covidmvp-2023-11-10

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intergenic N2603N BA.2.12
intergenic A2618V BA.2.12
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intergenic A2909V BA.2.12
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intergenic I3052V BA.2.12
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S N331N BA.2.12
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intergenic QS493RP BA.2.12
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intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12
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intergenic A69V BA.2.12
intergenic M109I BA.2.12
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intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12
intergenic G66_K68delinsE BA.2.12
intergenic P70L BA.2.12
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intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12
intergenic S23P BA.2.12
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12
intergenic P67L BA.2.12
intergenic Y86Y BA.2.12
intergenic P117P BA.2.12
intergenic G175G BA.2.12
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intergenic T296I BA.2.12
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intergenic K369I BA.2.12
N K369I BA.2.12
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intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12
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intergenic A28V BA.2.12
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
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intergenic A2690V BA.1.17
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intergenic M2796T BA.1.17
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ORF1b R4975G / NSP12
intergenic R4975G BA.1.17
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intergenic V5776V BA.1.17
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intergenic H69del BA.1.14,BA.1.17
intergenic V70del BA.1.14,BA.1.17
intergenic T95I BA.1.14,BA.1.17
intergenic G142_Y145delinsD BA.1.14,BA.1.17
intergenic M177I BA.1.17
intergenic N211_L212delinsI BA.1.14,BA.1.17
intergenic R214_D215insEPE BA.1.17
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
intergenic S371L BA.1.14,BA.1.17
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intergenic S375F BA.1.14,BA.1.17
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intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
intergenic G446S BA.1.14,BA.1.17
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
intergenic Q493R BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
intergenic G496S BA.1.14,BA.1.17
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
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intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
intergenic F643L BA.1.17
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
intergenic A701V BA.1.17
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intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
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intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
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intergenic V75L BA.1.17
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intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
intergenic L35I BA.1.17
intergenic D61D BA.1.14,BA.1.17
intergenic E95X BA.1.17
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
intergenic D113D BA.1.17
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17
intergenic D103D BA.1.17
N D103D BA.1.17
intergenic A134A BA.1.17
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17
intergenic T282T BA.1.17
intergenic Y298Y BA.1.17
intergenic g.C-147T BA.5.2.2
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic G82S BA.5.2.2
intergenic G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2
intergenic H81H BA.5.2.2
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2
intergenic P309L BA.5.2.2
intergenic G401G BA.5.2.2
intergenic S443F BA.5.2.2
intergenic L454L BA.5.2.2
intergenic K722K BA.5.2.2
ORF1a G780G / NSP2
intergenic G780G BA.5.2.2
intergenic IT841VI BA.5.2.2
ORF1a NIT840SVI / NSP3
intergenic NIT840SVI BA.5.2.2
intergenic T842I BA.5.2.2
intergenic T882I BA.5.2.2
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic S966P BA.5.2.2
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2
intergenic T1426T BA.5.2.2
intergenic L1438L BA.1.14,BA.5.2.2
intergenic N1439N BA.5.2.2
ORF1a D1440D / NSP3
intergenic D1440D BA.5.2.2
ORF1a E1461E / NSP3
intergenic E1461E BA.5.2.2
intergenic N1749N BA.5.2.2
intergenic A1809V BA.5.2.2
intergenic F1925F BA.5.2.2
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ORF1a N2449N / NSP3
intergenic N2449N BA.5.2.2
intergenic T2648I BA.5.2.2
ORF1a V2680V / NSP3
intergenic V2680V BA.5.2.2
ORF1a E2946A / NSP4
intergenic E2946A BA.5.2.2
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2
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intergenic T3090I BA.5.2.2
intergenic L3191L BA.5.2.2
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2
intergenic V3349L BA.5.2.2
intergenic K3353R BA.2.12,BA.5.2.2
intergenic K3353N BA.5.2.2
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2
intergenic A3454T BA.5.2.2
intergenic N3484N BA.5.2.2
intergenic D3492D BA.5.2.2
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2
intergenic T3646I BA.5.2.2
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2
intergenic Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2
ORF1b T4668A / NSP12
intergenic T4668A BA.5.2.2
intergenic P4715F BA.5.2.2
intergenic P4715L BA.5.2.2
ORF1b V4816M / NSP12
intergenic V4816M BA.5.2.2
intergenic M4855I BA.5.2.2
intergenic F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2
intergenic A5270V BA.5.2.2
intergenic T5439I BA.5.2.2
intergenic T5451N BA.2.12,BA.5.2.2
ORF1b V5478V / NSP13
intergenic V5478V BA.5.2.2
intergenic T5538I BA.5.2.2
ORF1b F5549L / NSP13
intergenic F5549L BA.5.2.2
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intergenic A5645A BA.5.2.2
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intergenic T6028T BA.5.2.2
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intergenic T19L BA.5.2.2
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2
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intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2
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intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic L518I BA.5.2.2
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic D1163Y BA.5.2.2
intergenic G1219C BA.5.2.2
intergenic C1253C BA.5.2.2
intergenic P42H BA.5.2.2
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic L106L BA.5.2.2
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2
intergenic V256del BA.5.2.2
intergenic g.G-18T BA.5.2.2
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic D3N BA.5.2.2
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic L35L BA.5.2.2
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic Y179Y BA.5.2.2
intergenic P84L BA.5.2.2
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic g.C-5T BA.5.2.2
intergenic L60F BA.5.2.2
intergenic I71T BA.5.2.2
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic G5R BA.5.2.2
N G5R BA.5.2.2
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic G19G BA.5.2.2
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic I130I BA.5.2.2
intergenic A134A BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic D144D BA.5.2.2
intergenic G178S BA.5.2.2
N G178S BA.5.2.2
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2
intergenic T245I BA.5.2.2
intergenic Y360Y BA.5.2.2
intergenic g.C-3T BA.5.2.2
intergenic R24C BA.5.2.2
intergenic g.CAAT29675C BA.5.2.2
intergenic g.A29700G BA.5.2.2
intergenic g.G29717A BA.5.2.2
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2
intergenic g.T-129C BA.5.1.10
intergenic g.C-119T BA.5.1.10
intergenic g.C-63T BA.5.1.10
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic G49V BA.5.1.10
intergenic M85_V86del BA.5.1.10
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic N189N BA.5.1.10
intergenic P305S BA.5.1.10
intergenic G334G BA.5.1.10
intergenic H374H BA.5.1.10
intergenic G379E BA.5.1.10
intergenic T403I BA.5.1.10
ORF1a E441D / NSP2
intergenic E441D BA.5.1.10
intergenic S481S BA.5.1.10
intergenic A540V BA.5.1.10
intergenic A591V BA.5.1.10
intergenic T614I BA.5.1.10
intergenic D644D BA.5.1.10
intergenic G728C BA.5.1.10
intergenic L730I BA.5.1.10
intergenic P748L BA.5.1.10
intergenic V839V BA.5.1.10
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10
intergenic T882I BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic P971S BA.5.1.10
intergenic T1001I BA.2.12,BA.5.1.10
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic F1353fs BA.5.1.10
intergenic M1588T BA.5.1.10
ORF1a P1659S / NSP3
intergenic P1659S BA.5.1.10
ORF1a I1667V / NSP3
intergenic I1667V BA.5.1.10
intergenic N1673N BA.5.1.10
ORF1a L1725S / NSP3
intergenic L1725S BA.5.1.10
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intergenic F2964F BA.5.1.10
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intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10
intergenic S3149F BA.5.1.10
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intergenic G3245G BA.5.1.10
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic P3359S BA.5.1.10
intergenic R3368R BA.5.1.10
intergenic T3374T BA.5.1.10
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic Y3424Y BA.5.1.10
intergenic L3585L BA.5.1.10
intergenic F3603F BA.5.1.10
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic K3839R BA.5.1.10
intergenic I3853I BA.5.1.10
intergenic E3906E BA.5.1.10
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic Q3966R BA.5.1.10
intergenic Q4189H BA.5.1.10
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic I4291I BA.5.1.10
ORF1a N4338Y / NSP10
intergenic N4338Y BA.5.1.10
ORF1a D4344Y / NSP10
intergenic D4344Y BA.5.1.10
ORF1b C4446C / NSP12
intergenic C4446C BA.5.1.10
intergenic H4467H BA.5.1.10
intergenic T4477I BA.5.1.10
ORF1b L4578L / NSP12
intergenic L4578L BA.5.1.10
ORF1b Y4630Y / NSP12
intergenic Y4630Y BA.5.1.10
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10
intergenic F4820F BA.5.1.10
intergenic A4835A BA.5.1.10
intergenic N4851N BA.5.1.10
intergenic Y4908Y BA.5.1.10
intergenic F4986F BA.5.1.10
intergenic D5128N BA.5.1.10
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic L5254L BA.5.1.10
intergenic P5310L BA.5.1.10
intergenic P5371L BA.5.1.10
intergenic Y5444Y BA.5.1.10
intergenic T5451I BA.5.1.10
intergenic P5496H BA.5.1.10
intergenic R5572K BA.5.1.10
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic L5762L BA.5.1.10
intergenic I5804I BA.5.1.10
intergenic T5825I BA.5.1.10
intergenic T5912I BA.5.1.10
intergenic T5941A BA.5.1.10
intergenic G5942W BA.5.1.10
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic V6106V BA.5.1.10
intergenic L6205L BA.5.1.10
intergenic H6380Y BA.5.1.10
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic S6739L BA.5.1.10
intergenic Y6845Y BA.5.1.10
intergenic L6924F BA.2.12,BA.5.1.10
intergenic Y6930Y BA.5.1.10
intergenic F6985F BA.5.1.10
intergenic PR7013LN BA.5.1.10
ORF1b T7032I / NSP16
intergenic T7032I BA.5.1.10
intergenic L5F BA.2.12,BA.5.1.10
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic F32F BA.5.1.10
intergenic S60S BA.5.1.10
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic I68_H69del BA.5.1.10
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic V83V BA.5.1.10
intergenic S98F BA.5.1.10
intergenic I105V BA.5.1.10
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic Y145H BA.5.1.10
intergenic Q183R BA.5.1.10
intergenic V193L BA.5.1.10
intergenic V213E BA.5.1.10
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic S254S BA.5.1.10
intergenic D294D BA.5.1.10
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10
intergenic S359S BA.5.1.10
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10
intergenic E554G BA.5.1.10
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intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic T1006T BA.5.1.10
intergenic F1062F BA.5.1.10
intergenic T1100T BA.5.1.10
intergenic I1114T BA.5.1.10
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic A1226A BA.5.1.10
intergenic G1251R BA.5.1.10
intergenic K21N BA.5.1.10
intergenic I37I BA.5.1.10
intergenic P42S BA.5.1.10
intergenic F43S BA.5.1.10
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic L106L BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic Y113Y BA.5.1.10
intergenic C148C BA.5.1.10
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic H247Y BA.5.1.10
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic g.T-6C BA.5.1.10
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic N121N BA.5.1.10
intergenic C15C BA.5.1.10
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic P36S BA.5.1.10
intergenic A55V BA.5.1.10
intergenic S67F BA.5.1.10
intergenic K68N BA.5.1.10
intergenic I71T BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic T87I BA.5.1.10
intergenic V114L BA.5.1.10
intergenic R115H BA.5.1.10
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic P13F BA.5.1.10
intergenic P13L BA.5.1.10
intergenic G25G BA.5.1.10
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic D63D BA.5.1.10
intergenic P67L BA.2.12,BA.5.1.10
intergenic F110F BA.5.1.10
intergenic N126S BA.5.1.10
intergenic A152S BA.5.1.10
intergenic N192N BA.5.1.10
intergenic S194P BA.5.1.10
intergenic RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10
intergenic Y268Y BA.5.1.10
intergenic T271I BA.5.1.10
intergenic F274F BA.5.1.10
intergenic S310S BA.5.1.10
intergenic K347T BA.5.1.10
N K347T BA.5.1.10
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10
intergenic g.C-10T BA.5.1.10
intergenic R24C BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic L37F BA.5.1.10
intergenic g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic g.C-222T BA.4
intergenic g.C-63T BA.5.1.10,BA.4
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic R24C BA.4
intergenic H45Y BA.4
intergenic V60I BA.4
intergenic G82_V86del BA.4
ORF1a H81N / NSP1
intergenic H81N BA.4
ORF1a H81_M85delinsNV / NSP1
intergenic H81_M85delinsNV BA.4
intergenic M85_V86del BA.4
intergenic V86F BA.4
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4
ORF1a S142_F143delinsHTM / NSP1
intergenic S142_F143delinsHTM BA.4
ORF1a E172E / NSP1
intergenic E172E BA.4
intergenic K210K BA.4
intergenic S216S BA.4
intergenic V378I BA.4
intergenic V378A BA.4
intergenic I396I BA.4
intergenic L454L BA.5.2.2,BA.4
intergenic K492K BA.4
intergenic S505S BA.4
intergenic T512T BA.4
ORF1a A540A / NSP2
intergenic A540A BA.4
intergenic A555V BA.4
intergenic Q556K BA.4
intergenic Y576C BA.4
intergenic L580F BA.4
intergenic N615N BA.4
intergenic Y621Y BA.4
intergenic V627I BA.4
intergenic L730L BA.4
ORF1a D795G / NSP2
intergenic D795G BA.4
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic A964T BA.4
intergenic A967V BA.4
ORF1a I1023T / NSP3
intergenic I1023T BA.4
intergenic A1043V BA.4
intergenic D1088D BA.4
intergenic D1179D BA.4
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
ORF1a A1482T / NSP3
intergenic A1482T BA.4
intergenic P1541S BA.4
ORF1a P1659T / NSP3
intergenic P1659T BA.4
ORF1a N1672N / NSP3
intergenic N1673N BA.5.1.10,BA.4
intergenic Y1868Y BA.4
ORF1a S2048A / NSP3
intergenic T2121T BA.4
intergenic D2299D BA.4
intergenic M2365I BA.4
intergenic I2385I BA.4
intergenic V2421V BA.4
intergenic S2493G BA.4
intergenic Y2513Y BA.4
intergenic V2624V BA.4
intergenic S2625S BA.4
ORF1a E2681E / NSP3
intergenic E2681E BA.4
intergenic A2701A BA.4
ORF1a V2754I / NSP3
intergenic V2754I BA.4
intergenic H2799Y BA.4
intergenic F3018F BA.4
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4
intergenic L3092L BA.4
intergenic L3180L BA.2.12,BA.4
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic T3284I BA.4
intergenic N3291N BA.1.17,BA.4
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4
intergenic A3357A BA.4
intergenic R3368R BA.5.1.10,BA.4
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic G3437G BA.4
intergenic F3486L BA.4
intergenic D3511D BA.4
intergenic L3585L BA.5.1.10,BA.4
intergenic A3625A BA.4
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic P3952P BA.4
intergenic Y3954Y BA.1.14,BA.4
intergenic A3960A BA.4
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic V3976I BA.4
intergenic L4045L BA.4
intergenic L4064L BA.4
intergenic I4098T BA.4
intergenic C4163C BA.4
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic L4209L BA.4
intergenic N4235N BA.4
intergenic L4284L BA.2.12,BA.4
intergenic C4330C BA.4
intergenic A4357V BA.4
intergenic R4387R BA.4
intergenic V4406V BA.4
intergenic M4588I BA.4
intergenic D4652D BA.4
ORF1b D4661E / NSP12
intergenic D4661E BA.4
intergenic P4715F BA.5.2.2,BA.4
intergenic P4715L BA.5.2.2,BA.4
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10
intergenic Y4738H BA.4
intergenic L4779L BA.4
intergenic Y4847Y BA.4
intergenic A4972A BA.4
intergenic F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4
intergenic E5136D BA.4
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4
intergenic L5197L BA.4
intergenic L5230L BA.4
intergenic L5283L BA.4
intergenic A5342V BA.4
intergenic P5377S BA.4
intergenic G5378S BA.4
intergenic Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4
ORF1b T5552T / NSP13
intergenic T5552T BA.4
intergenic A5620T BA.4
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic S5748S BA.4
intergenic F5823F BA.4
intergenic P5828P BA.4
intergenic L5963L BA.4
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic M6078I BA.4
intergenic V6314V BA.4
intergenic V6362V BA.4
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic T6854I BA.4
intergenic A6997A BA.4
intergenic P7034L BA.4
intergenic L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic G75V BA.2.12,BA.4
intergenic A93S BA.4
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic K147_N148del BA.4
S K147_N148del BA.4
intergenic K182I BA.4
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic L229L BA.4
intergenic V308V BA.4
S V308V BA.4
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic G339V BA.4
S G339V BA.4
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4
intergenic R346S BA.4
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic S640F BA.4
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic N658S BA.4
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic Q804Q BA.4
intergenic D936N BA.4
intergenic S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic I1018I BA.4
intergenic A1020S BA.4
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic G1251G BA.4.1.8,BA.4
intergenic F8F BA.2.12,BA.4
intergenic V55F BA.4
intergenic A59V BA.4
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic S74F BA.4
intergenic L84L BA.4
intergenic L94F BA.4
intergenic L108F BA.4
intergenic L140F BA.4
intergenic G172V BA.4
intergenic Y206Y BA.4
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic P240S BA.4
intergenic g.G-15T BA.4
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic C33C BA.4
intergenic F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12
intergenic L56L BA.4
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4
intergenic L124L BA.2.12,BA.4
intergenic V170V BA.4
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4
intergenic g.C-5T BA.4
intergenic Y18H BA.4
ORF7a Y18H BA.4
intergenic V24L BA.4
intergenic Q62_F63delinsH BA.4
intergenic R80I BA.4
intergenic P84L BA.5.2.2,BA.4
intergenic V108_T111del BA.4
ORF7a V108_T111del BA.4
intergenic L11F BA.4
intergenic F19L BA.4
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic L32F BA.4
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic G66_K68delinsE BA.2.12,BA.4
intergenic F104L BA.4
intergenic F120fs BA.4
intergenic I121fs BA.4
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic P6S BA.4
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4
intergenic G19G BA.5.2.2,BA.4
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4
intergenic G30_S33delinsF BA.4
intergenic P142S BA.4
intergenic P151S BA.4
intergenic PA151SS BA.4
N PA151SS BA.4
intergenic I157I BA.4
intergenic E174E BA.4
intergenic S180I BA.4
intergenic N192N BA.5.1.10,BA.4
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4
intergenic RGT203KRN BA.4
N RGT203KRN BA.4
intergenic T332T BA.4
intergenic Y333Y BA.4
intergenic A336S BA.4
N A336S BA.4
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4
intergenic g.C-12A BA.4
intergenic Q29X BA.4
intergenic g.TG29710T BA.4
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGT29734C BA.4
intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGT29734T BA.4
intergenic g.C-95A BA.5.2.34
intergenic g.T-57G BA.5.2.34
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic R24C BA.4,BA.5.2.34
intergenic K72K BA.5.2.34
intergenic M85del BA.5.2.34
intergenic L92L BA.2.86.1,BA.5.2.34
intergenic H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34
intergenic I114V BA.5.2.34
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34
intergenic P193L BA.5.2.34
intergenic D203N BA.5.2.34
intergenic L259L BA.5.2.34
intergenic F266F BA.5.2.34
intergenic Y304H BA.5.2.34
intergenic C341C BA.5.2.34
intergenic A385V BA.5.2.34
intergenic R402R BA.5.2.34
intergenic A427V BA.5.2.34
intergenic L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34
intergenic D644D BA.5.1.10,BA.5.2.34
ORF1a A687D / NSP2
intergenic A687D BA.5.2.34
intergenic H712H BA.5.2.34
intergenic T727I BA.5.2.34
intergenic V757V BA.5.2.34
intergenic N786N BA.5.2.34
intergenic N811N BA.5.2.34
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
ORF1a D981G / NSP3
intergenic D981G BA.5.2.34
intergenic L1065L BA.5.2.34
intergenic G1073R BA.5.2.34
intergenic Y1174Y BA.5.2.34
intergenic L1186F BA.5.2.34
intergenic L1191L BA.5.2.34
intergenic T1246T BA.5.2.34
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic E1341E BA.5.2.34
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic K1428K BA.5.2.34
intergenic N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34
intergenic L1523L BA.5.2.34
intergenic N1555N BA.5.2.34
intergenic V1629V BA.5.2.34
intergenic T1890I BA.5.2.34
intergenic Y2003Y BA.5.2.34
intergenic D2043D BA.5.2.34
intergenic L2146F BA.5.2.34
intergenic S2242F BA.5.2.34
intergenic G2342E BA.5.2.34
ORF1a S2378P / NSP3
intergenic S2378P BA.5.2.34
intergenic L2518F BA.5.2.34
intergenic P2537S BA.5.2.34
ORF1a H2794H / NSP4
intergenic H2794H BA.5.2.34
intergenic P2870P BA.5.2.34
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic S3099L BA.2.12,BA.5.2.34
intergenic A3209V BA.5.1.10,BA.5.2.34
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic I3341I BA.5.2.34
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic D3439D BA.5.2.34
intergenic A3529A BA.5.2.34
intergenic F3568F BA.5.2.34
intergenic H3580H BA.5.2.34
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic S3742S BA.5.2.34
intergenic V3747I BA.5.2.34
intergenic T3750I BA.5.2.34
intergenic F3753V BA.5.2.34
intergenic N3801N BA.5.2.34
intergenic V3892A BA.5.2.34
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34
intergenic L4064F BA.5.2.34
intergenic D4165N BA.5.2.34
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic T4258T BA.5.2.34
intergenic V4369A BA.5.2.34
intergenic P4486L BA.5.2.34
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34
ORF1b S4825S / NSP12
intergenic S4825S BA.5.2.34
ORF1b A4977S / NSP12
intergenic A4977S BA.5.2.34
intergenic N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34
intergenic T5072T BA.5.2.34
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intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic Y5220Y BA.5.2.34
intergenic T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34
intergenic I5475I BA.5.2.34
intergenic S5490L BA.5.2.34
intergenic T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic P5828S BA.5.2.34
intergenic L5932L BA.5.2.34
intergenic V5939L BA.5.2.34
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic G5969S BA.5.2.34
intergenic P5971P BA.5.2.34
intergenic V6188F BA.5.2.34
intergenic A6206V BA.5.2.34
intergenic C6307C BA.5.2.34
intergenic T6441I BA.5.2.34
ORF1b R6542K / NSP15
intergenic R6542K BA.5.2.34
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
ORF1b K6601N / NSP15
intergenic K6601N BA.5.2.34
intergenic R6658S BA.5.2.34
intergenic A6735A BA.5.2.34
intergenic R7014H BA.5.2.34
intergenic R7014R BA.5.2.34
ORF1b P7049S / NSP16
intergenic P7049S BA.5.2.34
intergenic I7088V BA.5.2.34
intergenic L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic V11V BA.5.2.34
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34
intergenic H146H BA.2.12,BA.5.2.34
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic D215E BA.5.2.34
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic N460I BA.5.2.34
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic F562F BA.5.2.34
intergenic D574N BA.5.2.34
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic Q675Q BA.5.2.34
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic A688V BA.5.2.34
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic V826V BA.5.2.34
intergenic A879V BA.5.2.34
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic V1104L BA.5.2.34
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic C1248F BA.5.2.34
intergenic P1263L BA.5.2.34
intergenic L46F BA.5.2.34
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intergenic L96L BA.5.2.34
intergenic M125I BA.5.2.34
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intergenic R61L BA.5.2.34
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intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic L93L BA.5.2.34
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intergenic C15S BA.5.2.34
ORF7a C15S BA.5.2.34
intergenic Y40Y BA.5.2.34
intergenic V104F BA.5.2.34
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic E33X BA.5.2.34
intergenic L34L BA.5.2.34
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic H17H BA.5.2.34
intergenic P36P BA.1.14,BA.5.2.34
intergenic P38P BA.5.2.34
intergenic S82S BA.5.2.34
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34
intergenic G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34
intergenic T24I BA.5.2.34
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic D103H BA.5.2.34
intergenic A155V BA.5.2.34
intergenic I157I BA.4,BA.5.2.34
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34
intergenic A273S BA.5.2.34
intergenic P302P BA.5.2.34
intergenic T334I BA.5.2.34
intergenic I337I BA.5.2.34
intergenic F346F BA.5.2.34
intergenic L353L BA.5.2.34
intergenic P383P BA.5.2.34
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic P10S BA.2.12,BA.5.2.34
intergenic g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34
intergenic g.C-160T BA.5.1.24
intergenic g.T-98C BA.5.1.24
intergenic g.A-97G BA.5.1.24
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intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic L27L BA.5.1.24
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intergenic G49G BA.5.1.24
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intergenic Q66Q BA.5.1.24
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intergenic G98S BA.5.1.24
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
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intergenic L349V BA.5.1.24
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intergenic G432C BA.5.1.24
intergenic L454F BA.5.1.24
intergenic L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic V491V BA.5.1.24
intergenic S538L BA.5.1.24
intergenic V559A BA.5.1.24
intergenic L580F BA.4,BA.5.1.24
intergenic L580L BA.5.1.24
intergenic I694I BA.5.1.24
intergenic T796T BA.5.1.24
intergenic F813F BA.5.1.24
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic L864L BA.5.1.24
intergenic V886V BA.5.1.24
intergenic T891I BA.2.12,BA.5.1.24
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
ORF1a T1000T / NSP3
intergenic T1000T BA.5.1.24
intergenic I1002T BA.5.1.24
intergenic V1099V BA.5.1.24
intergenic K1112K BA.5.1.24
intergenic P1213L BA.5.1.24
intergenic D1282G BA.5.1.24
intergenic V1299L BA.5.1.24
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic D1323D BA.5.1.24
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic H1500Y BA.5.1.24
intergenic V1570L BA.5.1.24
intergenic D1600N BA.5.1.24
intergenic P1640L BA.5.1.24
intergenic L1680L BA.5.1.24
intergenic N1691N BA.5.1.24
intergenic T1731I BA.5.1.24
intergenic Y1734H BA.5.1.24
intergenic Y1868Y BA.4,BA.5.1.24
intergenic S1924R BA.5.1.24
intergenic C2041C BA.5.1.24
intergenic D2101D BA.5.1.24
intergenic L2113L BA.5.1.24
intergenic S2151G BA.5.1.24
intergenic M2374K BA.5.1.24
intergenic A2470A BA.5.1.24
intergenic P2480P BA.5.1.24
intergenic V2491I BA.5.1.24
intergenic L2609L BA.5.1.24
ORF1a I2634V / NSP3
intergenic I2634V BA.5.1.24
ORF1a C2691C / NSP3
intergenic C2691C BA.5.1.24
intergenic I2806I BA.5.1.24
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic D3222D BA.5.1.24
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic C3285C BA.5.1.24
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic I3341V BA.5.1.24
intergenic M3345I BA.5.1.24
intergenic K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24
intergenic V3388V BA.5.1.24
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic D3511N BA.5.1.24
intergenic D3526G BA.5.1.24
intergenic L3535L BA.2.12,BA.5.1.24
intergenic F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic T3575I BA.5.1.24
ORF1a I3576T / NSP6
intergenic I3576T BA.5.1.24
intergenic L3636L BA.5.1.24
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic M3684V BA.5.1.24
intergenic Y3744Y BA.5.1.24
intergenic Y3765C BA.5.1.24
intergenic V3815V BA.5.1.24
intergenic L3829F BA.5.1.24
intergenic C3867C BA.5.1.24
intergenic V3871V BA.5.1.24
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic T4083T BA.5.1.24
intergenic T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic P4220L BA.5.1.24
intergenic L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24
intergenic G4380G BA.5.1.24
intergenic R4447R BA.5.1.24
intergenic Q4473E BA.5.1.24
intergenic K4483E BA.5.1.24
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic D4769D BA.5.1.24
intergenic P4804P BA.5.1.24
intergenic V4887V BA.5.1.24
intergenic T4983I BA.5.1.24
intergenic R5113C BA.5.1.24
intergenic D5130Y BA.5.1.24
intergenic D5130D BA.5.1.24
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic D5152D BA.5.1.24
intergenic D5225D BA.5.1.24
intergenic A5232A BA.5.1.24
intergenic P5319S BA.5.1.24
intergenic S5360P BA.5.1.24
intergenic P5377S BA.4,BA.5.1.24
intergenic V5422F BA.5.1.24
intergenic L5454L BA.5.1.24
ORF1b T5465I / NSP13
intergenic T5465I BA.5.1.24
intergenic S5490L BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic Y5548C BA.5.1.24
intergenic A5662V BA.5.1.24
intergenic V5672L BA.5.1.24
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic T5737I BA.5.1.24
intergenic T5755I BA.5.1.24
intergenic I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24
ORF1b A5926S / NSP14
intergenic A5926S BA.2.12,BA.5.1.24
intergenic D5955E BA.5.1.24
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
ORF1b I6012I / NSP14
intergenic I6012I BA.5.1.24
intergenic P6046S BA.5.1.24
ORF1b D6069Y / NSP14
intergenic D6069Y BA.5.1.24
intergenic P6368S BA.5.1.24
intergenic F6370F BA.5.1.24
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic V6573V BA.5.1.24
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic K6741N BA.5.1.24
intergenic F6985F BA.5.1.10,BA.5.1.24
intergenic L7042L BA.5.1.24
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic V47V BA.5.1.24
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic K97K BA.5.1.24
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic N165Y BA.5.1.24
S N165Y BA.5.1.24
intergenic K182N BA.5.1.24
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic K444R BA.5.1.24
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic L560L BA.5.1.24
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic L629L BA.5.1.24
intergenic A647S BA.5.1.24
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic N657N BA.5.1.24
intergenic Q675H BA.5.1.24
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic I1130M BA.5.1.24
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic K1205N BA.5.1.24
intergenic G18V BA.5.1.24
intergenic I20I BA.1.17,BA.5.1.24
intergenic R30H BA.5.1.24
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic H78H BA.5.1.24
intergenic L94I BA.5.1.24
intergenic G100C BA.5.1.24
intergenic E102D BA.5.1.24
ORF3a E102D BA.5.1.24
intergenic H182H BA.5.1.24
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic V25V BA.5.1.24
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic Q19E BA.5.1.24
intergenic F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic F100F BA.5.1.24
intergenic H148H BA.5.1.24
intergenic L181L BA.5.1.24
intergenic V5I BA.5.1.24
intergenic A12T BA.5.1.24
intergenic F22_D30del BA.5.1.24
intergenic Y31Y BA.5.1.24
intergenic K38K BA.5.1.24
intergenic g.C-5T BA.4,BA.5.1.24
intergenic C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24
intergenic H19R BA.5.1.24
ORF7a H19R BA.5.1.24
intergenic H73Y BA.5.1.24
intergenic F101F BA.5.1.24
intergenic L116L BA.5.1.24
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic A14A BA.5.1.24
intergenic I121N BA.5.1.24
intergenic I121fs BA.5.1.24
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic Q9H BA.5.1.24
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic D63Y BA.5.1.24
intergenic R89T BA.5.1.24
N R89T BA.5.1.24
intergenic P122S BA.5.1.24
intergenic RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24
intergenic T245I BA.5.2.2,BA.5.1.24
intergenic Q289Q BA.5.1.24
intergenic A311T BA.5.1.24
intergenic R319R BA.5.1.24
intergenic T325I BA.5.1.24
intergenic T362I BA.5.1.24
intergenic D377Y BA.5.1.24
intergenic A398V BA.5.1.24
intergenic D401N BA.5.1.24
intergenic S413R BA.5.1.24
intergenic C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24
intergenic L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic R24C BA.4,BA.5.2.34
ORF1a L39S / NSP1
intergenic L39S BA.5.2.3
intergenic R43C BA.5.2.3
intergenic L92L BA.2.86.1,BA.5.2.34
intergenic H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34
intergenic K120N BA.5.2.3
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic R207C BA.5.2.3
intergenic R226K BA.5.2.3
intergenic S248S BA.5.2.3
intergenic T283I BA.5.2.3
ORF1a K292E / NSP2
intergenic K292E BA.5.2.3
intergenic P305S BA.5.1.10,BA.5.2.3
intergenic T350I BA.5.2.3
intergenic S376L BA.5.2.3
intergenic L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic I473I BA.5.2.3
intergenic A474A BA.5.2.3
intergenic S549S BA.5.2.3
ORF1a T554N / NSP2
intergenic T554N BA.5.2.3
intergenic M584V BA.5.2.3
intergenic L590F BA.5.2.3
intergenic D644D BA.5.1.10,BA.5.2.34
intergenic V660V BA.5.2.3
intergenic K680K BA.5.2.3
intergenic T727I BA.5.2.34,BA.5.2.3
ORF1a P765L / NSP2
intergenic P765L BA.5.2.3
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic A859A BA.5.2.3
intergenic A876T BA.5.2.3
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic N1436N BA.5.2.3
intergenic N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3
intergenic H1500Y BA.5.1.24,BA.5.2.3
ORF1a S1520Y / NSP3
intergenic S1520Y BA.5.2.3
intergenic I1525V BA.5.2.3
ORF1a F1553L / NSP3
intergenic F1553L BA.5.2.3
intergenic T1572I BA.5.2.3
intergenic K1655N BA.5.2.3
intergenic Y1658Y BA.5.2.3
intergenic R1953R BA.5.2.3
intergenic T2021I BA.5.2.3
intergenic A2033V BA.5.2.3
ORF1a I2076M / NSP3
intergenic I2076M BA.5.2.3
ORF1a P2079R / NSP3
intergenic P2079R BA.5.2.3
intergenic K2143K BA.5.2.3
intergenic T2247I BA.5.2.3
ORF1a T2484T / NSP3
intergenic T2484T BA.5.2.3
intergenic A2584V BA.5.2.3
ORF1a D2592Y / NSP3
intergenic D2592Y BA.5.2.3
intergenic S2625S BA.4,BA.5.2.3
intergenic L2675L BA.5.2.3
intergenic N2708N BA.5.2.3
intergenic N2768del BA.5.2.3
intergenic D2833D BA.5.2.3
intergenic V2892F BA.5.2.3
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic A3061A BA.5.2.3
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic S3099L BA.2.12,BA.5.2.34
intergenic F3100F BA.5.2.3
intergenic A3209V BA.5.1.10,BA.5.2.34
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic F3271F BA.5.2.3
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic L3321L BA.5.2.3
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic P3447P BA.5.2.3
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic L3829L BA.5.2.3
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3
intergenic P4197S BA.5.2.3
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic A4357V BA.4,BA.5.2.3
ORF1a G4374S / NSP10
intergenic G4374S BA.5.2.3
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic A4921V BA.5.2.3
intergenic I4928I BA.5.2.3
intergenic N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34
intergenic F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3
intergenic T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3
intergenic A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
ORF1b R5716S / NSP13
intergenic R5716S BA.5.2.3
intergenic F5746F BA.2.12,BA.5.2.3
intergenic V5819V BA.5.2.3
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic P6076L BA.5.2.3
intergenic N6424N BA.5.2.3
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic S6693S BA.5.2.3
intergenic G6890S BA.5.2.3
intergenic K6958R BA.5.2.3
ORF1b D6977G / NSP16
intergenic D6977G BA.5.2.3
intergenic T7032T BA.5.2.3
intergenic P7034S BA.5.2.3
intergenic L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34
intergenic Y145_H146del BA.5.2.3
intergenic H146H BA.2.12,BA.5.2.34
intergenic M153I BA.5.2.3
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic L249S BA.5.2.3
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic R346S BA.4,BA.5.2.3
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic ST375FA BA.5.2.3
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic K444R BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic E484V BA.5.2.3
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.5.2.3
intergenic T547I BA.5.2.3
intergenic P561S BA.5.2.3
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic T618T BA.1.14,BA.5.2.3
intergenic A623V BA.5.2.3
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic A694A BA.5.2.3
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic L878L BA.5.2.3
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic P1162S BA.5.2.3
intergenic E1202Q BA.4.1.8,BA.5.2.3
intergenic A23V BA.5.2.3
intergenic Q38Q BA.5.2.3
intergenic S40L BA.5.2.3
intergenic L53L BA.5.2.3
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic L71I BA.5.2.3
intergenic H78Y BA.2.12,BA.5.2.34
intergenic H93Q BA.5.2.3
intergenic A99S BA.5.2.3
intergenic P104L BA.5.2.3
intergenic V112V BA.5.2.3
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic g.C-23T BA.5.2.3
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3
intergenic F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic I97V BA.5.2.3
intergenic H125N BA.5.2.3
intergenic I161I BA.5.2.3
intergenic L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3
intergenic N207N BA.5.2.3
intergenic L4L BA.5.2.3
intergenic K23_Y31del BA.5.2.3
intergenic D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3
intergenic T28I BA.5.2.3
intergenic Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3
intergenic Y75Y BA.5.2.3
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic P36P BA.1.14,BA.5.2.34
intergenic D119D BA.5.2.3
ORF8 D119D BA.5.2.3
intergenic g.A-8T BA.5.2.3
intergenic g.A-3T BA.5.2.3
intergenic g.CTA-5_-3TTT BA.5.2.3
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic N8T BA.5.2.3
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic Y86Y BA.2.12,BA.5.2.3
intergenic D128E BA.5.2.3
N D128E BA.5.2.3
intergenic A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3
intergenic I157I BA.4,BA.5.2.34
intergenic Y172Y BA.5.2.3
intergenic G175G BA.2.12,BA.5.2.3
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3
intergenic K299K BA.5.2.3
intergenic Y360Y BA.5.2.2,BA.5.2.3
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3
intergenic g.C-13T BA.5.2.3
intergenic P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3
intergenic g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3
intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3
intergenic g.C-222T BA.4,BA.5
intergenic g.C-104T BA.5
intergenic g.G-67A BA.5
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic R24C BA.4,BA.5.2.34
intergenic R24R BA.5
intergenic D25D BA.5
intergenic V26V BA.5
intergenic G32R BA.5
intergenic R43C BA.5.2.3,BA.5
intergenic G49D BA.5.1.24,BA.5
ORF1a K58_L61delinsM / NSP1
intergenic K58_L61delinsM BA.5
intergenic R73C BA.5
intergenic G82_M85delinsV BA.5
intergenic G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5
intergenic H83_M85del BA.5
intergenic M85del BA.2.12,BA.5
intergenic V84_V86del BA.5
intergenic M85del BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic L92L BA.2.86.1,BA.5.2.34
intergenic H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34
intergenic A117T BA.5
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5
intergenic L219L BA.5
ORF1a P271P / NSP2
intergenic P305S BA.5.1.10,BA.5.2.3
intergenic A421A BA.5
intergenic S443S BA.5
ORF1a E452K / NSP2
intergenic E452K BA.5
intergenic L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic G519S BA.5
ORF1a N522N / NSP2
intergenic N522N BA.5
ORF1a K527R / NSP2
intergenic K527R BA.5
intergenic F548S BA.5
intergenic Q556K BA.4,BA.5
intergenic L570L BA.5
intergenic L578L BA.5
intergenic L580F BA.4,BA.5.1.24
intergenic V606V BA.5
intergenic E622G BA.5
intergenic V627F BA.5
intergenic D644D BA.5.1.10,BA.5.2.34
intergenic W646L BA.5
ORF1a I652I / NSP2
ORF1a G661C / NSP2
intergenic G661C BA.5
intergenic I693T BA.5
intergenic Y717Y BA.5
intergenic T727I BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5
intergenic I740I BA.2.12,BA.5
intergenic V774V BA.5
intergenic T796T BA.5.1.24,BA.5
intergenic P820L BA.5
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic N869N BA.5
intergenic F871F BA.5
intergenic T882I BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic T891I BA.2.12,BA.5.1.24
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
ORF1a D930Y / NSP3
intergenic D930Y BA.5
intergenic P971L BA.5
intergenic T1001I BA.2.12,BA.5.1.10
ORF1a S1102R / NSP3
intergenic S1102R BA.5
intergenic H1141Y BA.5
intergenic P1213L BA.5.1.24,BA.5
intergenic D1273D BA.5
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic Y1337Y BA.5
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic F1353fs BA.5.1.10,BA.5
intergenic A1397A BA.2.12,BA.5
intergenic L1438L BA.1.14,BA.5.2.2
intergenic N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5
intergenic T1444A BA.5
intergenic G1456G BA.5
intergenic N1487N BA.5
intergenic H1500Y BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic Y1658Y BA.5.2.3,BA.5
ORF1a M1771V / NSP3
intergenic M1771V BA.5
intergenic P1786L BA.5
intergenic C1847C BA.5
intergenic Y1868Y BA.4,BA.5.1.24
intergenic L1896L BA.5
intergenic V1915I BA.5
intergenic N1922N BA.5
intergenic H1974Y BA.5
intergenic T2007T BA.5
intergenic M2096L BA.5
ORF1a T2197I / NSP3
intergenic V2238V BA.5
intergenic I2244I BA.5
ORF1a F2328L / NSP3
intergenic F2328L BA.5
intergenic P2376P BA.5
intergenic Y2560Y BA.5
intergenic A2584V BA.5.2.3,BA.5
intergenic S2625S BA.4,BA.5.2.3
intergenic A2637T BA.5
intergenic L2675L BA.5.2.3,BA.5
intergenic A2710T BA.2.86.1,BA.1.14,BA.1.17,BA.5
ORF1a P2739P / NSP3
intergenic P2739P BA.5
intergenic M2796I BA.5.1.10,BA.5
ORF1a H2831H / NSP4
intergenic H2831H BA.5
intergenic P2870P BA.5.2.34,BA.5
intergenic N2894N BA.1.14,BA.5.1.10
intergenic S2900L BA.5
intergenic S2992S BA.5
intergenic F3018F BA.4,BA.5
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic Y3062Y BA.5
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic S3099L BA.2.12,BA.5.2.34
intergenic A3209V BA.5.1.10,BA.5.2.34
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic F3271F BA.5.2.3,BA.5
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic H3327H BA.5
intergenic K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5
ORF1a T3361T / NSP5
intergenic T3361T BA.5
ORF1a P3371T / NSP5
intergenic P3371T BA.5
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic P3395Y BA.5
intergenic G3437G BA.4,BA.5
intergenic P3504L BA.5
intergenic L3535L BA.2.12,BA.5.1.24
intergenic F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5
intergenic F3604L BA.5
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5
intergenic M3627I BA.5
intergenic A3645A BA.5
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic A3705A BA.5
intergenic L3796L BA.2.12,BA.5
intergenic L3828L BA.5
intergenic N3928N BA.5
intergenic N3937N BA.5
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3
intergenic L4149L BA.5
intergenic N4173N BA.5
intergenic T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24
ORF1a G4178V / NSP9
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic N4235N BA.4,BA.5
intergenic Y4283Y BA.5
intergenic L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic T4355I BA.5
intergenic A4357V BA.4,BA.5.2.3
intergenic K4377N BA.5
intergenic L4391F BA.5
intergenic G4417G BA.5
intergenic L4482F BA.5
intergenic K4483R BA.5
ORF1b L4519I / NSP12
intergenic L4519I BA.5
intergenic N4560N BA.5
intergenic Y4567Y BA.5
intergenic A4568A BA.5
intergenic T4638T BA.5
intergenic R4641S BA.5
intergenic T4654I BA.5
intergenic P4715F BA.5.2.2,BA.4,BA.5
intergenic P4715L BA.5.2.2,BA.4,BA.5
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic S4843S BA.5
intergenic N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5
intergenic M4993I BA.5
intergenic N5020N BA.1.17,BA.5
intergenic T5036T BA.5
intergenic G5063C BA.5
intergenic F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5
intergenic D5132Y BA.5
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
ORF1b Y5180Y / NSP12
intergenic Y5180Y BA.5
intergenic H5208H BA.5
ORF1b Q5214L / NSP12
intergenic Q5214L BA.5
intergenic L5221F BA.5
intergenic Y5223Y BA.5
intergenic A5232A BA.5.1.24,BA.5
intergenic F5273F BA.5
intergenic D5302D BA.5
intergenic V5322V BA.5
intergenic C5332C BA.5
intergenic P5377S BA.4,BA.5.1.24
intergenic T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3
intergenic S5490L BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5
intergenic I5658V BA.5
intergenic V5672L BA.5.1.24,BA.5
intergenic A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic P5726P BA.5
intergenic F5746F BA.2.12,BA.5.2.3
intergenic I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24
intergenic T5805M BA.5
intergenic R5826R BA.5
ORF1b A5926S / NSP14
intergenic A5926S BA.2.12,BA.5.1.24
intergenic T5956I BA.5.2.2,BA.5
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic D5973N BA.5
intergenic E6017E BA.5
intergenic A6044V BA.5
ORF1b P6083L / NSP14
intergenic P6083L BA.5
intergenic P6222L BA.5
intergenic D6249D BA.5
intergenic D6256D BA.5.2.2,BA.5
ORF1b S6282N / NSP14
intergenic S6282N BA.5
intergenic D6315G BA.5
intergenic DRYP6315EGCH BA.2.12,BA.5
intergenic Y6317Y BA.5
intergenic N6335N BA.5
intergenic L6393L BA.5
intergenic L6420L BA.5
intergenic M6425T BA.5
intergenic N6446N BA.4.1.8,BA.5
intergenic D6491N BA.5
intergenic L6509L BA.5
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic V6573V BA.5.1.24,BA.5
intergenic D6576D BA.5
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic G6598S BA.5
intergenic F6628F BA.5
intergenic G6738C BA.5
intergenic S6760S BA.5
intergenic T6777I BA.5
intergenic L6797L BA.5
intergenic A6832V BA.5
intergenic R6884K BA.5
intergenic L6924F BA.2.12,BA.5.1.10
intergenic T6938I BA.2.12,BA.5
intergenic G6953G BA.4.1.8,BA.5
intergenic K6958R BA.5.2.3,BA.5
intergenic F6985F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5
intergenic A6997A BA.4,BA.5
intergenic L7070S BA.5
intergenic L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic S12_T20del BA.5
S S12_T20del BA.5
intergenic T19I BA.5
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic D53D BA.5
intergenic S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34
intergenic H69del BA.1.14,BA.1.17,BA.5
intergenic V70del BA.1.14,BA.1.17,BA.5
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic V127F BA.2.86.1,BA.5.2.2
intergenic D138_Y144del BA.5
intergenic G142D BA.5
intergenic G142_Y144delinsDV BA.5
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34
intergenic H146Y BA.5
intergenic H146H BA.2.12,BA.5.2.34
intergenic S172S BA.5
S S172S BA.5
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic I231T BA.5
intergenic P251H BA.5
intergenic S255F BA.5
intergenic P272L BA.5
intergenic D294D BA.5.1.10,BA.5
intergenic L296L BA.5.2.2,BA.5
intergenic T299I BA.5
intergenic K304K BA.5
S K304K BA.5
intergenic F306L BA.5
S F306L BA.5
intergenic V327V BA.5
S V327V BA.5.5,BA.5
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34
intergenic R346S BA.4,BA.5.2.3
intergenic N354N BA.5
intergenic R357K BA.5
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5
intergenic R403K BA.2.86.1,BA.5
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic C432C BA.5
intergenic N440K BA.5
intergenic N440R BA.5
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic K444R BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic VG445AS BA.5
intergenic N448S BA.2.12,BA.5
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic N460S BA.5
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5
intergenic ST477DK BA.5
S ST477DK BA.5
intergenic ST477NK BA.5
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic E484A BA.5
intergenic VE483RA BA.5
S VE483RA BA.5
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.5.2.3
intergenic T547I BA.5.2.3,BA.5
intergenic N603N BA.4.1.8,BA.5.1.10
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic T618T BA.1.14,BA.5.2.3
intergenic L629V BA.5
S L629V BA.5
S L629L BA.5.1.24,BA.5.5,BF.9
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic P665P BA.5
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic A684V BA.5
intergenic A688V BA.5.2.34,BA.5
intergenic V736I BA.5
S V736I BA.5
intergenic T739T BA.5
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic A879A BA.5
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic N960N BA.5
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
S V1133V BA.2,BA.5.1.30
intergenic P1143S BA.5
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic D1153Y BA.5
intergenic P1162S BA.5.2.3,BA.5
intergenic E1202Q BA.4.1.8,BA.5.2.3
intergenic M5T BA.5
intergenic I20I BA.1.17,BA.5.1.24
intergenic A23S BA.5
intergenic D27Y BA.4.1.8,BA.5
intergenic V55A BA.5
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic L71L BA.5
intergenic H78Y BA.2.12,BA.5.2.34
intergenic Y91Y BA.5
intergenic A99T BA.5
intergenic L106L BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic V112V BA.5.2.3,BA.5
intergenic C148C BA.5.1.10,BA.5
intergenic T170T BA.5
intergenic E194G BA.5
intergenic Y206Y BA.4,BA.5
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic S272S BA.5
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic V17V BA.5
intergenic L73L BA.5
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5
intergenic L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic L56L BA.4,BA.5
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic L102L BA.5
intergenic L124L BA.2.12,BA.4,BA.5
intergenic H125Y BA.5
intergenic H148H BA.5.1.24,BA.5
M H148H BA.5.1.24,BA.5
intergenic L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3
intergenic T172T BA.5
intergenic Y179Y BA.5.2.2,BA.5
intergenic L29L BA.5
intergenic Y31Y BA.5.1.24,BA.5
intergenic D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3
intergenic X62fs BA.5
ORF6 X62fs BA.5
intergenic g.-7_-4delAACG BA.5
ORF6 g.-7_-4delAACG BA.5
intergenic g.C-5T BA.4,BA.5.1.24
intergenic g.C-1T BA.5
intergenic T11K BA.5
intergenic C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5
intergenic T28I BA.5.2.3,BA.5
intergenic Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3
intergenic H47N BA.5
intergenic Q62X BA.5
intergenic V74I BA.5
ORF7a V74I BA.5.2.20,BA.5
intergenic Y75C BA.5
intergenic P84L BA.5.2.2,BA.4,BA.5
intergenic L116L BA.5.1.24,BA.5
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic Q35K BA.5
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic H17H BA.5.2.34,BA.5
intergenic Q18X BA.5
intergenic P36L BA.5
intergenic P36P BA.1.14,BA.5.2.34
intergenic E59E BA.5
intergenic A65V BA.4.1.8,BA.5
intergenic I71T BA.5.2.2,BA.5.1.10
ORF8 H112H BA.2.3,BA.5.1.30
intergenic I121fs BA.5
intergenic g.A-3T BA.5.2.3,BA.5
intergenic g.CTA-5_-3TTT BA.5.2.3,BA.5
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic G5E BA.5
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5
intergenic G25V BA.5
N G25V BA.5
intergenic N27N BA.5
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic G30_S33delinsF BA.4,BA.5
intergenic T49I BA.5
intergenic K65R BA.5
intergenic P67L BA.2.12,BA.5.1.10
intergenic D82D BA.5
intergenic Y86Y BA.2.12,BA.5.2.3
intergenic A119S BA.5
intergenic A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3
intergenic H145H BA.5
intergenic P151S BA.4,BA.5
intergenic P151L BA.5
intergenic I157I BA.4,BA.5.2.34
intergenic L161F BA.5
intergenic G175G BA.2.12,BA.5.2.3
intergenic P199S BA.5
intergenic RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5
intergenic L219F BA.5
intergenic G243G BA.5
intergenic T245I BA.5.2.2,BA.5.1.24
intergenic E253E BA.5
intergenic Y268Y BA.5.1.10,BA.5
intergenic F274F BA.5.1.10,BA.5
N Q289Q BA.5.1.24,BA.5.1.30
intergenic H300H BA.5
intergenic P302S BA.5
intergenic D341D BA.4.1.8,BA.5
intergenic Y360Y BA.5.2.2,BA.5.2.3
intergenic T366T BA.5
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5
intergenic V6I BA.5
intergenic P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3
intergenic C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5
intergenic M21I BA.5
ORF10 M21I BA.5
intergenic S23F BA.5
intergenic R24C BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5
intergenic g.T29685G BA.5
intergenic g.G29692T BA.5
intergenic g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5
intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAG BA.5
intergenic g.C-80T BA.5.1.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic E36E BA.5.1.1
intergenic G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1
intergenic G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1
intergenic M85_V86del BA.5.1.1
intergenic M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1
intergenic V111A BA.5.1.1
intergenic V121F BA.5.1.1
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic I222V BA.5.1.1
intergenic S279F BA.5.1.1
intergenic S318L BA.5.1.1
intergenic P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1
intergenic L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic A498V BA.5.1.1
intergenic A599A BA.5.1.1
intergenic V606V BA.5,BA.5.1.1
intergenic G618S BA.5.1.1
intergenic T727I BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic G817G BA.5.1.1
intergenic IT841VI BA.5.1.1
intergenic T842I BA.5.1.1
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5
intergenic T882I BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic E929E BA.5.1.1
intergenic T1001I BA.2.12,BA.5.1.10
ORF1a K1124Q / NSP3
intergenic K1124Q BA.5.1.1
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
ORF1a Y1536C / NSP3
intergenic Y1536C BA.5.1.1
intergenic S1743F BA.5.1.1
ORF1a M2254R / NSP3
intergenic M2254R BA.5.1.1
intergenic T2274I BA.5.1.1
intergenic D2299D BA.4,BA.5.1.1
intergenic A2325A BA.5.1.1
intergenic L2524S BA.5.1.1
intergenic S2631S BA.5.1.1
intergenic A2784V BA.5.1.1
intergenic N2894N BA.1.14,BA.5.1.10
intergenic V3024I BA.5.1.1
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic L3430L BA.5.1.1
intergenic D3439D BA.5.2.34,BA.5.1.1
intergenic T3459T BA.5.1.1
intergenic L3495F BA.5.1.1
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5
ORF1a A3625T / NSP6
intergenic A3625T BA.5.1.1
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic V3708V BA.5.1.1
intergenic I3853I BA.5.1.10,BA.5.1.1
intergenic N3896N BA.5.1.1
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
ORF1a T4079I / NSP8
intergenic T4079I BA.5.1.1
intergenic T4083M BA.5.1.1
intergenic G4178V BA.5.1.1
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic P4220L BA.5.1.24,BA.5.1.1
intergenic N4235N BA.4,BA.5,BA.5.1.1
intergenic V4372I BA.5.1.1
ORF1a M4390T / NSP10
intergenic M4390T BA.5.1.1
intergenic L4639L BA.5.1.1
intergenic T4640T BA.5.1.1
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1
intergenic Y4871Y BA.5.1.1
ORF1b L4906F / NSP12
intergenic L4906F BA.5.1.1
intergenic G5063S BA.5.1.1
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic N5182N BA.5.1.1
intergenic A5660T BA.5.1.1
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic V6016V BA.5.1.1
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic H6686Y BA.5.1.1
ORF1b Q6696R / NSP15
intergenic Q6696R BA.5.1.1
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intergenic P6860P BA.5.1.1
intergenic T6918I BA.5.1.1
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intergenic A6997A BA.4,BA.5,BA.5.1.1
intergenic G7011N BA.5.1.1
intergenic L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic D53D BA.5,BA.5.1.1
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1
intergenic G72G BA.5.1.1
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intergenic H146del BA.5.1.1
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
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intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
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intergenic N603N BA.4.1.8,BA.5.1.10
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
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intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic Q690L BA.5.1.1
S Q690L BA.5.1.1
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic A846A BA.5.1.1
intergenic R847K BA.5.1.1
S R847K BA.5.1.1
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic I1169I BA.5.1.1
intergenic E1195E BA.5.1.1
S E1195E BA.5.1.1
intergenic Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1
intergenic C1236S BA.5.1.1
S C1236S BA.5.1.1
intergenic S1252P BA.5.1.1
intergenic K21N BA.5.1.10,BA.5.1.1
intergenic V48F BA.5.1.1
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic L94I BA.5.1.24,BA.5.1.1
intergenic L95F BA.5.1.1
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intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic V25V BA.5.1.24,BA.5.1.1
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic L124L BA.2.12,BA.4,BA.5,BA.5.1.1
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intergenic T39I BA.5.1.1
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic I71T BA.5.2.2,BA.5.1.10
intergenic Y105Y BA.5.1.1
intergenic I121fs BA.5,BA.5.1.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic D22G BA.5.1.1
intergenic G25D BA.5.1.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic P67L BA.2.12,BA.5.1.10
intergenic A182T BA.5.1.1
intergenic RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic H300Y BA.5.1.1
intergenic F315F BA.5.1.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1
intergenic C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1
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intergenic L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1
intergenic g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic A735A BA.1.14,BA.1.18
intergenic K856R BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
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intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic P3395H BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18
intergenic L3674_G3676del BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18
intergenic I3758V BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18
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intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
ORF1b P6519S / NSP15
intergenic P6519S BA.1.18
intergenic V11V BA.5.2.34,BA.1.18
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intergenic V70del BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18
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intergenic G142_Y145delinsD BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18
intergenic N211_L212delinsI BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18
intergenic R214_D215insEPE BA.1.17,BA.1.18
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
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intergenic S375F BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic G446S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18
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intergenic T547K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic N856K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic L981F BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic D155Y BA.1.18
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic D3G BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18
intergenic RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18
intergenic R24L BA.1.18
intergenic g.C29774T BA.1.18
intergenic g.C-49T BA.5.2.8
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic G49C BA.5.2.8
intergenic G49D BA.5.1.24,BA.5,BA.5.2.8
intergenic G82_V86del BA.5.2.8
intergenic M85_E87delinsK BA.5.2.8
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic G137G BA.5.2.8
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic V378I BA.4,BA.5.2.8
intergenic N449N BA.5.2.8
intergenic L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic V459V BA.5.2.8
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8
intergenic E913G BA.5.2.8
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic H1108H BA.5.2.8
intergenic H1141Y BA.5,BA.5.2.8
intergenic Q1227Q BA.5.2.8
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic F1353fs BA.5.1.10,BA.5,BA.5.2.8
intergenic T1597T BA.5.2.8
intergenic K1781K BA.5.2.8
intergenic P1786S BA.5.2.8
intergenic V1931V BA.5.2.8
intergenic S1978F BA.5.2.8
intergenic A2033V BA.5.2.3,BA.5.2.8
intergenic S2242F BA.5.2.34,BA.5.2.8
intergenic D2299D BA.4,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic T2335T BA.5.2.8
intergenic N2678N BA.5.2.8
intergenic L2869F BA.5.2.8
intergenic G2941S BA.5.2.8
intergenic S2960P BA.5.2.8
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic L3198L BA.2.12,BA.5.2.8
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic T3258T BA.5.2.8
intergenic F3271F BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic D3479D BA.5.2.8
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic I3738I BA.5.2.8
intergenic Y3803Y BA.2.12,BA.5.2.8
intergenic A3856A BA.5.2.8
intergenic L3887L BA.5.2.8
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic L3984L BA.5.2.8
intergenic Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8
intergenic L4037F BA.5.2.8
ORF1a Q4151R / NSP9
intergenic Q4151R BA.5.2.8
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic V4372V BA.5.2.8
intergenic K4483N BA.5.2.8
intergenic Y4555Y BA.5.2.8
intergenic T4617T BA.5.2.8
intergenic T4638T BA.5,BA.5.2.8
ORF1b D4661D / NSP12
intergenic D4661D BA.5.2.8
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic T4786M BA.5.2.8
ORF1b G5062V / NSP12
intergenic G5062V BA.5.2.8
intergenic Y5140Y BA.5.2.8
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic T5195I BA.5.2.8
intergenic L5349L BA.5.2.8
intergenic P5371L BA.5.1.10,BA.5.2.8
intergenic T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8
intergenic R5453K BA.5.2.8
intergenic K5463K BA.5.2.8
intergenic A5620S BA.5.2.8
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic D5725D BA.5.2.8
intergenic I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5.2.8
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic D6051D BA.5.2.8
ORF1b F6108L / NSP14
intergenic F6108L BA.5.2.8
ORF1b I6200T / NSP14
intergenic I6200T BA.5.2.8
ORF1b V6207C / NSP14
intergenic V6207C BA.5.2.8
intergenic N6347N BA.5.2.8
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic L6614F BA.5.2.8
ORF1b M6670K / NSP15
intergenic M6670K BA.5.2.8
ORF1b L6697L / NSP15
intergenic L6697L BA.5.2.8
intergenic Y6794Y BA.5.2.8
intergenic L6819L BA.5.2.2,BA.5.2.8
intergenic L6898F BA.5.2.8
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic F59S BA.5.2.8
intergenic S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.8
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic L84L BA.5.2.8
intergenic K97N BA.5.2.8
intergenic V130V BA.5.2.8
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic E180G BA.5.2.8
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic P631P BA.5.2.8
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic N658D BA.5.2.8
S N658D BA.5.2.8
intergenic P665P BA.5,BA.5.2.8
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic F855F BA.5.2.8
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic A1020S BA.4,BA.5.2.8
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic A51T BA.5.2.8
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic P138P BA.5.2.8
intergenic S180P BA.5.2.8
ORF3a S180P BA.5.2.8
intergenic Y211Y BA.5.2.8
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic I249I BA.5.2.8
intergenic P258L BA.5.2.8
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic M84V BA.5.2.8
M M84V BA.5.2.8
intergenic L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8
intergenic V122V BA.5.2.8
intergenic P132P BA.5.2.8
intergenic L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8
intergenic T21I BA.5.2.8
intergenic P34L BA.5.2.8
intergenic S36_T39del BA.5.2.8
ORF7a S36_T39del BA.5.2.8
intergenic Y40Y BA.5.2.8
intergenic D69D BA.1.14,BA.5.2.8
intergenic H73Y BA.5.1.24,BA.5.2.8
intergenic L77S BA.5.2.8
intergenic P99S BA.5.2.8
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic C25S BA.5.2.8
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8
intergenic F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8
intergenic A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8
intergenic S194L BA.5.2.8
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic K248K BA.5.2.8
N K248K BA.5.2.8
intergenic A376A BA.5.2.8
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8
intergenic g.C29696T BA.5.2.8
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic G82_M85delinsV BF.20
intergenic G112G BF.20
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
ORF1a T677A / NSP2
intergenic T677A BF.20
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
ORF1a D978N / NSP3
intergenic D978N BF.20
ORF1a S984I / NSP3
intergenic S984I BF.20
intergenic K1231E BF.20
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic P1921S BF.20
intergenic V2238V BA.5,BF.20
ORF1a T2274N / NSP3
intergenic T2274N BF.20
intergenic G2987G BF.20
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic D5271G BF.20
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10,BF.20
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic T172T BA.5,BF.20
intergenic P57L BF.20
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic A419A BF.20
intergenic g.C29686G BF.20
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic H13Y BA.5.1.2
intergenic L16L BA.5.1.2
intergenic S17_L18delinsM BA.5.1.2
intergenic M85del BA.5.1.2
intergenic M85del BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2
intergenic P153L BA.5.1.2
intergenic S166G BA.5.1.2
intergenic V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5
intergenic P271S BA.5.1.2
intergenic P309Q BA.5.1.2
intergenic G334C BA.5.1.2
ORF1a K394N / NSP2
intergenic K394N BA.5.1.2
intergenic L446F BA.5.1.2
intergenic L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic L580F BA.4,BA.5.1.24
intergenic A591V BA.5.1.10,BA.5.1.2
intergenic V665V BA.5.1.2
intergenic A698V BA.5.1.2
intergenic F741F BA.5.1.2
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic A872A BA.5.1.2
intergenic T891I BA.2.12,BA.5.1.24
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic A967S BA.5.1.2
intergenic P971L BA.5,BA.5.1.2
intergenic L1097L BA.5.1.2
intergenic G1155C BA.5.1.2
intergenic I1203I BA.5.1.2
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic Y1337Y BA.5,BA.5.1.2
intergenic K1350R BA.5.1.2
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic F1353fs BA.5.1.10,BA.5,BA.5.2.8,BA.5.1.2
intergenic L1445L BA.5.1.2
intergenic L1643L BA.5.1.2
intergenic T1760I BA.5.1.2
intergenic C1847C BA.5,BA.5.1.2
intergenic Y1868Y BA.4,BA.5.1.24
intergenic D2101D BA.5.1.24,BA.5.1.2
intergenic T2183I BA.5.1.2
ORF1a T2197I / NSP3
intergenic T2197I BA.5.1.2
intergenic S2242F BA.5.2.34,BA.5.2.8,BA.5.1.2
intergenic C2445C BA.4.1.8,BA.5.1.2
intergenic N2523N BA.5.1.2
ORF1a G2842G / NSP4
intergenic G2842G BA.5.1.2
intergenic G2871G BA.5.1.2
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic N3029N BA.5.1.2
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic I3055I BA.5.1.2
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic N3239N BA.5.1.2
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic S3273S BA.5.1.2
intergenic N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic K3351R BA.5.1.2
intergenic K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5
intergenic P3359S BA.5.1.10,BA.5.1.2
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic L3535L BA.2.12,BA.5.1.24
ORF1a M3539I / NSP5
intergenic M3539I BA.5.1.2
intergenic F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic A3615V BA.5.1.2
intergenic D3671D BA.5.1.2
intergenic T3672N BA.5.1.2
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic D3897D BA.5.1.2
intergenic L3919F BA.5.1.2
intergenic D3936D BA.5.1.2
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic D4020D BA.5.1.2
intergenic T4083M BA.5.1.1,BA.5.1.2
intergenic Y4172Y BA.5.1.2
intergenic T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic T4217I BA.5.1.2
intergenic L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic A4396V BA.5.1.2
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic D4769D BA.5.1.24,BA.5.1.2
intergenic N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2
ORF1b L5055L / NSP12
intergenic L5055L BA.5.1.2
intergenic D5130D BA.5.1.24,BA.5.1.2
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic Y5220Y BA.5.2.34,BA.5.1.2
intergenic A5232A BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.2
ORF1b M5298I / NSP12
intergenic M5298I BA.5.1.2
intergenic P5377S BA.4,BA.5.1.24
ORF1b T5385N / NSP13
intergenic T5385N BA.5.1.2
intergenic Y5388Y BA.2.12,BA.5.1.2
intergenic S5404G BA.5.1.2
intergenic S5490L BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.1.24
intergenic Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2
intergenic S5701S BA.5.1.2
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5.2.8
intergenic V5819V BA.5.2.3,BA.5.1.2
intergenic P5828S BA.5.2.34,BA.5.1.2
intergenic T5871A BA.5.1.2
ORF1b A5926S / NSP14
intergenic A5926S BA.2.12,BA.5.1.24
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic D6270G BA.5.1.2
intergenic P6376S BA.5.1.2
intergenic N6443N BA.5.1.2
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic E6597D BA.5.1.2
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic V6638V BA.5.1.2
intergenic H6686Y BA.5.1.1,BA.5.1.2
intergenic L6819L BA.5.2.2,BA.5.2.8,BA.5.1.2
intergenic A6914V BA.5.1.2
intergenic D6931D BA.5.1.2
intergenic F6985F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5
intergenic L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2
intergenic T19I BA.5.2.2,BA.5.1.2
intergenic T19L BA.5.2.2,BA.5.1.2
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic T29I BA.5.1.2
intergenic F32F BA.5.1.10,BA.5.1.2
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic V83V BA.5.1.10,BA.5.1.2
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic D178N BA.5.1.2
intergenic F186F BA.5.1.2
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic S256L BA.5.1.2
intergenic T299I BA.5,BA.5.1.2
intergenic T307I BA.5.1.2
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic D427D BA.5.1.2
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic N450I BA.5.1.2
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic P621P BA.5.1.2
S P621P BA.5.1.2
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic D936D BA.5.1.2
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic T9K BA.5.1.2
intergenic I20I BA.1.17,BA.5.1.24
intergenic S60S BA.5.1.2
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic L73L BA.5.1.2
intergenic S177I BA.5.1.2
intergenic F207F BA.5.1.2
intergenic Y211C BA.5.1.2
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic P240L BA.5.1.2
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic L19L BA.5.1.2
intergenic S55F BA.5.1.2
intergenic N66N BA.5.1.2
intergenic AD2VN BA.5.1.2
intergenic D3N BA.5.1.2
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10,BF.20,BA.5.1.2
intergenic F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8
intergenic V5I BA.5.1.24,BA.5.1.2
intergenic L16L BA.5.1.1,BA.5.1.2
intergenic g.C-5T BA.4,BA.5.1.24
intergenic C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2
intergenic L31L BA.5.1.2
intergenic F54L BA.5.1.2
intergenic L86L BA.5.1.2
intergenic L116F BA.4.1.8,BA.5.1.2
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic A51V BA.5.1.2
intergenic S69P BA.5.1.2
intergenic P70T BA.5.1.2
ORF8 P70T BA.5.1.2
intergenic S103L BA.5.1.2
intergenic E106X BA.5.1.2
intergenic F120F BA.5.1.2
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic T54T BA.5.1.2
intergenic S78S BA.5.1.2
intergenic G114G BA.5.1.2
intergenic D128D BA.5.1.2
intergenic A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2
intergenic N140N BA.5.1.2
intergenic A152S BA.5.1.10,BA.5.1.2
intergenic A155V BA.5.2.34,BA.5.1.2
intergenic G178G BA.5.1.2
intergenic S197S BA.5.1.2
intergenic RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic T245I BA.5.2.2,BA.5.1.24
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2
intergenic g.G-5T BA.5.1.2
intergenic C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1
intergenic L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2
intergenic g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2
intergenic g.G29706A BA.5.1.2
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
ORF1a L204L / NSP2
intergenic L204L BF.41
intergenic S443F BA.5.2.2,BF.41
intergenic L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic S944L BF.41
intergenic N1094_G1095delinsR BF.41
intergenic P1158S BF.41
intergenic I1232I BF.41
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic H1818Y BF.41
intergenic S2389L BF.41
intergenic Y2560Y BA.5,BF.41
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic F3329F BF.41
intergenic P3371S BF.41
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic L3591I BF.41
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
ORF1b F4834fs / NSP12
intergenic F4834fs BF.41
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic F5958F BF.41
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic Y5989Y BF.41
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic G257V BF.41
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic N777N BF.41
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic H1101Y BF.41
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic K192K BF.41
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic T172T BA.5,BF.20,BF.41
ORF6 A12V BF.41
intergenic D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3,BF.41
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic A43V BF.41
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic V62L BF.41
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41
intergenic S21S BF.41
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic S193T BF.41
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic g.CGTC-25_-22TGTT BF.9
intergenic V35V BF.9
intergenic G133G BF.9
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5,BF.9
intergenic D264D BF.9
intergenic S302F BA.5.1.24,BF.9
intergenic L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9
intergenic I473I BA.5.2.3,BF.9
intergenic I502V BF.9
intergenic A516V BF.9
intergenic M584V BA.5.2.3,BF.9
intergenic V606I BF.9
intergenic I616I BF.9
ORF1a P777L / NSP2
intergenic P777L BF.9
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
ORF1a T1001N / NSP3
intergenic T1001N BF.9
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic E1340D BF.9
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic T1521I BF.9
ORF1a F1527L / NSP3
intergenic F1527L BF.9
intergenic T1543I BF.9
intergenic T1597I BF.9
ORF1a V1661V / NSP3
intergenic V1661V BF.9
intergenic T1665T BF.9
intergenic G1764S BF.9
intergenic Y1873Y BA.5.1.10,BF.9
ORF1a S2048Y / NSP3
intergenic S2048Y BF.9
intergenic G2091G BF.9
intergenic D2101D BA.5.1.24,BA.5.1.2,BF.9
intergenic S2103F BA.2.86.1,BF.9
intergenic S2193F BF.9
intergenic V2238V BA.5,BF.20,BF.9
ORF1a R2267K / NSP3
intergenic R2267K BF.9
intergenic G2322G BF.9
intergenic V2324F BF.9
ORF1a A2733A / NSP3
intergenic A2733A BF.9
intergenic S2803L BF.9
intergenic A2856V BF.9
intergenic R2985R BF.9
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic F3100F BA.5.2.3,BF.9
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2,BF.9
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
ORF1a Q3596H / NSP6
intergenic Q3596H BF.9
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9
intergenic L3644F BF.9
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
ORF1a V3708L / NSP6
intergenic V3708L BF.9
intergenic F3785F BF.9
intergenic Y3813Y BF.9
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic D4317D BF.9
intergenic P4619L BF.9
intergenic T4638I BF.9
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic D4769D BA.5.1.24,BA.5.1.2,BF.9
intergenic P4897P BF.9
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic Y5276Y BF.9
intergenic A5342V BA.4,BF.9
intergenic A5532V BF.9
intergenic A5713V BF.9
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic A5727S BF.9
ORF1b T5873A / NSP13
intergenic T5873A BF.9
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic T6038I BF.9
ORF1b V6241F / NSP14
intergenic V6241F BF.9
ORF1b P6545P / NSP15
intergenic P6545P BF.9
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
ORF1b D6734Y / NSP15
intergenic D6734Y BF.9
intergenic S6740F BF.9
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic F55F BF.9
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic H146H BA.2.12,BA.5.2.34,BF.9
intergenic N185S BF.9
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic P272S BF.9
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic L629L BA.5.1.24,BF.9
S L629L BA.5.1.24,BA.5.5,BF.9
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic T734T BF.9
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic R847R BF.9
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic S967S BF.9
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic G1124V BF.9
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic N1192D BF.9
intergenic Q57H BF.9
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic L73F BF.9
intergenic L94F BA.4,BF.9
intergenic L101L BF.9
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic g.T-26C BF.9
intergenic g.A-9G BF.9
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic N41N BF.9
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic T172T BA.5,BF.20,BF.41,BF.9
intergenic V29A BF.9
intergenic Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic W29L BF.9
intergenic E33G BF.9
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic C37R BF.9
ORF8 C37R BF.9
intergenic I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9
intergenic T24I BA.5.2.34,BF.9
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic N126N BF.9
intergenic N140N BA.5.1.2,BF.9
intergenic H145L BF.9
N H145L BF.9
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic S235S BF.9
intergenic F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9
intergenic S327L BF.9
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9
intergenic g.T29680C BF.9
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1
intergenic M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1
intergenic N162N BA.4.1
intergenic S166G BA.5.1.2,BA.4.1
intergenic N188N BA.4.1.8,BA.4.1
intergenic D220D BA.5.1.24,BA.4.1
intergenic C231C BA.4.1
intergenic T333M BA.4.1
intergenic G442C BA.4.1
intergenic G519S BA.5,BA.4.1
ORF1a R542R / NSP2
intergenic R542R BA.4.1
intergenic V627F BA.5,BA.4.1
intergenic L642F BA.4.1
ORF1a K669T / NSP2
intergenic K669T BA.4.1
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intergenic A776T BA.4.1
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intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic P971S BA.5.1.10,BA.4.1
intergenic T1035I BA.4.1
intergenic N1059N BA.4.1
intergenic A1060V BA.4.1
intergenic G1125D BA.4.1.8,BA.4.1
intergenic H1160Y BA.4.1.8,BA.4.1
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic P1541P BA.4.1
ORF1a N1672N / NSP3
intergenic N1672N BA.4.1
intergenic Y1700Y BA.4.1
intergenic P1803L BA.4.1
intergenic T1822I BA.1.18,BA.4.1
intergenic N1917N BA.4.1
intergenic H1974H BA.4.1
ORF1a S2048A / NSP3
ORF1a V2051L / NSP3
intergenic V2051L BA.4.1
intergenic A2139T BA.4.1
ORF1a T2283T / NSP3
intergenic T2283T BA.4.1
ORF1a T2300A / NSP3
intergenic T2300A BA.4.1
intergenic F2351F BA.4.1
ORF1a K2511K / NSP3
intergenic K2511K BA.4.1
intergenic K2810K BA.4.1
intergenic R2949R BA.4.1
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic I3055I BA.5.1.2,BA.4.1
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
ORF1a N3159N / NSP4
intergenic N3159N BA.4.1
intergenic A3179A BA.4.1
intergenic L3191L BA.5.2.2,BA.4.1
intergenic Y3250Y BA.4.1
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic M3280I BA.4.1
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic L3321L BA.5.2.3,BA.4.1
intergenic A3333T BA.4.1
intergenic R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic N3494N BA.4.1
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1
intergenic L3636L BA.5.1.24,BA.4.1
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic T3750I BA.5.2.34,BA.4.1
intergenic G3757S BA.4.1
ORF1a L3808L / NSP6
intergenic L3808L BA.4.1
intergenic K3839K BA.4.1
intergenic D3864D BA.4.1
intergenic N3928N BA.5,BA.4.1
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic L4045L BA.4,BA.4.1
intergenic P4058P BA.4.1
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic T4412A BA.4.1
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intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic F4820F BA.5.1.10,BA.4.1
intergenic S4843I BA.4.1
intergenic N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1
intergenic F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1
intergenic H5117H BA.4.1
intergenic T5131I BA.4.1
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic L5283L BA.4,BA.4.1
intergenic A5660T BA.5.1.1,BA.4.1
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic P6065S BA.4.1
intergenic D6069D BA.2.12,BA.4.1
intergenic L6102L BA.4.1
intergenic D6249D BA.5,BA.4.1
ORF1b D6270D / NSP14
intergenic D6270D BA.4.1
intergenic DRYP6315EGCH BA.2.12,BA.5,BA.4.1
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic D6724D BA.4.1
intergenic K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1
intergenic L6959L BA.4.1
intergenic P7034S BA.5.2.3,BA.4.1
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intergenic V3G BA.4.1.8,BA.4.1
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic T73T BA.2.12,BA.4.1
intergenic G107G BA.4.1
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
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intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
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intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic E484A BA.5,BA.4.1
intergenic VE483IA BA.4.1
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic Y508Y BA.4.1
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic T632T BA.4.1
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic A672V BA.4.1
S A672V BA.4.1
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic A701V BA.1.17,BA.4.1
intergenic T732T BA.4.1
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic N824N BA.4.1
intergenic D867D BA.4.1
intergenic S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic T1077T BA.4.1
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic E1182D BA.4.1
S E1182D BA.4.1
intergenic A1222A BA.4.1
intergenic L41F BA.4.1
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic Y189Y BA.4.1
intergenic E194E BA.4.1
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic F4F BA.4.1
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic TG9IC BA.4.1
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1
intergenic T175M BA.4.1
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1
intergenic E55K BA.4.1
intergenic P57P BA.4.1
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1
intergenic R25T BA.4.1
intergenic L31L BA.5.1.2,BA.4.1
intergenic K32N BA.4.1
intergenic P34L BA.5.2.8,BA.4.1
intergenic F46I BA.4.1
ORF7a F46I BA.4.1
intergenic A64S BA.4.1
intergenic Q76H BA.4.1
intergenic I110del BA.4.1
intergenic L11F BA.4,BA.4.1
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1
intergenic Y105Y BA.5.1.1,BA.4.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic T54T BA.5.1.2,BA.4.1
intergenic L56L BA.4.1
intergenic A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1
intergenic P151S BA.4.1.8,BA.4.1
intergenic S193T BF.41,BA.4.1
intergenic S202C BA.4.1
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic G212C BA.4.1
N G212C BA.4.1
intergenic M234I BA.4.1
intergenic P302P BA.5.2.34,BA.4.1
intergenic P309P BA.4.1
intergenic T362I BA.5.1.24,BA.4.1
intergenic A381T BA.4.1
N A381T BA.4.1
intergenic P383S BA.4.1
intergenic S410S BA.4.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1
intergenic I13T BA.4.1
intergenic C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1
intergenic R24C BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9
intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1
intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic V14V BA.5.1.30
intergenic G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.30
intergenic G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30
intergenic V84V BA.5.1.30
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic N189N BA.5.1.10,BA.5.1.30
intergenic C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30
intergenic P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30
intergenic F411F BA.5.1.30
intergenic N447S BA.5.1.30
intergenic I475V BA.5.1.30
intergenic S505S BA.4,BA.5.1.30
intergenic S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30
intergenic T592I BA.5.1.30
intergenic A656V BA.1.14,BA.5.1.30
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic S918S BA.5.1.30
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic E939G BA.5.1.30
ORF1a T945N / NSP3
intergenic T945N BA.5.1.30
intergenic G1070V BA.5.1.30
intergenic A1082V BA.5.1.30
intergenic T1168I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.30
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic L1438L BA.1.14,BA.5.2.2,BA.5.1.30
intergenic N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.30
intergenic L1441L BA.5.1.30
intergenic L1627L BA.5.1.30
intergenic P1640L BA.5.1.24,BA.5.1.30
intergenic M1732I BA.5.1.30
intergenic S1743F BA.5.1.1,BA.5.1.30
intergenic P1921S BF.20,BA.5.1.30
intergenic P1977P BA.5.1.30
intergenic D2026A BA.5.1.30
intergenic S2114F BA.5.1.30
intergenic T2153I BA.5.1.30
intergenic S2303F BA.5.1.30
intergenic T2306T BA.5.1.30
intergenic T2319T BA.5.1.30
intergenic C2445C BA.4.1.8,BA.5.1.2,BA.5.1.30
ORF1a S2462S / NSP3
intergenic S2462S BA.5.1.30
intergenic S2500F BA.5.1.30
intergenic L2518L BA.5.1.30
intergenic N2523N BA.5.1.2,BA.5.1.30
intergenic M2674V BA.5.1.30
intergenic D2693D BA.5.1.30
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic S3099L BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.30
intergenic V3107I BA.5.1.30
ORF1a M3129L / NSP4
intergenic M3129L BA.5.1.30
intergenic T3150I BA.5.1.30
ORF1a A3230S / NSP4
intergenic A3230S BA.5.1.30
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic G3578S BA.5.1.30
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic I3738I BA.5.2.8,BA.5.1.30
intergenic F3769F BA.5.1.30
intergenic I3853I BA.5.1.10,BA.5.1.1,BA.5.1.30
intergenic L3899L BA.5.1.30
intergenic A3907A BA.5.1.30
ORF1a S3950T / NSP8
intergenic S3950T BA.5.1.30
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic R4017R BA.5.1.30
intergenic P4058P BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic A4168A BA.5.1.30
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic T4302N BA.5.1.30
intergenic L4386F BA.5.1.30
intergenic R4387R BA.4,BA.5.1.30
intergenic A4394S BA.5.1.30
intergenic S4398L BA.1.17,BA.5.1.30
intergenic A4577V BA.5.1.30
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic T4736I BA.5.1.30
intergenic G4878G BA.5.1.30
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic C5353C BA.5.1.30
intergenic Y5388Y BA.2.12,BA.5.1.2,BA.5.1.30
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intergenic A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3,BA.5.1.30
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
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intergenic D6584D BA.5.1.30
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intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
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intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
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intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
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intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
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S S758I BA.5.1.30
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intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic E988E BA.5.1.30
intergenic V1133V BA.5.1.30
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intergenic N1134N BA.5.1.30
S N1134N BA.5.1.30
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic I1169I BA.5.1.1,BA.5.1.30
intergenic Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30
intergenic F43L BA.5.1.30
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic V90F BA.5.1.30
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ORF3a L94P BA.5.1.30
intergenic P104S BA.5.1.30
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intergenic T223I BA.2.12,BA.5.1.30
intergenic V256del BA.5.2.2,BA.5.1.30
intergenic F4F BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic L145L BA.5.1.30
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M D160N BA.5.1.30
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intergenic N207N BA.5.2.3,BA.5.1.30
intergenic D6G BA.5.1.30
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intergenic L5F BA.5.1.30
intergenic C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30
intergenic V93F BA.5.1.30
intergenic P99L BA.5.1.30
intergenic T120A BA.5.1.30
ORF7a T120A BA.5.1.30
intergenic F19L BA.4,BA.5.1.30
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic N38I BA.5.1.30
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30
intergenic V33F BA.5.1.30
intergenic V49A BA.5.1.30
intergenic S67F BA.5.1.10,BA.5.1.30
intergenic H112H BA.5.1.30
ORF8 H112H BA.2.3,BA.5.1.30
intergenic F120F BA.5.1.30
intergenic FI120VL BA.5.1.30
intergenic I121I BA.5.1.30
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic T49I BA.5,BA.5.1.30
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intergenic L56L BA.4.1,BA.5.1.30
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N K65E BA.5.1.30
intergenic D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30
intergenic A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic G200C BA.5.1.30
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic Q289Q BA.5.1.24,BA.5.1.30
N Q289Q BA.5.1.24,BA.5.1.30
intergenic H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30
intergenic F315F BA.5.1.1,BA.5.1.30
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30
intergenic g.A-11T BA.5.1.30
intergenic L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic G49D BA.5.1.24,BA.5,BA.5.2.8,BQ.1.1.8
intergenic D75N BQ.1.1.8
intergenic G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic T224I BQ.1.1.8
ORF1a T265A / NSP2
intergenic T265A BQ.1.1.8
intergenic S318L BA.5.1.1,BQ.1.1.8
ORF1a I368V / NSP2
intergenic I368V BQ.1.1.8
intergenic H374Y BQ.1.1.8
intergenic V459V BA.5.2.8,BQ.1.1.8
intergenic D466D BQ.1.1.8
intergenic S481S BA.5.1.10,BQ.1.1.8
intergenic Q556K BA.4,BA.5,BQ.1.1.8
ORF1a L590S / NSP2
intergenic L590S BQ.1.1.8
intergenic T609I BQ.1.1.8
ORF1a G638G / NSP2
intergenic G638G BQ.1.1.8
intergenic K669K BQ.1.1.8
intergenic A690A BQ.1.1.8
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic L897L BQ.1.1.8
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic L969F BQ.1.1.8
intergenic V1025V BQ.1.1.8
ORF1a N1037S / NSP3
intergenic N1037S BQ.1.1.8
intergenic A1049V BA.4.1.8,BQ.1.1.8
intergenic G1070G BA.2.12,BQ.1.1.8
ORF1a I1206L / NSP3
intergenic I1206L BQ.1.1.8
intergenic D1273D BA.5,BQ.1.1.8
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic M1312I BQ.1.1.8
intergenic Y1337Y BA.5,BA.5.1.2,BQ.1.1.8
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic S1433S BQ.1.1.8
ORF1a Y1516H / NSP3
intergenic Y1516H BQ.1.1.8
intergenic T1589T BQ.1.1.8
ORF1a T1605I / NSP3
intergenic T1605I BQ.1.1.8
intergenic H1652H BQ.1.1.8
intergenic A1677T BQ.1.1.8
intergenic Y1700Y BA.4.1,BQ.1.1.8
intergenic I1714I BQ.1.1.8
intergenic Y1734Y BQ.1.1.8
intergenic Q1758Q BQ.1.1.8
intergenic T2007T BA.5,BQ.1.1.8
intergenic V2019I BQ.1.1.8
ORF1a L2119L / NSP3
intergenic L2119L BQ.1.1.8
intergenic T2124I BQ.1.1.8
intergenic S2132G BQ.1.1.8
ORF1a T2137A / NSP3
intergenic T2137A BQ.1.1.8
intergenic F2172F BQ.1.1.8
intergenic L2211L BQ.1.1.8
intergenic Y2245Y BQ.1.1.8
intergenic A2508A BQ.1.1.8
intergenic P2605S BQ.1.1.8
intergenic N2714N BQ.1.1.8
ORF1a Q2749Q / NSP3
intergenic Q2749Q BQ.1.1.8
intergenic A2759V BQ.1.1.8
intergenic H2799H BQ.1.1.8
intergenic N2829N BQ.1.1.8
intergenic T2836I BA.2.12,BQ.1.1.8
intergenic P2870P BA.5.2.34,BA.5,BQ.1.1.8
intergenic Y2897Y BQ.1.1.8
intergenic A2994V BQ.1.1.8
intergenic Y3011Y BQ.1.1.8
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8
intergenic N3081N BQ.1.1.8
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic E3176E BQ.1.1.8
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic T3432T BQ.1.1.8
ORF1a S3570S / NSP6
intergenic S3570S BQ.1.1.8
intergenic H3580H BA.5.2.34,BQ.1.1.8
intergenic V3595V BQ.1.1.8
intergenic H3631H BQ.1.1.8
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic V3700V BQ.1.1.8
intergenic D3728D BA.4.1.8,BQ.1.1.8
intergenic L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8
intergenic D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8
intergenic L3914L BQ.1.1.8
intergenic S3949N BQ.1.1.8
intergenic L3951F BQ.1.1.8
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8
intergenic Y4080H BQ.1.1.8
intergenic T4202T BQ.1.1.8
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic L4209L BA.4,BQ.1.1.8
intergenic L4252L BQ.1.1.8
intergenic V4266V BQ.1.1.8
intergenic H4467H BA.5.1.10,BQ.1.1.8
ORF1b F4549F / NSP12
intergenic F4549F BQ.1.1.8
intergenic Y4665H BQ.1.1.8
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic T4948T BQ.1.1.8
intergenic A4977A BQ.1.1.8
intergenic T4996T BQ.1.1.8
intergenic F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8
intergenic E5194E BQ.1.1.8
intergenic S5424S BQ.1.1.8
intergenic M5557I BQ.1.1.8
intergenic N5592S BQ.1.1.8
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic A5778V BQ.1.1.8
ORF1b D5907D / NSP13
intergenic D5907D BQ.1.1.8
intergenic P5949L BQ.1.1.8
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic P5995S BQ.1.1.8
intergenic Y6122Y BQ.1.1.8
intergenic P6128S BQ.1.1.8
intergenic T6175I BQ.1.1.8
intergenic S6299S BQ.1.1.8
intergenic L6308L BA.2.12,BQ.1.1.8
ORF1b I6559M / NSP15
intergenic I6559M BQ.1.1.8
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic D6584D BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic R6590H BQ.1.1.8
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
ORF1b E6672K / NSP15
intergenic E6672K BQ.1.1.8
ORF1b V6688V / NSP15
intergenic V6688V BQ.1.1.8
intergenic Y6730Y BQ.1.1.8
intergenic M6840T BQ.1.1.8
intergenic L6852L BQ.1.1.8
intergenic R7014N BQ.1.1.8
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic D53D BA.5,BA.5.1.1,BQ.1.1.8
intergenic A67_V70delinsSI BQ.1.1.8
intergenic H69del BQ.1.1.8
intergenic V70del BQ.1.1.8
intergenic T95A BA.2.12,BQ.1.1.8
S T95A BA.2.12,BQ.1.1.8
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic W152R BQ.1.1.8
intergenic G184S BQ.1.1.8
intergenic F186F BA.5.1.2,BQ.1.1.8
intergenic R190K BQ.1.1.8
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic L229V BQ.1.1.8
S L229V BQ.1.1.8
intergenic P230P BQ.1.1.8
S P230P BQ.1.1.8
intergenic S254A BQ.1.1.8
S S254A BQ.1.1.8
intergenic S255F BA.5,BQ.1.1.8
intergenic T286I BQ.1.1.8
intergenic T307I BA.5.1.2,BQ.1.1.8
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic I410I BQ.1.1.8
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic K444T BQ.1.1.8
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic T547K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BQ.1.1.8
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic T638I BQ.1.1.8
S T638I BQ.1.1.8
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic S735L BQ.1.1.8
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic N856N BQ.1.1.8
intergenic T883T BQ.1.1.8
intergenic F888F BQ.1.1.8
intergenic D936Y BQ.1.1.8
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic P1143L BA.2.86.1,BQ.1.1.8
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic P1162L BQ.1.1.8
intergenic D1165Y BQ.1.1.8
intergenic N1178N BQ.1.1.8
intergenic G18V BA.5.1.24,BQ.1.1.8
intergenic D22Y BQ.1.1.8
intergenic G49C BQ.1.1.8
intergenic L65I BQ.1.1.8
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic V112V BA.5.2.3,BA.5,BQ.1.1.8
intergenic C130C BQ.1.1.8
intergenic I169I BQ.1.1.8
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8
intergenic P240S BA.4,BQ.1.1.8
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic L119L BQ.1.1.8
intergenic G202G BA.5.2.34,BQ.1.1.8
intergenic R20S BQ.1.1.8
ORF6 R20S BQ.1.1.8
intergenic K53E BQ.1.1.8
intergenic T120I BQ.1.1.8
intergenic S5I BQ.1.1.8
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic H42Q BQ.1.1.8
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic I76V BQ.1.1.8
intergenic FI120VL BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic R10R BQ.1.1.8
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic P20S BQ.1.1.8
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8
intergenic T115T BQ.1.1.8
intergenic E136D BQ.1.1.8
intergenic D144N BQ.1.1.8
intergenic L161F BA.5,BQ.1.1.8
intergenic S183S BQ.1.1.8
intergenic S187P BQ.1.1.8
N S187P BQ.1.1.8
intergenic RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8
intergenic Q242Q BQ.1.1.8
intergenic S255T BQ.1.1.8
N S255T BQ.1.1.8
intergenic S255Y BQ.1.1.8
N S255Y BQ.1.1.8
intergenic S327S BQ.1.1.8
intergenic Y360Y BA.5.2.2,BA.5.2.3,BQ.1.1.8
intergenic E367E BA.2.12,BQ.1.1.8
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic g.G-15T BA.2.12,BQ.1.1.8
intergenic g.GAC-15_-13TAT BQ.1.1.8
intergenic g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8
intergenic g.C-119T BA.5.1.10,DV.7.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1
intergenic K47R DV.7.1
intergenic G82_H83del DV.7.1
intergenic G82_M85delinsV DV.7.1
intergenic M85_V86del DV.7.1
intergenic M85del DV.7.1
intergenic E113E DV.7.1
intergenic K129R DV.7.1
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1
intergenic N162N BA.4.1,DV.7.1
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intergenic R226K BA.5.2.3,DV.7.1
intergenic V228V DV.7.1
intergenic N310D DV.7.1
intergenic R402R BA.5.2.34,DV.7.1
intergenic H417H DV.7.1
intergenic V424V DV.7.1
intergenic A427V BA.5.2.34,DV.7.1
intergenic D448D DV.7.1
intergenic G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1
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intergenic A656V BA.1.14,BA.5.1.30,DV.7.1
intergenic A690V DV.7.1
intergenic Y717Y BA.5,BA.4.1,DV.7.1
intergenic S723S DV.7.1
intergenic T753I BA.4.1.8,DV.7.1
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intergenic S771N DV.7.1
intergenic L791L DV.7.1
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1
intergenic P885S DV.7.1
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1
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intergenic V1177V DV.7.1
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intergenic I1276V DV.7.1
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1
intergenic L1379L DV.7.1
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intergenic S2242F BA.5.2.34,BA.5.2.8,BA.5.1.2,DV.7.1
intergenic F2351F BA.4.1,DV.7.1
intergenic I2385I BA.4,DV.7.1
intergenic N2523S DV.7.1
intergenic A2584V BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1
intergenic V2651I DV.7.1
intergenic L2778F DV.7.1
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intergenic T2988T DV.7.1
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1
intergenic I3035I DV.7.1
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1
intergenic I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8,DV.7.1
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1
intergenic A3143V DV.7.1
intergenic R3163R DV.7.1
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intergenic T223I DV.7.1
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1
intergenic T11A DV.7.1
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1
intergenic S108S DV.7.1
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1
intergenic L129L DV.7.1
intergenic R146H DV.7.1
intergenic R150R DV.7.1
intergenic I151V DV.7.1
intergenic M1? DV.7.1
intergenic D6_F7del DV.7.1
intergenic R20Q DV.7.1
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1
intergenic D61F DV.7.1
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1
intergenic T28I BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1
intergenic E121Q DV.7.1
intergenic A15A DV.7.1
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1
intergenic T11K DV.7.1
intergenic P36P BA.1.14,BA.5.2.34,DV.7.1
intergenic P38P BA.5.2.34,DV.7.1
intergenic H40Y DV.7.1
intergenic S67F BA.5.1.10,BA.5.1.30,DV.7.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1
intergenic D22G BA.5.1.1,DV.7.1
intergenic T24A DV.7.1
intergenic S26I DV.7.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1
intergenic A35S DV.7.1
intergenic R41R DV.7.1
intergenic D63D BA.5.1.10,DV.7.1
intergenic N75N BA.4.1.8,DV.7.1
intergenic D82D BA.5,DV.7.1
intergenic D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1
intergenic T135A DV.7.1
intergenic K143K DV.7.1
intergenic T166I DV.7.1
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1
intergenic A217S DV.7.1
intergenic L219F BA.5,DV.7.1
intergenic V270L DV.7.1
intergenic F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1
intergenic D348H DV.7.1
intergenic T366I DV.7.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1
intergenic D415D DV.7.1
intergenic g.C29686T DV.7.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1
intergenic g.C29769T DV.7.1
intergenic g.T29793A DV.7.1
intergenic g.C-166T BA.5.2.20
intergenic g.C-149T BA.5.2.20
intergenic g.A-131G BA.5.2.20
intergenic g.A-88T BA.5.2.20
intergenic g.C-44T BA.5.2.20
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic V111V BA.5.2.20
intergenic V121F BA.5.1.1,BA.5.2.20
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic SYG135RYS BA.5.2.20
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic Y182Y BA.5.2.20
intergenic N188N BA.4.1.8,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic T224I BQ.1.1.8,BA.5.2.20
intergenic N434N BA.5.2.20
intergenic S443F BA.5.2.2,BF.41,BA.5.2.20
intergenic L454F BA.5.1.24,BA.5.2.20
intergenic L454L BA.5.2.20
intergenic R542C BA.5.2.20
intergenic S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20
intergenic A566V BA.5.2.20
intergenic G603S BA.5.2.20
intergenic N615N BA.4,BA.5.2.20
intergenic G638S BA.5.2.20
intergenic V649F BA.5.2.20
intergenic C657Y BA.5.2.20
intergenic A690V DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic G696G BA.5.2.20
intergenic P748L BA.5.1.10,BA.5.2.20
intergenic P748P BA.5.2.20
intergenic N810N BA.5.2.20
intergenic D828D BA.5.2.20
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic V852V BA.5.2.20
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic S966F BA.5.2.20
intergenic P971S BA.5.1.10,BA.4.1,BA.5.2.20
ORF1a Q991del / NSP3
intergenic Q991del BA.5.2.20
intergenic D996D BA.5.2.20
intergenic T1035T BA.5.2.20
intergenic V1056L BA.2.86.1,BA.5.2.20
intergenic G1068E BA.5.2.20
intergenic H1108H BA.5.2.8,BA.5.2.20
intergenic T1168I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.30,BA.5.2.20
intergenic V1295F BA.5.2.20
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
ORF1a T1310T / NSP3
intergenic T1310T BA.5.2.20
intergenic T1322I BA.2.12,BA.5.2.20
intergenic N1335N BA.5.2.20
intergenic Y1337Y BA.5,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BA.5.2.20
intergenic V1345V BA.5.2.20
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic V1483V BA.5.2.20
intergenic D1547N BA.5.2.20
intergenic T1581T BA.1.17,BA.5.2.20
intergenic T1678T BA.5.2.20
intergenic T1682I BA.5.2.20
intergenic Y1734Y BQ.1.1.8,BA.5.2.20
intergenic P1786S BA.5.2.8,BA.5.2.20
intergenic H1835H BA.5.2.20
intergenic T1840I BA.5.2.20
intergenic Y1882Y BA.5.2.20
intergenic I1935I BA.5.2.20
intergenic P1977L BA.5.2.20
intergenic T2016I BA.5.2.20
intergenic S2024S BA.5.2.20
intergenic E2031K BA.5.2.20
intergenic E2031A BA.5.2.20
intergenic L2044P BA.5.2.20
intergenic E2070K BA.5.2.20
intergenic P2079L BA.5.2.20
intergenic N2147N BA.5.1.10,BA.5.2.20
intergenic S2242F BA.5.2.34,BA.5.2.8,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic T2283I BA.5.2.20
ORF1a V2340V / NSP3
intergenic V2340V BA.5.2.20
ORF1a A2344S / NSP3
intergenic A2344S BA.5.2.20
intergenic Y2489Y BA.5.2.20
intergenic K2497E BA.5.2.20
intergenic H2659Y BA.5.2.20
intergenic N2678N BA.5.2.8,BA.5.2.20
ORF1a D2717A / NSP3
intergenic D2717A BA.5.2.20
intergenic N2894N BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.2.20
intergenic D2907D BA.2.12,BA.5.2.20
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic C3232C BA.5.2.20
intergenic L3238L BA.5.2.20
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic T3284I BA.4,BA.5.2.20
ORF1a 3291 / NSP5
intergenic 3291 BA.5.2.20
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic L3338F BA.5.2.20
intergenic K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic L3483F BA.5.2.20
intergenic R3542C BA.5.2.20
intergenic L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic M3627I BA.5,BA.5.2.20
intergenic V3629V BA.5.2.20
intergenic A3648V BA.5.2.20
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic L3692L BA.5.2.20
intergenic A3726V BA.5.2.20
intergenic K3839K BA.4.1,BA.5.2.20
intergenic V3847I BA.5.2.20
intergenic I3853I BA.5.1.10,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20
intergenic N3928N BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20
intergenic Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20
intergenic N4060N BA.5.2.20
intergenic T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20
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intergenic P4312P BA.5.2.20
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intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic N4795N BA.5.2.20
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intergenic N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20
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intergenic Y5066Y BA.5.2.20
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intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20
intergenic G75V BA.2.12,BA.4,BA.5.2.20
intergenic V130V BA.5.2.8,BA.5.2.20
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic H207Y BA.5.2.20
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic G257S DV.7.1,BA.5.2.20
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intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic V382V DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
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intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
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intergenic L53F BA.5.2.20
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intergenic L17F BA.5.2.20
intergenic R25T BA.4.1,BA.5.2.20
intergenic Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9,BA.5.2.20
intergenic V74I BA.5,BA.5.2.20
intergenic S81S BA.5.2.20
intergenic A105V BA.5.2.20
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20
intergenic H17Y BA.5.2.20
intergenic V62V BA.5.2.20
intergenic A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20
intergenic I71F BA.5.2.20
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.2.20
intergenic E31_G34delinsR BA.5.2.20
intergenic E31_S33del BA.5.2.20
intergenic F66F BA.5.2.20
intergenic P67L BA.2.12,BA.5.1.10,BA.5.2.20
intergenic F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20
intergenic P122P BA.5.2.20
intergenic A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20
intergenic A173V BA.5.2.20
intergenic S183S BQ.1.1.8,BA.5.2.20
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic P309P BA.4.1,BA.5.2.20
intergenic P365L BA.5.2.20
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20
intergenic g.C29708T BA.5.2.20
intergenic g.T29726G BA.5.2.20
intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20
intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20
intergenic g.C29769T DV.7.1,BA.5.2.20
intergenic g.G-67T BF.28
intergenic g.G-47T BF.28
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic S3S BF.28
intergenic S17_L18delinsM BA.5.1.2,BF.28
intergenic Q44L BF.28
intergenic G52G BF.28
intergenic H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34,BF.28
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic SYG135RYS BA.5.2.20,BF.28
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic F263L BF.28
intergenic E269E BF.28
intergenic A307A BF.28
intergenic P309L BA.5.2.2,BF.28
ORF1a T340N / NSP2
intergenic T340N BF.28
intergenic C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28
intergenic E342E BF.28
intergenic G379E BA.5.1.10,BF.28
intergenic R398C BF.28
intergenic H417H DV.7.1,BF.28
intergenic L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28
ORF1a K468K / NSP2
intergenic K468K BF.28
ORF1a G507V / NSP2
intergenic G507V BF.28
ORF1a G572G / NSP2
intergenic G572G BF.28
intergenic V665I BF.28
intergenic T677T BF.28
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
ORF1a V988F / NSP3
intergenic V988F BF.28
intergenic H1108Y BF.28
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic S1361P BF.28
intergenic Y1423Y BF.28
intergenic I1505V BF.28
ORF1a T1597S / NSP3
intergenic T1597S BF.28
intergenic N1749N BA.5.2.2,BF.28
intergenic E1801E BF.28
ORF1a G1861G / NSP3
intergenic G1861G BF.28
intergenic Y1873Y BA.5.1.10,BF.9,BF.28
intergenic T1890T BF.28
intergenic F1925F BA.5.2.2,BF.28
intergenic N1995N BA.2.12,BF.28
intergenic T2021A BF.28
ORF1a Q2058Q / NSP3
intergenic Q2058Q BF.28
intergenic A2128A BF.28
intergenic V2238V BA.5,BF.20,BF.9,BF.28
intergenic A2249V BF.28
intergenic T2300I BF.28
intergenic Y2384Y BA.2.12,BF.28
ORF1a H2502R / NSP3
intergenic H2502R BF.28
intergenic A2529V BF.28
intergenic S2535L BF.28
ORF1a T2846A / NSP4
intergenic T2846A BF.28
ORF1a V2865V / NSP4
intergenic V2865V BF.28
intergenic F2884F BF.28
intergenic F3018F BA.4,BA.5,BF.28
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic V3248V BF.28
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic L3338F BA.5.2.20,BF.28
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic N3414N BF.28
intergenic L3535L BA.2.12,BA.5.1.24,BF.28
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic T3772A BF.28
intergenic L3951F BQ.1.1.8,BF.28
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic R4387R BA.4,BA.5.1.30,BF.28
ORF1b V4422I / NSP12
intergenic V4422I BF.28
intergenic D4532D BF.28
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic T4736T BF.28
intergenic D4857D BF.28
intergenic F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28
intergenic T5131I BA.4.1,BF.28
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic P5377S BA.4,BA.5.1.24,BF.28
ORF1b E5460E / NSP13
intergenic E5460E BF.28
ORF1b V5481L / NSP13
intergenic V5481L BF.28
intergenic Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic T5574I BF.28
intergenic L5580F BF.28
intergenic V5680V BA.4.1.8,BF.28
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic S5748S BA.4,BF.28
ORF1b V5803V / NSP13
intergenic V5803V BF.28
intergenic Y5839Y BF.28
intergenic A5844G BF.28
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic L6082F BA.2.12,BF.28
intergenic Y6160Y BF.28
intergenic F6251F BF.28
intergenic K6464K BF.28
intergenic D6488D BF.28
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic H6701H BA.2.86.1,BF.28
intergenic G6738S BF.28
intergenic S6739L BA.5.1.10,BF.28
intergenic V6772L BA.5.2.2,BA.5.1.1,BF.28
intergenic V11V BA.5.2.34,BA.1.18,BF.28
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic F32F BA.5.1.10,BA.5.1.2,BF.28
intergenic F55F BF.9,BF.28
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic R102R BF.28
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28
intergenic R190R BF.28
S R190R BF.28
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic T307I BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BF.28
intergenic Q314K BF.28
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic C432C BA.5,BF.28
intergenic A435S BF.28
S A435S BF.28
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic N450D BA.2.86.1,BF.28
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic T547I BA.5.2.3,BA.5,BF.28
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic P665P BA.5,BA.5.2.8,BF.28
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28
intergenic A701S BF.28
S A701S BF.28
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic T778T BF.28
intergenic P793P BF.28
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic E1202Q BA.4.1.8,BA.5.2.3,BF.28
intergenic Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BF.28
intergenic P1263L BA.5.2.34,BF.28
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic H78Y BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.20,BF.28
intergenic P104P BF.28
intergenic Q185H BA.2.12,BF.28
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic F28F BF.28
intergenic T30T BF.28
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic V66L BF.28
intergenic T172T BA.5,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28
intergenic E54E BF.28
intergenic L9M BF.28
intergenic T14T BF.28
intergenic G38V BF.28
intergenic H47N BA.5,BF.28
intergenic L56L BF.28
intergenic C67S BF.28
ORF7a C67S BF.28
intergenic T120I BQ.1.1.8,BF.28
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28
intergenic W45L BF.28
intergenic R115H BA.5.1.10,BF.28
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.2.20,BF.28
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28
intergenic A55S BF.28
intergenic F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28
intergenic A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28
intergenic P199S BA.5,BF.28
intergenic RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28
intergenic L221L BF.28
N L221L BF.28
intergenic R319H BF.28
intergenic T379I BF.28
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic D415D DV.7.1,BF.28
intergenic g.A-14G BF.28
intergenic g.C-8T BF.28
intergenic C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28
intergenic g.C-160T BA.5.1.24,BE.1.1
intergenic g.G-68A BE.1.1
intergenic g.G-62T BE.1.1
intergenic g.C-44T BA.5.2.20,BE.1.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1
intergenic G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1
intergenic M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1
intergenic M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8,BE.1.1
intergenic H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34,BF.28,BE.1.1
intergenic V111A BA.5.1.1,BE.1.1
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intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
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intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
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ORF1b S5227S / NSP12
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intergenic R5485K BE.1.1
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intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
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intergenic G6699G BE.1.1
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intergenic L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic D53D BA.5,BA.5.1.1,BQ.1.1.8,BE.1.1
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic V130V BA.5.2.8,BA.5.2.20,BE.1.1
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic QP173NS BE.1.1
S QP173NS BE.1.1
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic I231T BA.5,BE.1.1
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intergenic S255F BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
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intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic V534V BE.1.1
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic R646H BE.1.1
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic Q675H BA.5.1.24,BE.1.1
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1
intergenic A701A BE.1.1
S A701A BE.1.1
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic T883T BQ.1.1.8,BE.1.1
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic K1149R BE.1.1
intergenic D1260N BE.1.1
intergenic D1260Y BE.1.1
intergenic g.T-1C BE.1.1
intergenic I20T BE.1.1
intergenic S40L BA.5.2.3,BE.1.1
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic V90A BE.1.1
intergenic L115F BE.1.1
intergenic W131C BE.1.1
intergenic H150R BE.1.1
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic S253S BA.2.12,BE.1.1
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic DS3NF BE.1.1
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic A104V BA.2.86.1,BE.1.1
intergenic T172T BA.5,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BE.1.1
intergenic C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30,BE.1.1
intergenic G38E BE.1.1
intergenic H73Y BA.5.1.24,BA.5.2.8,BE.1.1
intergenic V93F BA.5.1.30,BE.1.1
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic V62V BA.5.2.20,BE.1.1
intergenic Y79C BE.1.1
intergenic L84L BE.1.1
intergenic C90Y BE.1.1
intergenic E106D BE.1.1
ORF8 E106D BE.1.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic N8D BE.1.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic S26N BE.1.1
intergenic Q28Q BE.1.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1
intergenic R36R BE.1.1
intergenic R40C BE.1.1
intergenic F53F BE.1.1
intergenic N75N BA.4.1.8,DV.7.1,BE.1.1
intergenic D98D BE.1.1
intergenic F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic K127K BE.1.1
intergenic E136D BQ.1.1.8,BE.1.1
intergenic N154N BE.1.1
intergenic RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1
intergenic P279Q BE.1.1
intergenic L291L BE.1.1
intergenic Y298Y BA.1.17,BE.1.1
intergenic S318S BE.1.1
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intergenic T329T BE.1.1
intergenic T334T BE.1.1
N T334T BE.1.1
intergenic D341D BA.4.1.8,BA.5,BE.1.1
intergenic P383P BA.5.2.34,BE.1.1
intergenic A398V BA.5.1.24,BE.1.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1
intergenic g.C-13T BA.5.2.3,BE.1.1
intergenic L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30,BE.1.1
intergenic g.G29688C BE.1.1
intergenic g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic S3S BF.28,CH.1.1.28
intergenic S74S CH.1.1.28
intergenic V84_V86del CH.1.1.28
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic L140L CH.1.1.28
intergenic T183N CH.1.1.28
intergenic V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5,BF.9,CH.1.1.28
intergenic P361S CH.1.1.28
ORF1a Q575Q / NSP2
intergenic Q575Q CH.1.1.28
intergenic T708I CH.1.1.28
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic Y921H CH.1.1.28
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic E977E CH.1.1.28
intergenic E1007E CH.1.1.28
intergenic T1055I CH.1.1.28
ORF1a I1091I / NSP3
intergenic I1091I CH.1.1.28
intergenic V1177V DV.7.1,CH.1.1.28
intergenic Q1198K DV.7.1,CH.1.1.28
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intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
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intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
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S S161S CH.1.1.28
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intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
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intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
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intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic N856N BQ.1.1.8,CH.1.1.28
intergenic S875S CH.1.1.28
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic P1162S BA.5.2.3,BA.5,CH.1.1.28
intergenic N1194N CH.1.1.28
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic R68T CH.1.1.28
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic T270T CH.1.1.28
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic T77I CH.1.1.28
M T77I CH.1.1.28
intergenic T77T CH.1.1.28
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28
intergenic F87S CH.1.1.28
intergenic L14fs CH.1.1.28
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic I26S CH.1.1.28
intergenic H37Y CH.1.1.28
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic E31_S33del CH.1.1.28
intergenic N29_S33delinsHG CH.1.1.28
N N29_S33delinsHG CH.1.1.28
intergenic G71G CH.1.1.28
intergenic G178G BA.5.1.2,CH.1.1.28
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28
intergenic P302P BA.5.2.34,BA.4.1,CH.1.1.28
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic A28A CH.1.1.28
intergenic g.C29686T DV.7.1,CH.1.1.28
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28
intergenic g.C-44T BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic D33N BF.26
intergenic R43C BA.5.2.3,BA.5,BF.26
intergenic Q66Q BA.5.1.24,BF.26
intergenic G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26
intergenic M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic SYG135RYC BF.26
intergenic H165Y BF.26
intergenic F190F BF.26
intergenic L259S BF.26
intergenic F266F BA.5.2.34,BF.26
ORF1a P286T / NSP2
intergenic P286T BF.26
ORF1a V337A / NSP2
intergenic V337A BF.26
intergenic G345G BF.26
intergenic L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BF.26
intergenic I473T BF.26
intergenic K518K BF.26
intergenic I569T BE.1.1,BF.26
intergenic A599V BA.2.12,BF.26
intergenic P626S BF.26
intergenic E633E BF.26
intergenic V757V BA.5.2.34,BF.26
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic F871F BA.5,BF.26
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic G963S BF.26
intergenic P971L BA.5,BA.5.1.2,BF.26
intergenic E973K BF.26
intergenic D978D BF.26
ORF1a Q990Q / NSP3
intergenic Q990Q BF.26
intergenic E1015K BF.26
intergenic V1099M BF.26
intergenic V1118V DV.7.1,BF.26
ORF1a N1121Y / NSP3
intergenic N1121Y BF.26
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic E1341E BA.5.2.34,BF.26
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic A1485A BF.26
intergenic S1539N BF.26
intergenic F1544F BF.26
intergenic H1545H BF.26
intergenic S1612L BF.26
intergenic R1628C BF.26
intergenic M1647I BF.26
intergenic N1673N BA.5.1.10,BA.4,BE.1.1,BF.26
intergenic D1742N BF.26
intergenic K1781K BA.5.2.8,BF.26
ORF1a C1789C / NSP3
intergenic C1789C BF.26
intergenic D1849N BF.26
intergenic D1849D BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic Y1868Y BA.4,BA.5.1.24,BF.26
intergenic N1871N BF.26
intergenic P2018L BF.26
intergenic L2062F BA.5.1.10,BF.26
intergenic A2123A BF.26
intergenic A2199V BF.26
intergenic S2285F BF.26
intergenic L2329L BF.26
intergenic F2334F BA.2.12,BF.26
ORF1a D2668D / NSP3
intergenic D2668D BF.26
intergenic P2685P BF.26
intergenic A2745V BF.26
intergenic S2797F BA.1.17,BF.26
intergenic H2799Y BA.4,BF.26
ORF1a D2819N / NSP4
intergenic D2819N BF.26
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic L3041L BF.26
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic A3061A BA.5.2.3,BF.26
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic D3222D BA.5.1.24,BF.26
intergenic L3238L BA.5.2.20,BF.26
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic G3278S BF.26
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic T3356I BF.26
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26
intergenic A3615V BA.5.1.2,BF.26
intergenic A3620V BA.1.14,BF.26
intergenic P3642P BF.26
intergenic A3645V BF.26
intergenic 3676del BF.26
intergenic F3677del BF.26
intergenic S3675del BF.26
intergenic F3769F BA.5.1.30,BF.26
ORF1a A3837V / NSP6
intergenic A3837V BF.26
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26
intergenic L4045L BA.4,BA.4.1,BF.26
intergenic T4161I BF.26
intergenic Y4172Y BA.5.1.2,BF.26
intergenic T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic D4218D BF.26
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intergenic T4300T BF.26
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intergenic E4319E BF.26
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intergenic Y4430Y BA.2.86.1,BA.5.2.20,BF.26
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intergenic V4503I BF.26
intergenic D4532D BF.28,BF.26
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic G4777S BF.26
intergenic F4820F BA.5.1.10,BA.4.1,BF.26
ORF1b G5070G / NSP12
intergenic G5070G BF.26
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intergenic T5093T BF.26
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic D5152D BA.5.1.24,DV.7.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26
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intergenic Y5648Y BF.26
ORF1b A5686A / NSP13
intergenic A5686A BF.26
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intergenic V5721V BF.26
intergenic I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5.2.8,BF.26
intergenic M5900I BF.26
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic D6104D BA.2.12,BF.26
intergenic V6106V BA.5.1.10,BF.26
intergenic T6140I BF.26
intergenic T6148T BF.26
intergenic G6190V BF.26
intergenic D6300D BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26
intergenic DRYP6315EGCH BA.2.12,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.26
intergenic L6404L BF.26
intergenic R6513R BF.26
intergenic D6530D BF.26
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic C6742F BF.26
intergenic N6841N BF.26
ORF1b D6900D / NSP16
intergenic D6900D BF.26
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intergenic L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic T22I BF.26
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic F55F BF.9,BF.28,BF.26
intergenic H69del BA.5.1.30,BF.26
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intergenic D111N BF.26
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
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intergenic I235I BF.26
S I235I BF.26
intergenic S256P BF.26
intergenic T333T BF.26
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S P337P BF.26
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic R346S BA.4,BA.5.2.3,BF.26
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intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic I410I BQ.1.1.8,BF.26
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic C432C BA.5,BF.28,BF.26
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
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intergenic Y495Y BF.26
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
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S F643F BF.26
intergenic A647S BA.5.1.24,BF.26
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intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
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S P1143H BF.26
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intergenic Y1155F BF.26
S Y1155F BF.26
intergenic M1237I BF.26
intergenic I20I BA.1.17,BA.5.1.24,BF.26
intergenic V29F BF.26
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic L84L BF.26
intergenic T89I BF.26
intergenic V97I BF.26
intergenic Y107Y BF.26
intergenic T175I BA.5.1.30,BF.26
intergenic T176I BA.1.17,BF.26
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic T269T BF.26
intergenic S272G BF.26
ORF3a S272G BF.26
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
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intergenic L17F BF.26
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic T172T BA.5,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BE.1.1,BF.26
intergenic Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26
intergenic Y199Y BF.26
intergenic g.G-1T BF.26
intergenic I36V BF.26
intergenic D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3,BF.41,BF.26
intergenic A8T BF.26
intergenic N52N BF.26
intergenic Q94H BF.26
intergenic Y97Y BF.26
intergenic V104I BF.26
ORF7a V104I BF.26
intergenic MI1? BF.26
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26
intergenic P70P BF.26
intergenic F120F BA.5.1.2,BF.26
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic Q9Q BF.26
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic T16M BF.26
intergenic G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26
intergenic G30_S33delinsF BF.26
intergenic Q28_S33delinsHNF BF.26
N Q28_S33delinsHNF BF.26
intergenic A50A BF.26
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26
intergenic P258S BF.26
N P258S BF.26
intergenic F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1,BF.26
intergenic P279Q BE.1.1,BF.26
intergenic Y333Y BA.4,BF.26
intergenic H356H BF.26
intergenic A398V BA.5.1.24,BE.1.1,BF.26
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic g.C-17T BF.26
intergenic g.C-13A BF.26
intergenic P10L BF.26
intergenic g.T29682C BF.26
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26
intergenic g.C29769T DV.7.1,BA.5.2.20,BF.26
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic g.CGTCC-25_-21TGTCT BQ.1.13
intergenic R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13
intergenic R77R BQ.1.13
intergenic G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13
intergenic M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13
intergenic L92F BQ.1.13
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic L140L CH.1.1.28,BQ.1.13
intergenic S216S BA.4,BQ.1.13
intergenic R232C BQ.1.13
intergenic R232R BQ.1.13
intergenic L293L BQ.1.13
intergenic C316C BQ.1.13
intergenic H325Y BQ.1.13
intergenic S383N BQ.1.13
intergenic S481S BA.5.1.10,BQ.1.1.8,BQ.1.13
intergenic G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13
intergenic S538L BA.5.1.24,BQ.1.13
intergenic A540V BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.13
intergenic Q556K BA.4,BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13
intergenic A599A BA.5.1.1,BQ.1.13
intergenic V627I BA.4,BQ.1.13
intergenic A656V BA.1.14,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.13
intergenic L681F BA.2.12,BQ.1.13
intergenic Y717Y BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13
intergenic N786N BA.5.2.34,BQ.1.13
intergenic M789I BQ.1.13
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic L897L BQ.1.1.8,BQ.1.13
intergenic M902V BQ.1.13
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
ORF1a 1057 / NSP3
intergenic 1057 BQ.1.13
intergenic V1056V BQ.1.13
intergenic N1059N BA.4.1,BQ.1.13
ORF1a D1088N / NSP3
intergenic D1088N BQ.1.13
intergenic L1249F BQ.1.13
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
ORF1a L1560F / NSP3
intergenic L1560F BQ.1.13
intergenic P1692S BA.4.1.8,BQ.1.13
intergenic L1725L BQ.1.13
intergenic I1785T BQ.1.13
intergenic D1903D BQ.1.13
intergenic A1997V BQ.1.13
ORF1a V2051V / NSP3
intergenic V2051V BQ.1.13
intergenic H2092Y BQ.1.13
ORF1a V2150I / NSP3
intergenic V2150I BQ.1.13
intergenic F2172F BQ.1.1.8,BQ.1.13
intergenic F2338F BQ.1.13
intergenic F2351F BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13
ORF1a D2579D / NSP3
intergenic D2579D BQ.1.13
ORF1a S2731G / NSP3
intergenic S2731G BQ.1.13
intergenic T2823I BQ.1.13
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic M3087I BQ.1.13
intergenic T3090I BA.5.2.2,BQ.1.13
intergenic L3238L BA.5.2.20,BF.26,BQ.1.13
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic A3357A BA.4,BQ.1.13
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic A3497V BQ.1.13
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13
intergenic L3644F BF.9,BQ.1.13
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13
intergenic I3758I BQ.1.13
intergenic L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13
intergenic L3840L BQ.1.13
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13
ORF1a I4114V / NSP8
intergenic I4114V BQ.1.13
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic T4249I BQ.1.13
intergenic T4258I BQ.1.13
intergenic A4324A BQ.1.13
intergenic D4335N BQ.1.13
intergenic Y4665H BQ.1.1.8,BQ.1.13
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intergenic H5117H BA.4.1,BQ.1.13
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
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intergenic L5619L BQ.1.13
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intergenic L48L BQ.1.13
intergenic F58F BA.5.1.30,BQ.1.13
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intergenic V70del BQ.1.13
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intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic P174S BQ.1.13
intergenic N211_V213delinsIG BA.2.86.1,BQ.1.13
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intergenic S255F BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
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intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
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intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
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intergenic T618K BQ.1.13
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S I1232F BQ.1.13
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intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic L90L BQ.1.13
intergenic N117N BQ.1.13
intergenic D160D BQ.1.13
intergenic Y31Y BA.5.1.24,BA.5,BQ.1.13
intergenic D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3,BF.41,BF.26,BQ.1.13
intergenic I10T BQ.1.13
intergenic C23F BQ.1.13
intergenic Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9,BA.5.2.20,BQ.1.13
intergenic A55S BQ.1.13
intergenic Q94H BF.26,BQ.1.13
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13
intergenic FI120VL BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BQ.1.13
intergenic I121fs BQ.1.13
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13
intergenic T54T BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.13
intergenic E136D BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic A251V BQ.1.13
intergenic P383P BA.5.2.34,BE.1.1,BQ.1.13
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13
intergenic C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13
intergenic N25S BQ.1.13
ORF10 N25S BQ.1.13
intergenic g.C29686T DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13
intergenic g.G29692T BA.5,BQ.1.13
intergenic g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13
intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13
intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic V35V BF.9,DV.7.1.2
intergenic M85_V86del BA.5.1.10,DV.7.1.2
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2
intergenic Y185H DV.7.1.2
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intergenic S505S BA.4,BA.5.1.30,DV.7.1.2
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intergenic T654T DV.7.1,DV.7.1.2
intergenic T746T DV.7.1.2
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic A1151S DV.7.1.2
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intergenic Q1198K DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2
intergenic S1221L DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2
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intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic A1314V DV.7.1.2
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
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intergenic P1921S BF.20,BA.5.1.30,DV.7.1.2
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intergenic S2132G BQ.1.1.8,DV.7.1.2
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intergenic L2329L BF.26,DV.7.1.2
intergenic D2525D DV.7.1.2
intergenic A2891V DV.7.1.2
intergenic D2980D DV.7.1.2
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8,DV.7.1,DV.7.1.2
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2
intergenic S3149S DV.7.1.2
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic G3458G DV.7.1.2
intergenic A3548V DV.7.1,DV.7.1.2
intergenic L3591L DV.7.1.2
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2
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intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
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intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
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intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic V70I DV.7.1.2
intergenic F100F BA.5.1.24,DV.7.1.2
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2
intergenic G202G BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1.2
intergenic M19K DV.7.1.2
intergenic R20R DV.7.1.2
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2
intergenic E16E DV.7.1.2
intergenic L31L BA.5.1.2,BA.4.1,DV.7.1.2
intergenic G38X DV.7.1.2
intergenic A55T DV.7.1.2
intergenic L96F DV.7.1.2
intergenic T120I BQ.1.1.8,BF.28,DV.7.1.2
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic I27T DV.7.1.2
intergenic I10V DV.7.1.2
intergenic S69P BA.5.1.2,DV.7.1.2
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2
intergenic P122L DV.7.1.2
intergenic H145Y DV.7.1.2
intergenic S193I DV.7.1.2
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic T362I BA.5.1.24,BA.4.1,DV.7.1.2
intergenic D402D DV.7.1.2
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2
intergenic M1? DV.7.1.2
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2
intergenic g.C-160T BA.5.1.24,BE.1.1,BA.1.15
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic E311G BA.1.15
intergenic A735A BA.1.14,BA.1.18,BA.1.15
intergenic K856R BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15
intergenic V879V BA.2.12,BA.1.15
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic T1168I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.1.15
intergenic T1426T BA.5.2.2,DV.7.1,BA.1.15
ORF1a S1587L / NSP3
intergenic S1587L BA.1.15
intergenic A1707A BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15
intergenic M1769I BA.1.15
ORF1a C1833C / NSP3
intergenic C1833C BA.1.15
intergenic S2083_L2084delinsI BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15
intergenic T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic A2710T BA.2.86.1,BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15
intergenic N2966N BA.1.15
intergenic F3018F BA.4,BA.5,BF.28,BA.1.15
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic L3290L BA.1.15
intergenic P3395H BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15
intergenic L3674_G3676del BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15
intergenic I3758V BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15
intergenic V4310V BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15
intergenic T4668T BA.1.15
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic Y4875Y BA.1.15
intergenic N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20,BA.1.15
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15
intergenic K5190K BA.1.15
intergenic A5315V BA.1.15
intergenic A5458S BA.1.15
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic K6236N BA.1.15
intergenic T6557T BA.1.15
intergenic D6912D BA.1.15
ORF1b V6916I / NSP16
intergenic V6916I BA.1.15
intergenic Y6930Y BA.5.1.10,BA.1.15
intergenic A6986A BA.1.15
intergenic V11V BA.5.2.34,BA.1.18,BF.28,BA.1.15
intergenic H69del BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15
intergenic V70del BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15
intergenic T95I BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15
intergenic G142_Y145delinsD BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15
intergenic N211_L212delinsI BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15
intergenic R214_D215insEPE BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15
intergenic R346K BA.1.18,BE.1.1,BA.1.15
intergenic S371L BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic S375F BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic G446S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic Q493R BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15
intergenic G496S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic T547K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BQ.1.1.8,BA.1.15
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic N856K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic L981F BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic P104dup BQ.1.13,BA.1.15
intergenic L106F BA.1.15
intergenic S165F BA.1.15
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic D3G BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic L90L BA.1.15
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15
intergenic D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3,BF.41,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15
intergenic g.C-5T BA.4,BA.5.1.24,BA.1.15
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic A35A BA.1.15
intergenic A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15
intergenic D343G BA.1.15
intergenic g.C-17T BF.26,BA.1.15
intergenic g.C-126T BF.10
intergenic g.C-48T BF.10
intergenic g.G-47A BF.10
intergenic g.T-45C BF.10
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic G52G BF.28,BF.10
intergenic V54del BF.10
intergenic G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10
intergenic V108V BF.10
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10
intergenic G146D BF.10
intergenic T163I BF.10
intergenic R232H BF.10
intergenic V288V BF.10
intergenic T333M BA.4.1,BF.10
intergenic A354A BF.10
intergenic R402R BA.5.2.34,DV.7.1,BF.10
intergenic L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BF.26,BF.10
ORF1a A486A / NSP2
intergenic A486A BF.10
ORF1a E525G / NSP2
intergenic E525G BF.10
intergenic T568I DV.7.1,BF.10
intergenic Y600Y BF.10
ORF1a G618S / NSP2
intergenic G618S BA.5.1.1,BF.10
intergenic N786N BA.5.2.34,BQ.1.13,BF.10
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic V886V BA.5.1.24,BF.10
intergenic Y906Y BF.10
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic P971L BA.5,BA.5.1.2,BF.26,BF.10
intergenic P1147S BF.10
intergenic F1190L BF.10
intergenic L1249F BQ.1.13,BF.10
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic P1330P BF.10
intergenic T1338T BF.10
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic F1353fs BA.5.1.10,BA.5,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.10
intergenic K1364K BF.10
ORF1a P1497H / NSP3
intergenic P1497H BF.10
intergenic D1554D BF.10
ORF1a M1588T / NSP3
intergenic M1588T BA.5.1.10,BF.10
intergenic N1673N BA.5.1.10,BA.4,BE.1.1,BF.26,DV.7.1.2,BF.10
intergenic K1720N BA.2.12,BF.10
intergenic N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10
intergenic I1785T BQ.1.13,BF.10
intergenic T2069I BF.10
intergenic F2172F BQ.1.1.8,BQ.1.13,BF.10
intergenic G2207S BF.10
intergenic V2238V BA.5,BF.20,BF.9,BF.28,BF.10
intergenic G2258G BF.10
intergenic V2421V BA.4,BF.10
intergenic L2609L BA.5.1.24,BF.10
intergenic T2648I BA.5.2.2,BF.10
intergenic A2759T BF.10
ORF1a T2920T / NSP4
intergenic T2920T BF.10
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic L3034L BF.10
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic L3086F BF.10
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10
intergenic L3116F BF.10
intergenic R3163K BF.10
intergenic L3234L BA.1.17,BF.10
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic D3297D BF.10
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic L3321L BA.5.2.3,BA.4.1,BF.10
intergenic K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10
intergenic C3380C BF.10
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic L3915F BF.10
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10
intergenic A4016V BF.10
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic V4463V BF.10
intergenic D4652D BA.4,DV.7.1,BF.10
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic Q4836Q BF.10
intergenic A4921V BA.5.2.3,DV.7.1,DV.7.1.2,BF.10
intergenic A4946V BF.10
intergenic A5077A BF.10
intergenic F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic F5348F BF.10
intergenic N5375N BF.10
intergenic H5399H BF.10
intergenic Y5535Y BF.10
intergenic Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10
intergenic A5636A BF.10
intergenic A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3,BA.5.1.30,BF.26,BF.10
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10
ORF1b I5756V / NSP13
intergenic I5756V BF.10
intergenic V5776V BA.1.17,BF.10
intergenic T5912I BA.5.1.10,DV.7.1.2,BF.10
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic L6205L BA.5.1.10,BF.10
intergenic D6440D BF.10
intergenic Y6540Y BQ.1.13,BF.10
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic G6738V BF.10
ORF1b V6882V / NSP16
intergenic V6882V BF.10
intergenic D6931D BA.5.1.2,BF.10
intergenic F6948F BF.10
intergenic K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10
intergenic H245H BF.10
intergenic A262A BA.5.2.2,BF.10
S A262A BA.5.2.2,BF.10
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic R346S BA.4,BA.5.2.3,BF.26,BF.10
intergenic R357R BF.10
S R357R BF.10
intergenic S371F BF.10
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic D428D BF.10
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic K444M BF.10
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic F486I BF.10
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic Y508Y BA.4.1,BF.10
intergenic L518I BA.5.2.2,BF.10
S L518I BA.5.2.2,BF.10
intergenic T553I BF.10
intergenic I587I BF.10
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic N616N BF.10
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic V705F BF.10
S V705F BA.1,BF.10
intergenic A706V BA.1.14,BF.10
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic Q779K BF.10
intergenic E780D BF.10
intergenic L858L BF.10
intergenic P862P BF.10
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intergenic S929S BF.10
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic F1062Y BF.10
S F1062Y BF.10
intergenic L1063L BF.10
S L1063L BF.10
intergenic V1129I BF.10
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic L1218L BF.10
intergenic Q57H BF.9,BF.10
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic S74F BA.4,DV.7.1.2,BF.10
intergenic C133C BF.10
intergenic D199A BF.10
ORF3a D199A BF.10
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic E239D BF.10
intergenic g.G-18T BA.5.2.2,BF.10
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10
intergenic T9T BF.10
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic I161I BA.5.2.3,BF.10
intergenic T172T BA.5,BF.20,BF.41,BF.9,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10
intergenic T11I BF.10
intergenic S37F BF.10
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10
intergenic L4L BF.10
intergenic D63Y BF.10
intergenic T87I BA.5.1.10,BF.10
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic N8N BF.10
intergenic P13F BA.5.1.10,BF.10
intergenic G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic R36R BE.1.1,BF.10
intergenic S37P BF.10
intergenic T49I BA.5,BA.5.1.30,BF.10
intergenic R68R BA.1.14,BF.10
intergenic L113L BF.10
intergenic T148T BF.10
intergenic N192N BA.5.1.10,BA.4,BF.10
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10
intergenic G215G BF.10
N G215G BF.10
intergenic P309P BA.4.1,BA.5.2.20,BF.10
intergenic A336V BF.10
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10
intergenic R24H BA.2.12,BF.10
intergenic g.G29688T BF.10
intergenic g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10
intergenic g.G-142A BA.5.5
intergenic g.C-44T BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
ORF1a A76V / NSP1
intergenic A76V BA.5.5
intergenic G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.5
intergenic G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic L140L CH.1.1.28,BQ.1.13,BA.5.5
intergenic K141K BA.5.5
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic C213C BA.2.12,BA.5.5
intergenic G295G BA.5.5
intergenic C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5
intergenic C344C BA.5.5
intergenic T350I BA.5.2.3,BA.5.5
intergenic S376L BA.5.2.3,BA.5.5
intergenic T512K BA.5.5
intergenic Q563H BA.5.5
ORF1a K634K / NSP2
intergenic K634K BA.5.5
intergenic L642F BA.4.1,BA.5.5
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intergenic V774V BA.5,BA.5.5
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic A903V BA.5.5
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic A1049V BA.4.1.8,BQ.1.1.8,BA.5.5
intergenic N1059N BA.4.1,BQ.1.13,BA.5.5
ORF1a N1080S / NSP3
intergenic N1080S BA.5.5
intergenic G1125C BA.5.5
ORF1a H1160H / NSP3
intergenic H1160H BA.5.5
intergenic I1232I BF.41,BA.5.5
intergenic D1273D BA.5,BQ.1.1.8,BA.5.5
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic A1397A BA.2.12,BA.5,DV.7.1,BA.5.5
intergenic Y1425Y BA.5.5
intergenic Y1486Y BA.5.5
intergenic T1542T BA.5.5
intergenic Y1619Y DV.7.1,BA.5.5
intergenic Y1675Y BA.5.5
intergenic N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10,BA.5.5
intergenic S1952L BA.5.5
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intergenic F2172F BQ.1.1.8,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5
intergenic N2201N BA.5.5
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intergenic T2306T BA.5.1.30,BA.5.5
intergenic M2374T BA.5.5
ORF1a F2390Y / NSP3
intergenic F2390Y BA.5.5
ORF1a C2404C / NSP3
intergenic C2404C BA.5.5
intergenic V2421V BA.4,BF.10,BA.5.5
intergenic I2490I BA.5.5
intergenic K2533R BA.5.5
intergenic M2565V BA.5.5
intergenic N2623S BA.5.5
intergenic D2687D BA.5.5
intergenic A2759V BQ.1.1.8,BA.5.5
intergenic V2857V BA.5.5
intergenic F2884F BF.28,BA.5.5
intergenic R2953R BA.5.5
intergenic T2967T BA.5.5
intergenic V2998V BA.5.5
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8,DV.7.1,DV.7.1.2,BA.5.5
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic F3153F BA.5.5
intergenic R3163K BF.10,BA.5.5
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic L3338F BA.5.2.20,BF.28,BA.5.5
intergenic L3338L BA.5.5
intergenic V3367V BA.5.5
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic D3479D BA.5.2.8,BA.5.5
intergenic R3542C BA.5.2.20,BA.5.5
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic A3615V BA.5.1.2,BF.26,BA.5.5
intergenic L3636L BA.5.1.24,BA.4.1,BA.5.5
intergenic L3644F BF.9,BQ.1.13,BA.5.5
intergenic A3648V BA.5.2.20,BA.5.5
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic F3770F BA.5.5
intergenic Y3803Y BA.2.12,BA.5.2.8,BA.5.5
intergenic L3828L BA.5,DV.7.1,BA.5.5
intergenic L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5
intergenic K3839K BA.4.1,BA.5.2.20,BA.5.5
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5
intergenic G4178S BA.5.5
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic A4248A BA.5.5
intergenic T4249I BQ.1.13,BA.5.5
intergenic N4358N BA.2.86.1,BF.26,BA.5.5
intergenic L4391F BA.5,BE.1.1,BA.5.5
intergenic T4443I BA.5.5
intergenic R4447R BA.5.1.24,BA.5.5
intergenic K4483R BA.5,BA.5.5
intergenic P4486L BA.5.2.34,BF.26,BA.5.5
ORF1b P4504P / NSP12
intergenic P4504P BA.5.5
intergenic F4584F CH.1.1.28,BA.5.5
intergenic T4638I BF.9,BA.5.5
ORF1b V4707G / NSP12
intergenic V4707G BA.5.5
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
ORF1b E4742G / NSP12
intergenic E4742G BA.5.5
intergenic P4770P BA.1.14,BA.5.5
intergenic L4779L BA.4,BE.1.1,BA.5.5
intergenic N4795N BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.5.5
intergenic N4851N BA.5.1.10,BA.5.5
intergenic D4915D BA.2.12,BA.5.5
intergenic A4921V BA.5.2.3,DV.7.1,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20,BA.1.15,BA.5.5
ORF1b V5067I / NSP12
intergenic V5067I BA.5.5
intergenic F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic S5170S BA.5.5
intergenic V5481L BF.28,BA.5.5
intergenic G5530C BA.5.5
intergenic Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5
ORF1b V5545F / NSP13
intergenic V5545F BA.5.5
intergenic A5636A BF.10,BA.5.5
intergenic E5665D BA.5.5
intergenic E5689D BE.1.1,BA.5.5
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5
intergenic P5726P BA.5,BA.5.5
intergenic H5806H BA.5.5
intergenic T5941I BA.5.5
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic D6097D BA.2.12,BA.5.2.20,BA.5.5
intergenic H6208H BA.5.5
ORF1b I6322I / NSP14
intergenic I6322I BA.5.5
intergenic Y6436Y BA.5.5
intergenic I6515T BA.5.5
intergenic A6533V BA.5.5
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic T6566T BA.5.5
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic F6628F BA.5,BA.5.5
intergenic N6651S BA.5.5
intergenic S6780S BA.5.5
intergenic A6802A BA.5.5
ORF1b T6908T / NSP16
intergenic T6908T BA.5.5
ORF1b G6946C / NSP16
intergenic G6946C BA.5.5
intergenic F6948F BF.10,BA.5.5
intergenic K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5
intergenic L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5
intergenic L8L BA.5.5
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5
intergenic T76I BA.5.5
intergenic D88D BA.5.5
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic T250P BA.5.5
S T250P BA.5.5
intergenic V327V BA.5,BA.5.5
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic R346S BA.4,BA.5.2.3,BF.26,BF.10,BA.5.5
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic L629L BA.5.1.24,BF.9,BA.5.5
S L629L BA.5.1.24,BA.5.5,BF.9
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic A701V BA.1.17,BA.4.1,BA.5.5
intergenic L754L BA.5.5
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
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S Q954R BA.5.5
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S A1016S BA.5.5
intergenic K1073T BA.5.5
S K1073T BA.5.5
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
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intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic V256_N257delinsD BA.5.5
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic N41N BF.9,BA.5.5
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
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intergenic I32T BA.5.5
intergenic I32I BA.5.5
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intergenic g.C-1T BA.5,BA.5.5
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intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5
intergenic P38S BA.5.5
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intergenic T87I BA.5.1.10,BF.10,BA.5.5
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intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5
intergenic P20P BA.5.5
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5
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intergenic M234I BA.4.1,BA.5.5
intergenic H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.5
intergenic S413L BA.5.5
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5
intergenic g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5
intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGT29734C BA.4,BA.5.5
intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGT29734T BA.4,BA.5.5
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intergenic V1056V CK.2
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intergenic T2823I BQ.1.13,CK.2
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intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic I3145V CK.2
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic N3358N CK.2
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic N3494N BA.4.1,CK.2
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic T3940T CK.2
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20,CK.2
intergenic T4159I CK.2
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20,CK.2
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2
ORF1b C5964S / NSP14
intergenic C5964S CK.2
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic I6012L CK.2
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic Y7026Y CK.2
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic K444N CK.2
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic D936Y BQ.1.1.8,CK.2
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic V987V CK.2
intergenic T1077T BA.4.1,CK.2
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic I7I CK.2
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic L106L BA.5.2.2,BA.5.1.10,CK.2
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic V62F BA.5.2.20,CK.2
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.2.20,CK.2
intergenic g.C-5T BA.4,BA.5.1.24,BA.1.15,BA.5.5,CK.2
intergenic Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9,BA.5.2.20,BQ.1.13,CK.2
intergenic A66A CK.2
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intergenic P84L BA.5.2.2,BA.4,BA.5,CK.2
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2
intergenic G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,CK.2
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2
intergenic g.C-104T BA.5,EG.10.1
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intergenic R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13,EG.10.1
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intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
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intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
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intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic F3403F EG.10.1
intergenic P3613S EG.10.1
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intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic V3683I EG.10.1
intergenic T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic D4344G EG.10.1
intergenic N4569K EG.10.1
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1
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intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1
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intergenic T5538T EG.10.1
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic Y5865Y EG.10.1
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic P5971S BQ.1.13,EG.10.1
intergenic G6018G EG.10.1
intergenic P6354P EG.10.1
intergenic P6517S EG.10.1
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic P6722P EG.10.1
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intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
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intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1
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intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1
intergenic L368I EG.10.1
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic R403K BA.2.86.1,BA.5,DV.7.1,EG.10.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
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intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic VG445PS EG.10.1
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intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1
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intergenic S494P EG.10.1
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic S640F BA.4,EG.10.1
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic A701V BA.1.17,BA.4.1,BA.5.5,EG.10.1
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic V860L EG.10.1
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic H1101H EG.10.1
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic S74S EG.10.1
intergenic L96P EG.10.1
intergenic Y107Y BF.26,EG.10.1
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1
intergenic T11I BF.10,BA.5.5,EG.10.1
intergenic G38G EG.10.1
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic G8R EG.10.1
intergenic G8X EG.10.1
intergenic H17Y BA.5.2.20,EG.10.1
intergenic V114F EG.10.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic N8N BF.10,EG.10.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic P42P EG.10.1
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic Y298Y BA.1.17,BE.1.1,EG.10.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1
intergenic N25N EG.10.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1
intergenic g.C-174T BA.4.6
intergenic g.G-62A BA.4.6
intergenic g.G-58T BA.4.6
intergenic g.G-47A BF.10,BA.4.6
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic V38V BA.4.6
intergenic L39L BA.4.6
intergenic G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6
intergenic G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6
intergenic M85I BA.4.6
intergenic M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13,BA.4.6
intergenic M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BA.4.6
intergenic I114T BA.4.6
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6
ORF1a Q158Q / NSP1
intergenic Q158Q BA.4.6
intergenic N160N BA.4.6
intergenic S166G BA.5.1.2,BA.4.1,BA.4.6
intergenic N188N BA.4.1.8,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,BA.4.6
intergenic D203D BA.5.1.24,BA.4.6
intergenic P380S BA.4.6
intergenic P380L BA.4.6
intergenic L570L BA.5,BA.4.6
intergenic L578L BA.5,BA.4.6
intergenic L580L BA.5.1.24,BA.4.6
intergenic M584V BA.5.2.3,BF.9,BA.4.6
intergenic L595L BA.4.6
intergenic P626P BA.4.6
intergenic I652I BA.4.6
intergenic L703L BA.4.6
intergenic V710V BA.4.6
intergenic I740T BA.4.6
intergenic I740I BA.2.12,BA.5,CK.2,BA.4.6
intergenic G817G BA.5.1.1,BA.4.6
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic S944L BF.41,BA.4.6
ORF1a F1028_S1029delinsC / NSP3
intergenic F1028_S1029delinsC BA.4.6
intergenic V1046V BA.4.6
intergenic I1203T BA.4.6
intergenic P1220L BA.4.6
intergenic I1232I BF.41,BA.5.5,BA.4.6
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic Y1329Y BA.4.6
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic L1356L BA.4.6
intergenic L1438L BA.1.14,BA.5.2.2,BA.5.1.30,BA.4.6
intergenic N1540N BA.4.6
intergenic T1542T BA.5.5,BA.4.6
intergenic T1597I BF.9,BA.4.6
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ORF1a V1768I / NSP3
intergenic V1768I BA.4.6
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intergenic T1820I BA.4.6
intergenic T1854I BA.4.6
intergenic T1881I BA.4.6
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intergenic F1925F BA.5.2.2,BF.28,BE.1.1,BA.4.6
intergenic H2092Y BQ.1.13,BA.4.6
intergenic T2121T BA.4,BA.4.6
intergenic H2125Y BA.4.6
intergenic T2154I BA.4.6
intergenic K2200N BA.4.6
intergenic I2244I BA.5,BA.4.6
intergenic M2259I DV.7.1.2,BA.4.6
intergenic T2280T BA.4.6
ORF1a S2285C / NSP3
intergenic S2285C BA.4.6
intergenic D2402D BA.4.6
intergenic L2447L BA.4.6
intergenic D2472D BA.4.6
intergenic L2475L BA.4.6
intergenic S2625S BA.4,BA.5.2.3,BA.4.6
intergenic V2766del BA.4.6
intergenic D2980N BA.4.6
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
ORF1a T3090S / NSP4
intergenic T3090S BA.4.6
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intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
ORF1a L3440L / NSP5
intergenic L3440L BA.4.6
intergenic F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.4.6
intergenic L3583L BA.4.6
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intergenic I3663V BA.4.6
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic Y3744Y BA.5.1.24,BA.4.6
intergenic L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6
intergenic L3935L BA.4.6
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intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6
intergenic L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BA.4.6
intergenic T4161I BF.26,BA.4.6
intergenic A4168A BA.5.1.30,BA.4.6
intergenic L4169L BA.4.6
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic I4429I BA.4.6
intergenic V4434I BA.4.6
ORF1b D4484D / NSP12
intergenic D4484D BA.4.6
ORF1b V4503V / NSP12
intergenic V4503V BA.4.6
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic L4763L BA.4.6
intergenic L4779L BA.4,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6
intergenic Y4875Y BA.1.15,BA.4.6
intergenic I4886I BA.4.6
intergenic N5020N BA.1.17,BA.5,BA.4.6
intergenic F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6
intergenic T5131I BA.4.1,BF.28,BA.4.6
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic S5253S BA.4.6
intergenic S5393S BA.4.6
intergenic P5402S BA.4.6
intergenic Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6
intergenic Y5577H BA.4.6
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intergenic A5640A BA.4.6
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic P5732P BA.4.6
intergenic T5737I BA.5.1.24,DV.7.1.2,BA.4.6
intergenic L5762L BA.5.1.10,BA.5.1.30,BA.4.6
intergenic T5805T BA.4.6
intergenic T5912I BA.5.1.10,DV.7.1.2,BF.10,BA.4.6
intergenic I5940I BA.4.6
intergenic P5945P BA.4.6
ORF1b DI5966NV / NSP14
intergenic DI5966NV BA.4.6
intergenic I5967V BA.4.6
intergenic T6022I BA.4.6
intergenic A6044V BA.5,BA.4.6
intergenic L6102L BA.4.1,BA.4.6
intergenic V6161V BA.4.6
intergenic T6175I BQ.1.1.8,BA.4.6
intergenic P6267P BA.4.6
intergenic DRYP6315EGCH BA.2.12,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.26,BA.4.6
intergenic S6373S BA.4.6
intergenic Y6423Y DV.7.1,BA.4.6
intergenic S6428L BA.4.6
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic V6638V BA.5.1.2,BA.4.6
intergenic T6833I BA.4.6
intergenic L6892L BA.4.6
intergenic G7011N BA.5.1.1,BA.4.6
intergenic L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic F32F BA.5.1.10,BA.5.1.2,BF.28,BA.4.6
intergenic H69del BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15,BA.4.6
intergenic V70del BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18,BA.1.15,BA.4.6
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6
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intergenic A264T BA.4.6
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
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intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
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intergenic N460Y BA.4.6
S N460Y BA.4.6
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intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
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intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6
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intergenic V29V BA.4.6
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intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1
intergenic L129L EG.5.2.1
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intergenic R20R DV.7.1.2,EG.5.2.1
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1
intergenic G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1
intergenic R95C EG.5.2.1
intergenic I157I BA.4,BA.5.2.34,EG.5.2.1
intergenic L161F BA.5,BQ.1.1.8,EG.5.2.1
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1
intergenic A218V EG.5.2.1
intergenic T366I DV.7.1,EG.5.2.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1
intergenic S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1
intergenic g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1
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intergenic g.C-119T BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.2.3
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intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
intergenic I71I BQ.1.2.3
intergenic R73C BA.5,BQ.1.2.3
intergenic G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3
intergenic V108I BQ.1.2.3
intergenic V121V BQ.1.2.3
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
intergenic F143L BQ.1.2.3
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
intergenic R226R BQ.1.2.3
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intergenic L469F BQ.1.2.3
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intergenic A599A BA.5.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3
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intergenic T891I BA.2.12,BA.5.1.24,BQ.1.2.3
intergenic L897L BQ.1.1.8,BQ.1.13,BQ.1.2.3
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
intergenic L960F BQ.1.2.3
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ORF1a T1250T / NSP3
intergenic T1250T BQ.1.2.3
intergenic H1264H BQ.1.2.3
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intergenic Y1337Y BA.5,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BQ.1.2.3
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
ORF1a G1369R / NSP3
intergenic G1369R BQ.1.2.3
ORF1a D1600D / NSP3
intergenic D1600D BQ.1.2.3
ORF1a V1629F / NSP3
intergenic V1629F BQ.1.2.3
intergenic R1703R BQ.1.2.3
ORF1a V1915V / NSP3
intergenic V1915V BQ.1.2.3
intergenic F1925F BA.5.2.2,BF.28,BE.1.1,BA.4.6,BQ.1.2.3
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intergenic T2152I BA.1.17,BA.5.5,BQ.1.2.3
intergenic Y2245Y BQ.1.1.8,BQ.1.2.3
ORF1a L2292L / NSP3
intergenic L2292L BQ.1.2.3
intergenic V2324F BF.9,BQ.1.2.3
intergenic I2346I BQ.1.2.3
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ORF1a F2864S / NSP4
intergenic F2864S BQ.1.2.3
intergenic T2872M DV.7.1,BQ.1.2.3
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intergenic P2929P BQ.1.2.3
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
intergenic L3034L BF.10,BQ.1.2.3
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
intergenic I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8,DV.7.1,DV.7.1.2,BA.5.5,EG.5.1.8,BQ.1.2.3
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
intergenic Q3127Q BQ.1.2.3
intergenic S3244L BQ.1.2.3
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
intergenic F3329F BF.41,BQ.1.2.3
ORF1a M3345I / NSP5
intergenic M3345I BA.5.1.24,BQ.1.2.3
intergenic K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3
intergenic N3358N CK.2,BQ.1.2.3
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
ORF1a V3465I / NSP5
intergenic V3465I BQ.1.2.3
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
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intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
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intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
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intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
intergenic A6623V DV.7.1.2,BQ.1.2.3
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intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
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intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3
intergenic L118F BQ.1.2.3
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3
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intergenic R190S BQ.1.2.3
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intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
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intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3
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intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3
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intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3
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intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9
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intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9
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intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9
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intergenic R89T EG.5.1.9
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intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9
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intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9
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intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
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intergenic T891I BA.2.12,BA.5.1.24,BQ.1.2.3,FL.1.5
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic G993S FL.1.5
intergenic G1119D FL.1.5
intergenic D1258D FL.1.5
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic P1330P BF.10,EG.5.1.3,FL.1.5
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic F1353fs BA.5.1.10,BA.5,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.10,CK.2,FL.1.5
intergenic A1397V BA.2.86.1,BA.2.12,FL.1.5
intergenic N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.30,FL.1.5
intergenic V1535I FL.1.5
ORF1a V1570L / NSP3
intergenic V1570L BA.5.1.24,FL.1.5
intergenic G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic N1871N BF.26,FL.1.5
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ORF1a G2959D / NSP4
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intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic D3439D BA.5.2.34,BA.5.1.1,DV.7.1,EG.5.1.3,FL.1.5
intergenic D3508D FL.1.5
ORF1a L3525S / NSP5
intergenic L3525S FL.1.5
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5
intergenic E4019E FL.1.5
intergenic T4083M BA.5.1.1,BA.5.1.2,FL.1.5
intergenic T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic N4235N BA.4,BA.5,BA.5.1.1,FL.1.5
intergenic A4408E FL.1.5
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intergenic D4432Y FL.1.5
intergenic T4618T FL.1.5
intergenic V4626V FL.1.5
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic S5073S FL.1.5
intergenic A5091S FL.1.5
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic Q5214H FL.1.5
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic A5662S FL.1.5
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intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic I5723V FL.1.5
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic R6088C FL.1.5
intergenic Y6160Y BF.28,FL.1.5
intergenic Y6162Y FL.1.5
ORF1b A6232T / NSP14
intergenic P6252S EG.5.1.3,FL.1.5
intergenic L6308L BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.1.5
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic V6573V BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
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intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic A264V FL.1.5
intergenic D294D BA.5.1.10,BA.5,FL.1.5
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic E516Q FL.1.5
intergenic P561P FL.1.5
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic A701V BA.1.17,BA.4.1,BA.5.5,EG.10.1,FL.1.5
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic L821L BA.5.5,FL.1.5
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
S G1085A BA.5.2.20,FL.1.5.1
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BF.28,FL.1.5
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic T24I FL.1.5
intergenic G49V FL.1.5
intergenic L65F DV.7.1,BA.5.2.20,FL.1.5
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic S74F BA.4,DV.7.1.2,BF.10,FL.1.5
intergenic L85L FL.1.5
intergenic T89I BF.26,EG.5.1.8,FL.1.5
intergenic D210Y FL.1.5
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5
ORF3a E241D XBB.1.5,FL.1.5.1
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic P71L FL.1.5
intergenic L17F BF.26,FL.1.5
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic I24V FL.1.5
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic S94S FL.1.5
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic N47N FL.1.5
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic V82I FL.1.5
intergenic L116L BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic H17Y BA.5.2.20,EG.10.1,FL.1.5
intergenic P38S BA.5.5,FL.1.5
intergenic Y46Y FL.1.5
intergenic G50G FL.1.5
intergenic A55V BA.5.1.10,FL.1.5
ORF8 R115L BF.41,XBB.1.5.37,XBB.1.5.10,FL.1.5.1
intergenic F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic P73P FL.1.5
intergenic S176S FL.1.5
intergenic RG203KL FL.1.5
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5
intergenic D343D FL.1.5
intergenic P365L BA.5.2.20,FL.1.5
intergenic P368P FL.1.5
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic X39YextX? FL.1.5
intergenic g.G29688C BE.1.1,EG.5.1.8,FL.1.5
intergenic g.G29706T FL.1.5
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5
intergenic g.C-222T BA.4,BA.5,EG.7
intergenic g.G-92T EG.7
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
ORF1a D25G / NSP1
intergenic D25G EG.7
intergenic L27F EG.7
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic G82_M85delinsV DV.7.1,EG.7
intergenic M85del DV.7.1,EG.7
intergenic V106V EG.7
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic T183T EG.7
intergenic R184R EG.7
intergenic L450F EG.7
intergenic G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7
intergenic V627I BA.4,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7
intergenic R643I EG.7
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic A859A BA.5.2.3,BE.1.1,EG.7
intergenic V879V BA.2.12,BA.1.15,EG.7
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic P959S BA.2.12,EG.7
ORF1a T999A / NSP3
intergenic T999A EG.7
intergenic D1179Y EG.7
intergenic S1218I EG.7
intergenic V1291I EG.7
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic T1426T BA.5.2.2,DV.7.1,BA.1.15,EG.7
intergenic N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.30,FL.1.5,EG.7
intergenic N1540N BA.4.6,EG.7
intergenic T1543I BF.9,EG.7
ORF1a D1547G / NSP3
intergenic D1547G EG.7
intergenic E1724V EG.7
intergenic G1819S EG.7
intergenic P1916S EG.7
intergenic P1919P EG.7
intergenic V2047F EG.7
intergenic T2137I EG.7
intergenic T2300I BF.28,EG.7
intergenic S2312L EG.7
intergenic A2344A EG.7
intergenic N2531S EG.7
intergenic N2539N EG.7
intergenic A2575T EG.7
intergenic A2584V BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,EG.7
intergenic P2685T EG.7
intergenic Y2809Y EG.7
intergenic C2851C EG.7
intergenic R2991R EG.7
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic T3459T BA.5.1.1,BE.1.1,EG.7
intergenic L3525L EG.7
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
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intergenic L4185L EG.7
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intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
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intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
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intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
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intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
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intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic L513F EG.7
intergenic F541F EG.7
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic G648G EG.7
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic R683R EG.7
intergenic I726V EG.7
intergenic S735S EG.7
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic N856N BQ.1.1.8,CH.1.1.28,EG.7
intergenic I896M EG.7
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic H1101H EG.10.1,EG.7
intergenic R1107M EG.7
intergenic T1117I EG.7
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic F1148F EG.5.1.3,EG.7
intergenic E1188D EG.7
intergenic C1253C BA.5.2.2,BQ.1.2.3,EG.7
intergenic D2Y EG.7
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic G44V EG.7
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic R68R EG.7
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic E266E EG.7
ORF3a E266E EG.7
intergenic T270T CH.1.1.28,EG.7
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic N207N BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1.3,EG.7
intergenic L4L BA.5.2.3,EG.7
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic E39D EG.7
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic C102F EG.7
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic A35S DV.7.1,EG.7
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intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7
intergenic K237I EG.7
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7
intergenic g.C-36T EG.5.1.4
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4
intergenic R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13,EG.10.1,EG.5.1.3,EG.5.1.4
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4
intergenic A79V EG.5.1.4
intergenic H81H EG.5.1.4
intergenic M85_E87delinsK EG.5.1.4
intergenic E91A EG.5.1.4
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intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4
intergenic Y20H EG.5.1.4
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intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4
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intergenic L1438L BA.1.14,BA.5.2.2,BA.5.1.30,BA.4.6,FL.2.3
intergenic T1538I FL.2.3
intergenic G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic L2062F BA.5.1.10,BF.26,FL.2.3
intergenic T2124I BQ.1.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15,EG.5.1.4,FL.2.3
ORF1a Q2486Q / NSP3
intergenic Q2486Q FL.2.3
intergenic Y2561Y FL.2.3
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
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intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic L3234L BA.1.17,BF.10,FL.2.3
intergenic Y3250Y BA.4.1,FL.2.3
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic F3603F BA.5.1.10,FL.2.3
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3
ORF1a A3987V / NSP8
intergenic A3987V FL.2.3
intergenic T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic L4267L FL.2.3
intergenic S4398L BA.1.17,BA.5.1.30,BF.26,FL.2.3
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic T4786M BA.5.2.8,FL.2.3
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic L5167L FL.2.3
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
ORF1b G5391C / NSP13
intergenic G5391C FL.2.3
intergenic V5571V FL.2.3
intergenic G5606G FL.2.3
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic K5784R FL.2.3
intergenic K5848K FL.2.3
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3
intergenic S6180I FL.2.3
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic PT6563SI FL.2.3
intergenic T6564I FL.2.3
intergenic A6569V FL.2.3
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic L6924F BA.2.12,BA.5.1.10,FL.2.3
intergenic L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3
intergenic V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic N234N BE.1.1,FL.2.3
intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic T547I BA.5.2.3,BA.5,BF.28,FL.2.3
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic V1228L FL.2.3
intergenic D1260Y BE.1.1,FL.2.3
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic S180F BA.4.1.8,FL.2.3
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic g.T-40C FL.2.3
intergenic V10A FL.2.3
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intergenic G25G FL.2.3
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intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic E135E FL.2.3
intergenic T175T FL.2.3
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic L40S FL.2.3
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic T61I FL.2.3
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3
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intergenic I58T FL.2.3
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic A35A BA.1.15,FL.2.3
intergenic R189L FL.2.3
N R189L FL.2.3
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3
intergenic G236F FL.2.3
N G236F FL.2.3
intergenic G236V FL.2.3
N G236V XBB.1.5.15,FL.2.3
N G236V XBB.1.5.15,FL.2.3
intergenic D297D FL.2.3
intergenic Q303L FL.2.3
intergenic I337F FL.2.3
intergenic Q409L BQ.1.2.3,FL.2.3
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3
intergenic g.C-160T BA.5.1.24,BE.1.1,BA.1.15,EG.5.1.3
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
ORF1a S17C / NSP1
intergenic R24C BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.13,EG.10.1,EG.5.1.3,EG.5.1.4
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic V56V EG.5.1
intergenic L92F BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4
intergenic Y97Y BA.5.1.24,EG.5.1.8,EG.5.2.1
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic A138A EG.5.1
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3
intergenic N188N BA.4.1.8,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,BA.4.6,EG.5.1
intergenic F190F BF.26,EG.5.1.8
intergenic L198L EG.5.1
intergenic H234H EG.5.1
ORF1a K247R / NSP2
intergenic K247R EG.5.1
ORF1a K247N / NSP2
ORF1a D264D / NSP2
intergenic G268V EG.5.1
intergenic G268G EG.5.1
ORF1a L293P / NSP2
intergenic L293P EG.5.1
intergenic S318L BA.5.1.1,BQ.1.1.8,EG.5.1.8
intergenic A339A EG.5.1
intergenic C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5,EG.5.1.8,EG.5.1.3
intergenic S376L BA.5.2.3,BA.5.5,EG.5.1.9
intergenic H388Y BA.1.14,EG.5.1.9
intergenic R398C BF.28,EG.5.1.4
intergenic H417Y EG.5.1
ORF1a N470S / NSP2
intergenic I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9
intergenic V488M EG.5.1
intergenic G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1
intergenic R542C BA.5.2.20,EG.5.1.3,EG.5.1
intergenic S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1
intergenic I569T BE.1.1,BF.26,EG.5.1
intergenic L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3
intergenic A599V BA.2.12,BF.26,EG.5.1
intergenic V606V BA.5,BA.5.1.1,EG.5.1.8
intergenic P626P BA.4.6,EG.5.1
intergenic V627I BA.4,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7
intergenic L628F DV.7.1.2,EG.5.1
ORF1a A656T / NSP2
intergenic V665I BF.28,EG.5.1.8
intergenic C667S EG.5.1
intergenic K684K EG.5.1
ORF1a F685L / NSP2
intergenic F685L EG.5.1
intergenic A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1
intergenic T753I BA.4.1.8,DV.7.1,EG.5.1
intergenic L815L EG.5.1
intergenic G817G BA.5.1.1,BA.4.6,EG.5.1.8
intergenic V839V BA.5.1.10,EG.5.1
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic A872A BA.5.1.2,EG.5.1.4
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic D928D EG.5.1
ORF1a D935D / NSP3
intergenic F941L EG.5.1
intergenic S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4
ORF1a D982G / NSP3
intergenic T987N EG.5.1
ORF1a T1022N / NSP3
intergenic T1022N EG.5.1
intergenic V1025V BQ.1.1.8,EG.5.1
intergenic P1054L EG.5.1
intergenic V1057I DV.7.1,EG.5.1
intergenic A1078A EG.5.1
intergenic S1102G EG.5.1
intergenic G1155C BA.5.1.2,EG.5.1.4
intergenic G1155D EG.5.1
intergenic Y1174Y BA.5.2.34,EG.5.1.4
ORF1a V1187F / NSP3
intergenic E1192V EG.5.1
intergenic P1207P EG.5.1
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic P1330P BF.10,EG.5.1.3,FL.1.5
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic P1390P DV.7.1.2,EG.5.1.3,EG.5.1.4
intergenic L1441L BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1
intergenic A1473V EG.5.1
intergenic P1480L EG.5.1
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intergenic V1629V BA.5.2.34,EG.5.2.1,EG.5.1
intergenic P1640L BA.5.1.24,BA.5.1.30,EG.5.1.8
intergenic C1744C EG.5.1
intergenic N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10,BA.5.5,EG.5.1
intergenic V1765V EG.5.1
intergenic G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic S1857L EG.5.1
intergenic Y1873Y BA.5.1.10,BF.9,BF.28,EG.5.1.3
intergenic P1950P EG.5.1
intergenic Y1972Y EG.5.1
intergenic S2015S BA.2.86.1,BA.2.12,EG.5.1.3
ORF1a F2025F / NSP3
intergenic F2025F EG.5.1
intergenic V2052L EG.5.1
intergenic D2101D BA.5.1.24,BA.5.1.2,BF.9,EG.5.1
intergenic T2124I BQ.1.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic H2125Y BA.4.6,EG.5.1
intergenic Y2168Y BA.5.1.10,EG.5.1
intergenic T2196T EG.5.1
intergenic A2249V BF.28,EG.5.1
intergenic L2253L EG.5.1
intergenic Y2262H EG.5.1
intergenic A2279V EG.5.1
intergenic T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic P2287L EG.5.1
intergenic D2299D BA.4,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1
intergenic T2300T EG.5.1
intergenic I2309I EG.5.2.1,EG.5.1.3
intergenic F2334F BA.2.12,BF.26,EG.5.1.8
intergenic A2379V BA.4.1.8,EG.5.1.8
ORF1a I2426I / NSP3
intergenic I2490I BA.5.5,EG.5.1
intergenic V2491I BA.5.1.24,EG.5.1.8
intergenic T2495I EG.5.1.8,FL.1.5,EG.5.1.4
intergenic Y2560Y BA.5,BF.41,EG.5.1.3
intergenic V2624V BA.4,EG.5.1.9
intergenic N2708N BA.5.2.3,EG.5.1.4
intergenic I2806V EG.5.1
intergenic T2836I BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.1.8
intergenic N2847S EG.5.1
ORF1a A2856V / NSP4
intergenic A2856V BF.9,EG.5.1
intergenic R2875H EG.5.1
intergenic N2894N BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.2.20,EG.5.1.9
intergenic I2895I EG.5.1
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intergenic T2920T BF.10,EG.5.1
ORF1a S2926C / NSP4
intergenic P2929L EG.5.1
intergenic P2929P BQ.1.2.3,EG.5.1.4
ORF1a P2950P / NSP4
intergenic V2996L EG.5.1
intergenic N3007N EG.5.1.4,EG.5.1
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8,DV.7.1,DV.7.1.2,BA.5.5,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4
intergenic C3059C EG.5.1
intergenic A3061A BA.5.2.3,BF.26,EG.5.1.4
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic F3100F BA.5.2.3,BF.9,EG.5.1.4
intergenic A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1
ORF1a E3188D / NSP4
intergenic E3188D EG.5.1
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic A3209V BA.5.1.10,BA.5.2.34,EG.5.1.3
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic T3258T BA.5.2.8,EG.5.1.8
intergenic G3278S BF.26,EG.5.1
intergenic N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2,BF.9,BE.1.1,EG.5.1
intergenic D3297D BF.10,EG.5.1
intergenic Y3300Y EG.5.1
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic L3321F EG.5.1
intergenic L3338L BA.5.5,EG.5.1
ORF1a P3362P / NSP5
intergenic V3377V EG.5.1
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic F3397F EG.5.1
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intergenic D3479D BA.5.2.8,BA.5.5,EG.5.1.8
ORF1a I3522L / NSP5
intergenic I3522L EG.5.1
intergenic T3579I EG.5.1
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3
intergenic A3615V BA.5.1.2,BF.26,BA.5.5,EG.5.1.8
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic L3694F EG.5.1
intergenic V3751V EG.5.2.1,EG.5.1.3
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intergenic L3900L EG.5.1
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intergenic N3937S EG.5.1
intergenic N3937N BA.5,EG.5.2.1,EG.5.1
intergenic A4016V BF.10,EG.5.1
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intergenic L4037F BA.5.2.8,EG.5.1.3
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intergenic L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BA.4.6,EG.5.1.3
intergenic N4082N EG.5.1
intergenic T4175I EG.5.1
intergenic TT4174II EG.5.1
intergenic T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3
intergenic L4185L EG.7,EG.5.1
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic L4237L DV.7.1,EG.5.1.8
intergenic I4291I BA.5.1.10,EG.5.1.3
intergenic D4317D BF.9,EG.5.1.8
intergenic A4357V BA.4,BA.5.2.3,EG.5.1
ORF1a A4357A / NSP10
intergenic A4357A DV.7.1.2,EG.5.1
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intergenic D4384D EG.5.1
ORF1b D4455N / NSP12
intergenic D4455N EG.5.1
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ORF1b D4553G / NSP12
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intergenic V4582V EG.5.1
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intergenic Y4686Y BA.4.1.8,DV.7.1.2,EG.5.1.4
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
ORF1b S4735S / NSP12
intergenic S4735S EG.5.1
ORF1b A4767T / NSP12
intergenic A4767T EG.5.1
intergenic L4779L BA.4,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.4
intergenic C4787C EG.5.1
intergenic N4795N BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.5.5,BQ.1.2.3,EG.5.1
intergenic F4820F BA.5.1.10,BA.4.1,BF.26,BQ.1.2.3,EG.5.1
intergenic L4852L EG.5.1.9,EG.5.1.4
intergenic D4857D BF.28,EG.5.1
intergenic R4947R EG.5.1
ORF1b T4978T / NSP12
intergenic T4978T BQ.1.2.3,EG.5.1
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intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic E5136E EG.5.1
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic D5152D BA.5.1.24,DV.7.1,CH.1.1.28,BF.26,EG.5.1.3
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic L5167L FL.2.3,EG.5.1
intergenic Y5218Y EG.5.1
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic L5230L BA.4,EG.5.1.4
intergenic A5232A BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.2,BF.26,EG.5.1.8,EG.5.1
intergenic F5251F EG.5.1
intergenic L5283L BA.4,BA.4.1,EG.5.1.4,EG.5.1
intergenic N5303N EG.5.1
intergenic C5332C BA.5,EG.5.1.8,EG.5.1.9,EG.5.1
intergenic Y5355Y BA.2.12,BA.5.2.20,EG.5.1
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic P5371P BA.1.17,EG.5.2.1,EG.5.1
intergenic C5374C BE.1.1,EG.5.1.3
intergenic P5377S BA.4,BA.5.1.24,BF.28,EG.5.1
intergenic S5404G BA.5.1.2,BE.1.1,EG.5.1.3
intergenic H5488Y BF.26,EG.5.1
intergenic T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1
intergenic Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1
ORF1b L5543L / NSP13
ORF1b V5571V / NSP13
intergenic A5636A BF.10,BA.5.5,EG.5.1
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic A5727V BA.4.1.8,EG.5.1.8
intergenic K5784R FL.2.3,EG.5.1
intergenic A5829D EG.5.1
intergenic G5862G EG.5.1
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
ORF1b I5889I / NSP13
intergenic I5889I EG.5.1
intergenic H5951Y DV.7.1,EG.5.1.3
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1
intergenic T6028T BA.5.2.2,BE.1.1,EG.5.1.3
intergenic P6046S BA.5.1.24,EG.5.1.4
intergenic V6050V EG.5.1
intergenic P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1
intergenic M6078I BA.4,EG.5.1
intergenic D6097D BA.2.12,BA.5.2.20,BA.5.5,EG.5.1.3,EG.5.1.4
intergenic V6107I DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1
intergenic P6128P EG.5.1
intergenic T6131T BA.2.12,DV.7.1,EG.5.1.8
intergenic G6173S DV.7.1,EG.5.1.8
intergenic L6184L EG.5.1
intergenic V6188V BA.1.14,EG.5.1
intergenic N6191D EG.5.1
intergenic A6232T BE.1.1,EG.5.1.4
intergenic V6241I EG.5.1
intergenic P6252S EG.5.1.3,FL.1.5,EG.5.1
intergenic D6300D BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.5.1.9
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3,EG.5.1
intergenic T6485I BA.5.2.20,EG.5.1.4
intergenic A6511S EG.5.1
ORF1b A6560S / NSP15
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1
intergenic T6566M BA.5.2.20,EG.5.1
ORF1b V6583L / NSP15
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
ORF1b Q6660P / NSP15
intergenic Q6660P EG.5.1
intergenic M6661I EG.5.1
intergenic H6686Y BA.5.1.1,BA.5.1.2,EG.5.1.8
intergenic G6738S BF.28,EG.5.1
intergenic V6772L BA.5.2.2,BA.5.1.1,BF.28,EG.5.1.3
intergenic Y6813Y EG.5.1
intergenic A6832V BA.5,EG.5.1
intergenic T6833I BA.4.6,EG.5.1
intergenic S6872S BQ.1.2.3,EG.5.1
intergenic I6926V EG.5.1
intergenic K6935K EG.5.1
intergenic K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4
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intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
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intergenic N354H EG.5.1
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
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intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
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intergenic S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4
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intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
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S E1150Q EG.5.1
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intergenic P240L BA.5.1.2,EG.5.1.4,EG.5.1
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intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
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intergenic V62F BA.5.2.20,CK.2,EG.5.1
intergenic P71L FL.1.5,EG.5.1.4
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic L56L BA.4,BA.5,EG.5.1.4
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic T77T BA.4.6,EG.5.1
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intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic N117N BQ.1.13,BA.5.5,EG.5.1.3
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intergenic F2L EG.5.1
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic D61I EG.5.1
ORF6 D61I XBB.1.5.72,EG.5.1
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic A13T EG.5.1
intergenic G38G EG.5.1
intergenic S37F BF.10,EG.5.1
intergenic G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4
intergenic N52N BF.26,EG.5.1.3
intergenic S81L EG.5.1
intergenic Q94X BA.4.6,EG.5.1.3
intergenic I107M EG.5.1
intergenic L116L BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,EG.5.1.4
intergenic X122fs EG.5.1
intergenic A15S BA.2.12,EG.5.1.4
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
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intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1
intergenic F53F BE.1.1,EG.5.1
intergenic S78S BA.5.1.2,EG.5.1
intergenic D98D BE.1.1,EG.5.1
intergenic F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1
intergenic I157I BA.4,BA.5.2.34,EG.5.2.1,EG.5.1
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intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1
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intergenic D415D DV.7.1,BF.28,EG.5.1.3,EG.5.1
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intergenic P3134S EU.1.1
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intergenic L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1
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intergenic N4358N BA.2.86.1,BF.26,BA.5.5,EU.1.1
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intergenic F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EU.1.1
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
intergenic I5239I EU.1.1
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ORF1b Y5394Y / NSP13
intergenic Y5394Y EU.1.1
ORF1b V5493V / NSP13
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intergenic A5620A EU.1.1
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intergenic T385I EU.1.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
intergenic RQI408SQV EU.1.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
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intergenic Y453H EU.1.1
S Y453H EU.1.1
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
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intergenic P521S EG.5.1.4,EU.1.1
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
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intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
intergenic L877L BF.26,DV.7.1.2,EU.1.1
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intergenic A958A EU.1.1
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
intergenic D1118D EU.1.1
S D1118D EU.1.1
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
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S M1229L EU.1.1
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ORF3a V55F BA.4,EU.1.1
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ORF3a R122K EU.1.1
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intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
intergenic P71L FL.1.5,EG.5.1.4,EU.1.1
intergenic g.T-26C BF.9,EU.1.1
intergenic S4_I8delinsF EU.1.1
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
intergenic R107H EU.1.1
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
intergenic g.C-5T BA.4,BA.5.1.24,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EU.1.1
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intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
intergenic Q35X EU.1.1
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intergenic g.C-1T EU.1.1
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
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intergenic F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
intergenic P13F BA.5.1.10,BF.10,EU.1.1
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intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
intergenic G60G EU.1.1
intergenic L159L EU.1.1
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intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1
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intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1
intergenic g.T29793A DV.7.1,EU.1.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
ORF1a N348D / NSP2
intergenic N348D FL.14
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ORF1a K636N / NSP2
intergenic K636N FL.14
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
ORF1a N1076S / NSP3
intergenic N1076S FL.14
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
ORF1a R1703R / NSP3
intergenic R1703R BQ.1.2.3,FL.14
intergenic G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14
intergenic L2062F BA.5.1.10,BF.26,FL.2.3,FL.14
intergenic C2160Y FL.14
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14
intergenic T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
ORF1a C4343C / NSP10
intergenic C4343C FL.14
intergenic Y4424Y FL.1.5,FL.14
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic C5332C BA.5,EG.5.1.8,EG.5.1.9,EG.5.1,FL.14
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic D5380D FL.14
intergenic Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14
intergenic L5551L EG.7,FL.14
intergenic E5585D FL.14
intergenic S5674L FL.14
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic V5834V BA.5.2.20,FL.14
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic I5967V EG.5.1.4,FL.14
intergenic H6007H FL.14
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic R6709C FL.14
intergenic P6722S FL.14
intergenic V7086I FL.14
intergenic L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic T76I BA.5.5,FL.14
intergenic V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic L118L FL.14
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
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intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic I472I FL.14
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
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intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic V534I FL.14
S V534I FL.14
intergenic P561P FL.1.5,FL.14
intergenic I598I FL.14
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic T618T BA.1.14,BA.5.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic I692I BA.5.1.10,BA.4.6,FL.14
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic V1122M FL.14
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic A23V BA.5.2.3,EU.1.1,FL.14
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic H148Y FL.14
intergenic A195A FL.14
intergenic H3H FL.14
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic W45R FL.14
intergenic P93L FL.14
ORF8 P93L FL.14
intergenic V100L FL.14
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic R93S FL.14
N R93S FL.14
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic G238S FL.14
intergenic F346F BA.5.2.34,EG.5.1,FL.14
intergenic P364L FL.14
intergenic D371N FL.14
N D371N FL.14
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic L27L BA.5.1.24,FL.1.5.2
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic H81R FL.1.5.2
intergenic G112G BF.20,FL.1.5.2
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic A339T FL.1.5.2
intergenic V544A FL.1.5.2
intergenic T554I FL.1.5.2
intergenic Y621Y BA.4,FL.1.5,FL.1.5.2
intergenic V721V FL.1.5.2
intergenic S723F FL.1.5.2
intergenic N786N BA.5.2.34,BQ.1.13,BF.10,FL.1.5.2
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic G993S FL.1.5,FL.1.5.2
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic V1339I FL.1.5.2
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic 1529 FL.1.5.2
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intergenic N1709N BA.1.18,CK.2,FL.1.5.2
intergenic G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic P2046S BA.1.14,FL.1.5.2
intergenic K2219K FL.1.5.2
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intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic S3402S FL.1.5.2
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intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic T4129I FL.1.5.2
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intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
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intergenic G5233G FL.1.5.2
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intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2
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intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
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intergenic G142_H146delinsDVYQ FL.1.5.2
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
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intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic N481K FL.1.5.2
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic F490P EG.5.1,FL.1.5.2
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic P561P FL.1.5,FL.14,FL.1.5.2
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic G667A FL.1.5.2
intergenic C671C FL.1.5.2
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic P681R BA.2.86.1,FL.1.5.2
intergenic A701V BA.1.17,BA.4.1,BA.5.5,EG.10.1,FL.1.5,FL.1.5.2
intergenic P715P BA.5.2.20,FL.1.5.2
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic G1131A FL.1.5.2
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic D27H EG.5.1,FL.1.5.2
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic P104dup BQ.1.13,BA.1.15,FL.1.5.2
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic T30I FL.1.5.2
intergenic V52I FL.1.5.2
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic L22L FL.1.5.2
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic T208I FL.1.5.2
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic L86L BA.5.1.2,FL.1.5.2
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic H37L FL.1.5.2
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic N228N FL.1.5.2
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic g.C-3T BA.5.2.2,FL.1.5.2
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic R24R BA.5,FK.1.1
intergenic E57K FK.1.1
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic N160N BA.4.6,FK.1.1
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intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic N869S FK.1.1
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intergenic A1043V BA.4,BE.1.1,FK.1.1
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intergenic S1221L DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic L1356L BA.4.6,FK.1.1
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intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic Y3074Y FK.1.1
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic F3603F BA.5.1.10,FL.2.3,EU.1.1,FK.1.1
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic R3805R FK.1.1
intergenic L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1
intergenic M3934I FK.1.1
intergenic L4045L BA.4,BA.4.1,BF.26,FK.1.1
intergenic N4060S DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1
intergenic T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic Y4329Y FK.1.1
intergenic N4358S FK.1.1
intergenic M4390T BA.5.1.1,FK.1.1
intergenic M4588I BA.4,FK.1.1
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic Q4749H FK.1.1
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic T5161N FK.1.1
intergenic C5353C BA.5.1.30,FK.1.1
intergenic M5392V FK.1.1
ORF1b G5442V / NSP13
intergenic G5442V FK.1.1
intergenic Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic D5725D BA.5.2.8,FK.1.1
intergenic T5805M BA.5,FK.1.1
intergenic T5941I BA.5.5,FK.1.1
ORF1b G5942R / NSP14
intergenic G5942R FK.1.1
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic V6026I FK.1.1
intergenic Y6079Y FK.1.1
intergenic V6107I DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1,FK.1.1
intergenic T6131T BA.2.12,DV.7.1,EG.5.1.8,FK.1.1
intergenic V6188V BA.1.14,EG.5.1,FK.1.1
intergenic P6222S FK.1.1
ORF1b L6254I / NSP14
intergenic L6254I FK.1.1
intergenic E6272E FK.1.1
intergenic L6418F BQ.1.13,FK.1.1
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic T6566K FK.1.1
intergenic L6571F FK.1.1
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic V6638V BA.5.1.2,BA.4.6,FK.1.1
intergenic L6703L FK.1.1
intergenic T6733T FK.1.1
intergenic Q6826R DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1
intergenic G6911G FK.1.1
intergenic Y6930Y BA.5.1.10,BA.1.15,FK.1.1
intergenic K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic L6981I FK.1.1
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic R78R FK.1.1
intergenic V83V BA.5.1.10,BA.5.1.2,CH.1.1.28,FK.1.1
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1
intergenic K147E DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1
intergenic W152R BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1
intergenic G181R FK.1.1
intergenic R190K BQ.1.1.8,FK.1.1
intergenic I210V DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,FK.1.1
intergenic D215G FK.1.1
intergenic G219S FK.1.1
intergenic S221S BA.2.12,FK.1.1
intergenic G257S DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1
intergenic F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic K444T BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FK.1.1
intergenic G446S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,BA.1.15,FK.1.1
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,FK.1.1
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic F486S DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,FK.1.1
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic QD613HG FK.1.1
intergenic T618T BA.1.14,BA.5.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic A892V FK.1.1
intergenic G910G FK.1.1
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic A1190A FK.1.1
intergenic E1195Q EG.5.1.9,FK.1.1
intergenic A1222T FK.1.1
intergenic V1264L BA.5.5,EU.1.1,FK.1.1
intergenic 9 FK.1.1
intergenic F8F FK.1.1
intergenic A23A FK.1.1
intergenic I62I BQ.1.2.3,FK.1.1
intergenic I63T FK.1.1
intergenic L65F FK.1.1
intergenic T64T FK.1.1
intergenic K75N FK.1.1
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic g.-4delA FK.1.1
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic L27L FK.1.1
intergenic L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10,BF.20,BA.5.1.2,FK.1.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1
intergenic S212G FK.1.1
intergenic L16L BA.5.1.1,BA.5.1.2,FK.1.1
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic K72N FK.1.1
ORF7a K72N FK.1.1
intergenic 19 EG.5.1.4,FK.1.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic R32_G34del FK.1.1
intergenic S37L FK.1.1
intergenic A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1
intergenic R191R FK.1.1
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic D341G FK.1.1
intergenic S413R BA.5.1.24,FK.1.1
intergenic g.C-3T BA.5.2.2,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1
intergenic g.T-167C EG.6.1
intergenic g.C-63T BA.5.1.10,BA.4,EG.10.1,FL.1.5,EG.6.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1
ORF1a H165Y / NSP1
intergenic G192D EG.6.1
intergenic N310S EG.6.1
intergenic A405A EG.6.1
intergenic I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1
intergenic I567V EG.6.1
intergenic L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.6.1
intergenic L580F BA.4,BA.5.1.24,EG.6.1
intergenic L628R EG.6.1
intergenic L681F BA.2.12,BQ.1.13,EG.6.1
intergenic A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1
intergenic T711T BA.2.12,EG.6.1
intergenic N810N BA.5.2.20,EG.6.1
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
ORF1a G865D / NSP3
intergenic P892S EG.5.1.3,EG.6.1
intergenic L897L EG.6.1
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic D992D DV.7.1,EG.6.1
intergenic E1024A EG.6.1
intergenic E1047D EG.6.1
intergenic I1091M EG.6.1
intergenic P1147P EG.6.1
intergenic K1247K DV.7.1,EG.6.1
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
ORF1a A1485E / NSP3
intergenic T1504I EG.6.1
intergenic L1507F EG.6.1
intergenic T1543A EG.6.1
ORF1a L1559F / NSP3
ORF1a Y1634H / NSP3
intergenic L1643L BA.5.1.2,EG.6.1
intergenic D1671D BA.4.6,EG.6.1
intergenic Y1700Y BA.4.1,BQ.1.1.8,EG.6.1
intergenic G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic L1853F EG.6.1
intergenic F1867F EG.6.1
intergenic Y1868Y BA.4,BA.5.1.24,BF.26,EU.1.1,EG.6.1
intergenic Y1975Y EG.6.1
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intergenic D2026G EG.6.1
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intergenic P2221S EG.6.1
intergenic I2230T EG.6.1
intergenic T2247T FK.1.1,EG.6.1
intergenic T2274I BA.5.1.1,EG.6.1
intergenic S2493G BA.4,EG.6.1
intergenic A2584V BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,EG.7,EG.6.1
intergenic K2589R BE.1.1,EG.6.1
intergenic F2780F EG.6.1
ORF1a T2977K / NSP4
intergenic T2977K EG.6.1
ORF1a V3024I / NSP4
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic M3030I EG.6.1
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic F3100F BA.5.2.3,BF.9,EG.5.1.4,EG.6.1
intergenic S3171S EG.6.1
intergenic L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5,EG.6.1
ORF1a K3192R / NSP4
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic F3271F BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,EG.6.1
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic A3523V EG.6.1
ORF1a G3578V / NSP6
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1
intergenic A3620V BA.1.14,BF.26,EG.6.1
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic A3730A BA.2.12,EG.6.1
ORF1a Y3765H / NSP6
intergenic Y4077Y EG.6.1
intergenic S4093S EG.6.1
intergenic T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic F4196F EG.6.1
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic I4231I EG.6.1
intergenic I4308T EG.6.1
intergenic C4332S EG.6.1
intergenic V4361V EG.6.1
intergenic I4429I BA.4.6,EG.6.1
intergenic A4487V EG.6.1
intergenic D4562Y EG.6.1
intergenic P4619S EG.6.1
intergenic L4708L EG.6.1
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic V4802V EG.6.1
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic E5136D BA.4,EG.6.1
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic T5242T EG.6.1
intergenic P5310L BA.5.1.10,EG.6.1
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic P5401P EG.6.1
intergenic T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1
intergenic S5583L BE.1.1,EG.6.1
ORF1b D5584G / NSP13
intergenic D5584G EG.6.1
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic V5834V BA.5.2.20,FL.14,EG.6.1
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic D6069D BA.2.12,BA.4.1,EG.6.1
intergenic L6102L BA.4.1,BA.4.6,EG.6.1
intergenic D6104D BA.2.12,BF.26,EG.6.1
ORF1b G6190G / NSP14
intergenic L6308L EG.6.1
intergenic D6315G BA.5,EG.6.1
intergenic Y6317Y EG.6.1
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic N6403N EG.6.1
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic V6583L EG.6.1
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic D6664D EG.6.1
ORF1b H6686R / NSP15
intergenic A6990A EG.6.1
intergenic L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1
intergenic G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1
intergenic H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1
intergenic H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1
intergenic I692I BA.5.1.10,BA.4.6,FL.14,EG.6.1
S V729V EG.6.1
intergenic C743C EG.6.1
S C743C EG.6.1
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic V772I EG.6.1
intergenic D808H EG.6.1
intergenic N856N BQ.1.1.8,CH.1.1.28,EG.7,EG.6.1
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic Y1067Y EG.6.1
intergenic Q1113R EG.6.1
S Q1113R EG.6.1
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic C1236F EG.6.1
intergenic F1256F EG.6.1
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic S74S EG.10.1,EG.6.1
intergenic V80I EG.6.1
intergenic V97I BF.26,EG.6.1
intergenic I123T EG.6.1
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic P262S EG.6.1
intergenic S6S EG.6.1
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic R146H DV.7.1,EG.6.1
intergenic L149L EG.6.1
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic Y49H EG.6.1
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1
intergenic T39I EG.6.1
intergenic Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9,BA.5.2.20,BQ.1.13,CK.2,EG.6.1
intergenic I103fs EG.6.1
intergenic E3X EG.6.1
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic W29R EG.6.1
intergenic g.C-1T EU.1.1,EG.6.1
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic P30P EG.6.1
intergenic C37R BF.9,EG.6.1
intergenic V62L BF.41,BA.5.5,EG.5.1,EG.6.1
intergenic G66V EG.6.1
intergenic Y73Y EG.6.1
intergenic I88_N89insRAG EG.6.1
intergenic C90Y BE.1.1,EG.6.1
intergenic E110X EG.6.1
intergenic FI120VL BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BQ.1.13,EG.6.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic P6P EG.6.1
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic N192N BA.5.1.10,BA.4,BF.10,EG.6.1
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic G238C EG.6.1
intergenic S327S BQ.1.1.8,EG.6.1
intergenic L331L EG.6.1
N K372K EG.6.1
intergenic V392V EG.6.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1
intergenic g.C-3T BA.5.2.2,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic g.G29711T EG.5.1.8,EG.6.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic L27L BA.5.1.24,FL.1.5.2,FL.10.1
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intergenic L140L CH.1.1.28,BQ.1.13,BA.5.5,FL.10.1
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1
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intergenic D1323D BA.5.1.24,FL.10.1
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intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
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intergenic A3960A BA.4,FL.10.1
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intergenic S4186S FL.10.1
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intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1
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intergenic G6621E FL.10.1
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intergenic S45S FL.10.1
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intergenic F175L FL.10.1
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1
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intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic A344V FL.10.1
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic G413G DV.7.1.2,FL.10.1
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intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
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intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic K529N FL.10.1
intergenic E554K BA.2.86.1,FL.10.1
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1
intergenic L629L BA.5.1.24,BF.9,BA.5.5,FL.10.1
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
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intergenic S691S FL.10.1
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic Q853K FL.10.1
intergenic A879V BA.5.2.34,FL.10.1
intergenic A892V FK.1.1,FL.10.1
intergenic A930A BA.1.14,FL.10.1
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic L966L FL.10.1
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic T1006A FL.10.1
intergenic R1107M EG.7,FL.10.1
S R1107M FL.10.1
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic G1219C BA.5.2.2,FL.10.1
intergenic g.T-2C FL.10.1
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1
intergenic Y154Y BA.5.5,FL.10.1
intergenic Q213K BA.2.12,EG.5.1.3,FL.10.1
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic M260T FL.10.1
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic N41N BF.9,BA.5.5,FL.10.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic A104A FL.10.1
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic L120L FL.10.1
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic I32I BA.5.5,FL.10.1
intergenic E46E FL.10.1
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic T11A FL.10.1
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intergenic R78G FL.10.1
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intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1
intergenic H37Y CH.1.1.28,FL.10.1
intergenic H42H FL.10.1
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1
intergenic P30P EG.6.1,FL.10.1
intergenic S67F BA.5.1.10,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.5,EG.5.1,FL.10.1
intergenic V116A FL.10.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1
intergenic P13F BA.5.1.10,BF.10,EU.1.1,FL.10.1
intergenic P13L BA.5.1.10,EU.1.1,FL.10.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1
intergenic S197T FL.10.1
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic G275G FL.10.1
intergenic G287G FL.10.1
intergenic D288N FL.10.1
intergenic T296I BA.2.12,FL.10.1
intergenic S327S BQ.1.1.8,EG.6.1,FL.10.1
intergenic K361I FL.10.1
intergenic P364L FL.14,FL.10.1
intergenic S413H FL.10.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1
intergenic A8V FL.10.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1
intergenic g.C-168T FD.1.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic P6S FD.1.1
intergenic L16F FD.1.1
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intergenic P80L FD.1.1
intergenic G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,FD.1.1
intergenic G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1
intergenic M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1
intergenic M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BA.4.6,FD.1.1
intergenic R99C BA.4.1.8,FD.1.1
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intergenic A131V FD.1.1
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intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
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intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic H3076Y FD.1.1
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intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
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intergenic I3257I FD.1.1
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic L3313L FD.1.1
intergenic L3338L BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1
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intergenic T3374T BA.5.1.10,FD.1.1
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic A3473A FD.1.1
intergenic A3523A EG.5.1.4,FD.1.1
intergenic A3615V BA.5.1.2,BF.26,BA.5.5,EG.5.1.8,FD.1.1
ORF1a M3661T / NSP6
intergenic M3661T FD.1.1
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic Y3744Y BA.5.1.24,BA.4.6,FD.1.1
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ORF1a V4225V / NSP9
intergenic V4225V FD.1.1
intergenic L4237L DV.7.1,EG.5.1.8,FD.1.1
intergenic A4408V FD.1.1
ORF1b V4520V / NSP12
intergenic V4520V FD.1.1
ORF1b N4550N / NSP12
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ORF1b Q4684E / NSP12
intergenic Q4684E FD.1.1
intergenic Y4686Y BA.4.1.8,DV.7.1.2,EG.5.1.4,FD.1.1
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic V4745I FD.1.1
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EU.1.1,FD.1.1
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic G5231G FD.1.1
intergenic G5233G FL.1.5.2,FD.1.1
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
ORF1b P5499P / NSP13
intergenic P5499P FD.1.1
intergenic L5551L FD.1.1
intergenic E5585G FD.1.1
intergenic A5620A EU.1.1,FD.1.1
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic F5746F BA.2.12,BA.5.2.3,FD.1.1
ORF1b G5763V / NSP13
intergenic G5763V FD.1.1
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic L5905F EG.5.1.4,FD.1.1
intergenic T5956I BA.5.2.2,BA.5,FD.1.1
intergenic I5967V EG.5.1.4,FL.14,FD.1.1
intergenic IP5967VL FD.1.1
intergenic E6024E BA.5.2.20,FD.1.1
intergenic R6137I FD.1.1
intergenic S6180I FL.2.3,FD.1.1
intergenic H6208Y FD.1.1
intergenic V6241I EG.5.1,FD.1.1
ORF1b N6259N / NSP14
intergenic N6259N FD.1.1
intergenic L6308L BA.2.12,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.1.5,FD.1.1
intergenic DRYP6315EGCH BA.2.12,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.26,BA.4.6,FD.1.1
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic G6406S FD.1.1
intergenic T6485I BA.5.2.20,EG.5.1.4,FD.1.1
ORF1b T6500T / NSP15
intergenic T6500T FD.1.1
intergenic Y6540Y BQ.1.13,BF.10,FD.1.1
intergenic A6544V FD.1.1
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
ORF1b F6868F / NSP16
intergenic F6868F FD.1.1
intergenic L7042L BA.5.1.24,FD.1.1
intergenic L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1
intergenic T19I BA.5.2.2,BA.5.1.2,EG.5.1.3,EG.5.1,FD.1.1
intergenic T19L BA.5.2.2,BA.5.1.2,EG.5.1.3,EG.5.1,FD.1.1
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic I68T FD.1.1
intergenic V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic S98F BA.5.1.10,FL.1.5,FD.1.1
intergenic R102G FD.1.1
S R102G FD.1.1
intergenic S116S EG.5.1,EU.1.1,FD.1.1
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1
intergenic H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1
intergenic D178N BA.5.1.2,FD.1.1
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic VR213EH FD.1.1
S VR213EH FD.1.1
intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic N343N EG.5.1.9,EG.7,FD.1.1
intergenic R346T FD.1.1
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic I410I BQ.1.1.8,BF.26,FD.1.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
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intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
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intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic P812L DV.7.1,FD.1.1
intergenic S940S FD.1.1
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic A1020V FD.1.1
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intergenic 1148 FD.1.1
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
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intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic I20I BA.1.17,BA.5.1.24,BF.26,FD.1.1
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intergenic G254R FD.1.1
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intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
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intergenic T30T BF.28,FD.1.1
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intergenic A69S FD.1.1
M A69S FD.1.1
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic H155H FD.1.1
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intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
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ORF7a S60_V74del FD.1.1
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ORF7a Q94N FD.1.1
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ORF7b g.GATTG-136_-132CATTT FD.1.1
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic g.A-6T FD.1.1
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic V32A FD.1.1
intergenic P85S FD.1.1
intergenic C102R EG.5.1.3,FD.1.1
ORF8 C102R FD.1.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic R40R FD.1.1
intergenic T49I BA.5,BA.5.1.30,BF.10,FD.1.1
intergenic S190G FD.1.1
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intergenic RGT203KRI FD.1.1
intergenic Q240Q FD.1.1
N Q240Q FD.1.1
intergenic A254A FD.1.1
intergenic D377D FD.1.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1
intergenic C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13,FD.1.1
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intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1
intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1
intergenic g.G-56T BA.5.6
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6
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intergenic M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.5.6
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intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic P305L BA.5.6
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intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic D928D EG.5.1,BA.5.6
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intergenic V1085V BA.5.6
ORF1a G1155G / NSP3
intergenic G1155G BA.5.6
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ORF1a Y1285Y / NSP3
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intergenic P1321P BA.5.6
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic D1547D BA.5.6
ORF1a L1621L / NSP3
intergenic L1621L BA.5.6
intergenic Y1675Y BA.5.5,BA.5.6
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ORF1a K2200K / NSP3
intergenic K2200K BA.5.6
ORF1a R2336R / NSP3
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intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic G3219G BA.5.6
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intergenic T3308T BA.5.6
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intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
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intergenic L3535L BA.2.12,BA.5.1.24,BF.28,BA.5.6
intergenic L3588F BA.5.6
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6
intergenic L3636L BA.5.1.24,BA.4.1,BA.5.5,BA.5.6
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
ORF1a V3747L / NSP6
intergenic V3747L BA.5.6
intergenic F3769F BA.5.1.30,BF.26,FD.1.1,BA.5.6
ORF1a L3872L / NSP7
intergenic L3872L BA.5.6
intergenic N3937N BA.5,EG.5.2.1,EG.5.1,BA.5.6
intergenic P3952S BA.5.6
intergenic E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6
intergenic L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BA.4.6,EG.5.1.3,BA.5.6
intergenic P4120S BA.5.6
intergenic S4145S BA.5.6
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic A4285T BQ.1.2.3,BA.5.6
intergenic N4338N BA.5.6
ORF1b R4508R / NSP12
intergenic R4508R BA.5.6
intergenic D4532D BF.28,BF.26,BA.5.6
intergenic N4560N BA.5,BA.5.6
ORF1b R4575R / NSP12
intergenic R4575R BA.5.6
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic V4746V BA.5.6
intergenic N4752N BA.5.6
intergenic V4887V BA.5.1.24,BA.5.6
ORF1b K4903K / NSP12
intergenic K4903K BA.5.6
intergenic N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20,BA.1.15,BA.5.5,BA.5.6
intergenic V5067V BA.5.6
intergenic D5132D BA.5.6
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic S5160S BE.1.1,BA.5.6
intergenic V5478A BA.5.6
intergenic H5488Y BF.26,EG.5.1,BA.5.6
intergenic Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6
intergenic Y5601Y BA.5.6
ORF1b C5682C / NSP13
intergenic C5682C BA.5.6
intergenic A5713V BF.9,BA.5.6
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic N5843N BA.5.6
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6
intergenic R6060R BA.5.6
intergenic D6097D BA.2.12,BA.5.2.20,BA.5.5,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.10.1,BA.5.6
intergenic Y6160Y BF.28,FL.1.5,BA.5.6
intergenic N6231N BA.5.6
intergenic M6240I BA.5.6
intergenic N6259N FD.1.1,BA.5.6
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic G6598S BA.5,BA.5.6
ORF1b E6643D / NSP15
intergenic E6643D BA.5.6
intergenic P6657S BA.5.2.20,BA.5.6
intergenic D6724D BA.4.1,BA.5.6
intergenic Y6845Y BA.5.1.10,BA.5.6
intergenic T6938I BA.2.12,BA.5,BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.5.6
intergenic R7014N BQ.1.1.8,BQ.1.2.3,BA.5.6
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6
intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6
intergenic S112L BA.5.6
intergenic L117L BA.5.6
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6
intergenic E156D BA.5.6
S E156D BA.5.6
intergenic V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,FK.1.1,BA.5.6
intergenic S247N BA.5.6
intergenic S316S BA.5.6
S S316S BA.5.6
intergenic G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6
intergenic R346S BA.4,BA.5.2.3,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.5.6
intergenic N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,FK.1.1,BA.5.6
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic Y505H BA.5.6
intergenic F541F EG.7,BA.5.6
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic E619K BQ.1.2.3,BA.5.6
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic I7I CK.2,BA.5.6
intergenic G11_L15del BA.5.6
ORF3a G11_L15del BA.5.6
intergenic I20T BE.1.1,BA.5.6
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic L71L BA.5,BQ.1.13,BA.5.6
intergenic L73F BF.9,BA.5.6
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic V225V BA.5.6
ORF3a V225V BA.5.6
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic A68A BA.5.6
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic N113N BA.5.6
intergenic N117N BQ.1.13,BA.5.5,EG.5.1.3,BA.5.6
intergenic S211S BA.5.6
intergenic L4L BA.5.2.3,EG.7,BA.5.6
intergenic Y31Y BA.5.1.24,BA.5,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BA.5.6
intergenic C35C BA.5.6
intergenic H73Y BA.5.1.24,BA.5.2.8,BE.1.1,BA.5.6
intergenic S83L BA.5.6
intergenic E121V BA.5.6
ORF7a E121V BA.5.6
intergenic L14fs CH.1.1.28,BA.5.6
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6
intergenic G50V BA.5.6
intergenic V62L BF.41,BA.5.5,EG.5.1,EG.6.1,BA.5.6
intergenic C83F BA.5.6
intergenic FI120VL BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BQ.1.13,EG.6.1,BA.5.6
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic S37S BA.5.6
intergenic R88R BA.5.6
intergenic F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1,BA.5.6
intergenic T135I BA.5.6
intergenic P142S BA.4,BA.5.6
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6
intergenic F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1,BF.26,EG.5.1,BA.5.6
intergenic Y333Y BA.4,BF.26,BA.4.6,BA.5.6
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6
intergenic g.C-23T BA.5.6
intergenic C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13,FD.1.1,BA.5.6
intergenic A28V BA.2.12,BA.5.6
intergenic L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.6
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1,EU.1.1,FL.20.2
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic N1094S FL.20.2
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic T1788M BA.4.6,FL.20.2
intergenic G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2
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intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic D3042D FL.20.2
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic A3523A EG.5.1.4,FD.1.1,FL.20.2
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic A3956S FL.20.2
intergenic T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic F4584F CH.1.1.28,BA.5.5,FL.20.2
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.2.20,BA.1.15,BA.5.5,BA.5.6,FL.20.2
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic A5727A DV.7.1,FL.20.2
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic L6102L BA.4.1,BA.4.6,EG.6.1,FL.20.2
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intergenic N6497N FL.20.2
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic A6858S FL.20.2
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2
intergenic V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic Q173Q EG.5.2.1,FL.20.2
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic L452M FL.20.2
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic V29I BA.2.12,FL.20.2
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic A72T DV.7.1,DV.7.1.2,FD.1.1,FL.20.2
intergenic S74F BA.4,DV.7.1.2,BF.10,FL.1.5,FL.20.2
intergenic L108F BA.4,FL.20.2
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic V256del BA.5.2.2,BA.5.1.30,EG.5.1.3,FL.20.2
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic S81L EG.5.1,FL.20.2
intergenic F101_I103del FL.20.2
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic F19F FL.20.2
intergenic Q35X EU.1.1,FL.20.2
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic L56L BA.4.1,BA.5.1.30,FL.20.2
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic T282T BA.1.17,FL.20.2
intergenic F315F BA.5.1.1,BA.5.1.30,FL.20.2
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic g.T-17C GA.4.1
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic I280V GA.4.1
intergenic L469F BQ.1.2.3,GA.4.1
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic N1059N BA.4.1,BQ.1.13,BA.5.5,GA.4.1
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intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
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intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
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intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic L3352F GA.4.1
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
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intergenic N4704N GA.4.1
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
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intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic V6637I GA.4.1
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intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
intergenic Q115Q GA.4.1
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
intergenic H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
intergenic H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
intergenic D215H BA.5.1.1,GA.4.1
intergenic H245Y GA.4.1
intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1
intergenic K356T BA.2.86.1,GA.4.1
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
intergenic ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1
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intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
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intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
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intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
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intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1
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intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1
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intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
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intergenic V1391V FL.15.1.1
intergenic G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1
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intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
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intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1
intergenic T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic L4209L FL.15.1.1
intergenic Y4424Y FL.1.5,FL.14,FL.15.1.1
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic D5216S FL.15.1.1
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intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic D6069D BA.2.12,BA.4.1,EG.6.1,FL.15.1.1
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic G6406S FD.1.1,FL.15.1.1
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic Q6627H FL.15.1.1
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intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
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intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic A475V FL.15.1.1
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic E484V BA.5.2.3,FL.15.1.1
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic E583K FL.15.1.1
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic N709N FL.15.1.1
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intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic T176I BA.1.17,BF.26,FL.15.1.1
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic R191R FK.1.1,FL.15.1.1
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1
intergenic g.T-121C EG.5.1.6
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intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic G82_H83del BA.5.1.24,EG.5.1.6
intergenic E87D BA.5.6,EG.5.1.6
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic S166G BA.5.1.2,BA.4.1,BA.4.6,EG.5.1.6
intergenic L204L BF.41,EG.5.1.6
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intergenic T829I EG.5.1.6
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intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6
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intergenic N1324T EG.5.1.6
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intergenic I1935I BA.5.2.20,BA.5.6,EG.5.1.6
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intergenic V2047F EG.7,EG.5.1.6
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intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic L3041F EG.5.1.6
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
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intergenic A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
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intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
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intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic Y5276Y BF.9,EG.5.1.6
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic P5371P BA.1.17,EG.5.2.1,EG.5.1,EG.5.1.6
intergenic T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6
intergenic Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic K5738R EG.5.1.6
intergenic G5739S EG.5.1.6
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic L5905F EG.5.1.4,FD.1.1,EG.5.1.6
intergenic L5952F EG.5.1.6
intergenic V5954V EG.5.1.6
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic T5975T EG.5.1.6
intergenic P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6
ORF1b V6124M / NSP14
intergenic Q6187Q EG.5.1.6
intergenic K6236N BA.1.15,EG.5.1.6
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic A6832V BA.5,EG.5.1,FL.10.1,EG.5.1.6
intergenic G6953G BA.4.1.8,BA.5,EG.5.1.6
intergenic L10L FL.1.5.2,EG.5.1.6
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic T22I BF.26,EG.5.1.6
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6
intergenic V70V EG.5.1.6
intergenic V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6
intergenic G142_Y144delinsDF EG.5.1.6
S G142_Y144delinsDF EG.5.1.6
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6
intergenic H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6
intergenic H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic N211I EG.5.1.6
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic H245Y GA.4.1,EG.5.1.6
S R246G EG.5.1.6
intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6
intergenic F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6
intergenic T333T BF.26,EG.5.1.6
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
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intergenic V112F EG.5.1.6
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic F230F EG.5.1.6
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.6,GA.4.1,EG.5.1.6
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intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic P132P BA.5.2.8,EG.5.1.6
intergenic S213S EG.5.1.3,EG.5.1.6
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic 40 EG.5.1.6
intergenic G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6
intergenic D69D BA.1.14,BA.5.2.8,EG.5.1.6
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic g.C-1T EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic H17Y BA.5.2.20,EG.10.1,FL.1.5,EG.5.1.6
intergenic E110X EG.6.1,EG.5.1.6
intergenic R115C EU.1.1,EG.5.1.6
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
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intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic g.G29825A EG.5.1.6
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intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
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intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic I1045V FL.8
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intergenic T1542I FL.8
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intergenic M2380V FL.8
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intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic D3508D FL.1.5,FL.8
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intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic M3712V FL.8
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intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic L4252L BQ.1.1.8,FL.8
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intergenic A4775A FL.8
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intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic A5232A BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.2,BF.26,EG.5.1.8,EG.5.1,FL.8
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intergenic Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8
intergenic A5616A FL.8
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intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
ORF1b N6041D / NSP14
intergenic N6041D FL.8
intergenic N6333N FL.8
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic F55F BF.9,BF.28,BF.26,EG.5.1,FL.8
intergenic A67S FL.8
intergenic V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8
intergenic M177I BA.1.17,FL.8
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic L368I FL.8
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
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intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
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intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic V610V FL.8
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic I670I FL.8
S I670I FL.8
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic D1084Y FL.8
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic M1237I BF.26,FL.8
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic I62F FL.8
ORF3a I62F FL.8
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic T175T FL.2.3,FL.8
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic T24I BA.5.2.34,BF.9,FL.8
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic P46S FL.8
intergenic N126K FL.8
N N126K FL.8
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic T379N FL.8
N T379N FL.8
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8
intergenic g.C29708T BA.5.2.20,FL.8
intergenic g.C-119T BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.2.3,FL.15
intergenic g.G-68T FL.15
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intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic g.C-12T FL.15
intergenic H45Y BA.4,FL.15
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic P62S FL.15
intergenic L122L FL.15
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic K210K BA.4,FL.15
intergenic G268G EG.5.1,FL.15
intergenic H388Y BA.1.14,EG.5.1.9,EU.1.1,FL.15
intergenic G400S EG.5.1.4,FL.15
ORF1a G400V / NSP2
intergenic G400V FL.15.1.1,FL.15
intergenic R402R BA.5.2.34,DV.7.1,BF.10,BA.5.6,FL.15
intergenic H417Y EG.5.1,FL.15
intergenic I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6
intergenic G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15
intergenic A537A FL.15
intergenic L580L BA.5.1.24,BA.4.6,FL.15
intergenic A599T FL.15
intergenic A599A BA.5.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,FK.1.1,FL.15
intergenic S610L FL.15
intergenic E637K FL.15.1.1,FL.15
intergenic K669E FL.15
intergenic C720Y FL.15
intergenic S723S DV.7.1,FL.15
intergenic L730F FL.15
ORF1a E775G / NSP2
intergenic E775G FL.15
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic D1044D DV.7.1,FL.15
intergenic P1096L FL.15
intergenic V1104I FL.15
intergenic S1188L FL.15
intergenic I1276I FL.15
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic A1397A BA.2.12,BA.5,DV.7.1,BA.5.5,FL.15
intergenic N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.30,FL.1.5,EG.7,FD.1.1,FL.15
intergenic D1554D BF.10,FL.15
intergenic F1632F FL.15
intergenic Y1675Y BA.5.5,BA.5.6,GA.4.1,FL.15
intergenic L1748L FL.15
intergenic Q1813Q FK.1.1,FL.15
intergenic G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic V1957I EG.5.1.3,FL.15
intergenic T1998I FL.15
intergenic T2007T BA.5,BQ.1.1.8,GA.4.1,FL.15
intergenic V2090I FL.15
intergenic S2132G BQ.1.1.8,DV.7.1.2,FL.15
intergenic V2133A FL.15
intergenic S2185N FL.15.1.1,FL.15
intergenic L2235L FL.15
ORF1a S2313A / NSP3
intergenic S2313A FL.15
intergenic F2338F BQ.1.13,FL.15
intergenic I2490I BA.5.5,EG.5.1,EG.5.1.6,FL.15
intergenic K2533R BA.5.5,FL.15
intergenic N2539S FL.15
intergenic S2822P FL.15
intergenic S2822S FL.15
intergenic D2907D BA.2.12,BA.5.2.20,FL.15
intergenic S2981S EG.10.1,FL.15.1.1
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic I3052V BA.2.12,FL.15
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic P3134S EU.1.1,FL.15
ORF1a T3150A / NSP4
intergenic T3150A FL.15
intergenic V3166V FL.15
intergenic L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18,FL.1.5,EG.6.1,FL.15.1.1
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic N3239N BA.5.1.2,FL.15
intergenic Y3250Y BA.4.1,FL.2.3,FL.15
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic A3454A FL.15
intergenic D3508D FL.1.5,FL.8,FL.15
intergenic L3583L FL.15
intergenic V3593A FL.15
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15
intergenic M3616I FL.15
ORF1a M3627V / NSP6
intergenic M3627V FL.15
intergenic P3642P BF.26,FL.15
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intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic I3758V BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BA.1.15,FL.15
intergenic G3849G FL.15
intergenic D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15
intergenic L4045L BA.4,BA.4.1,BF.26,FK.1.1,FL.15
intergenic I4049I FL.15
intergenic A4168A BA.5.1.30,BA.4.6,FL.15
intergenic T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic L4209L FL.15.1.1,FL.15
intergenic N4235N BA.4,BA.5,BA.5.1.1,FL.1.5,FL.1.5.2,FL.15
intergenic T4249I BQ.1.13,BA.5.5,FL.15
intergenic K4346K FL.15
intergenic A4357V BA.4,BA.5.2.3,EG.5.1,FL.15
intergenic D4384D EG.5.1,FL.15
intergenic R4387R BA.4,BA.5.1.30,BF.28,FL.15
intergenic Y4424Y FL.1.5,FL.14,FL.15.1.1
intergenic D4556G FL.15
intergenic A4568A BA.5,FL.15
intergenic I4593I FL.15
intergenic Y4686Y BA.4.1.8,DV.7.1.2,EG.5.1.4,FD.1.1,FL.15
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic N4808N FL.15
intergenic D4891D FL.15
intergenic I5024V FL.15
intergenic A5031A FL.15
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic R5118R FL.15
intergenic E5121E FL.15
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic I5229I FL.15
intergenic N5303N EG.5.1,FL.15
intergenic Y5355Y BA.2.12,BA.5.2.20,EG.5.1,FL.1.5.2,FL.15
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic V5366V EG.5.2.1,FL.15
intergenic P5371P BA.1.17,EG.5.2.1,EG.5.1,EG.5.1.6,FL.15
intergenic P5377S BA.4,BA.5.1.24,BF.28,EG.5.1,FL.15
intergenic S5490L BA.5.2.34,BA.5.1.24,FL.15
intergenic Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic V5565V FL.15
intergenic D5584Y FL.15
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic A5727A DV.7.1,FL.20.2,FL.15
intergenic V5749V FL.15
intergenic A5793V FL.15
intergenic Q5842Q FL.15
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic Y5867Y FL.15
intergenic T5890T FL.15
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic K5986K FL.15
intergenic P5995L FL.15
intergenic L6032I FL.15
intergenic T6038I BF.9,FL.15
intergenic D6069D BA.2.12,BA.4.1,EG.6.1,FL.15.1.1
intergenic V6107I DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1,FK.1.1,FL.15
ORF1b S6180R / NSP14
intergenic S6180R FL.15
intergenic H6239H FL.15
intergenic E6290E FL.15
intergenic A6296V FL.15
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic E6378D FL.15
intergenic G6406S FD.1.1,FL.15.1.1
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic G6581S FL.15
ORF1b R6590C / NSP15
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic A6623V DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FL.15
intergenic T6733T FK.1.1,FL.15
ORF1b D6734D / NSP15
intergenic K6933K FL.15
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intergenic Q14R FL.15
intergenic Q14H EG.10.1,FL.15
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic F43F FL.15
intergenic H49Y FL.15
intergenic Q52H EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.15
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intergenic R102G FD.1.1,FL.15
intergenic S116S EG.5.1,EU.1.1,FD.1.1,FL.15.1.1
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15
intergenic H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15
intergenic H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15
intergenic H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8
intergenic N148T FL.15
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic F186S FL.15
intergenic V193L BA.5.1.10,FL.15
intergenic I197V FL.15
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic L249L FL.15
intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic V341I FL.15
intergenic A344S FL.15
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
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intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic Y421Y FL.15
S Y421Y FL.15
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intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15
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intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
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intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic E484V BA.5.2.3,FL.15.1.1
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
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intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
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intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic I3S FL.15
ORF7a I3S FL.15
intergenic G38E BE.1.1,FL.15
intergenic N52S FL.15
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic P56L FL.15
intergenic S67F BA.5.1.10,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.5,EG.5.1,FL.10.1,FL.15
intergenic I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9,FL.15
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic D63D BA.5.1.10,DV.7.1,FL.15
intergenic S78G FL.15
intergenic A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1,FL.15
intergenic T135I BA.5.6,FL.15
intergenic L139L FL.15
intergenic A155S FL.15
intergenic L161F BA.5,BQ.1.1.8,EG.5.2.1,FL.15
intergenic T166I DV.7.1,FL.15
N R185C FL.15
intergenic R191H FL.15
intergenic R191R FL.15
intergenic R191R FK.1.1,FL.15.1.1
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic D225D FL.15
intergenic F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1,BF.26,EG.5.1,BA.5.6,FL.15
intergenic P302P BA.5.2.34,BA.4.1,CH.1.1.28,FL.15
intergenic A313A FL.15
intergenic R319H BF.28,FL.15
intergenic M322I FL.15
intergenic Y360Y BA.5.2.2,BA.5.2.3,BQ.1.1.8,FL.15
intergenic P383P BA.5.2.34,BE.1.1,BQ.1.13,FL.15
intergenic Q409H FL.15
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15
intergenic R20X FL.15
ORF10 R20X FL.15
intergenic L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.6,FL.15
intergenic g.T29710A FL.15
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15
intergenic g.C29769T DV.7.1,BA.5.2.20,BF.26,FL.15
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic g.CGTCC-25_-21TGTCA FY.3.1
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic H374H BA.5.1.10,FY.3.1
ORF1a T568K / NSP2
intergenic T568K FY.3.1
intergenic E750K FY.3.1
intergenic E755E FY.3.1
intergenic V757V BA.5.2.34,BF.26,FY.3.1
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic D930E FY.3.1
intergenic H1141H FY.3.1
intergenic P1220S FY.3.1
ORF1a D1282Y / NSP3
intergenic D1282Y FY.3.1
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
ORF1a D1624D / NSP3
intergenic D1624D FY.3.1
intergenic N1749N BA.5.2.2,BF.28,BF.10,BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BA.5.6,FY.3.1
intergenic T1760I BA.5.1.2,GA.4.1,FY.3.1
intergenic P1921L FY.3.1
intergenic I1990V FY.3.1
ORF1a E2031A / NSP3
intergenic E2031A BA.5.2.20,FY.3.1
intergenic T2154I BA.4.6,FY.3.1
intergenic D2299N FY.3.1
ORF1a F2314S / NSP3
intergenic F2314S FY.3.1
intergenic D2693D BA.5.1.30,FY.3.1
intergenic P2739L FY.3.1
intergenic I2806I BA.5.1.24,FY.3.1
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
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intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
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intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
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intergenic A6192S FY.3.1
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
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intergenic S6549Y FY.3.1
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intergenic I6758T FY.3.1
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intergenic Q115Q GA.4.1,FY.3.1
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intergenic H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1
intergenic H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic Y200C FY.3.1
intergenic K206K FY.3.1
intergenic I210T FY.3.1
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic L244_H245delinsF FY.3.1
intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic R403K BA.2.86.1,BA.5,DV.7.1,EG.10.1,EG.7,FY.3.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic Q493L EG.5.1.4,FY.3.1
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intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.5.2.3,FY.3.1
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intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
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intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
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intergenic A33S FY.3.1
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intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic P71L FL.1.5,EG.5.1.4,EU.1.1,FY.3.1
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intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic T135I BA.5.6,FL.15,FY.3.1
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1
intergenic g.C-8T BF.28,FY.3.1
intergenic g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1
intergenic g.C29708T BA.5.2.20,FL.8,FY.3.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic G132S FL.25
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25
intergenic D223D FL.25
ORF1a K247N / NSP2
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intergenic A354V FL.25
intergenic G400S EG.5.1.4,FL.15,FL.25
intergenic Q455K FL.25
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intergenic G604S FL.25
intergenic T677I FL.25
intergenic L747F FL.25
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intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic P943P FL.25
intergenic S1150S FL.25
intergenic K1233T FL.25
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intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic L1438L BA.1.14,BA.5.2.2,BA.5.1.30,BA.4.6,FL.2.3,FL.25
intergenic S1510F FL.25
intergenic N1578N EG.5.1.6,FL.25
intergenic V1584V FL.25
intergenic G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25
intergenic S2352S FL.25
intergenic R2985R BF.9,FL.25
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic I3145T FL.25
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intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic A3333V FL.25
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
ORF1a Q3569Q / NSP5
intergenic Q3569Q FL.25
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25
intergenic T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25
intergenic A4194T FL.25
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
ORF1b V4423V / NSP12
intergenic V4423V FL.25
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic S5041L FL.25
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic A5189A FL.25
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic L5283L BA.4,BA.4.1,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.25
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic F5823F BA.4,EU.1.1,FL.25
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic L6099F FL.25
intergenic P6128S BQ.1.1.8,FL.25
intergenic H6208H BA.5.5,FL.10.1,FL.25
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic A6544V FD.1.1,FL.25
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic K6711K EG.7,FL.25
intergenic S6739L BA.5.1.10,BF.28,FL.25
intergenic A6919V FL.25
intergenic K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.5.2.1,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.1.5.2,FK.1.1,FY.3.1,FL.25
intergenic L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic D80D BA.5.1.1,FL.25
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intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25
intergenic S151N FL.25
intergenic F157S EU.1.1,FL.25
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
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intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic STP477NKH FL.25
S STP477NKH FL.25
intergenic E484A FL.25
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intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
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intergenic A623A FL.25
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intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic L53F BA.5.2.20,FL.25
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic A99A FL.25
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10,BF.20,BA.5.1.2,FK.1.1,FD.1.1,FL.25
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic F22_D30del BA.5.1.24,FL.25
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic L9L FL.25
intergenic A13T EG.5.1,FL.25
intergenic L116L BA.5.1.24,BA.5,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.25
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic H37L FL.1.5.2,FL.25
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic P85S FD.1.1,FL.25
intergenic P85L FL.25
intergenic N89D FL.25
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
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intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25
intergenic L331F FL.25
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intergenic g.A-24C FL.25
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25
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intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
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intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
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intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic A1397A BA.2.12,BA.5,DV.7.1,BA.5.5,FL.15,FU.1
intergenic V1453I FU.1
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intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic L3092L BA.4,FU.1
intergenic K3192R FU.1
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic L3290L BA.1.15,FU.1
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic V3367I FU.1
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
ORF1a L3591I / NSP6
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1
intergenic T3646T FU.1
intergenic Y3654Y FU.1
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intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
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intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
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intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
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intergenic E180V FU.1
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
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intergenic T274I FU.1
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
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intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic T547I BA.5.2.3,BA.5,BF.28,FL.2.3,FU.1
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intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic N703Y FU.1
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic R815R FU.1
S R815R FU.1
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic K1086R FU.1
intergenic E1092E FU.1
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic V29V FU.1
intergenic Q57H BF.9,BF.10,EG.5.1.4,FU.1
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic C130C BQ.1.1.8,FU.1
intergenic D173N FU.1
intergenic T176I BA.1.17,BF.26,FL.15.1.1,FU.1
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic T229I FL.15,FU.1
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic P71S FU.1
intergenic S4F FU.1
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic A69V BA.2.12,FU.1
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic L145L BA.5.1.30,FU.1
intergenic R200R FU.1
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic g.C-1T BA.5,BA.5.5,FU.1
intergenic L96F DV.7.1.2,FU.1
ORF7a C113Y FU.1
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic L22I FU.1
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic T11I FU.1
ORF8 L95V FU.1
intergenic L118V FU.1
intergenic F120fs EG.5.1.4,EG.5.1,FU.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic Q58Q FU.1
intergenic H145H BA.5,FU.1
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic S235S BF.9,FU.1
intergenic R276R FU.1
intergenic Y360Y BA.5.2.2,BA.5.2.3,BQ.1.1.8,FL.15,FU.1
intergenic D371D FU.1
intergenic T379I BF.28,FU.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic P10T FU.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic Y359Y FY.4.1.1
intergenic R560H EG.5.1.8,FY.4.1.1
intergenic E832K FY.4.1.1
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
ORF1a C2041Y / NSP3
intergenic C2041Y FY.4.1.1
intergenic V2703V FY.4.1.1
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic F3271F BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,EG.6.1,FY.4.1.1
intergenic S3273S BA.5.1.2,FY.4.1.1
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic T4654A FY.4.1.1
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic T5321A FY.4.1.1
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intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic Y6160Y BF.28,FL.1.5,BA.5.6,FY.4.1.1
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic P6722S FL.14,FY.4.1.1
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,EG.5.1.8,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1
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intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic Y200C FY.3.1,FY.4.1.1
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intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
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intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
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intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic Y451H FY.4.1.1
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic S494P EG.10.1,EG.5.1,EG.5.1.6,FY.4.1.1
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
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intergenic S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4,GA.4.1,FY.4.1.1
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic D1139H FY.4.1.1
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic P42L FY.4.1.1
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic W131L FY.4.1.1
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic D265D FY.4.1.1
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic H125R FY.4.1.1
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic P46S FL.8,FY.4.1.1
intergenic A152V FY.4.1.1
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic A218A FY.4.1.1
intergenic Y298H FY.4.1.1
intergenic A313A FL.15,FY.4.1.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2
intergenic V26V BA.5,FU.2
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2
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intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2
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intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2
intergenic VG445SS FU.2
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intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2
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S A1022A FU.2
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intergenic g.C-222T BA.4,BA.5,EG.7,BA.2.3
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intergenic g.G-47A BF.10,BA.4.6,BA.2.3
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3
intergenic M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3
intergenic L92L BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.2.3
intergenic S135R BA.2.3
intergenic L140L CH.1.1.28,BQ.1.13,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3
intergenic G146G FD.1.1,BA.2.3
intergenic I222V BA.5.1.1,FL.10.1,BA.2.3
intergenic S302F BA.5.1.24,BF.9,FU.1,BA.2.3
intergenic A307V BA.2.3
intergenic S330L BA.2.3
intergenic G392G FL.14,FL.8,BA.2.3
intergenic I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,BA.2.3
intergenic G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3
intergenic L631F BA.2.3
ORF1a S674R / NSP2
intergenic S674R BA.2.3
intergenic A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3
intergenic A735A BA.1.14,BA.1.18,BA.1.15,FL.1.5,BA.2.3
intergenic I793I FL.25,BA.2.3
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic A872V BA.2.3
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic T1000I BA.2.3
intergenic T1168I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.1.15,EG.5.2.1,FU.2,BA.2.3
intergenic D1228Y BA.2.3
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic Y1425Y BA.5.5,BA.2.3
intergenic G1451G BA.2.3
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intergenic E1801K BA.2.3
ORF1a K2029R / NSP3
intergenic K2029R BA.2.3
intergenic D2043G BA.2.3
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intergenic H2125Y BA.4.6,EG.5.1,BA.2.3
intergenic T2300T EG.5.1,FU.2,BA.2.3
intergenic P2376P BA.5,BA.2.3
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intergenic S2535L BF.28,BQ.1.2.3,FU.2,BA.2.3
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intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
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intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic A3235V BA.2.3
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intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
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ORF1a V3510I / NSP5
intergenic V3510I BA.2.3
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3
intergenic D3668D BA.2.3
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic A3730A BA.2.12,EG.6.1,GA.4.1,BA.2.3
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intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic S55F BA.5.1.2,EG.5.1,BA.2.3
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic Y71Y EG.5.1.4,FL.15,BA.2.3
intergenic L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic L120L FL.10.1,FL.15,BA.2.3
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic Q51Q BA.2.3
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic T39T BA.2.3
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intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic E64G EG.5.1.4,BA.2.3
intergenic H112H BA.5.1.30,BA.2.3
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intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic G5E BA.5,BA.2.3
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic A50A BF.26,BA.2.3
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intergenic D144N BQ.1.1.8,BA.2.3
intergenic RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3
intergenic H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.5,EG.5.1.4,BA.2.3
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3
intergenic g.C29769T DV.7.1,BA.5.2.20,BF.26,FL.15,BA.2.3
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic g.G-1A GJ.1
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intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1
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intergenic S428S GJ.1
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intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
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intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
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intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
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intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic V6617V GJ.1
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1
intergenic H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1
intergenic KQ182NE GJ.1
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1
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S T307S BA.5.1.30,GJ.1.2
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intergenic G339Y GJ.1
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intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
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intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
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intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1
intergenic E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1,FL.25,FU.2,GJ.1
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic A1078A GJ.1
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1
intergenic R30H BA.5.1.24,GJ.1
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1
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intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
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intergenic A13V GJ.1
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1
intergenic E106Q GJ.1
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intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1
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intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1
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intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic Q3332R GK.2.1
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic L3641S GK.2.1
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
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intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
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intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1
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intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
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intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
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intergenic H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1
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intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1
intergenic L216F BA.2.86.1,EG.5.1.3,GK.2.1
intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1
intergenic E281G GK.2.1
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1
intergenic N354N BA.5,EG.5.2.1,EG.6.1,BA.5.6,GK.2.1
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
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intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1
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intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1
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intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
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intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
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intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
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intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1
intergenic S68F GK.2.1
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic A8E GK.2.1
intergenic T28I BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,FD.1.1,GK.2.1
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic L25F GK.2.1
intergenic L34L BA.5.2.34,GK.2.1
intergenic E39X GK.2.1
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1
intergenic T11I FU.1,GK.2.1
intergenic Q27X GK.2.1
intergenic P38S BA.5.5,FL.1.5,GK.2.1
intergenic F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1,BA.2.3,GK.2.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic G34G GK.2.1
intergenic A50A BF.26,BA.2.3,GK.2.1
intergenic A152S BA.5.1.10,BA.5.1.2,GK.2.1
intergenic RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic g.G29688T BF.10,GK.2.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1
intergenic g.A-96G FL.20
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20
intergenic V28I FL.20
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20
intergenic I114T BA.4.6,FL.20
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20
intergenic G192D EG.6.1,FL.20
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intergenic A541T FL.20
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intergenic Y799Y FL.8,FL.20
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20
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intergenic L6420L BA.5,BA.5.1.30,BQ.1.2.3,EG.5.1,FL.10.1,FU.2,FL.20
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intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20
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intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20
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intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20
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intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
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intergenic S5398P GJ.1.2.6
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intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic L6034L BA.2.3,GJ.1.2.6
intergenic V6161V BA.4.6,GJ.1.2.6
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic Y6540Y BQ.1.13,BF.10,FD.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic T6572T GJ.1.2.6
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic L6961L GJ.1.2.6
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intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
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intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
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intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6
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intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
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intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic V1230V GJ.1.2.6
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic T175I BA.5.1.30,BF.26,EG.5.2.1,GJ.1.2.6
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic A13V GJ.1,GJ.1.2.6
intergenic P84S BA.2.12,GJ.1.2.6
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic E106Q GJ.1,GJ.1.2.6
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic g.G29706T FL.1.5,GJ.1,GJ.1.2.6
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6
intergenic g.C-63T BA.5.1.10,BA.4,EG.10.1,FL.1.5,EG.6.1,FL.15,GK.1.3
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3
intergenic R287G GK.1.3
intergenic L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.6.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3
ORF1a E633A / NSP2
intergenic E633A GK.1.3
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic V879V BA.2.12,BA.1.15,EG.7,GK.1.3
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
ORF1a A1049A / NSP3
intergenic A1049A GK.1.3
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
ORF1a L1627P / NSP3
intergenic L1627P GK.1.3
intergenic D1671N GK.1.3
ORF1a N2023S / NSP3
intergenic N2023S GK.1.3
intergenic A2249V BF.28,EG.5.1,GK.1.3
intergenic T2283I BA.5.2.20,DV.7.1.2,BA.1.15,EG.5.1.4,FL.2.3,FD.1.1,GK.1.3
intergenic S2433S BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3
intergenic A2584V BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,EG.7,EG.6.1,FL.10.1,GK.1.3
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intergenic D2824D GK.2.1,GK.1.3
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic A3610A GK.1.3
intergenic 3676del GK.1.3
intergenic F3677del GK.1.3
intergenic S3675del GK.1.3
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intergenic L3914I GK.1.3
intergenic P3952S BA.5.6,GK.1.3
intergenic A4068S GK.2.1,GK.1.3
intergenic T4090I GK.1.3
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3
intergenic G4380G BA.5.1.24,GK.1.3
intergenic R4387R BA.4,BA.5.1.30,BF.28,FL.15,GK.1.3
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
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intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic T573I EG.5.1,GK.1.3
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intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic I692I BA.5.1.10,BA.4.6,FL.14,EG.6.1,FU.2,GK.1.3
intergenic S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4,GA.4.1,FY.4.1.1,FL.20,GK.1.3
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic D936D BA.5.1.2,GK.1.3
intergenic S937S DV.7.1.2,EG.5.1.6,GK.1.3
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic S1161S GK.2.1,GK.1.3
intergenic K1266R GK.1.3
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic T89I BF.26,EG.5.1.8,FL.1.5,EG.5.1.4,FD.1.1,GK.1.3
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic F4F BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,GK.1.3
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic A63T GK.1.3
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic P45L BA.2.3,GK.1.3
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3
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intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3
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intergenic N6526N BQ.1
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intergenic Q7036Y BQ.1
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intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
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intergenic V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1
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intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
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intergenic A419A BQ.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
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intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
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intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
intergenic F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BA.4.6,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
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intergenic T547K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BQ.1.1.8,BA.1.15
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
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intergenic E619E BQ.1
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
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intergenic S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4,GA.4.1,FY.4.1.1,FL.20,GK.1.3
intergenic S708S BQ.1
S S708S BQ.1
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
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intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
intergenic L984L BQ.1
S L984L BQ.1
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intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
intergenic T1238A BQ.1
S T1238A BQ.1
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intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
intergenic R68I BQ.1
intergenic L71L BA.5,BQ.1.13,BA.5.6
intergenic L85F BQ.1
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ORF3a F114V BQ.1
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ORF3a H150R BE.1.1,BQ.1.2.3
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ORF3a E194G BA.5,BQ.1
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ORF3a E194D BQ.1
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intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
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intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1
intergenic A104V BA.2.86.1,BE.1.1,BQ.1
intergenic L120L FL.10.1,FL.15,BA.2.3,BQ.1
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intergenic F6S FY.3.1,BQ.1
intergenic L7S BQ.1
intergenic A13A BQ.1
intergenic C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1
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intergenic I2S BQ.1
intergenic A15S BA.2.12,EG.5.1.4,BQ.1
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
intergenic g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1
intergenic P36S BA.5.1.10,BQ.1.2.3
intergenic P38S BA.5.5,FL.1.5,GK.2.1,GK.1.3,BQ.1
intergenic V62V BA.5.2.20,BE.1.1,EG.5.1.4,EU.1.1,FL.20,BQ.1
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intergenic I76I BQ.1
intergenic FI120VL BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BQ.1.13,EG.6.1,BA.5.6
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
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intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1
intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1
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intergenic K3577K GK.1
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intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1
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intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1
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intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1
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intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1
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intergenic S1161S GK.2.1,GK.1.3,GK.1
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intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1
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intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1
intergenic S23T GK.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1
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intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1
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N P344P GK.1
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intergenic P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,GK.1
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intergenic A876S GK.3.1
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intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic G381R GK.3.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1
intergenic LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic A475V FL.15.1.1,GK.1,GK.3.1
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic L753L GK.3.1
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic P809S GK.3.1
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic S1021S GK.3.1
intergenic G1085V GK.3.1
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic S1161S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1
intergenic Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BF.28,FL.1.5,GK.3.1
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1
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intergenic I63T FK.1.1,GK.3.1
intergenic T64T FK.1.1,GK.3.1
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intergenic T217T GK.3.1
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1
intergenic Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1
intergenic D61L GK.3.1
intergenic D61_X62del GK.3.1
intergenic T11T GK.3.1
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1
intergenic P38S BA.5.5,FL.1.5,GK.2.1,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic H40Q EG.5.1,GK.3.1
intergenic I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9,FL.15,FU.2,GK.1,GK.3.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic Q9Q BF.26,GK.3.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic S184F GK.3.1
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic T334T BE.1.1,GK.3.1
intergenic R385I GK.3.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic Q418L GK.3.1
intergenic g.C29719T GK.3.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.6.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic A876S GK.3.1,GK.3.2
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic G1308G GK.3.2
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic S2433S BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic D2824D GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic A4068S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic T6500I GK.3.2
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
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intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic T572I FD.1.1,GK.3.2
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic S1161S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3,GK.3.2
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic P38S BA.5.5,FL.1.5,GK.2.1,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2
intergenic g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1,GK.3.2
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic L92L BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.2.3,GW.5
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic S302F BA.5.1.24,BF.9,FU.1,BA.2.3,GW.5
intergenic V597I GW.5
intergenic I694V GW.5
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
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intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
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intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
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intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic S3259S GW.5
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1,BQ.1,GW.5
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intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
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intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
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intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic I5475V GW.5
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
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intergenic V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
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intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic G142fs EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EU.1.1,EG.6.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.4.1.1,FU.2,GW.5
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intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic A475V FL.15.1.1,GK.1,GK.3.1,GW.5
intergenic ST477NI GW.5
intergenic N481K FL.1.5.2,GW.5
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic E554K BA.2.86.1,FL.10.1,GA.4.1,FL.25,FU.2,GJ.1,GK.1,GW.5
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic S735L BQ.1.1.8,GW.5
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic N824N BA.4.1,GW.5
intergenic L828L GW.5
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic M1050I GW.5
intergenic H1101H EG.10.1,EG.7,GK.1,GW.5
intergenic G1124A GW.5
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5
intergenic G100S GW.5
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic L29F BA.5.2.20,GW.5
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic F30C GW.5
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic L60L GW.5
intergenic V62V BA.5.2.20,BE.1.1,EG.5.1.4,EU.1.1,FL.20,BQ.1,GW.5
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic L56L BA.4.1,BA.5.1.30,FL.20.2,GW.5
intergenic P80S GW.5
intergenic D82D BA.5,DV.7.1,GW.5
intergenic G96D GW.5
intergenic K100Q GW.5
intergenic N150N GW.5
N T165T GJ.1.2,GW.5
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic T379I BF.28,FU.1,GW.5
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic A419A BF.20,EG.5.1.4,GW.5
intergenic g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,FY.3.1,GK.3.2,GW.5
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5
intergenic g.G29810T GW.5
intergenic g.T-65C GS.3
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic T403I BA.5.1.10,BQ.1,GK.3.1,GS.3
intergenic I463I GS.3
intergenic S505S BA.4,BA.5.1.30,DV.7.1.2,GS.3
intergenic G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3
intergenic L790L GS.3
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic S1106N BQ.1.2.3,GK.2.1,GS.3
intergenic D1258D FL.1.5,GS.3
intergenic L1296L GS.3
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic 1324 GS.3
intergenic D1323D GS.3
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic L1523L BA.5.2.34,GS.3
intergenic D1532N GS.3
intergenic L1627L BA.5.1.30,FU.1,FU.2,GS.3
intergenic Q1759R GS.3
intergenic G2091S GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3
intergenic T2093I GS.3
intergenic V2866M GS.3
intergenic A2891A GS.3
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic L3338L BA.5.5,EG.5.1,FD.1.1,BQ.1,GS.3
intergenic P3371S BF.41,GS.3
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic L3588F BA.5.6,GW.5,GS.3
intergenic M3616T GS.3
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic A4276S GS.3
intergenic F4448F GS.3
intergenic T4668T BA.1.15,GS.3
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic T4794T GS.3
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic I5239I EU.1.1,GS.3
intergenic D5425D GS.3
intergenic Y5444Y BA.5.1.10,GS.3
intergenic Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic E6002D GS.3
intergenic N6333N FL.8,GS.3
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic F6459L GS.3
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic F6731L GS.3
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic R190S BQ.1.2.3,GS.3
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic D253G GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic I818I BA.5.2.20,GS.3
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic F28F BF.28,GS.3
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic A13V GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3
intergenic K72N FK.1.1,GS.3
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic F66F BA.5.2.20,GS.3
intergenic N154Y GS.3
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3
intergenic g.G29706T FL.1.5,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic G82D GS.4
intergenic L107L FD.1.1,GS.4
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic A181T GS.4
intergenic D203G GS.4
intergenic K322R GS.4
intergenic S443S BA.5,EU.1.1,FU.2,GS.4
intergenic V627F BA.5,BA.4.1,GS.4
intergenic K684K EG.5.1,GS.4
intergenic L686L GS.4
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic P892L GK.2.1,GS.4
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6,GK.2.1,GK.3.1,GS.4
intergenic D954Y GS.4
intergenic S1106S EG.10.1,GS.4
intergenic V1173V GS.4
intergenic I1203T BA.4.6,GS.4
intergenic D1266D GS.4
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic D1323D BA.5.1.24,FL.10.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.4
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic R1467K GS.4
intergenic D1585D BE.1.1,GS.4
intergenic H1652H BQ.1.1.8,GS.4
intergenic T1788M BA.4.6,FL.20.2,GS.4
intergenic S2024L BA.5.2.2,FL.8,FL.20,GS.4
intergenic L2028L GS.4
intergenic G2091S GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4
intergenic T2124I BQ.1.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,FU.2,GS.4
intergenic V2252V GS.4
intergenic A2345V GS.4
intergenic A2557A BA.1.14,GS.4
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic D3222D BA.5.1.24,BF.26,FU.2,GS.4
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic Y3300Y EG.5.1,GS.4
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic F3397F EG.5.1,FL.20,GS.4
intergenic L3591L DV.7.1.2,GS.4
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic R3756R GS.4
intergenic G3757S BA.4.1,GS.4
intergenic F3797F GS.4
intergenic D4166A GS.4
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic T4355I BA.5,GK.3.1,GS.4
intergenic R4565H GS.4
intergenic T4640T BA.5.1.1,GS.4
intergenic T4668T BA.1.15,GS.3,GS.4
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic V4797F GS.4
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic T5563I GS.4
intergenic I5582I GS.4
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic L5762L BA.5.1.10,BA.5.1.30,BA.4.6,GS.4
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic Y6160Y BF.28,FL.1.5,BA.5.6,FY.4.1.1,GS.4
intergenic A6192A GS.4
intergenic V6241I EG.5.1,FD.1.1,GS.4
intergenic R6316R GS.4
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic D6374G GS.4
intergenic Y6540Y BQ.1.13,BF.10,FD.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GK.3.1,GS.4
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic A6997A BA.4,BA.5,BA.5.1.1,EG.10.1,FY.3.1,GS.4
intergenic L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BA.5.5,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,EG.6.1,FD.1.1,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GS.4
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic Y28Y BQ.1,GS.4
intergenic L56L GS.4
intergenic T76I BA.5.5,FL.14,GS.4
intergenic V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4
intergenic H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic L216L GS.4
intergenic D253G GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic S735S EG.7,GS.4
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic T827I GS.4
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic Y1110Y FD.1.1,GS.4
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic E1262E GS.4
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic A103A GS.4
intergenic G172C BQ.1.13,GS.4
intergenic T175I BA.5.1.30,BF.26,EG.5.2.1,GJ.1.2.6,GS.4
intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic V244V GS.4
intergenic S253S BA.2.12,BE.1.1,GS.4
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic L21F EG.5.1.3,GS.4
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic A104V BA.2.86.1,BE.1.1,BQ.1,GS.4
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic L29L BA.5,GS.4
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic A13V GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4
intergenic H47N BA.5,BF.28,BA.4.6,GS.4
intergenic A79A GS.4
intergenic E91D EG.5.1.3,GS.4
intergenic I110I GS.4
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic L32F BA.4,GS.4
intergenic Q91X GS.4
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic G30_S33delinsA GS.4
intergenic H145Y DV.7.1.2,GS.4
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic Q242R GS.4
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic g.GG29705GT GS.4
intergenic g.GG29705TT GS.4
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic g.CG-25_-24TA GK.2
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic G49G BA.5.1.24,GK.2
intergenic Q66Q BA.5.1.24,BF.26,GK.2.1
intergenic G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,GK.2
intergenic G98D GK.2
intergenic R124C CK.2,GK.2
intergenic A131T GK.2
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic D144D GK.2
intergenic D203D BA.5.1.24,BA.4.6,GK.2
intergenic R226G GK.2
intergenic P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.6,GK.2.1,GK.1
intergenic I475T GK.2
intergenic A540V BA.5.1.10,DV.7.1,BQ.1.13,GK.2.1
intergenic L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.6.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2
intergenic I616I BF.9,GK.2
intergenic D762D BA.5.5,GK.2.1
intergenic A776A GK.2
intergenic K798N GK.2
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic L853L GK.2.1,GK.2
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6,GK.2.1,GK.3.1,GS.4
intergenic Q990Q BF.26,GK.2
intergenic P1010T GK.2
intergenic S1106N BQ.1.2.3,GK.2.1,GS.3
intergenic R1170H GK.2
intergenic D1184D BE.1.1,BA.5.6,GK.2
intergenic N1252N GK.2
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic L1441L BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.5.1,FK.1.1,GK.1,GK.2
intergenic S1476S GK.2
intergenic S1510F FL.25,GK.2
intergenic N1540N BA.4.6,EG.7,GK.2
intergenic D1547N BA.5.2.20,GK.2.1
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intergenic T1638A GK.2
intergenic Q1757Q GK.2
intergenic P1786S BA.5.2.8,BA.5.2.20,BE.1.1,GK.2.1
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intergenic S2015S BA.2.86.1,BA.2.12,EG.5.1.3,FD.1.1,GK.2
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intergenic G2091S GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic L2117L GK.2
intergenic F2172F BQ.1.1.8,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,GK.2.1,GW.5
intergenic P2221S EG.6.1,GK.2
intergenic I2231V FL.10.1,GK.2
intergenic T2274I BA.5.1.1,EG.6.1,GK.2
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intergenic F2338L GK.2
intergenic I2385I BA.4,DV.7.1,FL.10.1,GK.2
intergenic S2433S BA.5.6,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2
intergenic D2492A GK.2
intergenic S2500S GK.2
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intergenic T2978T GK.2
intergenic F2979F GK.2
intergenic V3005I FU.1,GK.2.1
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic I3126I GK.2
intergenic L3198L BA.2.12,BA.5.2.8,FU.2,GK.2
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic N3243N GK.2
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic L3313L FD.1.1,GK.2
intergenic K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.10,BQ.1.2.3,BA.2.3,GK.2
intergenic P3359P GK.2
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic F3397F EG.5.1,FL.20,GS.4,GK.2
intergenic L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1,BQ.1,GW.5,GK.2
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2
ORF1a H3631H / NSP6
intergenic H3631H BQ.1.1.8,GJ.1.2.6,GK.2
intergenic T3646T FU.1,GK.2
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic M3752I EG.5.1.8,GK.2
intergenic N3896N BA.5.1.1,GK.2
intergenic A4068S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2
intergenic Q4151R BA.5.2.8,GK.2
intergenic L4185L EG.7,EG.5.1,GK.2
intergenic D4190D GK.2
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic A4357A DV.7.1.2,EG.5.1,GK.2
intergenic D4384D EG.5.1,FL.15,GK.2.1
intergenic T4640T BA.5.1.1,GS.4,GK.2
intergenic T4711I GK.2
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic N4748N GK.2
intergenic G4824G GK.2
intergenic I4886I BA.4.6,GK.2
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
ORF1b S5164C / NSP12
intergenic T5195T GK.2
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic Q5324Q GK.2
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2
intergenic P5377S BA.4,BA.5.1.24,BF.28,EG.5.1,FL.15,GK.2.1
intergenic T5435I EG.5.1.4,FU.2,GK.2
intergenic S5588S GK.2
intergenic A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2
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intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2
intergenic N481D GK.2
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic S494P EG.10.1,EG.5.1,EG.5.1.6,FY.4.1.1,GK.2
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic V511I GK.2.1,GK.2
intergenic N606N DV.7.1.2,EG.5.1.6,GK.2
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic F643del GK.2
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
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intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
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intergenic E55D GK.2
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic g.G-4T GK.2
ORF7a A8E GK.2
intergenic T28I BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1
intergenic Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9,BA.5.2.20,BQ.1.13,CK.2,EG.6.1,GK.2
intergenic Q90Q GK.2
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic L34L BA.5.2.34,GK.2.1
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2
intergenic T11I FU.1,GK.2.1
intergenic Y31H GK.2
intergenic P38S BA.5.5,FL.1.5,GK.2.1,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2
intergenic C90Y BE.1.1,EG.6.1,GK.2
intergenic C102F EG.7,GK.2
intergenic C102Y GK.2
intergenic F120F BA.5.1.2,BF.26,FL.1.5,EU.1.1,BA.2.3,GK.2.1,GK.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic P20P BA.5.5,GK.2
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2
intergenic A50A BF.26,BA.2.3,GK.2.1
intergenic F66F BA.5.2.20,GS.3,GK.2
intergenic A90S GK.2
intergenic A152S BA.5.1.10,BA.5.1.2,GK.2.1
intergenic T166I DV.7.1,FL.15,GK.2
intergenic P168S GK.2
intergenic R195K GK.2
intergenic RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic A208A GK.2
intergenic T271I BA.5.1.10,EU.1.1,GK.2
intergenic P309P BA.4.1,BA.5.2.20,BF.10,BA.4.6,BQ.1,GK.2
intergenic L353L BA.5.2.34,GK.2
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic Q418L GK.3.1,GK.2
intergenic g.C-12T GK.2
intergenic g.G29688T BF.10,GK.2.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic S74S CH.1.1.28,GZ.1
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic S302F BA.5.1.24,BF.9,FU.1,BA.2.3,GW.5,GZ.1
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic N869S FK.1.1,GZ.1
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic S994N GZ.1
intergenic T1055I CH.1.1.28,GZ.1
intergenic N1109N GZ.1
ORF1a K1194K / NSP3
intergenic K1194K GZ.1
intergenic V1211L GZ.1
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic D1323D BA.5.1.24,FL.10.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.4,GZ.1
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
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intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
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intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic N3801N BA.5.2.34,GZ.1
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intergenic T4217I BA.5.1.2,GZ.1
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intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic H5488Y BF.26,EG.5.1,BA.5.6,GZ.1
ORF1b T5675A / NSP13
intergenic T5675A GZ.1
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic M6166T GZ.1
ORF1b P6267P / NSP14
intergenic P6267P BA.4.6,GZ.1
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic I6537I BE.1.1,GZ.1
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
ORF1b D6762Y / NSP15
intergenic D6762Y GZ.1
intergenic T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1
intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic QG183EV GZ.1
intergenic F186L GK.1,GZ.1
intergenic D198G GZ.1
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic D253G GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1
intergenic L368I GZ.1
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic ST477NQ GZ.1
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic N501Y GZ.1
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic P521S EG.5.1.4,EU.1.1,GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic T768S GZ.1
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
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intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
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intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
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intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic A13V GJ.1,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GZ.1
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intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic N27K GZ.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1
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intergenic A273S BA.5.2.34,GZ.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic g.C-13A BF.26,GZ.1
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intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic R171R HK.7
intergenic P193S HK.7
intergenic A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic Q990L HK.7
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic H1500R DV.7.1,HK.7
intergenic R1701R HK.7
intergenic G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7
intergenic T1908R HK.7
intergenic F1960F FU.2,HK.7
intergenic S2015N FK.1.1,HK.7
intergenic H2092H GK.2.1,HK.7
intergenic L2371F HK.7
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic Q3536L HK.7
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7
intergenic T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,BA.2.3,FL.20,GK.1,HK.7
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic G4222S HK.7
intergenic D4455N EG.5.1,HK.7
intergenic R4510C HK.7
intergenic E4669V HK.7
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic T5198I HK.7
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7
intergenic T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7
intergenic Y5593H HK.7
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic P6076P BA.2.86.1,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic V6607I HK.7
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intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
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intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic N148T FL.15,FU.2,HK.7
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7
intergenic F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic P384P HK.7
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7
intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic I692I BA.5.1.10,BA.4.6,FL.14,EG.6.1,FU.2,GK.1.3,HK.7
intergenic N703K HK.7
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic T961T HK.7
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intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic I161I BA.5.2.3,BF.10,FD.1.1,HK.7
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
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intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7
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intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7
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intergenic PR13LC HK.7
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1,BF.26,EG.5.1,BA.5.6,FL.15,HK.7
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7
intergenic Y26Y HK.7
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7
intergenic g.C-166T BA.5.2.20,BQ.1.2.3,GK.1.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic E37D GK.1.1
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic S74S CH.1.1.28,GZ.1,GK.1.1
intergenic G82_M85delinsV BF.20,GK.1.1
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1
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intergenic K492Q GK.1.1
intergenic G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1
intergenic L570L BA.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.6.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1
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intergenic G645S GK.1.1
intergenic Q663Q GK.1.1
intergenic L766L GK.1.1
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic P943S GK.1.1
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intergenic L1243L GK.1.1
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
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intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
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intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2,BF.9,BE.1.1,EG.5.1,FL.20,GK.3.1,GK.1.1
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic A3357A BA.4,BQ.1.13,GK.1.1
intergenic R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BA.4.6,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1
intergenic A3379V GK.1.1
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1
intergenic R3662C GK.1.1
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic L3754L GK.1.1
intergenic L3781I GK.1.1
intergenic E3932G GK.1.1
intergenic T3940T CK.2,BA.4.6,BQ.1,GK.1.1
intergenic L4059L GK.1.1
intergenic I4061T GK.1.1
intergenic A4068S GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1
intergenic T4158N GK.1.1
intergenic T4175A FU.1,GK.1.1
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic L4779L BA.4,BE.1.1,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.4,FY.3.1,GK.1.1
intergenic F4811F BA.2.12,GK.1.1
intergenic V4865I GK.1.1
intergenic D4891D FL.15,GK.1.1
intergenic L4919L GK.1.1
intergenic A4972A BA.4,BQ.1.13,GK.1.1
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic N5105N GK.1.1
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic S5160N GK.1.1
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic I5229I FL.15,GK.1.1
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1
intergenic A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1
intergenic H5635H GK.1.1
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intergenic V5808F GK.1.1
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic L5932L BA.5.2.34,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.2.3,GJ.1,GK.1.1
intergenic T5956I BA.5.2.2,BA.5,FD.1.1,GK.1.1
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intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1
intergenic STP477NKL GK.1.1
intergenic EGF484AGP EG.5.1.8,EG.7,GK.1.1
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic F559F GK.1.1
intergenic T573I EG.5.1,GK.1.3,GK.1.1
intergenic E583D GK.1.1
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic A626S GK.1.1
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic S704L BA.2.12,BQ.1.13,EG.5.2.1,EG.5.1.4,GA.4.1,FY.4.1.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.1.1
intergenic P728P BF.26,GK.1.1
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic N824N BA.4.1,GW.5,GK.1.1
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intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic G1124V BF.9,GK.1.1
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intergenic Y71Y EG.5.1.4,FL.15,BA.2.3,GK.1.1
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intergenic Y179Y BA.5.2.2,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FK.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1
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intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic D22A GK.1.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic F53F BE.1.1,EG.5.1,GK.1.1
intergenic F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,DV.7.1.2,EG.5.1,BA.5.6,GK.1.1
intergenic P117P BA.2.12,GK.1.1
intergenic D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1,GK.1.1
intergenic A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1,FL.15,BA.2.3,GK.1.1
intergenic P162L GK.1.1
intergenic A173V BA.5.2.20,BA.4.6,EG.7,EG.5.1.4,EU.1.1,GK.1.1
intergenic Q181K GK.1.1
intergenic T198I GK.1.1
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic G287G FL.10.1,EG.5.1.6,GK.1.1
intergenic T379T GK.1.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1
intergenic C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.2.20,BF.28,BQ.1.13,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,FU.2,BQ.1,GK.1.1
intergenic g.G29706A BA.5.1.2,GK.1.1
intergenic g.CACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29730CACC GK.1.1
intergenic g.CACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29730TACC GK.1.1
intergenic g.C-160T BA.5.1.24,BE.1.1,BA.1.15,EG.5.1.3,GY.5
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic M297I GY.5
intergenic G327D GY.5
intergenic S443F BA.5.2.2,BF.41,BA.5.2.20,FL.20,GY.5
intergenic E444E GY.5
intergenic L450F EG.7,GY.5
intergenic V606I BF.9,GY.5
intergenic G715G BE.1.1,GY.5
ORF1a A735S / NSP2
intergenic A735S GY.5
intergenic I740I BA.2.12,BA.5,CK.2,BA.4.6,FU.2,GK.1,GY.5
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic E913D GY.5
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic P926H GY.5
intergenic S944L BF.41,BA.4.6,EG.5.1.4,EG.5.1.6,GK.2.1,GK.3.1,GS.4,GY.5
ORF1a D954D / NSP3
intergenic D954D GY.5
intergenic E1142K GY.5
intergenic R1170R BE.1.1,GY.5
ORF1a S1195N / NSP3
intergenic S1195N GY.5
intergenic E1205D GY.5
intergenic E1209E GY.5
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
ORF1a T1474T / NSP3
intergenic T1474T GY.5
intergenic T1496I GY.5
intergenic I1505T GY.5
intergenic D1513N GY.5
intergenic R1628C BF.26,GK.3.1,GK.2,GY.5
intergenic Q1758Q BQ.1.1.8,GY.5
intergenic P1786L BA.5,GY.5
intergenic T1822I BA.1.18,BA.4.1,FU.1,BQ.1,GY.5
intergenic I2010V FL.20.2,FL.20,GY.5
ORF1a M2036L / NSP3
intergenic M2036L GY.5
intergenic V2061F GY.5
intergenic H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5
ORF1a A2097T / NSP3
intergenic A2097T GY.5
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intergenic S2312L EG.7,GY.5
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intergenic D2592N GY.5
ORF1a A2704A / NSP3
intergenic A2704A GY.5
intergenic G2871G BA.5.1.2,GY.5
intergenic F2884F BF.28,BA.5.5,FL.8,GY.5
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intergenic V2975V EG.5.2.1,GW.5,GY.5
intergenic S2981S EG.10.1,FL.15.1.1,GY.5
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
ORF1a A3049V / NSP4
intergenic A3049V GY.5
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic V3056A GY.5
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic D3355D FD.1.1,GY.5
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic A3523A EG.5.1.4,FD.1.1,FL.20.2,FL.20,GY.5
intergenic T3579I EG.5.1,EU.1.1,GY.5
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5
intergenic A3610I GY.5
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic L3829F GY.5
intergenic D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5
intergenic 4157 GY.5
intergenic A4155A FU.1,FU.2,GY.5
intergenic T4202T BQ.1.1.8,GY.5
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic N4358N BA.2.86.1,BF.26,BA.5.5,EU.1.1,GY.5
intergenic S4470S GY.5
intergenic A4577V BA.5.1.30,GY.5
intergenic V4625I GY.5
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic V4864V FU.1,FU.2,GY.5
intergenic V4865F GY.5
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic L5197P GY.5
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic Y5276Y BF.9,EG.5.1.6,GY.5
intergenic L5283L BA.4,BA.4.1,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.25,GY.5
intergenic H5290H GY.5
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic S5398L GY.5
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intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic V433V GY.5
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic VG445SS FU.2,GY.5
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5
intergenic EGF484AGP EG.5.1.8,EG.7,GK.1.1,GY.5
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic P621S BA.2.86.1,GY.5
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic P1112S GY.5
S P1112S GY.5
intergenic D1139Y GY.5
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic V13L GY.5
intergenic S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1,EG.5.1.6,GK.2,HK.7,GY.5
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic Q70H GY.5
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intergenic W131C BE.1.1,FL.15,GY.5
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intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic H148Y FL.14,GY.5
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5
intergenic F59V GY.5
ORF7a F59V GY.5
intergenic D69D BA.1.14,BA.5.2.8,EG.5.1.6,GY.5
intergenic R118S GY.5
intergenic T120I BQ.1.1.8,BF.28,DV.7.1.2,GY.5
intergenic 19 EG.5.1.4,FK.1.1,GZ.1,HK.7,GY.5
intergenic L18L EG.5.1.4,GZ.1,HK.7,GY.5
intergenic X44QextX? GY.5
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic C37S GY.5
intergenic Q91X GS.4,GY.5
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5
intergenic D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BQ.1.2.3,GK.1.3,GK.1,GK.1.1,GY.5
intergenic H145Y DV.7.1.2,GS.4,GY.5
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic S206F GY.5
intergenic A208V GA.4.1,GY.5
intergenic K248K BA.5.2.8,GY.5
intergenic V270V GY.5
intergenic D288D GY.5
intergenic T325I BA.5.1.24,GY.5
intergenic D343Y GY.5
intergenic T362I BA.5.1.24,BA.4.1,DV.7.1.2,BQ.1.2.3,FU.2,GY.5
intergenic D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5
intergenic T379I BF.28,FU.1,GW.5,GY.5
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5
intergenic P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8,GK.1,GY.5
intergenic S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5
intergenic L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30,BE.1.1,BA.5.6,FL.15,GY.5
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5
intergenic g.C-160G GE.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1
intergenic L16L BA.5.1.2,GE.1
intergenic V20I GE.1
intergenic R24S GE.1
intergenic L27L BA.5.1.24,FL.1.5.2,FL.10.1,GE.1
ORF1a F31L / NSP1
intergenic F31L GE.1
intergenic V38I GE.1
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1
intergenic G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GE.1
intergenic H81H BA.5.2.2,GE.1
intergenic M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30,BE.1.1,BQ.1.13,BA.4.6,FD.1.1,BA.5.6,BA.2.3,GE.1
intergenic M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8,BE.1.1,BF.26,BA.4.6,FD.1.1,GE.1
intergenic E91K GE.1
intergenic E93K GE.1
intergenic Y97Y BA.5.1.24,EG.5.1.8,EG.5.2.1,GE.1
intergenic G112G BF.20,FL.1.5.2,GE.1
intergenic A117T BA.5,GE.1
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1
ORF1a D139G / NSP1
intergenic D139G GE.1
intergenic E176K GE.1
intergenic L177F GE.1
intergenic R226K BA.5.2.3,DV.7.1,GE.1
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intergenic S248S BA.5.2.3,GE.1
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ORF1a K322N / NSP2
intergenic K322N GE.1
intergenic C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30,BF.28,BA.5.5,EG.5.1.8,EG.5.1.3,FK.1.1,GE.1
intergenic P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30,BA.5.6,GK.2.1,GK.1,GE.1
intergenic E441E BA.1.14,GE.1
intergenic G442V GE.1
intergenic S443S BA.5,EU.1.1,FU.2,GS.4,GE.1
intergenic G445V GE.1
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intergenic A516V BF.9,GE.1
intergenic G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1
intergenic A537A FL.15,GE.1
intergenic Q556K BA.4,BA.5,BQ.1.1.8,BE.1.1,BQ.1.13,BQ.1.2.3,BQ.1,GE.1
intergenic D571D GE.1
intergenic L613L GE.1
intergenic I616I BF.9,GK.2,GE.1
intergenic G661S GE.1
intergenic H712H BA.5.2.34,GE.1
ORF1a T727T / NSP2
intergenic T727T GE.1
intergenic L730L BA.4,FL.2.3,GE.1
intergenic E745K GE.1
intergenic L778L GE.1
intergenic L778L EG.5.1.8,GE.1
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1
intergenic L864L BA.5.1.24,GE.1
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1
intergenic A967V BA.4,FU.1,GE.1
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intergenic P1010S GE.1
intergenic Y1064H GE.1
intergenic N1080N GE.1
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intergenic N1094K GE.1
intergenic V1104I FL.15,GE.1
intergenic L1110F GE.1
intergenic G1155C BA.5.1.2,EG.5.1.4,GK.3.1,GE.1
intergenic D1157H GE.1
intergenic Y1174Y BA.5.2.34,EG.5.1.4,FK.1.1,BA.5.6,GE.1
intergenic I1203S GE.1
intergenic P1207L GE.1
intergenic L1243L GE.1
intergenic N1252N GK.2,GE.1
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intergenic K72_L77del GE.1
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intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic A76A HK.11
intergenic G105G HK.11
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic G465G HK.11
intergenic S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1,EU.1.1,FL.20.2,FL.20,BQ.1,HK.11
intergenic A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11
intergenic G696G BA.5.2.20,HK.11
intergenic E755V HK.11
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic V886V BA.5.1.24,BF.10,HK.11
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic N1094S FL.20.2,HK.11
intergenic H1113H HK.11
intergenic G1155C BA.5.1.2,EG.5.1.4,GK.3.1,GE.1,HK.11
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic A1508A HK.11
intergenic G1819S DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FL.25,FL.20,HK.7,HK.11
intergenic C2041C BA.5.1.24,HK.11
intergenic H2092H GK.2.1,HK.7,GY.5,HK.11
intergenic T2154I BA.4.6,FY.3.1,HK.11
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic V3048V BE.1.1,HK.11
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic A3143V DV.7.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic A3209S HK.11
intergenic L3238I HK.11
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic F3271F BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,EG.6.1,FY.4.1.1,HK.11
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic Y3502Y HK.11
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
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intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
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intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11
intergenic N5370N BA.2.12,HK.11
intergenic T5538T EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11
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intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
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intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11
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intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
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intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
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intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
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intergenic T430I HK.11
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic LF455FL DV.7.1,DV.7.1.2,EG.5.1.8,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,GK.1.1,HK.11
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
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intergenic E484A BA.5,BA.4.1,HK.11
intergenic VE483FA HK.11
intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic Y789Y BQ.1.2.3,HK.11
intergenic Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic S1051S EG.5.1.6,HK.11
intergenic V1065L HK.11
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic A59T HK.11
intergenic S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1,EG.5.1.6,GK.2,HK.7,GY.5,HK.11
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic S171L GK.2,HK.11
intergenic G187V HK.11
intergenic T223I BA.2.12,BA.5.1.30,EG.5.1.3,GY.5,HK.11
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic R69X HK.11
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic A38S HK.11
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11
intergenic Q90L HK.11
intergenic V108V HK.11
intergenic T111K HK.11
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11
intergenic G77G HK.11
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1,FL.15,BA.2.3,GK.1.1,HK.11
intergenic N154S HK.11
intergenic A155A HK.11
intergenic S194A HK.11
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic P383S BA.4.1,HK.11
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11
intergenic S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
ORF1a H81Q / NSP1
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intergenic Y1174C GV.1
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intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic D3196G GV.1
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic L3313L FD.1.1,GK.2,GV.1
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intergenic T3459T BA.5.1.1,BE.1.1,EG.7,GV.1
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1
ORF1a A3645S / NSP6
intergenic A3645S GV.1
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic Y3793Y GV.1
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intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic A4774V GV.1
intergenic P4804S GV.1
intergenic F4820F BA.5.1.10,BA.4.1,BF.26,BQ.1.2.3,EG.5.1,BA.2.3,GV.1
intergenic N5020N BA.1.17,BA.5,BA.4.6,GV.1
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1
intergenic V5493F CH.1.1.28,GV.1
intergenic N5503N GV.1
intergenic Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FL.14,FK.1.1,BA.5.6,FL.20.2,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FU.1,BA.2.3,BQ.1,GS.3,GV.1
intergenic A5620A EU.1.1,FD.1.1,GK.2.1,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,GK.1.1,GV.1
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic T5956I BA.5.2.2,BA.5,FD.1.1,GK.1.1,GV.1
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic G5969C GV.1
intergenic A6044V BA.5,BA.4.6,GY.5,GV.1
intergenic D6069D BA.2.12,BA.4.1,EG.6.1,FL.15.1.1,GV.1
intergenic D6226D GV.1
intergenic H6239H FL.15,GK.2,GV.1
intergenic P6354P EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1
intergenic T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic V3A GV.1
intergenic T19I BA.5.2.2,BA.5.1.2,EG.5.1.3,EG.5.1,FD.1.1,GV.1
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intergenic L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic T29T GV.1
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intergenic G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BF.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic H146K EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1
intergenic H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1
intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic D215H BA.5.1.1,GA.4.1,GV.1
intergenic Q218R GV.1
intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1
intergenic C336C EG.5.1.3,GV.1
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic R466R GV.1
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intergenic E12D GV.1
M E12D GV.1
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic V29L FL.10.1,GV.1
intergenic I7I GV.1
intergenic F19L BA.4,BA.5.1.30,GV.1
intergenic F6_G8delinsX GV.1
intergenic G8X GV.1
intergenic K44R GV.1
intergenic T87fs GV.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic PR13LH GV.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic R68P GV.1
intergenic A134V GV.1
intergenic T148T BF.10,GV.1
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1
intergenic g.TG29710T BA.4,GV.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1,BQ.1.13,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1,FL.15,FU.2,BA.2.3,GK.1,GS.3,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1
intergenic T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic G1101D HF.1.1
intergenic G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic L1963L HF.1.1
intergenic T2121I EG.5.1.3,HF.1.1
intergenic T2247T FK.1.1,EG.6.1,HF.1.1
intergenic L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic L3201F BA.2.12,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic F3241F HF.1.1
intergenic T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1
intergenic D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1
intergenic A4155A FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic A4577V BA.5.1.30,GY.5,HF.1.1
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic A4791T HF.1.1
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intergenic V4864V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1
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intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1
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intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
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intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1
intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic A845S FU.2,HF.1.1
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intergenic N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic D1084N HF.1.1
intergenic H1101Y BF.41,BA.5.2.20,EG.5.1.3,HF.1.1
intergenic D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic F1148F EG.5.1.3,EG.7,FL.15,HF.1.1
intergenic D1163Y BA.5.2.2,DV.7.1.2,HF.1.1
intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic T175T HF.1.1
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intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1
intergenic G8X HF.1.1
intergenic T11I FU.1,GK.2.1,HF.1.1
intergenic S67S HF.1.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic P6L HF.1.1
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic A35T HF.1.1
intergenic Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic N213N HF.1.1
intergenic D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic V5F HK.1
intergenic H45Q HK.1
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic I473I BA.5.2.3,BF.9,BE.1.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.6.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.1
intergenic Q526H HK.1
intergenic S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30,BA.5.2.20,EG.5.1,EU.1.1,FL.20.2,FL.20,BQ.1,HK.11
intergenic G604S FL.25,FU.1,HK.1
intergenic A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1
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intergenic L758L HK.1
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intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
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intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic G252V EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic G257V BF.41,HK.1
intergenic F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
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intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1
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intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
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intergenic E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1
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intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
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intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic G38G EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.7,EG.5.1.4,EG.6.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1
intergenic S81P HK.1
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1
intergenic A43V BF.41,GK.1.1,HK.1
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BF.28,BA.1.15,FK.1.1,FL.15,BA.2.3,GK.1.1,HK.11
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic P383S BA.4.1,HK.11
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic S23F BA.5,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.5.1.6,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1
intergenic g.G29701T HK.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
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intergenic G7S BA.1.17,HF.1
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ORF1a S2015R / NSP3
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intergenic D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
ORF1a M3345I / NSP5
intergenic M3345I BA.5.1.24,BQ.1.2.3,HF.1
intergenic P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic K3532K HF.1
intergenic F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.4.6,EG.5.1.6,HF.1
intergenic L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5,BA.5.2.20,BF.26,FL.10.1,BQ.1,GW.5,GK.2,GE.1,HF.1
intergenic L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FK.1.1,EG.6.1,BA.5.6,EG.5.1.6,FL.15,FU.1,FU.2,BA.2.3,BQ.1,GK.2,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1
intergenic 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1,BE.1.1,BQ.1.13,BA.5.5,BA.4.6,BQ.1.2.3,EU.1.1,FK.1.1,FU.1,FU.2,FL.20,BQ.1,GW.5,HK.7,GV.1,HF.1.1,HF.1
intergenic D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8,FL.1.5,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,FL.15.1.1,FL.8,FL.15,FL.25,FU.1,FU.2,FL.20,GY.5,HF.1.1,HF.1
intergenic M3921I HF.1
intergenic M3997I HF.1
intergenic N4050N HF.1
intergenic P4058P BA.4.1,BA.5.1.30,EG.5.1,HF.1
intergenic T4090A HF.1
intergenic A4155A FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1
intergenic Y4172Y BA.5.1.2,BF.26,HF.1
intergenic K4176K HF.1
intergenic I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic G4378V HF.1
intergenic D4562N HF.1
intergenic A4568T HF.1
intergenic A4577V BA.5.1.30,GY.5,HF.1.1
intergenic P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic V4733I HF.1
intergenic Y4738H BA.4,HF.1
intergenic V4864V FU.1,FU.2,GY.5,GE.1,HF.1.1,HF.1
intergenic G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8,BF.26,BA.1.15,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic Y5223H HF.1
intergenic Y5223Y BA.5,HF.1.1
intergenic D5225D BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic A5342V BA.4,BF.9,BF.26,HF.1
intergenic S5360P BA.5.1.24,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic G5378V HF.1
intergenic T5465I BA.5.1.24,HF.1
intergenic L5551L EG.7,FL.14,FL.10.1,FU.2,HF.1
intergenic L5576L HF.1
ORF1b V5629L / NSP13
intergenic V5629L HF.1.1,HF.1
intergenic T5691A HF.1
intergenic R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic Y5865Y EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic G5895G HF.1.1,HF.1
intergenic L5932L BA.5.2.34,BA.5.1.30,BA.5.2.20,BA.2.3,GJ.1,GK.1.1,HF.1
intergenic I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic A6021V EG.5.1.4,HF.1
intergenic P6067S HF.1
intergenic L6102L BA.4.1,BA.4.6,EG.6.1,FL.20.2,GK.2.1,GK.3.1,HF.1
intergenic D6147Y FU.1,FU.2,GY.5,HF.1.1,HF.1
intergenic F6251F BF.28,HF.1
intergenic L6254F HF.1
intergenic S6294F GE.1,HF.1
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intergenic V83A EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
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intergenic H146Q EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,EG.6.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,FL.20,GK.1,GS.4,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1
intergenic H146Q EG.5.1.9,FL.1.5,FL.14,FL.10.1,FL.15.1.1,FL.8,FL.25,GJ.1,GK.2.1,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,HK.11,HF.1.1,HK.1
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intergenic Q183E EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic V213E BA.5.1.10,BA.5,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
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intergenic R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1
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intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic GST476SNR HF.1
intergenic ST477NK HF.1
intergenic ST477NR HF.1
intergenic ST477NR CH.1.1.28,FL.20.2,GA.4.1,FU.1,FU.2,GJ.1.2.6,GS.3,GS.4,GY.5,GE.1,GV.1,HF.1.1
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intergenic F486P BA.2.86.1,EG.10.1,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic F490S EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic S494P EG.10.1,EG.5.1,EG.5.1.6,FY.4.1.1,GK.2,HK.1,HF.1
intergenic N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic L518P HF.1
intergenic D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
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intergenic P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
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intergenic F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic S60S BA.5.1.2,DV.7.1,BA.4.6,EG.5.1,EG.5.1.6,GK.2,HK.7,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1
intergenic T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
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ORF3a P159P HF.1
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intergenic T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,GK.1.1,GE.1,GV.1,HF.1.1,HK.1
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intergenic T11A DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic A2V HF.1
intergenic D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,BF.26,BQ.1.13,BF.10,BA.5.5,CK.2,BQ.1.2.3,BA.5.6,BQ.1,HF.1
intergenic Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic W75L GK.2,HF.1
intergenic L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8,EG.5.1,FL.25,BA.2.3,GK.3.2,GK.1.1,GE.1,HF.1
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intergenic E13X HF.1
intergenic R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,BA.1.15,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic P57fs HF.1
intergenic D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic R25T BA.4.1,BA.5.2.20,HF.1
intergenic N52N BF.26,EG.5.1.3,HF.1
intergenic A79A GS.4,HF.1
intergenic L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GK.1.1,GE.1,HK.11,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic G8X EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,HK.11,HK.1,HF.1
intergenic T11I FU.1,GK.2.1,HF.1.1
intergenic g.A-3T BA.5.2.3,BA.5,HF.1
intergenic g.CTA-5_-3TTT BA.5.2.3,BA.5,HF.1
intergenic g.TA-4_-3CT HF.1
intergenic g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic N8N BF.10,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,GW.5,GS.3,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic D22G BA.5.1.1,DV.7.1,HF.1
intergenic E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic A35T HF.1.1,HF.1
intergenic Q58Q FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1
intergenic Q70Q HF.1
intergenic G164E HF.1
intergenic RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8,BF.28,BE.1.1,EG.5.1.9,EG.5.1.4,FD.1.1,GA.4.1,FU.2,BA.2.3,GK.2.1,HF.1
intergenic RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,GJ.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic G321S HF.1
intergenic D371D FU.1,FU.2,GK.1.3,GY.5,HF.1.1,HF.1
intergenic S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1
intergenic g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,DV.7.1.2,BF.10,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,FL.2.3,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GY.5,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1
intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1
intergenic g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.2.20,BQ.1.13,EG.5.1.8,EG.5.1.3,EG.5.1.4,EG.5.1,FD.1.1,GE.1,HF.1
intergenic g.C-126A HK.6
intergenic g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6
intergenic K47R DV.7.1,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6
intergenic V108V BF.10,HK.6
intergenic S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6
intergenic L140L CH.1.1.28,BQ.1.13,BA.5.5,FL.10.1,BA.2.3,HK.6
intergenic K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,BA.4.6,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.25,BA.2.3,BQ.1,GK.1.1,HF.1,HK.6
intergenic G146G FD.1.1,BA.2.3,HK.6
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intergenic A690V DV.7.1,BA.5.2.20,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,EG.6.1,EG.5.1.6,BA.2.3,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6
intergenic L766L HK.6
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intergenic S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6
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intergenic R5767R HK.6
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intergenic L242_L244del HK.6
intergenic GD252VG HK.6
intergenic F306F EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,EG.5.1.4,EG.5.1,FK.1.1,EG.5.1.6,HK.7,HK.11,HK.1,HK.6
intergenic G339H BA.2.86.1,DV.7.1,CH.1.1.28,DV.7.1.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6
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intergenic L368I EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6
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intergenic S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HF.1,HK.6
intergenic ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6
intergenic D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6
intergenic R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6
intergenic K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6
intergenic N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6
intergenic VG445PS EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6
intergenic N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1,CH.1.1.28,BQ.1.13,DV.7.1.2,CK.2,EG.10.1,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,FL.20.2,GA.4.1,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FU.1,FY.4.1.1,FU.2,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GJ.1.2.6,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GW.5,GS.3,GS.4,GK.2,GZ.1,HK.7,GK.1.1,GY.5,GE.1,HK.11,GV.1,HF.1.1,HK.1,HF.1,HK.6
intergenic ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1,BA.5.2.20,BF.28,BE.1.1,CH.1.1.28,BF.26,BQ.1.13,DV.7.1.2,BA.1.15,BF.10,BA.5.5,CK.2,EG.10.1,BA.4.6,EG.5.1.8,EG.5.2.1,BQ.1.2.3,EG.5.1.3,EG.5.1.9,FL.1.5,EG.7,EG.5.1.4,FL.2.3,EG.5.1,EU.1.1,FL.14,FL.1.5.2,FK.1.1,EG.6.1,FL.10.1,FD.1.1,BA.5.6,FL.15.1.1,EG.5.1.6,FL.8,FL.15,FY.3.1,FL.25,FY.4.1.1,BA.2.3,GJ.1,GK.2.1,FL.20,GK.1.3,BQ.1,GK.1,GK.3.1,GK.3.2,GK.2,HK.7,GK.1.1,HK.11,HK.1,HK.6
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