| Total sequences | 528052 |
| New sequences | 1782 |
| New lineages | [] |
| New mutations | |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1 |
| intergenic | L92L BA.2.86.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1 |
| intergenic | A211D BA.2.86.1 |
| intergenic | P361P BA.2.86.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1 |
| intergenic | V1056L BA.2.86.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1 |
| intergenic | A1397V BA.2.86.1 |
| intergenic | K1763R BA.2.86.1 |
| intergenic | K1973R BA.2.86.1 |
| intergenic | S2015S BA.2.86.1 |
| intergenic | S2103F BA.2.86.1 |
| intergenic | N2526S BA.2.86.1 |
| intergenic | T2676T BA.2.86.1 |
| intergenic | A2710T BA.2.86.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1 |
| intergenic | V3593F BA.2.86.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1 |
| intergenic | L3711F BA.2.86.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1 |
| intergenic | L4184L BA.2.86.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1 |
| intergenic | N4358N BA.2.86.1 |
| intergenic | Y4430Y BA.2.86.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1 |
| intergenic | S5164S BA.2.86.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1 |
| intergenic | P6076P BA.2.86.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1 |
| intergenic | H6701H BA.2.86.1 |
| intergenic | V16_N17insMPLF BA.2.86.1 |
| intergenic | TTR19ITT BA.2.86.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1 |
| intergenic | S50L BA.2.86.1 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1 |
| intergenic | V127F BA.2.86.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1 |
| intergenic | FR157SG BA.2.86.1 |
| intergenic | N185T BA.2.86.1 |
| intergenic | N211_V213delinsIG BA.2.86.1 |
| intergenic | L216F BA.2.86.1 |
| intergenic | H245N BA.2.86.1 |
| intergenic | A264D BA.2.86.1 |
| intergenic | I332V BA.2.86.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1 |
| intergenic | K356T BA.2.86.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1 |
| intergenic | R403K BA.2.86.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1 |
| intergenic | VG445HS BA.2.86.1 |
| intergenic | N450D BA.2.86.1 |
| intergenic | L452W BA.2.86.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1 |
| intergenic | N481_E484delinsKGK BA.2.86.1 |
| intergenic | F486P BA.2.86.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1 |
| intergenic | E554K BA.2.86.1 |
| intergenic | A570V BA.2.86.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1 |
| intergenic | P621S BA.2.86.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1 |
| intergenic | P681R BA.2.86.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1 |
| intergenic | P1143L BA.2.86.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1 |
| intergenic | Y1215Y BA.2.86.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1 |
| intergenic | D3H BA.2.86.1 |
| intergenic | G6V BA.2.86.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1 |
| intergenic | T30A BA.2.86.1 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1 |
| intergenic | A104V BA.2.86.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1 |
| intergenic | A35V BA.2.86.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1 |
| intergenic | Q229K BA.2.86.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | R99C BA.4.1.8 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8 |
| intergenic | N188N BA.4.1.8 |
| intergenic | F536F BA.4.1.8 |
| intergenic | T753I BA.4.1.8 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | A1049V BA.4.1.8 |
| intergenic | G1125D BA.4.1.8 |
| intergenic | H1160Y BA.4.1.8 |
| intergenic | T1168I BA.4.1.8 |
| intergenic | K1304K BA.4.1.8 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | Y1354Y BA.4.1.8 |
| intergenic | P1692S BA.4.1.8 |
| intergenic | P1862L BA.4.1.8 |
| ORF1a | S2048A / NSP3 |
| intergenic | S2048A BA.4.1.8 |
| intergenic | P2055S BA.4.1.8 |
| intergenic | A2379V BA.4.1.8 |
| intergenic | C2445C BA.4.1.8 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | V3690V BA.4.1.8 |
| intergenic | D3728D BA.4.1.8 |
| intergenic | Y3765Y BA.4.1.8 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | P4220H BA.4.1.8 |
| intergenic | D4452D BA.4.1.8 |
| intergenic | Y4686Y BA.4.1.8 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| ORF1b | R5228R / NSP12 |
| intergenic | R5228R BA.4.1.8 |
| intergenic | T5461T BA.4.1.8 |
| intergenic | C5633C BA.4.1.8 |
| intergenic | V5680V BA.4.1.8 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| ORF1b | A5727V / NSP13 |
| intergenic | A5727V BA.4.1.8 |
| intergenic | Q5947H BA.4.1.8 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | V6016A BA.4.1.8 |
| ORF1b | H6113H / NSP14 |
| intergenic | H6113H BA.4.1.8 |
| ORF1b | L6334F / NSP14 |
| intergenic | L6334F BA.4.1.8 |
| intergenic | N6446N BA.4.1.8 |
| ORF1b | A6532V / NSP15 |
| intergenic | A6532V BA.4.1.8 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| ORF1b | M6782I / NSP15 |
| intergenic | M6782I BA.4.1.8 |
| intergenic | G6953G BA.4.1.8 |
| intergenic | V3G BA.4.1.8 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | F543F BA.4.1.8 |
| intergenic | N603N BA.4.1.8 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | V1060I BA.4.1.8 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | E1202Q BA.4.1.8 |
| intergenic | G1251G BA.4.1.8 |
| intergenic | D27Y BA.4.1.8 |
| intergenic | S40P BA.4.1.8 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | S180F BA.4.1.8 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | M260K BA.4.1.8 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | T10T BA.4.1.8 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | L116F BA.4.1.8 |
| intergenic | L11fs BA.4.1.8 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | I10I BA.4.1.8 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | N75N BA.4.1.8 |
| intergenic | G85G BA.4.1.8 |
| intergenic | P151S BA.4.1.8 |
| intergenic | P151Y BA.4.1.8 |
| N | P151Y BA.4.1.8 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | D341D BA.4.1.8 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | H81Y BA.1.14 |
| intergenic | D144Y BA.1.14 |
| intergenic | K141_F143del BA.1.14 |
| intergenic | H388Y BA.1.14 |
| intergenic | E441E BA.1.14 |
| intergenic | A656V BA.1.14 |
| intergenic | A735A BA.1.14 |
| intergenic | K856R BA.1.14 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | Q998H BA.1.14 |
| intergenic | A1061T BA.1.14 |
| ORF1a | K1077N / NSP3 |
| intergenic | K1077N BA.1.14 |
| intergenic | P1158L BA.1.14 |
| ORF1a | K1315R / NSP3 |
| intergenic | K1315R BA.1.14 |
| intergenic | L1438L BA.1.14 |
| intergenic | A1707A BA.1.14 |
| intergenic | Y1770Y BA.1.14 |
| ORF1a | L1774R / NSP3 |
| intergenic | L1774R BA.1.14 |
| intergenic | P2046S BA.1.14 |
| intergenic | P2046L BA.1.14 |
| intergenic | S2083_L2084delinsI BA.1.14 |
| ORF1a | G2499D / NSP3 |
| intergenic | G2499D BA.1.14 |
| intergenic | A2557A BA.1.14 |
| intergenic | A2710T BA.2.86.1,BA.1.14 |
| intergenic | N2894N BA.1.14 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | P3395H BA.1.14 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | A3620V BA.1.14 |
| intergenic | L3674_G3676del BA.1.14 |
| ORF1a | S3673_F3677delinsI / NSP6 |
| intergenic | S3673_F3677delinsI BA.1.14 |
| intergenic | I3758V BA.1.14 |
| intergenic | S3950S BA.1.14 |
| intergenic | Y3954Y BA.1.14 |
| intergenic | T4087I BA.1.14 |
| intergenic | T4174I BA.1.14 |
| intergenic | V4310V BA.1.14 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | P4770P BA.1.14 |
| intergenic | N4992N BA.1.14 |
| intergenic | F5158F BA.1.14 |
| intergenic | P5498S BA.1.14 |
| ORF1b | G5530V / NSP13 |
| intergenic | G5530V BA.1.14 |
| intergenic | Q5947Q BA.1.14 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | H6020Y BA.1.14 |
| ORF1b | D6057G / NSP14 |
| intergenic | D6057G BA.1.14 |
| intergenic | V6188V BA.1.14 |
| intergenic | V6536V BA.1.14 |
| intergenic | G6875R BA.1.14 |
| intergenic | A6990S BA.1.14 |
| intergenic | Y38Y BA.1.14 |
| intergenic | H69del BA.1.14 |
| intergenic | V70del BA.1.14 |
| intergenic | T95I BA.1.14 |
| intergenic | G142_Y145delinsD BA.1.14 |
| intergenic | N211_L212delinsI BA.1.14 |
| intergenic | D215_L216delinsEPEDF BA.1.14 |
| S | D215_L216delinsEPEDF BA.1.14 |
| intergenic | R214_D215insEPE BA.1.14 |
| intergenic | T240I BA.1.14 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | S371L BA.1.14 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | S375F BA.1.14 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | G446S BA.1.14 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | Q493R BA.1.14 |
| intergenic | G496S BA.1.14 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | T547K BA.1.14 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | T618T BA.1.14 |
| intergenic | Q628R BA.1.14 |
| S | Q628R BA.1.14 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | A706V BA.1.14 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | T768I BA.1.14 |
| intergenic | I844I BA.1.14 |
| intergenic | N856K BA.1.14 |
| intergenic | A892S BA.1.14 |
| intergenic | A930A BA.1.14 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | L981F BA.1.14 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | A103P BA.1.14 |
| ORF3a | A103P BA.1.14 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | D3G BA.1.14 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | D61D BA.1.14 |
| intergenic | H47Y BA.1.14 |
| intergenic | D69D BA.1.14 |
| intergenic | Y97_I100del BA.1.14 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | P36P BA.1.14 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | R68R BA.1.14 |
| intergenic | R149R BA.1.14 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14 |
| intergenic | T332I BA.1.14 |
| intergenic | g.C-163T BA.2.12 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12 |
| intergenic | M85del BA.2.12 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | G146S BA.2.12 |
| intergenic | V186V BA.2.12 |
| intergenic | C213C BA.2.12 |
| intergenic | Y229Y BA.2.12 |
| intergenic | K247N BA.2.12 |
| ORF1a | E553G / NSP2 |
| intergenic | E553G BA.2.12 |
| intergenic | A599V BA.2.12 |
| intergenic | L681F BA.2.12 |
| intergenic | D691D BA.2.12 |
| intergenic | T711T BA.2.12 |
| intergenic | I740I BA.2.12 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | V879V BA.2.12 |
| intergenic | T891I BA.2.12 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | P959S BA.2.12 |
| intergenic | T1001I BA.2.12 |
| ORF1a | V1056M / NSP3 |
| intergenic | V1056M BA.2.12 |
| intergenic | G1070G BA.2.12 |
| intergenic | H1113Y BA.2.12 |
| intergenic | T1168I BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | K1281R BA.2.12 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | T1322I BA.2.12 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | A1397V BA.2.86.1,BA.2.12 |
| intergenic | A1397A BA.2.12 |
| ORF1a | T1444T / NSP3 |
| intergenic | T1444T BA.2.12 |
| ORF1a | A1482A / NSP3 |
| intergenic | A1482A BA.2.12 |
| intergenic | K1720N BA.2.12 |
| intergenic | N1995N BA.2.12 |
| intergenic | S2015S BA.2.86.1,BA.2.12 |
| intergenic | S2048A BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | N2272N BA.2.12 |
| intergenic | F2334F BA.2.12 |
| intergenic | Y2384Y BA.2.12 |
| intergenic | D2506D BA.2.12 |
| intergenic | N2603N BA.2.12 |
| intergenic | A2618V BA.2.12 |
| intergenic | P2685S BA.2.12 |
| intergenic | I2709I BA.2.12 |
| intergenic | H2794Y BA.2.12 |
| intergenic | T2836I BA.2.12 |
| intergenic | D2907D BA.2.12 |
| intergenic | A2909V BA.2.12 |
| intergenic | G2959D BA.2.12 |
| intergenic | T2967I BA.2.12 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | I3052V BA.2.12 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | S3099L BA.2.12 |
| intergenic | L3180L BA.2.12 |
| intergenic | L3198L BA.2.12 |
| intergenic | L3201F BA.2.12 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | I3322I BA.2.12 |
| intergenic | K3353R BA.2.12 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | V3420V BA.2.12 |
| intergenic | Q3507Q BA.2.12 |
| intergenic | L3535L BA.2.12 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| ORF1a | N3609S / NSP6 |
| intergenic | N3609S BA.2.12 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | L3717L BA.2.12 |
| intergenic | A3730A BA.2.12 |
| intergenic | L3796L BA.2.12 |
| intergenic | Y3803Y BA.2.12 |
| ORF1a | I3835I / NSP6 |
| intergenic | I3835I BA.2.12 |
| intergenic | A3837T BA.2.12 |
| ORF1a | E3906G / NSP7 |
| intergenic | E3906G BA.2.12 |
| intergenic | Q4015Q BA.2.12 |
| intergenic | L4070L BA.2.12 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | L4284L BA.2.12 |
| ORF1a | C4294F / NSP10 |
| intergenic | C4294F BA.2.12 |
| intergenic | H4301H BA.2.12 |
| intergenic | F4321F BA.2.12 |
| intergenic | D4455Y BA.2.12 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | F4811F BA.2.12 |
| intergenic | D4915D BA.2.12 |
| ORF1b | A4977V / NSP12 |
| intergenic | A4977V BA.2.12 |
| intergenic | Y5011Y BA.2.12 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12 |
| intergenic | H5144H BA.2.12 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | Y5355Y BA.2.12 |
| intergenic | N5370N BA.2.12 |
| intergenic | Y5388Y BA.2.12 |
| intergenic | T5451N BA.2.12 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12 |
| intergenic | A5626A BA.2.12 |
| intergenic | A5692V BA.2.12 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | F5746F BA.2.12 |
| intergenic | P5853L BA.2.12 |
| intergenic | A5926S BA.2.12 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | V6050F BA.2.12 |
| intergenic | D6069D BA.2.12 |
| intergenic | L6082F BA.2.12 |
| intergenic | D6097D BA.2.12 |
| intergenic | D6104D BA.2.12 |
| intergenic | P6128L BA.2.12 |
| intergenic | R6130R BA.2.12 |
| intergenic | T6131T BA.2.12 |
| intergenic | R6203R BA.2.12 |
| intergenic | L6308L BA.2.12 |
| intergenic | DRYP6315EGCH BA.2.12 |
| intergenic | N6463N BA.2.12 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | S6799S BA.2.12 |
| intergenic | I6838V BA.2.12 |
| intergenic | T6891T BA.2.12 |
| intergenic | L6924F BA.2.12 |
| intergenic | T6938I BA.2.12 |
| intergenic | L5F BA.2.12 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | T73T BA.2.12 |
| intergenic | G75V BA.2.12 |
| intergenic | L84I BA.2.12 |
| intergenic | T95A BA.2.12 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | H146H BA.2.12 |
| intergenic | T208T BA.2.12 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | S221S BA.2.12 |
| intergenic | N331N BA.2.12 |
| S | N331N BA.2.12 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | N448S BA.2.12 |
| intergenic | L452Q BA.2.12 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | Q493R BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | QS493RP BA.2.12 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | P579P BA.2.12 |
| intergenic | T604I BA.2.12 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | V620V BA.2.12 |
| intergenic | A623S BA.2.12 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | S704L BA.2.12 |
| intergenic | T732I BA.2.12 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | L1141L BA.2.12 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | D1259D BA.2.12 |
| intergenic | F8F BA.2.12 |
| intergenic | V29I BA.2.12 |
| intergenic | F43F BA.2.12 |
| intergenic | G44R BA.2.12 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | H78Y BA.2.12 |
| intergenic | Q185H BA.2.12 |
| intergenic | Q213K BA.2.12 |
| intergenic | Y215H BA.2.12 |
| intergenic | T223I BA.2.12 |
| intergenic | S253S BA.2.12 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | A69V BA.2.12 |
| intergenic | M109I BA.2.12 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | L124L BA.2.12 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | H47Y BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | D51D BA.2.12 |
| intergenic | P84S BA.2.12 |
| intergenic | A15S BA.2.12 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | G66_K68delinsE BA.2.12 |
| intergenic | P70L BA.2.12 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | S23P BA.2.12 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | P67L BA.2.12 |
| intergenic | Y86Y BA.2.12 |
| intergenic | P117P BA.2.12 |
| intergenic | G175G BA.2.12 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | T296I BA.2.12 |
| intergenic | E367E BA.2.12 |
| intergenic | K369I BA.2.12 |
| N | K369I BA.2.12 |
| intergenic | Q389H BA.2.12 |
| intergenic | F403F BA.2.12 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | g.G-15T BA.2.12 |
| intergenic | P10S BA.2.12 |
| intergenic | R24H BA.2.12 |
| intergenic | A28V BA.2.12 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | G7S BA.1.17 |
| intergenic | K856R BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | A1283V BA.1.17 |
| intergenic | T1581T BA.1.17 |
| intergenic | A1707A BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | P1803S BA.1.17 |
| intergenic | V1887I BA.1.17 |
| intergenic | S2083_L2084delinsI BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | T2152I BA.1.17 |
| intergenic | D2573D BA.1.17 |
| intergenic | A2690V BA.1.17 |
| intergenic | A2710T BA.2.86.1,BA.1.14,BA.1.17 |
| ORF1a | M2796T / NSP4 |
| intergenic | M2796T BA.1.17 |
| intergenic | S2797F BA.1.17 |
| intergenic | L3234L BA.1.17 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | N3291N BA.1.17 |
| intergenic | P3395H BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | L3674_G3676del BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | I3758V BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | V4310V BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | S4398L BA.1.17 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | V4722A BA.1.17 |
| ORF1b | R4975G / NSP12 |
| intergenic | R4975G BA.1.17 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | N5020N BA.1.17 |
| intergenic | P5371P BA.1.17 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | V5776V BA.1.17 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | H69del BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | V70del BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | T95I BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | G142_Y145delinsD BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | M177I BA.1.17 |
| intergenic | N211_L212delinsI BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | R214_D215insEPE BA.1.17 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | S371L BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | S375F BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | G446S BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | Q493R BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | G496S BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | H519H BA.1.17 |
| intergenic | T547K BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | F643L BA.1.17 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | A701V BA.1.17 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | N856K BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | L981F BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | Q17H BA.1.17 |
| intergenic | I20I BA.1.17 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | T176I BA.1.17 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | V75L BA.1.17 |
| intergenic | D3G BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | L35I BA.1.17 |
| intergenic | D61D BA.1.14,BA.1.17 |
| intergenic | E95X BA.1.17 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | D113D BA.1.17 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | D103D BA.1.17 |
| N | D103D BA.1.17 |
| intergenic | A134A BA.1.17 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17 |
| intergenic | T282T BA.1.17 |
| intergenic | Y298Y BA.1.17 |
| intergenic | g.C-147T BA.5.2.2 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | G82S BA.5.2.2 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | H81H BA.5.2.2 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | P309L BA.5.2.2 |
| intergenic | G401G BA.5.2.2 |
| intergenic | S443F BA.5.2.2 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2 |
| intergenic | K722K BA.5.2.2 |
| ORF1a | G780G / NSP2 |
| intergenic | G780G BA.5.2.2 |
| intergenic | IT841VI BA.5.2.2 |
| ORF1a | NIT840SVI / NSP3 |
| intergenic | NIT840SVI BA.5.2.2 |
| intergenic | T842I BA.5.2.2 |
| intergenic | T882I BA.5.2.2 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | S966P BA.5.2.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | T1426T BA.5.2.2 |
| intergenic | L1438L BA.1.14,BA.5.2.2 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2 |
| ORF1a | D1440D / NSP3 |
| intergenic | D1440D BA.5.2.2 |
| ORF1a | E1461E / NSP3 |
| intergenic | E1461E BA.5.2.2 |
| intergenic | N1749N BA.5.2.2 |
| intergenic | A1809V BA.5.2.2 |
| intergenic | F1925F BA.5.2.2 |
| intergenic | T2016K BA.5.2.2 |
| intergenic | S2024L BA.5.2.2 |
| ORF1a | N2449N / NSP3 |
| intergenic | N2449N BA.5.2.2 |
| intergenic | T2648I BA.5.2.2 |
| ORF1a | V2680V / NSP3 |
| intergenic | V2680V BA.5.2.2 |
| ORF1a | E2946A / NSP4 |
| intergenic | E2946A BA.5.2.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | T3090I BA.5.2.2 |
| intergenic | L3191L BA.5.2.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | V3349L BA.5.2.2 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | K3353N BA.5.2.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | A3454T BA.5.2.2 |
| intergenic | N3484N BA.5.2.2 |
| intergenic | D3492D BA.5.2.2 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | T3646I BA.5.2.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2 |
| intergenic | Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| ORF1b | T4668A / NSP12 |
| intergenic | T4668A BA.5.2.2 |
| intergenic | P4715F BA.5.2.2 |
| intergenic | P4715L BA.5.2.2 |
| ORF1b | V4816M / NSP12 |
| intergenic | V4816M BA.5.2.2 |
| intergenic | M4855I BA.5.2.2 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | A5270V BA.5.2.2 |
| intergenic | T5439I BA.5.2.2 |
| intergenic | T5451N BA.2.12,BA.5.2.2 |
| ORF1b | V5478V / NSP13 |
| intergenic | V5478V BA.5.2.2 |
| intergenic | T5538I BA.5.2.2 |
| ORF1b | F5549L / NSP13 |
| intergenic | F5549L BA.5.2.2 |
| intergenic | P5608P BA.5.2.2 |
| intergenic | A5645A BA.5.2.2 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | T5923T BA.5.2.2 |
| intergenic | T5956I BA.5.2.2 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | T6028T BA.5.2.2 |
| intergenic | T6144I BA.5.2.2 |
| intergenic | R6235R BA.5.2.2 |
| intergenic | D6256D BA.5.2.2 |
| intergenic | T6449I BA.5.2.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | Y6645Y BA.5.2.2 |
| intergenic | G6698S BA.5.2.2 |
| intergenic | V6772L BA.5.2.2 |
| intergenic | L6819L BA.5.2.2 |
| intergenic | A6976V BA.5.2.2 |
| intergenic | T19I BA.5.2.2 |
| intergenic | T19L BA.5.2.2 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | V127F BA.2.86.1,BA.5.2.2 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | A262A BA.5.2.2 |
| intergenic | L296L BA.5.2.2 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | R346I BA.5.2.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | L518I BA.5.2.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | D1163Y BA.5.2.2 |
| intergenic | G1219C BA.5.2.2 |
| intergenic | C1253C BA.5.2.2 |
| intergenic | P42H BA.5.2.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | L106L BA.5.2.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2 |
| intergenic | V256del BA.5.2.2 |
| intergenic | g.G-18T BA.5.2.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2 |
| intergenic | P84L BA.5.2.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2 |
| intergenic | L60F BA.5.2.2 |
| intergenic | I71T BA.5.2.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | G5R BA.5.2.2 |
| N | G5R BA.5.2.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | I130I BA.5.2.2 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | D144D BA.5.2.2 |
| intergenic | G178S BA.5.2.2 |
| N | G178S BA.5.2.2 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2 |
| intergenic | T245I BA.5.2.2 |
| intergenic | Y360Y BA.5.2.2 |
| intergenic | g.C-3T BA.5.2.2 |
| intergenic | R24C BA.5.2.2 |
| intergenic | g.CAAT29675C BA.5.2.2 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2 |
| intergenic | g.G29717A BA.5.2.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2 |
| intergenic | g.T-129C BA.5.1.10 |
| intergenic | g.C-119T BA.5.1.10 |
| intergenic | g.C-63T BA.5.1.10 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | G49V BA.5.1.10 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.10 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | N189N BA.5.1.10 |
| intergenic | P305S BA.5.1.10 |
| intergenic | G334G BA.5.1.10 |
| intergenic | H374H BA.5.1.10 |
| intergenic | G379E BA.5.1.10 |
| intergenic | T403I BA.5.1.10 |
| ORF1a | E441D / NSP2 |
| intergenic | E441D BA.5.1.10 |
| intergenic | S481S BA.5.1.10 |
| intergenic | A540V BA.5.1.10 |
| intergenic | A591V BA.5.1.10 |
| intergenic | T614I BA.5.1.10 |
| intergenic | D644D BA.5.1.10 |
| intergenic | G728C BA.5.1.10 |
| intergenic | L730I BA.5.1.10 |
| intergenic | P748L BA.5.1.10 |
| intergenic | V839V BA.5.1.10 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | T882I BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | P971S BA.5.1.10 |
| intergenic | T1001I BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | F1353fs BA.5.1.10 |
| intergenic | M1588T BA.5.1.10 |
| ORF1a | P1659S / NSP3 |
| intergenic | P1659S BA.5.1.10 |
| ORF1a | I1667V / NSP3 |
| intergenic | I1667V BA.5.1.10 |
| intergenic | N1673N BA.5.1.10 |
| ORF1a | L1725S / NSP3 |
| intergenic | L1725S BA.5.1.10 |
| intergenic | L1762I BA.5.1.10 |
| intergenic | A1851T BA.5.1.10 |
| intergenic | Y1873Y BA.5.1.10 |
| intergenic | S1905F BA.5.1.10 |
| intergenic | L2062F BA.5.1.10 |
| intergenic | N2147N BA.5.1.10 |
| intergenic | Y2168Y BA.5.1.10 |
| intergenic | V2776I BA.5.1.10 |
| intergenic | F2780S BA.5.1.10 |
| intergenic | M2796I BA.5.1.10 |
| intergenic | N2894N BA.1.14,BA.5.1.10 |
| intergenic | F2964F BA.5.1.10 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | S3149F BA.5.1.10 |
| intergenic | A3209V BA.5.1.10 |
| intergenic | G3245G BA.5.1.10 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | P3359S BA.5.1.10 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10 |
| intergenic | T3374T BA.5.1.10 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | Y3424Y BA.5.1.10 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10 |
| intergenic | F3603F BA.5.1.10 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | K3839R BA.5.1.10 |
| intergenic | I3853I BA.5.1.10 |
| intergenic | E3906E BA.5.1.10 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | Q3966R BA.5.1.10 |
| intergenic | Q4189H BA.5.1.10 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | I4291I BA.5.1.10 |
| ORF1a | N4338Y / NSP10 |
| intergenic | N4338Y BA.5.1.10 |
| ORF1a | D4344Y / NSP10 |
| intergenic | D4344Y BA.5.1.10 |
| ORF1b | C4446C / NSP12 |
| intergenic | C4446C BA.5.1.10 |
| intergenic | H4467H BA.5.1.10 |
| intergenic | T4477I BA.5.1.10 |
| ORF1b | L4578L / NSP12 |
| intergenic | L4578L BA.5.1.10 |
| ORF1b | Y4630Y / NSP12 |
| intergenic | Y4630Y BA.5.1.10 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10 |
| intergenic | F4820F BA.5.1.10 |
| intergenic | A4835A BA.5.1.10 |
| intergenic | N4851N BA.5.1.10 |
| intergenic | Y4908Y BA.5.1.10 |
| intergenic | F4986F BA.5.1.10 |
| intergenic | D5128N BA.5.1.10 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | L5254L BA.5.1.10 |
| intergenic | P5310L BA.5.1.10 |
| intergenic | P5371L BA.5.1.10 |
| intergenic | Y5444Y BA.5.1.10 |
| intergenic | T5451I BA.5.1.10 |
| intergenic | P5496H BA.5.1.10 |
| intergenic | R5572K BA.5.1.10 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | L5762L BA.5.1.10 |
| intergenic | I5804I BA.5.1.10 |
| intergenic | T5825I BA.5.1.10 |
| intergenic | T5912I BA.5.1.10 |
| intergenic | T5941A BA.5.1.10 |
| intergenic | G5942W BA.5.1.10 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | V6106V BA.5.1.10 |
| intergenic | L6205L BA.5.1.10 |
| intergenic | H6380Y BA.5.1.10 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | S6739L BA.5.1.10 |
| intergenic | Y6845Y BA.5.1.10 |
| intergenic | L6924F BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | Y6930Y BA.5.1.10 |
| intergenic | F6985F BA.5.1.10 |
| intergenic | PR7013LN BA.5.1.10 |
| ORF1b | T7032I / NSP16 |
| intergenic | T7032I BA.5.1.10 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | F32F BA.5.1.10 |
| intergenic | S60S BA.5.1.10 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | I68_H69del BA.5.1.10 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | V83V BA.5.1.10 |
| intergenic | S98F BA.5.1.10 |
| intergenic | I105V BA.5.1.10 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | Y145H BA.5.1.10 |
| intergenic | Q183R BA.5.1.10 |
| intergenic | V193L BA.5.1.10 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | S254S BA.5.1.10 |
| intergenic | D294D BA.5.1.10 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10 |
| intergenic | S359S BA.5.1.10 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10 |
| intergenic | E554G BA.5.1.10 |
| intergenic | N603N BA.4.1.8,BA.5.1.10 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | I692I BA.5.1.10 |
| intergenic | N710N BA.5.1.10 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | T1006T BA.5.1.10 |
| intergenic | F1062F BA.5.1.10 |
| intergenic | T1100T BA.5.1.10 |
| intergenic | I1114T BA.5.1.10 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | A1226A BA.5.1.10 |
| intergenic | G1251R BA.5.1.10 |
| intergenic | K21N BA.5.1.10 |
| intergenic | I37I BA.5.1.10 |
| intergenic | P42S BA.5.1.10 |
| intergenic | F43S BA.5.1.10 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | L106L BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | Y113Y BA.5.1.10 |
| intergenic | C148C BA.5.1.10 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | H247Y BA.5.1.10 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | g.T-6C BA.5.1.10 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | N121N BA.5.1.10 |
| intergenic | C15C BA.5.1.10 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | P36S BA.5.1.10 |
| intergenic | A55V BA.5.1.10 |
| intergenic | S67F BA.5.1.10 |
| intergenic | K68N BA.5.1.10 |
| intergenic | I71T BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | T87I BA.5.1.10 |
| intergenic | V114L BA.5.1.10 |
| intergenic | R115H BA.5.1.10 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | P13F BA.5.1.10 |
| intergenic | P13L BA.5.1.10 |
| intergenic | G25G BA.5.1.10 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | D63D BA.5.1.10 |
| intergenic | P67L BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10 |
| intergenic | N126S BA.5.1.10 |
| intergenic | A152S BA.5.1.10 |
| intergenic | N192N BA.5.1.10 |
| intergenic | S194P BA.5.1.10 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10 |
| intergenic | Y268Y BA.5.1.10 |
| intergenic | T271I BA.5.1.10 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10 |
| intergenic | S310S BA.5.1.10 |
| intergenic | K347T BA.5.1.10 |
| N | K347T BA.5.1.10 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | g.C-10T BA.5.1.10 |
| intergenic | R24C BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | g.C-222T BA.4 |
| intergenic | g.C-63T BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | R24C BA.4 |
| intergenic | H45Y BA.4 |
| intergenic | V60I BA.4 |
| intergenic | G82_V86del BA.4 |
| ORF1a | H81N / NSP1 |
| intergenic | H81N BA.4 |
| ORF1a | H81_M85delinsNV / NSP1 |
| intergenic | H81_M85delinsNV BA.4 |
| intergenic | M85_V86del BA.4 |
| intergenic | V86F BA.4 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4 |
| ORF1a | S142_F143delinsHTM / NSP1 |
| intergenic | S142_F143delinsHTM BA.4 |
| ORF1a | E172E / NSP1 |
| intergenic | E172E BA.4 |
| intergenic | K210K BA.4 |
| intergenic | S216S BA.4 |
| intergenic | V378I BA.4 |
| intergenic | V378A BA.4 |
| intergenic | I396I BA.4 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4 |
| intergenic | K492K BA.4 |
| intergenic | S505S BA.4 |
| intergenic | T512T BA.4 |
| ORF1a | A540A / NSP2 |
| intergenic | A540A BA.4 |
| intergenic | A555V BA.4 |
| intergenic | Q556K BA.4 |
| intergenic | Y576C BA.4 |
| intergenic | L580F BA.4 |
| intergenic | N615N BA.4 |
| intergenic | Y621Y BA.4 |
| intergenic | V627I BA.4 |
| intergenic | L730L BA.4 |
| ORF1a | D795G / NSP2 |
| intergenic | D795G BA.4 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | A964T BA.4 |
| intergenic | A967V BA.4 |
| ORF1a | I1023T / NSP3 |
| intergenic | I1023T BA.4 |
| intergenic | A1043V BA.4 |
| intergenic | D1088D BA.4 |
| intergenic | D1179D BA.4 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| ORF1a | A1482T / NSP3 |
| intergenic | A1482T BA.4 |
| intergenic | P1541S BA.4 |
| ORF1a | P1659T / NSP3 |
| intergenic | P1659T BA.4 |
| ORF1a | N1672N / NSP3 |
| intergenic | N1673N BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | Y1868Y BA.4 |
| ORF1a | S2048A / NSP3 |
| intergenic | T2121T BA.4 |
| intergenic | D2299D BA.4 |
| intergenic | M2365I BA.4 |
| intergenic | I2385I BA.4 |
| intergenic | V2421V BA.4 |
| intergenic | S2493G BA.4 |
| intergenic | Y2513Y BA.4 |
| intergenic | V2624V BA.4 |
| intergenic | S2625S BA.4 |
| ORF1a | E2681E / NSP3 |
| intergenic | E2681E BA.4 |
| intergenic | A2701A BA.4 |
| ORF1a | V2754I / NSP3 |
| intergenic | V2754I BA.4 |
| intergenic | H2799Y BA.4 |
| intergenic | F3018F BA.4 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | L3092L BA.4 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | T3284I BA.4 |
| intergenic | N3291N BA.1.17,BA.4 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4 |
| intergenic | A3357A BA.4 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | G3437G BA.4 |
| intergenic | F3486L BA.4 |
| intergenic | D3511D BA.4 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | A3625A BA.4 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | P3952P BA.4 |
| intergenic | Y3954Y BA.1.14,BA.4 |
| intergenic | A3960A BA.4 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | V3976I BA.4 |
| intergenic | L4045L BA.4 |
| intergenic | L4064L BA.4 |
| intergenic | I4098T BA.4 |
| intergenic | C4163C BA.4 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | L4209L BA.4 |
| intergenic | N4235N BA.4 |
| intergenic | L4284L BA.2.12,BA.4 |
| intergenic | C4330C BA.4 |
| intergenic | A4357V BA.4 |
| intergenic | R4387R BA.4 |
| intergenic | V4406V BA.4 |
| intergenic | M4588I BA.4 |
| intergenic | D4652D BA.4 |
| ORF1b | D4661E / NSP12 |
| intergenic | D4661E BA.4 |
| intergenic | P4715F BA.5.2.2,BA.4 |
| intergenic | P4715L BA.5.2.2,BA.4 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10 |
| intergenic | Y4738H BA.4 |
| intergenic | L4779L BA.4 |
| intergenic | Y4847Y BA.4 |
| intergenic | A4972A BA.4 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4 |
| intergenic | E5136D BA.4 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4 |
| intergenic | L5197L BA.4 |
| intergenic | L5230L BA.4 |
| intergenic | L5283L BA.4 |
| intergenic | A5342V BA.4 |
| intergenic | P5377S BA.4 |
| intergenic | G5378S BA.4 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4 |
| ORF1b | T5552T / NSP13 |
| intergenic | T5552T BA.4 |
| intergenic | A5620T BA.4 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | S5748S BA.4 |
| intergenic | F5823F BA.4 |
| intergenic | P5828P BA.4 |
| intergenic | L5963L BA.4 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | M6078I BA.4 |
| intergenic | V6314V BA.4 |
| intergenic | V6362V BA.4 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | T6854I BA.4 |
| intergenic | A6997A BA.4 |
| intergenic | P7034L BA.4 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | G75V BA.2.12,BA.4 |
| intergenic | A93S BA.4 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | K147_N148del BA.4 |
| S | K147_N148del BA.4 |
| intergenic | K182I BA.4 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | L229L BA.4 |
| intergenic | V308V BA.4 |
| S | V308V BA.4 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | G339V BA.4 |
| S | G339V BA.4 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | R346S BA.4 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | S640F BA.4 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | N658S BA.4 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | Q804Q BA.4 |
| intergenic | D936N BA.4 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | I1018I BA.4 |
| intergenic | A1020S BA.4 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | G1251G BA.4.1.8,BA.4 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4 |
| intergenic | V55F BA.4 |
| intergenic | A59V BA.4 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | S74F BA.4 |
| intergenic | L84L BA.4 |
| intergenic | L94F BA.4 |
| intergenic | L108F BA.4 |
| intergenic | L140F BA.4 |
| intergenic | G172V BA.4 |
| intergenic | Y206Y BA.4 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | P240S BA.4 |
| intergenic | g.G-15T BA.4 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | C33C BA.4 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12 |
| intergenic | L56L BA.4 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4 |
| intergenic | L124L BA.2.12,BA.4 |
| intergenic | V170V BA.4 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4 |
| intergenic | g.C-5T BA.4 |
| intergenic | Y18H BA.4 |
| ORF7a | Y18H BA.4 |
| intergenic | V24L BA.4 |
| intergenic | Q62_F63delinsH BA.4 |
| intergenic | R80I BA.4 |
| intergenic | P84L BA.5.2.2,BA.4 |
| intergenic | V108_T111del BA.4 |
| ORF7a | V108_T111del BA.4 |
| intergenic | L11F BA.4 |
| intergenic | F19L BA.4 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | L32F BA.4 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | G66_K68delinsE BA.2.12,BA.4 |
| intergenic | F104L BA.4 |
| intergenic | F120fs BA.4 |
| intergenic | I121fs BA.4 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | P6S BA.4 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | G30_S33delinsF BA.4 |
| intergenic | P142S BA.4 |
| intergenic | P151S BA.4 |
| intergenic | PA151SS BA.4 |
| N | PA151SS BA.4 |
| intergenic | I157I BA.4 |
| intergenic | E174E BA.4 |
| intergenic | S180I BA.4 |
| intergenic | N192N BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4 |
| intergenic | RGT203KRN BA.4 |
| N | RGT203KRN BA.4 |
| intergenic | T332T BA.4 |
| intergenic | Y333Y BA.4 |
| intergenic | A336S BA.4 |
| N | A336S BA.4 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4 |
| intergenic | g.C-12A BA.4 |
| intergenic | Q29X BA.4 |
| intergenic | g.TG29710T BA.4 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGT29734C BA.4 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGT29734T BA.4 |
| intergenic | g.C-95A BA.5.2.34 |
| intergenic | g.T-57G BA.5.2.34 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | K72K BA.5.2.34 |
| intergenic | M85del BA.5.2.34 |
| intergenic | L92L BA.2.86.1,BA.5.2.34 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34 |
| intergenic | I114V BA.5.2.34 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | P193L BA.5.2.34 |
| intergenic | D203N BA.5.2.34 |
| intergenic | L259L BA.5.2.34 |
| intergenic | F266F BA.5.2.34 |
| intergenic | Y304H BA.5.2.34 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34 |
| intergenic | A385V BA.5.2.34 |
| intergenic | R402R BA.5.2.34 |
| intergenic | A427V BA.5.2.34 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | D644D BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| ORF1a | A687D / NSP2 |
| intergenic | A687D BA.5.2.34 |
| intergenic | H712H BA.5.2.34 |
| intergenic | T727I BA.5.2.34 |
| intergenic | V757V BA.5.2.34 |
| intergenic | N786N BA.5.2.34 |
| intergenic | N811N BA.5.2.34 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| ORF1a | D981G / NSP3 |
| intergenic | D981G BA.5.2.34 |
| intergenic | L1065L BA.5.2.34 |
| intergenic | G1073R BA.5.2.34 |
| intergenic | Y1174Y BA.5.2.34 |
| intergenic | L1186F BA.5.2.34 |
| intergenic | L1191L BA.5.2.34 |
| intergenic | T1246T BA.5.2.34 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | E1341E BA.5.2.34 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | K1428K BA.5.2.34 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34 |
| intergenic | L1523L BA.5.2.34 |
| intergenic | N1555N BA.5.2.34 |
| intergenic | V1629V BA.5.2.34 |
| intergenic | T1890I BA.5.2.34 |
| intergenic | Y2003Y BA.5.2.34 |
| intergenic | D2043D BA.5.2.34 |
| intergenic | L2146F BA.5.2.34 |
| intergenic | S2242F BA.5.2.34 |
| intergenic | G2342E BA.5.2.34 |
| ORF1a | S2378P / NSP3 |
| intergenic | S2378P BA.5.2.34 |
| intergenic | L2518F BA.5.2.34 |
| intergenic | P2537S BA.5.2.34 |
| ORF1a | H2794H / NSP4 |
| intergenic | H2794H BA.5.2.34 |
| intergenic | P2870P BA.5.2.34 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | S3099L BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | A3209V BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | I3341I BA.5.2.34 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | D3439D BA.5.2.34 |
| intergenic | A3529A BA.5.2.34 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34 |
| intergenic | H3580H BA.5.2.34 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | S3742S BA.5.2.34 |
| intergenic | V3747I BA.5.2.34 |
| intergenic | T3750I BA.5.2.34 |
| intergenic | F3753V BA.5.2.34 |
| intergenic | N3801N BA.5.2.34 |
| intergenic | V3892A BA.5.2.34 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34 |
| intergenic | L4064F BA.5.2.34 |
| intergenic | D4165N BA.5.2.34 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | T4258T BA.5.2.34 |
| intergenic | V4369A BA.5.2.34 |
| intergenic | P4486L BA.5.2.34 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| ORF1b | S4825S / NSP12 |
| intergenic | S4825S BA.5.2.34 |
| ORF1b | A4977S / NSP12 |
| intergenic | A4977S BA.5.2.34 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34 |
| intergenic | T5072T BA.5.2.34 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | Y5220Y BA.5.2.34 |
| intergenic | T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34 |
| intergenic | I5475I BA.5.2.34 |
| intergenic | S5490L BA.5.2.34 |
| intergenic | T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | P5828S BA.5.2.34 |
| intergenic | L5932L BA.5.2.34 |
| intergenic | V5939L BA.5.2.34 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | G5969S BA.5.2.34 |
| intergenic | P5971P BA.5.2.34 |
| intergenic | V6188F BA.5.2.34 |
| intergenic | A6206V BA.5.2.34 |
| intergenic | C6307C BA.5.2.34 |
| intergenic | T6441I BA.5.2.34 |
| ORF1b | R6542K / NSP15 |
| intergenic | R6542K BA.5.2.34 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| ORF1b | K6601N / NSP15 |
| intergenic | K6601N BA.5.2.34 |
| intergenic | R6658S BA.5.2.34 |
| intergenic | A6735A BA.5.2.34 |
| intergenic | R7014H BA.5.2.34 |
| intergenic | R7014R BA.5.2.34 |
| ORF1b | P7049S / NSP16 |
| intergenic | P7049S BA.5.2.34 |
| intergenic | I7088V BA.5.2.34 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | V11V BA.5.2.34 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34 |
| intergenic | H146H BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | D215E BA.5.2.34 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | N460I BA.5.2.34 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | F562F BA.5.2.34 |
| intergenic | D574N BA.5.2.34 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | Q675Q BA.5.2.34 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | A688V BA.5.2.34 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | V826V BA.5.2.34 |
| intergenic | A879V BA.5.2.34 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | V1104L BA.5.2.34 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | C1248F BA.5.2.34 |
| intergenic | P1263L BA.5.2.34 |
| intergenic | L46F BA.5.2.34 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | H78Y BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | L96L BA.5.2.34 |
| intergenic | M125I BA.5.2.34 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | R61L BA.5.2.34 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34 |
| intergenic | L164L BA.5.2.34 |
| intergenic | G202G BA.5.2.34 |
| intergenic | V9V BA.5.2.34 |
| intergenic | D30D BA.5.2.34 |
| intergenic | C15S BA.5.2.34 |
| ORF7a | C15S BA.5.2.34 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34 |
| intergenic | V104F BA.5.2.34 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | E33X BA.5.2.34 |
| intergenic | L34L BA.5.2.34 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | H17H BA.5.2.34 |
| intergenic | P36P BA.1.14,BA.5.2.34 |
| intergenic | P38P BA.5.2.34 |
| intergenic | S82S BA.5.2.34 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | T24I BA.5.2.34 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | D103H BA.5.2.34 |
| intergenic | A155V BA.5.2.34 |
| intergenic | I157I BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | A273S BA.5.2.34 |
| intergenic | P302P BA.5.2.34 |
| intergenic | T334I BA.5.2.34 |
| intergenic | I337I BA.5.2.34 |
| intergenic | F346F BA.5.2.34 |
| intergenic | L353L BA.5.2.34 |
| intergenic | P383P BA.5.2.34 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | P10S BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | g.C-160T BA.5.1.24 |
| intergenic | g.T-98C BA.5.1.24 |
| intergenic | g.A-97G BA.5.1.24 |
| intergenic | g.T-89C BA.5.1.24 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L27L BA.5.1.24 |
| intergenic | G49D BA.5.1.24 |
| intergenic | G49G BA.5.1.24 |
| intergenic | C51Y BA.5.1.24 |
| intergenic | Q66Q BA.5.1.24 |
| intergenic | G82_H83del BA.5.1.24 |
| intergenic | M85del BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L88L BA.5.1.24 |
| intergenic | Y97Y BA.5.1.24 |
| intergenic | G98S BA.5.1.24 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D152G BA.5.1.24 |
| intergenic | V186V BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | D203D BA.5.1.24 |
| intergenic | L204F BA.5.1.24 |
| intergenic | D220D BA.5.1.24 |
| intergenic | I257V BA.5.1.24 |
| intergenic | P271P BA.5.1.24 |
| intergenic | S302F BA.5.1.24 |
| intergenic | Y304Y BA.5.1.24 |
| ORF1a | L349V / NSP2 |
| intergenic | L349V BA.5.1.24 |
| intergenic | E381E BA.5.1.24 |
| ORF1a | G432C / NSP2 |
| intergenic | G432C BA.5.1.24 |
| intergenic | L454F BA.5.1.24 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | V491V BA.5.1.24 |
| intergenic | S538L BA.5.1.24 |
| intergenic | V559A BA.5.1.24 |
| intergenic | L580F BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | L580L BA.5.1.24 |
| intergenic | I694I BA.5.1.24 |
| intergenic | T796T BA.5.1.24 |
| intergenic | F813F BA.5.1.24 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L864L BA.5.1.24 |
| intergenic | V886V BA.5.1.24 |
| intergenic | T891I BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| ORF1a | T1000T / NSP3 |
| intergenic | T1000T BA.5.1.24 |
| intergenic | I1002T BA.5.1.24 |
| intergenic | V1099V BA.5.1.24 |
| intergenic | K1112K BA.5.1.24 |
| intergenic | P1213L BA.5.1.24 |
| intergenic | D1282G BA.5.1.24 |
| intergenic | V1299L BA.5.1.24 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D1323D BA.5.1.24 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | H1500Y BA.5.1.24 |
| intergenic | V1570L BA.5.1.24 |
| intergenic | D1600N BA.5.1.24 |
| intergenic | P1640L BA.5.1.24 |
| intergenic | L1680L BA.5.1.24 |
| intergenic | N1691N BA.5.1.24 |
| intergenic | T1731I BA.5.1.24 |
| intergenic | Y1734H BA.5.1.24 |
| intergenic | Y1868Y BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | S1924R BA.5.1.24 |
| intergenic | C2041C BA.5.1.24 |
| intergenic | D2101D BA.5.1.24 |
| intergenic | L2113L BA.5.1.24 |
| intergenic | S2151G BA.5.1.24 |
| intergenic | M2374K BA.5.1.24 |
| intergenic | A2470A BA.5.1.24 |
| intergenic | P2480P BA.5.1.24 |
| intergenic | V2491I BA.5.1.24 |
| intergenic | L2609L BA.5.1.24 |
| ORF1a | I2634V / NSP3 |
| intergenic | I2634V BA.5.1.24 |
| ORF1a | C2691C / NSP3 |
| intergenic | C2691C BA.5.1.24 |
| intergenic | I2806I BA.5.1.24 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D3222D BA.5.1.24 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | C3285C BA.5.1.24 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | I3341V BA.5.1.24 |
| intergenic | M3345I BA.5.1.24 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | V3388V BA.5.1.24 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D3511N BA.5.1.24 |
| intergenic | D3526G BA.5.1.24 |
| intergenic | L3535L BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | T3575I BA.5.1.24 |
| ORF1a | I3576T / NSP6 |
| intergenic | I3576T BA.5.1.24 |
| intergenic | L3636L BA.5.1.24 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | M3684V BA.5.1.24 |
| intergenic | Y3744Y BA.5.1.24 |
| intergenic | Y3765C BA.5.1.24 |
| intergenic | V3815V BA.5.1.24 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24 |
| intergenic | C3867C BA.5.1.24 |
| intergenic | V3871V BA.5.1.24 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | T4083T BA.5.1.24 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | P4220L BA.5.1.24 |
| intergenic | L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | G4380G BA.5.1.24 |
| intergenic | R4447R BA.5.1.24 |
| intergenic | Q4473E BA.5.1.24 |
| intergenic | K4483E BA.5.1.24 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D4769D BA.5.1.24 |
| intergenic | P4804P BA.5.1.24 |
| intergenic | V4887V BA.5.1.24 |
| intergenic | T4983I BA.5.1.24 |
| intergenic | R5113C BA.5.1.24 |
| intergenic | D5130Y BA.5.1.24 |
| intergenic | D5130D BA.5.1.24 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D5152D BA.5.1.24 |
| intergenic | D5225D BA.5.1.24 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24 |
| intergenic | P5319S BA.5.1.24 |
| intergenic | S5360P BA.5.1.24 |
| intergenic | P5377S BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | V5422F BA.5.1.24 |
| intergenic | L5454L BA.5.1.24 |
| ORF1b | T5465I / NSP13 |
| intergenic | T5465I BA.5.1.24 |
| intergenic | S5490L BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | Y5548C BA.5.1.24 |
| intergenic | A5662V BA.5.1.24 |
| intergenic | V5672L BA.5.1.24 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | T5737I BA.5.1.24 |
| intergenic | T5755I BA.5.1.24 |
| intergenic | I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24 |
| ORF1b | A5926S / NSP14 |
| intergenic | A5926S BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | D5955E BA.5.1.24 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| ORF1b | I6012I / NSP14 |
| intergenic | I6012I BA.5.1.24 |
| intergenic | P6046S BA.5.1.24 |
| ORF1b | D6069Y / NSP14 |
| intergenic | D6069Y BA.5.1.24 |
| intergenic | P6368S BA.5.1.24 |
| intergenic | F6370F BA.5.1.24 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | V6573V BA.5.1.24 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | K6741N BA.5.1.24 |
| intergenic | F6985F BA.5.1.10,BA.5.1.24 |
| intergenic | L7042L BA.5.1.24 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | V47V BA.5.1.24 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | K97K BA.5.1.24 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | N165Y BA.5.1.24 |
| S | N165Y BA.5.1.24 |
| intergenic | K182N BA.5.1.24 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | K444R BA.5.1.24 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L560L BA.5.1.24 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L629L BA.5.1.24 |
| intergenic | A647S BA.5.1.24 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | N657N BA.5.1.24 |
| intergenic | Q675H BA.5.1.24 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | I1130M BA.5.1.24 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | K1205N BA.5.1.24 |
| intergenic | G18V BA.5.1.24 |
| intergenic | I20I BA.1.17,BA.5.1.24 |
| intergenic | R30H BA.5.1.24 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | H78H BA.5.1.24 |
| intergenic | L94I BA.5.1.24 |
| intergenic | G100C BA.5.1.24 |
| intergenic | E102D BA.5.1.24 |
| ORF3a | E102D BA.5.1.24 |
| intergenic | H182H BA.5.1.24 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | V25V BA.5.1.24 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | Q19E BA.5.1.24 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | F100F BA.5.1.24 |
| intergenic | H148H BA.5.1.24 |
| intergenic | L181L BA.5.1.24 |
| intergenic | V5I BA.5.1.24 |
| intergenic | A12T BA.5.1.24 |
| intergenic | F22_D30del BA.5.1.24 |
| intergenic | Y31Y BA.5.1.24 |
| intergenic | K38K BA.5.1.24 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24 |
| intergenic | H19R BA.5.1.24 |
| ORF7a | H19R BA.5.1.24 |
| intergenic | H73Y BA.5.1.24 |
| intergenic | F101F BA.5.1.24 |
| intergenic | L116L BA.5.1.24 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | A14A BA.5.1.24 |
| intergenic | I121N BA.5.1.24 |
| intergenic | I121fs BA.5.1.24 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | Q9H BA.5.1.24 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D63Y BA.5.1.24 |
| intergenic | R89T BA.5.1.24 |
| N | R89T BA.5.1.24 |
| intergenic | P122S BA.5.1.24 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24 |
| intergenic | T245I BA.5.2.2,BA.5.1.24 |
| intergenic | Q289Q BA.5.1.24 |
| intergenic | A311T BA.5.1.24 |
| intergenic | R319R BA.5.1.24 |
| intergenic | T325I BA.5.1.24 |
| intergenic | T362I BA.5.1.24 |
| intergenic | D377Y BA.5.1.24 |
| intergenic | A398V BA.5.1.24 |
| intergenic | D401N BA.5.1.24 |
| intergenic | S413R BA.5.1.24 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34 |
| ORF1a | L39S / NSP1 |
| intergenic | L39S BA.5.2.3 |
| intergenic | R43C BA.5.2.3 |
| intergenic | L92L BA.2.86.1,BA.5.2.34 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34 |
| intergenic | K120N BA.5.2.3 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | R207C BA.5.2.3 |
| intergenic | R226K BA.5.2.3 |
| intergenic | S248S BA.5.2.3 |
| intergenic | T283I BA.5.2.3 |
| ORF1a | K292E / NSP2 |
| intergenic | K292E BA.5.2.3 |
| intergenic | P305S BA.5.1.10,BA.5.2.3 |
| intergenic | T350I BA.5.2.3 |
| intergenic | S376L BA.5.2.3 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3 |
| intergenic | A474A BA.5.2.3 |
| intergenic | S549S BA.5.2.3 |
| ORF1a | T554N / NSP2 |
| intergenic | T554N BA.5.2.3 |
| intergenic | M584V BA.5.2.3 |
| intergenic | L590F BA.5.2.3 |
| intergenic | D644D BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | V660V BA.5.2.3 |
| intergenic | K680K BA.5.2.3 |
| intergenic | T727I BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| ORF1a | P765L / NSP2 |
| intergenic | P765L BA.5.2.3 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A859A BA.5.2.3 |
| intergenic | A876T BA.5.2.3 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | N1436N BA.5.2.3 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | H1500Y BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| ORF1a | S1520Y / NSP3 |
| intergenic | S1520Y BA.5.2.3 |
| intergenic | I1525V BA.5.2.3 |
| ORF1a | F1553L / NSP3 |
| intergenic | F1553L BA.5.2.3 |
| intergenic | T1572I BA.5.2.3 |
| intergenic | K1655N BA.5.2.3 |
| intergenic | Y1658Y BA.5.2.3 |
| intergenic | R1953R BA.5.2.3 |
| intergenic | T2021I BA.5.2.3 |
| intergenic | A2033V BA.5.2.3 |
| ORF1a | I2076M / NSP3 |
| intergenic | I2076M BA.5.2.3 |
| ORF1a | P2079R / NSP3 |
| intergenic | P2079R BA.5.2.3 |
| intergenic | K2143K BA.5.2.3 |
| intergenic | T2247I BA.5.2.3 |
| ORF1a | T2484T / NSP3 |
| intergenic | T2484T BA.5.2.3 |
| intergenic | A2584V BA.5.2.3 |
| ORF1a | D2592Y / NSP3 |
| intergenic | D2592Y BA.5.2.3 |
| intergenic | S2625S BA.4,BA.5.2.3 |
| intergenic | L2675L BA.5.2.3 |
| intergenic | N2708N BA.5.2.3 |
| intergenic | N2768del BA.5.2.3 |
| intergenic | D2833D BA.5.2.3 |
| intergenic | V2892F BA.5.2.3 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A3061A BA.5.2.3 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | S3099L BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | F3100F BA.5.2.3 |
| intergenic | A3209V BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | F3271F BA.5.2.3 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L3321L BA.5.2.3 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | P3447P BA.5.2.3 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L3829L BA.5.2.3 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | P4197S BA.5.2.3 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A4357V BA.4,BA.5.2.3 |
| ORF1a | G4374S / NSP10 |
| intergenic | G4374S BA.5.2.3 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A4921V BA.5.2.3 |
| intergenic | I4928I BA.5.2.3 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| ORF1b | R5716S / NSP13 |
| intergenic | R5716S BA.5.2.3 |
| intergenic | F5746F BA.2.12,BA.5.2.3 |
| intergenic | V5819V BA.5.2.3 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | P6076L BA.5.2.3 |
| intergenic | N6424N BA.5.2.3 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | S6693S BA.5.2.3 |
| intergenic | G6890S BA.5.2.3 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3 |
| ORF1b | D6977G / NSP16 |
| intergenic | D6977G BA.5.2.3 |
| intergenic | T7032T BA.5.2.3 |
| intergenic | P7034S BA.5.2.3 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34 |
| intergenic | Y145_H146del BA.5.2.3 |
| intergenic | H146H BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | M153I BA.5.2.3 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L249S BA.5.2.3 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | R346S BA.4,BA.5.2.3 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | ST375FA BA.5.2.3 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | K444R BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | E484V BA.5.2.3 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.5.2.3 |
| intergenic | T547I BA.5.2.3 |
| intergenic | P561S BA.5.2.3 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | T618T BA.1.14,BA.5.2.3 |
| intergenic | A623V BA.5.2.3 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A694A BA.5.2.3 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L878L BA.5.2.3 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | P1162S BA.5.2.3 |
| intergenic | E1202Q BA.4.1.8,BA.5.2.3 |
| intergenic | A23V BA.5.2.3 |
| intergenic | Q38Q BA.5.2.3 |
| intergenic | S40L BA.5.2.3 |
| intergenic | L53L BA.5.2.3 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L71I BA.5.2.3 |
| intergenic | H78Y BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | H93Q BA.5.2.3 |
| intergenic | A99S BA.5.2.3 |
| intergenic | P104L BA.5.2.3 |
| intergenic | V112V BA.5.2.3 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | g.C-23T BA.5.2.3 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | I97V BA.5.2.3 |
| intergenic | H125N BA.5.2.3 |
| intergenic | I161I BA.5.2.3 |
| intergenic | L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | N207N BA.5.2.3 |
| intergenic | L4L BA.5.2.3 |
| intergenic | K23_Y31del BA.5.2.3 |
| intergenic | D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3 |
| intergenic | T28I BA.5.2.3 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | Y75Y BA.5.2.3 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | P36P BA.1.14,BA.5.2.34 |
| intergenic | D119D BA.5.2.3 |
| ORF8 | D119D BA.5.2.3 |
| intergenic | g.A-8T BA.5.2.3 |
| intergenic | g.A-3T BA.5.2.3 |
| intergenic | g.CTA-5_-3TTT BA.5.2.3 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | N8T BA.5.2.3 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | Y86Y BA.2.12,BA.5.2.3 |
| intergenic | D128E BA.5.2.3 |
| N | D128E BA.5.2.3 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3 |
| intergenic | I157I BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | Y172Y BA.5.2.3 |
| intergenic | G175G BA.2.12,BA.5.2.3 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | K299K BA.5.2.3 |
| intergenic | Y360Y BA.5.2.2,BA.5.2.3 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | g.C-13T BA.5.2.3 |
| intergenic | P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3 |
| intergenic | g.C-222T BA.4,BA.5 |
| intergenic | g.C-104T BA.5 |
| intergenic | g.G-67A BA.5 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | R24C BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | R24R BA.5 |
| intergenic | D25D BA.5 |
| intergenic | V26V BA.5 |
| intergenic | G32R BA.5 |
| intergenic | R43C BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | G49D BA.5.1.24,BA.5 |
| ORF1a | K58_L61delinsM / NSP1 |
| intergenic | K58_L61delinsM BA.5 |
| intergenic | R73C BA.5 |
| intergenic | G82_M85delinsV BA.5 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5 |
| intergenic | H83_M85del BA.5 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5 |
| intergenic | V84_V86del BA.5 |
| intergenic | M85del BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L92L BA.2.86.1,BA.5.2.34 |
| intergenic | H110Y BA.4.1.8,BA.5.2.34 |
| intergenic | A117T BA.5 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | L219L BA.5 |
| ORF1a | P271P / NSP2 |
| intergenic | P305S BA.5.1.10,BA.5.2.3 |
| intergenic | A421A BA.5 |
| intergenic | S443S BA.5 |
| ORF1a | E452K / NSP2 |
| intergenic | E452K BA.5 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | G519S BA.5 |
| ORF1a | N522N / NSP2 |
| intergenic | N522N BA.5 |
| ORF1a | K527R / NSP2 |
| intergenic | K527R BA.5 |
| intergenic | F548S BA.5 |
| intergenic | Q556K BA.4,BA.5 |
| intergenic | L570L BA.5 |
| intergenic | L578L BA.5 |
| intergenic | L580F BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | V606V BA.5 |
| intergenic | E622G BA.5 |
| intergenic | V627F BA.5 |
| intergenic | D644D BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | W646L BA.5 |
| ORF1a | I652I / NSP2 |
| ORF1a | G661C / NSP2 |
| intergenic | G661C BA.5 |
| intergenic | I693T BA.5 |
| intergenic | Y717Y BA.5 |
| intergenic | T727I BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | I740I BA.2.12,BA.5 |
| intergenic | V774V BA.5 |
| intergenic | T796T BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | P820L BA.5 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | N869N BA.5 |
| intergenic | F871F BA.5 |
| intergenic | T882I BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | T891I BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| ORF1a | D930Y / NSP3 |
| intergenic | D930Y BA.5 |
| intergenic | P971L BA.5 |
| intergenic | T1001I BA.2.12,BA.5.1.10 |
| ORF1a | S1102R / NSP3 |
| intergenic | S1102R BA.5 |
| intergenic | H1141Y BA.5 |
| intergenic | P1213L BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | D1273D BA.5 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | Y1337Y BA.5 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | F1353fs BA.5.1.10,BA.5 |
| intergenic | A1397A BA.2.12,BA.5 |
| intergenic | L1438L BA.1.14,BA.5.2.2 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | T1444A BA.5 |
| intergenic | G1456G BA.5 |
| intergenic | N1487N BA.5 |
| intergenic | H1500Y BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | Y1658Y BA.5.2.3,BA.5 |
| ORF1a | M1771V / NSP3 |
| intergenic | M1771V BA.5 |
| intergenic | P1786L BA.5 |
| intergenic | C1847C BA.5 |
| intergenic | Y1868Y BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | L1896L BA.5 |
| intergenic | V1915I BA.5 |
| intergenic | N1922N BA.5 |
| intergenic | H1974Y BA.5 |
| intergenic | T2007T BA.5 |
| intergenic | M2096L BA.5 |
| ORF1a | T2197I / NSP3 |
| intergenic | V2238V BA.5 |
| intergenic | I2244I BA.5 |
| ORF1a | F2328L / NSP3 |
| intergenic | F2328L BA.5 |
| intergenic | P2376P BA.5 |
| intergenic | Y2560Y BA.5 |
| intergenic | A2584V BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | S2625S BA.4,BA.5.2.3 |
| intergenic | A2637T BA.5 |
| intergenic | L2675L BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | A2710T BA.2.86.1,BA.1.14,BA.1.17,BA.5 |
| ORF1a | P2739P / NSP3 |
| intergenic | P2739P BA.5 |
| intergenic | M2796I BA.5.1.10,BA.5 |
| ORF1a | H2831H / NSP4 |
| intergenic | H2831H BA.5 |
| intergenic | P2870P BA.5.2.34,BA.5 |
| intergenic | N2894N BA.1.14,BA.5.1.10 |
| intergenic | S2900L BA.5 |
| intergenic | S2992S BA.5 |
| intergenic | F3018F BA.4,BA.5 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | Y3062Y BA.5 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | S3099L BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | A3209V BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | F3271F BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | H3327H BA.5 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5 |
| ORF1a | T3361T / NSP5 |
| intergenic | T3361T BA.5 |
| ORF1a | P3371T / NSP5 |
| intergenic | P3371T BA.5 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | P3395Y BA.5 |
| intergenic | G3437G BA.4,BA.5 |
| intergenic | P3504L BA.5 |
| intergenic | L3535L BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L3585L BA.5.1.10,BA.4,BA.5 |
| intergenic | F3604L BA.5 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | M3627I BA.5 |
| intergenic | A3645A BA.5 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | A3705A BA.5 |
| intergenic | L3796L BA.2.12,BA.5 |
| intergenic | L3828L BA.5 |
| intergenic | N3928N BA.5 |
| intergenic | N3937N BA.5 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | L4149L BA.5 |
| intergenic | N4173N BA.5 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24 |
| ORF1a | G4178V / NSP9 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | N4235N BA.4,BA.5 |
| intergenic | Y4283Y BA.5 |
| intergenic | L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | T4355I BA.5 |
| intergenic | A4357V BA.4,BA.5.2.3 |
| intergenic | K4377N BA.5 |
| intergenic | L4391F BA.5 |
| intergenic | G4417G BA.5 |
| intergenic | L4482F BA.5 |
| intergenic | K4483R BA.5 |
| ORF1b | L4519I / NSP12 |
| intergenic | L4519I BA.5 |
| intergenic | N4560N BA.5 |
| intergenic | Y4567Y BA.5 |
| intergenic | A4568A BA.5 |
| intergenic | T4638T BA.5 |
| intergenic | R4641S BA.5 |
| intergenic | T4654I BA.5 |
| intergenic | P4715F BA.5.2.2,BA.4,BA.5 |
| intergenic | P4715L BA.5.2.2,BA.4,BA.5 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | S4843S BA.5 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5 |
| intergenic | M4993I BA.5 |
| intergenic | N5020N BA.1.17,BA.5 |
| intergenic | T5036T BA.5 |
| intergenic | G5063C BA.5 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5 |
| intergenic | D5132Y BA.5 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| ORF1b | Y5180Y / NSP12 |
| intergenic | Y5180Y BA.5 |
| intergenic | H5208H BA.5 |
| ORF1b | Q5214L / NSP12 |
| intergenic | Q5214L BA.5 |
| intergenic | L5221F BA.5 |
| intergenic | Y5223Y BA.5 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | F5273F BA.5 |
| intergenic | D5302D BA.5 |
| intergenic | V5322V BA.5 |
| intergenic | C5332C BA.5 |
| intergenic | P5377S BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | S5490L BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | I5658V BA.5 |
| intergenic | V5672L BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | P5726P BA.5 |
| intergenic | F5746F BA.2.12,BA.5.2.3 |
| intergenic | I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24 |
| intergenic | T5805M BA.5 |
| intergenic | R5826R BA.5 |
| ORF1b | A5926S / NSP14 |
| intergenic | A5926S BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | T5956I BA.5.2.2,BA.5 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | D5973N BA.5 |
| intergenic | E6017E BA.5 |
| intergenic | A6044V BA.5 |
| ORF1b | P6083L / NSP14 |
| intergenic | P6083L BA.5 |
| intergenic | P6222L BA.5 |
| intergenic | D6249D BA.5 |
| intergenic | D6256D BA.5.2.2,BA.5 |
| ORF1b | S6282N / NSP14 |
| intergenic | S6282N BA.5 |
| intergenic | D6315G BA.5 |
| intergenic | DRYP6315EGCH BA.2.12,BA.5 |
| intergenic | Y6317Y BA.5 |
| intergenic | N6335N BA.5 |
| intergenic | L6393L BA.5 |
| intergenic | L6420L BA.5 |
| intergenic | M6425T BA.5 |
| intergenic | N6446N BA.4.1.8,BA.5 |
| intergenic | D6491N BA.5 |
| intergenic | L6509L BA.5 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | V6573V BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | D6576D BA.5 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | G6598S BA.5 |
| intergenic | F6628F BA.5 |
| intergenic | G6738C BA.5 |
| intergenic | S6760S BA.5 |
| intergenic | T6777I BA.5 |
| intergenic | L6797L BA.5 |
| intergenic | A6832V BA.5 |
| intergenic | R6884K BA.5 |
| intergenic | L6924F BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | T6938I BA.2.12,BA.5 |
| intergenic | G6953G BA.4.1.8,BA.5 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | F6985F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | A6997A BA.4,BA.5 |
| intergenic | L7070S BA.5 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | S12_T20del BA.5 |
| S | S12_T20del BA.5 |
| intergenic | T19I BA.5 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | D53D BA.5 |
| intergenic | S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | H69del BA.1.14,BA.1.17,BA.5 |
| intergenic | V70del BA.1.14,BA.1.17,BA.5 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | V127F BA.2.86.1,BA.5.2.2 |
| intergenic | D138_Y144del BA.5 |
| intergenic | G142D BA.5 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.5 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34 |
| intergenic | H146Y BA.5 |
| intergenic | H146H BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | S172S BA.5 |
| S | S172S BA.5 |
| intergenic | V213E BA.5.1.10,BA.5 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | I231T BA.5 |
| intergenic | P251H BA.5 |
| intergenic | S255F BA.5 |
| intergenic | P272L BA.5 |
| intergenic | D294D BA.5.1.10,BA.5 |
| intergenic | L296L BA.5.2.2,BA.5 |
| intergenic | T299I BA.5 |
| intergenic | K304K BA.5 |
| S | K304K BA.5 |
| intergenic | F306L BA.5 |
| S | F306L BA.5 |
| intergenic | V327V BA.5 |
| S | V327V BA.5.5,BA.5 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | R346S BA.4,BA.5.2.3 |
| intergenic | N354N BA.5 |
| intergenic | R357K BA.5 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | R403K BA.2.86.1,BA.5 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | C432C BA.5 |
| intergenic | N440K BA.5 |
| intergenic | N440R BA.5 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | K444R BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | VG445AS BA.5 |
| intergenic | N448S BA.2.12,BA.5 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | N460S BA.5 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5 |
| intergenic | ST477DK BA.5 |
| S | ST477DK BA.5 |
| intergenic | ST477NK BA.5 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | E484A BA.5 |
| intergenic | VE483RA BA.5 |
| S | VE483RA BA.5 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.5.2.3 |
| intergenic | T547I BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | N603N BA.4.1.8,BA.5.1.10 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | T618T BA.1.14,BA.5.2.3 |
| intergenic | L629V BA.5 |
| S | L629V BA.5 |
| S | L629L BA.5.1.24,BA.5.5,BF.9 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | P665P BA.5 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | A684V BA.5 |
| intergenic | A688V BA.5.2.34,BA.5 |
| intergenic | V736I BA.5 |
| S | V736I BA.5 |
| intergenic | T739T BA.5 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | A879A BA.5 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | N960N BA.5 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| S | V1133V BA.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | P1143S BA.5 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | D1153Y BA.5 |
| intergenic | P1162S BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | E1202Q BA.4.1.8,BA.5.2.3 |
| intergenic | M5T BA.5 |
| intergenic | I20I BA.1.17,BA.5.1.24 |
| intergenic | A23S BA.5 |
| intergenic | D27Y BA.4.1.8,BA.5 |
| intergenic | V55A BA.5 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | L71L BA.5 |
| intergenic | H78Y BA.2.12,BA.5.2.34 |
| intergenic | Y91Y BA.5 |
| intergenic | A99T BA.5 |
| intergenic | L106L BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | V112V BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | C148C BA.5.1.10,BA.5 |
| intergenic | T170T BA.5 |
| intergenic | E194G BA.5 |
| intergenic | Y206Y BA.4,BA.5 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | S272S BA.5 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | V17V BA.5 |
| intergenic | L73L BA.5 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | L56L BA.4,BA.5 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | L102L BA.5 |
| intergenic | L124L BA.2.12,BA.4,BA.5 |
| intergenic | H125Y BA.5 |
| intergenic | H148H BA.5.1.24,BA.5 |
| M | H148H BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | T172T BA.5 |
| intergenic | Y179Y BA.5.2.2,BA.5 |
| intergenic | L29L BA.5 |
| intergenic | Y31Y BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3 |
| intergenic | X62fs BA.5 |
| ORF6 | X62fs BA.5 |
| intergenic | g.-7_-4delAACG BA.5 |
| ORF6 | g.-7_-4delAACG BA.5 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | g.C-1T BA.5 |
| intergenic | T11K BA.5 |
| intergenic | C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | T28I BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | H47N BA.5 |
| intergenic | Q62X BA.5 |
| intergenic | V74I BA.5 |
| ORF7a | V74I BA.5.2.20,BA.5 |
| intergenic | Y75C BA.5 |
| intergenic | P84L BA.5.2.2,BA.4,BA.5 |
| intergenic | L116L BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | Q35K BA.5 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | H17H BA.5.2.34,BA.5 |
| intergenic | Q18X BA.5 |
| intergenic | P36L BA.5 |
| intergenic | P36P BA.1.14,BA.5.2.34 |
| intergenic | E59E BA.5 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5 |
| intergenic | I71T BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| ORF8 | H112H BA.2.3,BA.5.1.30 |
| intergenic | I121fs BA.5 |
| intergenic | g.A-3T BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | g.CTA-5_-3TTT BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | G5E BA.5 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | G25V BA.5 |
| N | G25V BA.5 |
| intergenic | N27N BA.5 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | G30_S33delinsF BA.4,BA.5 |
| intergenic | T49I BA.5 |
| intergenic | K65R BA.5 |
| intergenic | P67L BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | D82D BA.5 |
| intergenic | Y86Y BA.2.12,BA.5.2.3 |
| intergenic | A119S BA.5 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3 |
| intergenic | H145H BA.5 |
| intergenic | P151S BA.4,BA.5 |
| intergenic | P151L BA.5 |
| intergenic | I157I BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | L161F BA.5 |
| intergenic | G175G BA.2.12,BA.5.2.3 |
| intergenic | P199S BA.5 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | L219F BA.5 |
| intergenic | G243G BA.5 |
| intergenic | T245I BA.5.2.2,BA.5.1.24 |
| intergenic | E253E BA.5 |
| intergenic | Y268Y BA.5.1.10,BA.5 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5 |
| N | Q289Q BA.5.1.24,BA.5.1.30 |
| intergenic | H300H BA.5 |
| intergenic | P302S BA.5 |
| intergenic | D341D BA.4.1.8,BA.5 |
| intergenic | Y360Y BA.5.2.2,BA.5.2.3 |
| intergenic | T366T BA.5 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | V6I BA.5 |
| intergenic | P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | M21I BA.5 |
| ORF10 | M21I BA.5 |
| intergenic | S23F BA.5 |
| intergenic | R24C BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | g.T29685G BA.5 |
| intergenic | g.G29692T BA.5 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAG BA.5 |
| intergenic | g.C-80T BA.5.1.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | E36E BA.5.1.1 |
| intergenic | G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.1 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | V111A BA.5.1.1 |
| intergenic | V121F BA.5.1.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | I222V BA.5.1.1 |
| intergenic | S279F BA.5.1.1 |
| intergenic | S318L BA.5.1.1 |
| intergenic | P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | A498V BA.5.1.1 |
| intergenic | A599A BA.5.1.1 |
| intergenic | V606V BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | G618S BA.5.1.1 |
| intergenic | T727I BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | G817G BA.5.1.1 |
| intergenic | IT841VI BA.5.1.1 |
| intergenic | T842I BA.5.1.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5 |
| intergenic | T882I BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | E929E BA.5.1.1 |
| intergenic | T1001I BA.2.12,BA.5.1.10 |
| ORF1a | K1124Q / NSP3 |
| intergenic | K1124Q BA.5.1.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| ORF1a | Y1536C / NSP3 |
| intergenic | Y1536C BA.5.1.1 |
| intergenic | S1743F BA.5.1.1 |
| ORF1a | M2254R / NSP3 |
| intergenic | M2254R BA.5.1.1 |
| intergenic | T2274I BA.5.1.1 |
| intergenic | D2299D BA.4,BA.5.1.1 |
| intergenic | A2325A BA.5.1.1 |
| intergenic | L2524S BA.5.1.1 |
| intergenic | S2631S BA.5.1.1 |
| intergenic | A2784V BA.5.1.1 |
| intergenic | N2894N BA.1.14,BA.5.1.10 |
| intergenic | V3024I BA.5.1.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | L3430L BA.5.1.1 |
| intergenic | D3439D BA.5.2.34,BA.5.1.1 |
| intergenic | T3459T BA.5.1.1 |
| intergenic | L3495F BA.5.1.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5 |
| ORF1a | A3625T / NSP6 |
| intergenic | A3625T BA.5.1.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | V3708V BA.5.1.1 |
| intergenic | I3853I BA.5.1.10,BA.5.1.1 |
| intergenic | N3896N BA.5.1.1 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| ORF1a | T4079I / NSP8 |
| intergenic | T4079I BA.5.1.1 |
| intergenic | T4083M BA.5.1.1 |
| intergenic | G4178V BA.5.1.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | P4220L BA.5.1.24,BA.5.1.1 |
| intergenic | N4235N BA.4,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | V4372I BA.5.1.1 |
| ORF1a | M4390T / NSP10 |
| intergenic | M4390T BA.5.1.1 |
| intergenic | L4639L BA.5.1.1 |
| intergenic | T4640T BA.5.1.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1 |
| intergenic | Y4871Y BA.5.1.1 |
| ORF1b | L4906F / NSP12 |
| intergenic | L4906F BA.5.1.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | N5182N BA.5.1.1 |
| intergenic | A5660T BA.5.1.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | V6016V BA.5.1.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | H6686Y BA.5.1.1 |
| ORF1b | Q6696R / NSP15 |
| intergenic | Q6696R BA.5.1.1 |
| intergenic | V6772L BA.5.2.2,BA.5.1.1 |
| intergenic | P6860P BA.5.1.1 |
| intergenic | T6918I BA.5.1.1 |
| intergenic | L6924F BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | A6997A BA.4,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | G7011N BA.5.1.1 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | D53D BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1 |
| intergenic | G72G BA.5.1.1 |
| intergenic | D80H BA.5.1.1 |
| intergenic | D80D BA.5.1.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1 |
| intergenic | H146del BA.5.1.1 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | D215H BA.5.1.1 |
| intergenic | G261V BA.5.1.1 |
| intergenic | I285I BA.5.1.1 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | F543F BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.5.2.3 |
| intergenic | N603N BA.4.1.8,BA.5.1.10 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | Q690L BA.5.1.1 |
| S | Q690L BA.5.1.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | A846A BA.5.1.1 |
| intergenic | R847K BA.5.1.1 |
| S | R847K BA.5.1.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | I1169I BA.5.1.1 |
| intergenic | E1195E BA.5.1.1 |
| S | E1195E BA.5.1.1 |
| intergenic | Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1 |
| intergenic | C1236S BA.5.1.1 |
| S | C1236S BA.5.1.1 |
| intergenic | S1252P BA.5.1.1 |
| intergenic | K21N BA.5.1.10,BA.5.1.1 |
| intergenic | V48F BA.5.1.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | L94I BA.5.1.24,BA.5.1.1 |
| intergenic | L95F BA.5.1.1 |
| intergenic | L106L BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | V25V BA.5.1.24,BA.5.1.1 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | L124L BA.2.12,BA.4,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | H125Y BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | V143V BA.5.1.1 |
| intergenic | g.C-6T BA.5.1.1 |
| intergenic | L16L BA.5.1.1 |
| intergenic | C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | T39I BA.5.1.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | I71T BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | Y105Y BA.5.1.1 |
| intergenic | I121fs BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | D22G BA.5.1.1 |
| intergenic | G25D BA.5.1.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | P67L BA.2.12,BA.5.1.10 |
| intergenic | A182T BA.5.1.1 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | H300Y BA.5.1.1 |
| intergenic | F315F BA.5.1.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | R24C BA.5.2.2,BA.5.1.10 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | A735A BA.1.14,BA.1.18 |
| intergenic | K856R BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | A964A BA.1.18 |
| intergenic | A1707A BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | N1709N BA.1.18 |
| intergenic | T1822I BA.1.18 |
| intergenic | S2083_L2084delinsI BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | A2710T BA.2.86.1,BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18 |
| intergenic | L3180L BA.2.12,BA.4,BA.1.18 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | P3395H BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | L3674_G3676del BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | I3758V BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | V4310V BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| ORF1b | P6519S / NSP15 |
| intergenic | P6519S BA.1.18 |
| intergenic | V11V BA.5.2.34,BA.1.18 |
| intergenic | H69del BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18 |
| intergenic | V70del BA.1.14,BA.1.17,BA.5,BA.1.18 |
| intergenic | T95I BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | G142_Y145delinsD BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | N211_L212delinsI BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | R214_D215insEPE BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | R346K BA.1.18 |
| intergenic | S371L BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | S375F BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | G446S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | Q493R BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | G496S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | T547K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | N856K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | L981F BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | D155Y BA.1.18 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | D3G BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18 |
| intergenic | R24L BA.1.18 |
| intergenic | g.C29774T BA.1.18 |
| intergenic | g.C-49T BA.5.2.8 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | G49C BA.5.2.8 |
| intergenic | G49D BA.5.1.24,BA.5,BA.5.2.8 |
| intergenic | G82_V86del BA.5.2.8 |
| intergenic | M85_E87delinsK BA.5.2.8 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | G137G BA.5.2.8 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | V378I BA.4,BA.5.2.8 |
| intergenic | N449N BA.5.2.8 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | V459V BA.5.2.8 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8 |
| intergenic | E913G BA.5.2.8 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | H1108H BA.5.2.8 |
| intergenic | H1141Y BA.5,BA.5.2.8 |
| intergenic | Q1227Q BA.5.2.8 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | F1353fs BA.5.1.10,BA.5,BA.5.2.8 |
| intergenic | T1597T BA.5.2.8 |
| intergenic | K1781K BA.5.2.8 |
| intergenic | P1786S BA.5.2.8 |
| intergenic | V1931V BA.5.2.8 |
| intergenic | S1978F BA.5.2.8 |
| intergenic | A2033V BA.5.2.3,BA.5.2.8 |
| intergenic | S2242F BA.5.2.34,BA.5.2.8 |
| intergenic | D2299D BA.4,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | T2335T BA.5.2.8 |
| intergenic | N2678N BA.5.2.8 |
| intergenic | L2869F BA.5.2.8 |
| intergenic | G2941S BA.5.2.8 |
| intergenic | S2960P BA.5.2.8 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | L3198L BA.2.12,BA.5.2.8 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | T3258T BA.5.2.8 |
| intergenic | F3271F BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | D3479D BA.5.2.8 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | I3738I BA.5.2.8 |
| intergenic | Y3803Y BA.2.12,BA.5.2.8 |
| intergenic | A3856A BA.5.2.8 |
| intergenic | L3887L BA.5.2.8 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | L3984L BA.5.2.8 |
| intergenic | Q4015Q BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8 |
| intergenic | L4037F BA.5.2.8 |
| ORF1a | Q4151R / NSP9 |
| intergenic | Q4151R BA.5.2.8 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | V4372V BA.5.2.8 |
| intergenic | K4483N BA.5.2.8 |
| intergenic | Y4555Y BA.5.2.8 |
| intergenic | T4617T BA.5.2.8 |
| intergenic | T4638T BA.5,BA.5.2.8 |
| ORF1b | D4661D / NSP12 |
| intergenic | D4661D BA.5.2.8 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | T4786M BA.5.2.8 |
| ORF1b | G5062V / NSP12 |
| intergenic | G5062V BA.5.2.8 |
| intergenic | Y5140Y BA.5.2.8 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | T5195I BA.5.2.8 |
| intergenic | L5349L BA.5.2.8 |
| intergenic | P5371L BA.5.1.10,BA.5.2.8 |
| intergenic | T5451N BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8 |
| intergenic | R5453K BA.5.2.8 |
| intergenic | K5463K BA.5.2.8 |
| intergenic | A5620S BA.5.2.8 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | D5725D BA.5.2.8 |
| intergenic | I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5.2.8 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | D6051D BA.5.2.8 |
| ORF1b | F6108L / NSP14 |
| intergenic | F6108L BA.5.2.8 |
| ORF1b | I6200T / NSP14 |
| intergenic | I6200T BA.5.2.8 |
| ORF1b | V6207C / NSP14 |
| intergenic | V6207C BA.5.2.8 |
| intergenic | N6347N BA.5.2.8 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | L6614F BA.5.2.8 |
| ORF1b | M6670K / NSP15 |
| intergenic | M6670K BA.5.2.8 |
| ORF1b | L6697L / NSP15 |
| intergenic | L6697L BA.5.2.8 |
| intergenic | Y6794Y BA.5.2.8 |
| intergenic | L6819L BA.5.2.2,BA.5.2.8 |
| intergenic | L6898F BA.5.2.8 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | F59S BA.5.2.8 |
| intergenic | S60S BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.8 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | L84L BA.5.2.8 |
| intergenic | K97N BA.5.2.8 |
| intergenic | V130V BA.5.2.8 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | E180G BA.5.2.8 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | P631P BA.5.2.8 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | N658D BA.5.2.8 |
| S | N658D BA.5.2.8 |
| intergenic | P665P BA.5,BA.5.2.8 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | F855F BA.5.2.8 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | A1020S BA.4,BA.5.2.8 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | A51T BA.5.2.8 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | P138P BA.5.2.8 |
| intergenic | S180P BA.5.2.8 |
| ORF3a | S180P BA.5.2.8 |
| intergenic | Y211Y BA.5.2.8 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | I249I BA.5.2.8 |
| intergenic | P258L BA.5.2.8 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | M84V BA.5.2.8 |
| M | M84V BA.5.2.8 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8 |
| intergenic | V122V BA.5.2.8 |
| intergenic | P132P BA.5.2.8 |
| intergenic | L164L BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8 |
| intergenic | T21I BA.5.2.8 |
| intergenic | P34L BA.5.2.8 |
| intergenic | S36_T39del BA.5.2.8 |
| ORF7a | S36_T39del BA.5.2.8 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.8 |
| intergenic | D69D BA.1.14,BA.5.2.8 |
| intergenic | H73Y BA.5.1.24,BA.5.2.8 |
| intergenic | L77S BA.5.2.8 |
| intergenic | P99S BA.5.2.8 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | C25S BA.5.2.8 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8 |
| intergenic | S194L BA.5.2.8 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | K248K BA.5.2.8 |
| N | K248K BA.5.2.8 |
| intergenic | A376A BA.5.2.8 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | P10S BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5.2.8 |
| intergenic | g.C29696T BA.5.2.8 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | G82_M85delinsV BF.20 |
| intergenic | G112G BF.20 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| ORF1a | T677A / NSP2 |
| intergenic | T677A BF.20 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| ORF1a | D978N / NSP3 |
| intergenic | D978N BF.20 |
| ORF1a | S984I / NSP3 |
| intergenic | S984I BF.20 |
| intergenic | K1231E BF.20 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | P1921S BF.20 |
| intergenic | V2238V BA.5,BF.20 |
| ORF1a | T2274N / NSP3 |
| intergenic | T2274N BF.20 |
| intergenic | G2987G BF.20 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | D5271G BF.20 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10,BF.20 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | T172T BA.5,BF.20 |
| intergenic | P57L BF.20 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | A419A BF.20 |
| intergenic | g.C29686G BF.20 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | H13Y BA.5.1.2 |
| intergenic | L16L BA.5.1.2 |
| intergenic | S17_L18delinsM BA.5.1.2 |
| intergenic | M85del BA.5.1.2 |
| intergenic | M85del BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | P153L BA.5.1.2 |
| intergenic | S166G BA.5.1.2 |
| intergenic | V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | P271S BA.5.1.2 |
| intergenic | P309Q BA.5.1.2 |
| intergenic | G334C BA.5.1.2 |
| ORF1a | K394N / NSP2 |
| intergenic | K394N BA.5.1.2 |
| intergenic | L446F BA.5.1.2 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L580F BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | A591V BA.5.1.10,BA.5.1.2 |
| intergenic | V665V BA.5.1.2 |
| intergenic | A698V BA.5.1.2 |
| intergenic | F741F BA.5.1.2 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | A872A BA.5.1.2 |
| intergenic | T891I BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | A967S BA.5.1.2 |
| intergenic | P971L BA.5,BA.5.1.2 |
| intergenic | L1097L BA.5.1.2 |
| intergenic | G1155C BA.5.1.2 |
| intergenic | I1203I BA.5.1.2 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | Y1337Y BA.5,BA.5.1.2 |
| intergenic | K1350R BA.5.1.2 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | F1353fs BA.5.1.10,BA.5,BA.5.2.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | L1445L BA.5.1.2 |
| intergenic | L1643L BA.5.1.2 |
| intergenic | T1760I BA.5.1.2 |
| intergenic | C1847C BA.5,BA.5.1.2 |
| intergenic | Y1868Y BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | D2101D BA.5.1.24,BA.5.1.2 |
| intergenic | T2183I BA.5.1.2 |
| ORF1a | T2197I / NSP3 |
| intergenic | T2197I BA.5.1.2 |
| intergenic | S2242F BA.5.2.34,BA.5.2.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | C2445C BA.4.1.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | N2523N BA.5.1.2 |
| ORF1a | G2842G / NSP4 |
| intergenic | G2842G BA.5.1.2 |
| intergenic | G2871G BA.5.1.2 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | N3029N BA.5.1.2 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | N3239N BA.5.1.2 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | S3273S BA.5.1.2 |
| intergenic | N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | K3351R BA.5.1.2 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | P3359S BA.5.1.10,BA.5.1.2 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | L3535L BA.2.12,BA.5.1.24 |
| ORF1a | M3539I / NSP5 |
| intergenic | M3539I BA.5.1.2 |
| intergenic | F3568F BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | A3615V BA.5.1.2 |
| intergenic | D3671D BA.5.1.2 |
| intergenic | T3672N BA.5.1.2 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2 |
| intergenic | L3919F BA.5.1.2 |
| intergenic | D3936D BA.5.1.2 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D4020D BA.5.1.2 |
| intergenic | T4083M BA.5.1.1,BA.5.1.2 |
| intergenic | Y4172Y BA.5.1.2 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | T4217I BA.5.1.2 |
| intergenic | L4284L BA.2.12,BA.4,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A4396V BA.5.1.2 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D4769D BA.5.1.24,BA.5.1.2 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2 |
| ORF1b | L5055L / NSP12 |
| intergenic | L5055L BA.5.1.2 |
| intergenic | D5130D BA.5.1.24,BA.5.1.2 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | Y5220Y BA.5.2.34,BA.5.1.2 |
| intergenic | A5232A BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.2 |
| ORF1b | M5298I / NSP12 |
| intergenic | M5298I BA.5.1.2 |
| intergenic | P5377S BA.4,BA.5.1.24 |
| ORF1b | T5385N / NSP13 |
| intergenic | T5385N BA.5.1.2 |
| intergenic | Y5388Y BA.2.12,BA.5.1.2 |
| intergenic | S5404G BA.5.1.2 |
| intergenic | S5490L BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | T5538I BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.1.24 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2 |
| intergenic | S5701S BA.5.1.2 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | I5804I BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5.2.8 |
| intergenic | V5819V BA.5.2.3,BA.5.1.2 |
| intergenic | P5828S BA.5.2.34,BA.5.1.2 |
| intergenic | T5871A BA.5.1.2 |
| ORF1b | A5926S / NSP14 |
| intergenic | A5926S BA.2.12,BA.5.1.24 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D6270G BA.5.1.2 |
| intergenic | P6376S BA.5.1.2 |
| intergenic | N6443N BA.5.1.2 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | E6597D BA.5.1.2 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | V6638V BA.5.1.2 |
| intergenic | H6686Y BA.5.1.1,BA.5.1.2 |
| intergenic | L6819L BA.5.2.2,BA.5.2.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | A6914V BA.5.1.2 |
| intergenic | D6931D BA.5.1.2 |
| intergenic | F6985F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5 |
| intergenic | L5F BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.1,BA.5.1.2 |
| intergenic | T19I BA.5.2.2,BA.5.1.2 |
| intergenic | T19L BA.5.2.2,BA.5.1.2 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | T29I BA.5.1.2 |
| intergenic | F32F BA.5.1.10,BA.5.1.2 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | V83V BA.5.1.10,BA.5.1.2 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D178N BA.5.1.2 |
| intergenic | F186F BA.5.1.2 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | S256L BA.5.1.2 |
| intergenic | T299I BA.5,BA.5.1.2 |
| intergenic | T307I BA.5.1.2 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D427D BA.5.1.2 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | N450I BA.5.1.2 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | P621P BA.5.1.2 |
| S | P621P BA.5.1.2 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D936D BA.5.1.2 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | T9K BA.5.1.2 |
| intergenic | I20I BA.1.17,BA.5.1.24 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | L73L BA.5.1.2 |
| intergenic | S177I BA.5.1.2 |
| intergenic | F207F BA.5.1.2 |
| intergenic | Y211C BA.5.1.2 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | P240L BA.5.1.2 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | L19L BA.5.1.2 |
| intergenic | S55F BA.5.1.2 |
| intergenic | N66N BA.5.1.2 |
| intergenic | AD2VN BA.5.1.2 |
| intergenic | D3N BA.5.1.2 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | L35L BA.5.2.2,BA.5.1.10,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | L93L BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.8 |
| intergenic | V5I BA.5.1.24,BA.5.1.2 |
| intergenic | L16L BA.5.1.1,BA.5.1.2 |
| intergenic | g.C-5T BA.4,BA.5.1.24 |
| intergenic | C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2 |
| intergenic | L31L BA.5.1.2 |
| intergenic | F54L BA.5.1.2 |
| intergenic | L86L BA.5.1.2 |
| intergenic | L116F BA.4.1.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | A51V BA.5.1.2 |
| intergenic | S69P BA.5.1.2 |
| intergenic | P70T BA.5.1.2 |
| ORF8 | P70T BA.5.1.2 |
| intergenic | S103L BA.5.1.2 |
| intergenic | E106X BA.5.1.2 |
| intergenic | F120F BA.5.1.2 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | T54T BA.5.1.2 |
| intergenic | S78S BA.5.1.2 |
| intergenic | G114G BA.5.1.2 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | N140N BA.5.1.2 |
| intergenic | A152S BA.5.1.10,BA.5.1.2 |
| intergenic | A155V BA.5.2.34,BA.5.1.2 |
| intergenic | G178G BA.5.1.2 |
| intergenic | S197S BA.5.1.2 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | T245I BA.5.2.2,BA.5.1.24 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2 |
| intergenic | g.G-5T BA.5.1.2 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2 |
| intergenic | g.G29706A BA.5.1.2 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| ORF1a | L204L / NSP2 |
| intergenic | L204L BF.41 |
| intergenic | S443F BA.5.2.2,BF.41 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S944L BF.41 |
| intergenic | N1094_G1095delinsR BF.41 |
| intergenic | P1158S BF.41 |
| intergenic | I1232I BF.41 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | H1818Y BF.41 |
| intergenic | S2389L BF.41 |
| intergenic | Y2560Y BA.5,BF.41 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | F3329F BF.41 |
| intergenic | P3371S BF.41 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | L3591I BF.41 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| ORF1b | F4834fs / NSP12 |
| intergenic | F4834fs BF.41 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | F5958F BF.41 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | Y5989Y BF.41 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | G257V BF.41 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | N777N BF.41 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | H1101Y BF.41 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | K192K BF.41 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | T172T BA.5,BF.20,BF.41 |
| ORF6 | A12V BF.41 |
| intergenic | D61D BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.3,BF.41 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | A43V BF.41 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | V62L BF.41 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41 |
| intergenic | S21S BF.41 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S193T BF.41 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | g.CGTC-25_-22TGTT BF.9 |
| intergenic | V35V BF.9 |
| intergenic | G133G BF.9 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | V186V BA.2.12,BA.5.1.24,BA.5,BF.9 |
| intergenic | D264D BF.9 |
| intergenic | S302F BA.5.1.24,BF.9 |
| intergenic | L454L BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9 |
| intergenic | I473I BA.5.2.3,BF.9 |
| intergenic | I502V BF.9 |
| intergenic | A516V BF.9 |
| intergenic | M584V BA.5.2.3,BF.9 |
| intergenic | V606I BF.9 |
| intergenic | I616I BF.9 |
| ORF1a | P777L / NSP2 |
| intergenic | P777L BF.9 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| ORF1a | T1001N / NSP3 |
| intergenic | T1001N BF.9 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | E1340D BF.9 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | T1521I BF.9 |
| ORF1a | F1527L / NSP3 |
| intergenic | F1527L BF.9 |
| intergenic | T1543I BF.9 |
| intergenic | T1597I BF.9 |
| ORF1a | V1661V / NSP3 |
| intergenic | V1661V BF.9 |
| intergenic | T1665T BF.9 |
| intergenic | G1764S BF.9 |
| intergenic | Y1873Y BA.5.1.10,BF.9 |
| ORF1a | S2048Y / NSP3 |
| intergenic | S2048Y BF.9 |
| intergenic | G2091G BF.9 |
| intergenic | D2101D BA.5.1.24,BA.5.1.2,BF.9 |
| intergenic | S2103F BA.2.86.1,BF.9 |
| intergenic | S2193F BF.9 |
| intergenic | V2238V BA.5,BF.20,BF.9 |
| ORF1a | R2267K / NSP3 |
| intergenic | R2267K BF.9 |
| intergenic | G2322G BF.9 |
| intergenic | V2324F BF.9 |
| ORF1a | A2733A / NSP3 |
| intergenic | A2733A BF.9 |
| intergenic | S2803L BF.9 |
| intergenic | A2856V BF.9 |
| intergenic | R2985R BF.9 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | F3100F BA.5.2.3,BF.9 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | N3291N BA.1.17,BA.4,BA.5.1.2,BF.9 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| ORF1a | Q3596H / NSP6 |
| intergenic | Q3596H BF.9 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9 |
| intergenic | L3644F BF.9 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| ORF1a | V3708L / NSP6 |
| intergenic | V3708L BF.9 |
| intergenic | F3785F BF.9 |
| intergenic | Y3813Y BF.9 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | D4317D BF.9 |
| intergenic | P4619L BF.9 |
| intergenic | T4638I BF.9 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | D4769D BA.5.1.24,BA.5.1.2,BF.9 |
| intergenic | P4897P BF.9 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | Y5276Y BF.9 |
| intergenic | A5342V BA.4,BF.9 |
| intergenic | A5532V BF.9 |
| intergenic | A5713V BF.9 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | A5727S BF.9 |
| ORF1b | T5873A / NSP13 |
| intergenic | T5873A BF.9 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | T6038I BF.9 |
| ORF1b | V6241F / NSP14 |
| intergenic | V6241F BF.9 |
| ORF1b | P6545P / NSP15 |
| intergenic | P6545P BF.9 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| ORF1b | D6734Y / NSP15 |
| intergenic | D6734Y BF.9 |
| intergenic | S6740F BF.9 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | F55F BF.9 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | H146H BA.2.12,BA.5.2.34,BF.9 |
| intergenic | N185S BF.9 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | P272S BF.9 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | L629L BA.5.1.24,BF.9 |
| S | L629L BA.5.1.24,BA.5.5,BF.9 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | T734T BF.9 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | R847R BF.9 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | S967S BF.9 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | G1124V BF.9 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | N1192D BF.9 |
| intergenic | Q57H BF.9 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | L73F BF.9 |
| intergenic | L94F BA.4,BF.9 |
| intergenic | L101L BF.9 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | g.T-26C BF.9 |
| intergenic | g.A-9G BF.9 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | N41N BF.9 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | T172T BA.5,BF.20,BF.41,BF.9 |
| intergenic | V29A BF.9 |
| intergenic | Y40Y BA.5.2.34,BA.5.2.3,BF.9 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | W29L BF.9 |
| intergenic | E33G BF.9 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | C37R BF.9 |
| ORF8 | C37R BF.9 |
| intergenic | I121fs BA.5,BA.5.1.1,BF.9 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | G19G BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9 |
| intergenic | T24I BA.5.2.34,BF.9 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | N126N BF.9 |
| intergenic | N140N BA.5.1.2,BF.9 |
| intergenic | H145L BF.9 |
| N | H145L BF.9 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | S235S BF.9 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9 |
| intergenic | S327L BF.9 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9 |
| intergenic | g.T29680C BF.9 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1 |
| intergenic | N162N BA.4.1 |
| intergenic | S166G BA.5.1.2,BA.4.1 |
| intergenic | N188N BA.4.1.8,BA.4.1 |
| intergenic | D220D BA.5.1.24,BA.4.1 |
| intergenic | C231C BA.4.1 |
| intergenic | T333M BA.4.1 |
| intergenic | G442C BA.4.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1 |
| ORF1a | R542R / NSP2 |
| intergenic | R542R BA.4.1 |
| intergenic | V627F BA.5,BA.4.1 |
| intergenic | L642F BA.4.1 |
| ORF1a | K669T / NSP2 |
| intergenic | K669T BA.4.1 |
| intergenic | Y717Y BA.5,BA.4.1 |
| intergenic | A776T BA.4.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | P971S BA.5.1.10,BA.4.1 |
| intergenic | T1035I BA.4.1 |
| intergenic | N1059N BA.4.1 |
| intergenic | A1060V BA.4.1 |
| intergenic | G1125D BA.4.1.8,BA.4.1 |
| intergenic | H1160Y BA.4.1.8,BA.4.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | P1541P BA.4.1 |
| ORF1a | N1672N / NSP3 |
| intergenic | N1672N BA.4.1 |
| intergenic | Y1700Y BA.4.1 |
| intergenic | P1803L BA.4.1 |
| intergenic | T1822I BA.1.18,BA.4.1 |
| intergenic | N1917N BA.4.1 |
| intergenic | H1974H BA.4.1 |
| ORF1a | S2048A / NSP3 |
| ORF1a | V2051L / NSP3 |
| intergenic | V2051L BA.4.1 |
| intergenic | A2139T BA.4.1 |
| ORF1a | T2283T / NSP3 |
| intergenic | T2283T BA.4.1 |
| ORF1a | T2300A / NSP3 |
| intergenic | T2300A BA.4.1 |
| intergenic | F2351F BA.4.1 |
| ORF1a | K2511K / NSP3 |
| intergenic | K2511K BA.4.1 |
| intergenic | K2810K BA.4.1 |
| intergenic | R2949R BA.4.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2,BA.4.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| ORF1a | N3159N / NSP4 |
| intergenic | N3159N BA.4.1 |
| intergenic | A3179A BA.4.1 |
| intergenic | L3191L BA.5.2.2,BA.4.1 |
| intergenic | Y3250Y BA.4.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | M3280I BA.4.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | L3321L BA.5.2.3,BA.4.1 |
| intergenic | A3333T BA.4.1 |
| intergenic | R3368R BA.5.1.10,BA.4,BA.5.1.1,BA.4.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | N3494N BA.4.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | L3636L BA.5.1.24,BA.4.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | T3750I BA.5.2.34,BA.4.1 |
| intergenic | G3757S BA.4.1 |
| ORF1a | L3808L / NSP6 |
| intergenic | L3808L BA.4.1 |
| intergenic | K3839K BA.4.1 |
| intergenic | D3864D BA.4.1 |
| intergenic | N3928N BA.5,BA.4.1 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | L4045L BA.4,BA.4.1 |
| intergenic | P4058P BA.4.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | T4412A BA.4.1 |
| intergenic | P4656S BA.4.1 |
| intergenic | R4677H BA.4.1 |
| intergenic | N4689N BA.4.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | F4820F BA.5.1.10,BA.4.1 |
| intergenic | S4843I BA.4.1 |
| intergenic | N4992N BA.1.14,BA.1.17,BA.5.2.34,BA.5,BA.1.18,BA.5.1.2,BA.4.1 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1 |
| intergenic | H5117H BA.4.1 |
| intergenic | T5131I BA.4.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | L5283L BA.4,BA.4.1 |
| intergenic | A5660T BA.5.1.1,BA.4.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | P6065S BA.4.1 |
| intergenic | D6069D BA.2.12,BA.4.1 |
| intergenic | L6102L BA.4.1 |
| intergenic | D6249D BA.5,BA.4.1 |
| ORF1b | D6270D / NSP14 |
| intergenic | D6270D BA.4.1 |
| intergenic | DRYP6315EGCH BA.2.12,BA.5,BA.4.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | D6724D BA.4.1 |
| intergenic | K6958R BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1 |
| intergenic | L6959L BA.4.1 |
| intergenic | P7034S BA.5.2.3,BA.4.1 |
| intergenic | I7035I BA.4.1 |
| intergenic | V3G BA.4.1.8,BA.4.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | H69del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | V70del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | T73T BA.2.12,BA.4.1 |
| intergenic | G107G BA.4.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | E484A BA.5,BA.4.1 |
| intergenic | VE483IA BA.4.1 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | Y508Y BA.4.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | T632T BA.4.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | A672V BA.4.1 |
| S | A672V BA.4.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | A701V BA.1.17,BA.4.1 |
| intergenic | T732T BA.4.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | N824N BA.4.1 |
| intergenic | D867D BA.4.1 |
| intergenic | S939F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | T1077T BA.4.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | E1182D BA.4.1 |
| S | E1182D BA.4.1 |
| intergenic | A1222A BA.4.1 |
| intergenic | L41F BA.4.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | Y189Y BA.4.1 |
| intergenic | E194E BA.4.1 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | F4F BA.4.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | TG9IC BA.4.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1 |
| intergenic | T175M BA.4.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1 |
| intergenic | E55K BA.4.1 |
| intergenic | P57P BA.4.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1 |
| intergenic | R25T BA.4.1 |
| intergenic | L31L BA.5.1.2,BA.4.1 |
| intergenic | K32N BA.4.1 |
| intergenic | P34L BA.5.2.8,BA.4.1 |
| intergenic | F46I BA.4.1 |
| ORF7a | F46I BA.4.1 |
| intergenic | A64S BA.4.1 |
| intergenic | Q76H BA.4.1 |
| intergenic | I110del BA.4.1 |
| intergenic | L11F BA.4,BA.4.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | A65V BA.4.1.8,BA.5,BA.4.1 |
| intergenic | Y105Y BA.5.1.1,BA.4.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | T54T BA.5.1.2,BA.4.1 |
| intergenic | L56L BA.4.1 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1 |
| intergenic | P151S BA.4.1.8,BA.4.1 |
| intergenic | S193T BF.41,BA.4.1 |
| intergenic | S202C BA.4.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | G212C BA.4.1 |
| N | G212C BA.4.1 |
| intergenic | M234I BA.4.1 |
| intergenic | P302P BA.5.2.34,BA.4.1 |
| intergenic | P309P BA.4.1 |
| intergenic | T362I BA.5.1.24,BA.4.1 |
| intergenic | A381T BA.4.1 |
| N | A381T BA.4.1 |
| intergenic | P383S BA.4.1 |
| intergenic | S410S BA.4.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1 |
| intergenic | I13T BA.4.1 |
| intergenic | C19C BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1 |
| intergenic | R24C BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAC BA.5.2.3,BA.5,BA.4.1 |
| intergenic | g.GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTAC29734TAT BA.5.2.3,BA.4.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | V14V BA.5.1.30 |
| intergenic | G82_M85delinsV BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | M85_V86del BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | V84V BA.5.1.30 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | N189N BA.5.1.10,BA.5.1.30 |
| intergenic | C341C BA.5.2.34,BA.5.1.30 |
| intergenic | P361P BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | F411F BA.5.1.30 |
| intergenic | N447S BA.5.1.30 |
| intergenic | I475V BA.5.1.30 |
| intergenic | S505S BA.4,BA.5.1.30 |
| intergenic | S549S BA.5.2.3,BA.5.1.30 |
| intergenic | T592I BA.5.1.30 |
| intergenic | A656V BA.1.14,BA.5.1.30 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | S918S BA.5.1.30 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | E939G BA.5.1.30 |
| ORF1a | T945N / NSP3 |
| intergenic | T945N BA.5.1.30 |
| intergenic | G1070V BA.5.1.30 |
| intergenic | A1082V BA.5.1.30 |
| intergenic | T1168I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.30 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L1438L BA.1.14,BA.5.2.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | N1439N BA.5.2.2,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.30 |
| intergenic | L1441L BA.5.1.30 |
| intergenic | L1627L BA.5.1.30 |
| intergenic | P1640L BA.5.1.24,BA.5.1.30 |
| intergenic | M1732I BA.5.1.30 |
| intergenic | S1743F BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | P1921S BF.20,BA.5.1.30 |
| intergenic | P1977P BA.5.1.30 |
| intergenic | D2026A BA.5.1.30 |
| intergenic | S2114F BA.5.1.30 |
| intergenic | T2153I BA.5.1.30 |
| intergenic | S2303F BA.5.1.30 |
| intergenic | T2306T BA.5.1.30 |
| intergenic | T2319T BA.5.1.30 |
| intergenic | C2445C BA.4.1.8,BA.5.1.2,BA.5.1.30 |
| ORF1a | S2462S / NSP3 |
| intergenic | S2462S BA.5.1.30 |
| intergenic | S2500F BA.5.1.30 |
| intergenic | L2518L BA.5.1.30 |
| intergenic | N2523N BA.5.1.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | M2674V BA.5.1.30 |
| intergenic | D2693D BA.5.1.30 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | S3099L BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.30 |
| intergenic | V3107I BA.5.1.30 |
| ORF1a | M3129L / NSP4 |
| intergenic | M3129L BA.5.1.30 |
| intergenic | T3150I BA.5.1.30 |
| ORF1a | A3230S / NSP4 |
| intergenic | A3230S BA.5.1.30 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | G3578S BA.5.1.30 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | I3738I BA.5.2.8,BA.5.1.30 |
| intergenic | F3769F BA.5.1.30 |
| intergenic | I3853I BA.5.1.10,BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L3899L BA.5.1.30 |
| intergenic | A3907A BA.5.1.30 |
| ORF1a | S3950T / NSP8 |
| intergenic | S3950T BA.5.1.30 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | R4017R BA.5.1.30 |
| intergenic | P4058P BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | A4168A BA.5.1.30 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | T4302N BA.5.1.30 |
| intergenic | L4386F BA.5.1.30 |
| intergenic | R4387R BA.4,BA.5.1.30 |
| intergenic | A4394S BA.5.1.30 |
| intergenic | S4398L BA.1.17,BA.5.1.30 |
| intergenic | A4577V BA.5.1.30 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | T4736I BA.5.1.30 |
| intergenic | G4878G BA.5.1.30 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | C5353C BA.5.1.30 |
| intergenic | Y5388Y BA.2.12,BA.5.1.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | A5692V BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.3,BA.5.1.30 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L5762L BA.5.1.10,BA.5.1.30 |
| intergenic | N5883N BA.5.1.30 |
| intergenic | L5932L BA.5.2.34,BA.5.1.30 |
| intergenic | I5967L BA.5.1.30 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | G5969G BA.5.1.30 |
| intergenic | D6051D BA.5.2.8,BA.5.1.30 |
| intergenic | D6183N BA.5.1.30 |
| intergenic | K6274N BA.5.1.30 |
| intergenic | L6420L BA.5,BA.5.1.30 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | D6584D BA.5.1.30 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| ORF1b | S6659S / NSP15 |
| intergenic | S6659S BA.5.1.30 |
| intergenic | A6707S BA.5.1.30 |
| ORF1b | A6808T / NSP16 |
| intergenic | A6808T BA.5.1.30 |
| intergenic | N7084N BA.5.1.30 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | F58F BA.5.1.30 |
| intergenic | H69del BA.5.1.30 |
| intergenic | I68_H69del BA.5.1.30 |
| intergenic | V70del BA.5.1.30 |
| intergenic | P82T BA.5.1.30 |
| S | P82T BA.5.1.30 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L176F BA.5.1.30 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L276L BA.5.1.30 |
| intergenic | L296L BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.30 |
| intergenic | T307S BA.5.1.30 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | A688V BA.5.2.34,BA.5,BA.5.1.30 |
| intergenic | S698L BA.5.1.30 |
| intergenic | S758I BA.5.1.30 |
| S | S758I BA.5.1.30 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | E988E BA.5.1.30 |
| intergenic | V1133V BA.5.1.30 |
| S | V1133V BA.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | N1134N BA.5.1.30 |
| S | N1134N BA.5.1.30 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | I1169I BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | Y1215Y BA.2.86.1,BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | F43L BA.5.1.30 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | V90F BA.5.1.30 |
| intergenic | L94P BA.5.1.30 |
| ORF3a | L94P BA.5.1.30 |
| intergenic | P104S BA.5.1.30 |
| intergenic | T175I BA.5.1.30 |
| intergenic | T223I BA.2.12,BA.5.1.30 |
| intergenic | V256del BA.5.2.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | F4F BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | F53F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L145L BA.5.1.30 |
| intergenic | D160N BA.5.1.30 |
| M | D160N BA.5.1.30 |
| intergenic | P165P BA.5.1.30 |
| intergenic | N203N BA.5.1.30 |
| intergenic | N207N BA.5.2.3,BA.5.1.30 |
| intergenic | D6G BA.5.1.30 |
| intergenic | V24I BA.5.1.30 |
| intergenic | L5F BA.5.1.30 |
| intergenic | C15C BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | V93F BA.5.1.30 |
| intergenic | P99L BA.5.1.30 |
| intergenic | T120A BA.5.1.30 |
| ORF7a | T120A BA.5.1.30 |
| intergenic | F19L BA.4,BA.5.1.30 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | N38I BA.5.1.30 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30 |
| intergenic | V33F BA.5.1.30 |
| intergenic | V49A BA.5.1.30 |
| intergenic | S67F BA.5.1.10,BA.5.1.30 |
| intergenic | H112H BA.5.1.30 |
| ORF8 | H112H BA.2.3,BA.5.1.30 |
| intergenic | F120F BA.5.1.30 |
| intergenic | FI120VL BA.5.1.30 |
| intergenic | I121I BA.5.1.30 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | T49I BA.5,BA.5.1.30 |
| intergenic | T54T BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | L56L BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | K65E BA.5.1.30 |
| N | K65E BA.5.1.30 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | A134A BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.2.3,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | G200C BA.5.1.30 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | Q289Q BA.5.1.24,BA.5.1.30 |
| N | Q289Q BA.5.1.24,BA.5.1.30 |
| intergenic | H300Y BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | F315F BA.5.1.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30 |
| intergenic | g.A-11T BA.5.1.30 |
| intergenic | L37F BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.1.2,BA.5.1.30 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | G49D BA.5.1.24,BA.5,BA.5.2.8,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D75N BQ.1.1.8 |
| intergenic | G82_V86del BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | M85del BA.2.12,BA.5,BA.5.1.1,BA.4.1,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T224I BQ.1.1.8 |
| ORF1a | T265A / NSP2 |
| intergenic | T265A BQ.1.1.8 |
| intergenic | S318L BA.5.1.1,BQ.1.1.8 |
| ORF1a | I368V / NSP2 |
| intergenic | I368V BQ.1.1.8 |
| intergenic | H374Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | V459V BA.5.2.8,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D466D BQ.1.1.8 |
| intergenic | S481S BA.5.1.10,BQ.1.1.8 |
| intergenic | Q556K BA.4,BA.5,BQ.1.1.8 |
| ORF1a | L590S / NSP2 |
| intergenic | L590S BQ.1.1.8 |
| intergenic | T609I BQ.1.1.8 |
| ORF1a | G638G / NSP2 |
| intergenic | G638G BQ.1.1.8 |
| intergenic | K669K BQ.1.1.8 |
| intergenic | A690A BQ.1.1.8 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L897L BQ.1.1.8 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L969F BQ.1.1.8 |
| intergenic | V1025V BQ.1.1.8 |
| ORF1a | N1037S / NSP3 |
| intergenic | N1037S BQ.1.1.8 |
| intergenic | A1049V BA.4.1.8,BQ.1.1.8 |
| intergenic | G1070G BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| ORF1a | I1206L / NSP3 |
| intergenic | I1206L BQ.1.1.8 |
| intergenic | D1273D BA.5,BQ.1.1.8 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | M1312I BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y1337Y BA.5,BA.5.1.2,BQ.1.1.8 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S1433S BQ.1.1.8 |
| ORF1a | Y1516H / NSP3 |
| intergenic | Y1516H BQ.1.1.8 |
| intergenic | T1589T BQ.1.1.8 |
| ORF1a | T1605I / NSP3 |
| intergenic | T1605I BQ.1.1.8 |
| intergenic | H1652H BQ.1.1.8 |
| intergenic | A1677T BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y1700Y BA.4.1,BQ.1.1.8 |
| intergenic | I1714I BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y1734Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | Q1758Q BQ.1.1.8 |
| intergenic | T2007T BA.5,BQ.1.1.8 |
| intergenic | V2019I BQ.1.1.8 |
| ORF1a | L2119L / NSP3 |
| intergenic | L2119L BQ.1.1.8 |
| intergenic | T2124I BQ.1.1.8 |
| intergenic | S2132G BQ.1.1.8 |
| ORF1a | T2137A / NSP3 |
| intergenic | T2137A BQ.1.1.8 |
| intergenic | F2172F BQ.1.1.8 |
| intergenic | L2211L BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y2245Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | A2508A BQ.1.1.8 |
| intergenic | P2605S BQ.1.1.8 |
| intergenic | N2714N BQ.1.1.8 |
| ORF1a | Q2749Q / NSP3 |
| intergenic | Q2749Q BQ.1.1.8 |
| intergenic | A2759V BQ.1.1.8 |
| intergenic | H2799H BQ.1.1.8 |
| intergenic | N2829N BQ.1.1.8 |
| intergenic | T2836I BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| intergenic | P2870P BA.5.2.34,BA.5,BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y2897Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | A2994V BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y3011Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8 |
| intergenic | N3081N BQ.1.1.8 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | E3176E BQ.1.1.8 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T3432T BQ.1.1.8 |
| ORF1a | S3570S / NSP6 |
| intergenic | S3570S BQ.1.1.8 |
| intergenic | H3580H BA.5.2.34,BQ.1.1.8 |
| intergenic | V3595V BQ.1.1.8 |
| intergenic | H3631H BQ.1.1.8 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | V3700V BQ.1.1.8 |
| intergenic | D3728D BA.4.1.8,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D3897D BA.5.1.2,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L3914L BQ.1.1.8 |
| intergenic | S3949N BQ.1.1.8 |
| intergenic | L3951F BQ.1.1.8 |
| intergenic | E3965E BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y4080H BQ.1.1.8 |
| intergenic | T4202T BQ.1.1.8 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L4209L BA.4,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L4252L BQ.1.1.8 |
| intergenic | V4266V BQ.1.1.8 |
| intergenic | H4467H BA.5.1.10,BQ.1.1.8 |
| ORF1b | F4549F / NSP12 |
| intergenic | F4549F BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y4665H BQ.1.1.8 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T4948T BQ.1.1.8 |
| intergenic | A4977A BQ.1.1.8 |
| intergenic | T4996T BQ.1.1.8 |
| intergenic | F5086Y BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5,BA.4.1,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | F5158F BA.1.14,BA.4,BQ.1.1.8 |
| intergenic | E5194E BQ.1.1.8 |
| intergenic | S5424S BQ.1.1.8 |
| intergenic | M5557I BQ.1.1.8 |
| intergenic | N5592S BQ.1.1.8 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | A5778V BQ.1.1.8 |
| ORF1b | D5907D / NSP13 |
| intergenic | D5907D BQ.1.1.8 |
| intergenic | P5949L BQ.1.1.8 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | P5995S BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y6122Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | P6128S BQ.1.1.8 |
| intergenic | T6175I BQ.1.1.8 |
| intergenic | S6299S BQ.1.1.8 |
| intergenic | L6308L BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| ORF1b | I6559M / NSP15 |
| intergenic | I6559M BQ.1.1.8 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D6584D BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | R6590H BQ.1.1.8 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| ORF1b | E6672K / NSP15 |
| intergenic | E6672K BQ.1.1.8 |
| ORF1b | V6688V / NSP15 |
| intergenic | V6688V BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y6730Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | M6840T BQ.1.1.8 |
| intergenic | L6852L BQ.1.1.8 |
| intergenic | R7014N BQ.1.1.8 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D53D BA.5,BA.5.1.1,BQ.1.1.8 |
| intergenic | A67_V70delinsSI BQ.1.1.8 |
| intergenic | H69del BQ.1.1.8 |
| intergenic | V70del BQ.1.1.8 |
| intergenic | T95A BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| S | T95A BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | G142_Y144delinsDV BA.2.86.1,BA.5.2.34,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | W152R BQ.1.1.8 |
| intergenic | G184S BQ.1.1.8 |
| intergenic | F186F BA.5.1.2,BQ.1.1.8 |
| intergenic | R190K BQ.1.1.8 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L229V BQ.1.1.8 |
| S | L229V BQ.1.1.8 |
| intergenic | P230P BQ.1.1.8 |
| S | P230P BQ.1.1.8 |
| intergenic | S254A BQ.1.1.8 |
| S | S254A BQ.1.1.8 |
| intergenic | S255F BA.5,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T286I BQ.1.1.8 |
| intergenic | T307I BA.5.1.2,BQ.1.1.8 |
| intergenic | G339D BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | I410I BQ.1.1.8 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | K444T BQ.1.1.8 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | F486V BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T547K BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T638I BQ.1.1.8 |
| S | T638I BQ.1.1.8 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S735L BQ.1.1.8 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | N856N BQ.1.1.8 |
| intergenic | T883T BQ.1.1.8 |
| intergenic | F888F BQ.1.1.8 |
| intergenic | D936Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | P1143L BA.2.86.1,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | P1162L BQ.1.1.8 |
| intergenic | D1165Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | N1178N BQ.1.1.8 |
| intergenic | G18V BA.5.1.24,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D22Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | G49C BQ.1.1.8 |
| intergenic | L65I BQ.1.1.8 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | V112V BA.5.2.3,BA.5,BQ.1.1.8 |
| intergenic | C130C BQ.1.1.8 |
| intergenic | I169I BQ.1.1.8 |
| intergenic | T223I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BQ.1.1.8 |
| intergenic | P240S BA.4,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | D3N BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | L119L BQ.1.1.8 |
| intergenic | G202G BA.5.2.34,BQ.1.1.8 |
| intergenic | R20S BQ.1.1.8 |
| ORF6 | R20S BQ.1.1.8 |
| intergenic | K53E BQ.1.1.8 |
| intergenic | T120I BQ.1.1.8 |
| intergenic | S5I BQ.1.1.8 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | H42Q BQ.1.1.8 |
| intergenic | g.C-5T BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | I76V BQ.1.1.8 |
| intergenic | FI120VL BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | R10R BQ.1.1.8 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | P20S BQ.1.1.8 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | F110F BA.5.1.10,BA.5.2.8,BQ.1.1.8 |
| intergenic | T115T BQ.1.1.8 |
| intergenic | E136D BQ.1.1.8 |
| intergenic | D144N BQ.1.1.8 |
| intergenic | L161F BA.5,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S183S BQ.1.1.8 |
| intergenic | S187P BQ.1.1.8 |
| N | S187P BQ.1.1.8 |
| intergenic | RG203KR BA.1.14,BA.5.1.10,BA.5.1.24,BA.1.18,BQ.1.1.8 |
| intergenic | Q242Q BQ.1.1.8 |
| intergenic | S255T BQ.1.1.8 |
| N | S255T BQ.1.1.8 |
| intergenic | S255Y BQ.1.1.8 |
| N | S255Y BQ.1.1.8 |
| intergenic | S327S BQ.1.1.8 |
| intergenic | Y360Y BA.5.2.2,BA.5.2.3,BQ.1.1.8 |
| intergenic | E367E BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | g.G-15T BA.2.12,BQ.1.1.8 |
| intergenic | g.GAC-15_-13TAT BQ.1.1.8 |
| intergenic | g.A29700G BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.2,BQ.1.1.8 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8 |
| intergenic | g.C-119T BA.5.1.10,DV.7.1 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | K47R DV.7.1 |
| intergenic | G82_H83del DV.7.1 |
| intergenic | G82_M85delinsV DV.7.1 |
| intergenic | M85_V86del DV.7.1 |
| intergenic | M85del DV.7.1 |
| intergenic | E113E DV.7.1 |
| intergenic | K129R DV.7.1 |
| intergenic | S135R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | K141_F143del BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | N162N BA.4.1,DV.7.1 |
| intergenic | N188N BA.4.1.8,BA.4.1,DV.7.1 |
| intergenic | R226K BA.5.2.3,DV.7.1 |
| intergenic | V228V DV.7.1 |
| intergenic | N310D DV.7.1 |
| intergenic | R402R BA.5.2.34,DV.7.1 |
| intergenic | H417H DV.7.1 |
| intergenic | V424V DV.7.1 |
| intergenic | A427V BA.5.2.34,DV.7.1 |
| intergenic | D448D DV.7.1 |
| intergenic | G519S BA.5,BA.4.1,DV.7.1 |
| intergenic | A540V BA.5.1.10,DV.7.1 |
| intergenic | T568I DV.7.1 |
| intergenic | T654T DV.7.1 |
| intergenic | A656V BA.1.14,BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | A690V DV.7.1 |
| intergenic | Y717Y BA.5,BA.4.1,DV.7.1 |
| intergenic | S723S DV.7.1 |
| intergenic | T753I BA.4.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | V757I DV.7.1 |
| intergenic | S771N DV.7.1 |
| intergenic | L791L DV.7.1 |
| intergenic | T842I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | P885S DV.7.1 |
| intergenic | F924F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | A964T BA.4,DV.7.1 |
| intergenic | D992D DV.7.1 |
| intergenic | T1001I BA.2.12,BA.5.1.10,DV.7.1 |
| intergenic | D1044D DV.7.1 |
| intergenic | V1057I DV.7.1 |
| intergenic | V1118V DV.7.1 |
| intergenic | V1177V DV.7.1 |
| intergenic | Q1198K DV.7.1 |
| intergenic | P1213L BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1 |
| intergenic | S1221L DV.7.1 |
| intergenic | K1247K DV.7.1 |
| intergenic | I1257I DV.7.1 |
| intergenic | I1276V DV.7.1 |
| intergenic | G1307S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | A1352A BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | L1379L DV.7.1 |
| intergenic | A1397A BA.2.12,BA.5,DV.7.1 |
| intergenic | T1426T BA.5.2.2,DV.7.1 |
| intergenic | L1441L BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | H1500R DV.7.1 |
| intergenic | Y1619Y DV.7.1 |
| intergenic | P1640S DV.7.1 |
| intergenic | G1819S DV.7.1 |
| intergenic | S2030L DV.7.1 |
| intergenic | M2036V DV.7.1 |
| intergenic | S2242F BA.5.2.34,BA.5.2.8,BA.5.1.2,DV.7.1 |
| intergenic | F2351F BA.4.1,DV.7.1 |
| intergenic | I2385I BA.4,DV.7.1 |
| intergenic | N2523S DV.7.1 |
| intergenic | A2584V BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1 |
| intergenic | V2651I DV.7.1 |
| intergenic | L2778F DV.7.1 |
| intergenic | T2872M DV.7.1 |
| intergenic | T2988T DV.7.1 |
| intergenic | L3027F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | I3035I DV.7.1 |
| intergenic | V3053V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | I3055I BA.5.1.2,BA.4.1,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | T3090I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | A3143V DV.7.1 |
| intergenic | R3163R DV.7.1 |
| intergenic | S3173S DV.7.1 |
| intergenic | L3201F BA.2.12,DV.7.1 |
| intergenic | T3255I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | D3311D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | K3353R BA.2.12,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.1.24,BA.5,DV.7.1 |
| intergenic | P3395H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | D3416D DV.7.1 |
| intergenic | D3439D BA.5.2.34,BA.5.1.1,DV.7.1 |
| intergenic | A3548V DV.7.1 |
| intergenic | L3606F BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.2.8,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | V3660V DV.7.1 |
| intergenic | 3676del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | F3677del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | S3675del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | A3688V DV.7.1 |
| intergenic | I3731V DV.7.1 |
| intergenic | V3782F DV.7.1 |
| intergenic | L3828L BA.5,DV.7.1 |
| intergenic | L3829F BA.5.1.24,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | L3829P DV.7.1 |
| intergenic | Q3859H DV.7.1 |
| intergenic | I3927M DV.7.1 |
| intergenic | Y3954Y BA.1.14,BA.4,DV.7.1 |
| intergenic | N4060S DV.7.1 |
| intergenic | L4070L BA.2.12,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | S4112C DV.7.1 |
| intergenic | T4175I BA.2.86.1,BA.5.1.24,BA.5.1.2,DV.7.1 |
| intergenic | I4205I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | L4237L DV.7.1 |
| intergenic | L4365I DV.7.1 |
| intergenic | C4373C DV.7.1 |
| intergenic | Y4541Y DV.7.1 |
| intergenic | D4546Y DV.7.1 |
| intergenic | L4578L BA.5.1.10,DV.7.1 |
| intergenic | D4586G DV.7.1 |
| intergenic | G4620G DV.7.1 |
| intergenic | D4652D BA.4,DV.7.1 |
| intergenic | T4668M DV.7.1 |
| intergenic | P4715L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | R4905R DV.7.1 |
| intergenic | A4921V BA.5.2.3,DV.7.1 |
| intergenic | G5063S BA.5.1.1,BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | G5104G DV.7.1 |
| intergenic | D5109D DV.7.1 |
| intergenic | L5150L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | D5152D BA.5.1.24,DV.7.1 |
| intergenic | Y5220Y BA.5.2.34,BA.5.1.2,DV.7.1 |
| intergenic | D5271D DV.7.1 |
| intergenic | T5477N DV.7.1 |
| intergenic | Y5541Y BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | M5598I DV.7.1 |
| intergenic | R5716C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | A5727A DV.7.1 |
| intergenic | A5829V DV.7.1 |
| intergenic | A5846A DV.7.1 |
| intergenic | H5951Y DV.7.1 |
| intergenic | I5967V BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | P5995P DV.7.1 |
| intergenic | P6066T DV.7.1 |
| intergenic | V6107I DV.7.1 |
| intergenic | T6131T BA.2.12,DV.7.1 |
| intergenic | G6173S DV.7.1 |
| intergenic | V6242I DV.7.1 |
| intergenic | H6380Y BA.5.1.10,DV.7.1 |
| intergenic | Y6423Y DV.7.1 |
| intergenic | K6541R DV.7.1 |
| intergenic | T6564I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | D6580A DV.7.1 |
| intergenic | E6597E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | I6663I DV.7.1 |
| intergenic | P6805S DV.7.1 |
| intergenic | Q6826R DV.7.1 |
| intergenic | V6894A DV.7.1 |
| intergenic | V6937V DV.7.1 |
| intergenic | T19I BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | L24_A27delinsS BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | L54L DV.7.1 |
| intergenic | N99N DV.7.1 |
| intergenic | G142D BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | K147E DV.7.1 |
| intergenic | W152R BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | E180D DV.7.1 |
| intergenic | Q183K DV.7.1 |
| intergenic | N185D DV.7.1 |
| intergenic | I210V DV.7.1 |
| intergenic | V213G BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | T240I BA.1.14,DV.7.1 |
| intergenic | G257S DV.7.1 |
| intergenic | A292T DV.7.1 |
| intergenic | L296L BA.5.2.2,BA.5,BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | G339H BA.2.86.1,DV.7.1 |
| intergenic | R346T BA.4.1.8,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | I358I DV.7.1 |
| intergenic | S371F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | S373P BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | ST375FA BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | V382V DV.7.1 |
| intergenic | R403K BA.2.86.1,BA.5,DV.7.1 |
| intergenic | D405N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | R408S BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | K417N BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | N440K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | K444T BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | G446S BA.1.14,BA.1.17,BA.1.18,DV.7.1 |
| intergenic | L452R BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | LF455FL DV.7.1 |
| intergenic | N460K BA.2.86.1,BA.5,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | ST477NK BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | E484A BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | F486S DV.7.1 |
| intergenic | N501Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | Y505H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | N603N BA.4.1.8,BA.5.1.10,DV.7.1 |
| intergenic | D614G BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | V622V DV.7.1 |
| intergenic | D627D DV.7.1 |
| intergenic | H655Y BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | N679K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | P681H BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | I692F DV.7.1 |
| intergenic | S698L BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | N764K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | P812L DV.7.1 |
| intergenic | E819E DV.7.1 |
| intergenic | L858I DV.7.1 |
| intergenic | Q954H BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | N969K BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | L981I DV.7.1 |
| intergenic | P1143P DV.7.1 |
| intergenic | D1146D BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | D1184Y DV.7.1 |
| intergenic | L1200F DV.7.1 |
| intergenic | F8F BA.2.12,BA.4,DV.7.1 |
| intergenic | T32I DV.7.1 |
| intergenic | F43S BA.5.1.10,DV.7.1 |
| intergenic | S60S BA.5.1.2,DV.7.1 |
| intergenic | L65F DV.7.1 |
| intergenic | T64T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | A72T DV.7.1 |
| intergenic | A110V DV.7.1 |
| intergenic | L115S DV.7.1 |
| intergenic | S177N DV.7.1 |
| intergenic | Y189Y BA.4.1,DV.7.1 |
| intergenic | D210D DV.7.1 |
| intergenic | T223F DV.7.1 |
| intergenic | T223I DV.7.1 |
| intergenic | T9I BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | T11A DV.7.1 |
| intergenic | Q19E BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | A63T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | S108S DV.7.1 |
| intergenic | F112F BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1 |
| intergenic | L129L DV.7.1 |
| intergenic | R146H DV.7.1 |
| intergenic | R150R DV.7.1 |
| intergenic | I151V DV.7.1 |
| intergenic | M1? DV.7.1 |
| intergenic | D6_F7del DV.7.1 |
| intergenic | R20Q DV.7.1 |
| intergenic | R20R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.4,BA.1.18,BA.4.1,DV.7.1 |
| intergenic | D61F DV.7.1 |
| intergenic | D61L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.4,BA.4.1,DV.7.1 |
| intergenic | T28I BA.5.2.3,BA.5,DV.7.1 |
| intergenic | E121Q DV.7.1 |
| intergenic | A15A DV.7.1 |
| intergenic | L18L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | T11K DV.7.1 |
| intergenic | P36P BA.1.14,BA.5.2.34,DV.7.1 |
| intergenic | P38P BA.5.2.34,DV.7.1 |
| intergenic | H40Y DV.7.1 |
| intergenic | S67F BA.5.1.10,BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | g.A-3T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | P13L BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | D22G BA.5.1.1,DV.7.1 |
| intergenic | T24A DV.7.1 |
| intergenic | S26I DV.7.1 |
| intergenic | E31_S33del BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | A35S DV.7.1 |
| intergenic | R41R DV.7.1 |
| intergenic | D63D BA.5.1.10,DV.7.1 |
| intergenic | N75N BA.4.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | D82D BA.5,DV.7.1 |
| intergenic | D128D BA.5.1.2,BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | T135A DV.7.1 |
| intergenic | K143K DV.7.1 |
| intergenic | T166I DV.7.1 |
| intergenic | RG203KR BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,DV.7.1 |
| intergenic | A217S DV.7.1 |
| intergenic | L219F BA.5,DV.7.1 |
| intergenic | V270L DV.7.1 |
| intergenic | F274F BA.5.1.10,BA.5,BF.9,DV.7.1 |
| intergenic | D348H DV.7.1 |
| intergenic | T366I DV.7.1 |
| intergenic | S413R BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF.9,BA.4.1,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | D415D DV.7.1 |
| intergenic | g.C29686T DV.7.1 |
| intergenic | g.CGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTG29733C BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.2.12,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.1.1,BA.5.2.8,BA.5.1.2,BF.9,BA.5.1.30,BQ.1.1.8,DV.7.1 |
| intergenic | g.C29769T DV.7.1 |
| intergenic | g.T29793A DV.7.1 |
| intergenic | g.C-166T BA.5.2.20 |
| intergenic | g.C-149T BA.5.2.20 |
| intergenic | g.A-131G BA.5.2.20 |
| intergenic | g.A-88T BA.5.2.20 |
| intergenic | g.C-44T BA.5.2.20 |
| intergenic | g.C-25T BA.2.86.1,BA.4.1.8,BA.1.14,BA.2.12,BA.1.17,BA.5.2.2,BA.5.1.10,BA.4,BA.5.2.34,BA.5.1.24,BA.5.2.3,BA.5,BA.5.1.1,BA.1.18,BA.5.2.8,BF.20,BA.5.1.2,BF.41,BF. |