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| S | N165Y BA.5.1.24 |
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| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | I1130M BA.5.1.24 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | K1205N BA.5.1.24 |
| intergenic | G18V BA.5.1.24 |
| intergenic | I20I BA.1.17,BA.5.1.24 |
| intergenic | R30H BA.5.1.24 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
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| ORF3a | E102D BA.5.1.24 |
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| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24 |
| intergenic | H19R BA.5.1.24 |
| ORF7a | H19R BA.5.1.24 |
| intergenic | H73Y BA.5.1.24 |
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| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | A14A BA.5.1.24 |
| intergenic | I121N BA.5.1.24 |
| intergenic | I121fs BA.5.1.24 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | Q9H BA.5.1.24 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D63Y BA.5.1.24 |
| intergenic | R89T BA.5.1.24 |
| N | R89T BA.5.1.24 |
| intergenic | P122S BA.5.1.24 |
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| intergenic | T245I BA.5.2.2,BA.5.1.24 |
| intergenic | Q289Q BA.5.1.24 |
| intergenic | A311T BA.5.1.24 |
| intergenic | R319R BA.5.1.24 |
| intergenic | T325I BA.5.1.24 |
| intergenic | T362I BA.5.1.24 |
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| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34 |
| ORF1a | L39S / NSP1 |
| intergenic | L39S BA.5.2.3 |
| intergenic | R43C BA.5.2.3 |
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| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34 |
| intergenic | K120N BA.5.2.3 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | R207C BA.5.2.3 |
| intergenic | R226K BA.5.2.3 |
| intergenic | S248S BA.5.2.3 |
| intergenic | T283I BA.5.2.3 |
| ORF1a | K292E / NSP2 |
| intergenic | K292E BA.5.2.3 |
| intergenic | P305S BA.5.1.10,BA.5.2.3 |
| intergenic | T350I BA.5.2.3 |
| intergenic | S376L BA.5.2.3 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3 |
| intergenic | A474A BA.5.2.3 |
| intergenic | S549S BA.5.2.3 |
| ORF1a | T554N / NSP2 |
| intergenic | T554N BA.5.2.3 |
| intergenic | M584V BA.5.2.3 |
| intergenic | L590F BA.5.2.3 |
| intergenic | D644D BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | V660V BA.5.2.3 |
| intergenic | K680K BA.5.2.3 |
| intergenic | T727I BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| ORF1a | P765L / NSP2 |
| intergenic | P765L BA.5.2.3 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A859A BA.5.2.3 |
| intergenic | A876T BA.5.2.3 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | N1436N BA.5.2.3 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | H1500Y BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| ORF1a | S1520Y / NSP3 |
| intergenic | S1520Y BA.5.2.3 |
| intergenic | I1525V BA.5.2.3 |
| ORF1a | F1553L / NSP3 |
| intergenic | F1553L BA.5.2.3 |
| intergenic | T1572I BA.5.2.3 |
| intergenic | K1655N BA.5.2.3 |
| intergenic | Y1658Y BA.5.2.3 |
| intergenic | R1953R BA.5.2.3 |
| intergenic | T2021I BA.5.2.3 |
| intergenic | A2033V BA.5.2.3 |
| ORF1a | I2076M / NSP3 |
| intergenic | I2076M BA.5.2.3 |
| ORF1a | P2079R / NSP3 |
| intergenic | P2079R BA.5.2.3 |
| intergenic | K2143K BA.5.2.3 |
| intergenic | T2247I BA.5.2.3 |
| ORF1a | T2484T / NSP3 |
| intergenic | T2484T BA.5.2.3 |
| intergenic | A2584V BA.5.2.3 |
| ORF1a | D2592Y / NSP3 |
| intergenic | D2592Y BA.5.2.3 |
| intergenic | S2625S BA.4,BA.5.2.3 |
| intergenic | L2675L BA.5.2.3 |
| intergenic | N2708N BA.5.2.3 |
| intergenic | N2768del BA.5.2.3 |
| intergenic | D2833D BA.5.2.3 |
| intergenic | V2892F BA.5.2.3 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A3061A BA.5.2.3 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | S3099L BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | F3100F BA.5.2.3 |
| intergenic | A3209V BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | F3271F BA.5.2.3 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L3321L BA.5.2.3 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | P3447P BA.5.2.3 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L3829L BA.5.2.3 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | P4197S BA.5.2.3 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A4357V BA.4,BA.5.2.3 |
| ORF1a | G4374S / NSP10 |
| intergenic | G4374S BA.5.2.3 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A4921V BA.5.2.3 |
| intergenic | I4928I BA.5.2.3 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| ORF1b | R5716S / NSP13 |
| intergenic | R5716S BA.5.2.3 |
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| intergenic | V5819V BA.5.2.3 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | P6076L BA.5.2.3 |
| intergenic | N6424N BA.5.2.3 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | S6693S BA.5.2.3 |
| intergenic | G6890S BA.5.2.3 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3 |
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| intergenic | D6977G BA.5.2.3 |
| intergenic | T7032T BA.5.2.3 |
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| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
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| intergenic | H146H BA.2.12,BA.5.2.34 |
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| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L249S BA.5.2.3 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | R346S BA.4,BA.5.2.3 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | ST375FA BA.5.2.3 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
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| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
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| intergenic | K444R BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
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| intergenic | E484V BA.5.2.3 |
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| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
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| intergenic | T547I BA.5.2.3 |
| intergenic | P561S BA.5.2.3 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | T618T BA.1.14,BA.5.2.3 |
| intergenic | A623V BA.5.2.3 |
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| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A694A BA.5.2.3 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L878L BA.5.2.3 |
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| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | P1162S BA.5.2.3 |
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| intergenic | L53L BA.5.2.3 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L71I BA.5.2.3 |
| intergenic | H78Y BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | H93Q BA.5.2.3 |
| intergenic | A99S BA.5.2.3 |
| intergenic | P104L BA.5.2.3 |
| intergenic | V112V BA.5.2.3 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | g.C-23T BA.5.2.3 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | I97V BA.5.2.3 |
| intergenic | H125N BA.5.2.3 |
| intergenic | I161I BA.5.2.3 |
| intergenic | L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | N207N BA.5.2.3 |
| intergenic | L4L BA.5.2.3 |
| intergenic | K23_Y31del BA.5.2.3 |
| intergenic | D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3 |
| intergenic | T28I BA.5.2.3 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | Y75Y BA.5.2.3 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | P36P BA.1.14,BA.5.2.34 |
| intergenic | D119D BA.5.2.3 |
| ORF8 | D119D BA.5.2.3 |
| intergenic | g.A-8T BA.5.2.3 |
| intergenic | g.A-3T BA.5.2.3 |
| intergenic | g.CTA-5_-3TTT BA.5.2.3 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | N8T BA.5.2.3 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | Y86Y BA.2.12,BA.5.2.3 |
| intergenic | D128E BA.5.2.3 |
| N | D128E BA.5.2.3 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3 |
| intergenic | I157I BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | Y172Y BA.5.2.3 |
| intergenic | G175G BA.2.12,BA.5.2.3 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | K299K BA.5.2.3 |
| intergenic | Y360Y BA.5.2.2,BA.5.2.3 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | g.C-13T BA.5.2.3 |
| intergenic | P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3 |
| intergenic | g.C-222T BA.4,BA.5 |
| intergenic | g.C-104T BA.5 |
| intergenic | g.G-67A BA.5 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | R24R BA.5 |
| intergenic | D25D BA.5 |
| intergenic | V26V BA.5 |
| intergenic | G32R BA.5 |
| intergenic | R43C BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | G49D BA.5.1.24,BA.5 |
| ORF1a | K58_L61delinsM / NSP1 |
| intergenic | K58_L61delinsM BA.5 |
| intergenic | R73C BA.5 |
| intergenic | G82_M85delinsV BA.5 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5 |
| intergenic | H83_M85del BA.5 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5 |
| intergenic | V84_V86del BA.5 |
| intergenic | M85del BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L92L BA.2.86.1,BA.5.2.34 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34 |
| intergenic | A117T BA.5 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | L219L BA.5 |
| ORF1a | P271P / NSP2 |
| intergenic | P305S BA.5.1.10,BA.5.2.3 |
| intergenic | A421A BA.5 |
| intergenic | S443S BA.5 |
| ORF1a | E452K / NSP2 |
| intergenic | E452K BA.5 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | G519S BA.5 |
| ORF1a | N522N / NSP2 |
| intergenic | N522N BA.5 |
| ORF1a | K527R / NSP2 |
| intergenic | K527R BA.5 |
| intergenic | F548S BA.5 |
| intergenic | Q556K BA.4,BA.5 |
| intergenic | L570L BA.5 |
| intergenic | L578L BA.5 |
| intergenic | L580F BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | V606V BA.5 |
| intergenic | E622G BA.5 |
| intergenic | V627F BA.5 |
| intergenic | D644D BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | W646L BA.5 |
| ORF1a | I652I / NSP2 |
| ORF1a | G661C / NSP2 |
| intergenic | G661C BA.5 |
| intergenic | I693T BA.5 |
| intergenic | Y717Y BA.5 |
| intergenic | T727I BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | I740I BA.2.12,BA.5 |
| intergenic | V774V BA.5 |
| intergenic | T796T BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | P820L BA.5 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | N869N BA.5 |
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| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
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| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
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| S | S172S BA.5 |
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| S | F306L BA.5 |
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| S | V327V BA.5.5,BA.5 |
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| intergenic | C432C BA.5 |
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| intergenic | N440R BA.5 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
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| intergenic | ST477DK BA.5 |
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| S | VE483RA BA.5 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
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| M | H148H BA.5.1.24,BA.5 |
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| ORF6 | g.-7_-4delAACG BA.5 |
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| intergenic | g.C-1T BA.5 |
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| intergenic | g.CTA-5_-3TTT BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
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| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5 |
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| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
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| ORF1a | A3625T / NSP6 |
| intergenic | A3625T BA.5.1.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | V3708V BA.5.1.1 |
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| ORF1a | T4079I / NSP8 |
| intergenic | T4079I BA.5.1.1 |
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| intergenic | P4220L BA.5.1.24,BA.5.1.1 |
| intergenic | N4235N BA.4,BA.5,BA.5.1.1 |
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| ORF1a | M4390T / NSP10 |
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| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1 |
| intergenic | Y4871Y BA.5.1.1 |
| ORF1b | L4906F / NSP12 |
| intergenic | L4906F BA.5.1.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
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| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | G446S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18 |
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| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
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| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
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| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18 |
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| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
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| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
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| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8 |
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| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
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| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
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| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
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| intergenic | D4661D BA.5.2.8 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
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| ORF1b | G5062V / NSP12 |
| intergenic | G5062V BA.5.2.8 |
| intergenic | Y5140Y BA.5.2.8 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | T5195I BA.5.2.8 |
| intergenic | L5349L BA.5.2.8 |
| intergenic | P5371L BA.5.1.10,BA.5.2.8 |
| intergenic | T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8 |
| intergenic | R5453K BA.5.2.8 |
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| intergenic | A5620S BA.5.2.8 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
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| intergenic | I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5.2.8 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
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| intergenic | N6347N BA.5.2.8 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | L6614F BA.5.2.8 |
| ORF1b | M6670K / NSP15 |
| intergenic | M6670K BA.5.2.8 |
| ORF1b | L6697L / NSP15 |
| intergenic | L6697L BA.5.2.8 |
| intergenic | Y6794Y BA.5.2.8 |
| intergenic | L6819L BA.5.2.2,BA.5.2.8 |
| intergenic | L6898F BA.5.2.8 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | F59S BA.5.2.8 |
| intergenic | S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.8 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | L84L BA.5.2.8 |
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| intergenic | V130V BA.5.2.8 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | E180G BA.5.2.8 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | P631P BA.5.2.8 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | N658D BA.5.2.8 |
| S | N658D BA.5.2.8 |
| intergenic | P665P BA.5,BA.5.2.8 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | F855F BA.5.2.8 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | A1020S BA.4,BA.5.2.8 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | A51T BA.5.2.8 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | P138P BA.5.2.8 |
| intergenic | S180P BA.5.2.8 |
| ORF3a | S180P BA.5.2.8 |
| intergenic | Y211Y BA.5.2.8 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | I249I BA.5.2.8 |
| intergenic | P258L BA.5.2.8 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | M84V BA.5.2.8 |
| M | M84V BA.5.2.8 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8 |
| intergenic | V122V BA.5.2.8 |
| intergenic | P132P BA.5.2.8 |
| intergenic | L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8 |
| intergenic | T21I BA.5.2.8 |
| intergenic | P34L BA.5.2.8 |
| intergenic | S36_T39del BA.5.2.8 |
| ORF7a | S36_T39del BA.5.2.8 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.8 |
| intergenic | D69D BA.1.14,BA.5.2.8 |
| intergenic | H73Y BA.5.1.24,BA.5.2.8 |
| intergenic | L77S BA.5.2.8 |
| intergenic | P99S BA.5.2.8 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | C25S BA.5.2.8 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8 |
| intergenic | S194L BA.5.2.8 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | K248K BA.5.2.8 |
| N | K248K BA.5.2.8 |
| intergenic | A376A BA.5.2.8 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8 |
| intergenic | g.C29696T BA.5.2.8 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | G82_M85delinsV BF.20 |
| intergenic | G112G BF.20 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| ORF1a | T677A / NSP2 |
| intergenic | T677A BF.20 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| ORF1a | D978N / NSP3 |
| intergenic | D978N BF.20 |
| ORF1a | S984I / NSP3 |
| intergenic | S984I BF.20 |
| intergenic | K1231E BF.20 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | P1921S BF.20 |
| intergenic | V2238V BA.5,BF.20 |
| ORF1a | T2274N / NSP3 |
| intergenic | T2274N BF.20 |
| intergenic | G2987G BF.20 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | D5271G BF.20 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10,BF.20 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T172T BA.5,BF.20 |
| intergenic | P57L BF.20 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | A419A BF.20 |
| intergenic | g.C29686G BF.20 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | H13Y BA.5.1.2 |
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| intergenic | S17_L18delinsM BA.5.1.2 |
| intergenic | M85del BA.5.1.2 |
| intergenic | M85del BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | P153L BA.5.1.2 |
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| intergenic | V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | P271S BA.5.1.2 |
| intergenic | P309Q BA.5.1.2 |
| intergenic | G334C BA.5.1.2 |
| ORF1a | K394N / NSP2 |
| intergenic | K394N BA.5.1.2 |
| intergenic | L446F BA.5.1.2 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L580F BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | A591V BA.5.1.10,BA.5.1.2 |
| intergenic | V665V BA.5.1.2 |
| intergenic | A698V BA.5.1.2 |
| intergenic | F741F BA.5.1.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | A872A BA.5.1.2 |
| intergenic | T891I BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | A967S BA.5.1.2 |
| intergenic | P971L BA.5,BA.5.1.2 |
| intergenic | L1097L BA.5.1.2 |
| intergenic | G1155C BA.5.1.2 |
| intergenic | I1203I BA.5.1.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | Y1337Y BA.5,BA.5.1.2 |
| intergenic | K1350R BA.5.1.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | F1353fs BA.5.1.10,BA.5,BA.5.2.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | L1445L BA.5.1.2 |
| intergenic | L1643L BA.5.1.2 |
| intergenic | T1760I BA.5.1.2 |
| intergenic | C1847C BA.5,BA.5.1.2 |
| intergenic | Y1868Y BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | D2101D BA.5.1.24,BA.5.1.2 |
| intergenic | T2183I BA.5.1.2 |
| ORF1a | T2197I / NSP3 |
| intergenic | T2197I BA.5.1.2 |
| intergenic | S2242F BA.5.2.34,BA.5.2.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | C2445C BA.4.1.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | N2523N BA.5.1.2 |
| ORF1a | G2842G / NSP4 |
| intergenic | G2842G BA.5.1.2 |
| intergenic | G2871G BA.5.1.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | N3029N BA.5.1.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | N3239N BA.5.1.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | S3273S BA.5.1.2 |
| intergenic | N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | K3351R BA.5.1.2 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | P3359S BA.5.1.10,BA.5.1.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | L3535L BA.2.12,BA.5.1.24 |
| ORF1a | M3539I / NSP5 |
| intergenic | M3539I BA.5.1.2 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | A3615V BA.5.1.2 |
| intergenic | D3671D BA.5.1.2 |
| intergenic | T3672N BA.5.1.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2 |
| intergenic | L3919F BA.5.1.2 |
| intergenic | D3936D BA.5.1.2 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D4020D BA.5.1.2 |
| intergenic | T4083M BA.5.1.1,BA.5.1.2 |
| intergenic | Y4172Y BA.5.1.2 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | T4217I BA.5.1.2 |
| intergenic | L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A4396V BA.5.1.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D4769D BA.5.1.24,BA.5.1.2 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2 |
| ORF1b | L5055L / NSP12 |
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| intergenic | D5130D BA.5.1.24,BA.5.1.2 |
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| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
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| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| ORF1a | L204L / NSP2 |
| intergenic | L204L BF.41 |
| intergenic | S443F BA.5.2.2,BF.41 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S944L BF.41 |
| intergenic | N1094_G1095delinsR BF.41 |
| intergenic | P1158S BF.41 |
| intergenic | I1232I BF.41 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | H1818Y BF.41 |
| intergenic | S2389L BF.41 |
| intergenic | Y2560Y BA.5,BF.41 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
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| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | F3329F BF.41 |
| intergenic | P3371S BF.41 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | L3591I BF.41 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| ORF1b | F4834fs / NSP12 |
| intergenic | F4834fs BF.41 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | F5958F BF.41 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | Y5989Y BF.41 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | G257V BF.41 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
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| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
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| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
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| intergenic | H1101Y BF.41 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | K192K BF.41 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | T172T BA.5,BF.20,BF.41 |
| ORF6 | A12V BF.41 |
| intergenic | D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3,BF.41 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | A43V BF.41 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | V62L BF.41 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41 |
| intergenic | S21S BF.41 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S193T BF.41 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | g.CGTC-25_-22TGTT BF.9 |
| intergenic | V35V BF.9 |
| intergenic | G133G BF.9 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5,BF.9 |
| intergenic | D264D BF.9 |
| intergenic | S302F BA.5.1.24,BF.9 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9 |
| intergenic | I502V BF.9 |
| intergenic | A516V BF.9 |
| intergenic | M584V BA.5.2.3,BF.9 |
| intergenic | V606I BF.9 |
| intergenic | I616I BF.9 |
| ORF1a | P777L / NSP2 |
| intergenic | P777L BF.9 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| ORF1a | T1001N / NSP3 |
| intergenic | T1001N BF.9 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | E1340D BF.9 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | T1521I BF.9 |
| ORF1a | F1527L / NSP3 |
| intergenic | F1527L BF.9 |
| intergenic | T1543I BF.9 |
| intergenic | T1597I BF.9 |
| ORF1a | V1661V / NSP3 |
| intergenic | V1661V BF.9 |
| intergenic | T1665T BF.9 |
| intergenic | G1764S BF.9 |
| intergenic | Y1873Y BA.5.1.10,BF.9 |
| ORF1a | S2048Y / NSP3 |
| intergenic | S2048Y BF.9 |
| intergenic | G2091G BF.9 |
| intergenic | D2101D BA.5.1.24,BA.5.1.2,BF.9 |
| intergenic | S2103F BA.2.86.1,BF.9 |
| intergenic | S2193F BF.9 |
| intergenic | V2238V BA.5,BF.20,BF.9 |
| ORF1a | R2267K / NSP3 |
| intergenic | R2267K BF.9 |
| intergenic | G2322G BF.9 |
| intergenic | V2324F BF.9 |
| ORF1a | A2733A / NSP3 |
| intergenic | A2733A BF.9 |
| intergenic | S2803L BF.9 |
| intergenic | A2856V BF.9 |
| intergenic | R2985R BF.9 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | F3100F BA.5.2.3,BF.9 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2,BF.9 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| ORF1a | Q3596H / NSP6 |
| intergenic | Q3596H BF.9 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9 |
| intergenic | L3644F BF.9 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| ORF1a | V3708L / NSP6 |
| intergenic | V3708L BF.9 |
| intergenic | F3785F BF.9 |
| intergenic | Y3813Y BF.9 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | D4317D BF.9 |
| intergenic | P4619L BF.9 |
| intergenic | T4638I BF.9 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | D4769D BA.5.1.24,BA.5.1.2,BF.9 |
| intergenic | P4897P BF.9 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | Y5276Y BF.9 |
| intergenic | A5342V BA.4,BF.9 |
| intergenic | A5532V BF.9 |
| intergenic | A5713V BF.9 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | A5727S BF.9 |
| ORF1b | T5873A / NSP13 |
| intergenic | T5873A BF.9 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | T6038I BF.9 |
| ORF1b | V6241F / NSP14 |
| intergenic | V6241F BF.9 |
| ORF1b | P6545P / NSP15 |
| intergenic | P6545P BF.9 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| ORF1b | D6734Y / NSP15 |
| intergenic | D6734Y BF.9 |
| intergenic | S6740F BF.9 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | F55F BF.9 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | H146H BA.2.12,BA.5.2.34,BF.9 |
| intergenic | N185S BF.9 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | P272S BF.9 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
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| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | L629L BA.5.1.24,BF.9 |
| S | L629L BA.5.1.24,BA.5.5,BF.9 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
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| N | H145L BF.9 |
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| intergenic | A5660T BA.5.1.1,BA.4.1 |
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| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
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| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | S918S BA.5.1.30 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | E939G BA.5.1.30 |
| ORF1a | T945N / NSP3 |
| intergenic | T945N BA.5.1.30 |
| intergenic | G1070V BA.5.1.30 |
| intergenic | A1082V BA.5.1.30 |
| intergenic | T1168I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.30 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
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| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | S3099L BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.30 |
| intergenic | V3107I BA.5.1.30 |
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| intergenic | M3129L BA.5.1.30 |
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| ORF1a | A3230S / NSP4 |
| intergenic | A3230S BA.5.1.30 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | G3578S BA.5.1.30 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | I3738I BA.5.2.8,BA.5.1.30 |
| intergenic | F3769F BA.5.1.30 |
| intergenic | I3853I BA.5.1.10,BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L3899L BA.5.1.30 |
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| ORF1a | S3950T / NSP8 |
| intergenic | S3950T BA.5.1.30 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
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| intergenic | T4302N BA.5.1.30 |
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| intergenic | R4387R BA.4,BA.5.1.30 |
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| intergenic | A4577V BA.5.1.30 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | T4736I BA.5.1.30 |
| intergenic | G4878G BA.5.1.30 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
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| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3,BA.5.1.30 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L5762L BA.5.1.10,BA.5.1.30 |
| intergenic | N5883N BA.5.1.30 |
| intergenic | L5932L BA.5.2.34,BA.5.1.30 |
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| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | G5969G BA.5.1.30 |
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| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | D6584D BA.5.1.30 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| ORF1b | S6659S / NSP15 |
| intergenic | S6659S BA.5.1.30 |
| intergenic | A6707S BA.5.1.30 |
| ORF1b | A6808T / NSP16 |
| intergenic | A6808T BA.5.1.30 |
| intergenic | N7084N BA.5.1.30 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | F58F BA.5.1.30 |
| intergenic | H69del BA.5.1.30 |
| intergenic | I68_H69del BA.5.1.30 |
| intergenic | V70del BA.5.1.30 |
| intergenic | P82T BA.5.1.30 |
| S | P82T BA.5.1.30 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L176F BA.5.1.30 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L276L BA.5.1.30 |
| intergenic | L296L BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.30 |
| intergenic | T307S BA.5.1.30 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
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| S | S758I BA.5.1.30 |
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| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
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| S | N1134N BA.5.1.30 |
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| ORF3a | L94P BA.5.1.30 |
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| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30 |
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| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
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| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30 |
| intergenic | V33F BA.5.1.30 |
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| intergenic | S67F BA.5.1.10,BA.5.1.30 |
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| ORF8 | H112H BA.2.3,BA.5.1.30 |
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| intergenic | I121I BA.5.1.30 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
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| intergenic | L56L BA.4.1,BA.5.1.30 |
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| N | K65E BA.5.1.30 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30 |
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| N | Q289Q BA.5.1.24,BA.5.1.30 |
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| intergenic | g.A-11T BA.5.1.30 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | G49D BA.5.1.24,BA.5,BA.5.2.8,BQ.1.1.8 |
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| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
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| intergenic | T265A BQ.1.1.8 |
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| intergenic | I368V BQ.1.1.8 |
| intergenic | H374Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | V459V BA.5.2.8,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D466D BQ.1.1.8 |
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| intergenic | L590S BQ.1.1.8 |
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| intergenic | G638G BQ.1.1.8 |
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| intergenic | L897L BQ.1.1.8 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L969F BQ.1.1.8 |
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| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
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| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T3432T BQ.1.1.8 |
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| intergenic | S3570S BQ.1.1.8 |
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| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
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| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
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| intergenic | <