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D1481D GE.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | Y1537Y XBB.1.16.6 |
| intergenic | T1543I BF.9,EG.7,FD.1.1,FU.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L1621L BA.5.6,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P1659A XBB.1.16.6 |
| ORF1a | T1788K / NSP3 |
| ORF1a | P1803L / NSP3 |
| intergenic | QY1813LN XBB.1.16.6 |
| intergenic | D1849D BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,HN.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.6 |
| intergenic | S1978T XBB.1.16.6 |
| intergenic | K2067Q XBB.1.16.6 |
| intergenic | P2079S EG.5.1.9,EG.6.1,GV.1,JG.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L2084L XBB.1.16.6 |
| intergenic | L2235L XBB.1.16.6 |
| intergenic | S2242F BA.5.2.34,BA.5.2.8,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,EG.10.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A2249S XBB.1.16.6 |
| intergenic | V2324I XBB.1.16.6 |
| intergenic | Y2331Y XBB.1.16.6 |
| intergenic | N2405K XBB.1.16.6 |
| intergenic | R2432R XBB.1.16.6 |
| intergenic | N2539S FL.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L2675L BA.5.2.3,BA.5,FU.2,GE.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T2684I XBB.1.16.6 |
| ORF1a | K2761M / NSP3 |
| intergenic | K2761M XBB.1.16.6 |
| intergenic | T2800I XBB.1.16.6 |
| intergenic | D2833N XBB.1.16.6 |
| intergenic | N2894N BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.2.20,EG.5.1.9,JF.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | K2928N XBB.1.16.6 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V3048I XBB.1.16.6 |
| intergenic | A3049V GY.5,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | R3066K JG.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T3090S BA.4.6,XBB.1.16.6 |
| intergenic | S3099S HY.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | R3163K BF.10,BA.5.5,GJ.1.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L3352F GA.4.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N3414N BF.28,BE.1.1,BA.5.6,BA.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A3436V XBB.1.16.6 |
| intergenic | A3523A EG.5.1.4,FD.1.1,FL.20.2,FL.20,GY.5,EG.5.1.1,HK.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | K3532K HF.1,JF.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1,BQ.1,GW.5,GK.2,GE.1,HF.1,GS.4.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XCL,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L3641L EG.5.1.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| ORF1a | E3764D / NSP6 |
| intergenic | Y3822Y XBB.1.16.6 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,XCH.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | K3839K BA.4.1,BA.5.2.20,BA.5.5,GE.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | I3853I BA.5.1.10,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BE.1.1,HN.1,JG.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V3855I XBB.1.16.6 |
| intergenic | K3886T XBB.1.16.6 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1,HF.1,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P3952S BA.5.6,GK.1.3,HK.11,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A4044A JF.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N4046N XBB.1.16.6 |
| ORF1a | L4070I / NSP8 |
| intergenic | A4155A FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P4220T XBB.1.16.6 |
| intergenic | A4314S XBB.1.16.6 |
| intergenic | T4368I XBB.1.16.6 |
| intergenic | V4372I BA.5.1.1,JD.1,XBB.1.42.1,XBB.1.16.6 |
| ORF1b | P4413L / NSP12 |
| intergenic | T4418I XBB.1.16.8,XBB.1.5.10,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L4564L XBB.1.16.6 |
| ORF1b | N4607S / NSP12 |
| intergenic | T4640T BA.5.1.1,GS.4,GK.2,HK.6,XBB.1.16.8,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V4864V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | I4886I BA.4.6,GK.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V5001I XBB.1.16.6 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T5198I HK.7,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V5252V XBB.1.16.6 |
| intergenic | C5353C BA.5.1.30,FK.1.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,BA.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N5440S XBB.1.16.6 |
| intergenic | H5488Y BF.26,EG.5.1,BA.5.6,GZ.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | Y5535Y BF.10,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V5550M XBB.1.16.6 |
| intergenic | S5625S JD.1.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | C5633C BA.4.1.8,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | F5697V XBB.1.16.6 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V5894L XBB.1.16.6 |
| intergenic | G5942G FL.1.5.1,XBB.1.5.70,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L5943L EG.5.1.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | Q5947Q BA.1.14,XBB.1.16.6 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V6016V BA.5.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T6056I XBB.1.16.6 |
| intergenic | I6075L XBB.1.16.6 |
| intergenic | R6088C FL.1.5,BQ.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D6104D BA.2.12,BF.26,EG.6.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P6128P EG.5.1,XBB.1.16.6 |
| ORF1b | R6130C / NSP14 |
| intergenic | T6131T BA.2.12,DV.7.1,EG.5.1.8,FK.1.1,FL.20.2,BQ.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D6147Y FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A6199S XBB.1.16.6 |
| intergenic | H6208H BA.5.5,FL.10.1,FL.25,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N6335N BA.5,EU.1.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| ORF1b | L6367L / NSP14 |
| intergenic | L6367L XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| ORF1b | A6413V / NSP14 |
| ORF1b | Q6452Q / NSP14 |
| intergenic | Q6452Q XBB.1.16.6 |
| intergenic | A6506A XBB.1.16.6 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T6566T BA.5.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G6598D HK.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D6671Y XBB.1.16.6 |
| intergenic | I6779T XBB.1.16.6 |
| ORF1b | Q6801R / NSP16 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HN.1,FY.5,FL.1.5.1,JJ.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L54F XBB.1.16.6 |
| intergenic | G75A EG.10.1,EG.5.2.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T108T EU.1.1,XBB.1.5.37,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HY.1,JD.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L176V XBB.1.16.6 |
| S | L176V XBB.1.16.6 |
| intergenic | E180V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | I210T FY.3.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XCL,XCH,XCH.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | Y369Y BQ.1.2.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A475A XBB.1.9.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.42.1,XCH.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P621S BA.2.86.1,GY.5,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N679K FL.10.1,JD.1.1,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | TN678IK FL.10.1,JD.1.1,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | R683R EG.7,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D808D JF.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D936D BA.5.1.2,GK.1.3,GK.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.6 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N969K XBB.1.16.6 |
| intergenic | N969R XBB.1.16.6 |
| intergenic | L996L XBB.1.16.6 |
| intergenic | T1006I XBB.1.16.6 |
| intergenic | A1015A XBB.1.16.6 |
| intergenic | A1070T BA.2.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | I1114V XBB.1.16.6 |
| intergenic | I1114I FL.15,FY.5,XBB.1.16.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| S | L1152L XBB.1.16.6 |
| intergenic | P1162R XBB.1.16.6 |
| S | Q1180H XBB.1.16.6 |
| intergenic | E1202Q BA.4.1.8,BA.5.2.3,BF.28,XBB.1.5.10,XBB.1.16.6 |
| intergenic | 9 FK.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | F8F FK.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V13L GY.5,EG.5.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T14I XBB.1.16.6 |
| intergenic | F43F BA.2.12,BA.5.2.20,FD.1.1,HY.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G49V FL.1.5,BA.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A54V EG.5.1.9,GK.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | R68R EG.7,XBB.1.16.6 |
| intergenic | H78Y BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.20,BF.28,EG.5.1,GK.2.1,FY.5,XBB.1.16.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T89A XBB.1.16.6 |
| intergenic | V90L BA.4.6,XBB.1.16.6 |
| intergenic | H93Y XBB.1.5.70,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P104H XBB.1.16.6 |
| ORF3a | N119D XBB.1.16.6 |
| intergenic | Y154Y BA.5.5,FL.10.1,FU.2,HK.3.2,GJ.1.2,HK.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T221T XBB.1.16.6 |
| ORF3a | T221T XBB.1.16.6 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| ORF3a | H247N XBB.1.16.6 |
| intergenic | M260K BA.4.1.8,EG.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | g.C-17T FL.20,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N41N BF.9,BA.5.5,FL.10.1,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.6 |
| M | R44R XBB.1.16.6 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6,GZ.1,GE.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T77T BA.4.6,EG.5.1,FL.15,FL.20,GK.2,XBB.1.16.1,XCH.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G78S EG.5.1.3,XBB.1.5.37,XBB.1.16.6 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N121N BA.5.1.10,XBB.1.16.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | H125Y BA.5,BA.5.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,EG.5.1,GJ.1.2,JD.1.1,XBB.1.17.1,XBB.2.3.5,XBB.1.16.6 |
| M | E137E XBB.1.16.6 |
| intergenic | R146R XBB.1.16.6 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | S37Y XBB.1.16.6 |
| intergenic | N52N BF.26,EG.5.1.3,HF.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T61I FL.2.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T120I BQ.1.1.8,BF.28,DV.7.1.2,GY.5,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | E3A XBB.1.16.6 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A43V BF.41,GK.1.1,HK.1,HY.1,FL.1.5.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A15V XBB.1.16.8,XBB.1.16.6 |
| ORF8 | A15V XBB.1.16.6 |
| intergenic | Q91H XBB.1.16.6 |
| ORF8 | Q91H XBB.1.16.6 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T49N XBB.1.16.6 |
| intergenic | Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G124D XBB.1.16.6 |
| intergenic | P151P XBB.1.16.6 |
| N | F171F XBB.1.16.6 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L227L EG.5.1.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P279S XBB.1.16.6 |
| intergenic | Q289H XBB.1.16.6 |
| intergenic | L291L XBB.1.16.6 |
| intergenic | D341D BA.4.1.8,BA.5,BE.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6 |
| N | Q389L XBB.1.16.6 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A419A BF.20,EG.5.1.4,GW.5,XBB.1.16.6 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,FU.2,BQ.1,GK.1.1,BA.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | R24C BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4.1,FL.1.5.1,BA.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | R24L BA.1.18,XBB.1.16.6 |
| intergenic | Q29X BA.4,XBB.1.16.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | g.C29675T EG.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,JD.1.2,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | g.C-38T XBB.1.9.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| ORF1a | A76S / NSP1 |
| intergenic | R99C BA.4.1.8,FD.1.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A181T GS.4,GS.4.1,JA.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | K210K BA.4,FL.15,XBB.1.9.1 |
| intergenic | R226K BA.5.2.3,DV.7.1,GE.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | K261E XBB.1.9.1 |
| intergenic | Y304Y BA.5.1.24,FL.1.5.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | H388Y BA.1.14,EG.5.1.9,EU.1.1,FL.15,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1 |
| intergenic | R402C FL.20,XBB.1.9.1 |
| intergenic | E441E BA.1.14,GE.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | G442G XBB.1.9.1 |
| intergenic | L446F BA.5.1.2,GJ.1.2,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A498V BA.5.1.1,GK.3.1,EG.5.1.1,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N704N XBB.1.5.15,XBB.1.9.1 |
| intergenic | E754D XBB.1.9.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A876S GK.3.1,GK.3.2,XBB.1.9.1 |
| intergenic | D877N XBB.1.9.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | G993S FL.1.5,FL.1.5.2,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L1016H XBB.1.9.1 |
| intergenic | A1043A XBB.1.9.1 |
| intergenic | A1074V XBB.1.9.1 |
| intergenic | V1085V BA.5.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | P1330P BF.10,EG.5.1.3,FL.1.5,JG.3,JF.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.9.1 |
| intergenic | Y1337Y BA.5,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BQ.1.2.3,FL.10.1,FL.1.5.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | V1391V FL.15.1.1,FY.5,XBB.1.16.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T1426T BA.5.2.2,DV.7.1,BA.1.15,EG.7,HK.3,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N1436S XBB.1.9.1 |
| intergenic | R1566R XBB.1.9.1 |
| ORF1a | L1650L / NSP3 |
| intergenic | A1812V XBB.1.9.1 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.9.2,XBB.1.9.1 |
| intergenic | C1847C BA.5,BA.5.1.2,XBB.1.9.1 |
| intergenic | Y1873Y BA.5.1.10,BF.9,BF.28,EG.5.1.3,HK.6,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.9.1 |
| intergenic | F1925F BA.5.2.2,BF.28,BE.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,FL.10.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T2007I FL.15.1.1,GK.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L2127L GJ.1.2,XBB.1.9.1 |
| ORF1a | T2137I / NSP3 |
| intergenic | T2137I EG.7,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T2153I BA.5.1.30,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T2183I BA.5.1.2,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L2236V XBB.1.9.1 |
| intergenic | S2246L DV.7.1.2,FL.10.1,JF.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | M2259I DV.7.1.2,BA.4.6,FL.1.5.1,JG.3,XBB.1.9.1 |
| ORF1a | V2276I / NSP3 |
| intergenic | T2300T EG.5.1,FU.2,BA.2.3,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N2523N BA.5.1.2,BA.5.1.30,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A2614V JF.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1 |
| intergenic | D2693D BA.5.1.30,FY.3.1,JD.1.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N2708N BA.5.2.3,EG.5.1.4,GE.1,JG.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T2836T XBB.1.9.1 |
| ORF1a | R2860K / NSP4 |
| intergenic | I2873M BA.5.6,HR.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | H2986H BE.1.1,CH.1.1.28,GZ.1,GJ.1.2,EG.5.1.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T3032I XBB.1.9.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| ORF1a | P3385P / NSP5 |
| intergenic | P3385P XBB.1.9.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A3523V EG.6.1,JD.1.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.9.2,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T3575I BA.5.1.24,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N3609N GE.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A3615V BA.5.1.2,BF.26,BA.5.5,EG.5.1.8,FD.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.9.1 |
| ORF1a | T3646I / NSP6 |
| intergenic | T3646I BA.5.2.2,JD.1.1,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | V3718F XBB.1.9.1 |
| intergenic | T3750I BA.5.2.34,BA.4.1,BQ.1,HK.3.2,JD.1.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.1 |
| intergenic | R3756R GS.4,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L3814L HN.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | I3853I BA.5.1.10,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BE.1.1,HN.1,JG.3,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1,HF.1,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | S3916S XBB.1.9.1 |
| intergenic | N3937N BA.5,EG.5.2.1,EG.5.1,BA.5.6,XBB.1.16.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A3955A XBB.1.9.1 |
| intergenic | E4019E FL.1.5,XBB.1.16.15,XBB.1.9.1 |
| intergenic | R4022R XBB.1.9.1 |
| intergenic | V4137V FY.5,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1 |
| intergenic | W4193C XBB.1.9.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | C4327C XBB.1.9.1 |
| intergenic | A4357V BA.4,BA.5.2.3,EG.5.1,FL.15,XBB.1.9.1 |
| ORF1b | T4443N / NSP12 |
| ORF1b | H4474Y / NSP12 |
| intergenic | H4474Y XBB.1.9.1 |
| intergenic | T4638T BA.5,BA.5.2.8,EG.7,XBB.1.16.11,XBB.1.9.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | I4842I XBB.1.9.1 |
| intergenic | P4853S XBB.1.9.1 |
| intergenic | Y4871Y BA.5.1.1,FY.3.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | V4887V BA.5.1.24,BA.5.6,FL.1.5.1,XBB.1.16.11,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A5031S XBB.1.9.1 |
| ORF1b | M5058I / NSP12 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L5141L XBB.1.9.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| ORF1b | N5266T / NSP12 |
| intergenic | N5266T XBB.1.9.1 |
| intergenic | C5353C BA.5.1.30,FK.1.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | Y5355Y BA.2.12,BA.5.2.20,EG.5.1,FL.1.5.2,FL.15,FU.1,BA.2.3,EG.5.1.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T5449T FY.5,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L5482L XBB.1.9.1 |
| intergenic | H5488Y BF.26,EG.5.1,BA.5.6,GZ.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A5626S XBB.1.9.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T5805T BA.4.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | P5828S BA.5.2.34,BA.5.1.2,XBB.1.16.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | F5835F XBB.1.9.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | V5894L XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | F5958L XBB.1.9.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T6038I BF.9,FL.15,GE.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L6099F FL.25,XBB.1.5.15,XBB.1.9.1 |
| intergenic | P6128L BA.2.12,HK.6,EG.5.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.9.2,XBB.1.9.1 |
| intergenic | V6161V BA.4.6,GJ.1.2.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | F6275F XBB.1.9.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | H6380Y BA.5.1.10,DV.7.1,HK.8,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3,EG.5.1,FL.10.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GK.3.1,GY.5,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1 |
| ORF1b | V6474V / NSP15 |
| intergenic | V6474V XBB.1.9.1 |
| intergenic | I6478I XBB.1.9.1 |
| ORF1b | I6479T / NSP15 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| ORF1b | R6590H / NSP15 |
| intergenic | R6590H BQ.1.1.8,XBB.1.9.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| ORF1b | L6668I / NSP15 |
| intergenic | L6668I XBB.1.9.1 |
| ORF1b | E6680G / NSP15 |
| intergenic | S6713A XBB.1.9.1 |
| intergenic | P6722L BQ.1,JA.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | D6734N XBB.1.9.1 |
| intergenic | L6848L EG.5.1.8,GW.5,FL.1.5.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N6853N BQ.1.13,EG.5.2.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | H6867H XBB.1.9.1 |
| ORF1b | L6883L / NSP16 |
| intergenic | L6883L XBB.1.9.1 |
| intergenic | T6891A XBB.1.9.1 |
| ORF1b | A6919T / NSP16 |
| intergenic | A6919T XBB.1.9.1 |
| ORF1b | PR7013TH / NSP16 |
| intergenic | PR7013TH XBB.1.9.1 |
| intergenic | P7034L BA.4,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | V62V XBB.1.16.8,XBB.1.9.1 |
| intergenic | R78R FK.1.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | D178D XBB.1.9.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | H245H BF.10,XBB.1.9.1 |
| intergenic | G252V XBB.1.9.1 |
| intergenic | PG251SV XBB.1.9.1 |
| intergenic | T323I JD.1,XBB.1.16.8,XBB.1.9.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | K356T BA.2.86.1,GA.4.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | Y369Y BQ.1.2.3,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.42.1,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | E554V XBB.1.9.1 |
| intergenic | K558N XBB.1.9.1 |
| intergenic | D614G HY.1,XBB.1.16.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | QD613HG FK.1.1,HY.1,XBB.1.16.1,XBB.1.42.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | P621S BA.2.86.1,GY.5,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | S659L XBB.1.9.1 |
| S | S659L XBB.1.9.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A701V BA.1.17,BA.4.1,BA.5.5,EG.10.1,FL.1.5,FL.1.5.2,GJ.1.2,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | NR764KH XBB.1.9.1 |
| intergenic | N856N BQ.1.1.8,CH.1.1.28,EG.7,EG.6.1,FL.15,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T883I BF.26,BA.5.5,BQ.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | G932S XBB.1.9.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N960N BA.5,XBB.1.5.70,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1 |
| intergenic | D1041E XBB.1.9.1 |
| S | D1041E XBB.1.9.1 |
| intergenic | Q1113R EG.6.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | Q1201K XCH.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | G1219C BA.5.2.2,FL.10.1,XBB.1.16.15,HK.3,XBB.1.9.1 |
| intergenic | D1259D BA.2.12,HK.3.2,XBB.1.17.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1 |
| intergenic | I20V XBB.1.9.1 |
| intergenic | D27Y BA.4.1.8,BA.5,BQ.1.2.3,XBB.1.16.15,XBB.1.9.1 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1,EG.5.1.6,GK.2,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,XBB.1.16.2,HK.3,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | S74F BA.4,DV.7.1.2,BF.10,FL.1.5,FL.20.2,GJ.1.2,XBB.1.9.1 |
| intergenic | S74S EG.10.1,EG.6.1,EG.5.1.6,GJ.1.2,JG.3,XBB.1.16.15,BA.5.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | H93H BA.5.1,XBB.1.9.1 |
| ORF3a | G174S XBB.1.9.1 |
| intergenic | T175K XCH,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T223I BA.2.12,BA.5.1.30,EG.5.1.3,GY.5,HK.11,HF.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | g.C-17T FL.20,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | S60S XBB.1.9.1 |
| intergenic | V62F BA.5.2.20,CK.2,EG.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.9.1 |
| intergenic | S4P XBB.1.9.1 |
| intergenic | N5N XBB.1.9.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N41N BF.9,BA.5.5,FL.10.1,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3,GK.3.2,GK.1.1,GE.1,HF.1,HY.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.15,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T106T BA.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L129L DV.7.1,EG.5.1.3,XCH,XCH.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N203N BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1.3,JG.3,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| ORF6 | M58T XBB.1.9.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | E22D XBB.1.5.37,XBB.1.9.1 |
| intergenic | P68S XBB.1.9.1 |
| ORF7a | P68S XBB.1.9.1 |
| intergenic | D69D BA.1.14,BA.5.2.8,EG.5.1.6,GY.5,GJ.1.2,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A79A GS.4,HF.1,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | E3X EG.6.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | 19 EG.5.1.4,FK.1.1,GZ.1,HK.7,GY.5,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L18L EG.5.1.4,GZ.1,HK.7,GY.5,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | I10I BA.4.1.8,XBB.1.9.1 |
| intergenic | S24L XBB.1.9.1 |
| intergenic | S43S XBB.1.9.1 |
| intergenic | V62L BF.41,BA.5.5,EG.5.1,EG.6.1,BA.5.6,XBB.1.17.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.9.1 |
| intergenic | V62V BA.5.2.20,BE.1.1,EG.5.1.4,EU.1.1,FL.20,BQ.1,GW.5,EG.5.1.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,FU.2,BQ.1,GK.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1 |
| intergenic | E110Q XBB.1.9.1 |
| intergenic | D119E XBB.1.9.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A35V BA.2.86.1,GS.4.1,JG.3,XBB.1.9.1 |
| intergenic | P42P EG.10.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1 |
| intergenic | G60G EU.1.1,HY.1,JD.1.1.2,XBB.1.5.10,XBB.1.9.1 |
| intergenic | G71G CH.1.1.28,XBB.1.9.1 |
| intergenic | P80S GW.5,HK.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | G114G BA.5.1.2,XBB.1.9.1 |
| intergenic | P151S BA.4,BA.5,BA.4.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | R191R FK.1.1,FL.15.1.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T296I BA.2.12,FL.10.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | K299K BA.5.2.3,XBB.1.9.1 |
| intergenic | P309P BA.4.1,BA.5.2.20,BF.10,BA.4.6,BQ.1,GK.2,GE.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | S310G EU.1.1,XBB.1.9.1 |
| N | S310G XBB.1.9.1 |
| intergenic | F346F BA.5.2.34,EG.5.1,FL.14,FL.25,FU.2,XBB.1.5.15,XBB.1.9.1 |
| intergenic | F363F XBB.1.9.1 |
| N | Q409H XBB.1.9.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | D415D DV.7.1,BF.28,EG.5.1.3,EG.5.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | F7C XBB.1.9.1 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,FU.2,BQ.1,GK.1.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | g.T29691C XBB.1.9.1 |
| intergenic | g.C29708T BA.5.2.20,FL.8,FY.3.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | g.G29711A XBB.1.9.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,JD.1.2,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | g.G29800A XBB.1.9.1 |
| intergenic | g.G29810A XBB.1.9.1 |
| intergenic | g.C-174T BA.4.6,BA.2.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.C-90T XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.C-69A XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.G-62A BA.4.6,BQ.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.C-59T GK.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L16L BA.5.1.2,GE.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D75N BQ.1.1.8,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P80S HK.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | H81_E87delinsQ XBB.2.3.2 |
| intergenic | L104L XBB.2.3.2 |
| intergenic | K125K XBB.2.3.2 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N160S XBB.2.3.2 |
| intergenic | R184C XBB.2.3.2 |
| intergenic | C191C XBB.2.3.2 |
| intergenic | 206 XBB.2.3.2 |
| intergenic | L219L EU.1.1,BQ.1,FL.1.5.1,XBB.1.17.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F221F XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y241Y XBB.1.16.11,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | K261N XBB.2.3.2 |
| ORF1a | L293I / NSP2 |
| intergenic | L293I XBB.2.3.2 |
| intergenic | M315I XBB.2.3.2 |
| intergenic | S318L BA.5.1.1,BQ.1.1.8,EG.5.1.8,HK.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T333M BA.4.1,BF.10,XBB.1.16.8,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3.2 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5,EG.5.1.8,EG.5.1.3,FK.1.1,GE.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V378I BA.4,BA.5.2.8,XBB.2.3.2 |
| intergenic | E444A XBB.2.3.2 |
| ORF1a | A482T / NSP2 |
| intergenic | A482T XBB.2.3.2 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| ORF1a | R560S / NSP2 |
| intergenic | R560S XBB.2.3.2 |
| intergenic | D582D XBB.2.3.2 |
| intergenic | S610L FL.15,JF.1,XBB.2.3.2 |
| ORF1a | W646L / NSP2 |
| intergenic | W646L BA.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I739V XBB.1.41.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P765A XBB.2.3.2 |
| intergenic | K822K XBB.2.3.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A872T XBB.1.16.15,XBB.2.3.2 |
| ORF1a | E913D / NSP3 |
| intergenic | E913D GY.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| ORF1a | G934S / NSP3 |
| intergenic | G934S BA.5.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T965I XBB.2.3.2 |
| intergenic | A967V BA.4,FU.1,GE.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | E976E XBB.2.3.2 |
| intergenic | D992N XBB.2.3.2 |
| ORF1a | I1005I / NSP3 |
| intergenic | I1005I XBB.2.3.2 |
| intergenic | S1027N XBB.2.3.2 |
| ORF1a | N1042S / NSP3 |
| intergenic | N1042S XBB.2.3.2 |
| ORF1a | T1093D / NSP3 |
| intergenic | T1093D XBB.2.3.2 |
| intergenic | A1111A XBB.2.3.2 |
| intergenic | H1113Y BA.2.12,EG.5.2.1,GK.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V1143F HY.1,JD.1.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D1167G XBB.2.3.2 |
| intergenic | L1191L BA.5.2.34,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D1228D XBB.2.3.2 |
| intergenic | V1299V EU.1.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P1321P BA.5.6,BQ.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D1323D BA.5.1.24,FL.10.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,BA.5.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y1337Y BA.5,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BQ.1.2.3,FL.10.1,FL.1.5.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | K1347R XBB.2.3.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | E1363K XBB.2.3.2 |
| ORF1a | K1396T / NSP3 |
| intergenic | K1396T XBB.2.3.2 |
| intergenic | T1542T BA.5.5,BA.4.6,HY.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V1570V XBB.2.3.2 |
| intergenic | T1589I FL.1.5.2,FD.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.41.1,BA.5.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L1627L BA.5.1.30,FU.1,FU.2,GS.3,XBB.1.41.1,XBB.1.5.70,XBB.2.3.2 |
| intergenic | H1636N XBB.2.3.2 |
| intergenic | N1673N BA.5.1.10,BA.4,BE.1.1,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,FD.1.1,JF.1,XBB.1.16.11,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A1677A XBB.2.3.2 |
| ORF1a | V1722I / NSP3 |
| intergenic | V1722I XBB.2.3.2 |
| intergenic | T1754N XBB.2.3.2 |
| intergenic | G1772G XBB.2.3.2 |
| intergenic | P1786S BA.5.2.8,BA.5.2.20,BE.1.1,GK.2.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T1788K XBB.2.3.2 |
| intergenic | T1788M BA.4.6,FL.20.2,GS.4,HK.6,XBB.1.16.1,XBB.2.3.2 |
| ORF1a | V1805V / NSP3 |
| intergenic | V1805V XBB.2.3.2 |
| intergenic | T1881T XBB.2.3.2 |
| intergenic | F1925F BA.5.2.2,BF.28,BE.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,FL.10.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A1997V BQ.1.13,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y2003Y BA.5.2.34,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S2015N FK.1.1,HK.7,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D2060D EG.5.1.8,FL.1.5.1,JF.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L2062F BA.5.1.10,BF.26,FL.2.3,FL.14,GE.1,XBB.1.42.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | E2063G XBB.2.3.2 |
| intergenic | G2091S GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | GH2091SY XBB.2.3.2 |
| intergenic | L2113L XBB.2.3.2 |
| intergenic | T2124I BQ.1.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,FU.2,GS.4,GS.4.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S2132S XBB.2.3.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T2152I BA.1.17,BA.5.5,BQ.1.2.3,XBB.1.5.10,XBB.2.3.2 |
| intergenic | R2159W EG.5.1.4,XBB.2.3.2 |
| intergenic | C2210F XBB.2.3.2 |
| intergenic | N2222N XBB.2.3.2 |
| intergenic | I2230T EG.6.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S2246L DV.7.1.2,FL.10.1,JF.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T2247T FK.1.1,EG.6.1,HF.1.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V2252A XBB.2.3.2 |
| intergenic | T2274I BA.5.1.1,EG.6.1,GK.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.5.70,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I2278T XBB.1.17.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15,EG.5.1.4,FL.2.3,FD.1.1,GK.1.3,HK.6,GJ.1.2,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G2284S XBB.2.3.2 |
| intergenic | I2286T XBB.2.3.2 |
| intergenic | D2299D BA.4,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1,BQ.1,GS.4.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S2352N XBB.2.3.2 |
| intergenic | I2385I BA.4,DV.7.1,FL.10.1,GK.2,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S2396N XBB.2.3.2 |
| intergenic | A2470A BA.5.1.24,FD.1.1,FL.20,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P2483L EG.5.1.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T2676T BA.2.86.1,EG.5.2.1,FL.20,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D2693D BA.5.1.30,FY.3.1,JD.1.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| ORF1a | V2783I / NSP4 |
| intergenic | V2783I XBB.2.3.2 |
| intergenic | S2797F BA.1.17,BF.26,EG.5.1.6,GK.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A2821V XBB.1.5.10,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S2822P FL.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D2824D GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70,XCH,XCH.1,XBB.2.3.2 |
| ORF1a | A2832D / NSP4 |
| intergenic | A2832D XBB.2.3.2 |
| intergenic | F2881L XBB.2.3.2 |
| intergenic | L2882L XBB.2.3.2 |
| intergenic | F2884F BF.28,BA.5.5,FL.8,GY.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P2929P BQ.1.2.3,EG.5.1.4,XBB.2.3.2 |
| ORF1a | P2950H / NSP4 |
| intergenic | P2950H XBB.1.16.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S2972A XBB.2.3.2 |
| intergenic | T2977I XBB.1.17.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | R2985R BF.9,FL.25,XCH.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V2998V BA.5.5,HY.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S3121S XBB.2.3.2 |
| intergenic | M3129I FY.5,XBB.1.5.70,XBB.2.3.2 |
| ORF1a | T3133I / NSP4 |
| intergenic | T3133I XBB.2.3.2 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| ORF1a | Y3214Y / NSP4 |
| intergenic | Y3214Y XBB.2.3.2 |
| intergenic | F3241F HF.1.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T3284I BA.4,BA.5.2.20,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D3297D BF.10,EG.5.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S3344F GJ.1.2.6,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3,JN.3,XBB.1.16.23,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCH,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N3414N BF.28,BE.1.1,BA.5.6,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V3420V BA.2.12,BE.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y3472Y GE.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D3492E XBB.2.3.2 |
| intergenic | A3518A XBB.2.3.2 |
| intergenic | H3581H HK.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1,BQ.1,GW.5,GK.2,GE.1,HF.1,GS.4.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XCL,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A3610V HY.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V3653A XBB.2.3.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A3730A BA.2.12,EG.6.1,GA.4.1,BA.2.3,BQ.1,JD.1.1.1,FL.1.5.1,JG.3,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S3732P XBB.2.3.2 |
| intergenic | G3757S BA.4.1,GS.4,XBB.2.3.2 |
| intergenic | R3802R XBB.1.9.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L3806L XBB.2.3.2 |
| intergenic | Q3826Q XBB.2.3.2 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2 |
| ORF1a | D3836G / NSP6 |
| intergenic | D3836G XBB.2.3.2 |
| intergenic | A3837A XBB.2.3.2 |
| intergenic | L4045L BA.4,BA.4.1,BF.26,FK.1.1,FL.15,HK.3.2,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P4058P BA.4.1,BA.5.1.30,EG.5.1,HF.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BA.4.6,EG.5.1.3,BA.5.6,FU.1,GW.5,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I4098T BA.4,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P4120L GW.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L4149L BA.5,XBB.1.16.1,XCH.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | R4179K XBB.2.3.2 |
| intergenic | P4197S BA.5.2.3,XBB.1.5.15,XCH,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G4287R XBB.2.3.2 |
| intergenic | T4300T BF.26,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V4372I BA.5.1.1,JD.1,XBB.1.42.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G4374S BA.5.2.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A4408E FL.1.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T4412A BA.4.1,EG.7,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D4452D BA.4.1.8,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V4463I XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | R4573C XBB.1.16.11,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L4743L XBB.2.3.2 |
| intergenic | D4769D BA.5.1.24,BA.5.1.2,BF.9,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A4774V GV.1,EG.5.1.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y4871Y BA.5.1.1,FY.3.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T5036T BA.5,BA.5.2.20,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| ORF1b | D5132Y / NSP12 |
| intergenic | D5132Y BA.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D5217G XBB.2.3.2 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| ORF1b | I5229T / NSP12 |
| intergenic | I5229T XBB.2.3.2 |
| intergenic | P5319P GE.1,JN.2,XBB.1.17.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D5437D GJ.1.2,HR.1,JG.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A5476A XBB.2.3.2 |
| intergenic | S5583L BE.1.1,EG.6.1,GE.1,BA.5.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A5662V BA.5.1.24,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D5668D EG.5.1.4,XBB.2.3.2 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| ORF1b | K5718K / NSP13 |
| intergenic | K5718K XBB.2.3.2 |
| intergenic | H5806H BA.5.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V5819V BA.5.2.3,BA.5.1.2,FL.10.1,FU.2,JG.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F5823F BA.4,EU.1.1,FL.25,XBB.1.16.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | R5891R XBB.2.3.2 |
| intergenic | M5900I BF.26,BA.5.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L5905F EG.5.1.4,FD.1.1,EG.5.1.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T5923I EG.7,EU.1.1,XBB.1.16.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P5945P BA.4.6,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T5956I BA.5.2.2,BA.5,FD.1.1,GK.1.1,GV.1,GJ.1.2,XBB.2.3.2 |
| ORF1b | DI5966GV / NSP14 |
| intergenic | DI5966GV XBB.2.3.2 |
| intergenic | I5967V XBB.2.3.2 |
| intergenic | T6000I XBB.2.3.2 |
| intergenic | N6054N XBB.2.3.2 |
| intergenic | V6087V XBB.2.3.2 |
| intergenic | L6102L BA.4.1,BA.4.6,EG.6.1,FL.20.2,GK.2.1,GK.3.1,HF.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2 |
| ORF1b | L6134L / NSP14 |
| intergenic | L6134L XBB.2.3.2 |
| intergenic | S6146S XBB.2.3.2 |
| intergenic | H6153H XBB.2.3.2 |
| intergenic | V6188V BA.1.14,EG.5.1,FK.1.1,XCH.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A6206A XBB.2.3.2 |
| intergenic | G6225D XBB.2.3.2 |
| intergenic | F6251F BF.28,HF.1,XBB.1.16.2,XBB.1.17.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | C6324C XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y6345Y FL.10.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F6351F XBB.2.3.2 |
| intergenic | P6354L XBB.2.3.2 |
| intergenic | P6354P XBB.2.3.2 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3,EG.5.1,FL.10.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GK.3.1,GY.5,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A6623A EG.5.1.4,GK.1.1,HY.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V6637I GA.4.1,XBB.1.17.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | R6709R XBB.2.3.2 |
| intergenic | P6714H XBB.2.3.2 |
| intergenic | S6760S BA.5,GJ.1.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L6825L XBB.2.3.2 |
| intergenic | T6854I BA.4,GK.1.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T6915I XBB.2.3.2 |
| intergenic | L6959L XBB.2.3.2 |
| intergenic | P7034L BA.4,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N7083N BE.1.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F58F BA.5.1.30,BQ.1.13,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I68T FD.1.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S98F BA.5.1.10,FL.1.5,FD.1.1,FL.20,BQ.1,GK.3.1,GK.1.1,JF.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I105V BA.5.1.10,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S116S EG.5.1,EU.1.1,FD.1.1,FL.15.1.1,GE.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F140_Y144del XBB.2.3.2 |
| intergenic | G142D XBB.2.3.2 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV XBB.2.3.2 |
| intergenic | G142fs XBB.2.3.2 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | HK146QN XBB.2.3.2 |
| intergenic | M153I BA.5.2.3,GE.1,GJ.1.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V171V EG.5.1.8,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G181A XBB.2.3.2 |
| intergenic | QG183EV GZ.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A222A XBB.1.17.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | H245Q XBB.2.3.2 |
| intergenic | D253G GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,HK.3,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T315T XBB.2.3.2 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S371F BF.10,XBB.1.5.70,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V407I XBB.2.3.2 |
| S | V407I XBB.2.3.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P412P XBB.2.3.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N450Y XBB.2.3.2 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I472V XBB.2.3.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.42.1,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.15,XBB.1.17.1,JA.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.5.2.3,FY.3.1,BQ.1,EG.5.1.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A575A XBB.2.3.2 |
| intergenic | P579P BA.2.12,GV.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Q607R XBB.2.3.2 |
| intergenic | D614G HY.1,XBB.1.16.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V622F BQ.1.2.3,HK.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V642G EG.5.1.4,FU.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S673T XBB.2.3.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N703K HK.7,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S735L BQ.1.1.8,GW.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L877L BF.26,DV.7.1.2,EU.1.1,BA.2.3,BA.5.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S884F XBB.2.3.2 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,GK.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.5.10,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V952V BA.5.2.20,XBB.1.16.11,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A1020V FD.1.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T1117T XBB.2.3.2 |
| intergenic | E1144Q EG.5.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F1148F EG.5.1.3,EG.7,FL.15,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.23,XCL,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N1178N BQ.1.1.8,GK.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D1259D BA.2.12,HK.3.2,XBB.1.17.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V1264V BA.5.5,FY.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T1273K XBB.2.3.2 |
| S | T1273K XBB.2.3.2 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F43F BA.2.12,BA.5.2.20,FD.1.1,HY.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A54S HK.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S58G JD.1.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L65F DV.7.1,BA.5.2.20,FL.1.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L71L BA.5,BQ.1.13,BA.5.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | K75R XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F79L XBB.2.3.2 |
| intergenic | R134H FU.2,GK.1,HK.3,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N161N FU.2,XBB.2.3.2 |
| ORF3a | N161N XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y189Y BA.4.1,DV.7.1,DV.7.1.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | E194E BA.4.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V197V XBB.2.3.2 |
| intergenic | H204N XBB.2.3.2 |
| ORF3a | H204N XBB.2.3.2 |
| intergenic | Q213Q XBB.2.3.2 |
| intergenic | T223I BA.2.12,BA.5.1.30,EG.5.1.3,GY.5,HK.11,HF.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V228G XBB.2.3.2 |
| ORF3a | V228G XBB.2.3.2 |
| intergenic | P240L BA.5.1.2,EG.5.1.4,EG.5.1,HY.1,JD.1.1.1,JJ.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V256I XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.C-17A XBB.2.3.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V25V BA.5.1.24,BA.5.1.1,EG.5.1.8,XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.TATTAGTTTT-35_-26GATCTGTTC XBB.2.3.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N41N BF.9,BA.5.5,FL.10.1,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6,GZ.1,GE.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T77T BA.4.6,EG.5.1,FL.15,FL.20,GK.2,XBB.1.16.1,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N117N BQ.1.13,BA.5.5,EG.5.1.3,BA.5.6,FL.15,EG.5.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N121N BA.5.1.10,XBB.1.16.15,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V143V BA.5.1.1,EG.5.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P165P BA.5.1.30,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2 |
| M | P165P BA.5.1.30,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D190D HK.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L35I BA.1.17,XBB.2.3.2 |
| ORF6 | L35I BA.1.17,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y49H EG.6.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I3I BA.5.2.20,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A13V GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | C15R XBB.2.3.2 |
| intergenic | E22E XBB.2.3.2 |
| intergenic | T39I BA.5.1.1,EU.1.1,FY.3.1,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N52K XBB.2.3.2 |
| intergenic | G70G EG.5.1.8,HK.3.2,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S83L BA.5.6,JN.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L86L XBB.2.3.2 |
| intergenic | T115I XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XCH.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L14fs CH.1.1.28,BA.5.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G8E XBB.2.3.2 |
| ORF8 | G8E XBB.2.3.2 |
| intergenic | F16F XBB.2.3.2 |
| intergenic | T26I JG.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Q27X GK.2.1,HK.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | W45S XBB.2.3.2 |
| intergenic | A65S BA.5.5,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G96C XBB.2.3.2 |
| intergenic | D119fs XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S37S BA.5.6,XCH.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Q70Q HF.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P117P BA.2.12,GK.1.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,GY.5,GE.1,GJ.1.2,JD.1.2,JF.1,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P142S BA.4,BA.5.6,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D144H XBB.2.3.2 |
| intergenic | G179S GK.1,HN.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S201S XBB.2.3.2 |
| N | S201S XBB.2.3.2 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1,HK.6,HK.8,EG.5.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A211S XBB.1.16.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | R259R XBB.2.3.2 |
| intergenic | V270L DV.7.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D297H XBB.2.3.2 |
| intergenic | T334I BA.5.2.34,HK.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I337I BA.5.2.34,BA.5.1,XCH.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P365S FL.1.5.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P365L BA.5.2.20,FL.1.5,GE.1,GS.4.1,JD.1.2,XBB.1.5.10,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S413L BA.5.5,XBB.1.16.8,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D415D DV.7.1,BF.28,EG.5.1.3,EG.5.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.C-23T BA.5.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A8V FL.10.1,BQ.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,GK.1,GY.5,HN.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P10L BF.26,XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.G29692T BA.5,BQ.1.13,XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.G29706T FL.1.5,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | Y621Y BA.4,FL.1.5,FL.1.5.2,HN.1,FL.1.5.1,XCK |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | G993S FL.1.5,FL.1.5.2,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.9.1,XCK |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | L1643L BA.5.1.2,EG.6.1,GE.1,XCK |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10,BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BA.5.6,FY.3.1,GE.1,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,XBB.1.5.72,XCK |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.9.2,XBB.1.9.1,XCK |
| intergenic | C1847C BA.5,BA.5.1.2,XBB.1.9.1,XCK |
| intergenic | N2111D XCK |
| intergenic | T2800I XBB.1.16.6,XCK |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | P3504T XCK |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1,HF.1,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XCK |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | N4235N BA.4,BA.5,BA.5.1.1,FL.1.5,FL.1.5.2,FL.15,HN.1,JG.1,FL.1.5.1,XCK |
| intergenic | Q4576Q XCK |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | Y4847Y BA.4,FL.10.1,FL.1.5.1,XCK |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | L5167L FL.2.3,EG.5.1,GS.4.1,BA.1,XCK |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | H5944H HK.3,XCK |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | T6566T BA.5.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.6,XCK |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | S6599I HN.1,FL.1.5.1,XCK |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HN.1,FY.5,FL.1.5.1,JJ.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6,XCK |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,XBB.1.16.17,JF.1,JA.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.2.3.5,XCH.1,XCK |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.42.1,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | A701V BA.1.17,BA.4.1,BA.5.5,EG.10.1,FL.1.5,FL.1.5.2,GJ.1.2,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17,XBB.1.9.1,XCK |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | S74F BA.4,DV.7.1.2,BF.10,FL.1.5,FL.20.2,GJ.1.2,XBB.1.9.1,XCK |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK |
| intergenic | V256_V259del XCK |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,HF.1,BA.5.1,XCK |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | V143V BA.5.1.1,EG.5.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1,XCK |
| intergenic | C90X XCK |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | E136D BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BQ.1,JD.1.2,XCK |
| intergenic | Q163R XCK |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK |
| intergenic | T282I XCK |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | g.AT29725A XCK |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | g.G29779T EG.5.1,FL.1.5.1,JJ.1,JD.1.1,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XCK |
| intergenic | g.C-44T BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1,XCL,XBB.2.3.11 |
| intergenic | g.T-42C EU.1.1,GK.3.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V108I BQ.1.2.3,XBB.2.3.11 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L204I EU.1.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | R287S XBB.2.3.11 |
| intergenic | A339A EG.5.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T340I HK.3,XBB.1.16.11,XBB.2.3.11 |
| ORF1a | A405T / NSP2 |
| intergenic | A405T XBB.2.3.11 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.1,GJ.1.2,HR.1,XBB.1.16.23,XBB.1.42.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G493S XBB.1.5.10,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V597I GW.5,XBB.2.3.11 |
| intergenic | F678F XBB.2.3.11 |
| intergenic | T708I CH.1.1.28,XBB.1.16.23,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | R724G XBB.2.3.11 |
| intergenic | A735V XBB.2.3.11 |
| intergenic | E754G XBB.2.3.11 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L864L BA.5.1.24,GE.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D909D XBB.2.3.11 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| ORF1a | E1007K / NSP3 |
| intergenic | E1007K XBB.2.3.11 |
| intergenic | T1017I EG.5.1.1,XBB.2.3.11 |
| ORF1a | V1143D / NSP3 |
| intergenic | V1143D XBB.2.3.11 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D1323D BA.5.1.24,FL.10.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,BA.5.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | Y1337Y BA.5,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BQ.1.2.3,FL.10.1,FL.1.5.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.30,FL.1.5,EG.7,FD.1.1,FL.15,HK.3.2,XBB.1.5.15,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V1584V FL.25,XBB.2.3.11 |
| ORF1a | Y1598Y / NSP3 |
| intergenic | Y1598Y HF.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G1601G XBB.2.3.11 |
| intergenic | P1659L XBB.2.3.11 |
| intergenic | I1714V JD.1.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | M1769I BA.1.15,XBB.2.3.11 |
| intergenic | Y1873Y BA.5.1.10,BF.9,BF.28,EG.5.1.3,HK.6,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T1875T XBB.2.3.11 |
| intergenic | F1907F FU.1,FU.2,FL.1.5.1,HR.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | Y1920H XBB.2.3.11 |
| intergenic | A1983V XBB.2.3.11 |
| intergenic | S2015S BA.2.86.1,BA.2.12,EG.5.1.3,FD.1.1,GK.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G2091S GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L2146F BA.5.2.34,GE.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T2166I XBB.2.3.11 |
| intergenic | F2172F BQ.1.1.8,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,GK.2.1,GW.5,HF.1,EG.5.1.1,XBB.2.3.11 |
| ORF1a | T2197I / NSP3 |
| intergenic | T2197I BA.5.1.2,HF.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | M2254I XBB.2.3.11 |
| intergenic | I2385I BA.4,DV.7.1,FL.10.1,GK.2,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L2518L BA.5.1.30,GJ.1.2.6,GJ.1.2,XBB.1.16.15,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L2570M XBB.2.3.11 |
| intergenic | S2631P XBB.1.16.15,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L2675L BA.5.2.3,BA.5,FU.2,GE.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L2688L XBB.2.3.11 |
| intergenic | I2790T XBB.2.3.11 |
| intergenic | I2806I BA.5.1.24,FY.3.1,HF.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.11,XBB.2.3.11 |
| intergenic | I2812V XBB.2.3.11 |
| intergenic | T2846I XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N2894N BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.2.20,EG.5.1.9,JF.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.11 |
| intergenic | I2895I EG.5.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D2980D DV.7.1.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | M3087T XBB.2.3.11 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V3120V XBB.2.3.11 |
| intergenic | V3166I XBB.2.3.11 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T3224A XBB.2.3.11 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T3284I BA.4,BA.5.2.20,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D3297D BF.10,EG.5.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L3321L BA.5.2.3,BA.4.1,BF.10,XBB.2.3.11 |
| intergenic | S3344F GJ.1.2.6,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3,JN.3,XBB.1.16.23,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCH,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.15,HK.3,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | Y3381Y XBB.2.3.11 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | K3400K XBB.2.3.11 |
| intergenic | D3418D XBB.2.3.11 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L3692L XBB.2.3.11 |
| intergenic | A3730A BA.2.12,EG.6.1,GA.4.1,BA.2.3,BQ.1,JD.1.1.1,FL.1.5.1,JG.3,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V3747I BA.5.2.34,XBB.2.3.11 |
| intergenic | M3934I FK.1.1,XBB.2.3.11 |
| ORF1a | I4108N / NSP8 |
| intergenic | I4108N XBB.2.3.11 |
| intergenic | T4161I BF.26,BA.4.6,BQ.1,JD.1.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N4235N BA.4,BA.5,BA.5.1.1,FL.1.5,FL.1.5.2,FL.15,HN.1,JG.1,FL.1.5.1,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L4252L BQ.1.1.8,FL.8,GJ.1.2,HK.3,XBB.1.5.70,XBB.2.3.11 |
| intergenic | H4301H BA.2.12,GJ.1.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D4428D XBB.1.16.8,XBB.2.3.11 |
| intergenic | F4448F GS.3,XBB.2.3.11 |
| ORF1b | D4455D / NSP12 |
| intergenic | D4455D XBB.2.3.11 |
| ORF1b | I4498L / NSP12 |
| intergenic | I4498L XBB.2.3.11 |
| intergenic | G4571S XBB.2.3.11 |
| intergenic | D4586G DV.7.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D4603D XBB.2.3.11 |
| intergenic | T4640I GE.1,XBB.1.16.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V4712V XBB.2.3.11 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T4785T FL.10.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A4882A XBB.2.3.11 |
| intergenic | V4887V BA.5.1.24,BA.5.6,FL.1.5.1,XBB.1.16.11,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A4973V XBB.2.3.11 |
| intergenic | T4983T FU.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D5130D BA.5.1.24,BA.5.1.2,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | E5311A XBB.2.3.11 |
| intergenic | E5314E XCH.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | Y5355Y BA.2.12,BA.5.2.20,EG.5.1,FL.1.5.2,FL.15,FU.1,BA.2.3,EG.5.1.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N5375N BF.10,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G5378S BA.4,GK.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D5429D XBB.2.3.11 |
| intergenic | T5435I EG.5.1.4,FU.2,GK.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T5449A XBB.2.3.11 |
| intergenic | T5465N XBB.2.3.11 |
| intergenic | D5484D XBB.2.3.11 |
| intergenic | H5488Y BF.26,EG.5.1,BA.5.6,GZ.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G5494G HK.6,FL.1.5.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | K5516K XBB.2.3.11 |
| intergenic | E5643D XBB.2.3.11 |
| intergenic | A5692S XBB.2.3.11 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L5905F EG.5.1.4,FD.1.1,EG.5.1.6,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | R5919S XBB.2.3.11 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | K5972K XBB.2.3.11 |
| intergenic | P6046L XBB.2.3.11 |
| intergenic | D6051D BA.5.2.8,BA.5.1.30,GJ.1.2,JN.2,XBB.1.17.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | H6239H FL.15,GK.2,GV.1,GJ.1.2,FL.1.5.1,XBB.1.17.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L6308L BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.1.5,FD.1.1,GK.2.1,HN.1,XCH.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | P6368S BA.5.1.24,GK.2,XBB.1.5.72,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V6518L XBB.2.3.11 |
| intergenic | N6525N XBB.2.3.11 |
| intergenic | D6539D BQ.1.2.3,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A6623V DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FL.15,GK.1,EG.5.1.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V6638V BA.5.1.2,BA.4.6,FK.1.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | I6704V XBB.2.3.11 |
| intergenic | N6729N GE.1,HK.6,JD.1.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.11 |
| ORF1b | F6731L / NSP15 |
| intergenic | F6731F GE.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D6748D XBB.2.3.11 |
| intergenic | K6768N XBB.2.3.11 |
| intergenic | Y6851Y XBB.2.3.11 |
| intergenic | R6884R XBB.2.3.11 |
| ORF1b | G6890S / NSP16 |
| intergenic | G6890S BA.5.2.3,XBB.2.3.11 |
| intergenic | R7014H BA.5.2.34,GK.2.1,BA.5.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L7042L BA.5.1.24,FD.1.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L24_A27delinsS GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.2,XCH.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L24_Y28delinsSH XBB.2.3.11 |
| intergenic | F59L XBB.2.3.11 |
| intergenic | K77K XBB.2.3.11 |
| intergenic | R78M XBB.2.3.11 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6,GJ.1.2,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,JF.1,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G142_Y145delinsDD GK.3.1,HK.1,HR.1,XBB.1.16.23,XBB.2.3.11 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N148T FL.15,FU.2,HK.7,JD.1.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.17.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.11 |
| intergenic | KQ182RE XBB.2.3.11 |
| intergenic | Q183E XBB.2.3.11 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D253G GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D290D XBB.2.3.11 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V382V DV.7.1,BA.5.2.20,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.42.1,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L513L XBB.2.3.11 |
| intergenic | P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.15,XBB.1.17.1,JA.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | F541F EG.7,BA.5.6,GE.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N542N GJ.1.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | K558N XBB.1.9.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D571D XBB.1.16.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | E583D GK.1.1,GE.1,JD.1.1.2,JD.1.1,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | F643V XBB.2.3.11 |
| S | F643V XBB.2.3.11 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N709N FL.15.1.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | I844V XBB.2.3.11 |
| intergenic | A942S XBB.2.3.11 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | E988E BA.5.1.30,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A1070V EG.5.1.8,HK.3,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G1085A BA.5.2.20,FL.1.5.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G1171G XBB.2.3.11 |
| intergenic | Q1208H XBB.1.16.8,XBB.2.3.11 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | Q17P XBB.2.3.11 |
| intergenic | F43F BA.2.12,BA.5.2.20,FD.1.1,HY.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V112V BA.5.2.3,BA.5,BQ.1.1.8,GJ.1.2,HK.3,XBB.1.5.72,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T176T XBB.2.3.11 |
| intergenic | L219F XBB.2.3.11 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V256F XBB.1.5.37,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | R69R XBB.2.3.11 |
| E | R69R XBB.2.3.11 |
| intergenic | g.T-29G XBB.2.3.11 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L29F BA.5.2.20,GW.5,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3,GK.3.2,GK.1.1,GE.1,HF.1,HY.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.15,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L102L BA.5,EG.5.1,XBB.1.16.2,XBB.1.17.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A104V BA.2.86.1,BE.1.1,BQ.1,GS.4,GS.4.1,BA.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D163D XBB.2.3.11 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.70,XCL,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T10N XBB.2.3.11 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | g.C-1T BA.5,BA.5.5,FU.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A13V GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | K32K XBB.2.3.11 |
| intergenic | V71I XBB.2.3.11 |
| intergenic | L4L XBB.2.3.11 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A51A XBB.2.3.11 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,FU.2,BQ.1,GK.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L98L XBB.2.3.11 |
| intergenic | I121I BA.5.1.30,XBB.2.3.11 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T24I BA.5.2.34,BF.9,FL.8,EG.5.1.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.11 |
| intergenic | E31_S33del JF.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G30_S33delinsA GS.4,GS.4.1,JF.1,XBB.1.17.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T49I BA.5,BA.5.1.30,BF.10,FD.1.1,HK.8,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A50A BF.26,BA.2.3,GK.2.1,GS.4.1,JA.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L121L XBB.2.3.11 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,GY.5,GE.1,GJ.1.2,JD.1.2,JF.1,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1,FL.15,BA.2.3,GK.1.1,HK.11,BA.1,JN.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | P142S BA.4,BA.5.6,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | I157I BA.4,BA.5.2.34,EG.5.2.1,EG.5.1,GE.1,XBB.1.17.1,XBB.1.42.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G200D XBB.1.16.11,XBB.2.3.11 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T282T BA.1.17,FL.20.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D288D GY.5,XBB.2.3.11 |
| intergenic | P302P BA.5.2.34,BA.4.1,CH.1.1.28,FL.15,GE.1,HK.6,FL.1.5.1,JN.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | Y333Y BA.4,BF.26,BA.4.6,BA.5.6,JD.1.1.1,BA.5.1,XCH,XBB.2.3.11 |
| intergenic | F346F BA.5.2.34,EG.5.1,FL.14,FL.25,FU.2,XBB.1.5.15,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A376A BA.5.2.8,XBB.2.3.11 |
| intergenic | Q386Q XBB.2.3.11 |
| intergenic | K405K XBB.2.3.11 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N34N XBB.2.3.11 |
| intergenic | g.G29706T FL.1.5,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | g.C-174T BA.4.6,BA.2.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.G-99T XBB.2.3 |
| intergenic | g.G-92T EG.7,HN.1,JF.1,XBB.1.42.1,XBB.2.3 |
| intergenic | g.G-62A BA.4.6,BQ.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.C-59T GK.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.C-44T BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1,XCL,XBB.2.3.11 |
| intergenic | g.T-42C EU.1.1,GK.3.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | L16L BA.5.1.2,GE.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L27F EG.7,HK.8,XBB.2.3 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | L64L XBB.2.3 |
| intergenic | D75N BQ.1.1.8,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P80S HK.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V108I BQ.1.2.3,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V121I EG.5.1.4,XBB.2.3 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3 |
| intergenic | N160N BA.4.6,FK.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3 |
| intergenic | R184C XBB.2.3.2,XBB.2.3 |
| intergenic | L204I EU.1.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A206V XBB.2.3 |
| intergenic | L219L EU.1.1,BQ.1,FL.1.5.1,XBB.1.17.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y241Y XBB.1.16.11,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A307V BA.2.3,XBB.2.3 |
| intergenic | S318L BA.5.1.1,BQ.1.1.8,EG.5.1.8,HK.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | H325R XBB.2.3 |
| intergenic | T333M BA.4.1,BF.10,XBB.1.16.8,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A339A EG.5.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T340I HK.3,XBB.1.16.11,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5,EG.5.1.8,EG.5.1.3,FK.1.1,GE.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F343S XBB.2.3 |
| intergenic | G345D XBB.2.3 |
| intergenic | T346T XBB.2.3 |
| intergenic | P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.6,GK.2.1,GK.1,GE.1,HK.8,XBB.2.3.5,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V378I BA.4,BA.5.2.8,XBB.2.3.2 |
| intergenic | R398C BF.28,EG.5.1.4,XBB.1.42.1,XBB.2.3 |
| intergenic | N449D XBB.2.3 |
| intergenic | I453T HR.1,XBB.1.16.23,XBB.2.3 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.1,GJ.1.2,HR.1,XBB.1.16.23,XBB.1.42.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.11 |
| intergenic | I476T XBB.2.3 |
| intergenic | G493S XBB.1.5.10,XBB.2.3.11 |
| ORF1a | I502L / NSP2 |
| intergenic | I502L XBB.2.3 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | V543A XBB.2.3 |
| intergenic | A591V BA.5.1.10,BA.5.1.2,FL.14,FL.25,XBB.2.3.5 |
| intergenic | V597I GW.5,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V606V BA.5,BA.5.1.1,EG.5.1.8,XBB.1.5.10,XBB.2.3 |
| intergenic | S610L FL.15,JF.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T614I BA.5.1.10,HK.3.2,HY.1,BA.5.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3 |
| intergenic | E637K FL.15.1.1,FL.15,XBB.2.3 |
| ORF1a | E637G / NSP2 |
| intergenic | E637G XBB.2.3 |
| ORF1a | W646L / NSP2 |
| intergenic | W646L BA.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I652T XBB.2.3 |
| intergenic | V660I JD.1.1,XBB.2.3 |
| intergenic | I671S XBB.2.3 |
| intergenic | T708I CH.1.1.28,XBB.1.16.23,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | I739V XBB.1.41.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A776V XBB.1.17.1,XBB.2.3 |
| intergenic | Y799Y FL.8,FL.20,XBB.2.3 |
| intergenic | P804S XBB.2.3 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | L864L BA.5.1.24,GE.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A872T XBB.1.16.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A872V BA.2.3,XBB.2.3 |
| intergenic | E913D GY.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| ORF1a | G934S / NSP3 |
| intergenic | G934S BA.5.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A967V BA.4,FU.1,GE.1,XBB.2.3.2 |
| ORF1a | D981A / NSP3 |
| intergenic | D981A XBB.2.3 |
| intergenic | Q991H XBB.2.3 |
| intergenic | Q998H BA.1.14,XBB.2.3 |
| intergenic | T1017I EG.5.1.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D1088D BA.4,XBB.2.3 |
| intergenic | D1089D XBB.2.3 |
| intergenic | H1113N XBB.2.3 |
| intergenic | H1113Y BA.2.12,EG.5.2.1,GK.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V1143F HY.1,JD.1.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L1191L BA.5.2.34,XBB.2.3.2 |
| intergenic | E1209D XBB.2.3 |
| intergenic | P1213L BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,FL.10.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3 |
| intergenic | D1229G XBB.2.3 |
| intergenic | T1241I XBB.2.3 |
| intergenic | V1299V EU.1.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | A1314S XBB.2.3 |
| intergenic | P1321P BA.5.6,BQ.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D1323D BA.5.1.24,FL.10.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,BA.5.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | Q1332Q XBB.2.3 |
| intergenic | Y1337Y BA.5,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BQ.1.2.3,FL.10.1,FL.1.5.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | K1428K BA.5.2.34,XBB.1.5.10,XBB.2.3 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.30,FL.1.5,EG.7,FD.1.1,FL.15,HK.3.2,XBB.1.5.15,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L1441L BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1,FK.1.1,GK.1,GK.2,GE.1,XBB.1.41.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3 |
| intergenic | P1497L XBB.1.16.2,XBB.1.16.1,XBB.2.3 |
| intergenic | L1523L BA.5.2.34,GS.3,GE.1,JD.1.1,XBB.2.3 |
| intergenic | T1542T BA.5.5,BA.4.6,HY.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L1546L XBB.2.3 |
| intergenic | V1584V FL.25,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T1589I FL.1.5.2,FD.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.41.1,BA.5.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P1596L GV.1,EG.5.1.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | Y1598Y HF.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L1599L XBB.2.3 |
| intergenic | L1627L BA.5.1.30,FU.1,FU.2,GS.3,XBB.1.41.1,XBB.1.5.70,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L1643L BA.5.1.2,EG.6.1,GE.1,XCK,XBB.2.3 |
| intergenic | N1673N BA.5.1.10,BA.4,BE.1.1,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,FD.1.1,JF.1,XBB.1.16.11,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I1714V JD.1.1,XBB.2.3.11 |
| ORF1a | E1724E / NSP3 |
| intergenic | E1724E BA.5.6,FL.1.5.1,XBB.2.3 |
| intergenic | M1769I BA.1.15,XBB.2.3.11 |
| intergenic | I1785V XBB.2.3 |
| intergenic | P1786S BA.5.2.8,BA.5.2.20,BE.1.1,GK.2.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P1786L BA.5,GY.5,GE.1,XBB.2.3 |
| intergenic | T1788M BA.4.6,FL.20.2,GS.4,HK.6,XBB.1.16.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.9.2,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3 |
| intergenic | T1822I BA.1.18,BA.4.1,FU.1,BQ.1,GY.5,GE.1,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.5 |
| intergenic | Y1873Y BA.5.1.10,BF.9,BF.28,EG.5.1.3,HK.6,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | F1907F FU.1,FU.2,FL.1.5.1,HR.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D1913D DV.7.1.2,XBB.2.3 |
| intergenic | F1925F BA.5.2.2,BF.28,BE.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,FL.10.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V1931V BA.5.2.8,XBB.2.3.5 |
| intergenic | K1956E XBB.2.3 |
| intergenic | F1960F FU.2,HK.7,XBB.1.16.1,XBB.2.3 |
| intergenic | A1997V BQ.1.13,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y2003Y BA.5.2.34,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N2006N XBB.2.3 |
| intergenic | S2015N FK.1.1,HK.7,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S2015S BA.2.86.1,BA.2.12,EG.5.1.3,FD.1.1,GK.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | S2022L EG.5.1.8,XBB.2.3 |
| intergenic | A2040V XBB.2.3 |
| intergenic | D2043D BA.5.2.34,XBB.2.3 |
| intergenic | Q2058R XBB.2.3 |
| intergenic | D2060D EG.5.1.8,FL.1.5.1,JF.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L2062F BA.5.1.10,BF.26,FL.2.3,FL.14,GE.1,XBB.1.42.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T2087I CH.1.1.28,EG.5.2.1,JG.3,JN.3,XBB.1.16.1,XBB.2.3 |
| intergenic | G2091S GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | S2103F BA.2.86.1,BF.9,CK.2,XBB.1.17.1,XBB.1.5.10,XBB.1.5.72,XBB.2.3 |
| ORF1a | E2112E / NSP3 |
| intergenic | E2112E XBB.2.3 |
| intergenic | T2124I BQ.1.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,FU.2,GS.4,GS.4.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N2131N XBB.2.3 |
| intergenic | S2132S XBB.2.3.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L2146F BA.5.2.34,GE.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N2147S XBB.2.3 |
| intergenic | T2152I BA.1.17,BA.5.5,BQ.1.2.3,XBB.1.5.10,XBB.2.3.2 |
| intergenic | R2159W EG.5.1.4,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F2172F BQ.1.1.8,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,GK.2.1,GW.5,HF.1,EG.5.1.1,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| ORF1a | T2197I / NSP3 |
| intergenic | T2197I BA.5.1.2,HF.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | I2230T EG.6.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L2235L FL.15,XBB.2.3 |
| intergenic | S2246L DV.7.1.2,FL.10.1,JF.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T2247T FK.1.1,EG.6.1,HF.1.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y2262Y EG.10.1,XBB.2.3 |
| intergenic | T2274I BA.5.1.1,EG.6.1,GK.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.5.70,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I2278T XBB.1.17.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15,EG.5.1.4,FL.2.3,FD.1.1,GK.1.3,HK.6,GJ.1.2,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XBB.2.3 |
| intergenic | I2286T XBB.2.3.2,XBB.2.3 |
| intergenic | D2299D BA.4,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1,BQ.1,GS.4.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I2346I BQ.1.2.3,XBB.2.3 |
| intergenic | V2356A XBB.1.5.72,XBB.2.3 |
| intergenic | P2376P BA.5,BA.2.3,XBB.1.5.72,XBB.2.3 |
| intergenic | I2385I BA.4,DV.7.1,FL.10.1,GK.2,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A2470A BA.5.1.24,FD.1.1,FL.20,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P2483L EG.5.1.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S2500F BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.6,FL.20.2,BA.5.1,XBB.2.3 |
| intergenic | S2500S GK.2,FL.1.5.1,HR.1,HK.3,XBB.2.3.5 |
| intergenic | L2518L BA.5.1.30,GJ.1.2.6,GJ.1.2,XBB.1.16.15,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N2526T XBB.2.3 |
| ORF1a | K2546K / NSP3 |
| intergenic | K2546K XBB.2.3 |
| intergenic | A2614V JF.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3 |
| intergenic | S2631P XBB.1.16.15,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L2675L BA.5.2.3,BA.5,FU.2,GE.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T2676T BA.2.86.1,EG.5.2.1,FL.20,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D2693D BA.5.1.30,FY.3.1,JD.1.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | H2707H XBB.2.3 |
| intergenic | S2797F BA.1.17,BF.26,EG.5.1.6,GK.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I2806I BA.5.1.24,FY.3.1,HF.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.11,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A2821V XBB.1.5.10,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S2822P FL.15,XBB.2.3.2 |
| ORF1a | T2823T / NSP4 |
| intergenic | T2823T EG.5.1.8,XBB.2.3 |
| intergenic | D2824D GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70,XCH,XCH.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N2829N BQ.1.1.8,XBB.1.16.1,XBB.2.3 |
| intergenic | T2846I XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V2866V XBB.2.3 |
| intergenic | L2869F BA.5.2.8,GK.3.1,XBB.2.3 |
| intergenic | F2884F BF.28,BA.5.5,FL.8,GY.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N2894N BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.2.20,EG.5.1.9,JF.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.11 |
| intergenic | I2895I EG.5.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | P2929P BQ.1.2.3,EG.5.1.4,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P2950H XBB.1.16.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T2977I XBB.1.17.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D2980D DV.7.1.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | S2981S EG.10.1,FL.15.1.1,GY.5,EG.5.1.1,XBB.2.3 |
| intergenic | R2985R BF.9,FL.25,XCH.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V2998V BA.5.5,HY.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N3007N EG.5.1.4,EG.5.1,GV.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3 |
| ORF1a | A3023V / NSP4 |
| intergenic | A3023V XBB.2.3 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | Y3098Y HY.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.5 |
| intergenic | Q3127Q BQ.1.2.3,XBB.2.3.5 |
| intergenic | M3129I FY.5,XBB.1.5.70,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | F3241F HF.1.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | T3284I BA.4,BA.5.2.20,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T3288T EG.5.1.1,XBB.2.3 |
| intergenic | D3297D BF.10,EG.5.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | L3321L BA.5.2.3,BA.4.1,BF.10,XBB.2.3.11 |
| intergenic | S3344F GJ.1.2.6,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3,JN.3,XBB.1.16.23,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCH,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.15,HK.3,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A3392V EG.5.1.4,XBB.2.3 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | N3414N BF.28,BE.1.1,BA.5.6,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V3420V BA.2.12,BE.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y3472Y GE.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D3479D BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1.8,GK.3.1,GE.1,EG.5.1.1,BA.5.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3 |
| intergenic | Y3502Y HK.11,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P3504L BA.5,GK.3.1,HY.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3 |
| intergenic | H3581H HK.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1,BQ.1,GW.5,GK.2,GE.1,HF.1,GS.4.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XCL,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A3610V HY.1,XBB.2.3.2 |
| ORF1a | L3641V / NSP6 |
| intergenic | L3641V XBB.2.3 |
| ORF1a | A3645T / NSP6 |
| intergenic | A3645T XBB.2.3 |
| ORF1a | A3648T / NSP6 |
| intergenic | A3648T XBB.2.3 |
| intergenic | M3661V XBB.2.3 |
| intergenic | M3669I XBB.2.3 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | A3730A BA.2.12,EG.6.1,GA.4.1,BA.2.3,BQ.1,JD.1.1.1,FL.1.5.1,JG.3,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V3747I BA.5.2.34,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G3757S BA.4.1,GS.4,XBB.2.3.2 |
| ORF1a | G3757V / NSP6 |
| intergenic | G3757V XBB.2.3 |
| intergenic | F3769F BA.5.1.30,BF.26,FD.1.1,BA.5.6,BQ.1,GK.3.1,GW.5,GJ.1.2,EG.5.1.1,XBB.1.16.1,XBB.2.3 |
| ORF1a | C3798C / NSP6 |
| intergenic | C3798C XBB.2.3 |
| intergenic | R3802R XBB.1.9.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XBB.2.3 |
| intergenic | V3892V XBB.1.5.70,XBB.2.3 |
| intergenic | L3894L XBB.2.3 |
| intergenic | H3895H XBB.1.16.2,XBB.2.3 |
| intergenic | M3934I FK.1.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A4016V BF.10,EG.5.1,HN.1,XBB.2.3 |
| intergenic | L4045L BA.4,BA.4.1,BF.26,FK.1.1,FL.15,HK.3.2,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P4058P BA.4.1,BA.5.1.30,EG.5.1,HF.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2 |
| ORF1a | L4064F / NSP8 |
| intergenic | L4064F BA.5.2.34,XBB.2.3 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BA.4.6,EG.5.1.3,BA.5.6,FU.1,GW.5,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I4098T BA.4,XBB.2.3.2 |
| intergenic | M4116R XBB.2.3 |
| intergenic | P4120L GW.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I4127V XBB.1.41.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | L4149L BA.5,XBB.1.16.1,XCH.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T4161I BF.26,BA.4.6,BQ.1,JD.1.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | Y4172Y BA.5.1.2,BF.26,HF.1,JG.3,XBB.1.5.15,XBB.2.3.5 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3 |
| intergenic | G4178C XBB.2.3 |
| intergenic | P4197S BA.5.2.3,XBB.1.5.15,XCH,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | N4235N BA.4,BA.5,BA.5.1.1,FL.1.5,FL.1.5.2,FL.15,HN.1,JG.1,FL.1.5.1,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | M4241V XBB.2.3 |
| intergenic | T4249I BQ.1.13,BA.5.5,FL.15,FY.5,XBB.1.16.15,XBB.1.17.1,XBB.2.3 |
| intergenic | L4252L BQ.1.1.8,FL.8,GJ.1.2,HK.3,XBB.1.5.70,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T4265I EG.5.1.6,JD.1.1,XBB.2.3 |
| intergenic | P4290S XBB.2.3 |
| intergenic | T4300T BF.26,XBB.2.3.2 |
| intergenic | H4301H BA.2.12,GJ.1.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | I4308V XBB.2.3 |
| intergenic | A4314S XBB.1.16.6,XBB.2.3 |
| intergenic | G4341G FL.1.5.2,XBB.2.3 |
| intergenic | V4372I BA.5.1.1,JD.1,XBB.1.42.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G4374S BA.5.2.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S4398L BA.1.17,BA.5.1.30,BF.26,FL.2.3,EU.1.1,XBB.1.16.8,XBB.1.5.15,XBB.2.3 |
| intergenic | A4408E FL.1.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T4412A BA.4.1,EG.7,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G4417G BA.5,XBB.1.5.72,XBB.2.3 |
| intergenic | Y4424Y FL.1.5,FL.14,FL.15.1.1,GE.1,XBB.1.16.17,XBB.2.3 |
| intergenic | D4428D XBB.1.16.8,XBB.2.3.11 |
| intergenic | F4448F GS.3,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D4452D BA.4.1.8,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V4463I XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | R4573C XBB.1.16.11,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D4586G DV.7.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | P4635P XBB.2.3 |
| intergenic | T4640I GE.1,XBB.1.16.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | Y4665Y XBB.2.3 |
| intergenic | Y4681H XBB.2.3 |
| intergenic | Y4686Y BA.4.1.8,DV.7.1.2,EG.5.1.4,FD.1.1,FL.15,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | D4769D BA.5.1.24,BA.5.1.2,BF.9,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A4774V GV.1,EG.5.1.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T4785T FL.10.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | Y4847Y BA.4,FL.10.1,FL.1.5.1,XCK,XBB.2.3 |
| intergenic | Y4871Y BA.5.1.1,FY.3.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V4887V BA.5.1.24,BA.5.6,FL.1.5.1,XBB.1.16.11,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A4921A XBB.2.3 |
| intergenic | Y4922Y HY.1,XBB.2.3 |
| intergenic | R4947R EG.5.1,XBB.2.3 |
| intergenic | T4983T FU.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | 4993 XBB.2.3 |
| intergenic | T5036T BA.5,BA.5.2.20,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | D5130D BA.5.1.24,BA.5.1.2,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.2.3.11 |
| ORF1b | D5132Y / NSP12 |
| intergenic | D5132Y BA.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | T5195I BA.5.2.8,GK.3.1,JD.1.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | E5314E XCH.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | P5319P GE.1,JN.2,XBB.1.17.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y5355Y BA.2.12,BA.5.2.20,EG.5.1,FL.1.5.2,FL.15,FU.1,BA.2.3,EG.5.1.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | H5363H XBB.2.3 |
| intergenic | N5375N BF.10,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G5378S BA.4,GK.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T5435I EG.5.1.4,FU.2,GK.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D5437D GJ.1.2,HR.1,JG.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | H5488Y BF.26,EG.5.1,BA.5.6,GZ.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | G5494G HK.6,FL.1.5.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.8,HK.3,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3 |
| intergenic | L5551L FD.1.1,JD.1.1.1,XBB.2.3 |
| intergenic | L5580L EG.5.1.4,GE.1,HK.1,XBB.2.3 |
| intergenic | S5583L BE.1.1,EG.6.1,GE.1,BA.5.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | E5585D FL.14,XBB.2.3 |
| intergenic | A5662V BA.5.1.24,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D5668D EG.5.1.4,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A5703A GE.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,XCH.1,XBB.2.3 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | R5716F XBB.2.3 |
| intergenic | L5729L XBB.2.3 |
| intergenic | H5806H BA.5.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V5808A BA.5.1,XBB.2.3 |
| intergenic | V5819V BA.5.2.3,BA.5.1.2,FL.10.1,FU.2,JG.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F5823F BA.4,EU.1.1,FL.25,XBB.1.16.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G5862G EG.5.1,EG.5.1.1,XBB.2.3 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | M5900I BF.26,BA.5.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L5905F EG.5.1.4,FD.1.1,EG.5.1.6,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T5923I EG.7,EU.1.1,XBB.1.16.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P5945P BA.4.6,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T5956I BA.5.2.2,BA.5,FD.1.1,GK.1.1,GV.1,GJ.1.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | C6019C XBB.2.3 |
| intergenic | T6028T BA.5.2.2,BE.1.1,EG.5.1.3,XBB.1.5.37,XBB.2.3 |
| intergenic | D6051D BA.5.2.8,BA.5.1.30,GJ.1.2,JN.2,XBB.1.17.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L6082I XBB.2.3 |
| intergenic | L6102F GJ.1.2,XBB.1.5.37,XBB.2.3 |
| intergenic | L6102L BA.4.1,BA.4.6,EG.6.1,FL.20.2,GK.2.1,GK.3.1,HF.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y6122Y BQ.1.1.8,XBB.2.3 |
| intergenic | V6124V XBB.2.3 |
| intergenic | Y6160Y BF.28,FL.1.5,BA.5.6,FY.4.1.1,GS.4,JD.1.1.2,JG.3,XBB.2.3.5 |
| ORF1b | N6163N / NSP14 |
| intergenic | N6163N XBB.2.3 |
| intergenic | T6175I BQ.1.1.8,BA.4.6,GE.1,FL.1.5.1,XBB.1.42.1,XBB.2.3 |
| intergenic | V6188V BA.1.14,EG.5.1,FK.1.1,XCH.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A6206A XBB.2.3.2,XBB.2.3 |
| intergenic | H6208H BA.5.5,FL.10.1,FL.25,XBB.1.16.6,XBB.2.3 |
| intergenic | T6218I FL.1.5.1,XBB.2.3 |
| intergenic | H6239H FL.15,GK.2,GV.1,GJ.1.2,FL.1.5.1,XBB.1.17.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | K6243R XBB.2.3 |
| intergenic | F6251F BF.28,HF.1,XBB.1.16.2,XBB.1.17.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | H6255H XBB.1.16.15,XBB.2.3 |
| ORF1b | K6274R / NSP14 |
| intergenic | K6274R XBB.2.3 |
| intergenic | T6303I XBB.2.3 |
| intergenic | L6308L BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.1.5,FD.1.1,GK.2.1,HN.1,XCH.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | Y6345Y FL.10.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | P6368S BA.5.1.24,GK.2,XBB.1.5.72,XBB.2.3.11 |
| ORF1b | Y6372H / NSP14 |
| intergenic | Y6372H XBB.2.3 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3,EG.5.1,FL.10.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GK.3.1,GY.5,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D6440D BF.10,GK.2,HR.1,XBB.1.16.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | N6446N BA.4.1.8,BA.5,XBB.2.3 |
| intergenic | T6449I BA.5.2.2,BA.2.3,XBB.2.3 |
| intergenic | Q6470Q XBB.2.3 |
| intergenic | Q6471H DV.7.1.2,XBB.2.3 |
| intergenic | D6539D BQ.1.2.3,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | A6623V DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FL.15,GK.1,EG.5.1.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A6623A EG.5.1.4,GK.1.1,HY.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F6628F BA.5,BA.5.5,GK.1.1,GJ.1.2,XBB.1.17.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | V6637I GA.4.1,XBB.1.17.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V6638V BA.5.1.2,BA.4.6,FK.1.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | F6665F XBB.2.3 |
| intergenic | F6673F BQ.1.2.3,XBB.2.3 |
| intergenic | K6711N XBB.2.3 |
| intergenic | S6713L XBB.2.3 |
| intergenic | S6725G XBB.2.3 |
| intergenic | N6729N GE.1,HK.6,JD.1.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.11 |
| intergenic | F6731F GE.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | S6760S BA.5,GJ.1.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V6772L BA.5.2.2,BA.5.1.1,BF.28,EG.5.1.3,GK.2,HK.3,XBB.1.5.37,XBB.2.3 |
| intergenic | D6830N XBB.2.3 |
| intergenic | A6832V BA.5,EG.5.1,FL.10.1,EG.5.1.6,GE.1,HY.1,XBB.2.3 |
| intergenic | T6854I BA.4,GK.1.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2 |
| ORF1b | G6890S / NSP16 |
| intergenic | G6890S BA.5.2.3,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D6900D BF.26,XBB.2.3 |
| intergenic | D6923D XBB.2.3 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HN.1,FY.5,FL.1.5.1,JJ.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3 |
| intergenic | H6972H XBB.2.3 |
| intergenic | K6980R XBB.2.3 |
| ORF1b | P7013L / NSP16 |
| intergenic | PR7013LN BA.5.1.10,GK.3.1,XBB.2.3 |
| intergenic | R7014H BA.5.2.34,GK.2.1,BA.5.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V7021F XBB.2.3 |
| intergenic | P7034L BA.4,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P7034P GK.1,XBB.1.16.15,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.2.3 |
| intergenic | L7042L BA.5.1.24,FD.1.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N7083N BE.1.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.2,XCH.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | H49Y FL.15,XBB.2.3 |
| intergenic | F58F BA.5.1.30,BQ.1.13,XBB.2.3.2 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,BA.5.1,XBB.2.3 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,BA.5.1,XBB.2.3 |
| intergenic | I68T FD.1.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G75V BA.2.12,BA.4,BA.5.2.20,FU.2,HF.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3 |
| intergenic | V83A EG.5.1.8,XBB.2.3 |
| intergenic | V83S XBB.2.3 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N87N FU.2,XBB.2.3.5 |
| intergenic | S98F BA.5.1.10,FL.1.5,FD.1.1,FL.20,BQ.1,GK.3.1,GK.1.1,JF.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I105V BA.5.1.10,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S116S EG.5.1,EU.1.1,FD.1.1,FL.15.1.1,GE.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6,GJ.1.2,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,JF.1,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | G142_Y145delinsDD GK.3.1,HK.1,HR.1,XBB.1.16.23,XBB.2.3.11 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,XBB.1.16.17,JF.1,JA.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.2.3.5,XCH.1,XCK |
| intergenic | N148T FL.15,FU.2,HK.7,JD.1.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.17.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.11 |
| intergenic | M153I BA.5.2.3,GE.1,GJ.1.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | R158G GE.1,GS.4.1,XBB.2.3 |
| intergenic | V171V EG.5.1.8,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3 |
| intergenic | QG183EV GZ.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3 |
| intergenic | N188N BQ.1,XBB.2.3 |
| intergenic | I210del GK.2.1,XBB.2.3 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | D215N XBB.2.3 |
| intergenic | S221L HF.1,JN.2,XBB.2.3 |
| intergenic | A222A XBB.1.17.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I231T BA.5,BE.1.1,XBB.2.3 |
| intergenic | H245Y GA.4.1,EG.5.1.6,GK.3.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3 |
| intergenic | D253G XBB.2.3 |
| intergenic | D253S XBB.2.3 |
| S | D253S XBB.2.3 |
| intergenic | D253G GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | S255F BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,EG.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.11,XBB.2.3 |
| intergenic | S256T XBB.2.3 |
| S | S256T XBB.2.3 |
| intergenic | S256L BA.5.1.2,BQ.1,GK.1.1,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.2.3 |
| intergenic | L276L BA.5.1.30,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.2.3 |
| S | E281G XBB.2.3 |
| intergenic | T302T XBB.1.5.15,XBB.2.3.5 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,HK.3,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T323I JD.1,XBB.1.16.8,XBB.1.9.1,XBB.2.3 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XCL,XCH,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | S371F BF.10,XBB.1.5.70,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | V382V DV.7.1,BA.5.2.20,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | S477N XBB.2.3 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.42.1,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | Q493L EG.5.1.4,FY.3.1,XBB.2.3.5 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.15,XBB.1.17.1,JA.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | F541F EG.7,BA.5.6,GE.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N542N GJ.1.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.5.2.3,FY.3.1,BQ.1,EG.5.1.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3 |
| intergenic | K558N XBB.1.9.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D571D XBB.1.16.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T572I FD.1.1,GK.3.2,FY.5,XBB.1.16.11,XBB.2.3 |
| intergenic | P579P BA.2.12,GV.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | E583D GK.1.1,GE.1,JD.1.1.2,JD.1.1,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D586D XBB.2.3 |
| intergenic | S605S XBB.2.3 |
| intergenic | D614G HY.1,XBB.1.16.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | N616N BF.10,XBB.2.3 |
| intergenic | V622F BQ.1.2.3,HK.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V642G EG.5.1.4,FU.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | EH654KY EG.5.1.4,XBB.2.3 |
| intergenic | H655Y EG.5.1.4,XBB.2.3 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N658K XBB.2.3 |
| intergenic | Q675K GJ.1.2,XBB.2.3 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | NSP679KSH BA.5.2.20,GV.1,HK.3.2,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.5.37,XBB.2.3 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | R683R EG.7,XBB.1.16.6,XBB.2.3 |
| intergenic | N703K HK.7,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4,GA.4.1,FY.4.1.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,JG.3,XCH,XBB.2.3.5,XCH.1 |
| intergenic | N709N FL.15.1.1,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | P715P BA.5.2.20,FL.1.5.2,EG.5.1.6,FY.3.1,GJ.1.2.6,JF.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3 |
| intergenic | T732I BA.2.12,EG.5.1,JG.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.8,XBB.2.3 |
| intergenic | S735L BQ.1.1.8,GW.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S750R XBB.2.3 |
| S | S750R XBB.2.3 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | N801N XBB.2.3 |
| intergenic | V826L XBB.2.3 |
| intergenic | K854N XBB.2.3 |
| intergenic | L877L BF.26,DV.7.1.2,EU.1.1,BA.2.3,BA.5.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S937T JD.1.1,XBB.2.3 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,GK.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.5.10,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S940S FD.1.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3 |
| intergenic | V952V BA.5.2.20,XBB.1.16.11,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | E988E BA.5.1.30,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A1020V FD.1.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A1070V EG.5.1.8,HK.3,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | A1078A GJ.1,XBB.2.3 |
| intergenic | G1085A BA.5.2.20,FL.1.5.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | H1101H EG.10.1,EG.7,GK.1,GW.5,XBB.1.17.1,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.2.3 |
| intergenic | Y1110Y FD.1.1,GS.4,XBB.1.16.1,XBB.2.3 |
| intergenic | T1117K XBB.2.3 |
| intergenic | D1139D FY.5,XBB.1.5.72,XBB.2.3 |
| intergenic | E1144Q EG.5.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L1145L XBB.2.3 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | F1148F EG.5.1.3,EG.7,FL.15,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.23,XCL,XBB.2.3.2 |
| intergenic | K1157M XBB.2.3 |
| intergenic | I1172I XBB.2.3 |
| intergenic | N1178N BQ.1.1.8,GK.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2,XBB.2.3 |
| intergenic | Q1201K XBB.2.3 |
| intergenic | Q1208H XBB.1.16.8,XBB.2.3.11 |
| intergenic | Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BF.28,FL.1.5,GK.3.1,GV.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.1,XBB.2.3 |
| intergenic | M1229V XBB.2.3 |
| S | M1229V XBB.2.3 |
| intergenic | S1249Y XBB.2.3 |
| S | S1249Y XBB.2.3 |
| intergenic | D1259D BA.2.12,HK.3.2,XBB.1.17.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V1264V BA.5.5,FY.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | 9 FK.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3 |
| intergenic | F8F FK.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V13L GY.5,EG.5.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.6,XBB.2.3 |
| intergenic | S26L EG.5.1.1,XBB.2.3 |
| intergenic | D27H EG.5.1,FL.1.5.2,GK.1.1,XBB.2.3 |
| intergenic | F43F BA.2.12,BA.5.2.20,FD.1.1,HY.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A54S HK.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A54A EG.5.1,XBB.2.3 |
| intergenic | S58G JD.1.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L65F DV.7.1,BA.5.2.20,FL.1.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | L71L BA.5,BQ.1.13,BA.5.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | K75R XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T89I BF.26,EG.5.1.8,FL.1.5,EG.5.1.4,FD.1.1,GK.1.3,GK.1.1,HN.1,JD.1.1.2,JD.1.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3 |
| intergenic | L95L XBB.2.3 |
| intergenic | V112V BA.5.2.3,BA.5,BQ.1.1.8,GJ.1.2,HK.3,XBB.1.5.72,XBB.2.3.11 |
| intergenic | R134H FU.2,GK.1,HK.3,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | R134R XBB.2.3 |
| ORF3a | R134R XBB.2.3 |
| intergenic | N161N FU.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | H182Y GK.1.1,XBB.2.3 |
| intergenic | Y189Y BA.4.1,DV.7.1,DV.7.1.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | E194E BA.4.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L219F XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | T223I BA.2.12,BA.5.1.30,EG.5.1.3,GY.5,HK.11,HF.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | D238Y XBB.2.3 |
| ORF3a | D238Y XBB.2.3 |
| intergenic | P240L BA.5.1.2,EG.5.1.4,EG.5.1,HY.1,JD.1.1.1,JJ.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V244V GS.4,XBB.2.3 |
| intergenic | H247Y BA.5.1.10,XBB.1.16.23,XBB.2.3 |
| intergenic | V256F XBB.1.5.37,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T268M BA.2.3,GY.5,XBB.1.5.72,XBB.2.3 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | V25V BA.5.1.24,BA.5.1.1,EG.5.1.8,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L73F XBB.2.3 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | L29F BA.5.2.20,GW.5,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A40S GJ.1.2,XBB.2.3 |
| intergenic | N41N BF.9,BA.5.5,FL.10.1,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I52T XBB.2.3 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6,GZ.1,GE.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | T77T BA.4.6,EG.5.1,FL.15,FL.20,GK.2,XBB.1.16.1,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3,GK.3.2,GK.1.1,GE.1,HF.1,HY.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.15,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | L102L BA.5,EG.5.1,XBB.1.16.2,XBB.1.17.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A104V BA.2.86.1,BE.1.1,BQ.1,GS.4,GS.4.1,BA.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | 114 XBB.2.3 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | N117N BQ.1.13,BA.5.5,EG.5.1.3,BA.5.6,FL.15,EG.5.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3 |
| intergenic | N121N BA.5.1.10,XBB.1.16.15,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | H125Y BA.5,BA.5.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,EG.5.1,GJ.1.2,JD.1.1,XBB.1.17.1,XBB.2.3.5,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A142V XBB.2.3 |
| intergenic | V143V BA.5.1.1,EG.5.1,XBB.2.3.2,XCK |
| intergenic | P165P BA.5.1.30,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2 |
| M | P165P BA.5.1.30,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.70,XCL,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | S184S BA.5.2.20,XBB.2.3 |
| intergenic | D190D HK.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y196Y BQ.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | L35I BA.1.17,XBB.2.3.2 |
| ORF6 | L35I BA.1.17,XBB.2.3.2 |
| intergenic | K42E XBB.2.3 |
| intergenic | Y49H EG.6.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EU.1.1,GE.1,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3 |
| intergenic | g.G-4C XBB.2.3 |
| intergenic | g.C-1T BA.5,BA.5.5,FU.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.11 |
| intergenic | I3I BA.5.2.20,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I4V XBB.2.3 |
| intergenic | A13V GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | P34L BA.5.2.8,BA.4.1,XBB.1.17.1,XBB.2.3 |
| intergenic | T39I BA.5.1.1,EU.1.1,FY.3.1,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G70G EG.5.1.8,HK.3.2,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S83L BA.5.6,JN.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | E95Q XBB.2.3 |
| intergenic | Y97Y BF.26,BA.5.5,JD.1.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3 |
| intergenic | T115I XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XCH.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L14fs CH.1.1.28,BA.5.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | S31L XBB.2.3 |
| intergenic | H42H FL.10.1,HR.1,HK.3,XBB.2.3 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3 |
| intergenic | T26I JG.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Q27X GK.2.1,HK.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A51V BA.5.1.2,EU.1.1,XBB.2.3 |
| intergenic | A55V BA.5.1.10,FL.1.5,FL.20,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | A65S BA.5.5,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,FU.2,BQ.1,GK.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | K94T XBB.2.3 |
| intergenic | I121I BA.5.1.30,XBB.2.3.11 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | S21S BF.41,XBB.2.3.5 |
| intergenic | T24I BA.5.2.34,BF.9,FL.8,EG.5.1.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.11 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3 |
| intergenic | E31_S33del JF.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G30_S33delinsA GS.4,GS.4.1,JF.1,XBB.1.17.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.11 |
| intergenic | S37S BA.5.6,XCH.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T49I BA.5,BA.5.1.30,BF.10,FD.1.1,HK.8,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A50A BF.26,BA.2.3,GK.2.1,GS.4.1,JA.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | Q70Q HF.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1,BA.5.6,GK.1.1,GJ.1.2,JD.1.1.2,JD.1.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3 |
| intergenic | P117P BA.2.12,GK.1.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3 |
| intergenic | A125V XBB.2.3 |
| N | A125V XBB.2.3 |
| intergenic | N126N BF.9,BA.4.6,JG.3,XBB.1.41.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,GY.5,GE.1,GJ.1.2,JD.1.2,JF.1,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1,FL.15,BA.2.3,GK.1.1,HK.11,BA.1,JN.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | P142S BA.4,BA.5.6,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | P151P XBB.1.16.6,XBB.2.3 |
| intergenic | I157I BA.4,BA.5.2.34,EG.5.2.1,EG.5.1,GE.1,XBB.1.17.1,XBB.1.42.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G179S GK.1,HN.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G200D XBB.1.16.11,XBB.2.3.11 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1,HK.6,HK.8,EG.5.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2,XBB.2.3 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A211S XBB.1.16.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D216D XBB.2.3 |
| intergenic | A220A XBB.2.3 |
| intergenic | V270L DV.7.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T282T BA.1.17,FL.20.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G287G FL.10.1,EG.5.1.6,GK.1.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | D288D GY.5,XBB.2.3.11 |
| intergenic | I292I HK.8,HN.1,HK.3,XBB.2.3 |
| intergenic | H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.5,EG.5.1.4,BA.2.3,BQ.1,GE.1,GS.4.1,XBB.1.41.1,XBB.1.16.1,XBB.2.3 |
| intergenic | P302P BA.5.2.34,BA.4.1,CH.1.1.28,FL.15,GE.1,HK.6,FL.1.5.1,JN.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | P309P BA.4.1,BA.5.2.20,BF.10,BA.4.6,BQ.1,GK.2,GE.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3 |
| intergenic | Y333Y BA.4,BF.26,BA.4.6,BA.5.6,JD.1.1.1,BA.5.1,XCH,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T334I BA.5.2.34,HK.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I337I BA.5.2.34,BA.5.1,XCH.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | 343 XBB.2.3 |
| N | 343 XBB.2.3 |
| intergenic | K342K XBB.2.3 |
| N | K342K XBB.2.3 |
| intergenic | F346F BA.5.2.34,EG.5.1,FL.14,FL.25,FU.2,XBB.1.5.15,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | P365S FL.1.5.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P365L BA.5.2.20,FL.1.5,GE.1,GS.4.1,JD.1.2,XBB.1.5.10,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A376A BA.5.2.8,XBB.2.3.11 |
| intergenic | E378D XBB.2.3 |
| intergenic | S413L BA.5.5,XBB.1.16.8,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | D415D DV.7.1,BF.28,EG.5.1.3,EG.5.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.C-23T BA.5.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.G-4T XBB.2.3 |
| intergenic | A8V FL.10.1,BQ.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,GK.1,GY.5,HN.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P10L BF.26,XBB.2.3.2 |
| intergenic | F11X XBB.2.3 |
| intergenic | R24C BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4.1,FL.1.5.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3 |
| intergenic | g.G29692T BA.5,BQ.1.13,XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.G29706T FL.1.5,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | g.C29769T DV.7.1,BA.5.2.20,BF.26,FL.15,BA.2.3,FL.1.5.1,XBB.1.41.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3 |
| intergenic | g.C-222T BA.4,BA.5,EG.7,BA.2.3,BQ.1,JG.3,HK.3,XCH.1,HV.1 |
| intergenic | g.T-162C HV.1 |
| intergenic | g.G-81T BA.5.1,HV.1 |
| intergenic | g.G-47A BF.10,BA.4.6,BA.2.3,HV.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | L27L BA.5.1.24,FL.1.5.2,FL.10.1,GE.1,HN.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.10,HV.1 |
| intergenic | S40L HV.1 |
| intergenic | H45R HV.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | KD47RG HV.1 |
| intergenic | G59G XBB.1.5.37,HV.1 |
| intergenic | G132G HV.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | G146C HV.1 |
| intergenic | I201M HV.1 |
| intergenic | A211V HV.1 |
| intergenic | V378V HV.1 |
| intergenic | E441E BA.1.14,GE.1,XBB.1.9.1,HV.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | I523I HV.1 |
| intergenic | S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1,EU.1.1,FL.20.2,FL.20,BQ.1,HK.11,XBB.1.17.1,HV.1 |
| intergenic | A599V BA.2.12,BF.26,EG.5.1,EU.1.1,HK.3,HV.1 |
| intergenic | S610L FL.15,JF.1,XBB.2.3.2,HV.1 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.5.10,HV.1 |
| intergenic | A702A XBB.1.5.10,HV.1 |
| intergenic | K734K XBB.1.16.11,HV.1 |
| intergenic | E743D XBB.1.5.72,HV.1 |
| intergenic | T760I HV.1 |
| intergenic | N810N BA.5.2.20,EG.6.1,FL.10.1,BQ.1,HV.1 |
| intergenic | T814I FD.1.1,HR.1,HV.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | E1024K XBB.1.17.1,HV.1 |
| intergenic | Y1039Y HV.1 |
| intergenic | N1094N HV.1 |
| intergenic | R1170C HV.1 |
| intergenic | A1204V GW.5,GJ.1.2,HV.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | Y1329Y BA.4.6,HV.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | R1386R XBB.1.16.1,HV.1 |
| intergenic | T1496I GY.5,HF.1,BA.1,HV.1 |
| intergenic | T1504T FK.1.1,JG.3,HV.1 |
| intergenic | S1520P HV.1 |
| intergenic | T1589I FL.1.5.2,FD.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.41.1,BA.5.1,XBB.2.3.2,HV.1 |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10,BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BA.5.6,FY.3.1,GE.1,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,XBB.1.5.72,XCK,HV.1 |
| intergenic | T1794I JG.3,HV.1 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.9.2,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | D1849D BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,HN.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.6,HV.1 |
| intergenic | L1853F EG.6.1,HV.1 |
| intergenic | S1857L HV.1 |
| intergenic | SS1856FL HV.1 |
| intergenic | N1917N BA.4.1,JG.1,XBB.1.5.10,HV.1 |
| intergenic | F1925F BA.5.2.2,BF.28,BE.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,FL.10.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,HV.1 |
| intergenic | P2018S GK.1.1,HV.1 |
| intergenic | V2130F HV.1 |
| intergenic | A2139A EG.5.1.6,HV.1 |
| intergenic | L2146F BA.5.2.34,GE.1,XBB.2.3.11,HV.1 |
| intergenic | L2226L HV.1 |
| intergenic | C2239Y HV.1 |
| intergenic | S2255F HV.1 |
| intergenic | S2312S JG.3,HV.1 |
| intergenic | C2445C BA.4.1.8,BA.5.1.2,BA.5.1.30,XCH.1,HV.1 |
| intergenic | H2707H XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | A2850V HV.1 |
| intergenic | A2855V HV.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3,XBB.1.16.11,XCH.1,HV.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | V3281I HV.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | L3338L BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BQ.1,GS.3,XBB.1.16.1,HV.1 |
| intergenic | T3356I BF.26,GJ.1.2,XBB.1.41.1,HV.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | N3494N BA.4.1,CK.2,XCH.1,HV.1 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1,BQ.1,GW.5,GK.2,GE.1,HF.1,GS.4.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XCL,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,HV.1 |
| intergenic | L3636L BA.5.1.24,BA.4.1,BA.5.5,BA.5.6,HK.3,HV.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | A3688V DV.7.1,HV.1 |
| intergenic | A3924V HV.1 |
| intergenic | V3925I HV.1 |
| intergenic | T4083M BA.5.1.1,BA.5.1.2,FL.1.5,FL.10.1,HV.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | P4220L BA.5.1.24,BA.5.1.1,GW.5,HV.1 |
| intergenic | P4312Q HV.1 |
| intergenic | D4344D EG.5.1.4,JD.1.1.2,HV.1 |
| intergenic | T4364I BA.5.2.20,FU.1,HV.1 |
| intergenic | A4587D HV.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | H4739H EG.7,HV.1 |
| intergenic | V4797F GS.4,HV.1 |
| intergenic | N4806N HV.1 |
| intergenic | I4842I XBB.1.9.1,HV.1 |
| intergenic | Y4847Y BA.4,FL.10.1,FL.1.5.1,XCK,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | F4920F EG.5.1.3,FU.1,FY.5,HV.1 |
| intergenic | R4945R HV.1 |
| intergenic | T4948T BQ.1.1.8,HV.1 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20,BA.1.15,BA.5.5,BA.5.6,FL.20.2,FU.2,BA.1,XBB.1.16.1,HV.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | D5152D BA.5.1.24,DV.7.1,CH.1.1.28,BF.26,EG.5.1.3,BQ.1,HN.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.15,HV.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | L5292L HV.1 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,HV.1 |
| intergenic | N5501N GJ.1.2,XBB.1.9.2,HV.1 |
| intergenic | T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,HV.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.8,HK.3,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | D5693D HV.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | I5916V HV.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | T6000I XBB.2.3.2,HV.1 |
| intergenic | P6076L BA.5.2.3,JF.1,XBB.1.5.72,HV.1 |
| intergenic | P6076P HV.1 |
| intergenic | A6150V HV.1 |
| intergenic | V6188I XBB.1.16.11,HV.1 |
| intergenic | C6210C EG.5.1.1,JN.1,HV.1 |
| intergenic | H6239H FL.15,GK.2,GV.1,GJ.1.2,FL.1.5.1,XBB.1.17.1,XBB.2.3.11,HV.1 |
| intergenic | A6245T HV.1 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3,EG.5.1,FL.10.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GK.3.1,GY.5,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,HV.1 |
| intergenic | D6440D BF.10,GK.2,HR.1,XBB.1.16.1,XBB.2.3.5,HV.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | V6573V BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,FU.1,GK.2,GS.4.1,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,HV.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | N6615N HR.1,HV.1 |
| intergenic | G6681V HV.1 |
| intergenic | L6706L EG.5.1.1,HV.1 |
| intergenic | N6729N GE.1,HK.6,JD.1.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.11,HV.1 |
| intergenic | Y6930Y BA.5.1.10,BA.1.15,FK.1.1,HK.3.3,JD.1.2,HV.1 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HN.1,FY.5,FL.1.5.1,JJ.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | L6961F BQ.1.13,FL.20,HV.1 |
| intergenic | V6965M HV.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | S46P HV.1 |
| intergenic | Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.15,FL.20,HK.7,HK.11,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3,XBB.1.9.2,HV.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1 |
| intergenic | N99N DV.7.1,HN.1,XBB.1.5.10,HV.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6,GJ.1.2,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,JF.1,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3.11,HV.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HY.1,JD.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,HV.1 |
| intergenic | H146H HY.1,XBB.1.9.2,HV.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | N148T FL.15,FU.2,HK.7,JD.1.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.17.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.11,HV.1 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | R190R BF.28,GS.4.1,HV.1 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | S221L HF.1,JN.2,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,HV.1 |
| intergenic | A263A HV.1 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,HK.3,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2,HV.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | A344A HV.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XCL,XCH,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,FK.1.1,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1,HV.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | Y508Y BA.4.1,BF.10,HK.3,XBB.1.5.10,HV.1 |
| intergenic | F541F EG.7,BA.5.6,GE.1,XBB.2.3.11,HV.1 |
| intergenic | L546L HV.1 |
| intergenic | T553I BF.10,FL.20,HV.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1 |
| intergenic | Y674Y HV.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1 |
| intergenic | S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4,GA.4.1,FY.4.1.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,JG.3,XCH,XBB.2.3.5,XCH.1,HV.1 |
| intergenic | Y707Y BA.5.2.20,XBB.1.5.37,HV.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | N925N BF.26,BF.10,XBB.1.17.1,HV.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | A1078S XBB.1.42.1,HV.1 |
| intergenic | F1089F HV.1 |
| intergenic | R1091R HV.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | V1264L BA.5.5,EU.1.1,FK.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.9.2,HV.1 |
| intergenic | L1265F HV.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,HV.1 |
| intergenic | I62L HV.1 |
| intergenic | I62I BQ.1.2.3,FK.1.1,HV.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | V97I BF.26,EG.6.1,GK.2,EG.5.1.1,JF.1,HV.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | V256del BA.5.2.2,BA.5.1.30,EG.5.1.3,FL.20.2,GE.1,HV.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | I82I XBB.1.5.15,HV.1 |
| intergenic | A104V BA.2.86.1,BE.1.1,BQ.1,GS.4,GS.4.1,BA.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | R105R HV.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | N117N BQ.1.13,BA.5.5,EG.5.1.3,BA.5.6,FL.15,EG.5.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | N121N BA.5.1.10,XBB.1.16.15,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,HV.1 |
| intergenic | H148Y FL.14,GY.5,HV.1 |
| intergenic | G202G BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1.2,FL.1.5.1,HV.1 |
| intergenic | N207N BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1.3,EG.7,FL.15,HV.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3,XBB.1.9.2,HV.1 |
| intergenic | P45S HV.1 |
| intergenic | N52N BF.26,EG.5.1.3,HF.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.6,HV.1 |
| intergenic | D69D BA.1.14,BA.5.2.8,EG.5.1.6,GY.5,GJ.1.2,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,HV.1 |
| intergenic | F87L HV.1 |
| intergenic | L116L BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.25,GE.1,XCH,XBB.1.5.72,HV.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | T40I HV.1 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | I9I XBB.1.5.15,HV.1 |
| intergenic | Q18X BA.5,FL.2.3,GJ.1.2,JG.3,XBB.1.16.1,HV.1 |
| intergenic | V32I HV.1 |
| intergenic | S54L HV.1 |
| intergenic | S69P BA.5.1.2,DV.7.1.2,BQ.1,XBB.1.16.11,HV.1 |
| intergenic | Q72H GK.1.1,XBB.1.5.37,HV.1 |
| intergenic | I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9,FL.15,FU.2,GK.1,GK.3.1,JD.1.1.1,HR.1,XBB.1.16.17,BA.5.1,XBB.1.42.1,HV.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | S23P BA.2.12,HV.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | Y111Y BQ.1.2.3,GJ.1.2,JG.3,HV.1 |
| intergenic | G178V HV.1 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1,HK.6,HK.8,EG.5.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | F315F BA.5.1.1,BA.5.1.30,FL.20.2,BQ.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.10,HV.1 |
| intergenic | I337I BA.5.2.34,BA.5.1,XCH.1,XBB.2.3.2,HV.1 |
| intergenic | A398V BA.5.1.24,BE.1.1,BF.26,GS.4.1,HV.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3,XBB.1.5.37,HV.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | g.C29784T HV.1 |
| intergenic | g.C-166T BA.5.2.20,BQ.1.2.3,GK.1.1,BA.5.2 |
| intergenic | g.A-70G BA.5.2 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13,EG.10.1,EG.5.1.3,EG.5.1.4,HN.1,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.5.70,XBB.1.42.1,BA.5.2 |
| intergenic | E36E BA.5.1.1,BA.5.2 |
| intergenic | G49D BA.5.1.24,BA.5,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,HY.1 |
| ORF1a | T50T / NSP1 |
| intergenic | T50T BA.5.2 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GE.1,GS.4.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.72,BA.5.2 |
| intergenic | L92L BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.2.3,GW.5 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34,BF.28,BE.1.1,FL.1.5,FL.2.3,JD.1.1,XBB.1.16.23,HK.3,XCH.1,BA.5.2 |
| intergenic | V121F BA.5.1.1,BA.5.2.20 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3 |
| intergenic | N188N BA.4.1.8,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,BA.4.6,EG.5.1,HF.1 |
| intergenic | L219L EU.1.1,BQ.1,FL.1.5.1,XBB.1.17.1,XBB.2.3.2,BA.5.2 |
| intergenic | T224I BQ.1.1.8,BA.5.2.20,GJ.1 |
| ORF1a | R226W / NSP2 |
| intergenic | R226W BA.5.2 |
| intergenic | P305S BA.5.1.10,BA.5.2.3 |
| intergenic | P309S EG.5.1.6,FL.8,HK.6,BA.5.2 |
| intergenic | L317L BA.5.2 |
| intergenic | L320F FL.10.1,BA.5.2 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5,EG.5.1.8,EG.5.1.3,FK.1.1,GE.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2,BA.5.2 |
| intergenic | V378I BA.4,BA.5.2.8,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T403I BA.5.1.10,BQ.1,GK.3.1,GS.3,FL.1.5.1,XBB.1.41.1,BA.5.2 |
| intergenic | G442D BA.5.2 |
| intergenic | S443F BA.5.2.2,BF.41,BA.5.2.20,FL.20,GY.5,EG.5.1.1,BA.5.2 |
| intergenic | S443S BA.5,EU.1.1,FU.2,GS.4,GE.1,GJ.1.2,HY.1,FL.1.5.1,BA.5.2 |
| intergenic | L454F BA.5.1.24,BA.5.2.20,FL.1.5,EU.1.1,EG.5.1.1,XCH.1 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BF.26,BF.10,CK.2,EU.1.1,GK.1,HK.3.2,JG.3,XBB.1.16.11,BA.5.2 |
| intergenic | A516A XBB.1.5.10,BA.5.2 |
| intergenic | L533L BA.5.2 |
| intergenic | S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1,EU.1.1,FL.20.2,FL.20,BQ.1,HK.11,XBB.1.17.1,HV.1 |
| intergenic | M584V BA.5.2.3,BF.9,BA.4.6,EG.5.2.1,BA.5.2 |
| intergenic | N615N BA.4,BA.5.2.20,FU.2,BQ.1 |
| intergenic | W630C BA.5.2 |
| intergenic | D644D BA.5.1.10,BA.5.2.34,BE.1.1,BA.5.5,XBB.1.16.2 |
| ORF1a | I652I / NSP2 |
| intergenic | L681F BA.2.12,BQ.1.13,EG.6.1,BA.5.2 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.5.10,HV.1 |
| intergenic | T727I BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,HN.1 |
| intergenic | P748L BA.5.1.10,BA.5.2.20 |
| intergenic | P748P BA.5.2.20,BA.5.6,GJ.1.2,XBB.1.16.1,BA.5.2 |
| intergenic | V757V BA.5.2.34,BF.26,FY.3.1,JD.1.1,HK.3,XBB.1.16.1,BA.5.2 |
| intergenic | N811N BA.5.2.34,EG.5.1.1,XBB.1.42.1,XBB.1.16.6,BA.5.2 |
| intergenic | T814I FD.1.1,HR.1,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | L815L EG.5.1,FL.8,FU.1,BQ.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.11,BA.5.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | V874V BA.5.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | F941L BA.5.2 |
| intergenic | P971S BA.5.1.10,BA.4.1,BA.5.2.20,XBB.1.16.15,XBB.1.5.10,XBB.1.16.6 |
| ORF1a | Q991L / NSP3 |
| intergenic | Q991L BA.5.2 |
| intergenic | G993G BA.5.2 |
| intergenic | V1056L BA.2.86.1,BA.5.2.20,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T1093A BA.5.2 |
| intergenic | H1108H BA.5.2.8,BA.5.2.20 |
| ORF1a | A1134T / NSP3 |
| intergenic | A1134T BA.5.2 |
| intergenic | H1141Y BA.5,BA.5.2.8,XBB.1.5.10 |
| intergenic | P1147S BF.10,FL.20,BA.5.2 |
| intergenic | T1168I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.1.15,EG.5.2.1,FU.2,BA.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | V1299V EU.1.1,XBB.2.3.2,BA.5.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | T1322I BA.2.12,BA.5.2.20 |
| intergenic | Y1337Y BA.5,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BQ.1.2.3,FL.10.1,FL.1.5.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | F1353fs BA.5.1.10,BA.5,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.10,CK.2,FL.1.5,BQ.1 |
| intergenic | L1438L BA.1.14,BA.5.2.2,BA.5.1.30,BA.4.6,FL.2.3,FL.25,FU.2,FY.5,JG.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.30,FL.1.5,EG.7,FD.1.1,FL.15,HK.3.2,XBB.1.5.15,XBB.2.3.11 |
| intergenic | H1500Y BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | I1502V BA.5.2 |
| intergenic | T1581T BA.1.17,BA.5.2.20,JG.3 |
| intergenic | L1627L BA.5.1.30,FU.1,FU.2,GS.3,XBB.1.41.1,XBB.1.5.70,XBB.2.3.2,BA.5.2 |
| intergenic | N1709N BA.1.18,CK.2,FL.1.5.2,GK.1,JG.3,BA.5.2 |
| intergenic | Y1734Y BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BE.1.1 |
| intergenic | C1744C EG.5.1,BA.5.2 |
| intergenic | P1786S BA.5.2.8,BA.5.2.20,BE.1.1,GK.2.1,XBB.2.3.2 |
| ORF1a | P1803P / NSP3 |
| intergenic | P1803P BA.5.2 |
| ORF1a | V1805I / NSP3 |
| intergenic | V1805I BA.5.2 |
| intergenic | T1864T BA.5.2 |
| intergenic | Y1873Y BA.5.1.10,BF.9,BF.28,EG.5.1.3,HK.6,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11,BA.5.2 |
| intergenic | T1890T BF.28,BA.5.2 |
| intergenic | S2015S BA.2.86.1,BA.2.12,EG.5.1.3,FD.1.1,GK.2,XBB.2.3.11,BA.5.2 |
| intergenic | A2033V BA.5.2.3,BA.5.2.8,BE.1.1,XCH |
| intergenic | L2122F BQ.1.2.3,GK.1.1,XBB.1.9.2,BA.5.2 |
| intergenic | N2140S BA.5.2 |
| intergenic | N2147N BA.5.1.10,BA.5.2.20,XBB.1.16.11,BA.5.2 |
| intergenic | N2155N GJ.1.2,BA.5.2 |
| intergenic | S2242F BA.5.2.34,BA.5.2.8,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,EG.10.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | S2285F BF.26,GE.1,JG.3,BA.5.2 |
| intergenic | D2299D BA.4,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1,BQ.1,GS.4.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T2310T BA.5.2 |
| intergenic | V2340A BA.5.2 |
| intergenic | A2375A HR.1,BA.5.2 |
| ORF1a | V2393I / NSP3 |
| intergenic | T2419I BA.5.2 |
| intergenic | R2420R BA.5.2 |
| intergenic | V2421V BA.4,BF.10,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3,HF.1,XBB.1.5.15,BA.5.2 |
| intergenic | S2517F BA.5.2 |
| intergenic | A2529V BF.28,FU.1,XBB.1.16.11,BA.5.2 |
| intergenic | S2625S BA.4,BA.5.2.3,BA.4.6,EG.5.1.6,HR.1,XBB.1.16.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | N2678N BA.5.2.8,BA.5.2.20,GE.1,GS.4.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V2857V BA.5.5,FL.8,BA.5.2 |
| intergenic | T2876I BA.5.2 |
| intergenic | N2894N BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.2.20,EG.5.1.9,JF.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D2907D BA.2.12,BA.5.2.20,FL.15 |
| intergenic | T2936T BE.1.1,XBB.1.16.11,JA.1,BA.5.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | S3099L BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.30 |
| ORF1a | Y3190Y / NSP4 |
| intergenic | Y3190Y BA.5.2 |
| intergenic | L3198L BA.2.12,BA.5.2.8,FU.2,GK.2,GZ.1,GK.1.1,BA.1,EG.5.1.1 |
| intergenic | A3209V BA.5.1.10,BA.5.2.34,EG.5.1.3,BA.5.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | F3271F BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,EG.6.1,FY.4.1.1,HK.11,XBB.1.16.8,XCH.1 |
| intergenic | T3284I BA.4,BA.5.2.20,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3,JN.3,XBB.1.16.23,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCH,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,BA.5.2 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.15,HK.3,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | D3508D FL.1.5,FL.8,FL.15,BQ.1,JF.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,BA.5.2 |
| intergenic | G3541G BA.5.2 |
| ORF1a | H3581Y / NSP6 |
| intergenic | H3581Y BA.5.2 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1,BQ.1,GW.5,GK.2,GE.1,HF.1,GS.4.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XCL,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,BA.5.2 |
| intergenic | M3627I BA.5,BA.5.2.20 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | T3750I BA.5.2.34,BA.4.1,BQ.1,HK.3.2,JD.1.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.1,BA.5.2 |
| intergenic | L3800F BA.5.2 |
| intergenic | Y3803Y BA.2.12,BA.5.2.8,BA.5.5 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | K3839K BA.4.1,BA.5.2.20,BA.5.5,GE.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | I3853I BA.5.1.10,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BE.1.1,HN.1,JG.3,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N3928N BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1,BA.5.2 |
| intergenic | V3986L BA.5.2 |
| intergenic | Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20,CK.2,BA.5.2 |
| intergenic | D4020D BA.5.1.2,EG.5.1,FD.1.1,BA.5.1,BA.5.2 |
| intergenic | D4117D GK.3.1,HK.11,BA.5.2 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24,BA.5.2.3,HK.11 |
| intergenic | I4291V BA.5.2 |
| intergenic | A4357V BA.4,BA.5.2.3,EG.5.1,FL.15,XBB.1.9.1,BA.5.2 |
| intergenic | Y4430Y BA.2.86.1,BA.5.2.20,BF.26 |
| intergenic | H4467H BA.5.1.10,BQ.1.1.8,GE.1,EG.5.1.1,JJ.1,XBB.1.16.17,BA.5.2 |
| ORF1b | Q4576H / NSP12 |
| intergenic | Q4576H BA.5.2 |
| intergenic | T4638T BA.5,BA.5.2.8,EG.7,XBB.1.16.11,XBB.1.9.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | V4733V EG.7,XBB.1.16.1,BA.5.2 |
| intergenic | M4855I BA.5.2.2,BA.5.2.20 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20,BA.1.15,BA.5.5,BA.5.6,FL.20.2,FU.2,BA.1,XBB.1.16.1,HV.1 |
| intergenic | T5036T BA.5,BA.5.2.20,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EU.1.1,FD.1.1,BA.5.1,XBB.1.5.15,BA.5.2 |
| intergenic | T5093T BF.26,BQ.1,GE.1,BA.5.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | S5253S BA.4.6,BA.5.2 |
| ORF1b | D5302G / NSP12 |
| intergenic | D5302G BA.5.2 |
| intergenic | C5353C BA.5.1.30,FK.1.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,BA.5.2 |
| intergenic | Y5355Y BA.2.12,BA.5.2.20,EG.5.1,FL.1.5.2,FL.15,FU.1,BA.2.3,EG.5.1.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | V5366V EG.5.2.1,FL.15,FU.1,XBB.1.16.8,BA.5.2 |
| intergenic | P5371L BA.5.1.10,BA.5.2.8,HY.1,XBB.1.16.15,BA.5.1 |
| intergenic | H5399H BF.10,HK.6,BA.5.2 |
| intergenic | T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20,CK.2,BA.5.2 |
| intergenic | T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.1.24,GE.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.8,HK.3,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | T5690T BA.1,BA.5.2 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3,BA.5.1.30,BF.26,BF.10,JG.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | F5746F BA.2.12,BA.5.2.3,FD.1.1,BA.2.3,GK.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | R5766R FU.2,GK.3.1,BA.1,BA.5.2 |
| intergenic | A5778V BQ.1.1.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5.2.8,BF.26,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,BA.5.1 |
| intergenic | T5912I BA.5.1.10,DV.7.1.2,BF.10,BA.4.6,FU.2,XBB.1.16.11,BA.5.2 |
| intergenic | R5919R XBB.1.16.23,BA.5.2 |
| intergenic | L5932L BA.5.2.34,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.2.3,GJ.1,GK.1.1,HF.1,HN.1 |
| intergenic | V5939L BA.5.2.34,BA.5.2 |
| intergenic | I5967L BA.5.1.30,BA.5.2.20 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | V6050F BA.2.12,BA.5.2 |
| intergenic | N6055N FU.2,BA.5.2 |
| intergenic | D6097D BA.2.12,BA.5.2.20,BA.5.5,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.10.1,BA.5.6,XBB.1.41.1,XBB.1.9.2 |
| ORF1b | D6159E / NSP14 |
| intergenic | D6159E BA.5.2 |
| intergenic | D6249D BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,XBB.1.16.15 |
| intergenic | K6274N BA.5.1.30,BA.5.2.20 |
| intergenic | DRYP6315EGCH BA.2.12,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.26,BA.4.6,FD.1.1,BQ.1 |
| ORF1b | T6535T / NSP15 |
| intergenic | T6535T BA.5.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | V6573V BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,FU.1,GK.2,GS.4.1,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| ORF1b | E6667D / NSP15 |
| intergenic | E6667D BA.5.2 |
| intergenic | S6740F BF.9,BA.5.2.20,BA.5.2 |
| intergenic | P6805S DV.7.1,BA.5.2 |
| intergenic | L6819L BA.5.2.2,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BE.1.1,XBB.1.16.8,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V6894V HK.8,BA.5.1,XBB.1.5.37,BA.5.2 |
| intergenic | T6938I BA.2.12,BA.5,BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.5.6,XBB.1.16.1,BA.5.2 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HN.1,FY.5,FL.1.5.1,JJ.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | A6997A BA.4,BA.5,BA.5.1.1,EG.10.1,FY.3.1,GS.4,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,BA.5.2 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | Y28Y BQ.1,GS.4,XBB.1.16.8,BA.5.2 |
| intergenic | T29I BA.5.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1,BA.5.2 |
| intergenic | S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.4 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,BA.5.1,XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,BA.5.1,XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | G75V BA.2.12,BA.4,BA.5.2.20,FU.2,HF.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3 |
| intergenic | S98F BA.5.1.10,FL.1.5,FD.1.1,FL.20,BQ.1,GK.3.1,GK.1.1,JF.1,XBB.2.3.2,BA.5.2 |
| intergenic | K113K HF.1,EG.5.1.1,BA.5.2 |
| intergenic | V127F BA.2.86.1,BA.5.2.2,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | V130V BA.5.2.8,BA.5.2.20,BE.1.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6,GJ.1.2,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,JF.1,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | H146H BA.2.12,BA.5.2.34,BF.9,BQ.1 |
| intergenic | G181V JG.3,BA.5.1,XBB.1.5.15,BA.5.2 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,FK.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,BA.5.1,BA.5.2 |
| intergenic | S255F BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,EG.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.11,XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | G257S DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Y313Y BA.5.2 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,BA.1,BA.5.1,BA.5.2 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | R346S BA.4,BA.5.2.3,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.5.6 |
| intergenic | S359N BA.5.2 |
| S | S359N BA.5.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | V382V DV.7.1,BA.5.2.20,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | K444R BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.2.20,BA.5.1 |
| intergenic | V445A BA.5.2 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,FK.1.1,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | E484V BA.5.2.3,FL.15.1.1,JD.1.1,BA.5.2 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1,BA.5.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.5.2.3,FY.3.1,BQ.1,EG.5.1.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | T618T BA.1.14,BA.5.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | P665P BA.5,BA.5.2.8,BF.28 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | A688V BA.5.2.34,BA.5,BA.5.1.30,JG.3,XBB.1.16.2,JF.1,JA.1,BA.5.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | Q779Q BA.5.2 |
| intergenic | F833F BA.5.2 |
| S | F833F BA.5.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | S967S BF.9,BA.5.2.20 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | A1020S BA.4,BA.5.2.8,BA.5.1 |
| intergenic | H1101Y BF.41,BA.5.2.20,EG.5.1.3,HF.1.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | I1169I BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,GK.2 |
| intergenic | N1178N BQ.1.1.8,GK.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2,XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | E1202Q BA.4.1.8,BA.5.2.3,BF.28,XBB.1.5.10,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D27H EG.5.1,FL.1.5.2,GK.1.1,XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | F43F BA.2.12,BA.5.2.20,FD.1.1,HY.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L65F DV.7.1,BA.5.2.20,FL.1.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | H78Y BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.20,BF.28,EG.5.1,GK.2.1,FY.5,XBB.1.16.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A99G BA.5.2 |
| intergenic | V168V BA.5.2 |
| intergenic | T175I BA.5.1.30,BF.26,EG.5.2.1,GJ.1.2.6,GS.4,GK.1.1,XBB.1.16.11,BA.5.2 |
| intergenic | H182Y GK.1.1,XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | F207F BA.5.1.2,BA.5.2.20,BA.2.3,GJ.1.2,HY.1,XBB.1.16.15,XCH |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | V237V BA.5.2 |
| intergenic | F4F BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,GK.1.3 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,HF.1,BA.5.1,XCK,BA.5.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6,GZ.1,GE.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L56L BA.4,BA.5,EG.5.1.4,BA.5.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3,GK.3.2,GK.1.1,GE.1,HF.1,HY.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.15,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | L124L BA.2.12,BA.4,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.20,GK.1,HY.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.15 |
| intergenic | H125Y BA.5,BA.5.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,EG.5.1,GJ.1.2,JD.1.1,XBB.1.17.1,XBB.2.3.5,XBB.1.16.6,BA.5.2 |
| intergenic | L156L BA.5.2 |
| M | L156L BA.5.2 |
| intergenic | L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20,CK.2,XBB.1.16.15,BA.5.2 |
| intergenic | S177S BA.5.2 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.70,XCL,XBB.2.3.11,XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | N203N BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1.3,JG.3,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N207N BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1.3,EG.7,FL.15,HV.1 |
| intergenic | N28H BA.5.2 |
| ORF6 | N28H BA.5.2 |
| intergenic | D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3,BF.41,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15 |
| intergenic | A8T BF.26,BA.5.2 |
| intergenic | T11K BA.5,BA.5.2.20 |
| intergenic | R25T BA.4.1,BA.5.2.20,HF.1,HK.3.2,HN.1 |
| intergenic | G38V BF.28,FD.1.1,GS.4.1,BA.5.2 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9,BA.5.2.20,BQ.1.13,CK.2,EG.6.1,GK.2,XBB.1.16.15,XBB.1.16.11,BA.5.2 |
| intergenic | D69D BA.1.14,BA.5.2.8,EG.5.1.6,GY.5,GJ.1.2,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,HV.1 |
| intergenic | H73Y BA.5.1.24,BA.5.2.8,BE.1.1,BA.5.6 |
| intergenic | V74I BA.5,BA.5.2.20 |
| intergenic | V104F BA.5.2.34,BA.5.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1,XCK,BA.5.2 |
| intergenic | P36P BA.1.14,BA.5.2.34,DV.7.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,FU.2,BQ.1,GK.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G66_K68delinsE BA.2.12,BA.4,FY.3.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.72,BA.5.2 |
| intergenic | C102F EG.7,GK.2,XBB.1.16.15,XBB.1.5.37,BA.5.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | R10R BA.5.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,CK.2,BA.5.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | G30_R32del BA.5.2 |
| intergenic | D63N HK.6,BA.5.2 |
| intergenic | P67L BA.2.12,BA.5.1.10,BA.5.2.20,XBB.1.5.72 |
| intergenic | Y86Y BA.2.12,BA.5.2.3,BA.5.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,BA.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1,BA.5.6,GK.1.1,GJ.1.2,JD.1.1.2,JD.1.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3 |
| intergenic | K127R BA.5.2 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1,FL.15,BA.2.3,GK.1.1,HK.11,BA.1,JN.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A152S BA.5.1.10,BA.5.1.2,GK.2.1,BA.5.2 |
| intergenic | I157I BA.4,BA.5.2.34,EG.5.2.1,EG.5.1,GE.1,XBB.1.17.1,XBB.1.42.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G175G BA.2.12,BA.5.2.3,GS.4.1 |
| intergenic | S183S BQ.1.1.8,BA.5.2.20 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1,HK.6,HK.8,EG.5.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11 |
| intergenic | S206S BA.5.2 |
| intergenic | D216D XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | P302P BA.5.2.34,BA.4.1,CH.1.1.28,FL.15,GE.1,HK.6,FL.1.5.1,JN.2,XBB.2.3.11,BA.5.2 |
| intergenic | P309P BA.4.1,BA.5.2.20,BF.10,BA.4.6,BQ.1,GK.2,GE.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3 |
| intergenic | F315F BA.5.1.1,BA.5.1.30,FL.20.2,BQ.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.10,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | Y360Y BA.5.2.2,BA.5.2.3,BQ.1.1.8,FL.15,FU.1,FY.5 |
| intergenic | Q386Q XBB.2.3.11,BA.5.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | g.C-17T BF.26,BA.1.15,HR.1,BA.5.2 |
| intergenic | P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,GK.1,GY.5,HN.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,FU.2,BQ.1,GK.1.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | R24C BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4.1,FL.1.5.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1,GK.3.2,GW.5,HK.6,GS.4.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,BA.5.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,JD.1.2,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | g.C29769T DV.7.1,BA.5.2.20,BF.26,FL.15,BA.2.3,FL.1.5.1,XBB.1.41.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | g.C-160T BA.5.1.24,BE.1.1,BA.1.15,EG.5.1.3,GY.5,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | g.C-119T BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.2.3,FL.15,XBB.1.16.8 |
| intergenic | g.T-89C BA.5.1.24,XBB.1.16.8 |
| intergenic | g.C-44T BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1,XCL,XBB.2.3.11 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | g.CG-25_-24TA GK.2,XBB.1.16.17 |
| intergenic | F8L XBB.1.16 |
| intergenic | R24R BA.5,FK.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16 |
| intergenic | L27L BA.5.1.24,FL.1.5.2,FL.10.1,GE.1,HN.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.10,HV.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | G52G BF.28,BF.10,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V54del BF.10,XBB.1.16.8 |
| intergenic | F70F JD.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | I71I BQ.1.2.3,GJ.1,XBB.1.16.15,JF.1 |
| intergenic | A79V EG.5.1.4,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GE.1,GS.4.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.72,BA.5.2 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,GE.1,XBB.1.16.8,BA.5.1 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BA.4.6,FD.1.1,GE.1,XBB.1.16.8,BA.5.1 |
| intergenic | G82_M85delinsV BF.20,GK.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.10,DV.7.1.2,GK.1,JF.1,XBB.1.17.1,JA.1,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | M85I XBB.1.16 |
| intergenic | A90V XBB.1.16 |
| intergenic | V106V EG.7,XBB.1.16.6 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34,BF.28,BE.1.1,FL.1.5,FL.2.3,JD.1.1,XBB.1.16.23,HK.3,XCH.1,BA.5.2 |
| intergenic | V111V BA.5.2.20,XBB.1.16.1 |
| intergenic | S135R BA.2.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | S135K GJ.1.2.6,XBB.1.16 |
| intergenic | S135R GJ.1.2.6,XCH,XBB.1.16 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | L140L CH.1.1.28,BQ.1.13,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3,HK.6,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37,XBB.1.9.2 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3 |
| intergenic | G146D BF.10,XBB.1.16.8 |
| ORF1a | H165Y / NSP1 |
| intergenic | H165Y BF.26,XBB.1.16.2 |
| intergenic | N189N BA.5.1.10,BA.5.1.30,EG.5.2.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D203D BA.5.1.24,BA.4.6,GK.2,BA.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | T214N EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D220D BA.5.1.24,BA.4.1,EG.5.1.6,XBB.1.16 |
| intergenic | Y229Y BA.2.12,XBB.1.16.17 |
| intergenic | A260A GE.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T265I BQ.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16 |
| intergenic | G268G EG.5.1,FL.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P286S XBB.1.16.17,XBB.1.16.1 |
| ORF1a | V288V / NSP2 |
| intergenic | G295C GK.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | G295G BA.5.5,GK.1.1,XBB.1.16 |
| intergenic | P309L BA.5.2.2,BF.28,GE.1,XBB.1.16.15,HK.3,XBB.1.16 |
| intergenic | T333M BA.4.1,BF.10,XBB.1.16.8,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G334G BA.5.1.10,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.9.2 |
| intergenic | D335G FU.2,XBB.1.16.17 |
| intergenic | V337F XBB.1.16 |
| intergenic | T340I HK.3,XBB.1.16.11,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | T340T XBB.1.16 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5,EG.5.1.8,EG.5.1.3,FK.1.1,GE.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2,BA.5.2 |
| intergenic | G345V XBB.1.16 |
| intergenic | T350I BA.5.2.3,BA.5.5,GV.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2 |
| intergenic | P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.6,GK.2.1,GK.1,GE.1,HK.8,XBB.2.3.5,XBB.1.16.6 |
| intergenic | H374H BA.5.1.10,FY.3.1,GK.1.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S376L BA.5.2.3,BA.5.5,EG.5.1.9,FU.2,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.8 |
| intergenic | G379E BA.5.1.10,BF.28,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A385A BE.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1,BA.5.1 |
| intergenic | H388Y BA.1.14,EG.5.1.9,EU.1.1,FL.15,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1 |
| intergenic | E390E XBB.1.16 |
| intergenic | G392G FL.14,FL.8,BA.2.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T395T XBB.1.16 |
| intergenic | R402R BA.5.2.34,DV.7.1,BF.10,BA.5.6,FL.15,XBB.1.16.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | S428S GJ.1,GJ.1.2.6,GJ.1.2,XBB.1.16.8 |
| intergenic | I431M BA.5.6,XBB.1.16.6 |
| intergenic | I453T HR.1,XBB.1.16.23,XBB.2.3 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BF.26,BF.10,CK.2,EU.1.1,GK.1,HK.3.2,JG.3,XBB.1.16.11,BA.5.2 |
| intergenic | Q455K FL.25,XBB.1.16 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.1,GJ.1.2,HR.1,XBB.1.16.23,XBB.1.42.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.11 |
| ORF1a | S483F / NSP2 |
| intergenic | S483F XBB.1.16 |
| intergenic | V488V FL.1.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V503I XBB.1.16 |
| intergenic | E504E BQ.1,XBB.1.16 |
| ORF1a | K510E / NSP2 |
| intergenic | K510E XBB.1.16 |
| ORF1a | A516T / NSP2 |
| intergenic | A516V BF.9,GE.1,XBB.1.16 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | A520A BQ.1,XBB.1.16 |
| intergenic | S528L XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A540V BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.13,GK.2.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A540A BA.4,XBB.1.16.11 |
| intergenic | F548S BA.5,XBB.1.16.11,XBB.1.9.2 |
| intergenic | R560C BQ.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L580F BA.4,BA.5.1.24,EG.6.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L580L BA.5.1.24,BA.4.6,FL.15,XCH.1,XBB.1.16.6 |
| ORF1a | S588S / NSP2 |
| intergenic | S588S XBB.1.16 |
| intergenic | N593N JG.3,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | M598I JN.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A599A BA.5.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,FK.1.1,FL.15,XBB.1.16.2,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L628F DV.7.1.2,EG.5.1,HK.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | K634R XBB.1.16 |
| intergenic | L642F BA.4.1,BA.5.5,EG.5.1.6,GK.1,EG.5.1.1,XBB.1.5.70,XBB.1.16 |
| intergenic | R643I EG.7,XBB.1.16.1 |
| intergenic | D644D BA.5.1.10,BA.5.2.34,BE.1.1,BA.5.5,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T654T DV.7.1,DV.7.1.2,GS.4.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A656V BA.1.14,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.13,BA.5.6,HK.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | E673K XCL,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.5.10,HV.1 |
| intergenic | T708I CH.1.1.28,XBB.1.16.23,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | Y717Y BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,FK.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | I740I BA.2.12,BA.5,CK.2,BA.4.6,FU.2,GK.1,GY.5,XBB.1.16.15,XBB.1.5.72 |
| intergenic | P748P BA.5.2.20,BA.5.6,GJ.1.2,XBB.1.16.1,BA.5.2 |
| intergenic | T753I BA.4.1.8,DV.7.1,EG.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V757V BA.5.2.34,BF.26,FY.3.1,JD.1.1,HK.3,XBB.1.16.1,BA.5.2 |
| intergenic | N811N BA.5.2.34,EG.5.1.1,XBB.1.42.1,XBB.1.16.6,BA.5.2 |
| intergenic | T812I XBB.1.16 |
| intergenic | L815L EG.5.1,FL.8,FU.1,BQ.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.11,BA.5.2 |
| intergenic | A819V BQ.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | G835G XBB.1.16 |
| intergenic | Y836Y XBB.1.16 |
| intergenic | V839V BA.5.1.10,EG.5.1,XBB.1.16.23,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | A876T BA.5.2.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | V879V BA.2.12,BA.1.15,EG.7,GK.1.3,BA.1,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | V886V BA.5.1.24,BF.10,HK.11,XBB.1.16.6 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | P926H GY.5,XBB.1.16.2 |
| intergenic | S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6,GK.2.1,GK.3.1,GS.4,GY.5,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.16 |
| intergenic | Y949C HR.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L960L EG.5.1.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P971S BA.5.1.10,BA.4.1,BA.5.2.20,XBB.1.16.15,XBB.1.5.10,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T987T GE.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T1001I BA.2.12,BA.5.1.10,DV.7.1,EU.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | P1054L EG.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V1056L BA.2.86.1,BA.5.2.20,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | G1073E BE.1.1,XBB.1.16 |
| intergenic | A1074T XBB.1.5.37,XBB.1.16 |
| intergenic | H1108Y BF.28,XBB.1.16.8 |
| intergenic | H1113Y BA.2.12,EG.5.2.1,GK.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | V1118V DV.7.1,BF.26,XBB.1.16.6 |
| intergenic | H1141H FY.3.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G1155D EG.5.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P1158L BA.1.14,JD.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | R1170R BE.1.1,GY.5,GV.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | K1202N BE.1.1,HK.6,XBB.1.16.1 |
| intergenic | I1203I BA.5.1.2,BQ.1,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P1207L GE.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V1211F HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | I1215T XBB.1.16 |
| intergenic | H1264H BQ.1.2.3,XBB.1.41.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | A1268A FL.10.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D1273D BA.5,BQ.1.1.8,BA.5.5,FL.10.1,EG.5.1.6,BQ.1,GK.3.1,HY.1,HR.1,XBB.1.16.6,XBB.1.16 |
| intergenic | D1275D FU.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | P1330P BF.10,EG.5.1.3,FL.1.5,JG.3,JF.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.9.1,XBB.1.16 |
| intergenic | V1345V BA.5.2.20,XBB.1.16.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | Y1354Y BA.4.1.8,XBB.1.16 |
| intergenic | V1391V FL.15.1.1,FY.5,XBB.1.16.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | V1393V BE.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | E1413E XBB.1.16.17,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Y1425Y BA.5.5,BA.2.3,HR.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | N1436N BA.5.2.3,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L1438L BA.1.14,BA.5.2.2,BA.5.1.30,BA.4.6,FL.2.3,FL.25,FU.2,FY.5,JG.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D1481D GE.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P1497L XBB.1.16.2,XBB.1.16.1,XBB.2.3 |
| intergenic | S1510F FL.25,GK.2,XBB.1.16.2 |
| ORF1a | N1540S / NSP3 |
| intergenic | N1540S XBB.1.16 |
| intergenic | T1543I BF.9,EG.7,FD.1.1,FU.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D1554D BF.10,FL.15,XBB.1.16.1 |
| intergenic | V1584V FL.25,XBB.2.3.11,XBB.1.16 |
| intergenic | T1589I FL.1.5.2,FD.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.41.1,BA.5.1,XBB.2.3.2,HV.1 |
| intergenic | L1621L BA.5.6,XBB.1.16.6 |
| intergenic | R1628C BF.26,GK.3.1,GK.2,GY.5,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T1638I EU.1.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15 |
| intergenic | Y1646Y FL.10.1,XBB.1.16 |
| intergenic | K1655N BA.5.2.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | V1661V BF.9,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T1665I FD.1.1,XBB.1.16 |
| intergenic | N1673N BA.5.1.10,BA.4,BE.1.1,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,FD.1.1,JF.1,XBB.1.16.11,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T1678T BA.5.2.20,XBB.1.16.8,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L1680L XBB.1.16 |
| intergenic | Y1700Y BA.4.1,BQ.1.1.8,EG.6.1,FD.1.1,FU.2,GJ.1.2,XBB.1.16.11,JA.1 |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10,BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BA.5.6,FY.3.1,GE.1,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,XBB.1.5.72,XCK,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | K1763R BA.2.86.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T1773I XBB.1.16 |
| ORF1a | T1788K / NSP3 |
| intergenic | T1788M BA.4.6,FL.20.2,GS.4,HK.6,XBB.1.16.1,XBB.2.3.2 |
| ORF1a | P1803L / NSP3 |
| intergenic | G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.9.2,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | Y1846C EG.5.1.3,HY.1,XBB.1.16 |
| intergenic | D1849D BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,HN.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.6,HV.1 |
| intergenic | S1857L EG.5.1,EG.5.1.6,GV.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | Y1868Y BA.4,BA.5.1.24,BF.26,EU.1.1,EG.6.1,BQ.1,GK.3.1,HF.1,GJ.1.2,XBB.1.16 |
| intergenic | Y1873Y BA.5.1.10,BF.9,BF.28,EG.5.1.3,HK.6,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11,BA.5.2 |
| intergenic | T1874I HN.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | P1921L FY.3.1,XBB.1.16.17,XBB.1.17.1 |
| intergenic | N1922N BA.5,GE.1,EG.5.1.1,JG.3,XBB.1.16.15,XCH.1 |
| intergenic | F1925F BA.5.2.2,BF.28,BE.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,FL.10.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | F1960F FU.2,HK.7,XBB.1.16.1,XBB.2.3 |
| intergenic | N1995N BA.2.12,BF.28,GA.4.1,BA.5.1,XBB.1.16 |
| intergenic | N1996N XBB.1.16 |
| intergenic | T2007I FL.15.1.1,GK.1,XBB.1.9.1,XBB.1.16 |
| intergenic | T2016K BA.5.2.2,XBB.1.16 |
| intergenic | S2024L BA.5.2.2,FL.8,FL.20,GS.4,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S2030L DV.7.1,GK.1.1,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V2047F EG.7,EG.5.1.6,XBB.1.16.8 |
| intergenic | V2047V BA.5.6,GE.1,BA.5.1,XBB.1.16 |
| intergenic | E2049E XBB.1.16 |
| intergenic | P2079S EG.5.1.9,EG.6.1,GV.1,JG.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T2087I CH.1.1.28,EG.5.2.1,JG.3,JN.3,XBB.1.16.1,XBB.2.3 |
| intergenic | H2092Y BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.2.3,JG.3,XBB.1.16.11,XBB.1.5.72 |
| intergenic | H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.17,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.5.72 |
| intergenic | P2144S JG.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P2144L XBB.1.16 |
| intergenic | N2147N BA.5.1.10,BA.5.2.20,XBB.1.16.11,BA.5.2 |
| intergenic | T2154I BA.4.6,FY.3.1,HK.11,XBB.1.16.11,XBB.1.42.1 |
| ORF1a | T2166T / NSP3 |
| intergenic | L2211L BQ.1.1.8,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.42.1 |
| intergenic | K2219R XBB.1.16 |
| intergenic | C2239C JF.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S2242F BA.5.2.34,BA.5.2.8,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,EG.10.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | I2244I BA.5,BA.4.6,XBB.1.16 |
| intergenic | T2247I BA.5.2.3,FU.2,XBB.1.16 |
| intergenic | N2272N BA.2.12,DV.7.1.2,GY.5,GS.4.1,XBB.1.16 |
| intergenic | T2319T BA.5.1.30,XBB.1.16.1 |
| intergenic | F2338F BQ.1.13,FL.15,XBB.1.16.15 |
| intergenic | H2357Y EG.5.1.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | F2386F FK.1.1,BQ.1,XBB.1.16 |
| intergenic | S2488F GS.4.1,HK.8,HN.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | Y2489Y BA.5.2.20,EG.5.2.1,HR.1,XBB.1.16.17,HK.3 |
| intergenic | S2500F BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.6,FL.20.2,BA.5.1,XBB.2.3,XBB.1.16 |
| intergenic | S2500S GK.2,FL.1.5.1,HR.1,HK.3,XBB.2.3.5,XBB.1.16 |
| intergenic | T2512I JG.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L2518L BA.5.1.30,GJ.1.2.6,GJ.1.2,XBB.1.16.15,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N2523N BA.5.1.2,BA.5.1.30,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N2526N FL.10.1,XBB.1.5.10,XBB.1.16 |
| intergenic | A2529V BF.28,FU.1,XBB.1.16.11,BA.5.2 |
| intergenic | N2539S FL.15,XBB.1.16.6 |
| ORF1a | V2577V / NSP3 |
| intergenic | V2577V XBB.1.16 |
| intergenic | D2579D BQ.1.13,XBB.1.16 |
| intergenic | L2609L BA.5.1.24,BF.10,CK.2,FU.2,HK.6,XBB.1.16.8,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T2615I XBB.1.16 |
| intergenic | S2625S BA.4,BA.5.2.3,BA.4.6,EG.5.1.6,HR.1,XBB.1.16.2,XBB.1.17.1 |
| intergenic | T2648I BA.5.2.2,BF.10,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L2675L BA.5.2.3,BA.5,FU.2,GE.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N2678N BA.5.2.8,BA.5.2.20,GE.1,GS.4.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.37 |
| intergenic | N2682N JG.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | D2687D BA.5.5,XBB.1.16.15,BA.5.1 |
| intergenic | F2718F XBB.1.16 |
| intergenic | L2778F DV.7.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | I2806I BA.5.1.24,FY.3.1,HF.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.11,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G2814G BE.1.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | A2821A XBB.1.16 |
| intergenic | N2829N BQ.1.1.8,XBB.1.16.1,XBB.2.3 |
| intergenic | D2835N EG.5.2.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T2846I XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.11,XBB.1.16 |
| intergenic | C2851C EG.7,FU.2,FL.20,HK.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | I2854T JG.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | A2855A XBB.1.16 |
| intergenic | V2865V BF.28,XBB.1.16.11,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T2872T EG.5.1.3,GK.2.1,GW.5,XBB.1.16 |
| intergenic | N2894N BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.2.20,EG.5.1.9,JF.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.11 |
| intergenic | C2913C XBB.1.16 |
| intergenic | T2936T BE.1.1,XBB.1.16.11,JA.1,BA.5.2 |
| intergenic | R2949R BA.4.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | A3040A XBB.1.16 |
| intergenic | A3049V GY.5,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | C3059C EG.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | R3066K JG.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | T3090S BA.4.6,XBB.1.16.6 |
| intergenic | S3099S HY.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3,XBB.1.16.11,XCH.1,HV.1 |
| intergenic | R3163K BF.10,BA.5.5,GJ.1.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T3174N XBB.1.16 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5,EG.6.1,FL.15.1.1,HK.6,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.8,XBB.1.5.15 |
| intergenic | K3192R FU.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | A3209V BA.5.1.10,BA.5.2.34,EG.5.1.3,BA.5.1,XBB.1.16 |
| intergenic | L3234L BA.1.17,BF.10,FL.2.3,FU.2,HF.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | S3244L BQ.1.2.3,XBB.1.16 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | I3257I FD.1.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16 |
| intergenic | T3258T BA.5.2.8,EG.5.1.8,GE.1,HK.3.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | F3271F BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,EG.6.1,FY.4.1.1,HK.11,XBB.1.16.8,XCH.1 |
| intergenic | N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2,BF.9,BE.1.1,EG.5.1,FL.20,GK.3.1,GK.1.1,XBB.1.16.15,BA.5.1,XCH.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | G3334S XBB.1.16 |
| intergenic | L3338L BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BQ.1,GS.3,XBB.1.16.1,HV.1 |
| intergenic | K3351R BA.5.1.2,XBB.1.16.2 |
| intergenic | L3352F GA.4.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3,JN.3,XBB.1.16.23,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCH,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,BA.5.2 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.15,HK.3,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V3388V BA.5.1.24,XBB.1.16.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | N3414N BF.28,BE.1.1,BA.5.6,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XBB.1.16 |
| intergenic | G3437G BA.4,BA.5,XBB.1.16.17 |
| intergenic | D3439D BA.5.2.34,BA.5.1.1,DV.7.1,EG.5.1.3,FL.1.5,GE.1,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A3456V EG.5.2.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | Y3472Y GE.1,XBB.2.3.2,XBB.1.16 |
| intergenic | T3487T GJ.1.2.6,XBB.1.16 |
| ORF1a | A3497A / NSP5 |
| intergenic | D3508D FL.1.5,FL.8,FL.15,BQ.1,JF.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,BA.5.2 |
| ORF1a | H3509H / NSP5 |
| intergenic | G3521G XBB.1.16 |
| intergenic | A3523V EG.6.1,JD.1.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.9.2,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A3523A EG.5.1.4,FD.1.1,FL.20.2,FL.20,GY.5,EG.5.1.1,HK.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | K3532K HF.1,JF.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.4.6,EG.5.1.6,HF.1,HK.3.2,XBB.1.16.15,JA.1 |
| ORF1a | V3572A / NSP6 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1,BQ.1,GW.5,GK.2,GE.1,HF.1,GS.4.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XCL,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | V3595V BQ.1.1.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | A3620V BA.1.14,BF.26,EG.6.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L3641L EG.5.1.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L3644F BF.9,BQ.1.13,BA.5.5,XBB.1.16.1 |
| ORF1a | M3655I / NSP6 |
| intergenic | M3655I XBB.1.16 |
| intergenic | I3663V BA.4.6,XBB.1.16.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | 3676del BF.26,XBB.1.16.2 |
| intergenic | F3677del BF.26,XBB.1.16.2 |
| intergenic | S3675del BF.26,XBB.1.16.2 |
| intergenic | M3684V BA.5.1.24,XBB.1.16 |
| intergenic | V3690V BA.4.1.8,XBB.1.16.17 |
| intergenic | V3708V BA.5.1.1,FL.10.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D3728D BA.4.1.8,BQ.1.1.8,BQ.1.2.3,BA.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.23,HK.3 |
| intergenic | A3730A BA.2.12,EG.6.1,GA.4.1,BA.2.3,BQ.1,JD.1.1.1,FL.1.5.1,JG.3,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.1.16 |
| intergenic | I3738I BA.5.2.8,BA.5.1.30,XBB.1.16.1 |
| intergenic | S3742S BA.5.2.34,EG.5.1.6,XBB.1.16.11 |
| intergenic | M3752I EG.5.1.8,GK.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | I3758V BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,FL.15,BA.1,XBB.1.16 |
| intergenic | Y3765C BA.5.1.24,BQ.1.2.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | F3769F BA.5.1.30,BF.26,FD.1.1,BA.5.6,BQ.1,GK.3.1,GW.5,GJ.1.2,EG.5.1.1,XBB.1.16.1,XBB.2.3,XBB.1.16 |
| ORF1a | Q3818Q / NSP6 |
| intergenic | L3829F GY.5,XBB.1.16.2,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XBB.2.3,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | K3839K BA.4.1,BA.5.2.20,BA.5.5,GE.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G3848G XBB.1.16 |
| intergenic | I3853I BA.5.1.10,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BE.1.1,HN.1,JG.3,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1,HF.1,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.1.16 |
| intergenic | L3899L BA.5.1.30,GE.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.15 |
| intergenic | N3928N BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N3937N BA.5,EG.5.2.1,EG.5.1,BA.5.6,XBB.1.16.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T3940I GE.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | S3950S BA.1.14,XBB.1.16.8,BA.5.1,XCL,XBB.1.5.10 |
| intergenic | P3952S BA.5.6,GK.1.3,HK.11,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A3987V FL.2.3,XBB.1.16.2 |
| intergenic | D3992D HY.1,JG.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T4010T GJ.1.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | E4019E FL.1.5,XBB.1.16.15,XBB.1.9.1 |
| ORF1a | Q4030Q / NSP8 |
| intergenic | Q4030Q XBB.1.16 |
| intergenic | A4044A JF.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N4046N XBB.1.16.6,XBB.1.16 |
| intergenic | P4058P BA.4.1,BA.5.1.30,EG.5.1,HF.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BA.4.6,EG.5.1.3,BA.5.6,FU.1,GW.5,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G4086S JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T4087I BA.1.14,BA.2.3,XBB.1.16 |
| intergenic | T4090I GK.1.3,HR.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16 |
| intergenic | V4137I XBB.1.16 |
| intergenic | L4149L BA.5,XBB.1.16.1,XCH.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A4155A FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.16.6,XBB.1.16 |
| ORF1a | D4165N / NSP9 |
| intergenic | D4165N BA.5.2.34,GS.4.1,XBB.1.16 |
| intergenic | G4178V BA.5.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15 |
| ORF1a | A4194S / NSP9 |
| intergenic | A4194S XBB.1.16 |
| ORF1a | P4197L / NSP9 |
| intergenic | P4197L BQ.1.2.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | T4249I BQ.1.13,BA.5.5,FL.15,FY.5,XBB.1.16.15,XBB.1.17.1,XBB.2.3 |
| intergenic | D4275D XBB.1.16 |
| intergenic | S4286N XBB.1.16 |
| intergenic | T4304I XBB.1.16 |
| intergenic | I4308M XBB.1.16 |
| intergenic | Y4329Y FK.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | V4372I BA.5.1.1,JD.1,XBB.1.42.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L4386F BA.5.1.30,XBB.1.16.2 |
| intergenic | R4387R BA.4,BA.5.1.30,BF.28,FL.15,GK.1.3,GE.1,XBB.1.5.10,XBB.1.16 |
| intergenic | S4398L BA.1.17,BA.5.1.30,BF.26,FL.2.3,EU.1.1,XBB.1.16.8,XBB.1.5.15,XBB.2.3 |
| intergenic | T4418I XBB.1.16.8,XBB.1.5.10,XBB.1.16.6 |
| intergenic | Y4424Y FL.1.5,FL.14,FL.15.1.1,GE.1,XBB.1.16.17,XBB.2.3,XBB.1.16 |
| intergenic | D4428D XBB.1.16.8,XBB.2.3.11,XBB.1.16 |
| intergenic | H4467H BA.5.1.10,BQ.1.1.8,GE.1,EG.5.1.1,JJ.1,XBB.1.16.17,BA.5.2 |
| intergenic | T4477I BA.5.1.10,GJ.1,XBB.1.16.15,XBB.1.5.37 |
| ORF1b | T4477T / NSP12 |
| intergenic | T4477T XBB.1.16 |
| intergenic | A4489V GS.4.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D4499D GE.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L4597L XBB.1.16 |
| intergenic | N4605N FL.10.1,FD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T4618M XBB.1.16 |
| intergenic | T4618T FL.1.5,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | P4619L BF.9,GK.3.1,GZ.1,GS.4.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16 |
| intergenic | T4638T BA.5,BA.5.2.8,EG.7,XBB.1.16.11,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T4640I GE.1,XBB.1.16.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T4640T BA.5.1.1,GS.4,GK.2,HK.6,XBB.1.16.8,XBB.1.16.6,XBB.1.16 |
| intergenic | R4641K EG.5.1.4,XBB.1.16.11,XBB.1.5.72,XBB.1.16 |
| intergenic | I4658I XBB.1.16 |
| intergenic | D4666D JD.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T4668T BA.1.15,GS.3,GS.4,GS.4.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T4685I FL.20,XBB.1.16.23,XBB.1.16.1 |
| intergenic | D4696D BQ.1.2.3,HK.8,XBB.1.16 |
| intergenic | C4698C DV.7.1.2,XBB.1.16.17 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | V4733V EG.7,XBB.1.16.1,BA.5.2 |
| intergenic | N4748N GK.2,GE.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | V4765V EG.5.1.6,XBB.1.16 |
| intergenic | L4779L BA.4,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FY.3.1,GK.1.1,GE.1,XBB.1.16.17,JF.1,BA.5.1 |
| intergenic | N4808N FL.15,EG.5.1.1,XBB.1.16 |
| intergenic | F4820F BA.5.1.10,BA.4.1,BF.26,BQ.1.2.3,EG.5.1,BA.2.3,GV.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | V4864V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.16.6,XBB.1.16 |
| intergenic | N4881N FU.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | I4886I BA.4.6,GK.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V4887V BA.5.1.24,BA.5.6,FL.1.5.1,XBB.1.16.11,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20,BA.1.15,BA.5.5,BA.5.6,FL.20.2,FU.2,BA.1,XBB.1.16.1,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | N5105N GK.1.1,HY.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D5130D BA.5.1.24,BA.5.1.2,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D5132D BA.5.6,XBB.1.16.23 |
| intergenic | R5142H XBB.1.16 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | D5152D BA.5.1.24,DV.7.1,CH.1.1.28,BF.26,EG.5.1.3,BQ.1,HN.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.15,HV.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | D5196D EG.5.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T5198A GS.4.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T5198I HK.7,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | Y5223H HF.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | L5230L BA.4,EG.5.1.4,XBB.1.16 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.2,BF.26,EG.5.1.8,EG.5.1,FL.8,FL.20,GE.1,JD.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L5283L BA.4,BA.4.1,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.25,GY.5,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37 |
| intergenic | H5290H GY.5,XBB.1.16.8 |
| intergenic | R5306K XBB.1.16 |
| intergenic | C5343C EG.5.1.1,XBB.1.16.23,BA.5.1 |
| intergenic | F5348F BF.10,BQ.1,GE.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.2,BA.5.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | C5353C BA.5.1.30,FK.1.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,BA.5.2 |
| intergenic | D5356D XBB.1.16 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | V5366V EG.5.2.1,FL.15,FU.1,XBB.1.16.8,BA.5.2 |
| intergenic | P5371L BA.5.1.10,BA.5.2.8,HY.1,XBB.1.16.15,BA.5.1 |
| intergenic | P5371P BA.1.17,EG.5.2.1,EG.5.1,EG.5.1.6,FL.15,XBB.1.16.17,XBB.1.9.2 |
| intergenic | S5398L GY.5,XBB.1.16.15,JF.1 |
| intergenic | H5399H BF.10,HK.6,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | P5402S BA.4.6,XBB.1.16.1 |
| intergenic | Y5444Y BA.5.1.10,GS.3,BA.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | N5448N GS.4.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T5449T FY.5,XBB.1.9.1,XBB.1.16 |
| intergenic | H5488Y BF.26,EG.5.1,BA.5.6,GZ.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| ORF1b | E5492E / NSP13 |
| intergenic | Y5535Y BF.10,XBB.1.16.6 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.8,HK.3,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | P5562P XBB.1.16 |
| intergenic | N5581N HN.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | S5583S XBB.1.16 |
| intergenic | S5625S JD.1.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | C5633C BA.4.1.8,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V5680V BA.4.1.8,BF.28,FL.1.5,EG.7,FU.1,GK.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.5.15,XBB.1.16 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3,BA.5.1.30,BF.26,BF.10,JG.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | D5698D GJ.1.2,XBB.1.16.8 |
| intergenic | V5711V BA.5.2.20,XBB.1.16.15 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | Y5722Y JD.1.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | G5724G JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T5737I BA.5.1.24,DV.7.1.2,BA.4.6,XBB.1.16.2,XBB.1.5.70 |
| intergenic | P5769P XBB.1.16 |
| intergenic | I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5.2.8,BF.26,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,BA.5.1 |
| intergenic | V5808V XBB.1.16 |
| intergenic | F5823F BA.4,EU.1.1,FL.25,XBB.1.16.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P5828S BA.5.2.34,BA.5.1.2,XBB.1.16.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | T5912I BA.5.1.10,DV.7.1.2,BF.10,BA.4.6,FU.2,XBB.1.16.11,BA.5.2 |
| intergenic | T5923I EG.7,EU.1.1,XBB.1.16.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L5932L BA.5.2.34,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.2.3,GJ.1,GK.1.1,HF.1,HN.1,XBB.1.16 |
| intergenic | G5942G FL.1.5.1,XBB.1.5.70,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L5943L EG.5.1.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | Q5947Q BA.1.14,XBB.1.16.6 |
| intergenic | F5958L XBB.1.16 |
| intergenic | I5967V EG.5.1.4,FL.14,FD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.9.2 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | P5971S BQ.1.13,EG.10.1,XBB.1.16.17,HK.3 |
| intergenic | E6002D GS.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | V6016V BA.5.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T6022I BA.4.6,HN.1,XBB.1.16 |
| intergenic | T6038I BF.9,FL.15,GE.1,XBB.1.9.1,XBB.1.16 |
| intergenic | A6044V BA.5,BA.4.6,GY.5,GV.1,JG.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.5.10 |
| intergenic | V6061V XBB.1.16 |
| intergenic | R6088C FL.1.5,BQ.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D6104D BA.2.12,BF.26,EG.6.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P6128L BA.2.12,HK.6,EG.5.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.9.2,XBB.1.9.1 |
| intergenic | P6128P EG.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T6131T BA.2.12,DV.7.1,EG.5.1.8,FK.1.1,FL.20.2,BQ.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | C6141C BA.5.2.20,GY.5,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | D6147Y FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.16.6,XBB.1.16 |
| intergenic | P6164P BQ.1.13,XBB.1.16.11 |
| intergenic | S6180I FL.2.3,FD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A6192V JG.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L6205L BA.5.1.10,BF.10,BQ.1,XBB.1.41.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | H6208H BA.5.5,FL.10.1,FL.25,XBB.1.16.6,XBB.2.3,XBB.1.16 |
| intergenic | L6228M XBB.1.16 |
| intergenic | M6240V BQ.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | D6249D BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,XBB.1.16.15 |
| intergenic | F6251F BF.28,HF.1,XBB.1.16.2,XBB.1.17.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D6300D BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.5.1.9,XBB.1.16.8 |
| intergenic | K6301K XBB.1.16 |
| intergenic | F6302F BQ.1.13,EG.5.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.10 |
| intergenic | D6304Y XBB.1.16 |
| intergenic | C6307C BA.5.2.34,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | N6335N BA.5,EU.1.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| ORF1b | L6367L / NSP14 |
| intergenic | L6367L XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| ORF1b | D6374Y / NSP14 |
| intergenic | D6374Y XBB.1.16 |
| intergenic | G6406S FD.1.1,FL.15.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | Y6436Y BA.5.5,GS.4.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | D6440D BF.10,GK.2,HR.1,XBB.1.16.1,XBB.2.3.5,HV.1 |
| intergenic | L6444L BA.5.2.20,XBB.1.16.1 |
| intergenic | F6459L GS.3,XBB.1.16.23 |
| intergenic | H6466H FU.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | V6474L GK.2,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | T6566M BA.5.2.20,EG.5.1,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T6566T BA.5.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.6,XCK |
| intergenic | A6569V FL.2.3,XBB.1.16.2 |
| intergenic | V6573V BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,FU.1,GK.2,GS.4.1,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | G6598D HK.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G6598S BA.5,BA.5.6,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L6614F BA.5.2.8,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,XBB.1.5.70,XBB.1.42.1 |
| intergenic | Y6645Y BA.5.2.2,GK.3.2,GY.5,HF.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | R6658S BA.5.2.34,JD.1.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L6666L EG.5.1.3,GK.1,XBB.1.16.1,XBB.1.16 |
| intergenic | Y6682Y GW.5,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16 |
| intergenic | R6709C FL.14,XBB.1.16.17 |
| intergenic | P6714S GW.5,GJ.1.2,XBB.1.16.8,HK.3 |
| ORF1b | G6738G / NSP15 |
| intergenic | G6738G XBB.1.16 |
| intergenic | V6743L XBB.1.16 |
| ORF1b | D6753D / NSP15 |
| intergenic | V6770V XBB.1.16 |
| intergenic | T6777I BA.5,GE.1,HK.3.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A6802A BA.5.5,GE.1,XBB.1.16.17,HK.3 |
| intergenic | P6805P XBB.1.16 |
| intergenic | L6819L BA.5.2.2,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BE.1.1,XBB.1.16.8,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T6889T XBB.1.16.11,XBB.1.16 |
| intergenic | S6903S XBB.1.16 |
| intergenic | T6938I BA.2.12,BA.5,BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.5.6,XBB.1.16.1,BA.5.2 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HN.1,FY.5,FL.1.5.1,JJ.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | P7034P GK.1,XBB.1.16.15,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.2.3 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | V6F XBB.1.16 |
| intergenic | N17K XBB.1.16 |
| intergenic | T19I BA.5.2.2,BA.5.1.2,EG.5.1.3,EG.5.1,FD.1.1,GV.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T19L BA.5.2.2,BA.5.1.2,EG.5.1.3,EG.5.1,FD.1.1,GV.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.2,XCH.1,XBB.2.3.11,XBB.1.16 |
| intergenic | P25_A27del GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.2,XCH.1 |
| intergenic | Y28Y BQ.1,GS.4,XBB.1.16.8,BA.5.2 |
| intergenic | F32L GK.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | S45S FL.10.1,GK.2.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1 |
| intergenic | L54L DV.7.1,GY.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A67A XBB.1.16 |
| intergenic | G75A EG.10.1,EG.5.2.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G75V BA.2.12,BA.4,BA.5.2.20,FU.2,HF.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3,XBB.1.16 |
| intergenic | D80D BA.5.1.1,FL.25,GK.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | T108T EU.1.1,XBB.1.5.37,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6,GJ.1.2,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,JF.1,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | G142_Y145delinsDD GK.3.1,HK.1,HR.1,XBB.1.16.23,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HY.1,JD.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,HV.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| S | HK146QN XBB.2.3.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,XBB.1.16.17,JF.1,JA.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.2.3.5,XCH.1,XCK |
| S | HK146QN XBB.2.3.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | N148T FL.15,FU.2,HK.7,JD.1.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.17.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.11,HV.1 |
| intergenic | W152R BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1,XBB.1.16 |
| intergenic | E156Q GK.1.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | R158S XBB.1.16 |
| S | R158S XBB.1.16 |
| intergenic | L176F BA.5.1.30,EG.5.1.9,FY.5,JG.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D178N BA.5.1.2,FD.1.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | E180V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.16.6,XBB.1.16 |
| intergenic | KQ182QE FY.5,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Q183E FU.2,FY.5,EG.5.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | KQ182NE GJ.1,GJ.1.2.6,GJ.1.2,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | N185D DV.7.1,DV.7.1.2,BQ.1,GK.1,GS.4.1,XBB.1.5.15,XBB.1.16 |
| intergenic | F186S FL.15,XBB.1.16.17 |
| intergenic | F186L GK.1,GZ.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D198G GZ.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | K206K FY.3.1,XBB.1.16 |
| intergenic | I210T FY.3.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | D215H BA.5.1.1,GA.4.1,GV.1,XBB.1.16.17,XBB.1.17.1 |
| intergenic | S221S BA.2.12,FK.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | S255F BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,EG.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.11,XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | S256L BA.5.1.2,BQ.1,GK.1.1,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.2.3,XBB.1.16 |
| intergenic | G257S DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | G257V BF.41,HK.1,XBB.1.16 |
| intergenic | L276L BA.5.1.30,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.2.3 |
| intergenic | D290D XBB.2.3.11,XBB.1.16 |
| intergenic | F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,HK.3,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2,HV.1 |
| intergenic | T323I JD.1,XBB.1.16.8,XBB.1.9.1,XBB.2.3 |
| intergenic | C336C EG.5.1.3,GV.1,JG.1,JG.3,XBB.1.9.2,XBB.1.16 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | A352S XBB.1.16.1,XBB.1.16 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XCL,XCH,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | S359S BA.5.1.10,XBB.1.16.11 |
| S | S359S BA.5.1.10,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | Y369Y BQ.1.2.3,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | R403K BA.2.86.1,BA.5,DV.7.1,EG.10.1,EG.7,FY.3.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.41.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | L455F XBB.1.16 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | A475A XBB.1.9.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,FL.1.5.1,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.42.1,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.1.16 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | F490P EG.5.1,FL.1.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | F490S EG.5.1,XBB.1.16 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | L518L EG.5.1.3,HY.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.15,XBB.1.17.1,JA.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | F541F EG.7,BA.5.6,GE.1,XBB.2.3.11,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | T547I BA.5.2.3,BA.5,BF.28,FL.2.3,FU.1,FU.2,XBB.1.16.1,XBB.1.16 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1,FL.25,FU.2,GJ.1,GK.1,GW.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | E554Q BF.26,JD.1.2,XBB.1.16.17 |
| intergenic | E554A XBB.1.16 |
| intergenic | N556K XBB.1.16.17,XBB.1.5.70,XBB.1.16 |
| intergenic | T572I FD.1.1,GK.3.2,FY.5,XBB.1.16.11,XBB.2.3 |
| intergenic | R577R XBB.1.16 |
| intergenic | E583D GK.1.1,GE.1,JD.1.1.2,JD.1.1,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | P589P XBB.1.16 |
| S | P589P XBB.1.16 |
| intergenic | D614G HY.1,XBB.1.16.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | QD613HG FK.1.1,HY.1,XBB.1.16.1,XBB.1.42.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | P621S BA.2.86.1,GY.5,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A647S BA.5.1.24,BF.26,XBB.1.16.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | N658N XBB.1.16 |
| intergenic | Q675H BA.5.1.24,BE.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Q675Q BA.5.2.34,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N679K FL.10.1,JD.1.1,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | TN678IK FL.10.1,JD.1.1,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | NSP679KSH BA.5.2.20,GV.1,HK.3.2,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.5.37,XBB.2.3 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | R683R EG.7,XBB.1.16.6,XBB.2.3 |
| intergenic | A684V BA.5,FY.3.1,XBB.1.16.17,XBB.1.17.1 |
| intergenic | A688V BA.5.2.34,BA.5,BA.5.1.30,JG.3,XBB.1.16.2,JF.1,JA.1,BA.5.2 |
| intergenic | S689I GJ.1.2,XBB.1.16.8 |
| intergenic | I692I BA.5.1.10,BA.4.6,FL.14,EG.6.1,FU.2,GK.1.3,HK.7,GJ.1.2,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | A701V BA.1.17,BA.4.1,BA.5.5,EG.10.1,FL.1.5,FL.1.5.2,GJ.1.2,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17,XBB.1.9.1,XCK |
| intergenic | T732I BA.2.12,EG.5.1,JG.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.8,XBB.2.3 |
| intergenic | T732T BA.4.1,DV.7.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | Y789Y BQ.1.2.3,HK.11,GV.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D808D JF.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L821L BA.5.5,FL.1.5,EG.5.1,BA.2.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | C840C EG.5.1.3,JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | G842G XBB.1.16 |
| intergenic | T883I BF.26,BA.5.5,BQ.1,XBB.1.9.1,XBB.1.16 |
| intergenic | S929T XBB.1.41.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70 |
| intergenic | G932G BA.5.5,BQ.1.2.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D936D BA.5.1.2,GK.1.3,GK.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.6 |
| intergenic | V952V BA.5.2.20,XBB.1.16.11,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | T961M DV.7.1.2,BA.2.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | L1063L BF.10,XBB.1.16.23 |
| intergenic | A1070T BA.2.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | H1083H XBB.1.16 |
| intergenic | H1101H EG.10.1,EG.7,GK.1,GW.5,XBB.1.17.1,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.2.3,XBB.1.16 |
| intergenic | Y1110Y FD.1.1,GS.4,XBB.1.16.1,XBB.2.3 |
| intergenic | I1114I FL.15,FY.5,XBB.1.16.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G1124V BF.9,GK.1.1,HK.3.3,XBB.1.16.8 |
| intergenic | I1132I XBB.1.16 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | F1148F EG.5.1.3,EG.7,FL.15,HF.1.1,HF.1,XBB.1.16.23,XCL,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P1162S BA.5.2.3,BA.5,CH.1.1.28,JD.1.2,JG.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P1162L BQ.1.1.8,HF.1,XBB.1.16 |
| intergenic | N1178N BQ.1.1.8,GK.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2,XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | V1189I XBB.1.16 |
| intergenic | E1202Q BA.4.1.8,BA.5.2.3,BF.28,XBB.1.5.10,XBB.1.16.6 |
| intergenic | K1211K XBB.1.16 |
| intergenic | Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BF.28,FL.1.5,GK.3.1,GV.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.1,XBB.2.3 |
| intergenic | G1219C BA.5.2.2,FL.10.1,XBB.1.16.15,HK.3,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A1222T FK.1.1,XBB.1.16.1 |
| S | G1251R BA.5.1.10,XBB.1.16.1 |
| intergenic | S1252P BA.5.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | 9 FK.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3 |
| intergenic | F8F FK.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | V13L GY.5,EG.5.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.6,XBB.2.3 |
| intergenic | I20I BA.1.17,BA.5.1.24,BF.26,FD.1.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16 |
| intergenic | K21N BA.5.1.10,BA.5.1.1,DV.7.1.2,BA.4.6,FL.15,EG.5.1.1,HK.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | D27Y BA.4.1.8,BA.5,BQ.1.2.3,XBB.1.16.15,XBB.1.9.1 |
| intergenic | D27D GK.1.1,XBB.1.16 |
| intergenic | I35T BA.4.6,FL.15,XBB.1.16.8 |
| intergenic | I37T EG.5.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | Q38Q BA.5.2.3,XBB.1.16.23 |
| intergenic | F43F BA.2.12,BA.5.2.20,FD.1.1,HY.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L46F BA.5.2.34,XBB.1.16 |
| intergenic | G49V FL.1.5,BA.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A54V EG.5.1.9,GK.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | Q57H BF.9,BF.10,EG.5.1.4,FU.1,XBB.1.16 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1,EG.5.1.6,GK.2,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,XBB.1.16.2,HK.3,XBB.1.9.1 |
| intergenic | I62I BQ.1.2.3,FK.1.1,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | I63T FK.1.1,GK.3.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T64T FK.1.1,GK.3.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | R68R EG.7,XBB.1.16.6 |
| intergenic | S74S EG.10.1,EG.6.1,EG.5.1.6,GJ.1.2,JG.3,XBB.1.16.15,BA.5.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | H78Y BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.20,BF.28,EG.5.1,GK.2.1,FY.5,XBB.1.16.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | H78H BA.5.1.24,FY.5,XBB.1.16 |
| intergenic | H78Q XBB.1.16 |
| ORF3a | H78Q XBB.1.16 |
| intergenic | N82N XBB.1.16.8,XBB.1.16 |
| intergenic | V90L BA.4.6,XBB.1.16.6 |
| intergenic | H93Y XBB.1.5.70,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A99V BA.4.6,FL.1.5.1,JN.2,XBB.1.16.2,XBB.1.5.15 |
| intergenic | G100C BA.5.1.24,GK.2,XBB.1.16.1 |
| intergenic | A103V XBB.1.16.15,XBB.1.16.23 |
| intergenic | P104S BA.5.1.30,FL.15,EG.5.1.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | P104L BA.5.2.3,FD.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | Y107H EG.5.1.4,XBB.1.16.2,XBB.1.16.1 |
| intergenic | Y109C EG.5.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | V112F EG.5.1.6,XBB.1.16.8,BA.5.1 |
| ORF3a | V112F BA.5.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | Y154Y BA.5.5,FL.10.1,FU.2,HK.3.2,GJ.1.2,HK.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D155H JN.2,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T175I BA.5.1.30,BF.26,EG.5.2.1,GJ.1.2.6,GS.4,GK.1.1,XBB.1.16.11,BA.5.2 |
| intergenic | S180P BA.5.2.8,XBB.1.16.1 |
| intergenic | F207F BA.5.1.2,BA.5.2.20,BA.2.3,GJ.1.2,HY.1,XBB.1.16.15,XCH |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | D238A XBB.1.16 |
| ORF3a | D238A XBB.1.16 |
| intergenic | H247Y BA.5.1.10,XBB.1.16.23,XBB.2.3 |
| intergenic | S253S BA.2.12,BE.1.1,GS.4,GK.2,JG.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1 |
| intergenic | M260K BA.4.1.8,EG.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T269T BF.26,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,HK.3,XBB.1.17.1 |
| intergenic | g.G-18T BA.5.2.2,BF.10,HK.6,XBB.1.16 |
| intergenic | g.C-17T FL.20,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1 |
| intergenic | S6S EG.6.1,FL.15,HK.6,XBB.1.16.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | S55F BA.5.1.2,EG.5.1,BA.2.3,XBB.1.16.17 |
| intergenic | V58V XBB.1.16 |
| E | V58V XBB.1.16 |
| intergenic | V62F BA.5.2.20,CK.2,EG.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.9.1 |
| intergenic | S68S XBB.1.16 |
| intergenic | P71L FL.1.5,EG.5.1.4,EU.1.1,FY.3.1,XBB.1.16 |
| intergenic | g.T-26C BF.9,EU.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | A2S XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16 |
| intergenic | L17F BF.26,FL.1.5,XBB.1.16.17,JF.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | T30I XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N41N BF.9,BA.5.5,FL.10.1,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.1.16 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6,GZ.1,GE.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XBB.1.16 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | T77T BA.4.6,EG.5.1,FL.15,FL.20,GK.2,XBB.1.16.1,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XBB.1.16 |
| intergenic | G78S EG.5.1.3,XBB.1.5.37,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3,GK.3.2,GK.1.1,GE.1,HF.1,HY.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.15,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | R101R XBB.1.16 |
| M | R101R XBB.1.16 |
| intergenic | L102L BA.5,EG.5.1,XBB.1.16.2,XBB.1.17.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | S108S DV.7.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | N117N BQ.1.13,BA.5.5,EG.5.1.3,BA.5.6,FL.15,EG.5.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | N121N BA.5.1.10,XBB.1.16.15,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,HV.1 |
| intergenic | L124L BA.2.12,BA.4,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.20,GK.1,HY.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.15 |
| intergenic | H125Y BA.5,BA.5.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3,EG.5.1,GJ.1.2,JD.1.1,XBB.1.17.1,XBB.2.3.5,XBB.1.16.6,BA.5.2 |
| intergenic | P132P BA.5.2.8,EG.5.1.6,XBB.1.16.15 |
| intergenic | L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20,CK.2,XBB.1.16.15,BA.5.2 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.70,XCL,XBB.2.3.11,XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | N207S XBB.1.16 |
| intergenic | N207N BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1.3,EG.7,FL.15,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | D209N XBB.1.16 |
| intergenic | L4L BA.5.2.3,EG.7,BA.5.6,JG.3,HK.3,XBB.1.16.11,XCH |
| intergenic | Q8X XBB.1.16 |
| intergenic | T10I HN.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | L16L BA.5.1.1,BA.5.1.2,FK.1.1,FD.1.1,GK.1.1,FY.5,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EU.1.1,GE.1,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3 |
| intergenic | I3T EG.5.1.1,XBB.1.16.8,HK.3 |
| intergenic | L5F BA.5.1.30,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T14I BA.5.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T28I BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1,GE.1,EG.5.1.1,JG.3,XBB.1.5.37,XBB.1.16 |
| intergenic | P34S GK.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | G38E BE.1.1,FL.15,XBB.1.16 |
| intergenic | T39I BA.5.1.1,EU.1.1,FY.3.1,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9,BA.5.2.20,BQ.1.13,CK.2,EG.6.1,GK.2,XBB.1.16.15,XBB.1.16.11,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | N52N BF.26,EG.5.1.3,HF.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.6,HV.1 |
| intergenic | T61I FL.2.3,XBB.1.16.6 |
| ORF7a | Y75_L77delinsX XBB.1.9.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | A79A GS.4,HF.1,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.9.1 |
| intergenic | F87F EG.5.1.4,JD.1.2,XBB.1.16.1 |
| intergenic | V93F BA.5.1.30,BE.1.1,XBB.1.16 |
| intergenic | V93L XBB.1.16 |
| intergenic | P99S BA.5.2.8,HK.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T120I BQ.1.1.8,BF.28,DV.7.1.2,GY.5,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | L25F GK.2.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2 |
| intergenic | E39Q XBB.1.16.23,XBB.1.16.1 |
| intergenic | A43V BF.41,GK.1.1,HK.1,HY.1,FL.1.5.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.16.6 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | GI8X GK.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | V13I JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | A15V XBB.1.16.8,XBB.1.16.6 |
| intergenic | Q18X BA.5,FL.2.3,GJ.1.2,JG.3,XBB.1.16.1,HV.1 |
| intergenic | C25S BA.5.2.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | D34D GA.4.1,GE.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1 |
| intergenic | P38P BA.5.2.34,DV.7.1,XBB.1.16 |
| intergenic | R52I FY.3.1,GK.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | V62V BA.5.2.20,BE.1.1,EG.5.1.4,EU.1.1,FL.20,BQ.1,GW.5,EG.5.1.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.1.16 |
| intergenic | G66fs XBB.1.16 |
| intergenic | G66_K68delinsE BA.2.12,BA.4,FY.3.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.72,BA.5.2 |
| intergenic | S67F BA.5.1.10,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.5,EG.5.1,FL.10.1,FL.15,HK.6,XBB.1.16.8 |
| intergenic | S67S HF.1.1,XBB.1.16.23 |
| intergenic | S69P BA.5.1.2,DV.7.1.2,BQ.1,XBB.1.16.11,HV.1 |
| intergenic | S69L XBB.1.16 |
| intergenic | I74T XBB.1.16 |
| intergenic | K94I XBB.1.16 |
| ORF8 | K94I XBB.1.16 |
| intergenic | C102F EG.7,GK.2,XBB.1.16.15,XBB.1.5.37,BA.5.2 |
| intergenic | V114I XBB.1.16 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1,BA.2.3,GK.2.1,GK.1,HK.3.2,FY.5,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JN.2,XBB.1.16.8,XBB.1.5.37 |
| intergenic | I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9,FL.15,FU.2,GK.1,GK.3.1,JD.1.1.1,HR.1,XBB.1.16.17,BA.5.1,XBB.1.42.1,HV.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | P6L HF.1.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | P6P EG.6.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1 |
| intergenic | N8N XBB.1.16 |
| intergenic | N8S XBB.1.17.1,XBB.1.16 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | N27I XBB.1.16 |
| N | N27I XBB.1.16 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | E31_S33del JF.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G34G GK.2.1,FL.1.5.1,XBB.1.16 |
| intergenic | A35A BA.1.15,FL.2.3,JF.1,XBB.1.16.8,XBB.1.5.70,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P46S FL.8,FY.4.1.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.16 |
| intergenic | F66F BA.5.2.20,GS.3,GK.2,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | P73P FL.1.5,XBB.1.16.1 |
| intergenic | Y86Y BA.2.12,BA.5.2.3,BA.5.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,BA.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T115T BQ.1.1.8,GE.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,GY.5,GE.1,GJ.1.2,JD.1.2,JF.1,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.1.16 |
| intergenic | P162L GK.1.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T166I DV.7.1,FL.15,GK.2,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P168S GK.2,JN.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | Y172Y BA.5.2.3,XBB.1.16.23 |
| intergenic | G178D EU.1.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | S184S XBB.1.16 |
| intergenic | N192N BA.5.1.10,BA.4,BF.10,EG.6.1,GJ.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | S193I DV.7.1.2,GA.4.1,XBB.1.16 |
| intergenic | S194P BA.5.1.10,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T198T BQ.1,XBB.1.16.2 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1,HK.6,HK.8,EG.5.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | S202C BA.4.1,XBB.1.16 |
| N | S202C BA.4.1,XBB.1.16 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.1.16 |
| intergenic | L227L EG.5.1.3,XBB.1.16.6 |
| intergenic | S235S BF.9,FU.1,XBB.1.16 |
| intergenic | K249K FL.20,GJ.1.2,XBB.1.16 |
| intergenic | E253E BA.5,XBB.1.16 |
| intergenic | V270L DV.7.1,XBB.2.3.2,XBB.1.16 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1,BF.26,EG.5.1,BA.5.6,FL.15,HK.7,GE.1,HY.1,XBB.1.16.23,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.72,XBB.1.16 |
| intergenic | H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.5,EG.5.1.4,BA.2.3,BQ.1,GE.1,GS.4.1,XBB.1.41.1,XBB.1.16.1,XBB.2.3 |
| intergenic | A313A FL.15,FY.4.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | F315F BA.5.1.1,BA.5.1.30,FL.20.2,BQ.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.10,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | G316G XBB.1.16 |
| intergenic | S318S BE.1.1,XBB.1.16.15,BA.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | M322I FL.15,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T329T BE.1.1,XBB.1.16 |
| intergenic | I337I BA.5.2.34,BA.5.1,XCH.1,XBB.2.3.2,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | D341D BA.4.1.8,BA.5,BE.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.16 |
| intergenic | P344P GK.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | N354N XBB.1.16 |
| intergenic | T362I BA.5.1.24,BA.4.1,DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FU.2,GY.5,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.1 |
| intergenic | T362K JD.1.1,XBB.1.16.15 |
| intergenic | T366I DV.7.1,EG.5.2.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.16.1 |
| intergenic | D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1,HK.6,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.16 |
| intergenic | T379I BF.28,FU.1,GW.5,GY.5,EG.5.1.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11 |
| intergenic | T379T GK.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | P383S BA.4.1,HK.11,XBB.1.16.17,XBB.1.16.8 |
| intergenic | Q384H XBB.1.16 |
| intergenic | K387K EG.5.1.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | V392V EG.6.1,XBB.1.16.17,BA.5.1,XBB.1.16 |
| intergenic | D399H XBB.1.16 |
| intergenic | S410S BA.4.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | S413L BA.5.5,XBB.1.16.8,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | A419A BF.20,EG.5.1.4,GW.5,XBB.1.16.6 |
| intergenic | g.C-13T BA.5.2.3,BE.1.1,XBB.1.16.8 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,FU.2,BQ.1,GK.1.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.1.16 |
| intergenic | R20R XBB.1.16 |
| intergenic | R24C BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4.1,FL.1.5.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | R24L BA.1.18,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A28V BA.2.12,BA.5.6,FL.1.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.16 |
| intergenic | Q29X BA.4,XBB.1.16.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | g.C29675T EG.5.1,XBB.1.16.6 |
| intergenic | g.C29686T DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,XBB.1.5.10,XBB.1.16 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1,GK.3.2,GW.5,HK.6,GS.4.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,BA.5.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGT29734C BA.4,BA.5.5,XBB.1.16.15 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGT29734T BA.4,BA.5.5,XBB.1.16.15 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.1.16 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,JD.1.2,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.1.16 |
| intergenic | g.G29779T EG.5.1,FL.1.5.1,JJ.1,JD.1.1,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XCK |
| intergenic | g.C29831A XBB.1.16 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GE.1,GS.4.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.72,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3,BA.5.2.1 |
| intergenic | P361S CH.1.1.28,BA.5.2.1 |
| intergenic | R398C BF.28,EG.5.1.4,XBB.1.42.1,XBB.2.3,BA.5.2.1 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BF.26,BF.10,CK.2,EU.1.1,GK.1,HK.3.2,JG.3,XBB.1.16.11,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| ORF1a | G604D / NSP2 |
| intergenic | G604D BA.5.2.1 |
| intergenic | T614I BA.5.1.10,HK.3.2,HY.1,BA.5.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3,BA.5.2.1 |
| ORF1a | I616T / NSP2 |
| intergenic | I616T BA.5.2.1 |
| ORF1a | I652I / NSP2 |
| intergenic | I652I BA.4.6,XCH,BA.5.2.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | T1168I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.1.15,EG.5.2.1,FU.2,BA.2.3,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | L1191L BA.5.2.34,XBB.2.3.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | Q1198Q BA.5.2.1 |
| intergenic | D1273D BA.5,BQ.1.1.8,BA.5.5,FL.10.1,EG.5.1.6,BQ.1,GK.3.1,HY.1,HR.1,XBB.1.16.6,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | F1353fs BA.5.1.10,BA.5,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.10,CK.2,FL.1.5,BQ.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | N1673N BA.5.1.10,BA.4,BE.1.1,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,FD.1.1,JF.1,XBB.1.16.11,XBB.2.3.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | T1854I BA.4.6,GJ.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | Y1868Y BA.4,BA.5.1.24,BF.26,EU.1.1,EG.6.1,BQ.1,GK.3.1,HF.1,GJ.1.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | N1934N EG.5.1.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | S2024L BA.5.2.2,FL.8,FL.20,GS.4,XBB.1.16.15,BA.5.2.1 |
| intergenic | K2078K XBB.1.16.11,BA.5.2.1 |
| ORF1a | I2107L / NSP3 |
| intergenic | I2107L BA.5.2.1 |
| intergenic | V2238V BA.5,BF.20,BF.9,BF.28,BF.10,BA.5.2.1 |
| intergenic | S2535L BF.28,BQ.1.2.3,FU.2,BA.2.3,JD.1.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | N2623N BA.5.2.1 |
| intergenic | P2685T EG.7,GE.1,XBB.1.42.1,BA.5.2.1 |
| ORF1a | V3005V / NSP4 |
| intergenic | V3005V BA.5.2.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | L3198L BA.2.12,BA.5.2.8,FU.2,GK.2,GZ.1,GK.1.1,BA.1,EG.5.1.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | V3276V BA.5.2.1 |
| intergenic | D3297D BF.10,EG.5.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,BA.5.2.1 |
| intergenic | V3305V BA.5.2.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XBB.2.3,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | E3906E BA.5.1.10,BA.5.2.1 |
| intergenic | N3928N BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,XBB.1.16.11,BA.5.2.1 |
| intergenic | P3952S BA.5.6,GK.1.3,HK.11,XBB.1.16.6,BA.5.2.1 |
| ORF1a | S3953A / NSP8 |
| intergenic | S3953A BA.5.2.1 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | V3986V BA.5.2.1 |
| intergenic | Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20,CK.2,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | R4017K BA.5.2.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| ORF1a | I4231I / NSP9 |
| intergenic | I4231I EG.6.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | T4371A BA.5.2.1 |
| intergenic | P4715F BA.5.2.2,BA.4,BA.5,BA.5.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | P4715L BA.5.2.2,BA.4,BA.5,BA.5.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | F4820F BA.5.1.10,BA.4.1,BF.26,BQ.1.2.3,EG.5.1,BA.2.3,GV.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20,BA.1.15,BA.5.5,BA.5.6,FL.20.2,FU.2,BA.1,XBB.1.16.1,HV.1,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | T5036T BA.5,BA.5.2.20,XBB.2.3.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | F5044F BA.5.2.1 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EU.1.1,FD.1.1,BA.5.1,XBB.1.5.15,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | I5229I FL.15,GK.1.1,GS.4.1,JD.1.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | L5230L BA.5.2.1 |
| intergenic | T5451I BA.5.1.10,BF.26,GE.1,EG.5.1.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20,CK.2,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | H5488Y BF.26,EG.5.1,BA.5.6,GZ.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11,XBB.2.3,BA.5.2.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.8,HK.3,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| ORF1b | N5592N / NSP13 |
| intergenic | N5592N BA.5.2.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | V5939I BA.5.2.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | T6131T BA.2.12,DV.7.1,EG.5.1.8,FK.1.1,FL.20.2,BQ.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.6,BA.5.2.1 |
| intergenic | Y6540Y BQ.1.13,BF.10,FD.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GK.3.1,GS.4,GJ.1.2,XBB.1.5.15,BA.5.2.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | P6714S GW.5,GJ.1.2,XBB.1.16.8,HK.3,BA.5.2.1 |
| intergenic | R7014R BA.5.2.34,BA.2.3,GK.3.2,XBB.1.5.10,BA.5.2.1 |
| intergenic | L7052L BA.5.2.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | V6F XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | V11V BA.5.2.34,BA.1.18,BF.28,BA.1.15,FL.15,HK.3.3,BA.5.2.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,BA.5.1,XBB.2.3,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,BA.5.1,XBB.2.3,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | L84I BA.2.12,BA.5.2.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6,GJ.1.2,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,JF.1,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,FK.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,BA.5.1,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,BA.1,BA.5.1,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,FK.1.1,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | Y489Y BA.5.2.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | I569I BA.5.2.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | P665P BA.5,BA.5.2.8,BF.28,BA.5.2.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | N1178S BA.5.2.1 |
| intergenic | L1265L BA.5.2.1 |
| S | L1265L BA.5.2.1 |
| intergenic | F43F BA.2.12,BA.5.2.20,FD.1.1,HY.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,BA.5.2.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| ORF3a | V163V BA.5.2.1 |
| intergenic | T175I BA.5.1.30,BF.26,EG.5.2.1,GJ.1.2.6,GS.4,GK.1.1,XBB.1.16.11,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | T223I BA.2.12,BA.5.1.30,EG.5.1.3,GY.5,HK.11,HF.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | E226E BA.5.2.1 |
| ORF3a | E226E BA.5.2.1 |
| intergenic | M260I BA.5.2.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,HF.1,BA.5.1,XCK,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10,BF.20,BA.5.1.2,FK.1.1,FD.1.1,FL.25,GK.2,XBB.1.17.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20,CK.2,XBB.1.16.15,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | T172T BA.5,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.2.1 |
| intergenic | P57L BF.20,FU.2,GE.1,GJ.1.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EU.1.1,GE.1,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3,BA.5.2.1 |
| intergenic | T39I BA.5.1.1,EU.1.1,FY.3.1,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.2.3.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9,BA.5.2.20,BQ.1.13,CK.2,EG.6.1,GK.2,XBB.1.16.15,XBB.1.16.11,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | Q94H BF.26,BQ.1.13,BQ.1.2.3,JN.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | L116L BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.25,GE.1,XCH,XBB.1.5.72,HV.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | L4F BA.5.2.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1,XCK,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | Q18X BA.5,FL.2.3,GJ.1.2,JG.3,XBB.1.16.1,HV.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | D35D EG.5.1.3,BA.5.2.1 |
| intergenic | A65D BA.5.2.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,CK.2,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | G30_S33delinsF BA.4,BA.5,BA.5.2.1 |
| intergenic | N126N BF.9,BA.4.6,JG.3,XBB.1.41.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3,BA.5.2.1 |
| intergenic | E136D BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BQ.1,JD.1.2,XCK,BA.5.2.1 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1,HK.6,HK.8,EG.5.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | G238S FL.14,BA.5.2.1 |
| intergenic | L291L XBB.1.16.6,BA.5.2.1 |
| intergenic | S327L BF.9,BA.5.2.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1,GK.3.2,GW.5,HK.6,GS.4.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | g.G29706C BA.5.2.1 |
| intergenic | g.C29708T BA.5.2.20,FL.8,FY.3.1,XBB.1.9.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,JD.1.2,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | g.C-222T BA.4,BA.5,EG.7,BA.2.3,BQ.1,JG.3,HK.3,XCH.1,HV.1,BQ.1.1 |
| intergenic | g.T-65C GS.3,BQ.1.1 |
| intergenic | g.C-25T BQ.1.1 |
| intergenic | g.TTC-27_-25ATT BQ.1.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13,EG.10.1,EG.5.1.3,EG.5.1.4,HN.1,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.5.70,XBB.1.42.1,BA.5.2 |
| intergenic | G49D BA.5.1.24,BA.5,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,HY.1 |
| intergenic | G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,FD.1.1,BQ.1,BA.5.1,BQ.1.1 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GE.1,GS.4.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.72,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,GE.1,XBB.1.16.8,BA.5.1,BQ.1.1 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BA.4.6,FD.1.1,GE.1,XBB.1.16.8,BA.5.1 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34,BF.28,BE.1.1,FL.1.5,FL.2.3,JD.1.1,XBB.1.16.23,HK.3,XCH.1,BA.5.2,BQ.1.1 |
| intergenic | G112S EG.5.1.3,BQ.1.1 |
| intergenic | G112G BF.20,FL.1.5.2,GE.1,BQ.1.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | L140L CH.1.1.28,BQ.1.13,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3,HK.6,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37,XBB.1.9.2 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | G146G FD.1.1,BA.2.3,HK.6,FL.1.5.1,BQ.1.1 |
| intergenic | V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5,BF.9,CH.1.1.28,HY.1,FL.1.5.1,XBB.1.5.72,BQ.1.1 |
| intergenic | S216F EG.5.1.1,BQ.1.1 |
| intergenic | S216S BA.4,BQ.1.13,FL.1.5.1 |
| intergenic | Y304Y BA.5.1.24,FL.1.5.1,XBB.1.9.1,BQ.1.1 |
| intergenic | S318L BA.5.1.1,BQ.1.1.8,EG.5.1.8,HK.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | E381G BQ.1.1 |
| intergenic | R402R BA.5.2.34,DV.7.1,BF.10,BA.5.6,FL.15,XBB.1.16.15,XBB.1.16.6,BQ.1.1 |
| intergenic | S443F BA.5.2.2,BF.41,BA.5.2.20,FL.20,GY.5,EG.5.1.1,BA.5.2,BQ.1.1 |
| intergenic | N447N BQ.1.1 |
| intergenic | V459V BA.5.2.8,BQ.1.1.8 |
| intergenic | E472E FK.1.1,BQ.1.1 |
| intergenic | S481S BA.5.1.10,BQ.1.1.8,BQ.1.13 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| intergenic | S538L BA.5.1.24,BQ.1.13 |
| intergenic | A540V BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.13,GK.2.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.6,BQ.1.1 |
| intergenic | Q556K BA.4,BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BQ.1,GE.1,BQ.1.1 |
| intergenic | A599A BA.5.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,FK.1.1,FL.15,XBB.1.16.2,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V627I BA.4,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,GJ.1.2 |
| intergenic | A656V BA.1.14,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.13,BA.5.6,HK.8,XBB.1.16.11 |
| intergenic | L681F BA.2.12,BQ.1.13,EG.6.1,BA.5.2 |
| intergenic | T708I CH.1.1.28,XBB.1.16.23,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11,BQ.1.1 |
| intergenic | Y717Y BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,FK.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | R718R BQ.1.1 |
| intergenic | L758L BQ.1.1 |
| intergenic | N786N BA.5.2.34,BQ.1.13,BF.10,FL.1.5.2,BQ.1.1 |
| intergenic | V823I EG.5.1.4,BQ.1.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | N869N BA.5,BQ.1.1 |
| intergenic | L897L BQ.1.1.8,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BQ.1,BQ.1.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | A964A BA.1.18,GW.5,HR.1,BQ.1.1 |
| intergenic | T1001I BA.2.12,BA.5.1.10,DV.7.1,EU.1.1,XBB.1.16.15,BQ.1.1 |
| intergenic | A1049V BA.4.1.8,BQ.1.1.8,BA.5.5,FU.2,GJ.1.2,HR.1 |
| intergenic | N1059N BA.4.1,BQ.1.13,BA.5.5,GA.4.1,FU.2 |
| intergenic | G1070G BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| ORF1a | A1082T / NSP3 |
| intergenic | A1082T BQ.1.1 |
| intergenic | P1207L GE.1,XBB.1.16.6,BQ.1.1 |
| intergenic | P1213S XBB.1.5.72,BQ.1.1 |
| intergenic | D1273D BA.5,BQ.1.1.8,BA.5.5,FL.10.1,EG.5.1.6,BQ.1,GK.3.1,HY.1,HR.1,XBB.1.16.6,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | D1275D FU.1,XBB.1.16.8,BQ.1.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| ORF1a | K1319N / NSP3 |
| intergenic | K1319N BQ.1.1 |
| intergenic | Y1337Y BA.5,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BQ.1.2.3,FL.10.1,FL.1.5.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | F1353fs BA.5.1.10,BA.5,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.10,CK.2,FL.1.5,BQ.1,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | L1523L BA.5.2.34,GS.3,GE.1,JD.1.1,XBB.2.3,BQ.1.1 |
| intergenic | I1568I BQ.1.1 |
| intergenic | P1692S BA.4.1.8,BQ.1.13 |
| intergenic | Y1700Y BA.4.1,BQ.1.1.8,EG.6.1,FD.1.1,FU.2,GJ.1.2,XBB.1.16.11,JA.1 |
| intergenic | D1849D BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,HN.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.6,HV.1,BQ.1.1 |
| intergenic | D1885N BQ.1.1 |
| ORF1a | K1901K / NSP3 |
| intergenic | K1901K BQ.1.1 |
| intergenic | E1909K BQ.1.1 |
| intergenic | T2007T BA.5,BQ.1.1.8,GA.4.1,FL.15,BQ.1,GK.3.1,GS.4.1 |
| intergenic | S2015S BA.2.86.1,BA.2.12,EG.5.1.3,FD.1.1,GK.2,XBB.2.3.11,BA.5.2,BQ.1.1 |
| intergenic | V2047V BA.5.6,GE.1,BA.5.1,XBB.1.16,BQ.1.1 |
| intergenic | E2070K BA.5.2.20,BQ.1.1 |
| intergenic | P2079L BA.5.2.20,GK.2,HK.3,BQ.1.1 |
| intergenic | S2103F BA.2.86.1,BF.9,CK.2,XBB.1.17.1,XBB.1.5.10,XBB.1.5.72,XBB.2.3,BQ.1.1 |
| intergenic | T2166I XBB.2.3.11,BQ.1.1 |
| intergenic | F2172F BQ.1.1.8,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,GK.2.1,GW.5,HF.1,EG.5.1.1,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | F2173L BQ.1.1 |
| intergenic | G2258D XBB.1.5.37,BQ.1.1 |
| ORF1a | T2277I / NSP3 |
| intergenic | T2277I BQ.1.1 |
| intergenic | I2278T XBB.1.17.1,XBB.2.3.2,BQ.1.1 |
| intergenic | F2351F BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13 |
| intergenic | N2482N GE.1,BQ.1.1 |
| intergenic | A2529V BF.28,FU.1,XBB.1.16.11,BA.5.2,BQ.1.1 |
| ORF1a | V2665F / NSP3 |
| intergenic | V2665F GK.1.1,BQ.1.1 |
| ORF1a | S2797Y / NSP4 |
| intergenic | S2797Y BQ.1.1 |
| intergenic | T2836I BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.1.8 |
| intergenic | V2862M BQ.1.1 |
| intergenic | P2870P BA.5.2.34,BA.5,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T2877I GV.1,BQ.1.1 |
| intergenic | Y2897Y BQ.1.1.8,BQ.1.1 |
| intergenic | N2966S BQ.1.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8,DV.7.1,DV.7.1.2,BA.5.5,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,GE.1,GS.4.1 |
| intergenic | L3086F BF.10,BQ.1.1 |
| intergenic | T3090I BA.5.2.2,BQ.1.13,HF.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | Y3098Y HY.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.5,BQ.1.1 |
| intergenic | L3238L BA.5.2.20,BF.26,BQ.1.13,BA.4.6,FL.10.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3,JN.3,XBB.1.16.23,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCH,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,BA.5.2,BQ.1.1 |
| intergenic | A3357A BA.4,BQ.1.13,GK.1.1,JD.1.1,XCL |
| intergenic | A3392V EG.5.1.4,XBB.2.3,BQ.1.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | A3523V EG.6.1,JD.1.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.9.2,XBB.1.9.1,BQ.1.1 |
| intergenic | A3523A EG.5.1.4,FD.1.1,FL.20.2,FL.20,GY.5,EG.5.1.1,HK.3,XBB.1.16.6,BQ.1.1 |
| intergenic | H3580H BA.5.2.34,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | A3615S BQ.1.1 |
| intergenic | L3644F BF.9,BQ.1.13,BA.5.5,XBB.1.16.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | D3703D BQ.1.1 |
| intergenic | D3728D BA.4.1.8,BQ.1.1.8,BQ.1.2.3,BA.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.23,HK.3 |
| intergenic | F3770F BA.5.5,FD.1.1,EG.5.1.6,JF.1,XBB.1.9.2,BQ.1.1 |
| intergenic | L3796L BA.2.12,BA.5,GE.1,EG.5.1.1,HR.1,XBB.1.17.1,BQ.1.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XBB.2.3,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1,HF.1,HN.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.1.16 |
| intergenic | T3940I GE.1,XBB.1.16.17,BQ.1.1 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | P4058P BA.4.1,BA.5.1.30,EG.5.1,HF.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2,BQ.1.1 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BA.4.6,EG.5.1.3,BA.5.6,FU.1,GW.5,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I4098I BQ.1.1 |
| intergenic | N4118N BQ.1.1 |
| intergenic | G4157S BQ.1.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | L4209L BA.4,BQ.1.1.8 |
| intergenic | V4274I BQ.1.1 |
| intergenic | K4451R BQ.1.1 |
| intergenic | H4467H BA.5.1.10,BQ.1.1.8,GE.1,EG.5.1.1,JJ.1,XBB.1.16.17,BA.5.2 |
| intergenic | N4607N JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,BQ.1.1 |
| intergenic | F4611F BQ.1.1 |
| intergenic | Y4665H BQ.1.1.8,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BQ.1,BQ.1.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BQ.1.1 |
| intergenic | P4720P JD.1.1,BQ.1.1 |
| intergenic | A4972A BA.4,BQ.1.13,GK.1.1 |
| intergenic | A4977A BQ.1.1.8,BQ.1.1 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EU.1.1,FD.1.1,BA.5.1,XBB.1.5.15,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | H5117H BA.4.1,BQ.1.13 |
| ORF1b | V5129A / NSP12 |
| intergenic | V5129A BQ.1.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,BQ.1.1 |
| ORF1b | A5189T / NSP12 |
| intergenic | A5189T BQ.1.1 |
| intergenic | V5366V EG.5.2.1,FL.15,FU.1,XBB.1.16.8,BA.5.2,BQ.1.1 |
| intergenic | S5490L BA.5.2.34,BA.5.1.24,FL.15,JG.3,BQ.1.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.8,HK.3,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | M5557I BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BQ.1,BQ.1.1 |
| intergenic | N5592S BQ.1.1.8,BQ.1.13,BQ.1,BQ.1.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | K5784R FL.2.3,EG.5.1,GK.2,XBB.1.9.2,BQ.1.1 |
| intergenic | S5810S BQ.1.1 |
| intergenic | N5813N BQ.1.1 |
| intergenic | V5834V BA.5.2.20,FL.14,EG.6.1,XBB.1.17.1,BQ.1.1 |
| ORF1b | P5949P / NSP14 |
| intergenic | P5949P BQ.1.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | IP5967VS XBB.1.16.8,BQ.1.1 |
| intergenic | A6044V BA.5,BA.4.6,GY.5,GV.1,JG.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.5.10,BQ.1.1 |
| intergenic | C6141C BA.5.2.20,GY.5,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2,BQ.1.1 |
| intergenic | A6285V GE.1,BQ.1.1 |
| intergenic | S6299S BQ.1.1.8,BQ.1.13 |
| intergenic | L6308L BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.1.5,FD.1.1,GK.2.1,HN.1,XCH.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V6314V BA.4,BQ.1.13 |
| intergenic | DRYP6315EGCH BA.2.12,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.26,BA.4.6,FD.1.1,BQ.1,BQ.1.1 |
| intergenic | Q6470Q XBB.2.3,BQ.1.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | D6584D BA.5.1.30,BQ.1.1.8,XBB.1.17.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | Y6845Y BA.5.1.10,BA.5.6,GK.1.3,BQ.1.1 |
| intergenic | A6997A BA.4,BA.5,BA.5.1.1,EG.10.1,FY.3.1,GS.4,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,BA.5.2,BQ.1.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | Y28Y BQ.1,GS.4,XBB.1.16.8,BA.5.2,BQ.1.1 |
| intergenic | F43F FL.15,HK.8,FL.1.5.1,JF.1,BQ.1.1 |
| intergenic | D53D BA.5,BA.5.1.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.2.3,FL.1.5.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | F58F BA.5.1.30,BQ.1.13,XBB.2.3.2 |
| intergenic | H69_S71delinsF BQ.1.1 |
| intergenic | H69del BQ.1.1 |
| intergenic | V70del BQ.1.1 |
| intergenic | T73T BA.2.12,BA.4.1,BQ.1.1 |
| intergenic | V83V BA.5.1.10,BA.5.1.2,CH.1.1.28,FK.1.1,BQ.1.1 |
| intergenic | T95A BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| S | T95A BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T109T BQ.1.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6,GJ.1.2,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,JF.1,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | F186F BA.5.1.2,BQ.1.1.8 |
| intergenic | N211_V213delinsIG BA.2.86.1,BQ.1.13,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | N211N BQ.1.1 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,FK.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,BA.5.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | D215Y EG.5.1,FL.1.5.1,BQ.1.1 |
| intergenic | S255F BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,EG.5.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.11,XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | T307I BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BF.28 |
| intergenic | G311G BQ.1.1 |
| S | G311G BQ.1.1 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,BA.1,BA.5.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | N343N EG.5.1.9,EG.7,FD.1.1,EG.5.1.1,BQ.1.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | K444T BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FK.1.1,BQ.1,BQ.1.1 |
| intergenic | KV444TA BQ.1.1 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,FK.1.1,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,BQ.1.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | T547K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BQ.1.1.8,BA.1.15,BA.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4,GA.4.1,FY.4.1.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,JG.3,XCH,XBB.2.3.5,XCH.1,HV.1 |
| intergenic | T732T BA.4.1,DV.7.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,BQ.1.1 |
| intergenic | T747I GS.4.1,BQ.1.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | P812L DV.7.1,FD.1.1,BQ.1.1 |
| intergenic | L821L BA.5.5,FL.1.5,EG.5.1,BA.2.3,XBB.1.16.1,BQ.1.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | I1018I BA.4,BQ.1.1 |
| intergenic | R1019R BQ.1.1 |
| intergenic | S1051S EG.5.1.6,HK.11,JF.1,BQ.1.1 |
| intergenic | P1143L BA.2.86.1,BQ.1.1.8,JN.2,JN.1,JN.3 |
| intergenic | E1144E BQ.1.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | P1162S BA.5.2.3,BA.5,CH.1.1.28,JD.1.2,JG.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.15,BQ.1.1 |
| intergenic | A1226A BA.5.1.10,BQ.1.1 |
| intergenic | M1233V BQ.1.1 |
| intergenic | D1257D BQ.1.1 |
| intergenic | P1263S BQ.1.1 |
| S | P1263S BQ.1.1 |
| intergenic | V1264L BA.5.5,EU.1.1,FK.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.9.2,HV.1,BQ.1.1 |
| intergenic | M5T BA.5,XBB.1.9.2,BQ.1.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,HV.1,XBB.1.16,BQ.1.1 |
| intergenic | G18V BA.5.1.24,BQ.1.1.8 |
| intergenic | A39D BQ.1.1 |
| ORF3a | A39D BQ.1.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | L71L BA.5,BQ.1.13,BA.5.6,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S74F BA.4,DV.7.1.2,BF.10,FL.1.5,FL.20.2,GJ.1.2,XBB.1.9.1,XCK,BQ.1.1 |
| intergenic | C81C BQ.1.1 |
| intergenic | V112V BA.5.2.3,BA.5,BQ.1.1.8,GJ.1.2,HK.3,XBB.1.5.72,XBB.2.3.11 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BQ.1.1 |
| intergenic | E239E BQ.1.1 |
| intergenic | P240S BA.4,BQ.1.1.8,GV.1,GS.4.1,EG.5.1.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | F4F BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,GK.1.3,BQ.1.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | g.T-26C BF.9,EU.1.1,XBB.1.16.1,BQ.1.1 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,HF.1,BA.5.1,XCK,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | I82I XBB.1.5.15,HV.1,BQ.1.1 |
| intergenic | N117N BQ.1.13,BA.5.5,EG.5.1.3,BA.5.6,FL.15,EG.5.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,BQ.1.1 |
| intergenic | D160D BQ.1.13,BQ.1.1 |
| intergenic | G202G BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1.2,FL.1.5.1,HV.1 |
| intergenic | N207N BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1.3,EG.7,FL.15,HV.1,XBB.1.16,BQ.1.1 |
| intergenic | Y31Y BA.5.1.24,BA.5,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BA.5.6,GK.1.1,GE.1,BA.5.1 |
| intergenic | D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3,BF.41,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BQ.1.1 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9,BA.5.2.20,BQ.1.13,CK.2,EG.6.1,GK.2,XBB.1.16.15,XBB.1.16.11,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | E41D BQ.1.1 |
| intergenic | S60G BQ.1.1 |
| ORF7a | S60G BQ.1.1 |
| intergenic | Q94H BF.26,BQ.1.13,BQ.1.2.3,JN.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | I107M EG.5.1,BQ.1.1 |
| intergenic | V108V HK.11,BQ.1.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1,XCK,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | F6S BQ.1.1 |
| intergenic | S67F BA.5.1.10,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.5,EG.5.1,FL.10.1,FL.15,HK.6,XBB.1.16.8,BQ.1.1 |
| intergenic | FI120VL BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BQ.1.13,EG.6.1,BA.5.6,BQ.1.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | T54T BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.13,BA.5.1 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1,BA.5.6,GK.1.1,GJ.1.2,JD.1.1.2,JD.1.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3,BQ.1.1 |
| intergenic | N126N BF.9,BA.4.6,JG.3,XBB.1.41.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | E136D BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BQ.1,JD.1.2,XCK,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | L161F BA.5,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.15,XBB.1.17.1 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1,HK.6,HK.8,EG.5.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.1.16 |
| intergenic | I337I BA.5.2.34,BA.5.1,XCH.1,XBB.2.3.2,HV.1,XBB.1.16,BQ.1.1 |
| intergenic | Y360Y BA.5.2.2,BA.5.2.3,BQ.1.1.8,FL.15,FU.1,FY.5 |
| intergenic | E367E BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.1.1 |
| intergenic | A376V BQ.1.1 |
| N | A376V BQ.1.1 |
| intergenic | T379T GK.1.1,XBB.1.16.1,BQ.1.1 |
| intergenic | A381A EG.5.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,BQ.1.1 |
| intergenic | P383P BA.5.2.34,BE.1.1,BQ.1.13,FL.15,GE.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | g.G-15T BA.2.12,BQ.1.1.8,XBB.1.17.1,XBB.1.42.1 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,FU.2,BQ.1,GK.1.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.1.16,BQ.1.1 |
| intergenic | g.C29686T DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,XBB.1.5.10,XBB.1.16,BQ.1.1 |
| intergenic | g.G29692T BA.5,BQ.1.13,XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1,GK.3.2,GW.5,HK.6,GS.4.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BQ.1.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,JD.1.2,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.1.16,BA.5.2.1 |
| intergenic | g.C-222T BA.4,BA.5,EG.7,BA.2.3,BQ.1,JG.3,HK.3,XCH.1,HV.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | g.C-174T BA.4.6,BA.2.3,XBB.2.3.2 |
| intergenic | g.C-80T BA.5.1.1,BA.2.3,JG.3,XBB.1.5.70 |
| intergenic | g.G-47A BF.10,BA.4.6,BA.2.3,HV.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BA.2 |
| intergenic | G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,FD.1.1,BQ.1,BA.5.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GE.1,GS.4.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.72,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,GE.1,XBB.1.16.8,BA.5.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | L92L BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.2.3,GW.5 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | L140L CH.1.1.28,BQ.1.13,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3,HK.6,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37,XBB.1.9.2 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | G146G FD.1.1,BA.2.3,HK.6,FL.1.5.1,BQ.1.1 |
| intergenic | I222V BA.5.1.1,FL.10.1,BA.2.3 |
| intergenic | S302F BA.5.1.24,BF.9,FU.1,BA.2.3,GW.5,GZ.1,EG.5.1.1,JG.3 |
| intergenic | G392G FL.14,FL.8,BA.2.3,XBB.1.16.15 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.1,GJ.1.2,HR.1,XBB.1.16.23,XBB.1.42.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16 |
| ORF1a | Q526R / NSP2 |
| intergenic | Q526R BA.2 |
| intergenic | L628F DV.7.1.2,EG.5.1,HK.3,XBB.1.16.6,BA.2 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.5.10,HV.1 |
| intergenic | T727I BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,HN.1,BA.2 |
| intergenic | A735A BA.1.14,BA.1.18,BA.1.15,FL.1.5,BA.2.3,BA.1 |
| intergenic | I740I BA.2.12,BA.5,CK.2,BA.4.6,FU.2,GK.1,GY.5,XBB.1.16.15,XBB.1.5.72,BA.2 |
| ORF1a | E743A / NSP2 |
| intergenic | E743A BA.2 |
| intergenic | I793I FL.25,BA.2.3,GS.4.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | T891I BA.2.12,BA.5.1.24,BQ.1.2.3,FL.1.5,BA.2 |
| intergenic | I895I BA.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | E938G BA.2 |
| ORF1a | E1024G / NSP3 |
| intergenic | E1024G BA.2 |
| intergenic | A1061T BA.1.14,BA.2 |
| intergenic | A1074A HK.6,BA.2 |
| intergenic | H1108H BA.5.2.8,BA.5.2.20,BA.2 |
| intergenic | T1168I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.1.15,EG.5.2.1,FU.2,BA.2.3,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | I1203I BA.5.1.2,BQ.1,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.15,BA.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | E1340D BF.9,BA.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | A1397V BA.2.86.1,BA.2.12,FL.1.5 |
| intergenic | Y1425Y BA.5.5,BA.2.3,HR.1,XBB.1.16.1 |
| intergenic | L1441L BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1,FK.1.1,GK.1,GK.2,GE.1,XBB.1.41.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3,BA.2 |
| intergenic | L1523L BA.5.2.34,GS.3,GE.1,JD.1.1,XBB.2.3,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | T1543I BF.9,EG.7,FD.1.1,FU.2,XBB.1.16.6,BA.2 |
| intergenic | D1547D BA.5.6,BA.2.3 |
| intergenic | V1570V XBB.2.3.2,BA.2 |
| intergenic | D1575D EG.5.2.1,BA.2.3 |
| intergenic | N1672N BA.4.1,HY.1,BA.2 |
| intergenic | K1781K BA.5.2.8,BF.26,GK.1,BA.2 |
| intergenic | D1893D BA.2 |
| intergenic | P1977P BA.5.1.30,GK.3.1,FL.1.5.1,XBB.1.5.15,BA.2 |
| intergenic | S2015S BA.2.86.1,BA.2.12,EG.5.1.3,FD.1.1,GK.2,XBB.2.3.11,BA.5.2,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | S2030P XBB.1.16.1,BA.2 |
| intergenic | E2042A BA.2 |
| intergenic | S2048A BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | I2076T JD.1,BA.2 |
| intergenic | H2092Y BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.2.3,JG.3,XBB.1.16.11,XBB.1.5.72 |
| intergenic | S2103F BA.2.86.1,BF.9,CK.2,XBB.1.17.1,XBB.1.5.10,XBB.1.5.72,XBB.2.3,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | H2125Y BA.4.6,EG.5.1,BA.2.3 |
| intergenic | T2197I BA.5.1.2,HF.1,XBB.2.3.11,BA.2 |
| intergenic | Y2266H BA.2 |
| intergenic | T2300T EG.5.1,FU.2,BA.2.3,XBB.1.9.1 |
| intergenic | A2320V BA.2 |
| intergenic | I2346I BQ.1.2.3,XBB.2.3,BA.2 |
| intergenic | F2351F BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,BA.2 |
| intergenic | P2376P BA.5,BA.2.3,XBB.1.5.72,XBB.2.3 |
| intergenic | V2421V BA.4,BF.10,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3,HF.1,XBB.1.5.15,BA.5.2 |
| intergenic | R2479R BA.2 |
| intergenic | S2535L BF.28,BQ.1.2.3,FU.2,BA.2.3,JD.1.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | T2825I BA.2 |
| intergenic | A2909V BA.2.12,BA.2.3 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5,EG.6.1,FL.15.1.1,HK.6,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.8,XBB.1.5.15,BA.2 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,BA.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | L3321L BA.5.2.3,BA.4.1,BF.10,XBB.2.3.11,BA.2 |
| intergenic | I3322I BA.2.12,BA.2 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3,JN.3,XBB.1.16.23,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCH,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,BA.5.2,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.15,HK.3,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | L3535L BA.2.12,BA.5.1.24,BF.28,BA.5.6,BA.2 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | A3730A BA.2.12,EG.6.1,GA.4.1,BA.2.3,BQ.1,JD.1.1.1,FL.1.5.1,JG.3,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.1.16 |
| intergenic | V3892V XBB.1.5.70,XBB.2.3,BA.2 |
| intergenic | T4087I BA.1.14,BA.2.3,XBB.1.16 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24,BA.5.2.3,HK.11,BA.2 |
| intergenic | A4285V FL.10.1,BA.2 |
| ORF1a | F4321F / NSP10 |
| intergenic | F4321F BA.2.12,HK.11,BA.2 |
| intergenic | V4520V FD.1.1,BA.2 |
| intergenic | A4587A GE.1,BA.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | F4820F BA.5.1.10,BA.4.1,BF.26,BQ.1.2.3,EG.5.1,BA.2.3,GV.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | I4928T BA.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,BQ.1.1 |
| intergenic | K5172K BA.2 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.2,BF.26,EG.5.1.8,EG.5.1,FL.8,FL.20,GE.1,JD.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.11,BA.2 |
| intergenic | L5292L BA.2 |
| intergenic | Y5355Y BA.2.12,BA.5.2.20,EG.5.1,FL.1.5.2,FL.15,FU.1,BA.2.3,EG.5.1.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.1.24,GE.1,BA.2 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.8,HK.3,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | Q5605Q EG.5.1.3,BA.2.3 |
| intergenic | A5660S BA.2 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | F5746F BA.2.12,BA.5.2.3,FD.1.1,BA.2.3,GK.2,XBB.1.17.1,BA.2 |
| intergenic | F5823F BA.4,EU.1.1,FL.25,XBB.1.16.2,XBB.2.3.2,BA.2 |
| intergenic | L5824F BA.2 |
| intergenic | V5834V BA.5.2.20,FL.14,EG.6.1,XBB.1.17.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | L5932L BA.5.2.34,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.2.3,GJ.1,GK.1.1,HF.1,HN.1,XBB.1.16 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | H6153H XBB.2.3.2,BA.2 |
| intergenic | H6239H FL.15,GK.2,GV.1,GJ.1.2,FL.1.5.1,XBB.1.17.1,XBB.2.3.11,HV.1,BA.2 |
| intergenic | L6308L BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.1.5,FD.1.1,GK.2.1,HN.1,XCH.1,XBB.2.3.11,BA.2 |
| intergenic | DRYP6315EGCH BA.2.12,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.26,BA.4.6,FD.1.1,BQ.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | T6449I BA.5.2.2,BA.2.3,XBB.2.3 |
| intergenic | N6514S BA.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | S6740F BF.9,BA.5.2.20,BA.5.2,BA.2 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HN.1,FY.5,FL.1.5.1,JJ.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.2 |
| intergenic | A6966V BA.2 |
| intergenic | R7014R BA.5.2.34,BA.2.3,GK.3.2,XBB.1.5.10,BA.5.2.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,BA.5.1,XBB.2.3,BA.5.2,BA.5.2.1,BA.2 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,BA.5.1,XBB.2.3,BA.5.2,BA.5.2.1,BA.2 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6,GJ.1.2,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,JF.1,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,FK.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,BA.5.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | T250N BA.2 |
| intergenic | P272P BA.2 |
| intergenic | L296L BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.2.3,GS.4.1,XBB.1.17.1,XCH,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,BA.1,BA.5.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | I410I BQ.1.1.8,BF.26,FD.1.1,JG.3,BA.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,FK.1.1,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | F456F BA.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,BA.5.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | Q493R BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.2.3,BA.1,BA.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.5.2.3,FY.3.1,BQ.1,EG.5.1.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3,BA.5.2,BA.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | S735S EG.7,GS.4,BA.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | L821L BA.5.5,FL.1.5,EG.5.1,BA.2.3,XBB.1.16.1,BQ.1.1 |
| intergenic | L877L BF.26,DV.7.1.2,EU.1.1,BA.2.3,BA.5.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | T961M DV.7.1.2,BA.2.3,XBB.1.16.11 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | F1062F BA.5.1.10,BA.2 |
| intergenic | V1133V BA.5.1.30,BA.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,HV.1,XBB.1.16,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | L15S BA.2 |
| ORF3a | L15S BA.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | L140F BA.4,BA.2.3,JG.3 |
| intergenic | F207F BA.5.1.2,BA.5.2.20,BA.2.3,GJ.1.2,HY.1,XBB.1.16.15,XCH |
| intergenic | Y212Y DV.7.1.2,GK.1,GE.1,HK.3,XBB.1.42.1,BA.2 |
| intergenic | Q213K BA.2.12,EG.5.1.3,FL.10.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,JN.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | S55F BA.5.1.2,EG.5.1,BA.2.3,XBB.1.16.17 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | N41N BF.9,BA.5.5,FL.10.1,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.1.16,BA.2 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6,GZ.1,GE.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XBB.1.16,BA.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | Y71Y EG.5.1.4,FL.15,BA.2.3,GK.1.1,HY.1 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3,GK.3.2,GK.1.1,GE.1,HF.1,HY.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.15,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,BA.2 |
| intergenic | L120L FL.10.1,FL.15,BA.2.3,BQ.1,BA.5.1 |
| intergenic | L149L EG.6.1,BA.2 |
| intergenic | N207N BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1.3,EG.7,FL.15,HV.1,XBB.1.16,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,BA.2 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,BA.2 |
| intergenic | H47Y BA.1.14,BA.2.12,BA.4.6,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L56L BF.28,XBB.1.17.1,BA.2 |
| intergenic | V74V CK.2,BA.2.3 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | F3L HK.7,BA.2 |
| intergenic | T11I FU.1,GK.2.1,HF.1.1,FL.1.5.1,BA.2 |
| intergenic | E64G EG.5.1.4,BA.2.3 |
| intergenic | H112H BA.5.1.30,BA.2.3 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1,BA.2.3,GK.2.1,GK.1,HK.3.2,FY.5,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JN.2,XBB.1.16.8,XBB.1.5.37 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | G5E BA.5,BA.2.3 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | T24N BA.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | T49I BA.5,BA.5.1.30,BF.10,FD.1.1,HK.8,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11,BA.2 |
| intergenic | A50A BF.26,BA.2.3,GK.2.1,GS.4.1,JA.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D63D BA.5.1.10,DV.7.1,FL.15,BA.5.1,BA.2 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1,FL.15,BA.2.3,GK.1.1,HK.11,BA.1,JN.2,XBB.2.3.11,BA.2 |
| intergenic | T135I BA.5.6,FL.15,FY.3.1,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.72,BA.2 |
| intergenic | D144N BQ.1.1.8,BA.2.3 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1,HK.6,HK.8,EG.5.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.1.16 |
| intergenic | T296I BA.2.12,FL.10.1,XBB.1.9.1,BA.2 |
| intergenic | H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.5,EG.5.1.4,BA.2.3,BQ.1,GE.1,GS.4.1,XBB.1.41.1,XBB.1.16.1,XBB.2.3 |
| intergenic | D377D FD.1.1,BA.2 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | S416S BA.2 |
| N | S416S BA.2 |
| intergenic | g.C-17T BF.26,BA.1.15,HR.1,BA.5.2,BA.2 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,FU.2,BQ.1,GK.1.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.1.16,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BQ.1.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.1.16,BA.5.2.1,BA.2 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,JD.1.2,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.1.16,BA.5.2.1,BA.2 |
| intergenic | g.C29769T DV.7.1,BA.5.2.20,BF.26,FL.15,BA.2.3,FL.1.5.1,XBB.1.41.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | g.C-160T BA.5.1.24,BE.1.1,BA.1.15,EG.5.1.3,GY.5,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.6 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | L27L BA.5.1.24,FL.1.5.2,FL.10.1,GE.1,HN.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.10,HV.1,BA.1.1 |
| ORF1a | E726K / NSP2 |
| intergenic | E726K BA.1.1 |
| intergenic | A735A BA.1.14,BA.1.18,BA.1.15,FL.1.5,BA.2.3,BA.1,BA.1.1 |
| ORF1a | G835G / NSP3 |
| intergenic | G835G XBB.1.16,BA.1.1 |
| intergenic | K856R BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | V879V BA.2.12,BA.1.15,EG.7,GK.1.3,BA.1,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.9.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | T1168I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.1.15,EG.5.2.1,FU.2,BA.2.3,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | A1298V BA.1.1 |
| intergenic | A1397A BA.2.12,BA.5,DV.7.1,BA.5.5,FL.15,FU.1,JN.1,XBB.1.42.1,BA.1.1 |
| intergenic | T1426T BA.5.2.2,DV.7.1,BA.1.15,EG.7,HK.3,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L1441L BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1,FK.1.1,GK.1,GK.2,GE.1,XBB.1.41.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | A1707A BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,GK.3.1,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | D1849D BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,HN.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.6,HV.1,BQ.1.1,BA.1.1 |
| intergenic | S2083_L2084delinsI BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15,EG.5.1.4,FL.2.3,FD.1.1,GK.1.3,HK.6,GJ.1.2,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XBB.2.3 |
| intergenic | A2344V XBB.1.5.10,BA.1.1 |
| intergenic | L2503F BA.1.1 |
| ORF1a | K2679K / NSP3 |
| intergenic | K2679K BA.1.1 |
| intergenic | A2710T BA.2.86.1,BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15,BA.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.5.70,BA.1.1 |
| intergenic | F3018F BA.4,BA.5,BF.28,BA.1.15,GK.1,GK.3.1,JG.3 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5,EG.6.1,FL.15.1.1,HK.6,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.8,XBB.1.5.15,BA.2 |
| intergenic | L3198L BA.2.12,BA.5.2.8,FU.2,GK.2,GZ.1,GK.1.1,BA.1,EG.5.1.1,BA.5.2.1,BA.1.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3,JN.3,XBB.1.16.23,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCH,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,BA.5.2,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | P3395H BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | Y3502Y HK.11,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,BA.1.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | L3674_G3676del BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | I3758V BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,FL.15,BA.1,XBB.1.16,BA.1.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XBB.2.3,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.1.1 |
| intergenic | G3846S EG.7,FY.3.1,BA.1.1 |
| intergenic | V4310V BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | I4498V BA.1.1 |
| intergenic | V4649F BA.1.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | K4892K BA.1.1 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20,BA.1.15,BA.5.5,BA.5.6,FL.20.2,FU.2,BA.1,XBB.1.16.1,HV.1,XBB.1.16,BA.5.2.1,BA.1.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,BQ.1.1 |
| intergenic | G5494S HK.3.2,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.8,HK.3,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | E5689D BE.1.1,BA.5.5,BA.1.1 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3,BA.5.1.30,BF.26,BF.10,JG.1,XBB.1.16.17 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | L6102F GJ.1.2,XBB.1.5.37,XBB.2.3,BA.1.1 |
| intergenic | D6539N BA.1.1 |
| intergenic | V6579F EG.5.1.1,FL.1.5.1,BA.1.1 |
| intergenic | Y6930Y BA.5.1.10,BA.1.15,FK.1.1,HK.3.3,JD.1.2,HV.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | V11V BA.5.2.34,BA.1.18,BF.28,BA.1.15,FL.15,HK.3.3,BA.5.2.1,BA.1.1 |
| intergenic | H69del BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15,BA.4.6,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | V70del BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15,BA.4.6,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | T95I BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,EG.5.1.8,BA.1,GJ.1.2,BA.1.1 |
| intergenic | G142_Y145delinsD BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | N211_L212delinsI BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | R214_D215insEPE BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,BA.1,BA.5.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | R346K BA.1.18,BE.1.1,BA.1.15,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | S371L BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | S375F BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | G446S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,BA.1.15,FK.1.1,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | Q493R BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.2.3,BA.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | G496S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,EG.5.1.4,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | T547K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BQ.1.1.8,BA.1.15,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | N556N GJ.1.2,FL.1.5.1,BA.1.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | N856K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | A903A BA.1.1 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,GK.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.5.10,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | L981F BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | P104dup BQ.1.13,BA.1.15,FL.1.5.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | D3G BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,FL.20,BA.1,BA.1.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6,GZ.1,GE.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XBB.1.16,BA.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3,BF.41,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BQ.1.1,BA.1.1 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EU.1.1,GE.1,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3,BA.5.2.1 |
| intergenic | T120I BQ.1.1.8,BF.28,DV.7.1.2,GY.5,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6,BA.1.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1,FL.15,BA.2.3,GK.1.1,HK.11,BA.1,JN.2,XBB.2.3.11,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | Q181Q BA.1.1 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1,HK.6,HK.8,EG.5.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.1.16 |
| intergenic | g.C-17T BF.26,BA.1.15,HR.1,BA.5.2,BA.2 |
| intergenic | g.C-222T BA.4,BA.5,EG.7,BA.2.3,BQ.1,JG.3,HK.3,XCH.1,HV.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | g.C-126T BF.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5 |
| intergenic | g.C-80T BA.5.1.1,BA.2.3,JG.3,XBB.1.5.70 |
| intergenic | g.C-59T GK.1,XBB.2.3.2,XBB.1.5 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13,EG.10.1,EG.5.1.3,EG.5.1.4,HN.1,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.5.70,XBB.1.42.1,BA.5.2,XBB.1.5 |
| intergenic | L27L BA.5.1.24,FL.1.5.2,FL.10.1,GE.1,HN.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.10,HV.1,BA.1.1 |
| intergenic | V28I FL.20,HY.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| ORF1a | V54I / NSP1 |
| intergenic | V54I XBB.1.5 |
| intergenic | P67P XBB.1.5 |
| intergenic | G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,FD.1.1,BQ.1,BA.5.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GE.1,GS.4.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.72,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,GE.1,XBB.1.16.8,BA.5.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BA.4.6,FD.1.1,GE.1,XBB.1.16.8,BA.5.1,XBB.1.5 |
| intergenic | G82_M85delinsV BF.20,GK.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.10,DV.7.1.2,GK.1,JF.1,XBB.1.17.1,JA.1,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | M85_E87delinsK EG.5.1.4,HR.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G94S BQ.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L104I XBB.1.5 |
| intergenic | K120N BA.5.2.3,FL.1.5.1,JN.2,XBB.1.5.37 |
| intergenic | R124C CK.2,GK.2,XBB.1.5.70 |
| intergenic | A131V FD.1.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | SYG135RYC BF.26,XBB.1.5 |
| intergenic | A138A EG.5.1,HR.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L140L CH.1.1.28,BQ.1.13,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3,HK.6,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37,XBB.1.9.2 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,FY.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | L149L JD.1.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | N160N BA.4.6,FK.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3 |
| intergenic | V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5,BF.9,CH.1.1.28,HY.1,FL.1.5.1,XBB.1.5.72,BQ.1.1 |
| intergenic | N189N BA.5.1.10,BA.5.1.30,EG.5.2.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.5.72 |
| intergenic | P197S HY.1,FL.1.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | R207C BA.5.2.3,EG.10.1,GJ.1.2,FY.5,HY.1,XBB.1.5 |
| intergenic | V228V DV.7.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | E246G XBB.1.5 |
| intergenic | P305L BA.5.6,XBB.1.5.72 |
| intergenic | M315T XBB.1.5 |
| ORF1a | K322T / NSP2 |
| intergenic | K322T EG.5.1.8,XBB.1.5 |
| intergenic | T333M BA.4.1,BF.10,XBB.1.16.8,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3.2 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5,EG.5.1.8,EG.5.1.3,FK.1.1,GE.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2,BA.5.2 |
| intergenic | T350I BA.5.2.3,BA.5.5,GV.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2 |
| intergenic | H374H BA.5.1.10,FY.3.1,GK.1.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | H388Y BA.1.14,EG.5.1.9,EU.1.1,FL.15,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1 |
| intergenic | S443S BA.5,EU.1.1,FU.2,GS.4,GE.1,GJ.1.2,HY.1,FL.1.5.1,BA.5.2,XBB.1.5 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.1,GJ.1.2,HR.1,XBB.1.16.23,XBB.1.42.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.11 |
| intergenic | E489K JD.1.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | A498V BA.5.1.1,GK.3.1,EG.5.1.1,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HF.1,HN.1,HY.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | F548L EG.5.1.4,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T551I XBB.1.16.15,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T554I FL.1.5.2,HK.8,XBB.1.5.37,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.6.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70,XCH,XCH.1 |
| intergenic | L590F BA.5.2.3,XBB.1.5.15 |
| intergenic | N593N JG.3,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | M598I JN.2,XBB.1.16.15,XBB.1.5 |
| intergenic | A599A BA.5.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,FK.1.1,FL.15,XBB.1.16.2,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V606V BA.5,BA.5.1.1,EG.5.1.8,XBB.1.5.10,XBB.2.3 |
| intergenic | T609I BQ.1.1.8,JF.1,XBB.1.5.37 |
| ORF1a | G638S / NSP2 |
| intergenic | L642F BA.4.1,BA.5.5,EG.5.1.6,GK.1,EG.5.1.1,XBB.1.5.70,XBB.1.16 |
| intergenic | T654T DV.7.1,DV.7.1.2,GS.4.1,XBB.1.16.6,XBB.1.5 |
| intergenic | C657Y BA.5.2.20,FL.10.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.5.10,HV.1 |
| intergenic | I694V GW.5,XBB.1.5.37 |
| intergenic | I740I BA.2.12,BA.5,CK.2,BA.4.6,FU.2,GK.1,GY.5,XBB.1.16.15,XBB.1.5.72,BA.2 |
| intergenic | E754G XBB.2.3.11,XBB.1.5 |
| intergenic | L766L HK.6,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S771I XBB.1.5 |
| intergenic | V839V BA.5.1.10,EG.5.1,XBB.1.16.23,XBB.1.5.10 |
| intergenic | IT841VI BA.5.1.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T842I BA.5.1.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | L864L BA.5.1.24,GE.1,XBB.2.3.11,XBB.1.5 |
| intergenic | A872A BA.5.1.2,EG.5.1.4,XBB.1.5.37 |
| intergenic | P892S EG.5.1.3,EG.6.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6,GK.2.1,GK.3.1,GS.4,GY.5,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | P959S BA.2.12,EG.7,XBB.1.5.70 |
| intergenic | P971S BA.5.1.10,BA.4.1,BA.5.2.20,XBB.1.16.15,XBB.1.5.10,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P971L BA.5,BA.5.1.2,BF.26,BF.10,JD.1.1,XBB.1.5.15,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L1016F HY.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | Q1021H JD.1.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | A1043V BA.4,BE.1.1,FK.1.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | N1123N XBB.1.5.15,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D1127D GW.5,FL.1.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L1130F EG.5.1.8,EG.5.1.6,FY.5,XBB.1.5.10 |
| intergenic | H1141Y BA.5,BA.5.2.8,XBB.1.5.10 |
| intergenic | H1160H BA.5.5,XBB.1.5.70 |
| intergenic | V1173V GS.4,XBB.1.5.72 |
| intergenic | A1176V DV.7.1.2,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D1184D BE.1.1,BA.5.6,GK.2,BA.1,XBB.1.5 |
| intergenic | I1203T BA.4.6,GS.4,XBB.1.5.72 |
| intergenic | I1203I BA.5.1.2,BQ.1,GS.4.1,GJ.1.2,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.15,BA.2 |
| intergenic | P1213L BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,FL.10.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3 |
| intergenic | V1291I EG.7,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | P1330P BF.10,EG.5.1.3,FL.1.5,JG.3,JF.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.9.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | I1360I FL.1.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S1361P BF.28,XBB.1.5.37 |
| intergenic | K1428K BA.5.2.34,XBB.1.5.10,XBB.2.3 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.30,FL.1.5,EG.7,FD.1.1,FL.15,HK.3.2,XBB.1.5.15,XBB.2.3.11 |
| intergenic | L1441L BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1,FK.1.1,GK.1,GK.2,GE.1,XBB.1.41.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | N1442H XBB.1.5 |
| intergenic | L1507F EG.6.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | S1539N BF.26,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P1541P BA.4.1,GE.1,HK.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T1542I FL.8,XBB.1.5.15,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T1542T BA.5.5,BA.4.6,HY.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2 |
| intergenic | D1600D BQ.1.2.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | Y1619Y DV.7.1,BA.5.5,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L1627L BA.5.1.30,FU.1,FU.2,GS.3,XBB.1.41.1,XBB.1.5.70,XBB.2.3.2,BA.5.2 |
| intergenic | T1638I EU.1.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T1678T BA.5.2.20,XBB.1.16.8,XBB.1.5.70 |
| intergenic | N1691N BA.5.1.24,CK.2,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L1695L XBB.1.5 |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10,BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BA.5.6,FY.3.1,GE.1,GJ.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,XBB.1.5.72,XCK,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | V1751V GJ.1.2,XBB.1.5.72 |
| intergenic | Q1759Q XBB.1.16.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T1761T XBB.1.5 |
| intergenic | I1785T BQ.1.13,BF.10,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L1797L JJ.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T1822I BA.1.18,BA.4.1,FU.1,BQ.1,GY.5,GE.1,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.5 |
| intergenic | N1917N BA.4.1,JG.1,XBB.1.5.10,HV.1 |
| intergenic | Y1920Y FL.20,XBB.1.5.37 |
| intergenic | P1977P BA.5.1.30,GK.3.1,FL.1.5.1,XBB.1.5.15,BA.2 |
| intergenic | I2010V FL.20.2,FL.20,GY.5,XBB.1.5.70 |
| intergenic | T2016I BA.5.2.20,XBB.1.5 |
| intergenic | N2023S GK.1.3,XBB.1.5.70 |
| intergenic | S2030L DV.7.1,GK.1.1,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | E2031K BA.5.2.20,XBB.1.5.15 |
| intergenic | C2041C BA.5.1.24,HK.11,XBB.1.5.15 |
| intergenic | D2060D EG.5.1.8,FL.1.5.1,JF.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T2069I BF.10,XBB.1.5 |
| intergenic | D2074D GK.2.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | A2080V HK.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | I2086I EG.10.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G2091G BF.9,XBB.1.5.70,XBB.1.5.72 |
| intergenic | H2092Y BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.2.3,JG.3,XBB.1.16.11,XBB.1.5.72 |
| intergenic | H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,EG.5.1.1,XBB.1.16.17,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T2093I GS.3,GE.1,XBB.1.5 |
| intergenic | S2103F BA.2.86.1,BF.9,CK.2,XBB.1.17.1,XBB.1.5.10,XBB.1.5.72,XBB.2.3,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | L2113L BA.5.1.24,XBB.1.17.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L2117L HK.3.2,FY.5,XBB.1.5.72 |
| intergenic | V2130I FD.1.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | D2136N JG.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T2152I BA.1.17,BA.5.5,BQ.1.2.3,XBB.1.5.10,XBB.2.3.2 |
| intergenic | G2207G HK.8,XBB.1.5.37 |
| intergenic | P2221S EG.6.1,GK.2,XBB.1.5 |
| intergenic | C2239C JF.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T2264I FU.1,HY.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | N2272N BA.2.12,DV.7.1.2,GY.5,GS.4.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | T2274I BA.5.1.1,EG.6.1,GK.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.5.70,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15,EG.5.1.4,FL.2.3,FD.1.1,GK.1.3,HK.6,GJ.1.2,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XBB.2.3 |
| intergenic | D2299D BA.4,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1,BQ.1,GS.4.1,XBB.2.3.2,XBB.1.5 |
| intergenic | T2300I BF.28,EG.7,XBB.1.5.15 |
| ORF1a | L2329L / NSP3 |
| ORF1a | L2329L / NSP3 |
| intergenic | A2345V GS.4,XBB.1.5.10 |
| intergenic | I2346I BQ.1.2.3,XBB.2.3,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | P2376P BA.5,BA.2.3,XBB.1.5.72,XBB.2.3 |
| intergenic | I2385I BA.4,DV.7.1,FL.10.1,GK.2,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | V2421V BA.4,BF.10,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3,HF.1,XBB.1.5.15,BA.5.2 |
| intergenic | S2433S BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,JD.1.1,XBB.1.5.70,XCH,XCH.1 |
| intergenic | S2500S GK.2,FL.1.5.1,HR.1,HK.3,XBB.2.3.5,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | N2523N BA.5.1.2,BA.5.1.30,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N2526N FL.10.1,XBB.1.5.10,XBB.1.16 |
| intergenic | A2614V JF.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3 |
| intergenic | N2678N BA.5.2.8,BA.5.2.20,GE.1,GS.4.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.37 |
| intergenic | P2685S BA.2.12,XBB.1.5 |
| intergenic | A2710T BA.2.86.1,BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15,BA.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.5.70,BA.1.1 |
| intergenic | M2796I BA.5.1.10,BA.5,FY.5,XBB.1.5 |
| intergenic | I2806V EG.5.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | S2822S FL.15,XBB.1.5.10 |
| intergenic | D2824D GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70,XCH,XCH.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | T2846I XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.11,XBB.1.16 |
| intergenic | G2871G BA.5.1.2,GY.5,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L2939L XBB.1.16.23,XBB.1.5 |
| intergenic | R2953R BA.5.5,XBB.1.5 |
| intergenic | V2955V EG.5.1.4,XBB.1.5.72 |
| ORF1a | F2979F / NSP4 |
| intergenic | F2979F GK.2,XBB.1.5 |
| intergenic | R2985R BF.9,FL.25,XCH.1,XBB.2.3.2,XBB.1.5 |
| intergenic | A2994V BQ.1.1.8,GK.3.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | N3007N EG.5.1.4,EG.5.1,GV.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | Y3098Y HY.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.5,BQ.1.1 |
| intergenic | L3116F BF.10,XBB.1.5.37 |
| intergenic | M3129I FY.5,XBB.1.5.70,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P3134S EU.1.1,FL.15,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5,EG.6.1,FL.15.1.1,HK.6,EG.5.1.1,HR.1,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.8,XBB.1.5.15,BA.2 |
| intergenic | N3186N XBB.1.16.11,XBB.1.5.72 |
| intergenic | K3187K BE.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | D3240D FL.1.5.1,BA.5.1,XBB.1.5 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | T3284I BA.4,BA.5.2.20,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D3297D BF.10,EG.5.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,BA.5.2.1 |
| intergenic | T3308T BA.5.6,GE.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | L3313L FD.1.1,GK.2,GV.1,HR.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.72,XBB.1.5 |
| intergenic | S3344F GJ.1.2.6,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2,HK.6,JG.3,JN.3,XBB.1.16.23,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCH,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,BA.5.2,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HK.3.2,XBB.1.16.15,HK.3,XBB.1.9.2,XBB.2.3.11,XBB.1.5 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | V3420V BA.2.12,BE.1.1,EG.5.1.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y3424Y BA.5.1.10,XBB.1.5.10 |
| intergenic | D3450D BA.5.6,BA.1,GJ.1.2,HY.1,HR.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T3459T BA.5.1.1,BE.1.1,EG.7,GV.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | D3479D BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1.8,GK.3.1,GE.1,EG.5.1.1,BA.5.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3 |
| intergenic | Y3500Y HK.6,XBB.1.5.10 |
| intergenic | P3504L BA.5,GK.3.1,HY.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3 |
| intergenic | D3508D FL.1.5,FL.8,FL.15,BQ.1,JF.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,BA.5.2 |
| intergenic | L3513L XBB.1.5 |
| intergenic | C3563C XBB.1.16.2,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,XBB.1.16.15,JF.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | A3645A BA.5,BA.5.1,XBB.1.5.72 |
| ORF1a | T3646I / NSP6 |
| intergenic | T3646I BA.5.2.2,JD.1.1,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | A3688V DV.7.1,HV.1,XBB.1.5 |
| intergenic | I3693I XBB.1.16.11,XBB.1.5.37 |
| intergenic | R3706R JG.3,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L3711F BA.2.86.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | A3726V BA.5.2.20,FY.5,XBB.1.5.37 |
| intergenic | M3733I JD.1.2,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T3750I BA.5.2.34,BA.4.1,BQ.1,HK.3.2,JD.1.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.1,BA.5.2,XBB.1.5 |
| intergenic | G3757S BA.4.1,GS.4,XBB.2.3.2,XBB.1.5 |
| intergenic | F3785F BF.9,EG.5.1.4,FD.1.1,BQ.1,GE.1,GJ.1.2,XBB.1.5 |
| intergenic | G3795G XBB.1.5 |
| intergenic | Y3813Y BF.9,EG.7,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L3828L BA.5,DV.7.1,BA.5.5,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JN.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1,FL.1.5.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XBB.2.3,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.1.1 |
| intergenic | P3831P BQ.1.2.3,EG.5.1,GW.5,XBB.1.5 |
| intergenic | V3871V BA.5.1.24,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L3899L BA.5.1.30,GE.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.15 |
| intergenic | A3943A XBB.1.9.2,XBB.1.5.72 |
| intergenic | S3950S BA.1.14,XBB.1.16.8,BA.5.1,XCL,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L4045L BA.4,BA.4.1,BF.26,FK.1.1,FL.15,HK.3.2,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P4058P BA.4.1,BA.5.1.30,EG.5.1,HF.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2,BQ.1.1 |
| intergenic | A4068S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70,XCH,XCH.1 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BA.4.6,EG.5.1.3,BA.5.6,FU.1,GW.5,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.2.3.2,XBB.1.5 |
| intergenic | V4072I GE.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | V4073V FL.8,FL.20,XBB.1.5.10,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G4086S JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.10 |
| intergenic | S4093S EG.6.1,EG.5.1.6,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T4129I FL.1.5.2,GK.1,FL.1.5.1,XBB.1.5 |
| intergenic | V4137V FY.5,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1 |
| intergenic | T4159I CK.2,FD.1.1,XBB.1.17.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D4166D GK.2.1,JD.1.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | A4168A BA.5.1.30,BA.4.6,FL.15,FL.20,JD.1.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | Y4171Y EG.5.1.3,HK.6,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Y4172Y BA.5.1.2,BF.26,HF.1,JG.3,XBB.1.5.15,XBB.2.3.5 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | Q4189H BA.5.1.10,XBB.1.5.10 |
| intergenic | P4197S BA.5.2.3,XBB.1.5.15,XCH,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | L4252L BQ.1.1.8,FL.8,GJ.1.2,HK.3,XBB.1.5.70,XBB.2.3.11 |
| intergenic | D4317D BF.9,EG.5.1.8,XBB.1.5.70 |
| intergenic | N4367N BQ.1.2.3,XBB.1.5.72 |
| intergenic | R4387R BA.4,BA.5.1.30,BF.28,FL.15,GK.1.3,GE.1,XBB.1.5.10,XBB.1.16 |
| intergenic | S4398L BA.1.17,BA.5.1.30,BF.26,FL.2.3,EU.1.1,XBB.1.16.8,XBB.1.5.15,XBB.2.3,XBB.1.5 |
| intergenic | S4398S XBB.1.16.1,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G4417G BA.5,XBB.1.5.72,XBB.2.3 |
| intergenic | T4418I XBB.1.16.8,XBB.1.5.10,XBB.1.16.6 |
| intergenic | I4429I BA.4.6,EG.6.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T4477I BA.5.1.10,GJ.1,XBB.1.16.15,XBB.1.5.37 |
| ORF1b | K4483N / NSP12 |
| intergenic | K4483N BA.5.2.8,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P4486L BA.5.2.34,BF.26,BA.5.5,GK.1,XBB.1.5.37 |
| ORF1b | Y4555Y / NSP12 |
| intergenic | T4618T FL.1.5,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | T4640T BA.5.1.1,GS.4,GK.2,HK.6,XBB.1.16.8,XBB.1.16.6,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | R4641K EG.5.1.4,XBB.1.16.11,XBB.1.5.72,XBB.1.16 |
| intergenic | A4642V JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | T4644I XBB.1.16.11,XBB.1.5.10 |
| intergenic | P4656S BA.4.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | D4666D JD.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.72 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | F4740F JD.1.1,XBB.1.5.72 |
| ORF1b | Q4836Q / NSP12 |
| intergenic | Q4836Q BF.10,XBB.1.5.37 |
| intergenic | D4891D FL.15,GK.1.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | Y4908Y BA.5.1.10,HK.6,HK.3,XBB.1.5.15 |
| intergenic | D5010D HY.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EU.1.1,FD.1.1,BA.5.1,XBB.1.5.15,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | V5092V HY.1,FL.1.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | N5105N GK.1.1,HY.1,XBB.1.16.8,XBB.1.16.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | D5152D BA.5.1.24,DV.7.1,CH.1.1.28,BF.26,EG.5.1.3,BQ.1,HN.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.15,HV.1 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,BQ.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | N5182N BA.5.1.1,GJ.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T5198I HK.7,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | S5227S BE.1.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | G5231G FD.1.1,XBB.1.41.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | H5274Y FL.10.1,XBB.1.5 |
| intergenic | L5283L BA.4,BA.4.1,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.25,GY.5,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37 |
| intergenic | C5332C BA.5,EG.5.1.8,EG.5.1.9,EG.5.1,FL.14,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L5338L XBB.1.5 |
| intergenic | F5348F BF.10,BQ.1,GE.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.2,BA.5.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | T5507T XBB.1.5 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.2,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.8,HK.3,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.2.3.5,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | S5560N GJ.1.2,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L5564L HK.3,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1 |
| intergenic | T5574I BF.28,XBB.1.5.72 |
| intergenic | S5588S GK.2,XBB.1.5.15 |
| intergenic | G5606G FL.2.3,XBB.1.41.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,HR.1,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,JF.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.5 |
| intergenic | V5672V GE.1,XCL,XBB.1.5.10 |
| intergenic | V5680V BA.4.1.8,BF.28,FL.1.5,EG.7,FU.1,GK.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.5.15,XBB.1.16 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | D5725D BA.5.2.8,FK.1.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T5737I BA.5.1.24,DV.7.1.2,BA.4.6,XBB.1.16.2,XBB.1.5.70 |
| intergenic | I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5.2.8,BF.26,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5 |
| intergenic | G5818G EG.5.1.3,GK.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | P5828L EG.5.2.1,FL.20,BQ.1,JG.3,XBB.1.5.70,XCL |
| intergenic | N5843N BA.5.6,XBB.1.5.15 |
| intergenic | Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | I5940I BA.4.6,XBB.1.5.10 |
| intergenic | T5941I BA.5.5,FK.1.1,JG.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G5942W BA.5.1.10,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G5942G FL.1.5.1,XBB.1.5.70,XBB.1.16.6 |
| intergenic | P5945P BA.4.6,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P5949L BQ.1.1.8,XBB.1.5.37 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | G6018G EG.10.1,GJ.1,GE.1,GJ.1.2,EG.5.1.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T6028T BA.5.2.2,BE.1.1,EG.5.1.3,XBB.1.5.37,XBB.2.3 |
| intergenic | L6034L BA.2.3,GJ.1.2.6,HK.3.3,HY.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | A6044V BA.5,BA.4.6,GY.5,GV.1,JG.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.5.10,BQ.1.1 |
| intergenic | P6076L BA.5.2.3,JF.1,XBB.1.5.72,HV.1 |
| intergenic | L6099F FL.25,XBB.1.5.15,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L6102F GJ.1.2,XBB.1.5.37,XBB.2.3,BA.1.1 |
| intergenic | P6128S BQ.1.1.8,FL.25,GK.2.1,GE.1,JN.2,JD.1.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | C6197C XBB.1.5 |
| intergenic | V6241I EG.5.1,FD.1.1,GS.4,JD.1.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | D6256D BA.5.2.2,BA.5,GE.1,GS.4.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | F6302F BQ.1.13,EG.5.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.10 |
| intergenic | V6306V FU.2,JD.1.2,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L6308L BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.1.5,FD.1.1,GK.2.1,HN.1,XCH.1,XBB.2.3.11,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | DRYP6315EGCH BA.2.12,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.26,BA.4.6,FD.1.1,BQ.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | N6333N FL.8,GS.3,GE.1,GS.4.1,XBB.1.5.37,XBB.1.9.2 |
| intergenic | N6335N BA.5,EU.1.1,XBB.1.16.6,XBB.1.5 |
| intergenic | P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | P6368S BA.5.1.24,GK.2,XBB.1.5.72,XBB.2.3.11 |
| intergenic | S6386L BA.2.3,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3,EG.5.1,FL.10.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GK.3.1,GY.5,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,HV.1,XBB.1.5 |
| intergenic | T6441I BA.5.2.34,XBB.1.5.37 |
| intergenic | Y6540Y BQ.1.13,BF.10,FD.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GK.3.1,GS.4,GJ.1.2,XBB.1.5.15,BA.5.2.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | V6573V BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,FU.1,GK.2,GS.4.1,FL.1.5.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,HV.1,BA.5.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | L6614F BA.5.2.8,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,XBB.1.5.70,XBB.1.42.1 |
| intergenic | S6695I FL.1.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | P6722S FL.14,FY.4.1.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | N6729N GE.1,HK.6,JD.1.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.11,HV.1 |
| intergenic | V6772L BA.5.2.2,BA.5.1.1,BF.28,EG.5.1.3,GK.2,HK.3,XBB.1.5.37,XBB.2.3 |
| intergenic | A6802T JD.1.2,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L6819L BA.5.2.2,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BE.1.1,XBB.1.16.8,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T6833I BA.4.6,EG.5.1,FL.20,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T6854I BA.4,GK.1.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2 |
| intergenic | P6860P BA.5.1.1,FU.2,GS.4.1,XBB.1.5 |
| intergenic | V6894V HK.8,BA.5.1,XBB.1.5.37,BA.5.2 |
| intergenic | D6931D BA.5.1.2,BF.10,XBB.1.5.37 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25,GK.2.1,BQ.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HN.1,FY.5,FL.1.5.1,JJ.1,XBB.1.16.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | L6959L BA.4.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | A6997A BA.4,BA.5,BA.5.1.1,EG.10.1,FY.3.1,GS.4,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,BA.5.2,BQ.1.1 |
| intergenic | R7014R BA.5.2.34,BA.2.3,GK.3.2,XBB.1.5.10,BA.5.2.1 |
| intergenic | P7034P GK.1,XBB.1.16.15,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.2.3 |
| ORF1b | D7067D / NSP16 |
| intergenic | D7067D XBB.1.5 |
| ORF1b | L7072L / NSP16 |
| intergenic | L7072L BA.5.2.20,XBB.1.5.10 |
| intergenic | V3G BA.4.1.8,BA.4.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | F32F BA.5.1.10,BA.5.1.2,BF.28,BA.4.6,EG.5.1.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.17.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S45S FL.10.1,GK.2.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1 |
| intergenic | T51I GE.1,XCH,XBB.1.5 |
| intergenic | L56L GS.4,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V70F EG.5.1.4,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T76I BA.5.5,FL.14,GS.4,XBB.1.5.70,XBB.1.42.1 |
| intergenic | V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | S98F BA.5.1.10,FL.1.5,FD.1.1,FL.20,BQ.1,GK.3.1,GK.1.1,JF.1,XBB.2.3.2,BA.5.2,XBB.1.5 |
| intergenic | N99N DV.7.1,HN.1,XBB.1.5.10,HV.1 |
| intergenic | R102R BF.28,XBB.1.5.37 |
| intergenic | T108T EU.1.1,XBB.1.5.37,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L110L HK.6,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L118F BQ.1.2.3,GS.4.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,BA.2.3,GK.1.3,BQ.1,GK.2,HK.7,GY.5,GE.1,HK.6,GJ.1.2,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JD.1.1,JF.1,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.10,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HY.1,JD.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.16.6,HV.1 |
| intergenic | H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HY.1,EG.5.1.1,FL.1.5.1,HR.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | N148T FL.15,FU.2,HK.7,JD.1.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.17.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.11,HV.1 |
| intergenic | E156D BA.5.6,XBB.1.5.70 |
| intergenic | L179L FL.1.5,XBB.1.5.15 |
| intergenic | G181V JG.3,BA.5.1,XBB.1.5.15,BA.5.2 |
| intergenic | Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | Q183K DV.7.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | N185D DV.7.1,DV.7.1.2,BQ.1,GK.1,GS.4.1,XBB.1.5.15,XBB.1.16 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | Q218E FL.1.5.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | H245Y GA.4.1,EG.5.1.6,GK.3.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3 |
| intergenic | G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | S254F XBB.1.16.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T259I XBB.1.16.17,BA.5.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | A262V DV.7.1.2,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P272P BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | L296L BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.2.3,GS.4.1,XBB.1.17.1,XCH,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T333T BF.26,EG.5.1.6,XBB.1.5.37 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.1.1,JF.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XCL,XCH,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | K356T BA.2.86.1,GA.4.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | S371F BF.10,XBB.1.5.70,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | C391C HK.3.3,XBB.1.5.15 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | N450D BA.2.86.1,BF.28,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.5.70 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,JF.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,XCL,XCH,XCH.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,BQ.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | I472I FL.14,XBB.1.5.10 |
| intergenic | A475V FL.15.1.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JF.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.5 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | Y508Y BA.4.1,BF.10,HK.3,XBB.1.5.10,HV.1 |
| intergenic | H519H BA.1.17,XBB.1.5.37 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1,FL.25,FU.2,GJ.1,GK.1,GW.5,HY.1,FL.1.5.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.17.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | N556K XBB.1.16.17,XBB.1.5.70,XBB.1.16 |
| intergenic | I587I BF.10,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V597V XBB.1.5 |
| intergenic | D614G HY.1,XBB.1.16.1,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.1.5 |
| intergenic | QD613HG FK.1.1,HY.1,XBB.1.16.1,XBB.1.42.1,XBB.1.9.1,XBB.1.5 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | Q675H BA.5.1.24,BE.1.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.10 |
| intergenic | N679K FL.10.1,JD.1.1,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | TN678IK FL.10.1,JD.1.1,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | NSP679KSH BA.5.2.20,GV.1,HK.3.2,HR.1,XBB.1.16.15,XBB.1.5.37,XBB.2.3 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | Y707Y BA.5.2.20,XBB.1.5.37,HV.1 |
| intergenic | L727L BQ.1.13,GK.2.1,GK.2,XBB.1.5.70,XCL |
| intergenic | T732T BA.4.1,DV.7.1.2,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,BQ.1.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | T778T BF.28,FL.15,HY.1,JD.1.1,HK.3,XBB.1.5 |
| intergenic | Y789Y BQ.1.2.3,HK.11,GV.1,XBB.1.16.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T791I JD.1.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | E819E DV.7.1,EG.5.1.6,HK.6,XBB.1.5.10 |
| intergenic | V826V BA.5.2.34,XBB.1.5.37 |
| intergenic | S929T XBB.1.41.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70 |
| intergenic | D936Y BQ.1.1.8,CK.2,XBB.1.5.10 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,GK.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.5.10,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S940S FD.1.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | N960N BA.5,XBB.1.5.70,XBB.1.9.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | I980I FU.2,XBB.1.5.10 |
| intergenic | K1073K XBB.1.5 |
| intergenic | D1084Y FL.8,EG.5.1.1,JD.1.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | H1101Y BF.41,BA.5.2.20,EG.5.1.3,HF.1.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | H1101H EG.10.1,EG.7,GK.1,GW.5,XBB.1.17.1,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XBB.2.3,XBB.1.16 |
| intergenic | V1104L BA.5.2.34,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T1117I EG.7,GK.1,GJ.1.2,JD.1.1,JA.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | D1139D FY.5,XBB.1.5.72,XBB.2.3 |
| intergenic | E1144Q EG.5.1,XBB.2.3.2,XBB.1.5 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | S1161S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | P1162S BA.5.2.3,BA.5,CH.1.1.28,JD.1.2,JG.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.15,BQ.1.1 |
| intergenic | I1198V XCH,XBB.1.5.72 |
| intergenic | I1198I XBB.1.17.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | E1202Q BA.4.1.8,BA.5.2.3,BF.28,XBB.1.5.10,XBB.1.16.6 |
| intergenic | T1238T BA.5.5,HN.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,HV.1,XBB.1.16,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | T12I EG.5.1,FL.15,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L15F BA.4.6,XBB.1.5.72 |
| intergenic | S40P BA.4.1.8,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L52F FL.15,HK.3.3,XBB.1.5.10 |
| intergenic | L53F BA.5.2.20,FL.25,EG.5.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | L73L BA.5.1.2,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L85F BQ.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | T89I BF.26,EG.5.1.8,FL.1.5,EG.5.1.4,FD.1.1,GK.1.3,GK.1.1,HN.1,JD.1.1.2,JD.1.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3 |
| intergenic | Y91Y BA.5,XBB.1.5.15 |
| intergenic | H93Y XBB.1.5.70,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6 |
| intergenic | A99V BA.4.6,FL.1.5.1,JN.2,XBB.1.16.2,XBB.1.5.15 |
| intergenic | G100G EG.5.2.1,BQ.1.2.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L106F BA.1.15,EG.5.1.4,FL.20,GJ.1.2,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L106L BA.5.2.2,BA.5.1.10,CK.2,GK.2,GY.5,HK.1,FL.1.5.1,XBB.1.5 |
| intergenic | Y107Y BF.26,EG.10.1,FL.15,XBB.1.5.72 |
| intergenic | L108F BA.4,FL.20.2,FL.20,XBB.1.5 |
| intergenic | A110S BA.4.6,EG.5.1.3,GS.4.1,BA.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | V112V BA.5.2.3,BA.5,BQ.1.1.8,GJ.1.2,HK.3,XBB.1.5.72,XBB.2.3.11 |
| intergenic | W131C BE.1.1,FL.15,GY.5,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | R134H FU.2,GK.1,HK.3,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | N137N XBB.1.5.70,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L140F BA.4,BA.2.3,JG.3,XBB.1.5 |
| intergenic | C148C BA.5.1.10,BA.5,FL.15,JG.1,XBB.1.5.37,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T176I BA.1.17,BF.26,FL.15.1.1,FU.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | C200C XBB.1.16.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Y206Y BA.4,BA.5,BQ.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | D210D DV.7.1,BA.4.6,XBB.1.5.70 |
| intergenic | DT222VI XBB.1.5 |
| ORF3a | DT222VI XBB.1.5 |
| intergenic | T223I HK.7,FY.5,XBB.1.5 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BQ.1.1,BA.2 |
| intergenic | P240A XBB.1.5 |
| intergenic | E241D FL.1.5.1,XBB.1.5 |
| intergenic | V256_N257delinsD BA.5.5,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T268M BA.2.3,GY.5,XBB.1.5.72,XBB.2.3 |
| intergenic | T269M EG.5.1.3,XBB.1.5.15,XBB.1.9.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | F23F EG.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.9.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6,GZ.1,GE.1,EG.5.1.1,JN.2,JN.1,JN.3,XBB.1.16.23,BA.5.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XBB.1.16,BA.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | G78S EG.5.1.3,XBB.1.5.37,XBB.1.16.6 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3,GK.3.2,GK.1.1,GE.1,HF.1,HY.1,XBB.1.16.2,XBB.1.5.15,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | L124L BA.2.12,BA.4,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.20,GK.1,HY.1,FL.1.5.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L164L XBB.1.16.1,XBB.1.42.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | P165P BA.5.1.30,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2 |
| M | P165P BA.5.1.30,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.5.70,XCL,XBB.2.3.11,XBB.2.3,BA.5.2 |
| intergenic | A195A FL.14,XBB.1.5.37 |
| intergenic | Y196Y BQ.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3 |
| intergenic | N203N BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1.3,JG.3,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1 |
| intergenic | V5V XBB.1.5.15,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D6G BA.5.1.30,BA.5.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | L16L BA.5.1.1,BA.5.1.2,FK.1.1,FD.1.1,GK.1.1,FY.5,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | I26V HK.3,XBB.1.5 |
| intergenic | Y31Y BA.5.1.24,BA.5,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BA.5.6,GK.1.1,GE.1,BA.5.1,XBB.1.5 |
| intergenic | D61I EG.5.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | g.C-1T BA.5,BA.5.5,FU.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.11 |
| intergenic | I3I BA.5.2.20,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | I10T BQ.1.13,FU.2,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T28I BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1,GE.1,EG.5.1.1,JG.3,XBB.1.5.37,XBB.1.16 |
| intergenic | C35C BA.5.6,XBB.1.5.72 |
| intergenic | H47Y BA.1.14,BA.2.12,BA.4.6,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L49L XBB.1.5.70,XBB.1.5 |
| intergenic | D69D BA.1.14,BA.5.2.8,EG.5.1.6,GY.5,GJ.1.2,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,HV.1 |
| intergenic | G70G EG.5.1.8,HK.3.2,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L96F DV.7.1.2,FU.1,GS.4.1,BA.5.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Y97Y BF.26,BA.5.5,JD.1.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3 |
| intergenic | T115I XBB.1.5.15,XBB.1.5.10,XCH.1,XBB.2.3.2 |
| intergenic | L116L BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.25,GE.1,XCH,XBB.1.5.72,HV.1,BA.5.2.1 |
| intergenic | T120I BQ.1.1.8,BF.28,DV.7.1.2,GY.5,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.16.6,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | F13L BA.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | L18L EG.5.1.4,GZ.1,HK.7,GY.5,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | A43A EG.5.1.9,HN.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.72 |
| intergenic | X44QextX? GY.5,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G8R EG.10.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3,HV.1,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | T11K DV.7.1,JG.3,XBB.1.5.37 |
| intergenic | H17Y BA.5.2.20,EG.10.1,FL.1.5,EG.5.1.6,GK.1.3,XBB.1.41.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P38S BA.5.5,FL.1.5,GK.2.1,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,XBB.1.5.70,XCL,XBB.1.42.1 |
| intergenic | I39T XBB.1.5.37,XBB.1.5.10 |
| intergenic | W45L BF.28,XBB.1.5.37 |
| intergenic | V62L BF.41,BA.5.5,EG.5.1,EG.6.1,BA.5.6,XBB.1.17.1,XBB.1.5.37,XBB.1.5.15,XBB.1.9.1 |
| intergenic | V62V BA.5.2.20,BE.1.1,EG.5.1.4,EU.1.1,FL.20,BQ.1,GW.5,EG.5.1.1,XBB.1.16.23,HK.3,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1,XBB.1.16 |
| intergenic | A65S BA.5.5,XBB.1.5.37,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,EG.5.1,FU.2,BQ.1,GK.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JD.1,JD.1.2,JD.1.1,HK.3,XBB.1.5.37,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G66_K68delinsE BA.2.12,BA.4,FY.3.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.72,BA.5.2 |
| intergenic | K68N BA.5.1.10,XBB.1.5 |
| ORF8 | K68N BA.5.1.10,XBB.1.5 |
| intergenic | Q72H GK.1.1,XBB.1.5.37,HV.1 |
| intergenic | T80I EG.5.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | P85L FL.25,XBB.1.5.15,XBB.1.5.10 |
| intergenic | N89D FL.25,XBB.1.5.72 |
| intergenic | C90F HY.1,XBB.1.5.37 |
| intergenic | C102F EG.7,GK.2,XBB.1.16.15,XBB.1.5.37,BA.5.2 |
| intergenic | Y111C JD.1.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | R115L XBB.1.5.37,XBB.1.5.10 |
| ORF8 | R115L BF.41,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,FL.1.5.1 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1,BA.2.3,GK.2.1,GK.1,HK.3.2,FY.5,EG.5.1.1,FL.1.5.1,JN.2,XBB.1.16.8,XBB.1.5.37,XBB.1.5 |
| intergenic | I121L XBB.1.16.8,XBB.1.5.37 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,JJ.1,JG.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3,HV.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | PR13LC HK.7,XBB.1.5.15 |
| intergenic | T24I BA.5.2.34,BF.9,FL.8,EG.5.1.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.11 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,BA.1,HK.8,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,BA.1.1,XBB.1.5 |
| intergenic | E31_S33del JF.1,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.15,XBB.2.3.11 |
| intergenic | G30_S33delinsA GS.4,GS.4.1,JF.1,XBB.1.17.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.11 |
| N | G30_S33delinsA XBB.2.3.11,XBB.1.17.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | A35A BA.1.15,FL.2.3,JF.1,XBB.1.16.8,XBB.1.5.70,XBB.1.5.15 |
| intergenic | P42P EG.10.1,XBB.1.5.72,XBB.1.9.1 |
| intergenic | G60G EU.1.1,HY.1,JD.1.1.2,XBB.1.5.10,XBB.1.9.1 |
| intergenic | P67L BA.2.12,BA.5.1.10,BA.5.2.20,XBB.1.5.72 |
| intergenic | G85G BA.4.1.8,XBB.1.5.15 |
| N | G85G BA.4.1.8,XBB.1.5.15 |
| intergenic | Y86Y BA.2.12,BA.5.2.3,BA.5.5,FL.1.5.1,XBB.1.16.8,BA.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1,BA.5.6,GK.1.1,GJ.1.2,JD.1.1.2,JD.1.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,XBB.2.3,BQ.1.1 |
| intergenic | N126N BF.9,BA.4.6,JG.3,XBB.1.41.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3,BA.5.2.1,BQ.1.1 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,GY.5,GE.1,GJ.1.2,JD.1.2,JF.1,XBB.1.16.11,BA.5.1,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | T135I BA.5.6,FL.15,FY.3.1,HK.3,BA.5.1,XBB.1.5.72,BA.2 |
| intergenic | H145H BA.5,FU.1,HN.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | T148T BF.10,GV.1,GJ.1.2,EG.5.1.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | S190G FD.1.1,JG.3,XBB.1.5 |
| intergenic | P199S BA.5,BF.28,GJ.1.2,EG.5.1.1,XBB.1.5.70 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,BA.1,GJ.1.2,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XCK,XBB.2.3.11,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | A208V GA.4.1,GY.5,XBB.1.5.10 |
| intergenic | Q229H XBB.1.5 |
| intergenic | G243C EG.5.1.6,XBB.1.5.37 |
| intergenic | A251A FU.2,XBB.1.5.70 |
| intergenic | Y268Y BA.5.1.10,BA.5,BQ.1.2.3,GE.1,XBB.1.5.15,XBB.1.5 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1,BF.26,EG.5.1,BA.5.6,FL.15,HK.7,GE.1,HY.1,XBB.1.16.23,XBB.1.17.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.72,XBB.1.16,XBB.1.5 |
| intergenic | G287G FL.10.1,EG.5.1.6,GK.1.1,XBB.1.5.37,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2 |
| intergenic | I292I HK.8,HN.1,HK.3,XBB.2.3,XBB.1.5 |
| intergenic | H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.5,EG.5.1.4,BA.2.3,BQ.1,GE.1,GS.4.1,XBB.1.41.1,XBB.1.16.1,XBB.2.3,XBB.1.5 |
| intergenic | I304I XBB.1.5 |
| intergenic | F315F BA.5.1.1,BA.5.1.30,FL.20.2,BQ.1,XBB.1.5.70,XBB.1.5.10,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16 |
| intergenic | S318S BE.1.1,XBB.1.16.15,BA.5.1,XBB.1.5.15 |
| intergenic | F346F BA.5.2.34,EG.5.1,FL.14,FL.25,FU.2,XBB.1.5.15,XBB.1.9.1,XBB.2.3.11 |
| intergenic | H356H BF.26,XBB.1.5.70 |
| intergenic | A359A XBB.1.5 |
| intergenic | P365L BA.5.2.20,FL.1.5,GE.1,GS.4.1,JD.1.2,XBB.1.5.10,XBB.2.3.2 |
| intergenic | A381A EG.5.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,BQ.1.1 |
| intergenic | Q409L BQ.1.2.3,FL.2.3,XBB.1.5.10 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,FL.1.5.1,HR.1,JD.1,JD.1.2,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.15,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.17.1,XBB.1.16.11,XBB.1.5.70,JA.1,BA.5.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,XBB.1.16,BA.5.2.1,BQ.1.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | A8V FL.10.1,BQ.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.2 |
| intergenic | S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HK.6,HK.3.2,HK.8,HK.3.3,EG.5.1.1,JG.1,JJ.1,JG.3,HK.3,XBB.1.5.37,HV.1 |
| intergenic | A28V BA.2.12,BA.5.6,FL.1.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XBB.1.16 |
| intergenic | Q29X BA.4,XBB.1.16.1,XBB.1.16.6,XBB.1.5 |
| intergenic | g.C29686T DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,XBB.1.5.10,XBB.1.16,BQ.1.1 |
| intergenic | g.G29690T FD.1.1,FL.1.5.1,XBB.1.41.1,XBB.1.5.10 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1,GK.3.2,GW.5,HK.6,GS.4.1,EG.5.1.1,XBB.1.16.15,BA.5.1,XBB.1.5.37,XBB.1.42.1,XBB.1.9.2,BA.5.2,BA.5.2.1 |
| intergenic | g.G29706T FL.1.5,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GZ.1,GE.1,GS.4.1,GJ.1.2,JA.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3.5,XBB.2.3.2,XBB.2.3.11,XBB.2.3 |
| intergenic | g.G29711T EG.5.1.8,EG.6.1,XBB.1.5.72 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HK.3.2,GS.4.1,HK.8,HN.1,FY.5,HK.3.3,HY.1,JD.1.1.1,JD.1.1.2,EG.5.1.1,JG.1,HR.1,JD.1,JJ.1,JN.2,JG.3,JN.1,JN.3,JD.1.1,XBB.1.16.17,XBB.1.16.2,JF.1,XBB.1.16.23,XBB.1.41.1,XBB.1.16.8,HK.3,XBB.1.16.11,XBB.1.16.1,XBB.1.5.70,JA.1,XBB.1.5.37,XCL,XBB.1.42.1,XBB.1.5.15,XCH,XBB.1.5.10,XBB.2.3.5,XBB.1.9.2,XCH.1,XBB.1.5.72,XBB.2.3.2,XCK,XBB.2.3.11,XBB.2.3,HV.1,BA.5.2,BQ.1.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.1.16,BA.5.2.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1,HK.6,GJ.1.2,FL.1.5.1,JD.1.2,XBB.1.17.1,BA.5.1,XBB.1.16.6,XBB.1.9.1,XBB.1.16,BA.5.2.1,BA.2,XBB.1.5 |
| intergenic | g.C29769T DV.7.1,BA.5.2.20,BF.26,FL.15,BA.2.3,FL.1.5.1,XBB.1.41.1,XBB.1.5.15,XBB.2.3,BA.5.2,XBB.1.5 |